seq1 = pF1KB8414.tfa, 2739 bp
seq2 = pF1KB8414/gi568815589f_75791262.tfa (gi568815589f:75791262_76293349), 502088 bp

>pF1KB8414 2739
>gi568815589f:75791262_76293349 (Chr9)

1-192  (99921-100112)   100% ->
193-297  (141118-141222)   100% ->
298-411  (194871-194984)   100% ->
412-555  (232477-232620)   100% ->
556-632  (235700-235776)   100% ->
633-721  (276694-276782)   100% ->
722-894  (280465-280637)   100% ->
895-1107  (304629-304841)   100% ->
1108-1208  (315990-316090)   100% ->
1209-1312  (342848-342951)   100% ->
1313-1430  (365784-365901)   100% ->
1431-1619  (367722-367910)   100% ->
1620-1756  (378443-378579)   100% ->
1757-1900  (383725-383868)   100% ->
1901-2003  (388335-388437)   100% ->
2004-2197  (390137-390330)   100% ->
2198-2282  (393412-393496)   100% ->
2283-2380  (397317-397414)   100% ->
2381-2510  (397833-397962)   100% ->
2511-2626  (398370-398485)   100% ->
2627-2739  (401976-402088)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCTGGGGGAGCCGCTGCTGCTGCCCGGGACGTTTGGACCTGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99921 ATGGGCTGGGGGAGCCGCTGCTGCTGCCCGGGACGTTTGGACCTGCTGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGTGCTGGCGCTGCTCGGGGGCTGCCTGCTCCCCGTGTGTCGGACGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99971 CGTGCTGGCGCTGCTCGGGGGCTGCCTGCTCCCCGTGTGTCGGACGCGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTACACCAACCACTGGGCAGTCAAAATCGCCGGGGGCTTCCCGGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100021 TCTACACCAACCACTGGGCAGTCAAAATCGCCGGGGGCTTCCCGGAGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AACCGTATCGCCAGCAAGTACGGATTCATCAACATAGGACAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100071 AACCGTATCGCCAGCAAGTACGGATTCATCAACATAGGACAGGTA...CA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    193  ATAGGGGCCCTGAAGGACTACTACCACTTCTACCATAGCAGGACGATTA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141117 GATAGGGGCCCTGAAGGACTACTACCACTTCTACCATAGCAGGACGATTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAAGGTCAGTTATCTCGAGCAGAGGGACCCACAGTTTCATTTCAATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141167 AAAGGTCAGTTATCTCGAGCAGAGGGACCCACAGTTTCATTTCAATGGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCAAAG         GTGGAATGGATCCAACAGCAAGTGGTAAAAAAGCG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141217 CCAAAGGTA...CAGGTGGAATGGATCCAACAGCAAGTGGTAAAAAAGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GACAAAGAGGGATTATGACTTCAGTCGTGCCCAGTCTACCTATTTCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194906 GACAAAGAGGGATTATGACTTCAGTCGTGCCCAGTCTACCTATTTCAATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATCCCAAGTGGCCCAGCATGTGGTATATG         CACTGCAGTGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 194956 ATCCCAAGTGGCCCAGCATGTGGTATATGGTA...CAGCACTGCAGTGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AATACACATCCCTGCCAGTCTGACATGAATATCGAAGGAGCCTGGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232489 AATACACATCCCTGCCAGTCTGACATGAATATCGAAGGAGCCTGGAAGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGGCTACACGGGAAAGAACATTGTGGTCACTATCCTGGATGACGGAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232539 AGGCTACACGGGAAAGAACATTGTGGTCACTATCCTGGATGACGGAATTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGAGAACCCATCCAGATCTGATGCAAAACTAC         GATGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 232589 AGAGAACCCATCCAGATCTGATGCAAAACTACGTG...TAGGATGCTCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GCAAGTTGCGACGTGAATGGGAATGACTTGGACCCAATGCCTCGTTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 235709 GCAAGTTGCGACGTGAATGGGAATGACTTGGACCCAATGCCTCGTTATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGCAAGCAACGAGAACAA         GCATGGGACTCGCTGTGCTGGAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 235759 TGCAAGCAACGAGAACAAGTA...CAGGCATGGGACTCGCTGTGCTGGAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AAGTGGCAGCCGCTGCAAACAATTCGCACTGCACAGTCGGAATTGCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 276717 AAGTGGCAGCCGCTGCAAACAATTCGCACTGCACAGTCGGAATTGCTTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AACGCCAAGATCGGAG         GAGTGCGAATGCTGGACGGAGATGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 276767 AACGCCAAGATCGGAGGTA...AAGGAGTGCGAATGCTGGACGGAGATGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CACGGACATGGTTGAAGCAAAATCAGTTAGCTTCAACCCCCAGCACGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 280490 CACGGACATGGTTGAAGCAAAATCAGTTAGCTTCAACCCCCAGCACGTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ACATTTACAGCGCCAGCTGGGGCCCGGATGATGATGGCAAGACTGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 280540 ACATTTACAGCGCCAGCTGGGGCCCGGATGATGATGGCAAGACTGTGGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGACCAGCCCCCCTCACCCGGCAAGCCTTTGAAAACGGCGTTAGAATG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 280590 GGACCAGCCCCCCTCACCCGGCAAGCCTTTGAAAACGGCGTTAGAATGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    895        GGGCGGAGAGGCCTCGGCTCTGTGTTTGTTTGGGCATCTGGAA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 280640 A...CAGGGGCGGAGAGGCCTCGGCTCTGTGTTTGTTTGGGCATCTGGAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ATGGTGGAAGGAGCAAAGACCACTGCTCCTGTGATGGCTACACCAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 304672 ATGGTGGAAGGAGCAAAGACCACTGCTCCTGTGATGGCTACACCAACAGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ATCTACACCATCTCCATCAGCAGCACTGCAGAAAGCGGAAAGAAACCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 304722 ATCTACACCATCTCCATCAGCAGCACTGCAGAAAGCGGAAAGAAACCTTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GTACCTGGAAGAGTGTTCATCCACGCTGGCCACAACCTACAGCAGCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 304772 GTACCTGGAAGAGTGTTCATCCACGCTGGCCACAACCTACAGCAGCGGGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AGTCCTACGATAAGAAAATC         ATCACTACAGATCTGAGGCAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 304822 AGTCCTACGATAAGAAAATCGTA...CAGATCACTACAGATCTGAGGCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CGTTGCACGGACAACCACACTGGGACGTCAGCCTCAGCCCCCATGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 316011 CGTTGCACGGACAACCACACTGGGACGTCAGCCTCAGCCCCCATGGCTGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 AGGCATCATTGCGCTGGCCCTGGAAGCCAA         TCCGTTTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 316061 AGGCATCATTGCGCTGGCCCTGGAAGCCAAGTA...CAGTCCGTTTCTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CCTGGAGAGACGTACAGCATGTTATTGTCAGGACTTCCCGTGCGGGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 342859 CCTGGAGAGACGTACAGCATGTTATTGTCAGGACTTCCCGTGCGGGACAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TTGAACGCTAATGACTGGAAAACCAATGCTGCTGGTTTTAAGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 342909 TTGAACGCTAATGACTGGAAAACCAATGCTGCTGGTTTTAAGGGTG...C

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1313   TGAGCCATCTTTATGGATTTGGACTGATGGACGCAGAAGCCATGGTGA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 365782 AGTGAGCCATCTTTATGGATTTGGACTGATGGACGCAGAAGCCATGGTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TGGAGGCAGAGAAGTGGACCACCGTTCCCCGGCAGCACGTGTGTGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 365832 TGGAGGCAGAGAAGTGGACCACCGTTCCCCGGCAGCACGTGTGTGTGGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 AGCACAGACCGACAAATCAA         GACAATCCGCCCTAACAGTGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 365882 AGCACAGACCGACAAATCAAGTA...CAGGACAATCCGCCCTAACAGTGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 AGTGCGCTCCATCTACAAAGCTTCAGGCTGCTCGGATAACCCCAACCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 367743 AGTGCGCTCCATCTACAAAGCTTCAGGCTGCTCGGATAACCCCAACCGCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 ATGTCAACTACCTGGAGCACGTCGTTGTGCGCATCACCATCACCCACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 367793 ATGTCAACTACCTGGAGCACGTCGTTGTGCGCATCACCATCACCCACCCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 AGGAGAGGAGACCTGGCCATCTACCTGACCTCGCCCTCTGGAACTAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 367843 AGGAGAGGAGACCTGGCCATCTACCTGACCTCGCCCTCTGGAACTAGGTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 TCAGCTTTTGGCCAACAG         GCTATTTGATCACTCCATGGAAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 367893 TCAGCTTTTGGCCAACAGGTA...CAGGCTATTTGATCACTCCATGGAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 GATTCAAAAACTGGGAGTTCATGACCATTCATTGCTGGGGAGAAAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 378466 GATTCAAAAACTGGGAGTTCATGACCATTCATTGCTGGGGAGAAAGAGCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GCTGGTGACTGGGTCCTTGAAGTTTATGATACTCCCTCTCAGCTAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 378516 GCTGGTGACTGGGTCCTTGAAGTTTATGATACTCCCTCTCAGCTAAGGAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 CTTTAAGACTCCAG         GTAAATTGAAAGAATGGTCTTTGGTCC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 378566 CTTTAAGACTCCAGGTG...AAGGTAAATTGAAAGAATGGTCTTTGGTCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 TCTACGGCACCTCCGTGCAGCCATATTCACCAACCAATGAATTTCCGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 383752 TCTACGGCACCTCCGTGCAGCCATATTCACCAACCAATGAATTTCCGAAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 GTGGAACGGTTCCGCTATAGCCGAGTTGAAGACCCCACAGACGACTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 383802 GTGGAACGGTTCCGCTATAGCCGAGTTGAAGACCCCACAGACGACTATGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 CACAGAGGATTATGCAG         GTCCCTGCGACCCTGAGTGCAGTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 383852 CACAGAGGATTATGCAGGTG...AAGGTCCCTGCGACCCTGAGTGCAGTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 AGGTTGGCTGTGACGGGCCAGGACCAGACCACTGCAATGACTGTTTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 388359 AGGTTGGCTGTGACGGGCCAGGACCAGACCACTGCAATGACTGTTTGCAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 TACTACTACAAGCTGAAAAACAATACCAG         GATCTGTGTCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 388409 TACTACTACAAGCTGAAAAACAATACCAGGTA...CAGGATCTGTGTCTC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 CAGCTGCCCCCCTGGCCACTACCACGCCGACAAGAAGCGCTGCAGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 390149 CAGCTGCCCCCCTGGCCACTACCACGCCGACAAGAAGCGCTGCAGGAAGT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 GTGCCCCCAACTGTGAGTCCTGCTTTGGGAGCCATGGTGACCAATGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 390199 GTGCCCCCAACTGTGAGTCCTGCTTTGGGAGCCATGGTGACCAATGCATG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 TCCTGCAAATATGGATACTTTCTGAATGAAGAAACCAACAGCTGTGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 390249 TCCTGCAAATATGGATACTTTCTGAATGAAGAAACCAACAGCTGTGTTAC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 TCACTGCCCTGATGGGTCATATCAGGATACCA         AGAAAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 390299 TCACTGCCCTGATGGGTCATATCAGGATACCAGTA...CAGAGAAAAATC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 TTTGCCGGAAATGCAGTGAAAACTGCAAGACATGTACTGAATTCCATAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 393421 TTTGCCGGAAATGCAGTGAAAACTGCAAGACATGTACTGAATTCCATAAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 TGTACAGAATGTAGGGATGGGTTAAG         CCTGCAGGGATCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 393471 TGTACAGAATGTAGGGATGGGTTAAGGTA...CAGCCTGCAGGGATCCCG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 GTGCTCTGTCTCCTGTGAAGATGGACGGTATTTCAACGGCCAGGACTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 397332 GTGCTCTGTCTCCTGTGAAGATGGACGGTATTTCAACGGCCAGGACTGCC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 AGCCCTGCCACCGCTTCTGCGCCACTTGTGCTG         GGGCAGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 397382 AGCCCTGCCACCGCTTCTGCGCCACTTGTGCTGGTA...AAGGGGCAGGA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 GCTGATGGGTGCATTAACTGCACAGAGGGCTACTTCATGGAGGATGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 397841 GCTGATGGGTGCATTAACTGCACAGAGGGCTACTTCATGGAGGATGGGAG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 ATGCGTGCAGAGCTGTAGTATCAGCTATTACTTTGACCACTCTTCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 397891 ATGCGTGCAGAGCTGTAGTATCAGCTATTACTTTGACCACTCTTCAGAGA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2489 ATGGATACAAATCCTGCAAAAA         ATGTGATATCAGTTGTTTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 397941 ATGGATACAAATCCTGCAAAAAGTA...TAGATGTGATATCAGTTGTTTG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 ACGTGCAATGGCCCAGGATTCAAGAACTGTACAAGCTGCCCTAGTGGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 398389 ACGTGCAATGGCCCAGGATTCAAGAACTGTACAAGCTGCCCTAGTGGGTA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 TCTCTTAGACTTAGGAATGTGTCAAATGGGAGCCATTTGCAAGGATG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 398439 TCTCTTAGACTTAGGAATGTGTCAAATGGGAGCCATTTGCAAGGATGGTG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2627       CAACGGAAGAGTCCTGGGCGGAAGGAGGCTTCTGTATGCTTGTG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 398489 ...AAGCAACGGAAGAGTCCTGGGCGGAAGGAGGCTTCTGTATGCTTGTG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2671 AAAAAGAACAATCTGTGCCAACGGAAGGTTCTTCAACAACTTTGCTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 402020 AAAAAGAACAATCTGTGCCAACGGAAGGTTCTTCAACAACTTTGCTGCAA

   2900     .    :    .
   2721 AACATGTACATTTCAAGGC
        |||||||||||||||||||
 402070 AACATGTACATTTCAAGGC