Result of FASTA (ccds) for pF1KE0375
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0375, 567 aa
  1>>>pF1KE0375 567 - 567 aa - 567 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4472+/-0.000971; mu= 17.5629+/- 0.058
 mean_var=63.9967+/-12.910, 0's: 0 Z-trim(104.2): 18  B-trim: 0 in 0/46
 Lambda= 0.160323
 statistics sampled from 7760 (7767) to 7760 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.239), width:  16
 Scan time:  3.230

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10220.1 LCTL gene_id:197021|Hs108|chr15        ( 567) 3952 923.2       0
CCDS61678.1 LCTL gene_id:197021|Hs108|chr15        ( 394) 2752 645.6 3.3e-185
CCDS2178.1 LCT gene_id:3938|Hs108|chr2             (1927) 1413 336.2 2.2e-91
CCDS3451.1 KLB gene_id:152831|Hs108|chr4           (1044)  929 224.1 6.5e-58
CCDS9347.1 KL gene_id:9365|Hs108|chr13             (1012)  732 178.6 3.3e-44


>>CCDS10220.1 LCTL gene_id:197021|Hs108|chr15             (567 aa)
 initn: 3952 init1: 3952 opt: 3952  Z-score: 4936.2  bits: 923.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3952; 100.0% identity (100.0% similar) in 567 aa overlap (1-567:1-567)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MKPVWVATLLWMLLLVPRLGAARKGSPEEASFYYGTFPLGFSWGVGSSAYQTEGAWDQDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MKPVWVATLLWMLLLVPRLGAARKGSPEEASFYYGTFPLGFSWGVGSSAYQTEGAWDQDG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 KGPSIWDVFTHSGKGKVLGNETADVACDGYYKVQEDIILLRELHVNHYRFSLSWPRLLPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KGPSIWDVFTHSGKGKVLGNETADVACDGYYKVQEDIILLRELHVNHYRFSLSWPRLLPT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 GIRAEQVNKKGIEFYSDLIDALLSSNITPIVTLHHWDLPQLLQVKYGGWQNVSMANYFRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GIRAEQVNKKGIEFYSDLIDALLSSNITPIVTLHHWDLPQLLQVKYGGWQNVSMANYFRD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 YANLCFEAFGDRVKHWITFSDPRAMAEKGYETGHHAPGLKLRGTGLYKAAHHIIKAHAKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YANLCFEAFGDRVKHWITFSDPRAMAEKGYETGHHAPGLKLRGTGLYKAAHHIIKAHAKA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 WHSYNTTWRSKQQGLVGISLNCDWGEPVDISNPKDLEAAERYLQFCLGWFANPIYAGDYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 WHSYNTTWRSKQQGLVGISLNCDWGEPVDISNPKDLEAAERYLQFCLGWFANPIYAGDYP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 QVMKDYIGRKSAEQGLEMSRLPVFSLQEKSYIKGTSDFLGLGHFTTRYITERNYPSRQGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QVMKDYIGRKSAEQGLEMSRLPVFSLQEKSYIKGTSDFLGLGHFTTRYITERNYPSRQGP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 SYQNDRDLIELVDPNWPDLGSKWLYSVPWGFRRLLNFAQTQYGDPPIYVMENGASQKFHC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SYQNDRDLIELVDPNWPDLGSKWLYSVPWGFRRLLNFAQTQYGDPPIYVMENGASQKFHC
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 TQLCDEWRIQYLKGYINEMLKAIKDGANIKGYTSWSLLDKFEWEKGYSDRYGFYYVEFND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TQLCDEWRIQYLKGYINEMLKAIKDGANIKGYTSWSLLDKFEWEKGYSDRYGFYYVEFND
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 RNKPRYPKASVQYYKKIIIANGFPNPREVESWYLKALETCSINNQMLAAEPLLSHMQMVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RNKPRYPKASVQYYKKIIIANGFPNPREVESWYLKALETCSINNQMLAAEPLLSHMQMVT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       
pF1KE0 EIVVPTVCSLCVLITAVLLMLLLRRQS
       :::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EIVVPTVCSLCVLITAVLLMLLLRRQS
              550       560       

>>CCDS61678.1 LCTL gene_id:197021|Hs108|chr15             (394 aa)
 initn: 2752 init1: 2752 opt: 2752  Z-score: 3438.6  bits: 645.6 E(32554): 3.3e-185
Smith-Waterman score: 2752; 100.0% identity (100.0% similar) in 394 aa overlap (174-567:1-394)

           150       160       170       180       190       200   
pF1KE0 SSNITPIVTLHHWDLPQLLQVKYGGWQNVSMANYFRDYANLCFEAFGDRVKHWITFSDPR
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61                               MANYFRDYANLCFEAFGDRVKHWITFSDPR
                                             10        20        30

           210       220       230       240       250       260   
pF1KE0 AMAEKGYETGHHAPGLKLRGTGLYKAAHHIIKAHAKAWHSYNTTWRSKQQGLVGISLNCD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 AMAEKGYETGHHAPGLKLRGTGLYKAAHHIIKAHAKAWHSYNTTWRSKQQGLVGISLNCD
               40        50        60        70        80        90

           270       280       290       300       310       320   
pF1KE0 WGEPVDISNPKDLEAAERYLQFCLGWFANPIYAGDYPQVMKDYIGRKSAEQGLEMSRLPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 WGEPVDISNPKDLEAAERYLQFCLGWFANPIYAGDYPQVMKDYIGRKSAEQGLEMSRLPV
              100       110       120       130       140       150

           330       340       350       360       370       380   
pF1KE0 FSLQEKSYIKGTSDFLGLGHFTTRYITERNYPSRQGPSYQNDRDLIELVDPNWPDLGSKW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 FSLQEKSYIKGTSDFLGLGHFTTRYITERNYPSRQGPSYQNDRDLIELVDPNWPDLGSKW
              160       170       180       190       200       210

           390       400       410       420       430       440   
pF1KE0 LYSVPWGFRRLLNFAQTQYGDPPIYVMENGASQKFHCTQLCDEWRIQYLKGYINEMLKAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 LYSVPWGFRRLLNFAQTQYGDPPIYVMENGASQKFHCTQLCDEWRIQYLKGYINEMLKAI
              220       230       240       250       260       270

           450       460       470       480       490       500   
pF1KE0 KDGANIKGYTSWSLLDKFEWEKGYSDRYGFYYVEFNDRNKPRYPKASVQYYKKIIIANGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 KDGANIKGYTSWSLLDKFEWEKGYSDRYGFYYVEFNDRNKPRYPKASVQYYKKIIIANGF
              280       290       300       310       320       330

           510       520       530       540       550       560   
pF1KE0 PNPREVESWYLKALETCSINNQMLAAEPLLSHMQMVTEIVVPTVCSLCVLITAVLLMLLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PNPREVESWYLKALETCSINNQMLAAEPLLSHMQMVTEIVVPTVCSLCVLITAVLLMLLL
              340       350       360       370       380       390

           
pF1KE0 RRQS
       ::::
CCDS61 RRQS
           

>>CCDS2178.1 LCT gene_id:3938|Hs108|chr2                  (1927 aa)
 initn: 1361 init1: 592 opt: 1413  Z-score: 1754.0  bits: 336.2 E(32554): 2.2e-91
Smith-Waterman score: 1647; 48.0% identity (75.6% similar) in 488 aa overlap (28-513:894-1374)

                  10        20        30        40        50       
pF1KE0    MKPVWVATLLWMLLLVPRLGAARKGSPEEASFYYGTFPLGFSWGVGSSAYQTEGAWD
                                     :.  ::.:::   : :::.::::: :::::
CCDS21 PSKVRAFTFPSEVPSKAKVVWEKFSSQPKFERDLFYHGTFRDDFLWGVSSSAYQIEGAWD
           870       880       890       900       910       920   

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE0 QDGKGPSIWDVFTHSGKGKVLGNETADVACDGYYKVQEDIILLRELHVNHYRFSLSWPRL
        ::::::::: :::.  ..:  : :.:.:::.:.... :. .:: :.:. ::::.:: :.
CCDS21 ADGKGPSIWDNFTHTPGSNVKDNATGDIACDSYHQLDADLNMLRALKVKAYRFSISWSRI
           930       940       950       960       970       980   

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE0 LPTGIRAEQVNKKGIEFYSDLIDALLSSNITPIVTLHHWDLPQLLQVKYGGWQNVSMANY
       .::: :  ..:..:...:. ::..:..::: :.::: :::::: ::   :::.: .. . 
CCDS21 FPTG-RNSSINSHGVDYYNRLINGLVASNIFPMVTLFHWDLPQALQ-DIGGWENPALIDL
            990      1000      1010      1020       1030      1040 

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE0 FRDYANLCFEAFGDRVKHWITFSDPRAMAEKGYETGHHAPGLKLRGTGLYKAAHHIIKAH
       : .::..::..:::::: :.::..:  .:  :: .:.  ::.:  : . :. :: .::::
CCDS21 FDSYADFCFQTFGDRVKFWMTFNEPMYLAWLGYGSGEFPPGVKDPGWAPYRIAHAVIKAH
            1050      1060      1070      1080      1090      1100 

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE0 AKAWHSYNTTWRSKQQGLVGISLNCDWGEPVDISNPKDLEAAERYLQFCLGWFANPIY-A
       :...:.:.  .:..:.:....::.  :.:: . . :.:.:::.:.::: :::::.::.  
CCDS21 ARVYHTYDEKYRQEQKGVISLSLSTHWAEPKSPGVPRDVEAADRMLQFSLGWFAHPIFRN
            1110      1120      1130      1140      1150      1160 

        300       310       320       330       340       350      
pF1KE0 GDYPQVMKDYIGRKSAEQGLEMSRLPVFSLQEKSYIKGTSDFLGLGHFTTRYITERNYPS
       ::::..::  .: .:  : :  :::: :. .:: .:..:.: . :. . .: :.... : 
CCDS21 GDYPDTMKWKVGNRSELQHLATSRLPSFTEEEKRFIRATADVFCLNTYYSR-IVQHKTPR
            1170      1180      1190      1200      1210       1220

        360       370       380       390       400       410      
pF1KE0 RQGPSYQNDRDLIELVDPNWPDLGSKWLYSVPWGFRRLLNFAQTQYGDPPIYVMENGASQ
        . :::..:... :  ::.::. . .   ..::: :::::. . .::: :::. :::.. 
CCDS21 LNPPSYEDDQEMAEEEDPSWPSTAMN--RAAPWGTRRLLNWIKEEYGDIPIYITENGVGL
             1230      1240        1250      1260      1270        

        420       430       440        450       460       470     
pF1KE0 KFHCTQLCDEWRIQYLKGYINEMLKAIK-DGANIKGYTSWSLLDKFEWEKGYSDRYGFYY
           :.  :  :: : : :::: ::: . :: ...::..:::.:.::: .::. ..:.:.
CCDS21 TNPNTEDTD--RIFYHKTYINEALKAYRLDGIDLRGYVAWSLMDNFEWLNGYTVKFGLYH
     1280        1290      1300      1310      1320      1330      

         480       490       500       510       520       530     
pF1KE0 VEFNDRNKPRYPKASVQYYKKIIIANGFPNPREVESWYLKALETCSINNQMLAAEPLLSH
       :.::. :.::  .::..:: ..:  ::.:  :: :  :                      
CCDS21 VDFNNTNRPRTARASARYYTEVITNNGMPLAREDEFLYGRFPEGFIWSAASAAYQIEGAW
       1340      1350      1360      1370      1380      1390      

         540       550       560                                   
pF1KE0 MQMVTEIVVPTVCSLCVLITAVLLMLLLRRQS                            
                                                                   
CCDS21 RADGKGLSIWDTFSHTPLRVENDAIGDVACDSYHKIAEDLVTLQNLGVSHYRFSISWSRI
       1400      1410      1420      1430      1440      1450      

>--
 initn: 1184 init1: 491 opt: 1640  Z-score: 2037.8  bits: 388.7 E(32554): 3.5e-107
Smith-Waterman score: 1640; 48.7% identity (76.8% similar) in 474 aa overlap (35-506:1375-1843)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KE0 WVATLLWMLLLVPRLGAARKGSPEEASFYYGTFPLGFSWGVGSSAYQTEGAWDQDGKGPS
                                     : :: :: :...:.::: ::::  :::: :
CCDS21 PRTARASARYYTEVITNNGMPLAREDEFLYGRFPEGFIWSAASAAYQIEGAWRADGKGLS
         1350      1360      1370      1380      1390      1400    

           70        80        90       100       110       120    
pF1KE0 IWDVFTHSGKGKVLGNETADVACDGYYKVQEDIILLRELHVNHYRFSLSWPRLLPTGIRA
       :::.:.:.   .: ..  .:::::.:.:. ::.. :..: :.:::::.:: :.:: :  .
CCDS21 IWDTFSHTPL-RVENDAIGDVACDSYHKIAEDLVTLQNLGVSHYRFSISWSRILPDGT-T
         1410       1420      1430      1440      1450      1460   

          130       140       150       160       170       180    
pF1KE0 EQVNKKGIEFYSDLIDALLSSNITPIVTLHHWDLPQLLQVKYGGWQNVSMANYFRDYANL
       . .:. :...:  :::.::...: : ::..:::::: ::   :::.: .... :..::..
CCDS21 RYINEAGLNYYVRLIDTLLAASIQPQVTIYHWDLPQTLQ-DVGGWENETIVQRFKEYADV
           1470      1480      1490      1500       1510      1520 

          190       200       210       220        230       240   
pF1KE0 CFEAFGDRVKHWITFSDPRAMAEKGYETGHHAPGLKLR-GTGLYKAAHHIIKAHAKAWHS
        :. .::.:: :::...: ..: .::  :  :::.. : ::. : ..:..:::::.::: 
CCDS21 LFQRLGDKVKFWITLNEPFVIAYQGYGYGTAAPGVSNRPGTAPYIVGHNLIKAHAEAWHL
            1530      1540      1550      1560      1570      1580 

           250       260       270       280       290        300  
pF1KE0 YNTTWRSKQQGLVGISLNCDWGEPVDISNPKDLEAAERYLQFCLGWFANPIYA-GDYPQV
       :: ..:..: :...:... ::.:: : :: .:.:::.::.::  ::::.::.  ::: .:
CCDS21 YNDVYRASQGGVISITISSDWAEPRDPSNQEDVEAARRYVQFMGGWFAHPIFKNGDYNEV
            1590      1600      1610      1620      1630      1640 

            310       320       330       340       350       360  
pF1KE0 MKDYIGRKSAEQGLEMSRLPVFSLQEKSYIKGTSDFLGLGHFTTRYITERNYPSRQGPSY
       ::  :  .:   ::. :::: :. .::  :.:: ::.:..:.::    . :: .  . :.
CCDS21 MKTRIRDRSLAAGLNKSRLPEFTESEKRRINGTYDFFGFNHYTTVLAYNLNYATAIS-SF
            1650      1660      1670      1680      1690       1700

            370       380       390       400       410       420  
pF1KE0 QNDRDLIELVDPNWPDLGSKWLYSVPWGFRRLLNFAQTQYGDPPIYVMENGASQKFHCTQ
       . :: .  ..: .::: :: ::  .:.::::.::. . .:.:::::: :::.::. . :.
CCDS21 DADRGVASIADRSWPDSGSFWLKMTPFGFRRILNWLKEEYNDPPIYVTENGVSQR-EETD
             1710      1720      1730      1740      1750          

            430       440       450       460       470       480  
pF1KE0 LCDEWRIQYLKGYINEMLKAIKDGANIKGYTSWSLLDKFEWEKGYSDRYGFYYVEFNDRN
       : :  :: ::. :::: :::..: ....::: :: .:.:::  :.:.:.:...:...: .
CCDS21 LNDTARIYYLRTYINEALKAVQDKVDLRGYTVWSAMDNFEWATGFSERFGLHFVNYSDPS
    1760      1770      1780      1790      1800      1810         

            490       500       510       520       530       540  
pF1KE0 KPRYPKASVQYYKKIIIANGFPNPREVESWYLKALETCSINNQMLAAEPLLSHMQMVTEI
        :: ::::...: ...  ::::.:                                    
CCDS21 LPRIPKASAKFYASVVRCNGFPDPATGPHACLHQPDAGPTISPVRQEEVQFLGLMLGTTE
    1820      1830      1840      1850      1860      1870         

>--
 initn: 1361 init1: 592 opt: 1413  Z-score: 1754.0  bits: 336.2 E(32554): 2.2e-91
Smith-Waterman score: 1413; 43.1% identity (71.9% similar) in 487 aa overlap (22-503:367-847)

                        10        20        30        40        50 
pF1KE0          MKPVWVATLLWMLLLVPRLGAARKGSPEEASFYYGTFPLGFSWGVGSSAYQ
                                     : ..  :. .:   ::: :: ::....:..
CCDS21 SLALQPDQQQDHETTDSSPASAYQRIWEAFANQSRAERDAFLQDTFPEGFLWGASTGAFN
        340       350       360       370       380       390      

              60        70        80        90       100       110 
pF1KE0 TEGAWDQDGKGPSIWDVFTHSGKGKVLGNETADVACDGYYKVQEDIILLRELHVNHYRFS
       .::.: . :.: ::::   .   . . :. : .:: :.:.::  :. ::  :... :.::
CCDS21 VEGGWAEGGRGVSIWD--PRRPLNTTEGQATLEVASDSYHKVASDVALLCGLRAQVYKFS
        400       410         420       430       440       450    

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE0 LSWPRLLPTGIRAEQVNKKGIEFYSDLIDALLSSNITPIVTLHHWDLPQLLQVKYGGWQN
       .:: :..: : .. . .  :. .:. ::: : ...: :..:: :::::: ::  .:::::
CCDS21 ISWSRIFPMG-HGSSPSLPGVAYYNKLIDRLQDAGIEPMATLFHWDLPQALQ-DHGGWQN
          460        470       480       490       500        510  

             180       190       200       210       220       230 
pF1KE0 VSMANYFRDYANLCFEAFGDRVKHWITFSDPRAMAEKGYETGHHAPGLKLRGTGLYKAAH
        :... : ::: .:: .:::::: :.:: .: .:.  :: ::.: ::..  :.. .:.::
CCDS21 ESVVDAFLDYAAFCFSTFGDRVKLWVTFHEPWVMSYAGYGTGQHPPGISDPGVASFKVAH
            520       530       540       550       560       570  

             240       250       260       270       280       290 
pF1KE0 HIIKAHAKAWHSYNTTWRSKQQGLVGISLNCDWGEPVDISNPKDLEAAERYLQFCLGWFA
        ..::::..:: ::.  : .::: ::: :: ::.::..   :.::.:.::.:.: :::::
CCDS21 LVLKAHARTWHHYNSHHRPQQQGHVGIVLNSDWAEPLSPERPEDLRASERFLHFMLGWFA
            580       590       600       610       620       630  

              300       310       320       330       340       350
pF1KE0 NPIYA-GDYPQVMKDYIGRKSAEQGLEMSRLPVFSLQEKSYIKGTSDFLGLGHFTTRYIT
       .:... :::: ...  : . . . .  ...:: :.  ::. .::..:::::.:.:.: :.
CCDS21 HPVFVDGDYPATLRTQIQQMNRQCSHPVAQLPEFTEAEKQLLKGSADFLGLSHYTSRLIS
            640       650       660       670       680       690  

               360       370       380       390       400         
pF1KE0 ERNYPSRQG-PSYQNDRDLIELVDPNWPDLGSKWLYSVPWGFRRLLNFAQTQY--GDPPI
         : :.    :::..   . . :.  ::. .:.:.  ::::.::::.:.. .:  :  ::
CCDS21 --NAPQNTCIPSYDTIGGFSQHVNHVWPQTSSSWIRVVPWGIRRLLQFVSLEYTRGKVPI
              700       710       720       730       740       750

       410       420       430       440        450       460      
pF1KE0 YVMENGASQKFHCTQLCDEWRIQYLKGYINEMLKAIK-DGANIKGYTSWSLLDKFEWEKG
       :.  ::       . . :  :..:.. ::::.::::: :......: . ::.: ::  .:
CCDS21 YLAGNGMPIGESENLFDDSLRVDYFNQYINEVLKAIKEDSVDVRSYIARSLIDGFEGPSG
              760       770       780       790       800       810

        470       480       490       500       510       520      
pF1KE0 YSDRYGFYYVEFNDRNKPRYPKASVQYYKKIIIANGFPNPREVESWYLKALETCSINNQM
       ::.:.:...:.:.: .: : :. :. .. .::  :::                       
CCDS21 YSQRFGLHHVNFSDSSKSRTPRKSAYFFTSIIEKNGFLTKGAKRLLPPNTVNLPSKVRAF
              820       830       840       850       860       870

        530       540       550       560                          
pF1KE0 LAAEPLLSHMQMVTEIVVPTVCSLCVLITAVLLMLLLRRQS                   
                                                                   
CCDS21 TFPSEVPSKAKVVWEKFSSQPKFERDLFYHGTFRDDFLWGVSSSAYQIEGAWDADGKGPS
              880       890       900       910       920       930

>>CCDS3451.1 KLB gene_id:152831|Hs108|chr4                (1044 aa)
 initn: 1161 init1: 607 opt: 929  Z-score: 1153.2  bits: 224.1 E(32554): 6.5e-58
Smith-Waterman score: 1230; 41.2% identity (66.1% similar) in 478 aa overlap (28-503:72-508)

                  10        20        30        40        50       
pF1KE0    MKPVWVATLLWMLLLVPRLGAARKGSPEEASFYYGTFPLGFSWGVGSSAYQTEGAWD
                                     :   : : ::: .: ::.:..: :.::.: 
CCDS34 SALILLRAVTGFSGDGRAIWSKNPNFTPVNESQLFLYDTFPKNFFWGIGTGALQVEGSWK
              50        60        70        80        90       100 

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE0 QDGKGPSIWDVFTHSGKGKVLGNETADVACDGYYKVQEDIILLRELHVNHYRFSLSWPRL
       .::::::::: : :.   .:    ... . :.:  ...:.  :  . :. :.::.:::::
CCDS34 KDGKGPSIWDHFIHTHLKNV---SSTNGSSDSYIFLEKDLSALDFIGVSFYQFSISWPRL
             110       120          130       140       150        

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE0 LPTGIRAEQVNKKGIEFYSDLIDALLSSNITPIVTLHHWDLPQLLQVKYGGWQNVSMANY
       .: :: .  .: ::...:: :.:::.  :: :::::.:::::  :: :::::.: .. . 
CCDS34 FPDGI-VTVANAKGLQYYSTLLDALVLRNIEPIVTLYHWDLPLALQEKYGGWKNDTIIDI
      160        170       180       190       200       210       

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE0 FRDYANLCFEAFGDRVKHWITFSDPRAMAEKGYETGHHAPGLKLRGTGLYKAAHHIIKAH
       : :::. ::. ::::::.:::. .:  .: .:: :: :::: :   ...: ..:..::::
CCDS34 FNDYATYCFQMFGDRVKYWITIHNPYLVAWHGYGTGMHAPGEKGNLAAVYTVGHNLIKAH
       220       230       240       250       260       270       

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE0 AKAWHSYNTTWRSKQQGLVGISLNCDWGEPVDISNPKDLEAAERYLQFCLGWFANPIYA-
       .:.::.::: .: .:.: ..:.:.  : ::    :  :.   .. .   ::::::::.. 
CCDS34 SKVWHNYNTHFRPHQKGWLSITLGSHWIEPNRSENTMDIFKCQQSMVSVLGWFANPIHGD
       280       290       300       310       320       330       

        300       310       320       330       340       350      
pF1KE0 GDYPQVMKDYIGRKSAEQGLEMSRLPVFSLQEKSYIKGTSDFLGLGHFTTRYITERNYPS
       ::::. :.  .          .: ::.::  ::  ..::.::....              
CCDS34 GDYPEGMRKKL----------FSVLPIFSEAEKHEMRGTADFFAFSF-------------
       340                 350       360       370                 

        360       370       380       390       400       410      
pF1KE0 RQGPSYQNDRDLIELVDPNWPDLGSKWLYSVPWGFRRLLNFAQTQYGDPPIYVMENGASQ
         ::.  : . :  .         .:   .:  ..:. ::. . .:..: : . :::   
CCDS34 --GPN--NFKPLNTM---------AKMGQNVSLNLREALNWIKLEYNNPRILIAENGWFT
              380                390       400       410       420 

        420       430       440        450       460       470     
pF1KE0 KFHCTQLCDEWRIQYLKGYINEMLKAIK-DGANIKGYTSWSLLDKFEWEKGYSDRYGFYY
         . ..  :   : ..:......:.::. :   . :::.::::: :::. .:. : :..:
CCDS34 DSR-VKTEDTTAIYMMKNFLSQVLQAIRLDEIRVFGYTAWSLLDGFEWQDAYTIRRGLFY
              430       440       450       460       470       480

         480       490       500       510       520       530     
pF1KE0 VEFNDRNKPRYPKASVQYYKKIIIANGFPNPREVESWYLKALETCSINNQMLAAEPLLSH
       :.::...: : ::.:..:::.::  :::                                
CCDS34 VDFNSKQKERKPKSSAHYYKQIIRENGFSLKESTPDVQGQFPCDFSWGVTESVLKPESVA
              490       500       510       520       530       540

>--
 initn: 556 init1: 321 opt: 867  Z-score: 1075.7  bits: 209.8 E(32554): 1.4e-53
Smith-Waterman score: 917; 33.7% identity (62.6% similar) in 513 aa overlap (35-533:519-998)

           10        20        30        40        50         60   
pF1KE0 WVATLLWMLLLVPRLGAARKGSPEEASFYYGTFPLGFSWGVGSSAYQTEG-AWDQDGKGP
                                     : ::  :::::  :. . :. : . . . :
CCDS34 ERKPKSSAHYYKQIIRENGFSLKESTPDVQGQFPCDFSWGVTESVLKPESVASSPQFSDP
      490       500       510       520       530       540        

              70        80          90       100       110         
pF1KE0 S--IWDVFTHSGKGKVLGN--ETADVACDGYYKVQEDIILLRELHVNHYRFSLSWPRLLP
          .:..  .    .: :   .:  . :  . ...... .: ...:.::::.:.:  .::
CCDS34 HLYVWNATGNRLLHRVEGVRLKTRPAQCTDFVNIKKQLEMLARMKVTHYRFALDWASVLP
      550       560       570       580       590       600        

     120       130       140       150            160       170    
pF1KE0 TGIRAEQVNKKGIEFYSDLIDALLSSNITPIVTLH-----HWDLPQLLQVKYGGWQNVSM
       ::     ::......:  ...  :. .:. .:::.     :  ::. : ..  :: : : 
CCDS34 TG-NLSAVNRQALRYYRCVVSEGLKLGISAMVTLYYPTHAHLGLPEPL-LHADGWLNPST
      610        620       630       640       650        660      

          180       190       200       210       220       230    
pF1KE0 ANYFRDYANLCFEAFGDRVKHWITFSDPRAMAEKGYETGHHAPGLKLRGTGLYKAAHHII
       :. :. ::.:::. .:: :: :::...:  ...   ..:. .          : :::...
CCDS34 AEAFQAYAGLCFQELGDLVKLWITINEPNRLSDIYNRSGNDT----------YGAAHNLL
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pF1KE0 KAHAKAWHSYNTTWRSKQQGLVGISLNCDWGEPVDISNPKDLEAAERYLQFCLGWFANPI
        ::: ::. :.  .: .:.: :..::. ::.::..    .  .::::.::: ..:::.:.
CCDS34 VAHALAWRLYDRQFRPSQRGAVSLSLHADWAEPANPYADSHWRAAERFLQFEIAWFAEPL
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pF1KE0 Y-AGDYPQVMKDYIGRKSAEQGLEMSRLPVFSLQEKSYIKGTSDFLGLGHFTTRYITERN
       . .:::: .:..::. :  ..::  : :: ..  :.  .::: :: .:.:::::.. ...
CCDS34 FKTGDYPAAMREYIASKH-RRGLSSSALPRLTEAERRLLKGTVDFCALNHFTTRFVMHEQ
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pF1KE0 YPSRQGPSYQNDRDLIELVDPNWPDLGSKWLYSVPWGFRRLLNFAQTQYGDPPIYVMENG
            :  :..:::.  : : .  .  .. :  .::: :.:: ... .:::  ::.  .:
CCDS34 LA---GSRYDSDRDIQFLQDITRLSSPTR-LAVIPWGVRKLLRWVRRNYGDMDIYITASG
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pF1KE0 ASQKFHCTQLCDEWRIQYLKGYINEMLKA-IKDGANIKGYTSWSLLDKFEWEKGYSDRYG
        ...   .   :. :  ::  :..:.::: . : . :::: ...: .    ::. . :.:
CCDS34 IDDQ---ALEDDRLRKYYLGKYLQEVLKAYLIDKVRIKGYYAFKLAE----EKS-KPRFG
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pF1KE0 FYYVEFNDRNKPRYPKASVQYYKKIIIANGFP--NPREVESWYLKALETCSINNQMLAAE
       :.  .:.        :.:.:.:.:.: . :::  :     :   .  : :..   ..  .
CCDS34 FFTSDFK-------AKSSIQFYNKVISSRGFPFENSSSRCSQTQENTE-CTVCLFLVQKK
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pF1KE0 PLLSHMQMVTEIVVPTVCSLCVLITAVLLMLLLRRQS            
       ::.                                              
CCDS34 PLIFLGCCFFSTLVLLLSIAIFQRQKRRKFWKAKNLQHIPLKKGKRVVS
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CCDS93 SLSLLLVLLGLGGRRLRAEPGDGAQTWARFSRPPAPEAAGLFQGTFPDGFLWAVGSAAYQ
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pF1KE0 TEGAWDQDGKGPSIWDVFTHS---------------GKGKVLGNETADVACDGYYKVQED
       :::.:.: ::: ::::.:::                :  . :   :.::: :.: .: .:
CCDS93 TEGGWQQHGKGASIWDTFTHHPLAPPGDSRNASLPLGAPSPLQPATGDVASDSYNNVFRD
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pF1KE0 IILLRELHVNHYRFSLSWPRLLPTGIRAEQVNKKGIEFYSDLIDALLSSNITPIVTLHHW
          :::: :.:::::.:: :.::.:  :   :..:...:  :.. :   .. :.:::.::
CCDS93 TEALRELGVTHYRFSISWARVLPNG-SAGVPNREGLRYYRRLLERLRELGVQPVVTLYHW
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       :::: ::  :::: : ..:..:::::.:::. :: .::.:::...: ..: .:: ::. :
CCDS93 DLPQRLQDAYGGWANRALADHFRDYAELCFRHFGGQVKYWITIDNPYVVAWHGYATGRLA
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pF1KE0 PGLKLRGTGLYKAAHHIIKAHAKAWHSYNTTWRSKQQGLVGISLNCDWGEPVDISNPKDL
       ::..      : .::... ::::.:: :::..:  : : :.:.:.  : .:  ... ...
CCDS93 PGIRGSPRLGYLVAHNLLLAHAKVWHLYNTSFRPTQGGQVSIALSSHWINPRRMTD-HSI
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pF1KE0 EAAERYLQFCLGWFANPIYA-GDYPQVMKDYIGRKSAEQGLEMSRLPVFSLQEKSYIKGT
       .  .. :.: :::::.:..  ::::. ::. ..          : :: :. .::..::::
CCDS93 KECQKSLDFVLGWFAKPVFIDGDYPESMKNNLS----------SILPDFTESEKKFIKGT
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pF1KE0 SDFLGLGHFTTRYITERNYPSRQGPSYQNDRDLIELVDPNWPDLGSKWLYSVPWGFRRLL
       .::..:                 ::. .     ..:.::.   .  . : : : ..:.::
CCDS93 ADFFALCF---------------GPTLS-----FQLLDPH---MKFRQLES-P-NLRQLL
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       .. . ... : :...:::   .   :.  :   . ::: .: : ::::: ::... :::.
CCDS93 SWIDLEFNHPQIFIVENGWFVS-GTTKRDDAKYMYYLKKFIMETLKAIKLDGVDVIGYTA
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pF1KE0 WSLLDKFEWEKGYSDRYGFYYVEFNDRNKPRYPKASVQYYKKIIIANGFPNPREVESWYL
       :::.: :::..::: : :..::.: ...:   ::.:. .:.:.:  ::::          
CCDS93 WSLMDGFEWHRGYSIRRGLFYVDFLSQDKMLLPKSSALFYQKLIEKNGFPPLPENQPLEG
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pF1KE0 KALETCSINNQMLAAEPLLSHMQMVTEIVVPTVCSLCVLITAVLLMLLLRRQS       
                                                                   
CCDS93 TFPCDFAWGVVDNYIQVDTTLSQFTDLNVYLWDVHHSKRLIKVDGVVTKKRKSYCVDFAA
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                   10        20        30        40        50      
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CCDS93 DFLSQDKMLLPKSSALFYQKLIEKNGFPPLPENQPLE-GTFPCDFAWGVVDNYIQVDTTL
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pF1KE0 DQ-DGKGPSIWDVFTHSGKG-KVLGNETADVA--CDGYYKVQEDIILLRELHVNHYRFSL
       .:    .  .:::  :: .  :: :  :      :  .  .: .: ::.:.::.:.::::
CCDS93 SQFTDLNVYLWDVH-HSKRLIKVDGVVTKKRKSYCVDFAAIQPQIALLQEMHVTHFRFSL
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pF1KE0 SWPRLLPTGIRAEQVNKKGIEFYSDLIDALLSSNITPIVTLHHWD-------LPQLLQVK
       .:  .:: : .. :::.  ...:  . . :.  ::::.:.:  :.       ::.:: ..
CCDS93 DWALILPLGNQS-QVNHTILQYYRCMASELVRVNITPVVAL--WQPMAPNQGLPRLL-AR
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pF1KE0 YGGWQNVSMANYFRDYANLCFEAFGDRVKHWITFSDP--RAMAEKGYETGHHAPGLKLRG
        :.:.:   :  : .:: :::. .: .:: :::...:  : :.                 
CCDS93 QGAWENPYTALAFAEYARLCFQELGHHVKLWITMNEPYTRNMT-----------------
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          :.:.:...:::: ::: ::  .:  :.: ..:.:. :: ::.   . :: :.::: :
CCDS93 ---YSAGHNLLKAHALAWHVYNEKFRHAQNGKISIALQADWIEPACPFSQKDKEVAERVL
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       .: .::.:.::. .:::: ::.:......         :: :. .::. :.:: :::.:.
CCDS93 EFDIGWLAEPIFGSGDYPWVMRDWLNQRNNFL------LPYFTEDEKKLIQGTFDFLALS
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pF1KE0 HFTTRYI-TERNYPSRQGPSYQNDRDLIELVDPNWPDLGSKWLYSVPWGFRRLLNFAQTQ
       :.::  . .:.. : .    :..  .. :..: .: .  :. .  ::::.:..::. . .
CCDS93 HYTTILVDSEKEDPIK----YNDYLEVQEMTDITWLNSPSQ-VAVVPWGLRKVLNWLKFK
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pF1KE0 YGDPPIYVMENGASQKFHCTQLCDEWRIQYLKGYINEMLKA-IKDGANIKGYTSWSLLDK
       ::: :.:.. :: .. .:  .  :. :. :...:::: ::: : :: :. :: ..:. :.
CCDS93 YGDLPMYIISNGIDDGLHAED--DQLRVYYMQNYINEALKAHILDGINLCGYFAYSFNDR
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pF1KE0 FEWEKGYSDRYGFYYVEFNDRNKPRYPKASVQYYKKIIIANGFPNPREVESWYLKALETC
              . :.:.:    .. .    ::::...:.::: .::::.:. .: .  . . .:
CCDS93 ------TAPRFGLYRYAADQFE----PKASMKHYRKIIDSNGFPGPETLERFCPEEFTVC
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       .                                              
CCDS93 TECSFFHTRKSLLAFIAFLFFASIISLSLIFYYSKKGRRSYK     
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567 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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