Result of FASTA (ccds) for pF1KE1081
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1081, 1493 aa
  1>>>pF1KE1081 1493 - 1493 aa - 1493 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2609+/-0.00122; mu= 4.6047+/- 0.073
 mean_var=227.4480+/-45.910, 0's: 0 Z-trim(108.5): 62  B-trim: 12 in 1/50
 Lambda= 0.085042
 statistics sampled from 10173 (10225) to 10173 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.658), E-opt: 0.2 (0.314), width:  16
 Scan time:  4.900

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1812.1 PLEKHH2 gene_id:130271|Hs108|chr2       (1493) 9831 1220.9       0
CCDS45128.1 PLEKHH1 gene_id:57475|Hs108|chr14      (1364) 3938 497.8  9e-140


>>CCDS1812.1 PLEKHH2 gene_id:130271|Hs108|chr2            (1493 aa)
 initn: 9831 init1: 9831 opt: 9831  Z-score: 6529.7  bits: 1220.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9831; 99.6% identity (99.9% similar) in 1493 aa overlap (1-1493:1-1493)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MAELSEPEGPVDWKERCVALESQLMKFRVQASKIRELLAEKMQQLERQVIDAERQAEKAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MAELSEPEGPVDWKERCVALESQLMKFRVQASKIRELLAEKMQQLERQVIDAERQAEKAF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 QQVQVMEDKLKAANIQTSESETRLYNKCQDLESLIQEKDDVIQNLELQLEEQKQIRIQEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 QQVQVMEDKLKAANIQTSESETRLYNKCQDLESLIQEKDDVIQNLELQLEEQKQIRIQEA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 KIIEEKAAKIKEWVTVKLNELELENQNLRLINQNQTEEIRTMQSKLQEVQGKKSSTVSTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KIIEEKAAKIKEWVTVKLNELELENQNLRLINQNQTEEIRTMQSKLQEVQGKKSSTVSTL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 KLSEGQRLSSLTFGCFLSRARSPPQVVKSEEMSKISSKEPEFTEGKDMEEMEIPEKSVDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KLSEGQRLSSLTFGCFLSRARSPPQVVKSEEMSKISSKEPEFTEGKDMEEMEIPEKSVDN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 QVLENNRGQRTLHQTPCGSEQNRKTRTSFATDGGISQNSGAPVSDWSSDEEDGSKGRSKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 QVLENNRGQRTLHQTPCGSEQNRKTRTSFATDGGISQNSGAPVSDWSSDEEDGSKGRSKS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 RCTSTLSSHTSEEGVQCSRMGSEMYLTASDDSSSIFEEETFGIKRPEHKKLYSWQQEAQW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 RCTSTLSSHTSEEGVQCSRMGSEMYLTASDDSSSIFEEETFGIKRPEHKKLYSWQQEAQW
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 KALNSPLGKGNSELSKKEQDSSSDELNKKFQSQRLDYSSSSSEANTPSPILTPALMPKHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KALNSPLGKGNSELSKKEQDSSSDELNKKFQSQRLDYSSSSSEANTPSPILTPALMPKHP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 NSLSGKGTQLVPSSHLPPPKLRIPNVFSISAALAKRHLSQPQLSSDRMFGTNRNAISMIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 NSLSGKGTQLVPSSHLPPPKLRIPNVFSISVALAKRHLSQPQLSSDRMFGTNRNAISMIR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 PLRPQETDLDLVDGDSTEVLENMDTSCDDGLFSYDSLDSPNSDDQEHCDSAKKVAYSKPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 PLRPQETDLDLVDGDSTEVLENMDTSCDDGLFSYDSLDSPNSDDQEHCDSAKKVAYSKPP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE1 TPPLHRFPSWESRIYAVAKSGIRMSEAFNMESVNKNSAATLSYTTSGLYTSLIYKNMTTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 TPPLHRFPSWESRIYAVAKSGIRMSEAFNMESVNKNSAATLSYTTSGLYTSLIYKNMTTP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE1 VYTTLKGKATQISSSPFLDDSSGSEEEDSSRSSSRTSESDSRSRSGPGSPRAMKRGVSLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 VYTTLKGKATQISSSPFLDDSSGSEEEDSSRSSSRTSESDSRSRSGPGSPRAMKRGVSLS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE1 SVASESDYAIPPDAYSTDTEYSQPEQKLPKTCSSSSDNGKNEPLEKSGYLLKMSGKVKSW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 SVASESDYAIPPDAYSTDTEYSQPEQKLPKTCSSSSDNGKNEPLEKSGYLLKMSGKVKSW
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE1 KRRWFVLKGCELPYYKSPSDVIRKPQGHIELSASCSILRGDNKQTVQLTTEKHTYYLTAD
       ::::::::: :: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KRRWFVLKGGELLYYKSPSDVIRKPQGHIELSASCSILRGDNKQTVQLTTEKHTYYLTAD
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE1 SPNILEEWIKVLQNALRVQAANPLSLQPEGKPTMKGLLTKVKHGYSKRVWCTLIGKTLYY
       ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 SPNILEEWIKVLQNVLRVQAANPLSLQPEGKPTMKGLLTKVKHGYSKRVWCTLIGKTLYY
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE1 FRSQEDKFPLGQIKLWEVKVEEVDRSCDSDEDYEASGRSLLSTHYTIVIHPKDQGPTYLL
       :::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 FRSQEDKFPLGQIKLWEAKVEEVDRSCDSDEDYEASGRSLLSTHYTIVIHPKDQGPTYLL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE1 IGSKHEKDTWLYHLTVAAGSNNVNVGSEFEQLVCKLLNIDGEPSSQIWRHPTLCHSKEGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 IGSKHEKDTWLYHLTVAAGSNNVNVGSEFEQLVCKLLNIDGEPSSQIWRHPTLCHSKEGI
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE1 ISPLTTLPSEALQTEAIKLFKTCQLFINAAVDSPAIDYHISLAQSALQICLTHPELQNEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 ISPLTTLPSEALQTEAIKLFKTCQLFINAAVDSPAIDYHISLAQSALQICLTHPELQNEI
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE1 CCQLIKQTRRRQPQNQPGPLQGWQLLALCVGLFLPHHPFLWLLRLHLKRNADSRTEFGKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 CCQLIKQTRRRQPQNQPGPLQGWQLLALCVGLFLPHHPFLWLLRLHLKRNADSRTEFGKY
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE1 AIYCQRCVERTQQNGDREARPSRMEILSTLLRNPYHHSLPFSIPVHFMNGIYQVVGFDAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 AIYCQRCVERTQQNGDREARPSRMEILSTLLRNPYHHSLPFSIPVHFMNGIYQVVGFDAS
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE1 TTVEEFLNTLNQDTGMRKPAQSGFALFTDDPSGRDLEHCLQGNIKICDIISKWEQASKEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 TTVEEFLNTLNQDTGMRKPAQSGFALFTDDPSGRDLEHCLQGNIKICDIISKWEQASKEQ
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE1 QPGKCEGTRTVRLTYKNRLYFSVQARGETDREKLLLMYQTNDQIINGLFPLNKDLALEMA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 QPGKCEGTRTVRLTYKNRLYFSVQARGETDREKLLLMYQTNDQIINGLFPLNKDLALEMA
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE1 ALLSQVEIGDFERPFSTPAGHVTNQCKVNQTLKQVIEKFYPKRYRDGCSEEQLRQLCQRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 ALLSQVEIGDFERPFSTPAGHVTNQCKVNQTLKQVIEKFYPKRYRDGCSEEQLRQLCQRL
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE1 STRWMALRGHSAADCVRIYLTVARKWPFFGAKLFLAKPITPSSLGSTFLWLAVHEDGLSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 STRWMALRGHSAADCVRIYLTVARKWPFFGAKLFLAKPITPSSLGSTFLWLAVHEDGLSL
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE1 LEYNSMRLIVSYVYKSLMTFGGYQDDFMVVINNTHSKDKPTEKLLFAMAKPEILEITLLI
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS18 LEYNSMRLIVSYVYKSLMTFGGYQDDFMVVINNTHSKDKPTEKLLFAMAKPKILEITLLI
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490   
pF1KE1 ASYINNFHQQKAAFHHLSAPALLSAQTRGPQARMMGSQPLLSSSRPTKGPTLL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 ASYINNFHQQKAAFHHLSAPALLSAQTRGPQARMMGSQPLLSSSRPTKGPTLL
             1450      1460      1470      1480      1490   

>>CCDS45128.1 PLEKHH1 gene_id:57475|Hs108|chr14           (1364 aa)
 initn: 4048 init1: 1483 opt: 3938  Z-score: 2622.8  bits: 497.8 E(32554): 9e-140
Smith-Waterman score: 4334; 48.7% identity (71.8% similar) in 1512 aa overlap (1-1493:1-1364)

                10        20        30        40        50         
pF1KE1 MAELS-EPEGPVDWKERCVALESQLMKFRVQASKIRELLAEKMQQLERQVIDAERQAEKA
       ::::. :  . :::..::..::.::..::.::::::::::.:::.::.....::..::.:
CCDS45 MAELKVEAPASVDWQKRCLTLETQLFRFRLQASKIRELLADKMQELEQRLLEAEQRAENA
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE1 FQQVQVMEDKLKAANIQTSESETRLYNKCQDLESLIQEKDDVIQNLELQLEEQKQIRIQE
         :: :::.:.: .:... .::  :. : :.: . :. ::..:..:: :::.:::.: .:
CCDS45 ETQVGVMEEKVKLSNLKNVDSEGSLHRKYQELLKAIKGKDELISQLEAQLEKQKQMRAEE
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE1 AKIIEEKAAKIKEWVTVKLNELELENQNLRLINQNQTEEIRTMQSKLQEVQGKKSSTVST
       :: ..:::::::::::.:: .::.:::.:.  ::  .:.. ..:. :. .:         
CCDS45 AKTVQEKAAKIKEWVTLKLAKLEMENQHLKSHNQRLVEQVGSLQDALEAIQ---------
              130       140       150       160       170          

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE1 LKLSEGQRLSSLTFGCFLSRARSPPQVVKSEEMSKISSKEPEFTEGKDMEEMEIPEKSVD
         .. ...:    .:              . :.... : ::       .. :        
CCDS45 --IAPSRKLLVPPYG--------------AAEQDSVPS-EP------GIQPM--------
               180                     190              200        

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE1 NQVLENNRGQRTLHQTPCGSEQNRKTRTSFATDGGISQNSGAPVSDWSSDEEDGSKGRSK
               :: .      ::. .    . .: . :  :.. . ::. .:  ::.:     
CCDS45 --------GQDS------GSQAQGLKAAVLAPSPGALQSKDS-VSEAASPLEDSS-----
                            210       220        230       240     

     300       310       320       330       340          350      
pF1KE1 SRCTSTLSSHTSEEGVQCSRMGSEMYLTASDDSSSIFEEETFGIKRPEHK---KLYSWQ-
          .::.  :..:  :. . .  ..                 : . : :.   :: ... 
CCDS45 ---SSTV--HSGET-VEAKPLQPHL-----------------GRESPPHQPCMKLLTFRC
                    250                        260       270       

         360       370       380       390       400       410     
pF1KE1 QEAQWKALNSPLGKGNSELSKKEQDSSSDELNKKFQSQRLDYSSSSSEANTPSPILTPAL
       . :.:       :.:                     .::                   ..
CCDS45 SSASW-------GEG------------------LVTAQR-------------------GM
       280                                290                      

         420       430       440       450       460          470  
pF1KE1 MPKHPNSLSGKGTQLVPSSHLPPPKLRIPNVFSISAALAKRHLSQPQLSSD---RMFGTN
       .:   .:    :    :.: :  ::.: :..   :  ::::: ::::..     :. . .
CCDS45 LPGTKTSAREGG----PGSSLTLPKVRAPGTPRDSIQLAKRHHSQPQVGHGHFGRVVNIE
           300           310       320       330       340         

            480       490       500       510       520       530  
pF1KE1 RNAISMIRPLRPQETDLDLVDGDSTEVLENMDTSCDDGLFSYDSLDSPNSDDQEHCDSAK
        .:.: ..:    : .    . .  : .: :.     :  . .  .::..   :     .
CCDS45 TEAFSALHPSGLPELESRARSREEPEKME-MEEPPPAG--KNEERESPKALGAE----LE
     350       360       370        380         390       400      

             540       550       560       570       580       590 
pF1KE1 KVAY-SKPPTPPLHRFPSWESRIYAVAKSGIRMSEAFNMESVNKNSAATLSYTTSGLYTS
       .:   .::::::::.: :::::::::: ::.:.:.     ..   ...  . .. : ...
CCDS45 EVELGNKPPTPPLHQFSSWESRIYAVATSGMRLSDMSPRSNTACCASSPPALVSPGSFSG
            410       420       430       440       450       460  

             600       610       620       630         640         
pF1KE1 LIYKNMTTPVYTTLKGKATQISSSPFLDDSSGSEEEDSSRSSSRTS--ESDSRSRSGPGS
       :.:::.:.::::.:::.:::::. ::.:.::::... ::..: : :   :.::. :: ::
CCDS45 LVYKNVTVPVYTALKGRATQISNMPFMDESSGSDDDCSSQASFRISVPSSESRKTSGLGS
            470       480       490       500       510       520  

     650       660       670       680       690         700       
pF1KE1 PRAMKRGVSLSSVASESDYAIPPDAYSTDTEYSQPEQKLPKTCSSSSDN-G-KNEPLEKS
       :::.:::::.::..::.:::::::: : :..::.::.:: .: : :.:. :  .: ::::
CCDS45 PRAIKRGVSMSSLSSEGDYAIPPDACSLDSDYSEPEHKLQRTSSYSTDGLGLGGESLEKS
            530       540       550       560       570       580  

       710       720       730       740       750       760       
pF1KE1 GYLLKMSGKVKSWKRRWFVLKGCELPYYKSPSDVIRKPQGHIELSASCSILRGDNKQTVQ
       ::::::...::.::::::::.  .. ::::::::::::::...:.. :.:.::...:: :
CCDS45 GYLLKMGSQVKTWKRRWFVLRQGQIMYYKSPSDVIRKPQGQVDLNSRCQIVRGEGSQTFQ
            590       600       610       620       630       640  

       770       780       790       800       810        820      
pF1KE1 LTTEKHTYYLTADSPNILEEWIKVLQNALRVQAANPLSLQPEG-KPTMKGLLTKVKHGYS
       : .::.:::::::::..:::::.:::. :.:::..: .:   : :::.:: :::::::.:
CCDS45 LISEKKTYYLTADSPSLLEEWIRVLQSLLKVQATGPPALLRGGTKPTVKGWLTKVKHGHS
            650       660       670       680       690       700  

        830       840       850       860       870        880     
pF1KE1 KRVWCTLIGKTLYYFRSQEDKFPLGQIKLWEVKVEEVDRSCDSDEDYEASG-RSLLSTHY
       : :::.:.:: .::.::.::: ::: . . ....:::::::::::::::.: : :::.: 
CCDS45 KVVWCALVGKIFYYYRSHEDKRPLGCLPVRDAHIEEVDRSCDSDEDYEAGGTRRLLSSHC
            710       720       730       740       750       760  

         890       900       910       920       930       940     
pF1KE1 TIVIHPKDQGPTYLLIGSKHEKDTWLYHLTVAAGSNNVNVGSEFEQLVCKLLNIDGEPSS
       :.:::: ...:::::::.::::::::::::::::.....::. .:::. ::.. .:.:.:
CCDS45 TLVIHPTEHSPTYLLIGTKHEKDTWLYHLTVAAGGSSAKVGTAYEQLIGKLMDGEGDPDS
            770       780       790       800       810       820  

         950       960       970       980       990      1000     
pF1KE1 QIWRHPTLCHSKEGIISPLTTLPSEALQTEAIKLFKTCQLFINAAVDSPAIDYHISLAQS
        .:::: ::.::.:. . :::::::::::::.::::.::::::. :.. ..:::.::::.
CCDS45 PLWRHPMLCYSKDGLYASLTTLPSEALQTEALKLFKSCQLFINVPVEAASVDYHVSLAQT
            830       840       850       860       870       880  

        1010      1020      1030      1040      1050      1060     
pF1KE1 ALQICLTHPELQNEICCQLIKQTRRRQPQNQPGPLQGWQLLALCVGLFLPHHPFLWLLRL
       :::.::.:::::.:: :::.:::  : ::.  . .: :::::::. ::::.: ::: .. 
CCDS45 ALQVCLVHPELQSEIYCQLMKQTSCRPPQKY-SLMQCWQLLALCAPLFLPQHHFLWYVKQ
            890       900       910        920       930       940 

        1070      1080      1090      1100      1110      1120     
pF1KE1 HLKRNADSRTEFGKYAIYCQRCVERTQQNGDREARPSRMEILSTLLRNPYHHSLPFSIPV
       .:.:.:: :.: :.:: :::: :::: ..:.:::::::::..: :::::.::::::::::
CCDS45 QLQRHADPRSETGQYATYCQRAVERTLRTGEREARPSRMEVVSILLRNPFHHSLPFSIPV
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pF1KE1 HFMNGIYQVVGFDASTTVEEFLNTLNQDTGMRKPAQSGFALFTDDPSGRDLEHCLQGNIK
       :: :: :.:::::.:.::.:::. :::. :::::..:::::::::::::::::::::..:
CCDS45 HFTNGTYHVVGFDGSSTVDEFLQRLNQEIGMRKPSHSGFALFTDDPSGRDLEHCLQGSVK
            1010      1020      1030      1040      1050      1060 

        1190      1200       1210      1220      1230      1240    
pF1KE1 ICDIISKWEQASKEQQPGKCEG-TRTVRLTYKNRLYFSVQARGETDREKLLLMYQTNDQI
       ::: ::::::: :: .::: :: ::.:.: :::::::  :..::::::.:::  ::. .:
CCDS45 ICDAISKWEQAMKELHPGKSEGGTRVVKLMYKNRLYFRSQVKGETDRERLLLASQTSREI
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pF1KE1 INGLFPLNKDLALEMAALLSQVEIGDFERPFSTPAGHVTNQCKVNQTLKQVIEKFYPKRY
       . : ::.::.::::::::..::: ::.:.: . :.   :.  :... :.::...:.:.::
CCDS45 VAGRFPINKELALEMAALMAQVEYGDLEKP-ALPGPGGTSPAKAQHLLQQVLDRFHPRRY
            1130      1140      1150       1160      1170      1180

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pF1KE1 RDGCSEEQLRQLCQRLSTRWMALRGHSAADCVRIYLTVARKWPFFGAKLFLAKPITPSSL
       : :   ::::.: . :.:.: .:.: :  .:.:::::::::::::::::: :.:   :: 
CCDS45 RHGAPAEQLRHLADMLTTKWATLQGCSPPECIRIYLTVARKWPFFGAKLFAAQPAQLSSK
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         1370      1380      1390      1400      1410      1420    
pF1KE1 GSTFLWLAVHEDGLSLLEYNSMRLIVSYVYKSLMTFGGYQDDFMVVINNTHSKDKPT---
        ....:.::.:::.:.:..:.:.. ..: :.:. :::: .::::.:: .  .:..     
CCDS45 ENALVWIAVNEDGVSILDHNTMQVHITYPYSSVTTFGGCRDDFMLVIRSIPDKSSGKSHI
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       :::.: :: :.: : :...:::.:  :   ..    . :.  . :      .. : : . 
CCDS45 EKLIFRMAAPKIAEATFIMASYMN--HCTTTVNPPTNPPG--ACQLW----ELDGRQFFS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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