Result of FASTA (ccds) for pF1KB8998
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8998, 412 aa
  1>>>pF1KB8998 412 - 412 aa - 412 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4550+/-0.000859; mu= 17.6224+/- 0.051
 mean_var=182.5200+/-78.592, 0's: 0 Z-trim(109.2): 260  B-trim: 1260 in 2/48
 Lambda= 0.094933
 statistics sampled from 10220 (10728) to 10220 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.33), width:  16
 Scan time:  2.960

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13826.1 ADORA2A gene_id:135|Hs108|chr22        ( 412) 2793 395.4 5.1e-110
CCDS11173.1 ADORA2B gene_id:136|Hs108|chr17        ( 332) 1274 187.2 1.9e-47
CCDS1434.1 ADORA1 gene_id:134|Hs108|chr1           ( 326) 1015 151.7 9.1e-37
CCDS839.1 ADORA3 gene_id:140|Hs108|chr1            ( 318)  582 92.4 6.4e-19
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6         ( 345)  427 71.3 1.6e-12
CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6        ( 348)  401 67.7 1.9e-11
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8            ( 408)  397 67.3 3.1e-11


>>CCDS13826.1 ADORA2A gene_id:135|Hs108|chr22             (412 aa)
 initn: 2793 init1: 2793 opt: 2793  Z-score: 2088.7  bits: 395.4 E(32554): 5.1e-110
Smith-Waterman score: 2793; 100.0% identity (100.0% similar) in 412 aa overlap (1-412:1-412)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MPIMGSSVYITVELAIAVLAILGNVLVCWAVWLNSNLQNVTNYFVVSLAAADIAVGVLAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MPIMGSSVYITVELAIAVLAILGNVLVCWAVWLNSNLQNVTNYFVVSLAAADIAVGVLAI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 PFAITISTGFCAACHGCLFIACFVLVLTQSSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGLVTGTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PFAITISTGFCAACHGCLFIACFVLVLTQSSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGLVTGTR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 AKGIIAICWVLSFAIGLTPMLGWNNCGQPKEGKNHSQGCGEGQVACLFEDVVPMNYMVYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AKGIIAICWVLSFAIGLTPMLGWNNCGQPKEGKNHSQGCGEGQVACLFEDVVPMNYMVYF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 NFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLKQMESQPLPGERARSTLQKEVHAAKSLAIIVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLKQMESQPLPGERARSTLQKEVHAAKSLAIIVG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 LFALCWLPLHIINCFTFFCPDCSHAPLWLMYLAIVLSHTNSVVNPFIYAYRIREFRQTFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LFALCWLPLHIINCFTFFCPDCSHAPLWLMYLAIVLSHTNSVVNPFIYAYRIREFRQTFR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 KIIRSHVLRQQEPFKAAGTSARVLAAHGSDGEQVSLRLNGHPPGVWANGSAPHPERRPNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KIIRSHVLRQQEPFKAAGTSARVLAAHGSDGEQVSLRLNGHPPGVWANGSAPHPERRPNG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410  
pF1KB8 YALGLVSGGSAQESQGNTGLPDVELLSHELKGVCPEPPGLDDPLAQDGAGVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YALGLVSGGSAQESQGNTGLPDVELLSHELKGVCPEPPGLDDPLAQDGAGVS
              370       380       390       400       410  

>>CCDS11173.1 ADORA2B gene_id:136|Hs108|chr17             (332 aa)
 initn: 1234 init1: 824 opt: 1274  Z-score: 965.2  bits: 187.2 E(32554): 1.9e-47
Smith-Waterman score: 1274; 59.4% identity (82.1% similar) in 330 aa overlap (7-328:8-329)

                10        20        30        40        50         
pF1KB8  MPIMGSSVYITVELAIAVLAILGNVLVCWAVWLNSNLQNVTNYFVVSLAAADIAVGVLA
              ..:...::.::.:.. :::::: ::   ..::. ::::.:::::::.:::..:
CCDS11 MLLETQDALYVALELVIAALSVAGNVLVCAAVGTANTLQTPTNYFLVSLAAADVAVGLFA
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB8 IPFAITISTGFCAACHGCLFIACFVLVLTQSSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGLVTGT
       :::::::: :::.  .::::.:::::::::::::::::.:.:::.:: .::::..:::::
CCDS11 IPFAITISLGFCTDFYGCLFLACFVLVLTQSSIFSLLAVAVDRYLAICVPLRYKSLVTGT
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140              150       160       170  
pF1KB8 RAKGIIAICWVLSFAIGLTPMLGWN-------NCGQPKEGKNHSQGCGEGQVACLFEDVV
       ::.:.::. :::.:.:::::.::::       :: .: .: .. . :    : ::::.::
CCDS11 RARGVIAVLWVLAFGIGLTPFLGWNSKDSATNNCTEPWDGTTNESCC---LVKCLFENVV
              130       140       150       160          170       

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB8 PMNYMVYFNFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLKQMESQPLPGERARSTLQKEVHAA
       ::.::::::::.::: :::.:: .:..:::.: :::.. : .    ...:.:::.:.:::
CCDS11 PMSYMVYFNFFGCVLPPLLIMLVIYIKIFLVACRQLQRTELM----DHSRTTLQREIHAA
       180       190       200       210           220       230   

            240       250       260        270       280       290 
pF1KB8 KSLAIIVGLFALCWLPLHIINCFTFFCP-DCSHAPLWLMYLAIVLSHTNSVVNPFIYAYR
       ::::.:::.:::::::.: .:: :.: : . .. : : : .::.:::.::::::..::::
CCDS11 KSLAMIVGIFALCWLPVHAVNCVTLFQPAQGKNKPKWAMNMAILLSHANSVVNPIVYAYR
           240       250       260       270       280       290   

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB8 IREFRQTFRKIIRSHVLRQQEPFKAAGTSARVLAAHGSDGEQVSLRLNGHPPGVWANGSA
        :.:: ::.:::  ..: : .  :... .: :  : :                       
CCDS11 NRDFRYTFHKIISRYLLCQAD-VKSGNGQAGVQPALGVGL                    
           300       310        320       330                      

             360       370       380       390       400       410 
pF1KB8 PHPERRPNGYALGLVSGGSAQESQGNTGLPDVELLSHELKGVCPEPPGLDDPLAQDGAGV

>>CCDS1434.1 ADORA1 gene_id:134|Hs108|chr1                (326 aa)
 initn: 1007 init1: 700 opt: 1015  Z-score: 773.5  bits: 151.7 E(32554): 9.1e-37
Smith-Waterman score: 1015; 51.8% identity (75.9% similar) in 307 aa overlap (7-313:10-313)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB8    MPIMGSSVYITVELAIAVLAILGNVLVCWAVWLNSNLQNVTNYFVVSLAAADIAVGV
                ..:: .:. ::.... ::::: ::: .:. :...:  :.::::.::.:::.
CCDS14 MPPSISAFQAAYIGIEVLIALVSVPGNVLVIWAVKVNQALRDATFCFIVSLAVADVAVGA
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB8 LAIPFAITISTGFCAACHGCLFIACFVLVLTQSSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGLVT
       :.::.:: :. :  .  : ::..:: ::.::::::..:::::.:::. ..:::::. .::
CCDS14 LVIPLAILINIGPQTYFHTCLMVACPVLILTQSSILALLAIAVDRYLRVKIPLRYKMVVT
               70        80        90       100       110       120

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB8 GTRAKGIIAICWVLSFAIGLTPMLGWNNCGQPKEGKNHSQGCGEGQVACLFEDVVPMNYM
         ::   :: ::.:::..:::::.:::: .  ...   . . ::  . : :: :. :.::
CCDS14 PRRAAVAIAGCWILSFVVGLTPMFGWNNLSAVERAWAANGSMGEPVIKCEFEKVISMEYM
              130       140       150       160       170       180

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB8 VYFNFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLKQMESQPLPGERARSTLQKEVHAAKSLAI
       ::::::. :: :::::. .::..:   :.::..  :    :.  ..   ::.. :::::.
CCDS14 VYFNFFVWVLPPLLLMVLIYLEVFYLIRKQLNKKVSAS-SGD-PQKYYGKELKIAKSLAL
              190       200       210        220        230        

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB8 IVGLFALCWLPLHIINCFTFFCPDCSHAPLWLMYLAIVLSHTNSVVNPFIYAYRIREFRQ
       :. :::: ::::::.::.:.:::.: : :  : :.:: :.: ::..::..::.::..:: 
CCDS14 ILFLFALSWLPLHILNCITLFCPSC-HKPSILTYIAIFLTHGNSAMNPIVYAFRIQKFRV
      240       250       260        270       280       290       

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB8 TFRKIIRSHVLRQQEPFKAAGTSARVLAAHGSDGEQVSLRLNGHPPGVWANGSAPHPERR
       :: ::  .:   :  :                                            
CCDS14 TFLKIWNDHFRCQPAPPIDEDLPEERPDD                               
       300       310       320                                     

>>CCDS839.1 ADORA3 gene_id:140|Hs108|chr1                 (318 aa)
 initn: 770 init1: 474 opt: 582  Z-score: 453.1  bits: 92.4 E(32554): 6.4e-19
Smith-Waterman score: 811; 41.6% identity (75.4% similar) in 305 aa overlap (4-308:10-302)

                     10        20        30        40        50    
pF1KB8       MPIMGSSVYITVELAIAVLAILGNVLVCWAVWLNSNLQNVTNYFVVSLAAADIA
                ... .:::.:. :.. ::.:::::  .: :: .::..: ::.:::: ::::
CCDS83 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIA
               10        20        30        40        50        60

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB8 VGVLAIPFAITISTGFCAACHGCLFIACFVLVLTQSSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNG
       ::::..:.::..: :.    ..:::..:..:..:..::.::::::.:::. ... .::. 
CCDS83 VGVLVMPLAIVVSLGITIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVRYKR
               70        80        90       100       110       120

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB8 LVTGTRAKGIIAICWVLSFAIGLTPMLGWNNCGQPKEGKNHSQGCGEGQVACLFEDVVPM
       ..:  :    ...::..:: .:::::.:::     .  .: .       ..: : .:. :
CCDS83 VTTHRRIWLALGLCWLVSFLVGLTPMFGWNMKLTSEYHRNVTF------LSCQFVSVMRM
              130       140       150       160             170    

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB8 NYMVYFNFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLKQMESQPLPGERARSTLQKEVHAAKS
       .:::::.:.. ...::..: ..:: ::   : .:.   :.   .... .   .: ..:::
CCDS83 DYMVYFSFLTWIFIPLVVMCAIYLDIFYIIRNKLSLNLSN---SKETGAFYGREFKTAKS
          180       190       200       210          220       230 

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB8 LAIIVGLFALCWLPLHIINCFTFFCPDCSHAPLWLMYLAIVLSHTNSVVNPFIYAYRIRE
       : ... :::: :::: ::::. .:  .   .:  ..:..:.:::.::..::..:::.:..
CCDS83 LFLVLFLFALSWLPLSIINCIIYFNGE---VPQLVLYMGILLSHANSMMNPIVYAYKIKK
             240       250          260       270       280        

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB8 FRQTFRKIIRSHVLRQQEPFKAAGTSARVLAAHGSDGEQVSLRLNGHPPGVWANGSAPHP
       :..:.  :... :.                                              
CCDS83 FKETYLLILKACVVCHPSDSLDTSIEKNSE                              
      290       300       310                                      

>>CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6              (345 aa)
 initn: 366 init1: 138 opt: 427  Z-score: 338.1  bits: 71.3 E(32554): 1.6e-12
Smith-Waterman score: 427; 32.5% identity (58.8% similar) in 323 aa overlap (5-309:30-332)

                                        10         20        30    
pF1KB8                          MPIMGSSVYITVELAI-AVLAILGNVLVCWAVWLN
                                    :: : . . ... ::::..::.::  ..   
CCDS51 MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFGNLLVMISILHF
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           40        50        60        70           80        90 
pF1KB8 SNLQNVTNYFVVSLAAADIAVGVLAIPFAITISTGFCAACHG---CLFIACFVLVLTQSS
       ..:.. ::..:.::: ::. ::: ..::... ..  :    :   : : .:  ...  ::
CCDS51 KQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWY-FGRSFCTFHTCCDVAFCYSS
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pF1KB8 IFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGLVTGTRAKGI-IAICWVLSFAI-GLTPMLGWNNCGQP
       .: :  :.::::::.  :: :    : . ..:: :.. :.: .   : . . :  . :  
CCDS51 LFHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFT-VSVSGICISVSWILPLMYSGAVFYTGVYDDGL-
     120       130       140        150       160       170        

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pF1KB8 KEGKNHSQGCGEGQVACLFEDVVPMNYMV--YFNFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQ
        :  . . .:  :   :  . :: .:...  ...::    .: ..:. .:  :::.::::
CCDS51 -EELSDALNCIGG---C--QTVVNQNWVLTDFLSFF----IPTFIMIILYGNIFLVARRQ
        180          190         200           210       220       

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pF1KB8 LKQMESQPLPGERARSTLQ-----KEVHAAKSLAIIVGLFALCWLPLHI---INCFT-FF
        :..:.     : .  . .     .: .:::.:.. :  : . :::  :   :. :  :.
CCDS51 AKKIENTGSKTESSSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFI
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pF1KB8 CPDCSHAPL-WLMYLAIVLSHTNSVVNPFIYAYRIREFRQTFRKIIRSHVLRQQEPFKAA
        : : .    :  :        ::..::.:::     ::.... :. ..::.        
CCDS51 TPACIYEICCWCAYY-------NSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNL
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pF1KB8 GTSARVLAAHGSDGEQVSLRLNGHPPGVWANGSAPHPERRPNGYALGLVSGGSAQESQGN
                                                                   
CCDS51 FSEHI                                                       
                                                                   

>>CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6             (348 aa)
 initn: 353 init1: 128 opt: 401  Z-score: 318.8  bits: 67.7 E(32554): 1.9e-11
Smith-Waterman score: 401; 30.5% identity (58.8% similar) in 308 aa overlap (17-309:43-332)

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pF1KB8               MPIMGSSVYITVELAIAVLAILGNVLVCWAVWLNSNLQNVTNYFVV
                                     :::: .::.::  :.   ..:.. ::....
CCDS75 LCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLAAFGNLLVMIAILHFKQLHTPTNFLIA
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pF1KB8 SLAAADIAVGVLAIPFAITISTGFCAACHG--CLFIACFVLVLTQSSIFSLLAIAIDRYI
       ::: ::. ::: ..::. . :.  :       : : .::   .  .:.: :  :..::::
CCDS75 SLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHTCFDTSFCFASLFHLCCISVDRYI
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pF1KB8 AIRIPLRYNGLVTGTRAKGIIAICWVLSFAIGLTPMLGWNNCGQPKEGKNH---SQGCGE
       :.  :: :    : .    . .:: :::. ...:  ..    :  .:: ..   .  :  
CCDS75 AVTDPLTYPTKFTVS----VSGICIVLSWFFSVTYSFSIFYTGANEEGIEELVVALTCVG
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pF1KB8 GQVACLFEDVVPMNYMVYFNFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLKQMESQPLPGERA
       :  : : .. : . ....:       .: . :. .: .:::.:..: ...::    .. .
CCDS75 GCQAPLNQNWVLLCFLLFF-------IPNVAMVFIYSKIFLVAKHQARKIESTASQAQSS
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pF1KB8 RSTLQKEV-----HAAKSLAIIVGLFALCWLPL---HIINCF-TFFCPDCSHAPL-WLMY
         . ...:     .:::.:.: .. : . :::     .:. . .:. :   .  : : .:
CCDS75 SESYKERVAKRERKAAKTLGIAMAAFLVSWLPYLVDAVIDAYMNFITPPYVYEILVWCVY
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pF1KB8 LAIVLSHTNSVVNPFIYAYRIREFRQTFRKIIRSHVLRQQEPFKAAGTSARVLAAHGSDG
               ::..::.:::.  . : .... :. ..:::                      
CCDS75 Y-------NSAMNPLIYAFFYQWFGKAIKLIVSGKVLRTDSSTTNLFSEEVETD      
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pF1KB8 EQVSLRLNGHPPGVWANGSAPHPERRPNGYALGLVSGGSAQESQGNTGLPDVELLSHELK

>>CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8                 (408 aa)
 initn: 471 init1: 164 opt: 397  Z-score: 315.2  bits: 67.3 E(32554): 3.1e-11
Smith-Waterman score: 508; 34.6% identity (59.0% similar) in 376 aa overlap (14-345:44-407)

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                                     ::.:::: .: :.::  :.  .  ::..::
CCDS60 WPDLPTLAPNTANTSGLPGVPWEAALAGALLALAVLATVGGNLLVIVAIAWTPRLQTMTN
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pF1KB8 YFVVSLAAADIAVGVLAIPFAITIS-TG-FCAACHGC-LFIACFVLVLTQSSIFSLLAIA
        ::.::::::...:.:..: : :.. :: .  .  :: :. .  :: .: .:: .: :.:
CCDS60 VFVTSLAAADLVMGLLVVPPAATLALTGHWPLGATGCELWTSVDVLCVT-ASIETLCALA
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pF1KB8 IDRYIAIRIPLRYNGLVTGTRAKGIIAICWVLSFAIGLTPMLG-WNNCGQPKEGKNHSQG
       .:::.:.  ::::..:::   :.  ... ::.: :....:... :   :   :    .: 
CCDS60 VDRYLAVTNPLRYGALVTKRCARTAVVLVWVVSAAVSFAPIMSQWWRVGADAE----AQR
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pF1KB8 CGEGQVACLFEDVVPMNYMVYFNFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLKQM-------
       :  .   : : . .:   .: ..  .   .:::.:: :: :.:..: :::. .       
CCDS60 CHSNPRCCAFASNMP---YVLLSSSVSFYLPLLVMLFVYARVFVVATRQLRLLRGELGRF
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pF1KB8 ---ESQPLP---------------------GER-ARSTLQKEVHAAKSLAIIVGLFALCW
          :: : :                     :.: ::    .: .:  .:..:.: :.:::
CCDS60 PPEESPPAPSRSLAPAPVGTCAPPEGVPACGRRPARLLPLREHRALCTLGLIMGTFTLCW
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pF1KB8 LPLHIINCFTFFC-PDCSHAPLWLMYLAIV-LSHTNSVVNPFIYAYRIREFRQTFRKII-
       ::. . : .  .  :.   .:    .::.  :...::. ::.::  :  .::..::... 
CCDS60 LPFFLANVLRALGGPSLVPGP---AFLALNWLGYANSAFNPLIYC-RSPDFRSAFRRLLC
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pF1KB8 RSHVLRQQEPFKAAGTS---ARVLAAHGSDGE-QVSLRLNGHPPGVWANGSAPHPERRPN
       :       ::  ::  .   . : ::..: .. ..  ::.:   ::              
CCDS60 RCGRRLPPEPCAAARPALFPSGVPAARSSPAQPRLCQRLDGASWGVS             
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pF1KB8 GYALGLVSGGSAQESQGNTGLPDVELLSHELKGVCPEPPGLDDPLAQDGAGVS




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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