Result of SIM4 for pF1KA1086

seq1 = pF1KA1086.tfa, 2697 bp
seq2 = pF1KA1086/gi568815579r_3706024.tfa (gi568815579r:3706024_3934916), 228893 bp

>pF1KA1086 2697
>gi568815579r:3706024_3934916 (Chr19)

(complement)

1-144  (100001-100144)   100% ->
145-259  (101139-101253)   100% ->
260-478  (103039-103257)   99% ->
479-732  (103361-103614)   100% ->
733-915  (107264-107446)   100% ->
916-1093  (109510-109687)   100% ->
1094-1251  (111514-111671)   100% ->
1252-1371  (112717-112836)   100% ->
1372-1511  (113438-113577)   100% ->
1512-1620  (114627-114735)   100% ->
1621-1811  (115682-115872)   100% ->
1812-1983  (118072-118243)   100% ->
1984-2122  (120959-121097)   100% ->
2123-2217  (123551-123645)   100% ->
2218-2313  (124072-124167)   100% ->
2314-2425  (125934-126045)   100% ->
2426-2523  (127648-127745)   100% ->
2524-2697  (128792-128965)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACCCTGCCGTGAACCCGGCCTTTCCCCCAGCTGCCCCGGCAGGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACCCTGCCGTGAACCCGGCCTTTCCCCCAGCTGCCCCGGCAGGGTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGTGGATACCAGCCCCACTCCGGCCAGGACTTCGCCTACGGCAGCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGTGGATACCAGCCCCACTCCGGCCAGGACTTCGCCTACGGCAGCCGAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCAGGAGCCCGTCCCCACGGCCACCACCATGGCTACCTACCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100101 CCCAGGAGCCCGTCCCCACGGCCACCACCATGGCTACCTACCAGGTA...

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    145    GACAGTTACAGCTACGGACAGTCAGCAGCTGCCAGGAGCTATGAGGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101136 TAGGACAGTTACAGCTACGGACAGTCAGCAGCTGCCAGGAGCTATGAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAGGCCGTACTTCCAGTCTGCTGCCCTCCAGTCTGGGCGCATGACAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101186 CAGGCCGTACTTCCAGTCTGCTGCCCTCCAGTCTGGGCGCATGACAGCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGACTCCGGCCAGCCAG         GGACCCAAGAAGCCTGCGGGCAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 101236 CAGACTCCGGCCAGCCAGGTG...TAGGGACCCAAGAAGCCTGCGGGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCCAGCCCCCATGGCAGTCACAGCCACGCTCAGCCCCCACAGCAGGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103062 CCCAGCCCCCATGGCAGTCACAGCCACGCTCAGCCCCCACAGCAGGCGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CATAGTGGAGTCCGGACAGCCAGCGAGCACCTTGTCCTCGGGATACACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103112 CATAGTGGAGTCCGGACAGCCAGCGAGCACCTTGTCCTCGGGATACACCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACCCCACGGCGACAGGCGTCCAGCCCGAGTCGTCAGCTTCCATCATGACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 103162 ACCCCACGGCGACAGGCGTCCAGCCCGAGTCGTCAGCTTCCATCGTGACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TCCTACCCCCCGCCCTCCTACAACCCCACCTGCACCGCCTACACGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 103212 TCCTACCCCCCGCCCTCCTACAACCCCACCTGCACCGCCTACACGGGTA.

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    479      CACCAAGCTACCCGAACTATGACGCGTCGGTGTACTCCGCTGCCA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103262 ..CAGCACCAAGCTACCCGAACTATGACGCGTCGGTGTACTCCGCTGCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCCCTTTCTATCCTCCAGCGCAGCCCCCGCCTCCCCCGGGACCCCCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103406 GCCCTTTCTATCCTCCAGCGCAGCCCCCGCCTCCCCCGGGACCCCCGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CAGCTGCCCCCGCCGCCCGCGCCTGCAGGCTCAGGAAGCAGCCCCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103456 CAGCTGCCCCCGCCGCCCGCGCCTGCAGGCTCAGGAAGCAGCCCCAGGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CGACTCGAAGCCACCGCTTCCCAGCAAGCTGCCGAGACCCAAGGCGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103506 CGACTCGAAGCCACCGCTTCCCAGCAAGCTGCCGAGACCCAAGGCGGGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CCAGGCAGCTCCAGCTTCACTACTGCGACATCTGCAAGATCAGCTGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103556 CCAGGCAGCTCCAGCTTCACTACTGCGACATCTGCAAGATCAGCTGCGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GGCCCCCAG         ACCTACCGGGAACATCTGGGAGGGCAGAAGCA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 103606 GGCCCCCAGGTC...CAGACCTACCGGGAACATCTGGGAGGGCAGAAGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CAGAAAGAAGGAGGCGGCCCAGAAGACAGGCGTGCAGCCCAACGGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107296 CAGAAAGAAGGAGGCGGCCCAGAAGACAGGCGTGCAGCCCAACGGGAGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CGCGCGGGGTGCAGGCGCAGCTGCATTGCGACCTGTGCGCCGTGTCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107346 CGCGCGGGGTGCAGGCGCAGCTGCATTGCGACCTGTGCGCCGTGTCCTGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ACCGGGGCGGACGCCTACGCGGCCCACATCCGGGGATCCAAGCACCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107396 ACCGGGGCGGACGCCTACGCGGCCCACATCCGGGGATCCAAGCACCAGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 G         GTCTTCAAGCTGCACGCCAAACTGGGGAAGCCCATTCCCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107446 GGTA...CAGGTCTTCAAGCTGCACGCCAAACTGGGGAAGCCCATTCCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CCCTCGAGCCTGCACTGGCCACAGAGAGCCCCCCCGGGGCAGAGGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109550 CCCTCGAGCCTGCACTGGCCACAGAGAGCCCCCCCGGGGCAGAGGCCAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CCCACGTCCCCCACTGGCCCCAGCGTGTGTGCCTCGAGCAGGCCAGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109600 CCCACGTCCCCCACTGGCCCCAGCGTGTGTGCCTCGAGCAGGCCAGCGCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GGCCAAGAGACCCGTGGCCTCGAAGGCCTTATGCGAGG         GGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 109650 GGCCAAGAGACCCGTGGCCTCGAAGGCCTTATGCGAGGGTA...CAGGGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CTCCTGAGCCACAGGCAGCAGGCTGCAGACCCCAGTGGGGGAAACCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111517 CTCCTGAGCCACAGGCAGCAGGCTGCAGACCCCAGTGGGGGAAACCAGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CAACCTAAATTAGAGGGTCCCGGAGCACCTACCCAAGGAGGCTCAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111567 CAACCTAAATTAGAGGGTCCCGGAGCACCTACCCAAGGAGGCTCAAAGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 AGCTCCCGCGGGCTGCTCTGATGCGCAGCCGGTGGGCCCGGAATATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111617 AGCTCCCGCGGGCTGCTCTGATGCGCAGCCGGTGGGCCCGGAATATGTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 AGGAG         GTGTTCAGCGACGAAGGGCGAGTGCTTCGCTTCCAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111667 AGGAGGTA...CAGGTGTTCAGCGACGAAGGGCGAGTGCTTCGCTTCCAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TGCAAGCTGTGCGAGTGCAGTTTCAACGACCTTAACGCGAAGGACCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112753 TGCAAGCTGTGCGAGTGCAGTTTCAACGACCTTAACGCGAAGGACCTGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 CGTGAGGGGGCGGCGGCACCGGCTGCAGTACCGG         AAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 112803 CGTGAGGGGGCGGCGGCACCGGCTGCAGTACCGGGTG...CAGAAGAAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TGAACCCGGACCTTCCCATTGCCACGGAGCCCAGCAGCCGGGCTCGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113445 TGAACCCGGACCTTCCCATTGCCACGGAGCCCAGCAGCCGGGCTCGGAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 GTCCTGGAGGAGCGCATGAGGAAGCAGCGGCACCTGGCGGAGGAGCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113495 GTCCTGGAGGAGCGCATGAGGAAGCAGCGGCACCTGGCGGAGGAGCGGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 GGAGCAGCTGCGGCGCTGGCACGCGGAGAGGAG         GCGGCTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 113545 GGAGCAGCTGCGGCGCTGGCACGCGGAGAGGAGGTG...CAGGCGGCTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 AGGAGGAGCCACCCCAGGACGTGCCGCCCCACGCGCCGCCCGACTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114635 AGGAGGAGCCACCCCAGGACGTGCCGCCCCACGCGCCGCCCGACTGGGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 CAGCCTCTGCTCATGGGCAGGCCGGAGTCACCCGCCAGCGCCCCACTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114685 CAGCCTCTGCTCATGGGCAGGCCGGAGTCACCCGCCAGCGCCCCACTCCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 G         CCCGGGCGGCGGCCGGCGTCCAGCGACGACCGGCACGTCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114735 GGTA...CAGCCCGGGCGGCGGCCGGCGTCCAGCGACGACCGGCACGTCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 TGTGCAAGCACGCCACCATCTACCCCACGGAGCAGGAGCTCCTGGCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115722 TGTGCAAGCACGCCACCATCTACCCCACGGAGCAGGAGCTCCTGGCCGTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 CAGAGGGCCGTGTCCCACGCAGAGCGGGCCCTCAAGCTGGTGTCCGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115772 CAGAGGGCCGTGTCCCACGCAGAGCGGGCCCTCAAGCTGGTGTCCGACAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 ACTGGCCGAGGAGGACCGGGGCCGCCGAGAGGAAGAGGGTGACAAGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115822 ACTGGCCGAGGAGGACCGGGGCCGCCGAGAGGAAGAGGGTGACAAGCGCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 G         CAGCGTTGCCCCCCAGACTCGGGTCCTGAAAGGCGTCATG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115872 GGTC...CAGCAGCGTTGCCCCCCAGACTCGGGTCCTGAAAGGCGTCATG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 CGAGTAGGCATCCTGGCGAAAGGCCTCCTCCTGCGTGGGGACAGGAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118112 CGAGTAGGCATCCTGGCGAAAGGCCTCCTCCTGCGTGGGGACAGGAACGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 GCGCCTCGCTCTGCTCTGCTCCGAGAAGCCCACGCACAGCCTGCTGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118162 GCGCCTCGCTCTGCTCTGCTCCGAGAAGCCCACGCACAGCCTGCTGCGGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 GGATCGCCCAGCAGCTGCCCCGGCAGCTCCAG         ATGGTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 118212 GGATCGCCCAGCAGCTGCCCCGGCAGCTCCAGGTA...CAGATGGTGACC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 GAGGATGAGTATGAGGTCTCCTCCGACCCTGAAGCCAACATTGTCATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120968 GAGGATGAGTATGAGGTCTCCTCCGACCCTGAAGCCAACATTGTCATCTC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 CTCCTGTGAGGAGCCCAGGATGCAGGTCACCATATCTGTCACCTCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121018 CTCCTGTGAGGAGCCCAGGATGCAGGTCACCATATCTGTCACCTCACCTC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 TGATGCGGGAGGACCCCTCCACAGACCCAG         GTGTGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 121068 TGATGCGGGAGGACCCCTCCACAGACCCAGGTG...AAGGTGTGGAGGAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 CCTCAGGCTGATGCAGGTGATGTCCTGAGCCCCAAGAAGTGCCTCGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123562 CCTCAGGCTGATGCAGGTGATGTCCTGAGCCCCAAGAAGTGCCTCGAGTC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 CCTGGCCGCCCTCCGTCATGCCAGGTGGTTTCAG         GCTCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 123612 CCTGGCCGCCCTCCGTCATGCCAGGTGGTTTCAGGTC...AAGGCTCGAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 CCAGCGGCCTGCAGCCATGCGTGATCGTCATCAGGGTCCTGAGGGACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124079 CCAGCGGCCTGCAGCCATGCGTGATCGTCATCAGGGTCCTGAGGGACCTC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 TGCCGGCGTGTGCCCACCTGGGGGGCCCTGCCAGCCTGG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 124129 TGCCGGCGTGTGCCCACCTGGGGGGCCCTGCCAGCCTGGGTA...CAGGC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 CATGGAGCTGCTGGTGGAGAAGGCTGTGAGCAGTGCGGCTGGGCCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125936 CATGGAGCTGCTGGTGGAGAAGGCTGTGAGCAGTGCGGCTGGGCCCCTGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 GCCCCGGGGATGCAGTCAGGCGAGTCCTGGAGTGCGTGGCCACAGGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125986 GCCCCGGGGATGCAGTCAGGCGAGTCCTGGAGTGCGTGGCCACAGGGACG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2416 CTCCTGACAG         ACGGGCCCGGGCTCCAGGATCCCTGCGAGAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 126036 CTCCTGACAGGTC...AAGACGGGCCCGGGCTCCAGGATCCCTGCGAGAG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 AGACCAGACAGATGCCCTCGAGCCCATGACCCTCCAAGAGCGGGAAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127679 AGACCAGACAGATGCCCTCGAGCCCATGACCCTCCAAGAGCGGGAAGACG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 TGACCGCCAGCGCCCAG         CACGCCCTGCGAATGCTGGCCTTC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 127729 TGACCGCCAGCGCCCAGGTA...CAGCACGCCCTGCGAATGCTGGCCTTC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2548 CGGCAGACCCACAAGGTCCTGGGCATGGATCTCCTGCCGCCCAGACACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128816 CGGCAGACCCACAAGGTCCTGGGCATGGATCTCCTGCCGCCCAGACACCG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2598 GCTGGGGGCCCGCTTCCGGAAGAGGCAACGGGGACCTGGCGAGGGAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128866 GCTGGGGGCCCGCTTCCGGAAGAGGCAACGGGGACCTGGCGAGGGAGAGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 AGGGCGCAGGGGAGAAGAAGCGGGGCCGGCGGGGCGGAGAGGGGCTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128916 AGGGCGCAGGGGAGAAGAAGCGGGGCCGGCGGGGCGGAGAGGGGCTCGTG

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