Result of SIM4 for pF1KB5895

seq1 = pF1KB5895.tfa, 1497 bp
seq2 = pF1KB5895/gi568815583f_58332033.tfa (gi568815583f:58332033_58668824), 336792 bp

>pF1KB5895 1497
>gi568815583f:58332033_58668824 (Chr15)

1-88  (100001-100088)   100% ->
89-273  (206301-206485)   100% ->
274-456  (209753-209935)   100% ->
457-574  (210502-210619)   100% ->
575-808  (213710-213943)   99% ->
809-1051  (216298-216540)   99% ->
1052-1169  (228832-228949)   98% ->
1170-1388  (231473-231691)   100% ->
1389-1497  (236684-236792)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACACAAGTCCCCTGTGTTTCTCCATTCTGTTGGTTTTATGCATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACACAAGTCCCCTGTGTTTCTCCATTCTGTTGGTTTTATGCATCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATCCAATCAAGTGCCCTTGGACAAAGCCTGAAACCAG         AGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100051 TATCCAATCAAGTGCCCTTGGACAAAGCCTGAAACCAGGTA...CAGAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CATTTGGAAGAAGAGCTCAAGCTGTTGAAACAAACAAAACGCTGCATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206304 CATTTGGAAGAAGAGCTCAAGCTGTTGAAACAAACAAAACGCTGCATGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGAAGACCAGATTCCTGCTCTTTGGAGAAACCAATCAGGGCTGTCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206354 ATGAAGACCAGATTCCTGCTCTTTGGAGAAACCAATCAGGGCTGTCAGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCGAATCAATCATCCGGACACGTTACAGGAGTGCGGCTTCAACTCCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206404 TCGAATCAATCATCCGGACACGTTACAGGAGTGCGGCTTCAACTCCTCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGCCTCTGGTGATGATAATCCACGGGTGGTCG         GTGGACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 206454 TGCCTCTGGTGATGATAATCCACGGGTGGTCGGTA...CAGGTGGACGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTGCTAGAAAACTGGATCTGGCAGATGGTGGCCGCGCTGAAGTCTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209762 GTGCTAGAAAACTGGATCTGGCAGATGGTGGCCGCGCTGAAGTCTCAGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGCCCAGCCAGTGAACGTGGGGCTGGTGGACTGGATCACCCTGGCCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209812 GGCCCAGCCAGTGAACGTGGGGCTGGTGGACTGGATCACCCTGGCCCACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACCACTACACCATCGCCGTCCGCAACACCCGCCTTGTGGGCAAGGAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209862 ACCACTACACCATCGCCGTCCGCAACACCCGCCTTGTGGGCAAGGAGGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCGGCTCTTCTCCGGTGGCTGGAG         GAATCTGTGCAACTCTC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 209912 GCGGCTCTTCTCCGGTGGCTGGAGGTA...CAGGAATCTGTGCAACTCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TCGAAGCCATGTTCACCTAATTGGGTACAGCCTGGGTGCACACGTGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210519 TCGAAGCCATGTTCACCTAATTGGGTACAGCCTGGGTGCACACGTGTCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GATTTGCCGGCAGTTCCATCGGTGGAACGCACAAGATTGGGAGAATCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210569 GATTTGCCGGCAGTTCCATCGGTGGAACGCACAAGATTGGGAGAATCACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 G         GGCTGGATGCCGCGGGACCTTTGTTTGAGGGAAGTGCCCC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210619 GGTA...TAGGGCTGGATGCCGCGGGACCTTTGTTTGAGGGAAGTGCCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CAGCAATCGTCTTTCTCCAGATGATGCCAGTTTTGTGGATGCCATTCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 213750 CAGCAATCGTCTTTCTCCAGATGATGCCAATTTTGTGGATGCCATTCATA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCTTTACCCGGGAGCACATGGGCCTGAGCGTGGGCATCAAACAGCCCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213800 CCTTTACCCGGGAGCACATGGGCCTGAGCGTGGGCATCAAACAGCCCATA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GGACACTATGACTTCTATCCCAACGGGGGCTCCTTCCAGCCTGGCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213850 GGACACTATGACTTCTATCCCAACGGGGGCTCCTTCCAGCCTGGCTGCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CTTCCTAGAGCTCTACAGACATATTGCCCAGCACGGCTTCAATG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 213900 CTTCCTAGAGCTCTACAGACATATTGCCCAGCACGGCTTCAATGGTG...

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    809    CCATCACCCAGACCATAAAATGCTCCCACGAGCGATCGGTGCACCTT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216295 CAGCCATCACCCAGACCATAAAATGCTCCCACGAGCGATCGGTGCACCTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TTCATCGACTCTTTGCTGCACGCCGGCACGCAGAGCATGGCCTACCCGTG
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216345 TTCATCGACTCCTTGCTGCACGCCGGCACGCAGAGCATGGCCTACCCGTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TGGTGACATGAACAGCTTCAGCCAGGGCCTGTGCCTGAGCTGCAAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216395 TGGTGACATGAACAGCTTCAGCCAGGGCCTGTGCCTGAGCTGCAAGAAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GCCGCTGCAACACGCTGGGCTACCACGTCCGCCAGGAGCCGCGGAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216445 GCCGCTGCAACACGCTGGGCTACCACGTCCGCCAGGAGCCGCGGAGCAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 AGCAAGAGGCTCTTCCTCGTAACGCGAGCCCAGTCCCCCTTCAAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 216495 AGCAAGAGGCTCTTCCTCGTAACGCGAGCCCAGTCCCCCTTCAAAGGTG.

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052      TTTATCATTACCAGTTAAAGATCCAGTTCATCAACCAAACTGAGA
        ..>>>|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 216545 ..TAGTTTATCATTACCAGTTCAAGATCCAGTTCATCAACCAAACTGAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CGCCAATACAAACAACTTTTACCATGTCACTACTCGGAACAAAAGAGAAA
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228877 CACCAATACAAACAACTTTTACCATGTCACTACTCGGAACAAAAGAGAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 ATGCAGAAAATTCCCATCACTCT         GGGCAAAGGAATTGCTAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 228927 ATGCAGAAAATTCCCATCACTCTGTG...AAGGGGCAAAGGAATTGCTAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TAATAAAACGTATTCCTTTCTTATCACGCTGGATGTGGATATCGGCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231491 TAATAAAACGTATTCCTTTCTTATCACGCTGGATGTGGATATCGGCGAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TGATCATGATCAAGTTCAAGTGGGAAAACAGTGCAGTGTGGGCCAATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231541 TGATCATGATCAAGTTCAAGTGGGAAAACAGTGCAGTGTGGGCCAATGTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TGGGACACGGTCCAGACCATCATCCCATGGAGCACAGGGCCGCGCCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231591 TGGGACACGGTCCAGACCATCATCCCATGGAGCACAGGGCCGCGCCACTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 AGGCCTCGTTCTGAAGACGATCAGAGTCAAAGCAGGAGAAACCCAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231641 AGGCCTCGTTCTGAAGACGATCAGAGTCAAAGCAGGAGAAACCCAGCAAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 G         AATGACATTTTGTTCAGAAAACACAGATGACCTACTACTT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231691 GGTG...CAGAATGACATTTTGTTCAGAAAACACAGATGACCTACTACTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CGCCCAACCCAGGAAAAAATCTTCGTGAAATGTGAAATAAAGTCTAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236724 CGCCCAACCCAGGAAAAAATCTTCGTGAAATGTGAAATAAAGTCTAAAAC

   1550     .    :    .
   1479 ATCAAAGCGAAAGATCAGA
        |||||||||||||||||||
 236774 ATCAAAGCGAAAGATCAGA

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