Result of SIM4 for pF1KB7738

seq1 = pF1KB7738.tfa, 1452 bp
seq2 = pF1KB7738/gi568815581r_43428522.tfa (gi568815581r:43428522_43645617), 217096 bp

>pF1KB7738 1452
>gi568815581r:43428522_43645617 (Chr17)

(complement)

1-60  (100001-100060)   100% ->
61-154  (100251-100344)   100% ->
155-202  (100596-100643)   100% ->
203-256  (109139-109192)   100% ->
257-383  (111633-111759)   100% ->
384-545  (112270-112431)   100% ->
546-811  (112679-112944)   100% ->
812-886  (115437-115511)   100% ->
887-955  (115666-115734)   100% ->
956-1128  (115942-116114)   100% ->
1129-1230  (116382-116483)   100% ->
1231-1452  (116875-117096)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCGGAGGATGAAAGCCGGATACTTGGACCAGCAAGTGCCCTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCGGAGGATGAAAGCCGGATACTTGGACCAGCAAGTGCCCTACAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCAGCAGC         AAATCGCCCGGAAATGGGAGCTTGCGCGAAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCAGCAGCGTG...CAGAAATCGCCCGGAAATGGGAGCTTGCGCGAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGCTGATCGGCCCGCTGGGGAAGCTCATGGACCCGGGCTCCCTGCCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100282 CGCTGATCGGCCCGCTGGGGAAGCTCATGGACCCGGGCTCCCTGCCGCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTCGACTCTGAAG         ATCTCTTCCAGGATCTAAGTCACTTCCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100332 CTCGACTCTGAAGGTA...CAGATCTCTTCCAGGATCTAAGTCACTTCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGAGACGTGGCTCGCTGAAG         CTCAGGTACCAGACAGTGATG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100624 GGAGACGTGGCTCGCTGAAGGTG...CAGCTCAGGTACCAGACAGTGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AGCAGTTTGTTCCTGATTTCCATTCAGAAAACC         TAGCTTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 109160 AGCAGTTTGTTCCTGATTTCCATTCAGAAAACCGTG...CAGTAGCTTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 CACAGCCCCACCACCAGGATCAAGAAGGAGCCCCAGAGTCCCCGCACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111641 CACAGCCCCACCACCAGGATCAAGAAGGAGCCCCAGAGTCCCCGCACAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 CCCGGCCCTGTCCTGCAGCAGGAAGCCGCCACTCCCCTACCACCATGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111691 CCCGGCCCTGTCCTGCAGCAGGAAGCCGCCACTCCCCTACCACCATGGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AGCAGTGCCTTTACTCCAG         TGCCTATGACCCCCCCAGACAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 111741 AGCAGTGCCTTTACTCCAGGTG...CAGTGCCTATGACCCCCCCAGACAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 ATCGCCATCAAGTCCCCTGCCCCTGGTGCCCTTGGACAGTCGCCCCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112292 ATCGCCATCAAGTCCCCTGCCCCTGGTGCCCTTGGACAGTCGCCCCTACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GCCCTTTCCCCGGGCAGAGCAACGGAATTTCCTGAGATCCTCTGGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112342 GCCCTTTCCCCGGGCAGAGCAACGGAATTTCCTGAGATCCTCTGGCACCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CCCAGCCCCACCCTGGCCATGGGTACCTCGGGGAACATAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 112392 CCCAGCCCCACCCTGGCCATGGGTACCTCGGGGAACATAGGTA...CAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 TCCGTCTTCCAGCAGCCCCTGGACATTTGCCACTCCTTCACATCTCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112680 TCCGTCTTCCAGCAGCCCCTGGACATTTGCCACTCCTTCACATCTCAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 AGGGGGCCGGGAACCCCTCCCAGCCCCCTACCAACACCAGCTGTCGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112730 AGGGGGCCGGGAACCCCTCCCAGCCCCCTACCAACACCAGCTGTCGGAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CCTGCCCACCCTATCCCCAGCAGAGCTTTAAGCAAGAATACCATGATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112780 CCTGCCCACCCTATCCCCAGCAGAGCTTTAAGCAAGAATACCATGATCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CTGTATGAACAGGCGGGCCAGCCAGCCGTGGACCAGGGTGGGGTCAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112830 CTGTATGAACAGGCGGGCCAGCCAGCCGTGGACCAGGGTGGGGTCAATGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GCACAGGTACCCAGGGGCGGGGGTGGTGATCAAACAGGAACAGACGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112880 GCACAGGTACCCAGGGGCGGGGGTGGTGATCAAACAGGAACAGACGGACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TCGCCTACGACTCAG         ATGTCACCGGGTGCGCATCAATGTAC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 112930 TCGCCTACGACTCAGGTA...CAGATGTCACCGGGTGCGCATCAATGTAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CTCCACACAGAGGGCTTCTCTGGGCCCTCTCCAGGTGACGGGGCCATGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 115463 CTCCACACAGAGGGCTTCTCTGGGCCCTCTCCAGGTGACGGGGCCATGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    887         GCTATGGCTATGAGAAACCTCTGCGACCATTCCCAGATGATG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115513 TA...AAGGCTATGGCTATGAGAAACCTCTGCGACCATTCCCAGATGATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TCTGCGTTGTCCCTGAGAAATTTGAAG         GAGACATCAAGCAG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 115708 TCTGCGTTGTCCCTGAGAAATTTGAAGGTC...CAGGAGACATCAAGCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GAAGGGGTCGGTGCATTTCGAGAGGGGCCGCCCTACCAGCGCCGGGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115956 GAAGGGGTCGGTGCATTTCGAGAGGGGCCGCCCTACCAGCGCCGGGGTGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CCTGCAGCTGTGGCAATTTCTGGTGGCCTTGCTGGATGACCCAACAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116006 CCTGCAGCTGTGGCAATTTCTGGTGGCCTTGCTGGATGACCCAACAAATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CCCATTTCATTGCCTGGACGGGCCGGGGAATGGAGTTCAAGCTCATTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116056 CCCATTTCATTGCCTGGACGGGCCGGGGAATGGAGTTCAAGCTCATTGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CCTGAGGAG         GTCGCCAGGCTCTGGGGCATCCAGAAGAACCG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 116106 CCTGAGGAGGTG...CAGGTCGCCAGGCTCTGGGGCATCCAGAAGAACCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GCCAGCCATGAATTACGACAAGCTGAGCCGCTCGCTCCGATACTATTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116414 GCCAGCCATGAATTACGACAAGCTGAGCCGCTCGCTCCGATACTATTATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AGAAAGGCATCATGCAGAAG         GTGGCTGGTGAGCGTTACGTG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 116464 AGAAAGGCATCATGCAGAAGGTG...TAGGTGGCTGGTGAGCGTTACGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 TACAAGTTTGTGTGTGAGCCCGAGGCCCTCTTCTCTTTGGCCTTCCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116896 TACAAGTTTGTGTGTGAGCCCGAGGCCCTCTTCTCTTTGGCCTTCCCGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CAATCAGCGTCCAGCTCTCAAGGCTGAGTTTGACCGGCCTGTCAGTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116946 CAATCAGCGTCCAGCTCTCAAGGCTGAGTTTGACCGGCCTGTCAGTGAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 AGGACACAGTCCCTTTGTCCCACTTGGATGAGAGCCCCGCCTACCTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116996 AGGACACAGTCCCTTTGTCCCACTTGGATGAGAGCCCCGCCTACCTCCCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GAGCTGGCTGGCCCCGCCCAGCCATTTGGCCCCAAGGGTGGCTACTCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117046 GAGCTGGCTGGCCCCGCCCAGCCATTTGGCCCCAAGGGTGGCTACTCTTA

   1550 
   1452 C
        |
 117096 C

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