Result of FASTA (omim) for pF1KB0449
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB0449, 474 aa
  1>>>pF1KB0449 474 - 474 aa - 474 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5218+/-0.000617; mu= -7.2650+/- 0.036
 mean_var=693.8921+/-152.725, 0's: 0 Z-trim(116.2): 1448  B-trim: 0 in 0/55
 Lambda= 0.048689
 statistics sampled from 25210 (27272) to 25210 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.684), E-opt: 0.2 (0.32), width:  16
 Scan time:  8.910

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_002587 (OMIM: 169190) cyclin-dependent kinase 1 ( 474) 3161 238.2 3.6e-62
NP_997667 (OMIM: 169190) cyclin-dependent kinase 1 ( 474) 3161 238.2 3.6e-62
XP_011507904 (OMIM: 169190) PREDICTED: cyclin-depe ( 542) 3161 238.3 3.9e-62
NP_997668 (OMIM: 169190) cyclin-dependent kinase 1 ( 504) 2548 195.2 3.4e-49
XP_016856912 (OMIM: 169190) PREDICTED: cyclin-depe ( 572) 2548 195.3 3.7e-49
XP_016874894 (OMIM: 603440) PREDICTED: cyclin-depe ( 523) 2133 166.1 2.1e-40
XP_016874895 (OMIM: 603440) PREDICTED: cyclin-depe ( 523) 2133 166.1 2.1e-40
NP_002586 (OMIM: 603440) cyclin-dependent kinase 1 ( 523) 2133 166.1 2.1e-40
NP_001163935 (OMIM: 603440) cyclin-dependent kinas ( 523) 2083 162.6 2.4e-39
XP_016885060 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 496) 1982 155.5 3.2e-37
XP_016885059 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 496) 1982 155.5 3.2e-37
XP_016885062 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 496) 1982 155.5 3.2e-37
XP_016885061 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 496) 1982 155.5 3.2e-37
NP_006192 (OMIM: 311550) cyclin-dependent kinase 1 ( 496) 1982 155.5 3.2e-37
NP_148978 (OMIM: 311550) cyclin-dependent kinase 1 ( 502) 1982 155.5 3.2e-37
XP_016885058 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 543) 1982 155.5 3.3e-37
NP_001163931 (OMIM: 311550) cyclin-dependent kinas ( 570) 1982 155.6 3.4e-37
XP_011542228 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 497) 1973 154.8 4.9e-37
XP_011542230 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 497) 1973 154.8 4.9e-37
XP_011542226 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 497) 1973 154.8 4.9e-37
XP_011542227 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 497) 1973 154.8 4.9e-37
XP_011542229 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 497) 1973 154.8 4.9e-37
XP_011542225 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 503) 1973 154.8   5e-37
XP_011542224 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 540) 1973 154.9 5.1e-37
XP_011542223 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 544) 1973 154.9 5.2e-37
XP_011542222 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 571) 1973 154.9 5.3e-37
XP_016874896 (OMIM: 603440) PREDICTED: cyclin-depe ( 502) 1251 104.1 9.2e-22
NP_001274065 (OMIM: 610679) cyclin-dependent kinas ( 423) 1227 102.3 2.7e-21
XP_005250495 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 423) 1227 102.3 2.7e-21
XP_016867810 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 423) 1227 102.3 2.7e-21
XP_016867811 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 423) 1227 102.3 2.7e-21
XP_016867809 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 423) 1227 102.3 2.7e-21
XP_005250496 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 423) 1227 102.3 2.7e-21
XP_005250493 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 450) 1227 102.4 2.8e-21
NP_036527 (OMIM: 610679) cyclin-dependent kinase 1 ( 451) 1227 102.4 2.8e-21
XP_011514608 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 469) 1227 102.4 2.8e-21
NP_001274064 (OMIM: 610679) cyclin-dependent kinas ( 469) 1227 102.4 2.8e-21
XP_005246839 (OMIM: 616147) PREDICTED: cyclin-depe ( 384) 1148 96.7 1.2e-19
NP_631897 (OMIM: 616147) cyclin-dependent kinase 1 ( 384) 1148 96.7 1.2e-19
XP_005246838 (OMIM: 616147) PREDICTED: cyclin-depe ( 435) 1148 96.8 1.3e-19
NP_001248364 (OMIM: 616147) cyclin-dependent kinas ( 429) 1127 95.3 3.5e-19
NP_001248365 (OMIM: 616147) cyclin-dependent kinas ( 400) 1122 94.9 4.4e-19
XP_011509952 (OMIM: 616147) PREDICTED: cyclin-depe ( 412) 1122 94.9 4.4e-19
NP_004926 (OMIM: 123831,616342) cyclin-dependent-l ( 292) 1099 93.1 1.1e-18
NP_001274066 (OMIM: 610679) cyclin-dependent kinas ( 340) 1090 92.5 1.9e-18
XP_005270360 (OMIM: 116940) PREDICTED: cyclin-depe ( 297) 1053 89.8 1.1e-17
NP_001777 (OMIM: 116940) cyclin-dependent kinase 1 ( 297) 1053 89.8 1.1e-17
NP_001307847 (OMIM: 116940) cyclin-dependent kinas ( 297) 1053 89.8 1.1e-17
NP_001249 (OMIM: 123828) cyclin-dependent kinase 3 ( 305) 1039 88.9 2.2e-17
XP_011509956 (OMIM: 616147) PREDICTED: cyclin-depe ( 344) 1038 88.9 2.4e-17


>>NP_002587 (OMIM: 169190) cyclin-dependent kinase 18 is  (474 aa)
 initn: 3161 init1: 3161 opt: 3161  Z-score: 1237.0  bits: 238.2 E(85289): 3.6e-62
Smith-Waterman score: 3161; 100.0% identity (100.0% similar) in 474 aa overlap (1-474:1-474)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MIMNKMKNFKRRFSLSVPRTETIEESLAEFTEQFNQLHNRRNENLQLGPLGRDPPQECST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MIMNKMKNFKRRFSLSVPRTETIEESLAEFTEQFNQLHNRRNENLQLGPLGRDPPQECST
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 FSPTDSGEEPGQLSPGVQFQRRQNQRRFSMEDVSKRLSLPMDIRLPQEFLQKLQMESPDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FSPTDSGEEPGQLSPGVQFQRRQNQRRFSMEDVSKRLSLPMDIRLPQEFLQKLQMESPDL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 PKPLSRMSRRASLSDIGFGKLETYVKLDKLGEGTYATVFKGRSKLTENLVALKEIRLEHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PKPLSRMSRRASLSDIGFGKLETYVKLDKLGEGTYATVFKGRSKLTENLVALKEIRLEHE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 EGAPCTAIREVSLLKNLKHANIVTLHDLIHTDRSLTLVFEYLDSDLKQYLDHCGNLMSMH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EGAPCTAIREVSLLKNLKHANIVTLHDLIHTDRSLTLVFEYLDSDLKQYLDHCGNLMSMH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 NVKIFMFQLLRGLAYCHHRKILHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 NVKIFMFQLLRGLAYCHHRKILHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 VVTLWYRPPDVLLGSTEYSTPIDMWGVGCIHYEMATGRPLFPGSTVKEELHLIFRLLGTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VVTLWYRPPDVLLGSTEYSTPIDMWGVGCIHYEMATGRPLFPGSTVKEELHLIFRLLGTP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 TEETWPGVTAFSEFRTYSFPCYLPQPLINHAPRLDTDGIHLLSSLLLYESKSRMSAEAAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TEETWPGVTAFSEFRTYSFPCYLPQPLINHAPRLDTDGIHLLSSLLLYESKSRMSAEAAL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470    
pF1KB0 SHSYFRSLGERVHQLEDTASIFSLKEIQLQKDPGYRGLAFQQPGRGKNRRQSIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SHSYFRSLGERVHQLEDTASIFSLKEIQLQKDPGYRGLAFQQPGRGKNRRQSIF
              430       440       450       460       470    

>>NP_997667 (OMIM: 169190) cyclin-dependent kinase 18 is  (474 aa)
 initn: 3161 init1: 3161 opt: 3161  Z-score: 1237.0  bits: 238.2 E(85289): 3.6e-62
Smith-Waterman score: 3161; 100.0% identity (100.0% similar) in 474 aa overlap (1-474:1-474)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MIMNKMKNFKRRFSLSVPRTETIEESLAEFTEQFNQLHNRRNENLQLGPLGRDPPQECST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 MIMNKMKNFKRRFSLSVPRTETIEESLAEFTEQFNQLHNRRNENLQLGPLGRDPPQECST
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 FSPTDSGEEPGQLSPGVQFQRRQNQRRFSMEDVSKRLSLPMDIRLPQEFLQKLQMESPDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 FSPTDSGEEPGQLSPGVQFQRRQNQRRFSMEDVSKRLSLPMDIRLPQEFLQKLQMESPDL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 PKPLSRMSRRASLSDIGFGKLETYVKLDKLGEGTYATVFKGRSKLTENLVALKEIRLEHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 PKPLSRMSRRASLSDIGFGKLETYVKLDKLGEGTYATVFKGRSKLTENLVALKEIRLEHE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 EGAPCTAIREVSLLKNLKHANIVTLHDLIHTDRSLTLVFEYLDSDLKQYLDHCGNLMSMH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 EGAPCTAIREVSLLKNLKHANIVTLHDLIHTDRSLTLVFEYLDSDLKQYLDHCGNLMSMH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 NVKIFMFQLLRGLAYCHHRKILHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 NVKIFMFQLLRGLAYCHHRKILHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 VVTLWYRPPDVLLGSTEYSTPIDMWGVGCIHYEMATGRPLFPGSTVKEELHLIFRLLGTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 VVTLWYRPPDVLLGSTEYSTPIDMWGVGCIHYEMATGRPLFPGSTVKEELHLIFRLLGTP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 TEETWPGVTAFSEFRTYSFPCYLPQPLINHAPRLDTDGIHLLSSLLLYESKSRMSAEAAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 TEETWPGVTAFSEFRTYSFPCYLPQPLINHAPRLDTDGIHLLSSLLLYESKSRMSAEAAL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470    
pF1KB0 SHSYFRSLGERVHQLEDTASIFSLKEIQLQKDPGYRGLAFQQPGRGKNRRQSIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 SHSYFRSLGERVHQLEDTASIFSLKEIQLQKDPGYRGLAFQQPGRGKNRRQSIF
              430       440       450       460       470    

>>XP_011507904 (OMIM: 169190) PREDICTED: cyclin-dependen  (542 aa)
 initn: 3161 init1: 3161 opt: 3161  Z-score: 1236.5  bits: 238.3 E(85289): 3.9e-62
Smith-Waterman score: 3161; 100.0% identity (100.0% similar) in 474 aa overlap (1-474:69-542)

                                             10        20        30
pF1KB0                               MIMNKMKNFKRRFSLSVPRTETIEESLAEF
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ETQAAKGSGIRGPGPRTVPGAEQDPAAQSLMIMNKMKNFKRRFSLSVPRTETIEESLAEF
       40        50        60        70        80        90        

               40        50        60        70        80        90
pF1KB0 TEQFNQLHNRRNENLQLGPLGRDPPQECSTFSPTDSGEEPGQLSPGVQFQRRQNQRRFSM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TEQFNQLHNRRNENLQLGPLGRDPPQECSTFSPTDSGEEPGQLSPGVQFQRRQNQRRFSM
      100       110       120       130       140       150        

              100       110       120       130       140       150
pF1KB0 EDVSKRLSLPMDIRLPQEFLQKLQMESPDLPKPLSRMSRRASLSDIGFGKLETYVKLDKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EDVSKRLSLPMDIRLPQEFLQKLQMESPDLPKPLSRMSRRASLSDIGFGKLETYVKLDKL
      160       170       180       190       200       210        

              160       170       180       190       200       210
pF1KB0 GEGTYATVFKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKNLKHANIVTLHDLIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GEGTYATVFKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKNLKHANIVTLHDLIH
      220       230       240       250       260       270        

              220       230       240       250       260       270
pF1KB0 TDRSLTLVFEYLDSDLKQYLDHCGNLMSMHNVKIFMFQLLRGLAYCHHRKILHRDLKPQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TDRSLTLVFEYLDSDLKQYLDHCGNLMSMHNVKIFMFQLLRGLAYCHHRKILHRDLKPQN
      280       290       300       310       320       330        

              280       290       300       310       320       330
pF1KB0 LLINERGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSTEYSTPIDMWGVGCI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLINERGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSTEYSTPIDMWGVGCI
      340       350       360       370       380       390        

              340       350       360       370       380       390
pF1KB0 HYEMATGRPLFPGSTVKEELHLIFRLLGTPTEETWPGVTAFSEFRTYSFPCYLPQPLINH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HYEMATGRPLFPGSTVKEELHLIFRLLGTPTEETWPGVTAFSEFRTYSFPCYLPQPLINH
      400       410       420       430       440       450        

              400       410       420       430       440       450
pF1KB0 APRLDTDGIHLLSSLLLYESKSRMSAEAALSHSYFRSLGERVHQLEDTASIFSLKEIQLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 APRLDTDGIHLLSSLLLYESKSRMSAEAALSHSYFRSLGERVHQLEDTASIFSLKEIQLQ
      460       470       480       490       500       510        

              460       470    
pF1KB0 KDPGYRGLAFQQPGRGKNRRQSIF
       ::::::::::::::::::::::::
XP_011 KDPGYRGLAFQQPGRGKNRRQSIF
      520       530       540  

>>NP_997668 (OMIM: 169190) cyclin-dependent kinase 18 is  (504 aa)
 initn: 3147 init1: 2543 opt: 2548  Z-score: 1004.1  bits: 195.2 E(85289): 3.4e-49
Smith-Waterman score: 3091; 94.0% identity (94.0% similar) in 504 aa overlap (1-474:1-504)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MIMNKMKNFKRRFSLSVPRTETIEESLAEFTEQFNQLHNRRNENLQLGPLGRDPPQECST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 MIMNKMKNFKRRFSLSVPRTETIEESLAEFTEQFNQLHNRRNENLQLGPLGRDPPQECST
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90                              
pF1KB0 FSPTDSGEEPGQLSPGVQFQRRQNQRRFSME-----------------------------
       :::::::::::::::::::::::::::::::                             
NP_997 FSPTDSGEEPGQLSPGVQFQRRQNQRRFSMEVRASGALPRQVAGCTHKGVHRRAAALQPD
               70        80        90       100       110       120

              100       110       120       130       140       150
pF1KB0 -DVSKRLSLPMDIRLPQEFLQKLQMESPDLPKPLSRMSRRASLSDIGFGKLETYVKLDKL
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 FDVSKRLSLPMDIRLPQEFLQKLQMESPDLPKPLSRMSRRASLSDIGFGKLETYVKLDKL
              130       140       150       160       170       180

              160       170       180       190       200       210
pF1KB0 GEGTYATVFKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKNLKHANIVTLHDLIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 GEGTYATVFKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKNLKHANIVTLHDLIH
              190       200       210       220       230       240

              220       230       240       250       260       270
pF1KB0 TDRSLTLVFEYLDSDLKQYLDHCGNLMSMHNVKIFMFQLLRGLAYCHHRKILHRDLKPQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 TDRSLTLVFEYLDSDLKQYLDHCGNLMSMHNVKIFMFQLLRGLAYCHHRKILHRDLKPQN
              250       260       270       280       290       300

              280       290       300       310       320       330
pF1KB0 LLINERGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSTEYSTPIDMWGVGCI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 LLINERGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSTEYSTPIDMWGVGCI
              310       320       330       340       350       360

              340       350       360       370       380       390
pF1KB0 HYEMATGRPLFPGSTVKEELHLIFRLLGTPTEETWPGVTAFSEFRTYSFPCYLPQPLINH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 HYEMATGRPLFPGSTVKEELHLIFRLLGTPTEETWPGVTAFSEFRTYSFPCYLPQPLINH
              370       380       390       400       410       420

              400       410       420       430       440       450
pF1KB0 APRLDTDGIHLLSSLLLYESKSRMSAEAALSHSYFRSLGERVHQLEDTASIFSLKEIQLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 APRLDTDGIHLLSSLLLYESKSRMSAEAALSHSYFRSLGERVHQLEDTASIFSLKEIQLQ
              430       440       450       460       470       480

              460       470    
pF1KB0 KDPGYRGLAFQQPGRGKNRRQSIF
       ::::::::::::::::::::::::
NP_997 KDPGYRGLAFQQPGRGKNRRQSIF
              490       500    

>>XP_016856912 (OMIM: 169190) PREDICTED: cyclin-dependen  (572 aa)
 initn: 3147 init1: 2543 opt: 2548  Z-score: 1003.6  bits: 195.3 E(85289): 3.7e-49
Smith-Waterman score: 3091; 94.0% identity (94.0% similar) in 504 aa overlap (1-474:69-572)

                                             10        20        30
pF1KB0                               MIMNKMKNFKRRFSLSVPRTETIEESLAEF
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ETQAAKGSGIRGPGPRTVPGAEQDPAAQSLMIMNKMKNFKRRFSLSVPRTETIEESLAEF
       40        50        60        70        80        90        

               40        50        60        70        80        90
pF1KB0 TEQFNQLHNRRNENLQLGPLGRDPPQECSTFSPTDSGEEPGQLSPGVQFQRRQNQRRFSM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TEQFNQLHNRRNENLQLGPLGRDPPQECSTFSPTDSGEEPGQLSPGVQFQRRQNQRRFSM
      100       110       120       130       140       150        

                                            100       110       120
pF1KB0 E------------------------------DVSKRLSLPMDIRLPQEFLQKLQMESPDL
       :                              :::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EVRASGALPRQVAGCTHKGVHRRAAALQPDFDVSKRLSLPMDIRLPQEFLQKLQMESPDL
      160       170       180       190       200       210        

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 PKPLSRMSRRASLSDIGFGKLETYVKLDKLGEGTYATVFKGRSKLTENLVALKEIRLEHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PKPLSRMSRRASLSDIGFGKLETYVKLDKLGEGTYATVFKGRSKLTENLVALKEIRLEHE
      220       230       240       250       260       270        

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 EGAPCTAIREVSLLKNLKHANIVTLHDLIHTDRSLTLVFEYLDSDLKQYLDHCGNLMSMH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EGAPCTAIREVSLLKNLKHANIVTLHDLIHTDRSLTLVFEYLDSDLKQYLDHCGNLMSMH
      280       290       300       310       320       330        

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 NVKIFMFQLLRGLAYCHHRKILHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NVKIFMFQLLRGLAYCHHRKILHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNE
      340       350       360       370       380       390        

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 VVTLWYRPPDVLLGSTEYSTPIDMWGVGCIHYEMATGRPLFPGSTVKEELHLIFRLLGTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VVTLWYRPPDVLLGSTEYSTPIDMWGVGCIHYEMATGRPLFPGSTVKEELHLIFRLLGTP
      400       410       420       430       440       450        

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 TEETWPGVTAFSEFRTYSFPCYLPQPLINHAPRLDTDGIHLLSSLLLYESKSRMSAEAAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TEETWPGVTAFSEFRTYSFPCYLPQPLINHAPRLDTDGIHLLSSLLLYESKSRMSAEAAL
      460       470       480       490       500       510        

              430       440       450       460       470    
pF1KB0 SHSYFRSLGERVHQLEDTASIFSLKEIQLQKDPGYRGLAFQQPGRGKNRRQSIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SHSYFRSLGERVHQLEDTASIFSLKEIQLQKDPGYRGLAFQQPGRGKNRRQSIF
      520       530       540       550       560       570  

>>XP_016874894 (OMIM: 603440) PREDICTED: cyclin-dependen  (523 aa)
 initn: 2254 init1: 2117 opt: 2133  Z-score: 846.4  bits: 166.1 E(85289): 2.1e-40
Smith-Waterman score: 2133; 72.7% identity (90.1% similar) in 433 aa overlap (42-474:98-522)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KB0 RFSLSVPRTETIEESLAEFTEQFNQLHNRRNENLQLGPLGRDPPQECSTFSPTDSGEEPG
                                     .:::..:  :     : .  : :.: :   
XP_016 PPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDG-----ESDQASGTSSDEV--
        70        80        90       100            110       120  

              80        90       100       110       120       130 
pF1KB0 QLSPGVQFQRRQNQRRFSMEDVSKRLSLPMDIRLPQEFLQKLQMESPDLPKPLSRMSRRA
       :   :: . : . .::.::::..:::::: :::.:. .:.:::..:: . .:.:: ::::
XP_016 QSPTGVCL-RNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSRRA
               130       140       150       160       170         

             140       150       160       170       180       190 
pF1KB0 SLSDIGFGKLETYVKLDKLGEGTYATVFKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREV
       :::.:::::.:::.::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREV
     180       190       200       210       220       230         

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB0 SLLKNLKHANIVTLHDLIHTDRSLTLVFEYLDSDLKQYLDHCGNLMSMHNVKIFMFQLLR
       ::::.:::::::::::..:::.::::::::::.:::::.: :::.:::::::.:..:.::
XP_016 SLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQILR
     240       250       260       270       280       290         

             260       270       280       290       300       310 
pF1KB0 GLAYCHHRKILHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDV
       ::::::.::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDV
     300       310       320       330       340       350         

             320       330       340       350       360       370 
pF1KB0 LLGSTEYSTPIDMWGVGCIHYEMATGRPLFPGSTVKEELHLIFRLLGTPTEETWPGVTAF
       ::::.:::: ::::::::: .:::.::::::::::..::::::::::::..:::::... 
XP_016 LLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGISSN
     360       370       380       390       400       410         

             380       390       400       410       420       430 
pF1KB0 SEFRTYSFPCYLPQPLINHAPRLDTDGIHLLSSLLLYESKSRMSAEAALSHSYFRSLGER
        ::..:.:: : ::::::::::::..::.:....: ::::.:.::: :..: :::::: :
XP_016 EEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPR
     420       430       440       450       460       470         

             440       450       460       470     
pF1KB0 VHQLEDTASIFSLKEIQLQKDPGYRGLAFQQPGRGKNRRQSIF 
       .: : ...:::::::::::::::.:. .. . :.:::::::.. 
XP_016 IHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGKNRRQSMLF
     480       490       500       510       520   

>>XP_016874895 (OMIM: 603440) PREDICTED: cyclin-dependen  (523 aa)
 initn: 2254 init1: 2117 opt: 2133  Z-score: 846.4  bits: 166.1 E(85289): 2.1e-40
Smith-Waterman score: 2133; 72.7% identity (90.1% similar) in 433 aa overlap (42-474:98-522)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KB0 RFSLSVPRTETIEESLAEFTEQFNQLHNRRNENLQLGPLGRDPPQECSTFSPTDSGEEPG
                                     .:::..:  :     : .  : :.: :   
XP_016 PPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDG-----ESDQASGTSSDEV--
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>>NP_002586 (OMIM: 603440) cyclin-dependent kinase 17 is  (523 aa)
 initn: 2254 init1: 2117 opt: 2133  Z-score: 846.4  bits: 166.1 E(85289): 2.1e-40
Smith-Waterman score: 2133; 72.7% identity (90.1% similar) in 433 aa overlap (42-474:98-522)

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>>NP_001163935 (OMIM: 603440) cyclin-dependent kinase 17  (523 aa)
 initn: 2204 init1: 2067 opt: 2083  Z-score: 827.4  bits: 162.6 E(85289): 2.4e-39
Smith-Waterman score: 2083; 72.8% identity (89.8% similar) in 423 aa overlap (42-464:98-512)

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pF1KB0 LLGSTEYSTPIDMWGVGCIHYEMATGRPLFPGSTVKEELHLIFRLLGTPTEETWPGVTAF
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NP_001 LLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGISSN
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>>XP_016885060 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-dependen  (496 aa)
 initn: 1972 init1: 1972 opt: 1982  Z-score: 789.3  bits: 155.5 E(85289): 3.2e-37
Smith-Waterman score: 1982; 70.0% identity (87.3% similar) in 424 aa overlap (42-465:71-486)

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474 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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