FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1086, 899 aa 1>>>pF1KA1086 899 - 899 aa - 899 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0103+/-0.000444; mu= -10.0523+/- 0.028 mean_var=666.1934+/-139.516, 0's: 0 Z-trim(124.5): 31 B-trim: 2218 in 1/61 Lambda= 0.049691 statistics sampled from 46390 (46440) to 46390 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.797), E-opt: 0.2 (0.545), width: 16 Scan time: 17.550 The best scores are: opt bits E(85289) NP_057191 (OMIM: 615635) zinc finger RNA-binding p (1074) 1480 121.9 1.7e-26 NP_703194 (OMIM: 603182) interleukin enhancer-bind ( 690) 988 86.4 5.2e-16 NP_004507 (OMIM: 603182) interleukin enhancer-bind ( 702) 988 86.4 5.2e-16 NP_001131145 (OMIM: 603182) interleukin enhancer-b ( 706) 988 86.4 5.2e-16 XP_011526287 (OMIM: 603182) PREDICTED: interleukin ( 777) 988 86.5 5.6e-16 XP_006722805 (OMIM: 603182) PREDICTED: interleukin ( 855) 988 86.5 5.9e-16 NP_036350 (OMIM: 603182) interleukin enhancer-bind ( 894) 988 86.5 6.1e-16 XP_016882252 (OMIM: 603182) PREDICTED: interleukin ( 898) 988 86.5 6.1e-16 NP_060090 (OMIM: 603182) interleukin enhancer-bind ( 898) 988 86.5 6.1e-16 XP_011526286 (OMIM: 603182) PREDICTED: interleukin ( 898) 988 86.5 6.1e-16 XP_016870387 (OMIM: 611138) PREDICTED: spermatid p ( 648) 945 83.3 4.2e-15 XP_016870386 (OMIM: 611138) PREDICTED: spermatid p ( 657) 945 83.3 4.2e-15 NP_001164608 (OMIM: 611138) spermatid perinuclear ( 658) 945 83.3 4.2e-15 XP_016870385 (OMIM: 611138) PREDICTED: spermatid p ( 672) 945 83.3 4.3e-15 NP_060857 (OMIM: 611138) spermatid perinuclear RNA ( 672) 945 83.3 4.3e-15 XP_016870384 (OMIM: 611138) PREDICTED: spermatid p ( 672) 945 83.3 4.3e-15 XP_016870383 (OMIM: 611138) PREDICTED: spermatid p ( 672) 945 83.3 4.3e-15 XP_016870382 (OMIM: 611138) PREDICTED: spermatid p ( 674) 945 83.3 4.3e-15 XP_016870381 (OMIM: 611138) PREDICTED: spermatid p ( 674) 945 83.3 4.3e-15 XP_016870379 (OMIM: 611138) PREDICTED: spermatid p ( 674) 945 83.3 4.3e-15 XP_016870380 (OMIM: 611138) PREDICTED: spermatid p ( 674) 945 83.3 4.3e-15 >>NP_057191 (OMIM: 615635) zinc finger RNA-binding prote (1074 aa) initn: 1760 init1: 908 opt: 1480 Z-score: 596.9 bits: 121.9 E(85289): 1.7e-26 Smith-Waterman score: 2542; 47.1% identity (68.7% similar) in 937 aa overlap (51-890:143-1068) 30 40 50 60 70 pF1KA1 QPHSGQDFAYGSRPQEPVPTATTMATYQDSYSYGQSAA-ARSYEDRPYFQSAALQSGRMT ::: .:.: : .:... :.:. . .. .. 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NP_703 MRPMRIFVNDDRHVMAKHSSVYPTQEELEAVQNMVSHT 10 20 30 580 590 600 610 620 pF1KA1 ERALKLVSDTLAEEDRGRREE----------EGDKRSSVAPQ-----TRVLKGVMRVGIL ::::: ::: . :...: :. : :.. ... : ::.:.::::::.. NP_703 ERALKAVSDWIDEQEKGSSEQAESDNMDVPPEDDSKEGAGEQKTEHMTRTLRGVMRVGLV 40 50 60 70 80 90 630 640 650 660 670 680 pF1KA1 AKGLLLRGDRNVRLALLCSEKPTHSLLRRIAQQLPRQLQMVTEDEYEV-SSDPEANIVIS ::::::.:: ...:.:::.:::: .:: ..:..: :: ::::.::. .: .: :::. NP_703 AKGLLLKGDLDLELVLLCKEKPTTALLDKVADNLAIQLAAVTEDKYEILQSVDDAAIVIK 100 110 120 130 140 150 690 700 710 720 730 740 pF1KA1 SCEEPRMQVTISVTSPLMRED-PSTDPGVEEPQADAGDVLSPKKCLESLAALRHARWFQA . .:: ...:: .:::..::. .. : : :::. .::: .::.::::.:::: NP_703 NTKEPPLSLTIHLTSPVVREEMEKVLAGETLSVNDPPDVLDRQKCLAALASLRHAKWFQA 160 170 180 190 200 210 750 760 770 780 790 800 pF1KA1 RASGLQPCVIVIRVLRDLCRRVPTWGALPAWAMELLVEKAVSSAAGPLGPGDAVRRVLEC ::.::. :::::::::::: :::::: : .: .::: ::....: :.: :.:.:::::: NP_703 RANGLKSCVIVIRVLRDLCTRVPTWGPLRGWPLELLCEKSIGTANRPMGAGEALRRVLEC 220 230 240 250 260 270 810 820 830 840 850 860 pF1KA1 VATGTLLTDGPGLQDPCERDQTDALEPMTLQEREDVTASAQHALRMLAFRQTHKVLGMDL .:.: .. :: :. ::::.. :::. . :.:::.: :::::::. :: : ::::::: NP_703 LASGIVMPDGSGIYDPCEKEATDAIGHLDRQQREDITQSAQHALRLAAFGQLHKVLGMDP 280 290 300 310 320 330 870 880 890 pF1KA1 LPPRHRLGARFRKRQRGPGEGEEGAGEKKRGRRGGEGLV :: . NP_703 LPSKMPKKPKNENPVDYTVQIPPSTTYAITPMKRPMEEDGEEKSPSKKKKKIQKKEEKAE 340 350 360 370 380 390 >>NP_004507 (OMIM: 603182) interleukin enhancer-binding (702 aa) initn: 969 init1: 666 opt: 988 Z-score: 408.4 bits: 86.4 E(85289): 5.2e-16 Smith-Waterman score: 1144; 53.3% identity (76.3% similar) in 334 aa overlap (548-864:9-342) 520 530 540 550 560 570 pF1KA1 APPDWAQPLLMGRPESPASAPLQPGRRPASSDDRHVMCKHATIYPTEQELLAVQRAVSHA .:::::: ::...:::..:: ::: :::. NP_004 MRPMRIFVNDDRHVMAKHSSVYPTQEELEAVQNMVSHT 10 20 30 580 590 600 610 620 pF1KA1 ERALKLVSDTLAEEDRGRREE----------EGDKRSSVAPQ-----TRVLKGVMRVGIL ::::: ::: . :...: :. : :.. ... : ::.:.::::::.. NP_004 ERALKAVSDWIDEQEKGSSEQAESDNMDVPPEDDSKEGAGEQKTEHMTRTLRGVMRVGLV 40 50 60 70 80 90 630 640 650 660 670 680 pF1KA1 AKGLLLRGDRNVRLALLCSEKPTHSLLRRIAQQLPRQLQMVTEDEYEV-SSDPEANIVIS ::::::.:: ...:.:::.:::: .:: ..:..: :: ::::.::. .: .: :::. 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NP_004 LPSKMPKKPKNENPVDYTVQIPPSTTYAITPMKRPMEEDGEEKSPSKKKKKIQKKEEKAE 340 350 360 370 380 390 >>NP_001131145 (OMIM: 603182) interleukin enhancer-bindi (706 aa) initn: 969 init1: 666 opt: 988 Z-score: 408.4 bits: 86.4 E(85289): 5.2e-16 Smith-Waterman score: 1144; 53.3% identity (76.3% similar) in 334 aa overlap (548-864:9-342) 520 530 540 550 560 570 pF1KA1 APPDWAQPLLMGRPESPASAPLQPGRRPASSDDRHVMCKHATIYPTEQELLAVQRAVSHA .:::::: ::...:::..:: ::: :::. NP_001 MRPMRIFVNDDRHVMAKHSSVYPTQEELEAVQNMVSHT 10 20 30 580 590 600 610 620 pF1KA1 ERALKLVSDTLAEEDRGRREE----------EGDKRSSVAPQ-----TRVLKGVMRVGIL ::::: ::: . :...: :. : :.. ... : ::.:.::::::.. NP_001 ERALKAVSDWIDEQEKGSSEQAESDNMDVPPEDDSKEGAGEQKTEHMTRTLRGVMRVGLV 40 50 60 70 80 90 630 640 650 660 670 680 pF1KA1 AKGLLLRGDRNVRLALLCSEKPTHSLLRRIAQQLPRQLQMVTEDEYEV-SSDPEANIVIS ::::::.:: ...:.:::.:::: .:: ..:..: :: ::::.::. .: .: :::. NP_001 AKGLLLKGDLDLELVLLCKEKPTTALLDKVADNLAIQLAAVTEDKYEILQSVDDAAIVIK 100 110 120 130 140 150 690 700 710 720 730 740 pF1KA1 SCEEPRMQVTISVTSPLMRED-PSTDPGVEEPQADAGDVLSPKKCLESLAALRHARWFQA . .:: ...:: .:::..::. .. : : :::. .::: .::.::::.:::: NP_001 NTKEPPLSLTIHLTSPVVREEMEKVLAGETLSVNDPPDVLDRQKCLAALASLRHAKWFQA 160 170 180 190 200 210 750 760 770 780 790 800 pF1KA1 RASGLQPCVIVIRVLRDLCRRVPTWGALPAWAMELLVEKAVSSAAGPLGPGDAVRRVLEC ::.::. :::::::::::: :::::: : .: .::: ::....: :.: :.:.:::::: NP_001 RANGLKSCVIVIRVLRDLCTRVPTWGPLRGWPLELLCEKSIGTANRPMGAGEALRRVLEC 220 230 240 250 260 270 810 820 830 840 850 860 pF1KA1 VATGTLLTDGPGLQDPCERDQTDALEPMTLQEREDVTASAQHALRMLAFRQTHKVLGMDL .:.: .. :: :. ::::.. :::. . :.:::.: :::::::. :: : ::::::: NP_001 LASGIVMPDGSGIYDPCEKEATDAIGHLDRQQREDITQSAQHALRLAAFGQLHKVLGMDP 280 290 300 310 320 330 870 880 890 pF1KA1 LPPRHRLGARFRKRQRGPGEGEEGAGEKKRGRRGGEGLV :: . NP_001 LPSKMPKKPKNENPVDYTVQIPPSTTYAITPMKRPMEEDGEEKSPSKKKKKIQKKEEKAE 340 350 360 370 380 390 >>XP_011526287 (OMIM: 603182) PREDICTED: interleukin enh (777 aa) initn: 969 init1: 666 opt: 988 Z-score: 407.9 bits: 86.5 E(85289): 5.6e-16 Smith-Waterman score: 1144; 53.3% identity (76.3% similar) in 334 aa overlap (548-864:9-342) 520 530 540 550 560 570 pF1KA1 APPDWAQPLLMGRPESPASAPLQPGRRPASSDDRHVMCKHATIYPTEQELLAVQRAVSHA .:::::: ::...:::..:: ::: :::. XP_011 MRPMRIFVNDDRHVMAKHSSVYPTQEELEAVQNMVSHT 10 20 30 580 590 600 610 620 pF1KA1 ERALKLVSDTLAEEDRGRREE----------EGDKRSSVAPQ-----TRVLKGVMRVGIL ::::: ::: . :...: :. : :.. ... : ::.:.::::::.. XP_011 ERALKAVSDWIDEQEKGSSEQAESDNMDVPPEDDSKEGAGEQKTEHMTRTLRGVMRVGLV 40 50 60 70 80 90 630 640 650 660 670 680 pF1KA1 AKGLLLRGDRNVRLALLCSEKPTHSLLRRIAQQLPRQLQMVTEDEYEV-SSDPEANIVIS ::::::.:: ...:.:::.:::: .:: ..:..: :: ::::.::. .: .: :::. XP_011 AKGLLLKGDLDLELVLLCKEKPTTALLDKVADNLAIQLAAVTEDKYEILQSVDDAAIVIK 100 110 120 130 140 150 690 700 710 720 730 740 pF1KA1 SCEEPRMQVTISVTSPLMRED-PSTDPGVEEPQADAGDVLSPKKCLESLAALRHARWFQA . .:: ...:: .:::..::. .. : : :::. .::: .::.::::.:::: XP_011 NTKEPPLSLTIHLTSPVVREEMEKVLAGETLSVNDPPDVLDRQKCLAALASLRHAKWFQA 160 170 180 190 200 210 750 760 770 780 790 800 pF1KA1 RASGLQPCVIVIRVLRDLCRRVPTWGALPAWAMELLVEKAVSSAAGPLGPGDAVRRVLEC ::.::. :::::::::::: :::::: : .: .::: ::....: :.: :.:.:::::: XP_011 RANGLKSCVIVIRVLRDLCTRVPTWGPLRGWPLELLCEKSIGTANRPMGAGEALRRVLEC 220 230 240 250 260 270 810 820 830 840 850 860 pF1KA1 VATGTLLTDGPGLQDPCERDQTDALEPMTLQEREDVTASAQHALRMLAFRQTHKVLGMDL .:.: .. :: :. ::::.. :::. . :.:::.: :::::::. :: : ::::::: XP_011 LASGIVMPDGSGIYDPCEKEATDAIGHLDRQQREDITQSAQHALRLAAFGQLHKVLGMDP 280 290 300 310 320 330 870 880 890 pF1KA1 LPPRHRLGARFRKRQRGPGEGEEGAGEKKRGRRGGEGLV :: . XP_011 LPSKMPKKPKNENPVDYTVQIPPSTTYAITPMKRPMEEDGEEKSPSKKKKKIQKKEEKAE 340 350 360 370 380 390 >>XP_006722805 (OMIM: 603182) PREDICTED: interleukin enh (855 aa) initn: 969 init1: 666 opt: 988 Z-score: 407.4 bits: 86.5 E(85289): 5.9e-16 Smith-Waterman score: 1144; 53.3% identity (76.3% similar) in 334 aa overlap (548-864:9-342) 520 530 540 550 560 570 pF1KA1 APPDWAQPLLMGRPESPASAPLQPGRRPASSDDRHVMCKHATIYPTEQELLAVQRAVSHA .:::::: ::...:::..:: ::: :::. XP_006 MRPMRIFVNDDRHVMAKHSSVYPTQEELEAVQNMVSHT 10 20 30 580 590 600 610 620 pF1KA1 ERALKLVSDTLAEEDRGRREE----------EGDKRSSVAPQ-----TRVLKGVMRVGIL ::::: ::: . :...: :. : :.. ... : ::.:.::::::.. XP_006 ERALKAVSDWIDEQEKGSSEQAESDNMDVPPEDDSKEGAGEQKTEHMTRTLRGVMRVGLV 40 50 60 70 80 90 630 640 650 660 670 680 pF1KA1 AKGLLLRGDRNVRLALLCSEKPTHSLLRRIAQQLPRQLQMVTEDEYEV-SSDPEANIVIS ::::::.:: ...:.:::.:::: .:: ..:..: :: ::::.::. .: .: :::. 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XP_006 LPSKMPKKPKNENPVDYTVQIPPSTTYAITPMKRPMEEDGEEKSPSKKKKKIQKKEEKAE 340 350 360 370 380 390 >>NP_036350 (OMIM: 603182) interleukin enhancer-binding (894 aa) initn: 969 init1: 666 opt: 988 Z-score: 407.2 bits: 86.5 E(85289): 6.1e-16 Smith-Waterman score: 1144; 53.3% identity (76.3% similar) in 334 aa overlap (548-864:9-342) 520 530 540 550 560 570 pF1KA1 APPDWAQPLLMGRPESPASAPLQPGRRPASSDDRHVMCKHATIYPTEQELLAVQRAVSHA .:::::: ::...:::..:: ::: :::. NP_036 MRPMRIFVNDDRHVMAKHSSVYPTQEELEAVQNMVSHT 10 20 30 580 590 600 610 620 pF1KA1 ERALKLVSDTLAEEDRGRREE----------EGDKRSSVAPQ-----TRVLKGVMRVGIL ::::: ::: . :...: :. : :.. ... : ::.:.::::::.. NP_036 ERALKAVSDWIDEQEKGSSEQAESDNMDVPPEDDSKEGAGEQKTEHMTRTLRGVMRVGLV 40 50 60 70 80 90 630 640 650 660 670 680 pF1KA1 AKGLLLRGDRNVRLALLCSEKPTHSLLRRIAQQLPRQLQMVTEDEYEV-SSDPEANIVIS ::::::.:: ...:.:::.:::: .:: ..:..: :: ::::.::. .: .: :::. NP_036 AKGLLLKGDLDLELVLLCKEKPTTALLDKVADNLAIQLAAVTEDKYEILQSVDDAAIVIK 100 110 120 130 140 150 690 700 710 720 730 740 pF1KA1 SCEEPRMQVTISVTSPLMRED-PSTDPGVEEPQADAGDVLSPKKCLESLAALRHARWFQA . .:: ...:: .:::..::. .. : : :::. .::: .::.::::.:::: NP_036 NTKEPPLSLTIHLTSPVVREEMEKVLAGETLSVNDPPDVLDRQKCLAALASLRHAKWFQA 160 170 180 190 200 210 750 760 770 780 790 800 pF1KA1 RASGLQPCVIVIRVLRDLCRRVPTWGALPAWAMELLVEKAVSSAAGPLGPGDAVRRVLEC ::.::. :::::::::::: :::::: : .: .::: ::....: :.: :.:.:::::: NP_036 RANGLKSCVIVIRVLRDLCTRVPTWGPLRGWPLELLCEKSIGTANRPMGAGEALRRVLEC 220 230 240 250 260 270 810 820 830 840 850 860 pF1KA1 VATGTLLTDGPGLQDPCERDQTDALEPMTLQEREDVTASAQHALRMLAFRQTHKVLGMDL .:.: .. :: :. ::::.. :::. . :.:::.: :::::::. :: : ::::::: NP_036 LASGIVMPDGSGIYDPCEKEATDAIGHLDRQQREDITQSAQHALRLAAFGQLHKVLGMDP 280 290 300 310 320 330 870 880 890 pF1KA1 LPPRHRLGARFRKRQRGPGEGEEGAGEKKRGRRGGEGLV :: . NP_036 LPSKMPKKPKNENPVDYTVQIPPSTTYAITPMKRPMEEDGEEKSPSKKKKKIQKKEEKAE 340 350 360 370 380 390 >>XP_016882252 (OMIM: 603182) PREDICTED: interleukin enh (898 aa) initn: 969 init1: 666 opt: 988 Z-score: 407.1 bits: 86.5 E(85289): 6.1e-16 Smith-Waterman score: 1144; 53.3% identity (76.3% similar) in 334 aa overlap (548-864:9-342) 520 530 540 550 560 570 pF1KA1 APPDWAQPLLMGRPESPASAPLQPGRRPASSDDRHVMCKHATIYPTEQELLAVQRAVSHA .:::::: ::...:::..:: ::: :::. XP_016 MRPMRIFVNDDRHVMAKHSSVYPTQEELEAVQNMVSHT 10 20 30 580 590 600 610 620 pF1KA1 ERALKLVSDTLAEEDRGRREE----------EGDKRSSVAPQ-----TRVLKGVMRVGIL ::::: ::: . :...: :. : :.. ... : ::.:.::::::.. XP_016 ERALKAVSDWIDEQEKGSSEQAESDNMDVPPEDDSKEGAGEQKTEHMTRTLRGVMRVGLV 40 50 60 70 80 90 630 640 650 660 670 680 pF1KA1 AKGLLLRGDRNVRLALLCSEKPTHSLLRRIAQQLPRQLQMVTEDEYEV-SSDPEANIVIS ::::::.:: ...:.:::.:::: .:: ..:..: :: ::::.::. .: .: :::. XP_016 AKGLLLKGDLDLELVLLCKEKPTTALLDKVADNLAIQLAAVTEDKYEILQSVDDAAIVIK 100 110 120 130 140 150 690 700 710 720 730 740 pF1KA1 SCEEPRMQVTISVTSPLMRED-PSTDPGVEEPQADAGDVLSPKKCLESLAALRHARWFQA . .:: ...:: .:::..::. .. : : :::. .::: .::.::::.:::: XP_016 NTKEPPLSLTIHLTSPVVREEMEKVLAGETLSVNDPPDVLDRQKCLAALASLRHAKWFQA 160 170 180 190 200 210 750 760 770 780 790 800 pF1KA1 RASGLQPCVIVIRVLRDLCRRVPTWGALPAWAMELLVEKAVSSAAGPLGPGDAVRRVLEC ::.::. :::::::::::: :::::: : .: .::: ::....: :.: :.:.:::::: XP_016 RANGLKSCVIVIRVLRDLCTRVPTWGPLRGWPLELLCEKSIGTANRPMGAGEALRRVLEC 220 230 240 250 260 270 810 820 830 840 850 860 pF1KA1 VATGTLLTDGPGLQDPCERDQTDALEPMTLQEREDVTASAQHALRMLAFRQTHKVLGMDL .:.: .. :: :. ::::.. :::. . :.:::.: :::::::. :: : ::::::: XP_016 LASGIVMPDGSGIYDPCEKEATDAIGHLDRQQREDITQSAQHALRLAAFGQLHKVLGMDP 280 290 300 310 320 330 870 880 890 pF1KA1 LPPRHRLGARFRKRQRGPGEGEEGAGEKKRGRRGGEGLV :: . XP_016 LPSKMPKKPKNENPVDYTVQIPPSTTYAITPMKRPMEEDGEEKSPSKKKKKIQKKEEKAE 340 350 360 370 380 390 >>NP_060090 (OMIM: 603182) interleukin enhancer-binding (898 aa) initn: 969 init1: 666 opt: 988 Z-score: 407.1 bits: 86.5 E(85289): 6.1e-16 Smith-Waterman score: 1144; 53.3% identity (76.3% similar) in 334 aa overlap (548-864:9-342) 520 530 540 550 560 570 pF1KA1 APPDWAQPLLMGRPESPASAPLQPGRRPASSDDRHVMCKHATIYPTEQELLAVQRAVSHA .:::::: ::...:::..:: ::: :::. NP_060 MRPMRIFVNDDRHVMAKHSSVYPTQEELEAVQNMVSHT 10 20 30 580 590 600 610 620 pF1KA1 ERALKLVSDTLAEEDRGRREE----------EGDKRSSVAPQ-----TRVLKGVMRVGIL ::::: ::: . :...: :. : :.. ... : ::.:.::::::.. NP_060 ERALKAVSDWIDEQEKGSSEQAESDNMDVPPEDDSKEGAGEQKTEHMTRTLRGVMRVGLV 40 50 60 70 80 90 630 640 650 660 670 680 pF1KA1 AKGLLLRGDRNVRLALLCSEKPTHSLLRRIAQQLPRQLQMVTEDEYEV-SSDPEANIVIS ::::::.:: ...:.:::.:::: .:: ..:..: :: ::::.::. .: .: :::. NP_060 AKGLLLKGDLDLELVLLCKEKPTTALLDKVADNLAIQLAAVTEDKYEILQSVDDAAIVIK 100 110 120 130 140 150 690 700 710 720 730 740 pF1KA1 SCEEPRMQVTISVTSPLMRED-PSTDPGVEEPQADAGDVLSPKKCLESLAALRHARWFQA . .:: ...:: .:::..::. .. : : :::. .::: .::.::::.:::: NP_060 NTKEPPLSLTIHLTSPVVREEMEKVLAGETLSVNDPPDVLDRQKCLAALASLRHAKWFQA 160 170 180 190 200 210 750 760 770 780 790 800 pF1KA1 RASGLQPCVIVIRVLRDLCRRVPTWGALPAWAMELLVEKAVSSAAGPLGPGDAVRRVLEC ::.::. :::::::::::: :::::: : .: .::: ::....: :.: :.:.:::::: NP_060 RANGLKSCVIVIRVLRDLCTRVPTWGPLRGWPLELLCEKSIGTANRPMGAGEALRRVLEC 220 230 240 250 260 270 810 820 830 840 850 860 pF1KA1 VATGTLLTDGPGLQDPCERDQTDALEPMTLQEREDVTASAQHALRMLAFRQTHKVLGMDL .:.: .. :: :. ::::.. :::. . :.:::.: :::::::. :: : ::::::: NP_060 LASGIVMPDGSGIYDPCEKEATDAIGHLDRQQREDITQSAQHALRLAAFGQLHKVLGMDP 280 290 300 310 320 330 870 880 890 pF1KA1 LPPRHRLGARFRKRQRGPGEGEEGAGEKKRGRRGGEGLV :: . NP_060 LPSKMPKKPKNENPVDYTVQIPPSTTYAITPMKRPMEEDGEEKSPSKKKKKIQKKEEKAE 340 350 360 370 380 390 >>XP_011526286 (OMIM: 603182) PREDICTED: interleukin enh (898 aa) initn: 969 init1: 666 opt: 988 Z-score: 407.1 bits: 86.5 E(85289): 6.1e-16 Smith-Waterman score: 1144; 53.3% identity (76.3% similar) in 334 aa overlap (548-864:9-342) 520 530 540 550 560 570 pF1KA1 APPDWAQPLLMGRPESPASAPLQPGRRPASSDDRHVMCKHATIYPTEQELLAVQRAVSHA .:::::: ::...:::..:: ::: :::. XP_011 MRPMRIFVNDDRHVMAKHSSVYPTQEELEAVQNMVSHT 10 20 30 580 590 600 610 620 pF1KA1 ERALKLVSDTLAEEDRGRREE----------EGDKRSSVAPQ-----TRVLKGVMRVGIL ::::: ::: . :...: :. : :.. ... : ::.:.::::::.. XP_011 ERALKAVSDWIDEQEKGSSEQAESDNMDVPPEDDSKEGAGEQKTEHMTRTLRGVMRVGLV 40 50 60 70 80 90 630 640 650 660 670 680 pF1KA1 AKGLLLRGDRNVRLALLCSEKPTHSLLRRIAQQLPRQLQMVTEDEYEV-SSDPEANIVIS ::::::.:: ...:.:::.:::: .:: ..:..: :: ::::.::. .: .: :::. 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