Result of FASTA (ccds) for pF1KE0130
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0130, 399 aa
  1>>>pF1KE0130 399 - 399 aa - 399 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1855+/-0.000779; mu= 12.7625+/- 0.047
 mean_var=81.5958+/-16.258, 0's: 0 Z-trim(109.6): 20  B-trim: 10 in 1/50
 Lambda= 0.141984
 statistics sampled from 10964 (10979) to 10964 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.702), E-opt: 0.2 (0.337), width:  16
 Scan time:  3.070

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14719.1 PNMA6A gene_id:84968|Hs108|chrX        ( 399) 2649 552.1 3.3e-157
CCDS14718.1 PNMA5 gene_id:114824|Hs108|chrX        ( 448)  923 198.6 9.8e-51
CCDS9818.1 PNMA1 gene_id:9240|Hs108|chr14          ( 353)  883 190.3 2.3e-48
CCDS65344.1 PNMA3 gene_id:29944|Hs108|chrX         ( 455)  805 174.4 1.9e-43
CCDS35435.2 PNMA3 gene_id:29944|Hs108|chrX         ( 463)  805 174.4 1.9e-43
CCDS34868.1 PNMA2 gene_id:10687|Hs108|chr8         ( 364)  552 122.5 6.1e-28
CCDS65304.1 ZCCHC18 gene_id:644353|Hs108|chrX      ( 403)  466 104.9 1.3e-22
CCDS14574.1 ZCCHC12 gene_id:170261|Hs108|chrX      ( 402)  465 104.7 1.6e-22
CCDS9908.1 MOAP1 gene_id:64112|Hs108|chr14         ( 351)  375 86.3 4.9e-17
CCDS46124.1 PNMAL1 gene_id:55228|Hs108|chr19       ( 378)  370 85.3 1.1e-16
CCDS33059.1 PNMAL1 gene_id:55228|Hs108|chr19       ( 439)  370 85.3 1.2e-16
CCDS59400.1 PNMAL2 gene_id:57469|Hs108|chr19       ( 635)  288 68.6 1.9e-11


>>CCDS14719.1 PNMA6A gene_id:84968|Hs108|chrX             (399 aa)
 initn: 2649 init1: 2649 opt: 2649  Z-score: 2935.9  bits: 552.1 E(32554): 3.3e-157
Smith-Waterman score: 2649; 100.0% identity (100.0% similar) in 399 aa overlap (1-399:1-399)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAVTMLQDWCRWMGVNARRGLLILGIPEDCDDAEFQESLEAALRPMGHFTVLGKAFREED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MAVTMLQDWCRWMGVNARRGLLILGIPEDCDDAEFQESLEAALRPMGHFTVLGKAFREED
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 NATAALVELDREVNYALVPREIPGTGGPWNVVFVPRCSGEEFLGLGRVFHFPEQEGQMVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NATAALVELDREVNYALVPREIPGTGGPWNVVFVPRCSGEEFLGLGRVFHFPEQEGQMVE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 SVAGALGVGLRRVCWLRSIGQAVQPWVEAVRCQSLGVFSGRDQPAPGEESFEVWLDHTTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SVAGALGVGLRRVCWLRSIGQAVQPWVEAVRCQSLGVFSGRDQPAPGEESFEVWLDHTTE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 MLHVWQGVSERERRRRLLEGLRGTALQLVHALLAENPARTAQDCLAALAQVFGDNESQAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MLHVWQGVSERERRRRLLEGLRGTALQLVHALLAENPARTAQDCLAALAQVFGDNESQAT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 IRVKCLTAQQQSGERLSAFVLRLEVLLQKAMEKEALARASADRVRLRQMLTRAHLTEPLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IRVKCLTAQQQSGERLSAFVLRLEVLLQKAMEKEALARASADRVRLRQMLTRAHLTEPLD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 EALRKLRMAGRSPSFLEMLGLVRESEAWEASLARSVRAQTQEGAGARAGAQAVARASTKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EALRKLRMAGRSPSFLEMLGLVRESEAWEASLARSVRAQTQEGAGARAGAQAVARASTKV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390         
pF1KE0 EAVPGGPGREPEGLLQAGGQEAEELLQEGLKPVLEECDN
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EAVPGGPGREPEGLLQAGGQEAEELLQEGLKPVLEECDN
              370       380       390         

>>CCDS14718.1 PNMA5 gene_id:114824|Hs108|chrX             (448 aa)
 initn: 893 init1: 390 opt: 923  Z-score: 1024.3  bits: 198.6 E(32554): 9.8e-51
Smith-Waterman score: 937; 40.2% identity (69.8% similar) in 410 aa overlap (1-395:1-391)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAVTMLQDWCRWMGVNARRGLLILGIPEDCDDAEFQESLEAALRPMGHFTVLGKAFREED
       ::.:.:.:::. : .. :..:::.::: .:...:.:....:.:.:.  . :::. ::.::
CCDS14 MALTLLEDWCKGMDMDPRKALLIVGIPMECSEVEIQDTVKAGLQPLCAYRVLGRMFRRED
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 NATAALVELDREVNYALVPREIPGTGGPWNVVFVPRCSGEEFLGLGRVFHFPEQEGQMVE
       :: :...::   :::. .: .::: :: :.::  ::   .:::.  :. .: ..::. . 
CCDS14 NAKAVFIELADTVNYTTLPSHIPGKGGSWEVVVKPRNPDDEFLS--RLNYFLKDEGRSMT
               70        80        90       100         110        

              130         140                150       160         
pF1KE0 SVAGALGVGLRRVCWL--RSIGQAVQPWV---------EAVRCQSLGVFSGRDQPAPGEE
       .:: :::      : :  .:.   :.: :         :..  ..: ::::  .:.::::
CCDS14 DVARALGC-----CSLPAESLDAEVMPQVRSPPLEPPKESMWYRKLKVFSGTASPSPGEE
      120            130       140       150       160       170   

     170       180       190       200       210       220         
pF1KE0 SFEVWLDHTTEMLHVWQGVSERERRRRLLEGLRGTALQLVHALLAENPARTAQDCLAALA
       .:: ::...::.. .:: ::: :.::::::.::: ::.....: :.: . :...:: :: 
CCDS14 TFEDWLEQVTEIMPIWQ-VSEVEKRRRLLESLRGPALSIMRVLQANNDSITVEQCLDALK
           180       190        200       210       220       230  

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE0 QVFGDNESQATIRVKCLTAQQQSGERLSAFVLRLEVLLQKAMEKEALARASADRVRLRQM
       :.:::.:.  . . . : .. . ::..:.:.:::: :::::..:  :.  :.: .::...
CCDS14 QIFGDKEDFRASQFRFLQTSPKIGEKVSTFLLRLEPLLQKAVHKSPLSVRSTDMIRLKHL
            240       250       260       270       280       290  

     290       300       310       320       330         340       
pF1KE0 LTRAHLTEPLDEALRKLRMAGRSPSFLEMLGLVRESEAWEASLA--RSVRAQTQEGAGAR
       :.:. .:  :   :. : . :  :.:::.. :.:. : :: . :  .. .  . .: :: 
CCDS14 LARVAMTPALRGKLELLDQRGCPPNFLELMKLIRDEEEWENTEAVMKNKEKPSGRGRGA-
            300       310       320       330       340       350  

       350       360       370         380       390               
pF1KE0 AGAQAVARASTKVEAVPGGPGREPEGLLQAGG--QEAEELLQEGLKPVLEECDN      
       .: :: :.::...          :.. .:: .  . . . .: :: :...          
CCDS14 SGRQARAEASVSA----------PQATVQARSFSDSSPQTIQGGLPPLVKRRRLLGSEST
             360                 370       380       390       400 

CCDS14 RGEDHGQATYPKAENQTPGREGPQAAGEELGNEAGAGAMSHPKPWET
             410       420       430       440        

>>CCDS9818.1 PNMA1 gene_id:9240|Hs108|chr14               (353 aa)
 initn: 710 init1: 309 opt: 883  Z-score: 981.7  bits: 190.3 E(32554): 2.3e-48
Smith-Waterman score: 883; 44.1% identity (72.4% similar) in 340 aa overlap (1-329:1-335)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAVTMLQDWCRWMGVNARRGLLILGIPEDCDDAEFQESLEAALRPMGHFTVLGKAFREED
       ::.:.:.:::: : ::..:.::. ::: .::.::..:.:.::. :.  . .::. : .:.
CCDS98 MAMTLLEDWCRGMDVNSQRALLVWGIPVNCDEAEIEETLQAAM-PQVSYRMLGRMFWREE
               10        20        30        40         50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 NATAALVELDREVNYALVPREIPGTGGPWNVVFVPRCSGEEFLGLGRVFHFPEQEGQMVE
       :: :::.::   :.:: .:::.:: :: :.:.: :  :  :::   :.  :  .::  :.
CCDS98 NAKAALLELTGAVDYAAIPREMPGKGGVWKVLFKPPTSDAEFLE--RLHLFLAREGWTVQ
      60        70        80        90       100         110       

                     130         140       150       160       170 
pF1KE0 SVAGALGV-------GLRRVCWLRS--IGQAVQPWVEAVRCQSLGVFSGRDQPAPGEESF
       .:: .::        : .    . .  . ...:: ::..  . : .::::: :.::::.:
CCDS98 DVARVLGFQNPTPTPGPEMPAEMLNYILDNVIQPLVESIWYKRLTLFSGRDIPGPGEETF
       120       130       140       150       160       170       

             180       190       200       210       220       230 
pF1KE0 EVWLDHTTEMLHVWQGVSERERRRRLLEGLRGTALQLVHALLAENPARTAQDCLAALAQV
       . ::.::.:.:. :: ::. :.::::.:.::: : .... : ..::: :. .:: :: ::
CCDS98 DPWLEHTNEVLEEWQ-VSDVEKRRRLMESLRGPAADVIRILKSNNPAITTAECLKALEQV
       180       190        200       210       220       230      

             240       250       260       270       280       290 
pF1KE0 FGDNESQATIRVKCLTAQQQSGERLSAFVLRLEVLLQKAMEKEALARASADRVRLRQMLT
       ::. ::.   ..: :.. :. ::.:::.:.::: ::::..:: :. . .....::.:...
CCDS98 FGSVESSRDAQIKFLNTYQNPGEKLSAYVIRLEPLLQKVVEKGAIDKDNVNQARLEQVIA
        240       250       260       270       280       290      

             300       310         320       330       340         
pF1KE0 RAHLTEPLDEALRKLRMAGR--SPSFLEMLGLVRESEAWEASLARSVRAQTQEGAGARAG
        :. .  . . :  :  ::.  .:.....:  .:: :: :                    
CCDS98 GANHSGAIRRQLW-LTGAGEGPAPNLFQLLVQIREEEAKEEEEEAEATLLQLGLEGHF  
        300        310       320       330       340       350     

     350       360       370       380       390         
pF1KE0 AQAVARASTKVEAVPGGPGREPEGLLQAGGQEAEELLQEGLKPVLEECDN

>>CCDS65344.1 PNMA3 gene_id:29944|Hs108|chrX              (455 aa)
 initn: 1009 init1: 425 opt: 805  Z-score: 893.6  bits: 174.4 E(32554): 1.9e-43
Smith-Waterman score: 993; 44.8% identity (70.1% similar) in 375 aa overlap (1-364:1-367)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAVTMLQDWCRWMGVNARRGLLILGIPEDCDDAEFQESLEAALRPMGHFTVLGKAFREED
       : .:.::::::   .:.:: .::::::::: . ::.:.:. : : .:.. :.:. ::.:.
CCDS65 MPLTLLQDWCRGEHLNTRRCMLILGIPEDCGEDEFEETLQEACRHLGRYRVIGRMFRREE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 NATAALVELDREVNYALVPREIPGTGGPWNVVFVPRCSGEEFLGLGRVFHFPEQEGQMVE
       :: : :.:: ....:::.:::::: ::::.:.  :: :  :::.  :. .: :.: . : 
CCDS65 NAQAILLELAQDIDYALLPREIPGKGGPWEVIVKPRNSDGEFLN--RLNRFLEEERRTVS
               70        80        90       100         110        

              130                  140       150       160         
pF1KE0 SVAGALGVGLR----RVC-------WLRSIGQAVQPWVEAVRCQSLGVFSGRDQPAPGEE
       ..  .::        ::        : ...: :::: .: .  . : ::::     ::  
CCDS65 DMNRVLGSDTNCSAPRVTISPEFWTWAQTLGAAVQPLLEQMLYRELRVFSGNTISIPGAL
      120       130       140       150       160       170        

     170       180       190       200       210       220         
pF1KE0 SFEVWLDHTTEMLHVWQGVSERERRRRLLEGLRGTALQLVHALLAENPARTAQDCLAALA
       .:..::.::::::..:: : : :.::::.: ::: :::.: .: : : . :...::::: 
CCDS65 AFDAWLEHTTEMLQMWQ-VPEGEKRRRLMECLRGPALQVVSGLRASNASITVEECLAALQ
      180       190        200       210       220       230       

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE0 QVFGDNESQATIRVKCLTAQQQSGERLSAFVLRLEVLLQKAMEKEALARASADRVRLRQM
       ::::  ::.   .::   : :..::..:.:::::: :::.:.:.....: .....::...
CCDS65 QVFGPVESHKIAQVKLCKAYQEAGEKVSSFVLRLEPLLQRAVENNVVSRRNVNQTRLKRV
       240       250       260       270       280       290       

     290       300       310       320       330       340         
pF1KE0 LTRAHLTEPLDEALRKLRMAGRSPSFLEMLGLVRESEAWEASLARSVRAQTQEGAGARAG
       :. : : . : . :. ...  . :.:: .. :.:: : :::.:. . : . .   : ...
CCDS65 LSGATLPDKLRDKLKLMKQRRKPPGFLALVKLLREEEEWEATLGPD-RESLE---GLEVA
       300       310       320       330       340           350   

     350       360       370       380       390                   
pF1KE0 AQAVARASTKVEAVPGGPGREPEGLLQAGGQEAEELLQEGLKPVLEECDN          
        .  ::  : : :::                                             
CCDS65 PRPPARI-TGVGAVPLPASGNSFDARPSQGYRRRRGRGQHRRGGVARAGSRGSRKRKRHT
           360        370       380       390       400       410  

>>CCDS35435.2 PNMA3 gene_id:29944|Hs108|chrX              (463 aa)
 initn: 1009 init1: 425 opt: 805  Z-score: 893.5  bits: 174.4 E(32554): 1.9e-43
Smith-Waterman score: 993; 44.8% identity (70.1% similar) in 375 aa overlap (1-364:1-367)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAVTMLQDWCRWMGVNARRGLLILGIPEDCDDAEFQESLEAALRPMGHFTVLGKAFREED
       : .:.::::::   .:.:: .::::::::: . ::.:.:. : : .:.. :.:. ::.:.
CCDS35 MPLTLLQDWCRGEHLNTRRCMLILGIPEDCGEDEFEETLQEACRHLGRYRVIGRMFRREE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 NATAALVELDREVNYALVPREIPGTGGPWNVVFVPRCSGEEFLGLGRVFHFPEQEGQMVE
       :: : :.:: ....:::.:::::: ::::.:.  :: :  :::.  :. .: :.: . : 
CCDS35 NAQAILLELAQDIDYALLPREIPGKGGPWEVIVKPRNSDGEFLN--RLNRFLEEERRTVS
               70        80        90       100         110        

              130                  140       150       160         
pF1KE0 SVAGALGVGLR----RVC-------WLRSIGQAVQPWVEAVRCQSLGVFSGRDQPAPGEE
       ..  .::        ::        : ...: :::: .: .  . : ::::     ::  
CCDS35 DMNRVLGSDTNCSAPRVTISPEFWTWAQTLGAAVQPLLEQMLYRELRVFSGNTISIPGAL
      120       130       140       150       160       170        

     170       180       190       200       210       220         
pF1KE0 SFEVWLDHTTEMLHVWQGVSERERRRRLLEGLRGTALQLVHALLAENPARTAQDCLAALA
       .:..::.::::::..:: : : :.::::.: ::: :::.: .: : : . :...::::: 
CCDS35 AFDAWLEHTTEMLQMWQ-VPEGEKRRRLMECLRGPALQVVSGLRASNASITVEECLAALQ
      180       190        200       210       220       230       

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE0 QVFGDNESQATIRVKCLTAQQQSGERLSAFVLRLEVLLQKAMEKEALARASADRVRLRQM
       ::::  ::.   .::   : :..::..:.:::::: :::.:.:.....: .....::...
CCDS35 QVFGPVESHKIAQVKLCKAYQEAGEKVSSFVLRLEPLLQRAVENNVVSRRNVNQTRLKRV
       240       250       260       270       280       290       

     290       300       310       320       330       340         
pF1KE0 LTRAHLTEPLDEALRKLRMAGRSPSFLEMLGLVRESEAWEASLARSVRAQTQEGAGARAG
       :. : : . : . :. ...  . :.:: .. :.:: : :::.:. . : . .   : ...
CCDS35 LSGATLPDKLRDKLKLMKQRRKPPGFLALVKLLREEEEWEATLGPD-RESLE---GLEVA
       300       310       320       330       340           350   

     350       360       370       380       390                   
pF1KE0 AQAVARASTKVEAVPGGPGREPEGLLQAGGQEAEELLQEGLKPVLEECDN          
        .  ::  : : :::                                             
CCDS35 PRPPARI-TGVGAVPLPASGNSFDARPSQGYRRRRGRGQHRRGGVARAGSRGSRKRKRHT
           360        370       380       390       400       410  

>>CCDS34868.1 PNMA2 gene_id:10687|Hs108|chr8              (364 aa)
 initn: 865 init1: 382 opt: 552  Z-score: 615.1  bits: 122.5 E(32554): 6.1e-28
Smith-Waterman score: 869; 42.5% identity (70.4% similar) in 358 aa overlap (1-345:1-354)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAVTMLQDWCRWMGVNARRGLLILGIPEDCDDAEFQESLEAALRPMGHFTVLGKAFREED
       ::...:.:::: :.:. ...:.. ::: : ..::.:: :. .:. .:.. .::: ::...
CCDS34 MALALLEDWCRIMSVDEQKSLMVTGIPADFEEAEIQEVLQETLKSLGRYRLLGKIFRKQE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 NATAALVELDREVNYALVPREIPGTGGPWNVVFVPRCSGEEFLGLGRVFHFPEQEGQMVE
       ::.:.:.:: .... . .: :. : :: :.:.:    .  :::   :.  : :.::: : 
CCDS34 NANAVLLELLEDTDVSAIPSEVQGKGGVWKVIFKTPNQDTEFLE--RLNLFLEKEGQTVS
               70        80        90       100         110        

                 130             140           150       160       
pF1KE0 SVAGALG---VGLRRV-C-----WLRSIGQAV----QPWVEAVRCQSLGVFSGRDQPAPG
       ..  :::   :.   : :       . .:::.    :: .  .: ..: ::::   ::: 
CCDS34 GMFRALGQEGVSPATVPCISPELLAHLLGQAMAHAPQPLLP-MRYRKLRVFSGSAVPAPE
      120       130       140       150        160       170       

       170       180       190       200       210       220       
pF1KE0 EESFEVWLDHTTEMLHVWQGVSERERRRRLLEGLRGTALQLVHALLAENPARTAQDCLAA
       ::::::::...::... :  :.: :..: : :.::: ::.:.: . :.::. ....:: :
CCDS34 EESFEVWLEQATEIVKEWP-VTEAEKKRWLAESLRGPALDLMHIVQADNPSISVEECLEA
       180       190        200       210       220       230      

       230       240       250       260       270       280       
pF1KE0 LAQVFGDNESQATIRVKCLTAQQQSGERLSAFVLRLEVLLQKAMEKEALARASADRVRLR
       . ::::. ::. : .:. : . :. ::..::.:::::.::..:.::.:. :  ::.:::.
CCDS34 FKQVFGSLESRRTAQVRYLKTYQEEGEKVSAYVLRLETLLRRAVEKRAIPRRIADQVRLE
        240       250       260       270       280       290      

       290       300       310       320       330       340       
pF1KE0 QMLTRAHLTEPLDEALRKLRMAGRSPSFLEMLGLVRESEAWEASLARSVRAQTQEGAGAR
       :... : :.. :   ::.:.  :  :::::.. ..:: :  :::.      . .:  :  
CCDS34 QVMAGATLNQMLWCRLRELKDQGPPPSFLELMKVIREEEEEEASFENESIEEPEERDGYG
        300       310       320       330       340       350      

       350       360       370       380       390         
pF1KE0 AGAQAVARASTKVEAVPGGPGREPEGLLQAGGQEAEELLQEGLKPVLEECDN
                                                           
CCDS34 RWNHEGDD                                            
        360                                                

>>CCDS65304.1 ZCCHC18 gene_id:644353|Hs108|chrX           (403 aa)
 initn: 453 init1: 257 opt: 466  Z-score: 519.2  bits: 104.9 E(32554): 1.3e-22
Smith-Waterman score: 470; 37.6% identity (67.5% similar) in 234 aa overlap (136-357:26-258)

         110       120       130       140       150       160     
pF1KE0 GRVFHFPEQEGQMVESVAGALGVGLRRVCWLRSIGQAVQPWVEAVRCQSLGVFSGRDQPA
                                     :::.:... : :  .  ... .::::  ::
CCDS65      MASITACVGNSRQQNAPLPPWAHSMLRSLGRSLCPLVVKMAERNMKLFSGRVVPA
                    10        20        30        40        50     

         170       180       190       200       210       220     
pF1KE0 PGEESFEVWLDHTTEMLHVWQGVSERERRRRLLEGLRGTALQLVHALLAENPARTAQDCL
        :.:.:: :: ...:.:  :. .::.:. .::.. ::: : .... : : ::  .. : :
CCDS65 QGKETFENWLIQVNEVLPDWS-MSEEEKLKRLMKTLRGPAREVMRLLQAANPNLSVADFL
          60        70         80        90       100       110    

         230       240       250       260       270       280     
pF1KE0 AALAQVFGDNESQATIRVKCLTAQQQSGERLSAFVLRLEVLLQKAMEKEALARASADRVR
        :.  :::..::..: . : ... : .::. : .:.:::: ::.:..   ::. .:...:
CCDS65 RAMKLVFGESESSVTAHGKFFNTLQAQGEKASLYVIRLEVQLQNAIQAGILAEKDANQTR
          120       130       140       150       160       170    

         290       300        310           320       330       340
pF1KE0 LRQMLTRAHLTEPLDEALRKL-RMAG----RSPSFLEMLGLVRESEAWEASLARSVRAQT
       :.:.:  :.:.. :   :..: :: .    : :.:::.. ..:: : :. .. .  : . 
CCDS65 LQQLLLGAELNRDLRFRLKHLLRMYANKQERLPNFLELIKMIREEEDWDDAFIKRKRPKR
          180       190       200       210       220       230    

                     350       360       370       380       390   
pF1KE0 QEGAGARA-------GAQAVARASTKVEAVPGGPGREPEGLLQAGGQEAEELLQEGLKPV
       .:    ::       ::: .: .:                                    
CCDS65 SEPIMERAASPVAFQGAQPIAISSADCNCNVIEIDDTLDDSDEDVILVVSLYPSLTPTGA
          240       250       260       270       280       290    

>>CCDS14574.1 ZCCHC12 gene_id:170261|Hs108|chrX           (402 aa)
 initn: 468 init1: 259 opt: 465  Z-score: 518.1  bits: 104.7 E(32554): 1.6e-22
Smith-Waterman score: 465; 36.1% identity (69.1% similar) in 230 aa overlap (136-360:26-254)

         110       120       130       140       150       160     
pF1KE0 GRVFHFPEQEGQMVESVAGALGVGLRRVCWLRSIGQAVQPWVEAVRCQSLGVFSGRDQPA
                                     :::.:... : . ..  ... .::::  ::
CCDS14      MASIIARVGNSRRLNAPLPPWAHSMLRSLGRSLGPIMASMADRNMKLFSGRVVPA
                    10        20        30        40        50     

         170       180       190       200       210       220     
pF1KE0 PGEESFEVWLDHTTEMLHVWQGVSERERRRRLLEGLRGTALQLVHALLAENPARTAQDCL
        :::.:: :: ... .:  :. .::.:. .::.. ::: : .....: : ::  .. : :
CCDS14 QGEETFENWLTQVNGVLPDWN-MSEEEKLKRLMKTLRGPAREVMRVLQATNPNLSVADFL
          60        70         80        90       100       110    

         230       240       250       260       270       280     
pF1KE0 AALAQVFGDNESQATIRVKCLTAQQQSGERLSAFVLRLEVLLQKAMEKEALARASADRVR
        :.  :::..::..: . : ... : .::. : .:.:::: ::.:..   .:. .:.:.:
CCDS14 RAMKLVFGESESSVTAHGKFFNTLQAQGEKASLYVIRLEVQLQNAIQAGIIAEKDANRTR
          120       130       140       150       160       170    

         290       300        310           320       330       340
pF1KE0 LRQMLTRAHLTEPLDEALRK-LRMAG----RSPSFLEMLGLVRESEAWEASLARSVRAQT
       :.:.:  ..:.. :   :.  ::: .    : :.:::.. .::: : :. .. .  : . 
CCDS14 LQQLLLGGELSRDLRLRLKDFLRMYANEQERLPNFLELIRMVREEEDWDDAFIKRKRPKR
          180       190       200       210       220       230    

              350       360       370       380       390          
pF1KE0 QEGAGARAGAQAVARASTKVEAVPGGPGREPEGLLQAGGQEAEELLQEGLKPVLEECDN 
       .:.   :: . .. ..:  .                                        
CCDS14 SESMVERAVSPVAFQGSPPIVIGSADCNVIEIDDTLDDSDEDVILVESQDPPLPSWGAPP
          240       250       260       270       280       290    

>>CCDS9908.1 MOAP1 gene_id:64112|Hs108|chr14              (351 aa)
 initn: 777 init1: 347 opt: 375  Z-score: 419.4  bits: 86.3 E(32554): 4.9e-17
Smith-Waterman score: 818; 41.3% identity (70.7% similar) in 341 aa overlap (1-329:1-336)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAVTMLQDWCRWMGVNARRGLLILGIPEDCDDAEFQESLEAALRPMGHFTVLGKAFREED
       :.. .:.:::: : .: :..::: :: ..:. ::..:.:.:.: :.:.. .::. ::...
CCDS99 MTLRLLEDWCRGMDMNPRKALLIAGISQSCSVAEIEEALQAGLAPLGEYRLLGRMFRRDE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 NATAALVELDREVNYALVPREIPGTGGPWNVVFVPRCSGEEFLGLGRVFHFPEQEGQMVE
       :  .::: :  :...::::.:::: :: : :.: :    . ::.  :. .:   ::. : 
CCDS99 NRKVALVGLTAETSHALVPKEIPGKGGIWRVIFKPPDPDNTFLS--RLNEFLAGEGMTVG
               70        80        90       100         110        

                       130       140          150       160        
pF1KE0 SVAGALG---------VGLRRVCWLRSIGQAV---QPWVEAVRCQSLGVFSGRDQPAPGE
        .. :::          :.    :   ..::.   :: .. .. ..: :::::..: :::
CCDS99 ELSRALGHENGSLDPEQGMIPEMWAPMLAQALEALQPALQCLKYKKLRVFSGRESPEPGE
      120       130       140       150       160       170        

      170       180       190       200       210       220        
pF1KE0 ESFEVWLDHTTEMLHVWQGVSERERRRRLLEGLRGTALQLVHALLAENPARTAQDCLAAL
       : :  :. :::.:...:: : . :.::::::.::: ::.....:  .::  :...:: ::
CCDS99 EEFGRWMFHTTQMIKAWQ-VPDVEKRRRLLESLRGPALDVIRVLKINNPLITVDECLQAL
      180       190        200       210       220       230       

      230       240       250       260       270       280        
pF1KE0 AQVFGDNESQATIRVKCLTAQQQSGERLSAFVLRLEVLLQKAMEKEALARASADRVRLRQ
        .::: ...   ..:: ::. :.. :.:::.::::: :::: ... :. : .....:: :
CCDS99 EEVFGVTDNPRELQVKYLTTYQKDEEKLSAYVLRLEPLLQKLVQRGAIERDAVNQARLDQ
       240       250       260       270       280       290       

      290       300       310       320       330       340        
pF1KE0 MLTRAHLTEPLDEALRKLRMAGRSPSFLEMLGLVRESEAWEASLARSVRAQTQEGAGARA
       ... : . . . . : .:   : .:.::..: :... :: :                   
CCDS99 VIAGA-VHKTIRREL-NLPEDGPAPGFLQLLVLIKDYEAAEEEEALLQAILEGNFT    
       300        310        320       330       340       350     

      350       360       370       380       390         
pF1KE0 GAQAVARASTKVEAVPGGPGREPEGLLQAGGQEAEELLQEGLKPVLEECDN

>>CCDS46124.1 PNMAL1 gene_id:55228|Hs108|chr19            (378 aa)
 initn: 376 init1: 349 opt: 370  Z-score: 413.3  bits: 85.3 E(32554): 1.1e-16
Smith-Waterman score: 370; 33.2% identity (60.6% similar) in 226 aa overlap (1-217:5-215)

                   10        20        30        40        50      
pF1KE0     MAVTMLQDWCRWMGVNARRGLLILGIPEDCDDAEFQESLEAALRPMGHFTVLGKAF
           ::...:.:::: : :. .:.::. :::::: .::..:.:...: :.: . ::.: :
CCDS46 MSKTMAMNLLEDWCRGMEVDIHRSLLVTGIPEDCGQAEIEETLNGVLSPLGPYRVLNKIF
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KE0 REEDNATAALVELDREVNYALVPREIPGTGGPWNVVFVPRCSGEEFLGLGRVFHFPEQEG
        .:.:. :::.:. . :: . .:::.:: :: : ::     .  :::    . .: . ::
CCDS46 VREENVKAALIEVGEGVNLSTIPREFPGRGGVWRVVCRDPTQDAEFLK--NLNEFLDAEG
               70        80        90       100         110        

        120       130                140       150       160       
pF1KE0 QMVESVAGALGVGLRRVC---------WLRSIGQAVQPWVEAVRCQSLGVFSGRDQPAPG
       .  :.:.  : ..   .          : ...:  .   :. . :..  . : :.. : .
CCDS46 RTWEDVVRLLQLNHPTLSQNQHQPPENWAEALGVLLGAVVQIIFCMDAEIRS-REE-ARA
      120       130       140       150       160       170        

       170       180       190       200       210       220       
pF1KE0 EESFEVWLDHTTEMLHVWQGVSERERRRRLLEGLRGTALQLVHALLAENPARTAQDCLAA
       .:. :       : . .:  .. :. ...      : : ..  :: ::.:          
CCDS46 QEAAEF------EEMAAWALAAGRKVKKE-----PGLAAEVGSALKAETPNNWNATEDQH
        180             190            200       210       220     

       230       240       250       260       270       280       
pF1KE0 LAQVFGDNESQATIRVKCLTAQQQSGERLSAFVLRLEVLLQKAMEKEALARASADRVRLR
                                                                   
CCDS46 EPTKPLVRRAGAKSRSRRKKQKKNSRQEAVPWKKPKGINSNSTANLEDPEVGDAESMAIS
         230       240       250       260       270       280     




399 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 01:37:08 2016 done: Fri Nov  4 01:37:09 2016
 Total Scan time:  3.070 Total Display time:  0.030

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com