Result of FASTA (ccds) for pF1KB6461
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6461, 321 aa
  1>>>pF1KB6461 321 - 321 aa - 321 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6128+/-0.000765; mu= 11.0436+/- 0.046
 mean_var=121.5235+/-23.289, 0's: 0 Z-trim(112.8): 128  B-trim: 16 in 1/50
 Lambda= 0.116344
 statistics sampled from 13414 (13549) to 13414 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.774), E-opt: 0.2 (0.416), width:  16
 Scan time:  2.940

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS12184.1 FCER2 gene_id:2208|Hs108|chr19         ( 321) 2221 383.3 1.4e-106
CCDS12185.1 CLEC4G gene_id:339390|Hs108|chr19      ( 293)  438 84.0 1.6e-16
CCDS59347.1 CLEC4M gene_id:10332|Hs108|chr19       ( 263)  399 77.4 1.4e-14
CCDS82049.1 CLEC10A gene_id:10462|Hs108|chr17      ( 289)  379 74.1 1.5e-13
CCDS12187.1 CLEC4M gene_id:10332|Hs108|chr19       ( 399)  381 74.5 1.5e-13
CCDS45598.1 ASGR2 gene_id:433|Hs108|chr17          ( 292)  377 73.7 1.9e-13
CCDS32544.1 ASGR2 gene_id:433|Hs108|chr17          ( 311)  377 73.8   2e-13
CCDS45597.1 CLEC10A gene_id:10462|Hs108|chr17      ( 292)  376 73.6 2.2e-13
CCDS59344.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19        ( 268)  375 73.4 2.3e-13
CCDS56087.1 CLEC17A gene_id:388512|Hs108|chr19     ( 378)  377 73.8 2.4e-13
CCDS11088.1 ASGR2 gene_id:433|Hs108|chr17          ( 287)  367 72.1 6.1e-13
CCDS45952.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19        ( 312)  367 72.1 6.5e-13
CCDS56017.1 ASGR1 gene_id:432|Hs108|chr17          ( 252)  363 71.3 8.8e-13
CCDS11089.1 ASGR1 gene_id:432|Hs108|chr17          ( 291)  363 71.4 9.8e-13
CCDS45949.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19        ( 360)  351 69.4 4.7e-12
CCDS45950.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19        ( 380)  351 69.5 4.9e-12
CCDS12186.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19        ( 404)  351 69.5 5.1e-12
CCDS59345.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19        ( 243)  339 67.3 1.4e-11
CCDS11087.1 CLEC10A gene_id:10462|Hs108|chr17      ( 316)  338 67.2 1.9e-11
CCDS1149.1 BCAN gene_id:63827|Hs108|chr1           ( 911)  341 68.1 3.1e-11
CCDS12397.1 NCAN gene_id:1463|Hs108|chr19          (1321)  340 68.0 4.6e-11


>>CCDS12184.1 FCER2 gene_id:2208|Hs108|chr19              (321 aa)
 initn: 2221 init1: 2221 opt: 2221  Z-score: 2026.9  bits: 383.3 E(32554): 1.4e-106
Smith-Waterman score: 2221; 99.7% identity (100.0% similar) in 321 aa overlap (1-321:1-321)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MEEGQYSEIEELPRRRCCRRGTQIVLLGLVTAALWAGLLTLLLLWHWDTTQSLKQLEERA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MEEGQYSEIEELPRRRCCRRGTQIVLLGLVTAALWAGLLTLLLLWHWDTTQSLKQLEERA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 ARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQISQELEELRAEQQRLKSQDLELSWNLNGLQADL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQISQELEELRAEQQRLKSQDLELSWNLNGLQADL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 SSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLRMELQVSSGFVCNTCPEKWINFQRKCYYFGKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLRMELQVSSGFVCNTCPEKWINFQRKCYYFGKG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 TKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKHASHTGSWIGLRNLDLKGEFIWVDGSHV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKHASHTGSWIGLRNLDLKGEFIWVDGSHV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 DYSNWAPGEPTSRSQGEDCVMMRGSGRWNDAFCDRKLGAWVCDQLATCTPPASEGSAESM
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS12 DYSNWAPGEPTSRSQGEDCVMMRGSGRWNDAFCDRKLGAWVCDRLATCTPPASEGSAESM
              250       260       270       280       290       300

              310       320 
pF1KB6 GPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS
       :::::::::::::::::::::
CCDS12 GPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS
              310       320 

>>CCDS12185.1 CLEC4G gene_id:339390|Hs108|chr19           (293 aa)
 initn: 448 init1: 196 opt: 438  Z-score: 410.1  bits: 84.0 E(32554): 1.6e-16
Smith-Waterman score: 438; 29.7% identity (56.8% similar) in 273 aa overlap (19-288:29-293)

                         10        20        30        40        50
pF1KB6           MEEGQYSEIEELPRRRCCRRGTQIVLLGLVTAALWAGLLTLLLLWHWDTT
                                   ::   ..:  :::..::: .:..::       
CCDS12 MDTTRYSKWGGSSEEVPGGPWGRWVHWSRRPLFLALAVLVTTVLWAVILSILLSKASTER
               10        20        30        40        50        60

               60        70        80        90       100       110
pF1KB6 QSLKQLEERAARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQISQELEELRAEQQRLKSQDLELS
        .: . ..    :.:. .  : . . .    .:  .  . .:.  :::  . ... .:  
CCDS12 AALLDGHDLLRTNASKQTAALGALKEEVGDCHSCCSGTQAQLQTTRAELGEAQAKLMEQE
               70        80        90       100       110       120

              120       130       140       150       160       170
pF1KB6 WNLNGLQADLSSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLRMELQVSSGFVCNTCPEKWINF
         :  :.  ...  ..    :...   : :  : :     .:: .:   :. :: .:..:
CCDS12 SALRELRERVTQGLAEAGRGREDVRTELFRALEAV-----RLQNNS---CEPCPTSWLSF
              130       140       150            160          170  

              180       190       200       210       220       230
pF1KB6 QRKCYYFGKGTKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKHASHTGSWIGLRNLDLKG
       . .::.:.     :. :.  : :  ..:: . . .:: :::...   : :.::: .   :
CCDS12 EGSCYFFSVPKTTWAAAQDHCADASAHLVIVGGLDEQGFLTRNTRGRGYWLGLRAVRHLG
            180       190       200       210       220       230  

                 240       250       260       270       280       
pF1KB6 E---FIWVDGSHVDYSNWAPGEPTSRSQGEDCVMMRGSGRWNDAFCDRKLGAWVCDQLAT
       .   . ::::  ...:.:  :::..    :.::::  .: :::: :: .  .:.:..  .
CCDS12 KVQGYQWVDGVSLSFSHWNQGEPNDAWGRENCVMMLHTGLWNDAPCDSEKDGWICEKRHN
            240       250       260       270       280       290  

       290       300       310       320 
pF1KB6 CTPPASEGSAESMGPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS
       :                                 
CCDS12 C                                 
                                         

>>CCDS59347.1 CLEC4M gene_id:10332|Hs108|chr19            (263 aa)
 initn: 343 init1: 169 opt: 399  Z-score: 375.3  bits: 77.4 E(32554): 1.4e-14
Smith-Waterman score: 412; 33.0% identity (66.1% similar) in 230 aa overlap (64-288:51-259)

            40        50        60        70        80        90   
pF1KB6 LWAGLLTLLLLWHWDTTQSLKQLEERAARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQISQELE
                                     ::.: ..: .....: :  .. ::..  . 
CCDS59 TSGIRLFPRDFQFQQIHGHKSSTVPFLLGPVSKVPSSLSQEQSEQDAIYQNLTQLKAAVG
               30        40        50        60        70        80

           100       110       120       130       140       150   
pF1KB6 ELRAEQQRLKSQDLELSWNLNGLQADLSSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLRMELQ
       :: .:...:.    :.  .:. :.: ..     :: :...    :... .:.:.:.  ..
CCDS59 EL-SEKSKLQ----EIYQELTQLKAAVG-----ELPEKSK----LQEIYQELTRLKAAVE
                    90       100            110           120      

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB6 VSSGFVCNTCPEKWINFQRKCYYFGKGTKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKH
            .:  ::. :  :: .::..... ..:  .  ::.....::: :.. :::.::  .
CCDS59 R----LCRHCPKDWTFFQGNCYFMSNSQRNWHDSVTACQEVRAQLVVIKTAEEQNFLQLQ
            130       140       150       160       170       180  

             220       230       240          250       260        
pF1KB6 ASHTG--SWIGLRNLDLKGEFIWVDGSHVDYS---NWAPGEPTSRSQGEDCVMMRGSGRW
       .:...  ::.:: .:. .: . ::::: .. :    :  :::.. : .:::. . ::: :
CCDS59 TSRSNRFSWMGLSDLNQEGTWQWVDGSPLSPSFQRYWNSGEPNN-SGNEDCAEFSGSG-W
            190       200       210       220        230        240

      270       280       290       300       310       320 
pF1KB6 NDAFCDRKLGAWVCDQLATCTPPASEGSAESMGPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS
       ::  ::   . :.: . :.:                                 
CCDS59 NDNRCDVD-NYWICKKPAACFRDE                             
               250       260                                

>>CCDS82049.1 CLEC10A gene_id:10462|Hs108|chr17           (289 aa)
 initn: 387 init1: 209 opt: 379  Z-score: 356.6  bits: 74.1 E(32554): 1.5e-13
Smith-Waterman score: 379; 31.4% identity (63.3% similar) in 210 aa overlap (86-283:74-278)

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB6 LEERAARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQISQELEELRAEQQRLKSQDLELSWNLNG
                                     :..:.   .  :: : : ::   :  .. .
CCDS82 SLGLGLLLLVIICVVGFQNSKFQRDLVTLRTDFSNFTSNTVAEIQALTSQGSSLEETIAS
            50        60        70        80        90       100   

         120       130       140       150            160       170
pF1KB6 LQADLSSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLRMEL-----QVSSGFVCNTCPEKWINF
       :.:.. .::...   ..:    ...: ... ::  ..     ..:.  .:  :: .:.. 
CCDS82 LKAEVEGFKQERQAVHSEMLLRVQQLVQDLKKLTCQVATLNNNASTEGTC--CPVNWVEH
           110       120       130       140       150         160 

              180       190       200       210       220       230
pF1KB6 QRKCYYFGKGTKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKHASHTGSWIGLRNLDLKG
       : .::.:...  .:..:.  :.  ...:: :.: :::.:. :. . . .:.::   : .:
CCDS82 QDSCYWFSHSGMSWAEAEKYCQLKNAHLVVINSREEQNFVQKYLGSAYTWMGLS--DPEG
             170       180       190       200       210           

                240       250            260       270       280   
pF1KB6 EFIWVDGSH--VDYSNWAPGEPTSRSQ-----GEDCVMMRGSGRWNDAFCDRKLGAWVCD
        . ::::.   . ..:: ::.: . .      ::::. .. .:::::  :.:    :::.
CCDS82 AWKWVDGTDYATGFQNWKPGQPDDWQGHGLGGGEDCAHFHPDGRWNDDVCQRPYH-WVCE
     220       230       240       250       260       270         

           290       300       310       320 
pF1KB6 QLATCTPPASEGSAESMGPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS
                                             
CCDS82 AGLGQTSQESH                           
      280                                    

>>CCDS12187.1 CLEC4M gene_id:10332|Hs108|chr19            (399 aa)
 initn: 347 init1: 169 opt: 381  Z-score: 356.5  bits: 74.5 E(32554): 1.5e-13
Smith-Waterman score: 413; 32.6% identity (62.8% similar) in 239 aa overlap (57-288:174-395)

         30        40        50        60        70        80      
pF1KB6 LGLVTAALWAGLLTLLLLWHWDTTQSLKQLEERAARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQST
                                     :.   ... :    :..  :. . .::.  
CCDS12 AAVGELPEKSKLQEIYQELTRLKAAVGELPEKSKLQEIYQELTRLKAAVGE-LPEKSKLQ
           150       160       170       180       190        200  

         90       100         110       120       130       140    
pF1KB6 QISQELEELRAEQQRL--KSQDLELSWNLNGLQADLSSFKSQELNERNEASDLLERLREE
       .: ::: ::.:   .:  ::.  :.  .:. :.: ..     :: ....     ... .:
CCDS12 EIYQELTELKAAVGELPEKSKLQEIYQELTQLKAAVG-----ELPDQSKQ----QQIYQE
            210       220       230            240           250   

          150       160       170       180       190       200    
pF1KB6 VTKLRMELQVSSGFVCNTCPEKWINFQRKCYYFGKGTKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSP
       .: :.  ..     .:  ::. :  :: .::..... ..:  .  ::.....::: :.. 
CCDS12 LTDLKTAFE----RLCRHCPKDWTFFQGNCYFMSNSQRNWHDSVTACQEVRAQLVVIKTA
           260           270       280       290       300         

          210         220       230       240          250         
pF1KB6 EEQDFLTKHASHTG--SWIGLRNLDLKGEFIWVDGSHVDYS---NWAPGEPTSRSQGEDC
       :::.::  ..:...  ::.:: .:. .: . ::::: .. :    :  :::.. : .:::
CCDS12 EEQNFLQLQTSRSNRFSWMGLSDLNQEGTWQWVDGSPLSPSFQRYWNSGEPNN-SGNEDC
     310       320       330       340       350       360         

     260       270       280       290       300       310         
pF1KB6 VMMRGSGRWNDAFCDRKLGAWVCDQLATCTPPASEGSAESMGPDSRPDPDGRLPTPSAPL
       . . ::: :::  ::   . :.: . :.:                               
CCDS12 AEFSGSG-WNDNRCDVD-NYWICKKPAACFRDE                           
      370        380        390                                    

>>CCDS45598.1 ASGR2 gene_id:433|Hs108|chr17               (292 aa)
 initn: 362 init1: 228 opt: 377  Z-score: 354.8  bits: 73.7 E(32554): 1.9e-13
Smith-Waterman score: 377; 32.2% identity (63.0% similar) in 227 aa overlap (72-284:63-283)

              50        60        70        80          90         
pF1KB6 LLLWHWDTTQSLKQLEERAARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQ--ISQELEELRAEQ
                                     :.: : :.  . .: .  .:.      .: 
CCDS45 RLCSMVCFSLLALSFNILLLVVICVTGSQSEGHGGAQLQAELRSLKEAFSNFSSSTLTEV
             40        50        60        70        80        90  

     100       110       120       130       140            150    
pF1KB6 QRLKSQDLELSWNLNGLQADLSSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLR-----MELQV
       : ....   .. ....: : : . ..:.:.  ..:  :: .:..  . ::     :::  
CCDS45 QAISTHGGSVGDKITSLGAKLEK-QQQDLKADHDA--LLFHLKHFPVDLRFVACQMELLH
            100       110        120         130       140         

          160       170       180       190       200       210    
pF1KB6 SSGFVCNTCPEKWINFQRKCYYFGKGTKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKHA
       :.:   . :: .:.. : .::.:... : :..:.  :.  ...:: :.: ::: :...:.
CCDS45 SNGSQRTCCPVNWVEHQGSCYWFSHSGKAWAEAEKYCQLENAHLVVINSWEEQKFIVQHT
     150       160       170       180       190       200         

          220       230       240         250            260       
pF1KB6 SHTGSWIGLRNLDLKGEFIWVDGSHV--DYSNWAPGEPTSR-----SQGEDCVMMRGSGR
       .  ..:::: . :  : . ::::.    .:.:::  .: .      . .:::: .. .::
CCDS45 NPFNTWIGLTDSD--GSWKWVDGTDYRHNYKNWAVTQPDNWHGHELGGSEDCVEVQPDGR
     210       220         230       240       250       260       

       270       280       290       300       310       320 
pF1KB6 WNDAFCDRKLGAWVCDQLATCTPPASEGSAESMGPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS
       ::: ::  ..  :::..                                     
CCDS45 WNDDFC-LQVYRWVCEKRRNATGEVA                            
       270        280       290                              

>>CCDS32544.1 ASGR2 gene_id:433|Hs108|chr17               (311 aa)
 initn: 362 init1: 228 opt: 377  Z-score: 354.4  bits: 73.8 E(32554): 2e-13
Smith-Waterman score: 377; 32.2% identity (63.0% similar) in 227 aa overlap (72-284:82-302)

              50        60        70        80          90         
pF1KB6 LLLWHWDTTQSLKQLEERAARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQ--ISQELEELRAEQ
                                     :.: : :.  . .: .  .:.      .: 
CCDS32 RLCSMVCFSLLALSFNILLLVVICVTGSQSEGHGGAQLQAELRSLKEAFSNFSSSTLTEV
              60        70        80        90       100       110 

     100       110       120       130       140            150    
pF1KB6 QRLKSQDLELSWNLNGLQADLSSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLR-----MELQV
       : ....   .. ....: : : . ..:.:.  ..:  :: .:..  . ::     :::  
CCDS32 QAISTHGGSVGDKITSLGAKLEK-QQQDLKADHDA--LLFHLKHFPVDLRFVACQMELLH
             120       130        140         150       160        

          160       170       180       190       200       210    
pF1KB6 SSGFVCNTCPEKWINFQRKCYYFGKGTKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKHA
       :.:   . :: .:.. : .::.:... : :..:.  :.  ...:: :.: ::: :...:.
CCDS32 SNGSQRTCCPVNWVEHQGSCYWFSHSGKAWAEAEKYCQLENAHLVVINSWEEQKFIVQHT
      170       180       190       200       210       220        

          220       230       240         250            260       
pF1KB6 SHTGSWIGLRNLDLKGEFIWVDGSHV--DYSNWAPGEPTSR-----SQGEDCVMMRGSGR
       .  ..:::: . :  : . ::::.    .:.:::  .: .      . .:::: .. .::
CCDS32 NPFNTWIGLTDSD--GSWKWVDGTDYRHNYKNWAVTQPDNWHGHELGGSEDCVEVQPDGR
      230       240         250       260       270       280      

       270       280       290       300       310       320 
pF1KB6 WNDAFCDRKLGAWVCDQLATCTPPASEGSAESMGPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS
       ::: ::  ..  :::..                                     
CCDS32 WNDDFC-LQVYRWVCEKRRNATGEVA                            
        290        300       310                             

>>CCDS45597.1 CLEC10A gene_id:10462|Hs108|chr17           (292 aa)
 initn: 387 init1: 209 opt: 376  Z-score: 353.8  bits: 73.6 E(32554): 2.2e-13
Smith-Waterman score: 376; 31.3% identity (63.0% similar) in 211 aa overlap (86-283:74-281)

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB6 LEERAARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQISQELEELRAEQQRLKSQDLELSWNLNG
                                     :..:.   .  :: : : ::   :  .. .
CCDS45 SLGLGLLLLVIICVVGFQNSKFQRDLVTLRTDFSNFTSNTVAEIQALTSQGSSLEETIAS
            50        60        70        80        90       100   

         120       130       140       150         160             
pF1KB6 LQADLSSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLRMELQV--SSGFVCNT----CPEKWIN
       :.:.. .::...   ..:    ...: ... ::  .. .  ..:   .:    :: .:..
CCDS45 LKAEVEGFKQERQAVHSEMLLRVQQLVQDLKKLTCQVATLNNNGEEASTEGTCCPVNWVE
           110       120       130       140       150       160   

     170       180       190       200       210       220         
pF1KB6 FQRKCYYFGKGTKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKHASHTGSWIGLRNLDLK
        : .::.:...  .:..:.  :.  ...:: :.: :::.:. :. . . .:.::   : .
CCDS45 HQDSCYWFSHSGMSWAEAEKYCQLKNAHLVVINSREEQNFVQKYLGSAYTWMGLS--DPE
           170       180       190       200       210         220 

     230         240       250            260       270       280  
pF1KB6 GEFIWVDGSH--VDYSNWAPGEPTSRSQ-----GEDCVMMRGSGRWNDAFCDRKLGAWVC
       : . ::::.   . ..:: ::.: . .      ::::. .. .:::::  :.:    :::
CCDS45 GAWKWVDGTDYATGFQNWKPGQPDDWQGHGLGGGEDCAHFHPDGRWNDDVCQRPYH-WVC
             230       240       250       260       270        280

            290       300       310       320 
pF1KB6 DQLATCTPPASEGSAESMGPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS
       .                                      
CCDS45 EAGLGQTSQESH                           
              290                             

>>CCDS59344.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19             (268 aa)
 initn: 231 init1: 161 opt: 375  Z-score: 353.5  bits: 73.4 E(32554): 2.3e-13
Smith-Waterman score: 388; 31.3% identity (61.5% similar) in 265 aa overlap (52-308:22-265)

              30        40        50        60        70        80 
pF1KB6 TQIVLLGLVTAALWAGLLTLLLLWHWDTTQSLKQLEERAARNVSQVSKNLESHHGDQMAQ
                                     :..: . :    . :   .:..  :. ...
CCDS59          MSDSKEPRLQQLGLLVSKVPSSISQEQSRQD-AIYQNLTQLKAAVGE-LSE
                        10        20        30         40          

              90       100         110       120       130         
pF1KB6 KSQSTQISQELEELRAEQQRL--KSQDLELSWNLNGLQADLSSFKSQELNERNEASDLLE
       ::.  .: ::: .:.:   .:  ::.  :.  .:. :.: ..     :: :...    :.
CCDS59 KSKLQEIYQELTQLKAAVGELPEKSKLQEIYQELTRLKAAVG-----ELPEKSK----LQ
      50        60        70        80        90                100

     140       150       160       170       180       190         
pF1KB6 RLREEVTKLRMELQVSSGFVCNTCPEKWINFQRKCYYFGKGTKQWVHARYACDDMEGQLV
       .. .:.: :.  ..     .:. :: .:  :: .::..... ..:  .  :: .. .:::
CCDS59 EIYQELTWLKAAVER----LCHPCPWEWTFFQGNCYFMSNSQRNWHDSITACKEVGAQLV
              110           120       130       140       150      

     200       210         220       230       240          250    
pF1KB6 SIHSPEEQDFLTKHASHTG--SWIGLRNLDLKGEFIWVDGSHVDYS---NWAPGEPTSRS
        :.: :::.::  ..:...  .:.:: .:. .: . ::::: .  :    :  :::.. .
CCDS59 VIKSAEEQNFLQLQSSRSNRFTWMGLSDLNQEGTWQWVDGSPLLPSFKQYWNRGEPNNVG
        160       170       180       190       200       210      

          260       270       280        290       300       310   
pF1KB6 QGEDCVMMRGSGRWNDAFCDRKLGAWVCDQ-LATCTPPASEGSAESMGPDSRPDPDGRLP
       . :::. . :.: :::  :.     :.: .  :.:.   .: .  : .: . :.:     
CCDS59 E-EDCAEFSGNG-WNDDKCNLA-KFWICKKSAASCS--RDEEQFLSPAP-ATPNPPPA  
         220        230        240         250       260           

           320 
pF1KB6 TPSAPLHS

>>CCDS56087.1 CLEC17A gene_id:388512|Hs108|chr19          (378 aa)
 initn: 241 init1: 180 opt: 377  Z-score: 353.2  bits: 73.8 E(32554): 2.4e-13
Smith-Waterman score: 388; 34.5% identity (61.0% similar) in 200 aa overlap (93-288:196-378)

             70        80        90       100       110       120  
pF1KB6 NVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQISQELEELRAEQQRLKSQDLELSWNLNGLQADLSS
                                     .::  : . :. :..    :..:. : :..
CCDS56 QKRWMVYLCLLVVTSLFLGCLGLTVTLIKYQELMEELRMLSFQQMTWRTNMTGM-AGLAG
         170       180       190       200       210        220    

            130       140       150        160         170         
pF1KB6 FKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLRMELQVSSGFV-CN--TCPEKWINFQRKCYYFGK
       .: .           . :.: ....  .::    :.. :   :::: :. :. :::::. 
CCDS56 LKHD-----------IARVRADTNQSLVELW---GLLDCRRITCPEGWLPFEGKCYYFSP
                     230       240          250       260       270

     180       190       200       210        220       230        
pF1KB6 GTKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTK-HASHTGSWIGLRNLDLKGEFIWVDGS
       .::.: .::. :..  ..:: :.:  :..:..: :.:    :.:: .   .:.. :.:::
CCDS56 STKSWDEARMFCQENYSHLVIINSFAEHNFVAKAHGSPRVYWLGLNDRAQEGDWRWLDGS
              280       290       300       310       320       330

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB6 HVDYSNWAPGEPTSRSQGEDCVMMRGSGRWNDAFCDRKLGAWVCDQLATCTPPASEGSAE
        :  : : : ::..  . :::. :  .: :::  :  :   :.:..  .:          
CCDS56 PVTLSFWEPEEPNN-IHDEDCATMNKGGTWNDLSC-YKTTYWICERKCSC          
              340        350       360        370                  

      300       310       320 
pF1KB6 SMGPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS




321 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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