Result of FASTA (ccds) for pF1KB0419
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB0419, 472 aa
  1>>>pF1KB0419 472 - 472 aa - 472 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6025+/-0.00111; mu= 13.5447+/- 0.067
 mean_var=163.5361+/-34.504, 0's: 0 Z-trim(108.2): 69  B-trim: 0 in 0/49
 Lambda= 0.100292
 statistics sampled from 10000 (10055) to 10000 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.658), E-opt: 0.2 (0.309), width:  16
 Scan time:  2.850

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4446.1 HNRNPH1 gene_id:3187|Hs108|chr5         ( 449) 2991 445.2 6.6e-125
CCDS14485.1 HNRNPH2 gene_id:3188|Hs108|chrX        ( 449) 2907 433.0  3e-121
CCDS7204.1 HNRNPF gene_id:3185|Hs108|chr10         ( 415) 2128 320.3 2.4e-87
CCDS7278.1 HNRNPH3 gene_id:3189|Hs108|chr10        ( 346) 1422 218.1 1.2e-56
CCDS7279.1 HNRNPH3 gene_id:3189|Hs108|chr10        ( 331)  756 121.7 1.2e-27
CCDS47069.1 GRSF1 gene_id:2926|Hs108|chr4          ( 480)  666 108.8 1.3e-23
CCDS47070.1 GRSF1 gene_id:2926|Hs108|chr4          ( 318)  592 97.9 1.6e-20


>>CCDS4446.1 HNRNPH1 gene_id:3187|Hs108|chr5              (449 aa)
 initn: 3396 init1: 2991 opt: 2991  Z-score: 2355.9  bits: 445.2 E(32554): 6.6e-125
Smith-Waterman score: 2991; 98.0% identity (98.7% similar) in 446 aa overlap (1-446:1-446)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MMLGTEGGEGFVVKVRGLPWSCSADEVQRFFSDCKIQNGAQGIRFIYTREGRPSGEAFVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MMLGTEGGEGFVVKVRGLPWSCSADEVQRFFSDCKIQNGAQGIRFIYTREGRPSGEAFVE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 LESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 GCSKEEIVQFFSGLEIVPNGITLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GCSKEEIVQFFSGLEIVPNGITLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 IEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 GGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 TENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 LNSTAGASGGAYEHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LNSTAGASGGAYEHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGY
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470  
pF1KB0 GGGYGGQSSMSGYGNQGAVNSSYYSSGSRASMGVNGMGGLSSMSSMSGGWGM
       ::::::::::::: .    ::: ..:                          
CCDS44 GGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDFQSNIA                       
              430       440                                

>>CCDS14485.1 HNRNPH2 gene_id:3188|Hs108|chrX             (449 aa)
 initn: 3296 init1: 2907 opt: 2907  Z-score: 2290.2  bits: 433.0 E(32554): 3e-121
Smith-Waterman score: 2907; 94.8% identity (98.2% similar) in 446 aa overlap (1-446:1-446)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MMLGTEGGEGFVVKVRGLPWSCSADEVQRFFSDCKIQNGAQGIRFIYTREGRPSGEAFVE
       :::.::: :::::::::::::::::::.:::::::::::..:::::::::::::::::::
CCDS14 MMLSTEGREGFVVKVRGLPWSCSADEVMRFFSDCKIQNGTSGIRFIYTREGRPSGEAFVE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 LESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPF
       ::::.::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LESEEEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNSVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 GCSKEEIVQFFSGLEIVPNGITLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRY
       ::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GCSKEEIVQFFSGLEIVPNGMTLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 IEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 GGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRA
       ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS14 GGYDDYGGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSSFQSTTGHCVHMRGLPYRA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 TENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELF
       ::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS14 TENDIYNFFSPLNPMRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMAKDKANMQHRYVELF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 LNSTAGASGGAYEHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGY
       ::::::.:::::.: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LNSTAGTSGGAYDHSYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGY
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470  
pF1KB0 GGGYGGQSSMSGYGNQGAVNSSYYSSGSRASMGVNGMGGLSSMSSMSGGWGM
       ::::::::::::: .    ::: :.:                          
CCDS14 GGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDYQSNLA                       
              430       440                                

>>CCDS7204.1 HNRNPF gene_id:3185|Hs108|chr10              (415 aa)
 initn: 2425 init1: 2104 opt: 2128  Z-score: 1681.5  bits: 320.3 E(32554): 2.4e-87
Smith-Waterman score: 2191; 74.0% identity (87.8% similar) in 434 aa overlap (1-433:1-414)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MMLGTEGGEGFVVKVRGLPWSCSADEVQRFFSDCKIQNGAQGIRFIYTREGRPSGEAFVE
       :::: :::::::::.::::::::...:: :.::: :..:: :..:::::::: :::::::
CCDS72 MMLGPEGGEGFVVKLRGLPWSCSVEDVQNFLSDCTIHDGAAGVHFIYTREGRQSGEAFVE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 LESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPF
       : :::.::.:::::::.:::::.:::::. .::::::::.:::: :.:::::::::::::
CCDS72 LGSEDDVKMALKKDRESMGHRYIEVFKSHRTEMDWVLKHSGPNSADSANDGFVRLRGLPF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 GCSKEEIVQFFSGLEIVPNGITLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRY
       ::.::::::::::::::::::::::: .:. ::::::::::::.::::: ::::::::::
CCDS72 GCTKEEIVQFFSGLEIVPNGITLPVDPEGKITGEAFVQFASQELAEKALGKHKERIGHRY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 IEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGY
       ::.::::. :::.. ::: :.:..::::::::::..: : .: . ::.:::: :::. ::
CCDS72 IEVFKSSQEEVRSYSDPPLKFMSVQRPGPYDRPGTARRYIGIVKQAGLERMRPGAYSTGY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 GGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRA
       :::..:.: .::::: .: :::::.::.::: ::::::.  : :::::::::::::::.:
CCDS72 GGYEEYSGLSDGYGFTTDLFGRDLSYCLSGMYDHRYGDSEFTVQSTTGHCVHMRGLPYKA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 TENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.:::::::.:  
CCDS72 TENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEEAVAAMSKDRANMQHRYIE--
              310       320       330       340       350          

              370       380       390       400        410         
pF1KB0 LNSTAGASGGAYEHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSN-QSSYGGPASQQLSGG
                         ::::::.:::.:::.::.: :::.:  :..:.:  ::..:: 
CCDS72 ------------------LFLNSTTGASNGAYSSQVMQGMGVSAAQATYSGLESQSVSGC
                        360       370       380       390       400

     420       430       440       450       460       470  
pF1KB0 YGGGYGGQSSMSGYGNQGAVNSSYYSSGSRASMGVNGMGGLSSMSSMSGGWGM
       ::.::.::.::.::                                       
CCDS72 YGAGYSGQNSMGGYD                                      
              410                                           

>>CCDS7278.1 HNRNPH3 gene_id:3189|Hs108|chr10             (346 aa)
 initn: 1301 init1: 618 opt: 1422  Z-score: 1130.4  bits: 218.1 E(32554): 1.2e-56
Smith-Waterman score: 1455; 62.1% identity (79.8% similar) in 372 aa overlap (93-457:1-345)

             70        80        90       100       110       120  
pF1KB0 SEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGC
                                     ::::.::.:::.   :.:: ::::::::::
CCDS72                               MDWVMKHNGPND---ASDGTVRLRGLPFGC
                                             10           20       

            130       140       150       160       170       180  
pF1KB0 SKEEIVQFFSGLEIVPNGITLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIE
       :::::::::.::::::::::: .:.::::::::::::::.::::.:: ::::::::::::
CCDS72 SKEEIVQFFQGLEIVPNGITLTMDYQGRSTGEAFVQFASKEIAENALGKHKERIGHRYIE
        30        40        50        60        70        80       

            190       200       210        220       230           
pF1KB0 IFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRG-YNSIGRGAGFERMRRGA--YGGG
       ::.:::.:..  :::::.:.. ::::::::: .::: : . :::. ..:::::.  : ::
CCDS72 IFRSSRSEIKGFYDPPRRLLG-QRPGPYDRPIGGRGGYYGAGRGSMYDRMRRGGDGYDGG
        90       100        110       120       130       140      

     240       250       260       270          280       290      
pF1KB0 YGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYG---DGGSTFQSTTGHCVHMRGL
       :::.:::.:::. ::.:.: :  :      ::. : ::   :..: :..  :: ::::::
CCDS72 YGGFDDYGGYNN-YGYGNDGFD-DRMRDGRGMGGHGYGGAGDASSGFHG--GHFVHMRGL
        150        160        170       180       190         200  

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB0 PYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRY
       :.::::::: ::::::::.::::.:: :::.::::::::.::::::::::::: ::::::
CCDS72 PFRATENDIANFFSPLNPIRVHIDIGADGRATGEADVEFVTHEDAVAAMSKDKNNMQHRY
            210       220       230       240       250       260  

        360       370       380        390       400       410     
pF1KB0 VELFLNSTAGASGGAYEHRYVELFLNSTAGASG-GAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQ
       .::::::: :  ::            :  :.:: :.:: .     :..::..::. . . 
CCDS72 IELFLNSTPG--GG------------SGMGGSGMGGYGRD-----GMDNQGGYGSVGRMG
            270                     280            290       300   

         420       430       440       450       460       470  
pF1KB0 LSGGYGGGYGGQSSMSGYGNQGAVNSSYYSSGSRASMGVNGMGGLSSMSSMSGGWGM
       ....:.::::  ....:::  :. ...::..:. .. :  ::               
CCDS72 MGNNYSGGYGTPDGLGGYGRGGGGSGGYYGQGGMSGGGWRGMY              
           310       320       330       340                    

>>CCDS7279.1 HNRNPH3 gene_id:3189|Hs108|chr10             (331 aa)
 initn: 1262 init1: 579 opt: 756  Z-score: 609.8  bits: 121.7 E(32554): 1.2e-27
Smith-Waterman score: 1372; 60.4% identity (77.5% similar) in 369 aa overlap (93-457:1-330)

             70        80        90       100       110       120  
pF1KB0 SEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGC
                                     ::::.::.:::.   :.:: ::::::::::
CCDS72                               MDWVMKHNGPND---ASDGTVRLRGLPFGC
                                             10           20       

            130       140       150       160       170       180  
pF1KB0 SKEEIVQFFSGLEIVPNGITLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIE
       :::::::::.::::::::::: .:.::::::::::::::.::::.:: ::::::::::::
CCDS72 SKEEIVQFFQGLEIVPNGITLTMDYQGRSTGEAFVQFASKEIAENALGKHKERIGHRYIE
        30        40        50        60        70        80       

            190       200       210       220       230       240  
pF1KB0 IFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGG
       ::.:::.:..  :::::.:.. ::::::::: .:::        :.     ::  :.:::
CCDS72 IFRSSRSEIKGFYDPPRRLLG-QRPGPYDRPIGGRG--------GY----YGAGRGSYGG
        90       100        110       120                   130    

            250       260       270          280       290         
pF1KB0 YDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYG---DGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYR
       .:::.:::. ::.:.: :  :      ::. : ::   :..: :..  :: :::::::.:
CCDS72 FDDYGGYNN-YGYGNDGFD-DRMRDGRGMGGHGYGGAGDASSGFHG--GHFVHMRGLPFR
          140        150        160       170         180       190

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB0 ATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVEL
       :::::: ::::::::.::::.:: :::.::::::::.::::::::::::: ::::::.::
CCDS72 ATENDIANFFSPLNPIRVHIDIGADGRATGEADVEFVTHEDAVAAMSKDKNNMQHRYIEL
              200       210       220       230       240       250

     360       370       380        390       400       410        
pF1KB0 FLNSTAGASGGAYEHRYVELFLNSTAGASG-GAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSG
       ::::: :  ::            :  :.:: :.:: .     :..::..::. . . ...
CCDS72 FLNSTPG--GG------------SGMGGSGMGGYGRD-----GMDNQGGYGSVGRMGMGN
                            260       270            280       290 

      420       430       440       450       460       470  
pF1KB0 GYGGGYGGQSSMSGYGNQGAVNSSYYSSGSRASMGVNGMGGLSSMSSMSGGWGM
       .:.::::  ....:::  :. ...::..:. .. :  ::               
CCDS72 NYSGGYGTPDGLGGYGRGGGGSGGYYGQGGMSGGGWRGMY              
             300       310       320       330               

>>CCDS47069.1 GRSF1 gene_id:2926|Hs108|chr4               (480 aa)
 initn: 981 init1: 469 opt: 666  Z-score: 537.5  bits: 108.8 E(32554): 1.3e-23
Smith-Waterman score: 921; 42.9% identity (70.9% similar) in 354 aa overlap (11-363:150-475)

                                   10        20        30        40
pF1KB0                     MMLGTEGGEGFVVKVRGLPWSCSADEVQRFFSDCKIQNGA
                                     :.....::::::. ..:  :::::.:.:: 
CCDS47 ESKTTYLEDLPPPPEYELAPSKLEEEVDDVFLIRAQGLPWSCTMEDVLNFFSDCRIRNGE
     120       130       140       150       160       170         

               50        60        70        80        90       100
pF1KB0 QGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHT
       .::.:. .:.:.  :.:..:.:::..:. ::.: :  ::.:::::.. :: ..: ..:  
CCDS47 NGIHFLLNRDGKRRGDALIEMESEQDVQKALEKHRMYMGQRYVEVYEINNEDVDALMKSL
     180       190       200       210       220       230         

              110       120       130       140       150          
pF1KB0 GPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGITLPVDFQGR-STGEAFVQF
         .:  ..::: :::::::..:....::.::.::.::   ::. .:..:: .::::.:::
CCDS47 QVKSSPVVNDGVVRLRGLPYSCNEKDIVDFFAGLNIV--DITFVMDYRGRRKTGEAYVQF
     240       250       260       270         280       290       

     160       170       180       190       200       210         
pF1KB0 ASQEIAEKALKKHKERIGHRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGY
          :.:..:: ::.:.::.:::::: : : :::::             : :     :.  
CCDS47 EEPEMANQALLKHREEIGNRYIEIFPSRRNEVRTHV------------GSYK----GK--
       300       310       320       330                           

     220       230       240       250       260       270         
pF1KB0 NSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDG
           . :.:   .  .       .....  .:   . .  :  . .  .     ..  ..
CCDS47 ----KIASFPTAKYITEPEMV--FEEHEVNEDIQPMTA--FESEKEIELPKEVPEKLPEA
         340       350         360       370         380       390 

     280       290       300       310       320       330         
pF1KB0 GSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHE
       ..   ... : :::::::..:. .:: :::.::.:::. .: . .:..::::::.: :::
CCDS47 ADFGTTSSLHFVHMRGLPFQANAQDIINFFAPLKPVRITMEYSSSGKATGEADVHFETHE
             400       410       420       430       440       450 

     340       350       360       370       380       390         
pF1KB0 DAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGASGGAYEHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGG
       :::::: ::.....:::.::::::                                    
CCDS47 DAVAAMLKDRSHVHHRYIELFLNSCPKGK                               
             460       470       480                               

>>CCDS47070.1 GRSF1 gene_id:2926|Hs108|chr4               (318 aa)
 initn: 907 init1: 395 opt: 592  Z-score: 481.7  bits: 97.9 E(32554): 1.6e-20
Smith-Waterman score: 847; 42.4% identity (70.0% similar) in 340 aa overlap (25-363:2-313)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MMLGTEGGEGFVVKVRGLPWSCSADEVQRFFSDCKIQNGAQGIRFIYTREGRPSGEAFVE
                               ..:  :::::.:.:: .::.:. .:.:.  :.:..:
CCDS47                        MEDVLNFFSDCRIRNGENGIHFLLNRDGKRRGDALIE
                                      10        20        30       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 LESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPF
       .:::..:. ::.: :  ::.:::::.. :: ..: ..:    .:  ..::: :::::::.
CCDS47 MESEQDVQKALEKHRMYMGQRYVEVYEINNEDVDALMKSLQVKSSPVVNDGVVRLRGLPY
        40        50        60        70        80        90       

              130       140       150        160       170         
pF1KB0 GCSKEEIVQFFSGLEIVPNGITLPVDFQGR-STGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHR
       .:....::.::.::.::   ::. .:..:: .::::.:::   :.:..:: ::.:.::.:
CCDS47 SCNEKDIVDFFAGLNIV--DITFVMDYRGRRKTGEAYVQFEEPEMANQALLKHREEIGNR
       100       110         120       130       140       150     

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB0 YIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGG
       ::::: : : :::::                   :. .:     . :.:   .  .    
CCDS47 YIEIFPSRRNEVRTHV------------------GSYKGK----KIASFPTAKYITEPEM
         160       170                             180       190   

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB0 YGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYR
          .....  .:   . .  :  . .  .     ..  ....   ... : :::::::..
CCDS47 V--FEEHEVNEDIQPMTA--FESEKEIELPKEVPEKLPEAADFGTTSSLHFVHMRGLPFQ
             200         210       220       230       240         

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB0 ATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVEL
       :. .:: :::.::.:::. .: . .:..::::::.: ::::::::: ::.....:::.::
CCDS47 ANAQDIINFFAPLKPVRITMEYSSSGKATGEADVHFETHEDAVAAMLKDRSHVHHRYIEL
     250       260       270       280       290       300         

     360       370       380       390       400       410         
pF1KB0 FLNSTAGASGGAYEHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGG
       ::::                                                        
CCDS47 FLNSCPKGK                                                   
     310                                                           




472 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 16:48:44 2016 done: Sat Nov  5 16:48:44 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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