Result of FASTA (ccds) for pF1KB7811
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7811, 529 aa
  1>>>pF1KB7811 529 - 529 aa - 529 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5036+/-0.000863; mu= -4.8784+/- 0.052
 mean_var=250.7434+/-51.790, 0's: 0 Z-trim(115.1): 11  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.080995
 statistics sampled from 15665 (15674) to 15665 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.781), E-opt: 0.2 (0.481), width:  16
 Scan time:  3.620

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6419.1 HSF1 gene_id:3297|Hs108|chr8            ( 529) 3512 423.2 3.6e-118
CCDS42175.1 HSF4 gene_id:3299|Hs108|chr16          ( 492)  925 120.9 3.4e-27
CCDS45510.1 HSF4 gene_id:3299|Hs108|chr16          ( 462)  890 116.8 5.4e-26
CCDS47470.1 HSF2 gene_id:3298|Hs108|chr6           ( 518)  837 110.7 4.4e-24
CCDS5124.1 HSF2 gene_id:3298|Hs108|chr6            ( 536)  837 110.7 4.5e-24


>>CCDS6419.1 HSF1 gene_id:3297|Hs108|chr8                 (529 aa)
 initn: 3512 init1: 3512 opt: 3512  Z-score: 2235.1  bits: 423.2 E(32554): 3.6e-118
Smith-Waterman score: 3512; 100.0% identity (100.0% similar) in 529 aa overlap (1-529:1-529)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDLPVGPGAAGPSNVPAFLTKLWTLVSDPDTDALICWSPSGNSFHVFDQGQFAKEVLPKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MDLPVGPGAAGPSNVPAFLTKLWTLVSDPDTDALICWSPSGNSFHVFDQGQFAKEVLPKY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 FKHNNMASFVRQLNMYGFRKVVHIEQGGLVKPERDDTEFQHPCFLRGQEQLLENIKRKVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 FKHNNMASFVRQLNMYGFRKVVHIEQGGLVKPERDDTEFQHPCFLRGQEQLLENIKRKVT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 SVSTLKSEDIKIRQDSVTKLLTDVQLMKGKQECMDSKLLAMKHENEALWREVASLRQKHA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SVSTLKSEDIKIRQDSVTKLLTDVQLMKGKQECMDSKLLAMKHENEALWREVASLRQKHA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 QQQKVVNKLIQFLISLVQSNRILGVKRKIPLMLNDSGSAHSMPKYSRQFSLEHVHGSGPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 QQQKVVNKLIQFLISLVQSNRILGVKRKIPLMLNDSGSAHSMPKYSRQFSLEHVHGSGPY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 SAPSPAYSSSSLYAPDAVASSGPIISDITELAPASPMASPGGSIDERPLSSSPLVRVKEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SAPSPAYSSSSLYAPDAVASSGPIISDITELAPASPMASPGGSIDERPLSSSPLVRVKEE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 PPSPPQSPRVEEASPGRPSSVDTLLSPTALIDSILRESEPAPASVTALTDARGHTDTEGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PPSPPQSPRVEEASPGRPSSVDTLLSPTALIDSILRESEPAPASVTALTDARGHTDTEGR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 PPSPPPTSTPEKCLSVACLDKNELSDHLDAMDSNLDNLQTMLSSHGFSVDTSALLDLFSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PPSPPPTSTPEKCLSVACLDKNELSDHLDAMDSNLDNLQTMLSSHGFSVDTSALLDLFSP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 SVTVPDMSLPDLDSSLASIQELLSPQEPPRPPEAENSSPDSGKQLVHYTAQPLFLLDPGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SVTVPDMSLPDLDSSLASIQELLSPQEPPRPPEAENSSPDSGKQLVHYTAQPLFLLDPGS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520         
pF1KB7 VDTGSNDLPVLFELGEGSYFSEGDGFAEDPTISLLTGSEPPKAKDPTVS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 VDTGSNDLPVLFELGEGSYFSEGDGFAEDPTISLLTGSEPPKAKDPTVS
              490       500       510       520         

>>CCDS42175.1 HSF4 gene_id:3299|Hs108|chr16               (492 aa)
 initn: 738 init1: 587 opt: 925  Z-score: 601.8  bits: 120.9 E(32554): 3.4e-27
Smith-Waterman score: 1001; 41.2% identity (62.8% similar) in 473 aa overlap (7-475:9-453)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB7   MDLPVGPGAAGPSNVPAFLTKLWTLVSDPDTDALICWSPSGNSFHVFDQGQFAKEVLP
               :   ::: ::::: :::.::.:: :: :: :::::.:: : ::..:::::::
CCDS42 MQEAPAALPTEPGPSPVPAFLGKLWALVGDPGTDHLIRWSPSGTSFLVSDQSRFAKEVLP
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB7 KYFKHNNMASFVRQLNMYGFRKVVHIEQGGLVKPERDDTEFQHPCFLRGQEQLLENIKRK
       .::::.:::::::::::::::::: ::::::..:::: .::::: :.::.::::: ..::
CCDS42 QYFKHSNMASFVRQLNMYGFRKVVSIEQGGLLRPERDHVEFQHPSFVRGREQLLERVRRK
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB7 VTSVSTLKSEDIKIRQDSVTKLLTDVQLMKGKQECMDSKLLAMKHENEALWREVASLRQK
       : .   :...: . : ... .:: .:: ..: ::  ...:  ....:: :::::..:::.
CCDS42 VPA---LRGDDGRWRPEDLGRLLGEVQALRGVQESTEARLRELRQQNEILWREVVTLRQS
                 130       140       150       160       170       

      180       190       200        210       220       230       
pF1KB7 HAQQQKVVNKLIQFLISLVQSN-RILGVKRKIPLMLNDSGSAHSMPKYSRQFSLEHVHGS
       :.::..:..:::: :.. .:..    : :::. ::: : ::.   :       :  .  .
CCDS42 HGQQHRVIGKLIQCLFGPLQAGPSNAGGKRKLSLML-DEGSSCPTPAKFNTCPLPGALLQ
       180       190       200       210        220       230      

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB7 GPYSAPSPAYSSSSLYAPDAVASSGPIISDITELAPASPMASPGGSIDERPLSSSPLVRV
        ::   ::   ..   .:    . ::::::: : .:.   .  . : : :    . :. .
CCDS42 DPYFIQSPLPETNLGLSPHR--ARGPIISDIPEDSPSPEGTRLSPSSDGR--REKGLALL
        240       250         260       270       280         290  

       300       310       320       330       340        350      
pF1KB7 KEEPPSPPQSPRVEEASPGRPSSVDTLLSPTALIDSILRESEPAP-ASVTALTDARGHTD
       ::::           ::::  . .   :.:.   :  .    : : : : :. ...:  .
CCDS42 KEEP-----------ASPGGDGEAGLALAPNEC-DFCVTAPPPLPVAVVQAILEGKGSFS
                       300       310        320       330       340

        360       370       380       390         400       410    
pF1KB7 TEGRPPSPPPTSTPEKCLSVACLDKNELSDHLDAMDSNLDNL--QTMLSSHGFSVDTSAL
        ::    :  .. ::        :.. :.  :.. : . ..:    .:.    ::. .. 
CCDS42 PEG----PRNAQQPEPGDPREIPDRGPLG--LESGDRSPESLLPPMLLQPPQESVEPAGP
                  350       360         370       380       390    

          420       430       440       450       460       470    
pF1KB7 LDLFSPSVTVPDMSLPDLDSSLASIQELLSPQEPPRPPEAENSSPDSGKQLVHYTAQPLF
       ::...::.   . .: :::  :. .: :.  .  :.      .::. ::.     . ::.
CCDS42 LDVLGPSLQGREWTLMDLDMELSLMQPLVPERGEPELAVKGLNSPSPGKD--PTLGAPLL
          400       410       420       430       440         450  

          480       490       500       510       520         
pF1KB7 LLDPGSVDTGSNDLPVLFELGEGSYFSEGDGFAEDPTISLLTGSEPPKAKDPTVS
       :                                                      
CCDS42 LDVQAALGGPALGLPGALTIYSTPESRTASYLGPEASPSP               
            460       470       480       490                 

>>CCDS45510.1 HSF4 gene_id:3299|Hs108|chr16               (462 aa)
 initn: 728 init1: 587 opt: 890  Z-score: 580.1  bits: 116.8 E(32554): 5.4e-26
Smith-Waterman score: 902; 39.1% identity (58.2% similar) in 471 aa overlap (7-475:9-423)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB7   MDLPVGPGAAGPSNVPAFLTKLWTLVSDPDTDALICWSPSGNSFHVFDQGQFAKEVLP
               :   ::: ::::: :::.::.:: :: :: :::::.:: : ::..:::::::
CCDS45 MQEAPAALPTEPGPSPVPAFLGKLWALVGDPGTDHLIRWSPSGTSFLVSDQSRFAKEVLP
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB7 KYFKHNNMASFVRQLNMYGFRKVVHIEQGGLVKPERDDTEFQHPCFLRGQEQLLENIKRK
       .::::.:::::::::::::::::: ::::::..:::: .::::: :.::.::::: ..::
CCDS45 QYFKHSNMASFVRQLNMYGFRKVVSIEQGGLLRPERDHVEFQHPSFVRGREQLLERVRRK
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB7 VTSVSTLKSEDIKIRQDSVTKLLTDVQLMKGKQECMDSKLLAMKHENEALWREVASLRQK
       : .   :...: . : ... .:: .:: ..: ::  ...:  ....:: :::::..:::.
CCDS45 VPA---LRGDDGRWRPEDLGRLLGEVQALRGVQESTEARLRELRQQNEILWREVVTLRQS
                 130       140       150       160       170       

      180       190       200        210       220       230       
pF1KB7 HAQQQKVVNKLIQFLISLVQSN-RILGVKRKIPLMLNDSGSAHSMPKYSRQFSLEHVHGS
       :.::..:..:::: :.. .:..    : :::. ::: : ::.   :       :  .  .
CCDS45 HGQQHRVIGKLIQCLFGPLQAGPSNAGGKRKLSLML-DEGSSCPTPAKFNTCPLPGALLQ
       180       190       200       210        220       230      

       240       250       260        270       280       290      
pF1KB7 GPYSAPSPAYSSSSLYAPDAVASSGP-IISDITELAPASPMASPGGSIDERPLSSSPLVR
        ::   ::.  : :     :.: .::   :..:      :. .::           : : 
CCDS45 DPYFIQSPSTYSLSQRQIWALALTGPGAPSSLTSQKTLHPLRGPG---------FLPPVM
        240       250       260       270       280                

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB7 VKEEPPSPPQSPRVEEASPGRPSSVDTLLSPTALIDSILRESEPAPASVTALTDARGHTD
       .   :: :     :.    :. :     .::    ..    ..: :..   . : ::   
CCDS45 AGAPPPLPVAV--VQAILEGKGS-----FSP----EGPRNAQQPEPGDPREIPD-RGPLG
       290         300            310           320       330      

        360       370       380       390       400       410      
pF1KB7 TEGRPPSPPPTSTPEKCLSVACLDKNELSDHLDAMDSNLDNLQTMLSSHGFSVDTSALLD
        :.   ::     :                              .:.    ::. .. ::
CCDS45 LESGDRSPESLLPP-----------------------------MLLQPPQESVEPAGPLD
         340                                    350       360      

        420       430       440       450       460       470      
pF1KB7 LFSPSVTVPDMSLPDLDSSLASIQELLSPQEPPRPPEAENSSPDSGKQLVHYTAQPLFLL
       ...::.   . .: :::  :. .: :.  .  :.      .::. ::.     . ::.: 
CCDS45 VLGPSLQGREWTLMDLDMELSLMQPLVPERGEPELAVKGLNSPSPGKD--PTLGAPLLLD
        370       380       390       400       410         420    

        480       490       500       510       520         
pF1KB7 DPGSVDTGSNDLPVLFELGEGSYFSEGDGFAEDPTISLLTGSEPPKAKDPTVS
                                                            
CCDS45 VQAALGGPALGLPGALTIYSTPESRTASYLGPEASPSP               
          430       440       450       460                 

>>CCDS47470.1 HSF2 gene_id:3298|Hs108|chr6                (518 aa)
 initn: 1001 init1: 493 opt: 837  Z-score: 545.9  bits: 110.7 E(32554): 4.4e-24
Smith-Waterman score: 957; 39.4% identity (65.2% similar) in 477 aa overlap (13-480:5-439)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDLPVGPGAAGPSNVPAFLTKLWTLVSDPDTDALICWSPSGNSFHVFDQGQFAKEVLPKY
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CCDS47         MKQSSNVPAFLSKLWTLVEETHTNEFITWSQNGQSFLVLDEQRFAKEILPKY
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