Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0047
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0047, 753 aa
1>>>pF1KE0047 753 - 753 aa - 753 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9949+/-0.00106; mu= 17.3282+/- 0.065
mean_var=93.9941+/-18.839, 0's: 0 Z-trim(106.1): 52 B-trim: 312 in 1/50
Lambda= 0.132289
statistics sampled from 8739 (8784) to 8739 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16
Scan time: 3.940
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34013.1 PPEF2 gene_id:5470|Hs108|chr4 ( 753) 5054 975.5 0
CCDS43920.1 PPEF1 gene_id:5475|Hs108|chrX ( 591) 1106 222.0 2.2e-57
CCDS14188.1 PPEF1 gene_id:5475|Hs108|chrX ( 653) 1106 222.0 2.4e-57
CCDS12684.1 PPP5C gene_id:5536|Hs108|chr19 ( 499) 563 118.3 3e-26
CCDS31618.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11 ( 341) 390 85.1 2e-16
CCDS9150.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs108|chr12 ( 323) 389 84.9 2.1e-16
CCDS58279.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs108|chr12 ( 337) 389 85.0 2.2e-16
CCDS8160.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11 ( 330) 388 84.8 2.5e-16
CCDS33169.1 PPP1CB gene_id:5500|Hs108|chr2 ( 327) 385 84.2 3.7e-16
CCDS6079.1 PPP2CB gene_id:5516|Hs108|chr8 ( 309) 382 83.6 5.2e-16
CCDS10669.1 PPP4C gene_id:5531|Hs108|chr16 ( 307) 373 81.9 1.7e-15
CCDS8161.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11 ( 286) 370 81.3 2.4e-15
CCDS4173.1 PPP2CA gene_id:5515|Hs108|chr5 ( 309) 367 80.7 3.8e-15
CCDS6861.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9 ( 305) 358 79.0 1.2e-14
CCDS48018.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9 ( 342) 354 78.3 2.3e-14
CCDS47113.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 ( 469) 338 75.3 2.4e-13
CCDS47114.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 ( 511) 338 75.3 2.6e-13
CCDS34037.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 ( 521) 338 75.3 2.7e-13
CCDS59094.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 ( 502) 322 72.3 2.1e-12
CCDS34859.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 ( 512) 322 72.3 2.2e-12
CCDS59093.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 ( 521) 322 72.3 2.2e-12
CCDS44436.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10 ( 515) 315 71.0 5.5e-12
CCDS7328.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10 ( 524) 315 71.0 5.6e-12
CCDS44437.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10 ( 525) 315 71.0 5.6e-12
>>CCDS34013.1 PPEF2 gene_id:5470|Hs108|chr4 (753 aa)
initn: 5054 init1: 5054 opt: 5054 Z-score: 5214.3 bits: 975.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5054; 100.0% identity (100.0% similar) in 753 aa overlap (1-753:1-753)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGSGTSTQHHFAFQNAERAFKAAALIQRWYRRYVARLEMRRRCTWSIFQSIEYAGQQDQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MGSGTSTQHHFAFQNAERAFKAAALIQRWYRRYVARLEMRRRCTWSIFQSIEYAGQQDQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KLHDFFSYLMDHFIPSSHNDRDFLTRIFTEDRFAQDSEMKKCSDYESIEVPDSYTGPRLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KLHDFFSYLMDHFIPSSHNDRDFLTRIFTEDRFAQDSEMKKCSDYESIEVPDSYTGPRLS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FPLLPDHATALVEAFRLKQQLHARYVLNLLYETKKHLVQLPNINRVSTCYSEEITVCGDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FPLLPDHATALVEAFRLKQQLHARYVLNLLYETKKHLVQLPNINRVSTCYSEEITVCGDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 HGQLDDLIFIFYKNGLPSPERSYVFNGDFVDRGKDSVEILMILFAFMLVYPKEFHLNRGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HGQLDDLIFIFYKNGLPSPERSYVFNGDFVDRGKDSVEILMILFAFMLVYPKEFHLNRGN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 HEDHMVNLRYGFTKEVMNKYKVHGKEILRTLQDVFCWLPLATLIDEKVLILHGGVSDITD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HEDHMVNLRYGFTKEVMNKYKVHGKEILRTLQDVFCWLPLATLIDEKVLILHGGVSDITD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 LELLDKIERSKIVSTMRCKTRQKSEKQMEEKRRANQKSSAQGPIPWFLPESRSLPSSPLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LELLDKIERSKIVSTMRCKTRQKSEKQMEEKRRANQKSSAQGPIPWFLPESRSLPSSPLR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 LGSYKAQKTSRSSSIPCSGSLDGRELSRQVRSSVELELERCRQQAGLLVTGEKEEPSRSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LGSYKAQKTSRSSSIPCSGSLDGRELSRQVRSSVELELERCRQQAGLLVTGEKEEPSRSA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 SEADSEAGELRKPTQEEWRQVVDILWSDPMAQEGCKANTIRGGGCYFGPDVTQQLLQKYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SEADSEAGELRKPTQEEWRQVVDILWSDPMAQEGCKANTIRGGGCYFGPDVTQQLLQKYN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 MQFLIRSHECKPEGYEFCHNRKVLTIFSASNYYEVGSNRGAYVKLGPALTPHIVQYQANK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MQFLIRSHECKPEGYEFCHNRKVLTIFSASNYYEVGSNRGAYVKLGPALTPHIVQYQANK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 VTHTLTMRQRISRVEESALRALREKLFAHSSDLLSEFKKHDADKVGLITLSDWAAAVESV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VTHTLTMRQRISRVEESALRALREKLFAHSSDLLSEFKKHDADKVGLITLSDWAAAVESV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 LHLGLPWRMLRPQLVNSSADNMLEYKSWLKNLAKEQLSRENIQSSLLETLYRNRSNLETI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LHLGLPWRMLRPQLVNSSADNMLEYKSWLKNLAKEQLSRENIQSSLLETLYRNRSNLETI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 FRIIDSDHSGFISLDEFRQTWKLFSSHMNIDITDDCICDLARSIDFNKDGHIDINEFLEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FRIIDSDHSGFISLDEFRQTWKLFSSHMNIDITDDCICDLARSIDFNKDGHIDINEFLEA
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KE0 FRLVEKSCPEGDASECPQATNAKDSGCSSPGAH
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FRLVEKSCPEGDASECPQATNAKDSGCSSPGAH
730 740 750
>>CCDS43920.1 PPEF1 gene_id:5475|Hs108|chrX (591 aa)
initn: 1810 init1: 916 opt: 1106 Z-score: 1143.7 bits: 222.0 E(32554): 2.2e-57
Smith-Waterman score: 1572; 39.6% identity (63.3% similar) in 727 aa overlap (1-726:1-578)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGSGTSTQHHFAFQNAERAFKAAALIQRWYRRYVARLEMRRRCTWSIFQSIEYAGQQDQV
:: ..:. . . .. ...:: .:: ::: : :::. :.. . .:::::::: .: :.
CCDS43 MGCSSSSTKT---RRSDTSLRAALIIQNWYRGYKARLKARQHYALTIFQSIEYADEQGQM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 KLHDFFSYLMDHFIPSSHNDRDFLTRIFTEDRFAQDSEMKKCSDY-ESIEVPDSYTGPRL
.: :::...... .: .. : . .. . ....:. :: .::.:::::.::::
CCDS43 QLSTFFSFMLENY---THIHKEELE--LRNQSLESEQDMRDRWDYVDSIDVPDSYNGPRL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 SFPLLPDHATALVEAFRLKQQLHARYVLNLLYETKKHLVQLPNINRVSTCYSEEITVCGD
.::: :.:::. .: :::.:::..:.:::: : :.::.....: :.:.:.:::
CCDS43 QFPLTCTDIDLLLEAFKEQQILHAHYVLEVLFETKKVLKQMPNFTHIQTSPSKEVTICGD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LHGQLDDLIFIFYKNGLPSPERSYVFNGDFVDRGKDSVEILMILFAFMLVYPKEFHLNRG
:::.::::..::::::::: . ::::::::::::.:.:::::: . .::::...:::::
CCDS43 LHGKLDDLFLIFYKNGLPSERNPYVFNGDFVDRGKNSIEILMILCVSFLVYPNDLHLNRG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 NHEDHMVNLRYGFTKEVMNKYKVHGKEILRTLQDVFCWLPLATLIDEKVLILHGGVSDIT
:::: :.:::::::::...:::.:::.::. :.. . :::..:..:...:..:::.:. :
CCDS43 NHEDFMMNLRYGFTKEILHKYKLHGKRILQILEEFYAWLPIGTIVDNEILVIHGGISETT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 DLELLDKIERSKIVSTMRCKTRQKSEKQMEEKRRANQKSSAQGPIPWFLPESRSLPSSPL
::.:: ..::.:. :.. :: :.
CCDS43 DLNLLHRVERNKMKSVL---------------------------IP---------PTETN
300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 RLGSYKAQKTSRSSSIPCSGSLDGRELSRQVRSSVELELERCRQQAGLLVTGEKEEPSRS
: . :. ... . . :: .... : :..
CCDS43 R----DHDTDSKHNKVGVTFNAHGR-----IKTN------------G--------SPTEH
320 330 340
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 ASEADSEAGELRKPTQEEWRQVVDILWSDPMAQEGCKANTIRGGGCYFGPDVTQQLLQKY
.: .::.:::
CCDS43 LTE-------------HEWEQVV-------------------------------------
350
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 NMQFLIRSHECKPEGYEFCHNRKVLTIFSASNYYEVGSNRGAYVKLGPALTPHIVQYQAN
:::::::::: :::::::.:: . ::.. :::..
CCDS43 -------------------------TIFSASNYYEEGSNRGAYIKLCSGTTPRFFQYQVT
360 370 380 390
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 KVTHTLTMRQRISRVEESALRALREKLFAHSSDLLSEFKKHDADKVGLITLSDWAAAVES
:.: .:::.. .:.::.. :::......::: :. .: : : ...:.:: .:.
CCDS43 KATCFQPLRQRVDTMENSAIKILRERVISRKSDLTRAFQLQDHRKSGKLSVSQWAFCMEN
400 410 420 430 440 450
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 VLHLGLPWRMLRPQLVNSSADNMLEYKSWLKNLAKEQLSRENIQSSLLETLYRNRSNLET
.: :.:::: : .::: . .. .:: : ..:. :. .: .:.:.::::: ::.::
CCDS43 ILGLNLPWRSLSSNLVNIDQNGNVEYMSSFQNIRIEKPVQEA-HSTLVETLYRYRSDLEI
460 470 480 490 500 510
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 IFRIIDSDHSGFISLDEFRQTWKLFSSHMNIDITDDCICDLARSIDFNKDGHIDINEFLE
:: ::.::::.::..::: :::::::.:. : :. . :: .:.:::: ::.::::.
CCDS43 IFNAIDTDHSGLISVEEFRAMWKLFSSHYNVHIDDSQVNKLANIMDLNKDGSIDFNEFLK
520 530 540 550 560 570
720 730 740 750
pF1KE0 AFRLVEKSCPEGDASECPQATNAKDSGCSSPGAH
:: .:..
CCDS43 AFYVVHRYEDLMKPDVTNLG
580 590
>>CCDS14188.1 PPEF1 gene_id:5475|Hs108|chrX (653 aa)
initn: 2140 init1: 920 opt: 1106 Z-score: 1143.0 bits: 222.0 E(32554): 2.4e-57
Smith-Waterman score: 2039; 45.3% identity (71.1% similar) in 727 aa overlap (1-726:1-640)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGSGTSTQHHFAFQNAERAFKAAALIQRWYRRYVARLEMRRRCTWSIFQSIEYAGQQDQV
:: ..:. . . .. ...:: .:: ::: : :::. :.. . .:::::::: .: :.
CCDS14 MGCSSSSTKT---RRSDTSLRAALIIQNWYRGYKARLKARQHYALTIFQSIEYADEQGQM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 KLHDFFSYLMDHFIPSSHNDRDFLTRIFTEDRFAQDSEMKKCSDY-ESIEVPDSYTGPRL
.: :::...... .: .. : . .. . ....:. :: .::.:::::.::::
CCDS14 QLSTFFSFMLENY---THIHKEELE--LRNQSLESEQDMRDRWDYVDSIDVPDSYNGPRL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 SFPLLPDHATALVEAFRLKQQLHARYVLNLLYETKKHLVQLPNINRVSTCYSEEITVCGD
.::: :.:::. .: :::.:::..:.:::: : :.::.....: :.:.:.:::
CCDS14 QFPLTCTDIDLLLEAFKEQQILHAHYVLEVLFETKKVLKQMPNFTHIQTSPSKEVTICGD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LHGQLDDLIFIFYKNGLPSPERSYVFNGDFVDRGKDSVEILMILFAFMLVYPKEFHLNRG
:::.::::..::::::::: . ::::::::::::.:.:::::: . .::::...:::::
CCDS14 LHGKLDDLFLIFYKNGLPSERNPYVFNGDFVDRGKNSIEILMILCVSFLVYPNDLHLNRG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 NHEDHMVNLRYGFTKEVMNKYKVHGKEILRTLQDVFCWLPLATLIDEKVLILHGGVSDIT
:::: :.:::::::::...:::.:::.::. :.. . :::..:..:...:..:::.:. :
CCDS14 NHEDFMMNLRYGFTKEILHKYKLHGKRILQILEEFYAWLPIGTIVDNEILVIHGGISETT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 DLELLDKIERSKIVSTMRCKTRQKSEKQMEEKRRANQKSSAQGPIPWFLPESRSLPSSPL
::.:: ..::.:. :.. :: :.
CCDS14 DLNLLHRVERNKMKSVL---------------------------IP---------PTETN
300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 RLGSYKAQKTSRSSSIPCSGSLDGRELSRQVRSSVELELERCRQQAGLLVTGEKEEPSRS
: . :. ... . . :: .... : :..
CCDS14 R----DHDTDSKHNKVGVTFNAHGR-----IKTN------------G--------SPTEH
320 330 340
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 ASEADSEAGELRKPTQEEWRQVVDILWSDPMAQEGCKANTIRGGGCYFGPDVTQQLLQKY
.: .::.:..::::::: ...:: :: ::::::::::::...:.::
CCDS14 LTE-------------HEWEQIIDILWSDPRGKNGCFPNTCRGGGCYFGPDVTSKILNKY
350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 NMQFLIRSHECKPEGYEFCHNRKVLTIFSASNYYEVGSNRGAYVKLGPALTPHIVQYQAN
....:::::::::::::.::. ::.:::::::::: :::::::.:: . ::.. :::..
CCDS14 QLKMLIRSHECKPEGYEICHDGKVVTIFSASNYYEEGSNRGAYIKLCSGTTPRFFQYQVT
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 KVTHTLTMRQRISRVEESALRALREKLFAHSSDLLSEFKKHDADKVGLITLSDWAAAVES
:.: .:::.. .:.::.. :::......::: :. .: : : ...:.:: .:.
CCDS14 KATCFQPLRQRVDTMENSAIKILRERVISRKSDLTRAFQLQDHRKSGKLSVSQWAFCMEN
460 470 480 490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 VLHLGLPWRMLRPQLVNSSADNMLEYKSWLKNLAKEQLSRENIQSSLLETLYRNRSNLET
.: :.:::: : .::: . .. .:: : ..:. :. .: .:.:.::::: ::.::
CCDS14 ILGLNLPWRSLSSNLVNIDQNGNVEYMSSFQNIRIEKPVQEA-HSTLVETLYRYRSDLEI
520 530 540 550 560 570
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 IFRIIDSDHSGFISLDEFRQTWKLFSSHMNIDITDDCICDLARSIDFNKDGHIDINEFLE
:: ::.::::.::..::: :::::::.:. : :. . :: .:.:::: ::.::::.
CCDS14 IFNAIDTDHSGLISVEEFRAMWKLFSSHYNVHIDDSQVNKLANIMDLNKDGSIDFNEFLK
580 590 600 610 620 630
720 730 740 750
pF1KE0 AFRLVEKSCPEGDASECPQATNAKDSGCSSPGAH
:: .:..
CCDS14 AFYVVHRYEDLMKPDVTNLG
640 650
>>CCDS12684.1 PPP5C gene_id:5536|Hs108|chr19 (499 aa)
initn: 685 init1: 363 opt: 563 Z-score: 584.6 bits: 118.3 E(32554): 3e-26
Smith-Waterman score: 624; 29.2% identity (50.0% similar) in 538 aa overlap (11-538:80-478)
10 20 30
pF1KE0 MGSGTSTQHHFAFQNAERAFKA-AALIQRWYRRYVARLEM
.:. .: ::.. :. .::: .. . .
CCDS12 FYSQAIELNPSNAIYYGNRSLAYLRTECYGYALGDATRAIELDKKYIKGYYRRAASNMAL
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 RR-RCTWSIFQSIEYAGQQDQVKLHDFFSYLMDHFIPSSHNDRDFLTRIFTEDRFAQDSE
. : . .... .:: :: : . .. .. . : .: .:
CCDS12 GKFRAALRDYETVV------KVKPHD-----KDAKMKYQECNKIVKQKAF--ERAIAGDE
110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 MKKCS----DYESIEVPDSYTGPRL-SFPLLPDHATALVEAFRLKQQLHARYVLNLLYET
:. : ::. . : :.::.: . . . :.. .. ...:: . . ..: ..
CCDS12 HKRSVVDSLDIESMTIEDEYSGPKLEDGKVTISFMKELMQWYKDQKKLHRKCAYQILVQV
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 KKHLVQLPNINRVSTCYSEEITVCGDLHGQLDDLIFIFYKNGLPSPERSYVFNGDFVDRG
:. : .: .. ... .:.:::::: :::. ::. :: ::::: :.:::::::::
CCDS12 KEVLSKLSTLVETTLKETEKITVCGDTHGQFYDLLNIFELNGLPSETNPYIFNGDFVDRG
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 KDSVEILMILFAFMLVYPKEFHLNRGNHEDHMVNLRYGFTKEVMNKYKVHGKEILRTLQD
. :::... ::.: :.:: .::: ::::: .: ::: :: :: .. :.. ..
CCDS12 SFSVEVILTLFGFKLLYPDHFHLLRGNHETDNMNQIYGFEGEVKAKYTAQMYELF---SE
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 VFCWLPLATLIDEKVLILHGGV--SDITDLELLDKIERSKIVSTMRCKTRQKSEKQMEEK
:: ::::: :. ::::.:::. : . :. . ::::
CCDS12 VFEWLPLAQCINGKVLIMHGGLFSEDGVTLDDIRKIER----------------------
340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 RRANQKSSAQGPIPWFLPESRSLPSSPLRLGSYKAQKTSRSSSIPCSGSLDGRELSRQVR
:.. .::. :
CCDS12 ---NRQPPDSGPM--------------------------------C--------------
380
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 SSVELELERCRQQAGLLVTGEKEEPSRSASEADSEAGELRKPTQEEWRQVVDILWSDPMA
:.:::::.
CCDS12 ---------------------------------------------------DLLWSDPQP
390
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pF1KE0 QEGCKANTIRGGGCYFGPDVTQQLLQKYNMQFLIRSHECKPEGYEFCHNRKVLTIFSASN
:.: .. . :: .: ::::::. .:.. :....::::: : :::: :. . .:.::: :
CCDS12 QNG-RSISKRGVSCQFGPDVTKAFLEENNLDYIIRSHEVKAEGYEVAHGGRCVTVFSAPN
400 410 420 430 440 450
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 YYEVGSNRGAYVKL-GPALTPHIVQYQANKVTHTLTMRQRISRVEESALRALREKLFAHS
: . .:...:..: : : :.. :. :
CCDS12 YCDQMGNKASYIHLQGSDLRPQFHQFTAVPHPNVKPMAYANTLLQLGMM
460 470 480 490
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:: :.... :: : : : : : : :
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:.. : . :: . .: .... ... : . .. . . .:::.::: ::.
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.: .:.: :: .:.: ::.:::::.:.: . .:.:. . ::..: : ::::: .:
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::: : .:.. .. .:. : : ::.:...:::.. :::.: :. ..: . .:
CCDS31 IYGFYDECKRRYNI---KLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRI
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:
CCDS31 MRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKHDLDLICRAHQ
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::. . .: .... ... : . .. .
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. .:::.::: ::. .: .:.: :: .:.: ::.:::::.:.: . .:.:. .
CCDS91 ---PLKICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFP-PESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIK
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::..: : ::::: .: ::: : .:.. .. .:. : : ::.:...:::..
CCDS91 YPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRYNI---KLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIF
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:::.: :. ..: . .: :
CCDS91 CCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVLGWGENDRGVSFTFGAE
180 190 200 210 220 230
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::. . .: .... ... : . .. .
CCDS58 MADLDKLNIDSIIQRLLEVRGSKPGKNVQLQENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEA-
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. .:::.::: ::. .: .:.: :: .:.: ::.:::::.:.: . .:.:. .
CCDS58 ---PLKICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFP-PESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIK
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::..: : ::::: .: ::: : .:.. .. .:. : : ::.:...:::..
CCDS58 YPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRYNI---KLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIF
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CCDS58 CCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVLGWGENDRGVSFTFGAE
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. .:::.::: ::. .: .:.: :: .:
CCDS81 QLTENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFP-PESNY
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CCDS81 LFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRYNI-
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.. .:. : : ::.:...:::.. :::.: :. ..: . .: :
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. .:::.::: ::. .: .:.: :: .:
CCDS33 QMTEAEVRGLCIKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYTDLLRLFEYGGFP-PEANY
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.: ::.:::::.:.: . .:.:. . ::..: : ::::: .: ::: : ....
CCDS33 LFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRFNI-
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CCDS33 --KLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDTGLLCDL
150 160 170 180 190 200
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 KSEKQMEEKRRANQKSSAQGPIPWFLPESRSLPSSPLRLGSYKAQKTSRSSSIPCSGSLD
CCDS33 LWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGADVVSKFLNRHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLV
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CCDS60 MDDKAFTKELDQWVEQLNECKQLNENQVRTLCEKAKEILTKES
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]