seq1 = pF1KA1996.tfa, 1248 bp seq2 = pF1KA1996/gi568815588r_27104440.tfa (gi568815588r:27104440_27331795), 227356 bp >pF1KA1996 1248 >gi568815588r:27104440_27331795 (Chr10) (complement) 1-48 (100001-100048) 100% -> 49-163 (108344-108458) 100% -> 164-298 (111939-112073) 100% -> 299-502 (113613-113816) 99% -> 503-609 (116155-116261) 100% -> 610-877 (120715-120982) 99% -> 878-1077 (123351-123550) 100% -> 1078-1128 (126548-126598) 100% -> 1129-1246 (127247-127362) 96% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGACCAAAGAGGAAGCCATGATTGCATATGTTGAAGAAATGAAAAAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>> 100001 ATGACCAAAGAGGAAGCCATGATTGCATATGTTGAAGAAATGAAAAAGGT 50 . : . : . : . : . : 49 ATTATTGAAACTATGCCAATGACTGAGAAAGTTGAAGAATTGC >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 A...CAGATTATTGAAACTATGCCAATGACTGAGAAAGTTGAAGAATTGC 100 . : . : . : . : . : 92 TGCGTGTCATAGGTCCATTTTATGAAATTGTCGAGGACAAAAAGAGTGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108387 TGCGTGTCATAGGTCCATTTTATGAAATTGTCGAGGACAAAAAGAGTGGC 150 . : . : . : . : . : 142 AGGAGTTCTGATATAACCTCAG ATCTTGGTAATGTTCTCAC ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 108437 AGGAGTTCTGATATAACCTCAGGTT...TAGATCTTGGTAATGTTCTCAC 200 . : . : . : . : . : 183 TTCTACTCCAAACGCCAAAACCGTTAATGGTAAAGCTGAAAGCAGTGACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 111958 TTCTACTCCAAACGCCAAAACCGTTAATGGTAAAGCTGAAAGCAGTGACA 250 . : . : . : . : . : 233 GTGGAGCCGAGTCTGAGGAAGAAGAGGCCCAAGAAGAAGTGAAAGGAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112008 GTGGAGCCGAGTCTGAGGAAGAAGAGGCCCAAGAAGAAGTGAAAGGAGCA 300 . : . : . : . : . : 283 GAACAAAGTGATAATG ATAAGAAAATGATGAAGAAGTCAGC ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 112058 GAACAAAGTGATAATGGTA...AAGATAAGAAAATGATGAAGAAGTCAGC 350 . : . : . : . : . : 324 AGACCATAAGAATTTGGAAGTCATTGTCACTAATGGCTATGATAAAGATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113638 AGACCATAAGAATTTGGAAGTCATTGTCACTAATGGCTATGATAAAGATG 400 . : . : . : . : . : 374 GCTTTGTTCAGGATATACAGAATGACATTCATGCCAGTTCTTCCCTGAAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113688 GCTTTGTTCAGGATATACAGAATGACATTCATGCCAGTTCTTCCCTGAAT 450 . : . : . : . : . : 424 GGCAGAAGCACTGAAGAAGTAAAGCCTATTGATGAAAACTTGGGGCAAAC |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| 113738 GGCAGAAGCACTGAAGAAGTAAAGCCCATTGATGAAAACTTGGGGCAAAC 500 . : . : . : . : . : 474 TGGAAAATCTGCTGTTTGCATTCACCAAG ATATAAATGATG |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||| 113788 TGGAAAATCTGCTGTTTGCATTCACCAAGGTA...TAGATATAAATGATG 550 . : . : . : . : . : 515 ATCATGTTGAAGATGTTACAGGAATTCAGCATTTGACAAGCGATTCAGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116167 ATCATGTTGAAGATGTTACAGGAATTCAGCATTTGACAAGCGATTCAGAC 600 . : . : . : . : . : 565 AGTGAAGTTTACTGTGATTCTATGGAACAATTTGGACAAGAAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 116217 AGTGAAGTTTACTGTGATTCTATGGAACAATTTGGACAAGAAGAGGTA.. 650 . : . : . : . : . : 610 TCTTTAGACAGCTTTACGTCCAACAATGGACCATTTCAGTATTACT .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116267 .TAGTCTTTAGACAGCTTTACGTCCAACAATGGACCATTTCAGTATTACT 700 . : . : . : . : . : 656 TGGGTGGTCATTCCAGTCAACCCATGGAAAATTCTGGATTTCGTGAAGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120761 TGGGTGGTCATTCCAGTCAACCCATGGAAAATTCTGGATTTCGTGAAGAT 750 . : . : . : . : . : 706 ATTCAAGTACCTCCTGGAAATGGCAACATTGGGAATATGCAGGTGGTTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120811 ATTCAAGTACCTCCTGGAAATGGCAACATTGGGAATATGCAGGTGGTTGC 800 . : . : . : . : . : 756 AGTTGAAGGAAAAGGTGAAGTCAAGCATGGAGGAGAAGATGGCAGGAATA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120861 AGTTGAAGGAAAAGGTGAAGTCAAGCATGGAGGAGAAGATGGCAGGAATA 850 . : . : . : . : . : 806 ACAGCGGAGCGCCACACCGGGAGAAGCGAGGCGGAGAAACTGATGAATTC |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| 120911 ACAGCGGAGCACCACACCGGGAGAAGCGAGGCGGAGAAACTGACGAATTC 900 . : . : . : . : . : 856 TCTAATGTTAGAAGAGGAAGAG GACATAGGATGCAACACTT ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 120961 TCTAATGTTAGAAGAGGAAGAGGTG...TAGGACATAGGATGCAACACTT 950 . : . : . : . : . : 897 GAGCGAAGGAACCAAGGGCCGGCAGGTGGGAAGTGGAGGTGATGGGGAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123370 GAGCGAAGGAACCAAGGGCCGGCAGGTGGGAAGTGGAGGTGATGGGGAGC 1000 . : . : . : . : . : 947 GCTGGGGCTCCGACAGAGGGTCCCGAGGCAGCCTCAATGAGCAGATCGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123420 GCTGGGGCTCCGACAGAGGGTCCCGAGGCAGCCTCAATGAGCAGATCGCC 1050 . : . : . : . : . : 997 CTCGTGCTGATGAGACTGCAGGAGGACATGCAGAATGTCCTTCAGAGACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123470 CTCGTGCTGATGAGACTGCAGGAGGACATGCAGAATGTCCTTCAGAGACT 1100 . : . : . : . : . : 1047 GCAGAAACTGGAAACGCTGACTGCTTTGCAG GCAAAATCAT |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| 123520 GCAGAAACTGGAAACGCTGACTGCTTTGCAGGTA...CAGGCAAAATCAT 1150 . : . : . : . : . : 1088 CAACATCAACATTGCAGACTGCTCCTCAGCCCACCTCACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> 126558 CAACATCAACATTGCAGACTGCTCCTCAGCCCACCTCACAGGTA...CAG 1200 . : . : . : . : . : 1129 AGACCATCTTGGTGGCCCTTCGAGATGTCTCCTGGTGTGCTAACGTTTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127247 AGACCATCTTGGTGGCCCTTCGAGATGTCTCCTGGTGTGCTAACGTTTGC 1250 . : . : . : . : . : 1179 CATCATATGGCCTTTTATTGCACAGTGGTTGGTGTATTTATACTATCAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127297 CATCATATGGCCTTTTATTGCACAGTGGTTGGTGTATTTATACTATCAAA 1300 . : . 1229 GAAGGAGAAGAAAACTGA |||||||||| ||--|| 127347 GAAGGAGAAGGTAA GA