seq1 = pF1KE3580.tfa, 2997 bp seq2 = pF1KE3580/gi568815597f_1516507.tfa (gi568815597f:1516507_1730527), 214021 bp >pF1KE3580 2997 >gi568815597f:1516507_1730527 (Chr1) 1-110 (100000-100108) 99% -> 111-379 (106925-107193) 100% -> 380-551 (107268-107439) 100% -> 552-658 (108289-108395) 100% -> 659-853 (108485-108679) 99% -> 854-996 (108780-108922) 100% -> 997-1104 (109040-109147) 100% -> 1105-1209 (110144-110248) 100% -> 1210-1372 (110331-110493) 100% -> 1373-1506 (110568-110701) 99% -> 1507-1655 (110790-110938) 100% -> 1656-1812 (111167-111323) 100% -> 1813-1973 (111513-111673) 99% -> 1974-2100 (111767-111893) 100% -> 2101-2334 (111983-112216) 100% -> 2335-2513 (112627-112805) 100% -> 2514-2695 (112879-113060) 100% -> 2696-2761 (113133-113198) 100% -> 2762-2997 (113786-114021) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGGTTGGAAGCCCAGCGAGGCTAGAGGCCAGTCCCAAAGTTTCCAGGC |-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100000 A GGGTTGGAAGCCCAGCGAGGCTAGAGGCCAGTCCCAAAGTTTCCAGGC 50 . : . : . : . : . : 51 ATCAGGGCTGCAGCCCAGGAGCCTCAAGGCGGCCCGGCGGGCGACTGGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100049 ATCAGGGCTGCAGCCCAGGAGCCTCAAGGCGGCCCGGCGGGCGACTGGAC 100 . : . : . : . : . : 101 GGCCGGACAG GTCCCGAGCAGCCCCGCCCAACATGGACCCA ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 100099 GGCCGGACAGGTG...CAGGTCCCGAGCAGCCCCGCCCAACATGGACCCA 150 . : . : . : . : . : 142 GACCCCCAGGCGGGCGTGCAGGTGGGCATGCGGGTGGTGCGCGGCGTGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106956 GACCCCCAGGCGGGCGTGCAGGTGGGCATGCGGGTGGTGCGCGGCGTGGA 200 . : . : . : . : . : 192 CTGGAAGTGGGGCCAGCAGGACGGCGGCGAGGGCGGCGTGGGCACGGTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107006 CTGGAAGTGGGGCCAGCAGGACGGCGGCGAGGGCGGCGTGGGCACGGTGG 250 . : . : . : . : . : 242 TGGAGCTTGGCCGCCACGGCAGCCCCTCGACACCCGACCGCACAGTGGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107056 TGGAGCTTGGCCGCCACGGCAGCCCCTCGACACCCGACCGCACAGTGGTC 300 . : . : . : . : . : 292 GTGCAGTGGGACCAGGGCACGCGCACCAACTACCGCGCCGGCTACCAGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107106 GTGCAGTGGGACCAGGGCACGCGCACCAACTACCGCGCCGGCTACCAGGG 350 . : . : . : . : . : 342 CGCGCACGACCTGCTGCTGTACGACAACGCCCAGATCG GCG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| 107156 CGCGCACGACCTGCTGCTGTACGACAACGCCCAGATCGGTG...CAGGCG 400 . : . : . : . : . : 383 TCCGGCACCCCAACATCATCTGTGACTGCTGCAAGAAGCACGGGCTGCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107271 TCCGGCACCCCAACATCATCTGTGACTGCTGCAAGAAGCACGGGCTGCGG 450 . : . : . : . : . : 433 GGGATGCGCTGGAAGTGCCGTGTGTGCCTGGACTACGACCTCTGCACGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107321 GGGATGCGCTGGAAGTGCCGTGTGTGCCTGGACTACGACCTCTGCACGCA 500 . : . : . : . : . : 483 GTGCTACATGCACAACAAGCATGAGCTCGCCCACGCCTTCGACCGCTACG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107371 GTGCTACATGCACAACAAGCATGAGCTCGCCCACGCCTTCGACCGCTACG 550 . : . : . : . : . : 533 AGACCGCTCACTCGCGCCC TGTCACACTGAGTCCCCGCCAG |||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||| 107421 AGACCGCTCACTCGCGCCCGTG...CAGTGTCACACTGAGTCCCCGCCAG 600 . : . : . : . : . : 574 GGCCTCCCGAGGATCCCACTAAGGGGCATCTTCCAGGGAGCGAAGGTGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108311 GGCCTCCCGAGGATCCCACTAAGGGGCATCTTCCAGGGAGCGAAGGTGGT 650 . : . : . : . : . : 624 GCGAGGCCCCGACTGGGAGTGGGGCTCACAGGATG GAGGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||| 108361 GCGAGGCCCCGACTGGGAGTGGGGCTCACAGGATGGTG...CAGGAGGGG 700 . : . : . : . : . : 665 AAGGGAAACCGGGCCGTGTGGTGGACATCCGTGGCTGGGATGTGGAGACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108491 AAGGGAAACCGGGCCGTGTGGTGGACATCCGTGGCTGGGATGTGGAGACA 750 . : . : . : . : . : 715 GGCCGGAGTGTGGCCAGCGTGACGTGGGCTGATGGTACCACCAATGTGTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108541 GGCCGGAGTGTGGCCAGCGTGACGTGGGCTGATGGTACCACCAATGTGTA 800 . : . : . : . : . : 765 CCGTGTGGGCTACAAGGGCAAGGTGGACCTCAAGTGTGTGGGCGAGGCAG |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108591 CCGTGTGGGCCACAAGGGCAAGGTGGACCTCAAGTGTGTGGGCGAGGCAG 850 . : . : . : . : . : 815 CGGGCGGCTTCTACTACAAGGACCACCTCCCAAGGCTCG GC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|| 108641 CGGGCGGCTTCTACTACAAGGACCACCTCCCAAGGCTCGGTA...CAGGC 900 . : . : . : . : . : 856 AAGCCGGCGGAGCTGCAGCGCAGGGTGAGTGCTGACAGCCAGCCCTTCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108782 AAGCCGGCGGAGCTGCAGCGCAGGGTGAGTGCTGACAGCCAGCCCTTCCA 950 . : . : . : . : . : 906 GCACGGGGACAAGGTCAAGTGTCTGCTGGACACTGATGTCCTGCGGGAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108832 GCACGGGGACAAGGTCAAGTGTCTGCTGGACACTGATGTCCTGCGGGAGA 1000 . : . : . : . : . : 956 TGCAGGAAGGCCACGGCGGCTGGAACCCCAGGATGGCGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> 108882 TGCAGGAAGGCCACGGCGGCTGGAACCCCAGGATGGCGGAGGTG...CAG 1050 . : . : . : . : . : 997 TTTATCGGACAGACGGGCACCGTGCATCGTATCACGGACCGCGGGGACGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109040 TTTATCGGACAGACGGGCACCGTGCATCGTATCACGGACCGCGGGGACGT 1100 . : . : . : . : . : 1047 GCGCGTGCAGTTCAACCACGAGACGCGCTGGACCTTCCACCCCGGGGCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109090 GCGCGTGCAGTTCAACCACGAGACGCGCTGGACCTTCCACCCCGGGGCGC 1150 . : . : . : . : . : 1097 TCACCAAG CACCACTCCTTCTGGGTGGGCGACGTGGTCCGG ||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||| 109140 TCACCAAGGTG...CAGCACCACTCCTTCTGGGTGGGCGACGTGGTCCGG 1200 . : . : . : . : . : 1138 GTCATCGGCGACCTTGACACAGTGAAGCGGCTGCAGGCTGGGCATGGCGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110177 GTCATCGGCGACCTTGACACAGTGAAGCGGCTGCAGGCTGGGCATGGCGA 1250 . : . : . : . : . : 1188 GTGGACGGACGACATGGCCCCT GCCCTGGGCCGCGTCGGGA ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 110227 GTGGACGGACGACATGGCCCCTGTG...CAGGCCCTGGGCCGCGTCGGGA 1300 . : . : . : . : . : 1229 AGGTGGTGAAAGTGTTTGGAGACGGGAACCTGCGTGTAGCAGTCGCTGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110350 AGGTGGTGAAAGTGTTTGGAGACGGGAACCTGCGTGTAGCAGTCGCTGGT 1350 . : . : . : . : . : 1279 CAGCGGTGGACCTTCAGCCCCTCCTGCCTGGTGGCCTACCGGCCCGAGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110400 CAGCGGTGGACCTTCAGCCCCTCCTGCCTGGTGGCCTACCGGCCCGAGGA 1400 . : . : . : . : . : 1329 GGATGCCAACCTGGACGTGGCCGAGCGCGCCCGGGAGAACAAAA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>... 110450 GGATGCCAACCTGGACGTGGCCGAGCGCGCCCGGGAGAACAAAAGTG... 1450 . : . : . : . : . : 1373 GCTCACTGAGCGTGGCCCTGGACAAGCTTCGGGCCCAGAAGAGTGAC >>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110565 CAGGCTCACTGAGCGTGGCCCTGGACAAGCTTCGGGCCCAGAAGAGTGAC 1500 . : . : . : . : . : 1420 CCAGAGCACCCGGGAAGGCTGGTGGTGGAGGTGGCGCTGGGTAACGCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110615 CCAGAGCACCCGGGAAGGCTGGTGGTGGAGGTGGCGCTGGGTAACGCAGC 1550 . : . : . : . : . : 1470 CCGGGCTCTGGGCCTGCTGCGGAGGCGCCCAGAGCAG GTGG ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||| 110665 CCGGGCTCTGGACCTGCTGCGGAGGCGCCCAGAGCAGGCA...CAGGTGG 1600 . : . : . : . : . : 1511 ACACCAAGAACCAAGGCAGGACCGCTCTGCAAGTGGCTGCCTACCTGGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110794 ACACCAAGAACCAAGGCAGGACCGCTCTGCAAGTGGCTGCCTACCTGGGC 1650 . : . : . : . : . : 1561 CAGGTGGAGTTGATACGGCTGCTGCTACAAGCCAGGGCGGGCGTGGACCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110844 CAGGTGGAGTTGATACGGCTGCTGCTACAAGCCAGGGCGGGCGTGGACCT 1700 . : . : . : . : . : 1611 GCCGGACGACGAGGGCAACACGGCACTGCACTACGCGGCCCTGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 110894 GCCGGACGACGAGGGCAACACGGCACTGCACTACGCGGCCCTGGGGTG.. 1750 . : . : . : . : . : 1656 GAACCAGCCCGAGGCCACCAGGGTGCTCCTGAGTGCTGGGTGCCGG .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110944 .CAGGAACCAGCCCGAGGCCACCAGGGTGCTCCTGAGTGCTGGGTGCCGG 1800 . : . : . : . : . : 1702 GCGGACGCCATCAACAGCACCCAGAGCACAGCACTGCACGTGGCCGTGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 111213 GCGGACGCCATCAACAGCACCCAGAGCACAGCACTGCACGTGGCCGTGCA 1850 . : . : . : . : . : 1752 GAGGGGCTTCCTGGAGGTGGTGCGGGCCCTGTGTGAGCGCGGCTGTGACG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 111263 GAGGGGCTTCCTGGAGGTGGTGCGGGCCCTGTGTGAGCGCGGCTGTGACG 1900 . : . : . : . : . : 1802 TCAACCTGCCC GACGCCCACTCGGACACGCCCCTGCACTCC |||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||| 111313 TCAACCTGCCCGTG...CAGGACGCCCACTCGGACACGCCCCTGCACTCC 1950 . : . : . : . : . : 1843 GCCATCTCGGCGGGCACTGGAGCCGGCGGCATTGTCGAGGTCCTCACGGA |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| 111543 GCCATCTCGGCGGGCACTGGAGCCAGCGGCATTGTCGAGGTCCTCACGGA 2000 . : . : . : . : . : 1893 GGTGCCAAACATCGATGTTACCGCCACCAACAGCCAGGGTTTCACCCTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 111593 GGTGCCAAACATCGATGTTACCGCCACCAACAGCCAGGGTTTCACCCTGC 2050 . : . : . : . : . : 1943 TGCACCATGCCTCCCTCAAGGGTCACGCGCT AGCTGTGAGA |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| 111643 TGCACCATGCCTCCCTCAAGGGTCACGCGCTGTG...CAGAGCTGTGAGA 2100 . : . : . : . : . : 1984 AAGATTCTGGCTCGGGCGCGGCAGCTGGTGGACGCCAAGAAGGAGGACGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 111777 AAGATTCTGGCTCGGGCGCGGCAGCTGGTGGACGCCAAGAAGGAGGACGG 2150 . : . : . : . : . : 2034 CTTCACGGCGCTGCATCTGGCTGCCCTCAACAACCACCGCGAGGTGGCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 111827 CTTCACGGCGCTGCATCTGGCTGCCCTCAACAACCACCGCGAGGTGGCCC 2200 . : . : . : . : . : 2084 AGATCCTCATCCGGGAG GGCCGCTGTGACGTGAACGTGCGC |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| 111877 AGATCCTCATCCGGGAGGTG...CAGGGCCGCTGTGACGTGAACGTGCGC 2250 . : . : . : . : . : 2125 AACCGGAAGCTGCAGTCCCCGCTGCATCTCGCCGTGCAACAGGCCCACGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112007 AACCGGAAGCTGCAGTCCCCGCTGCATCTCGCCGTGCAACAGGCCCACGT 2300 . : . : . : . : . : 2175 GGGGCTGGTGCCGCTACTGGTGGACGCTGGGTGCAGTGTCAACGCCGAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112057 GGGGCTGGTGCCGCTACTGGTGGACGCTGGGTGCAGTGTCAACGCCGAGG 2350 . : . : . : . : . : 2225 ACGAGGAGGGGGACACAGCCCTGCACGTGGCGCTGCAGCGTCATCAGCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112107 ACGAGGAGGGGGACACAGCCCTGCACGTGGCGCTGCAGCGTCATCAGCTG 2400 . : . : . : . : . : 2275 CTGCCCCTGGTGGCTGATGGGGCCGGGGGGGACCCAGGGCCCTTGCAGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112157 CTGCCCCTGGTGGCTGATGGGGCCGGGGGGGACCCAGGGCCCTTGCAGCT 2450 . : . : . : . : . : 2325 GCTGTCCAGG CTACAGGCCTCGGGCCTCCCCGGCAGCGCGG ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 112207 GCTGTCCAGGGTG...CAGCTACAGGCCTCGGGCCTCCCCGGCAGCGCGG 2500 . : . : . : . : . : 2366 AGCTGACGGTGGGCGCGGCGGTCGCCTGCTTCCTGGCGCTGGAGGGCGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112658 AGCTGACGGTGGGCGCGGCGGTCGCCTGCTTCCTGGCGCTGGAGGGCGCC 2550 . : . : . : . : . : 2416 GACGTGAGCTACACCAACCACCGCGGTCGGAGCCCGCTGGACCTGGCCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112708 GACGTGAGCTACACCAACCACCGCGGTCGGAGCCCGCTGGACCTGGCCGC 2600 . : . : . : . : . : 2466 CGAGGGTCGCGTGCTCAAGGCCCTTCAGGGCTGCGCCCAGCGCTTCCG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>> 112758 CGAGGGTCGCGTGCTCAAGGCCCTTCAGGGCTGCGCCCAGCGCTTCCGGT 2650 . : . : . : . : . : 2514 GGAGCGGCAGGCGGGCGGGGGCGCGGCCCCGGGCCCCAGGCAA >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112808 G...CAGGGAGCGGCAGGCGGGCGGGGGCGCGGCCCCGGGCCCCAGGCAA 2700 . : . : . : . : . : 2557 ACGCTCGGGACCCCCAACACCGTGACGAACCTGCACGTGGGCGCCGCGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112922 ACGCTCGGGACCCCCAACACCGTGACGAACCTGCACGTGGGCGCCGCGCC 2750 . : . : . : . : . : 2607 GGGGCCCGAGGCCGCTGAGTGCCTGGTGTGCTCCGAGCTGGCGCTGCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112972 GGGGCCCGAGGCCGCTGAGTGCCTGGTGTGCTCCGAGCTGGCGCTGCTGG 2800 . : . : . : . : . : 2657 TGCTGTTCTCGCCGTGCCAGCACCGCACCGTGTGTGAGG AG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|| 113022 TGCTGTTCTCGCCGTGCCAGCACCGCACCGTGTGTGAGGGTG...CAGAG 2850 . : . : . : . : . : 2698 TGCGCGCGCAGGATGAAGAAGTGCATCAGGTGCCAGGTGGTCGTCAGCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113135 TGCGCGCGCAGGATGAAGAAGTGCATCAGGTGCCAGGTGGTCGTCAGCAA 2900 . : . : . : . : . : 2748 GAAACTGCGCCCAG ACGGCTCTGAGGTGGCGAGCGCCGCCC ||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||| 113185 GAAACTGCGCCCAGGTG...CAGACGGCTCTGAGGTGGCGAGCGCCGCCC 2950 . : . : . : . : . : 2789 CCGCCCCCGGCCCGCCGCGCCAGCTGGTGGAGGAGCTGCAGAGCCGCTAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113813 CCGCCCCCGGCCCGCCGCGCCAGCTGGTGGAGGAGCTGCAGAGCCGCTAC 3000 . : . : . : . : . : 2839 CGGCAGATGGAGGAACGCATCACCTGCCCCATCTGCATCGACAGCCACAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113863 CGGCAGATGGAGGAACGCATCACCTGCCCCATCTGCATCGACAGCCACAT 3050 . : . : . : . : . : 2889 CCGCCTCGTGTTCCAGTGCGGCCACGGCGCATGCGCCCCCTGCGGCTCCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113913 CCGCCTCGTGTTCCAGTGCGGCCACGGCGCATGCGCCCCCTGCGGCTCCG 3100 . : . : . : . : . : 2939 CGCTCAGCGCCTGCCCCATCTGCCGCCAGCCCATCCGCGACCGCATCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113963 CGCTCAGCGCCTGCCCCATCTGCCGCCAGCCCATCCGCGACCGCATCCAG 3150 . 2989 ATCTTCGTG ||||||||| 114013 ATCTTCGTG