Result of FASTA (ccds) for pF1KB7994
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7994, 447 aa
  1>>>pF1KB7994 447 - 447 aa - 447 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8519+/-0.000906; mu= 5.6746+/- 0.055
 mean_var=123.9510+/-26.157, 0's: 0 Z-trim(109.6): 29  B-trim: 3 in 1/51
 Lambda= 0.115199
 statistics sampled from 10966 (10994) to 10966 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.703), E-opt: 0.2 (0.338), width:  16
 Scan time:  3.340

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS43568.1 TBX20 gene_id:57057|Hs108|chr7         ( 447) 2952 501.7 6.1e-142
CCDS34495.1 TBX18 gene_id:9096|Hs108|chr6          ( 607)  947 168.5 1.6e-41
CCDS30816.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1          ( 496)  930 165.7 9.6e-41
CCDS81360.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1          ( 602)  931 165.9   1e-40
CCDS13767.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22          ( 495)  870 155.7 9.7e-38
CCDS13765.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22          ( 372)  858 153.7   3e-37
CCDS13766.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22          ( 398)  856 153.3   4e-37
CCDS14445.1 TBX22 gene_id:50945|Hs108|chrX         ( 520)  851 152.6   9e-37
CCDS31621.1 TBX10 gene_id:347853|Hs108|chr11       ( 385)  839 150.5 2.7e-36
CCDS9175.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12           ( 723)  834 149.8 8.6e-36
CCDS9173.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12           ( 518)  828 148.7 1.3e-35
CCDS9174.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12           ( 468)  819 147.2 3.3e-35
CCDS11627.2 TBX2 gene_id:6909|Hs108|chr17          ( 712)  821 147.6 3.8e-35
CCDS10670.1 TBX6 gene_id:6911|Hs108|chr16          ( 436)  808 145.4 1.1e-34
CCDS11629.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17          ( 545)  804 144.8 2.1e-34
CCDS82180.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17          ( 546)  804 144.8 2.1e-34
CCDS55960.1 MGA gene_id:23269|Hs108|chr15          (2856)  651 119.6 4.3e-26
CCDS55959.1 MGA gene_id:23269|Hs108|chr15          (3065)  651 119.6 4.6e-26
CCDS2646.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3           ( 686)  605 111.7 2.4e-24
CCDS33310.1 TBR1 gene_id:10716|Hs108|chr2          ( 682)  583 108.1   3e-23
CCDS11514.1 TBX21 gene_id:30009|Hs108|chr17        ( 535)  573 106.4 7.5e-23
CCDS63585.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3          ( 705)  567 105.4 1.9e-22
CCDS9176.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12           ( 743)  529 99.1 1.6e-20
CCDS59045.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6              ( 377)  498 93.8 3.1e-19
CCDS5290.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6               ( 435)  479 90.7 3.1e-18
CCDS63584.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3          ( 410)  463 88.0 1.9e-17
CCDS1272.1 TBX19 gene_id:9095|Hs108|chr1           ( 448)  453 86.4 6.4e-17


>>CCDS43568.1 TBX20 gene_id:57057|Hs108|chr7              (447 aa)
 initn: 2952 init1: 2952 opt: 2952  Z-score: 2661.8  bits: 501.7 E(32554): 6.1e-142
Smith-Waterman score: 2952; 100.0% identity (100.0% similar) in 447 aa overlap (1-447:1-447)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MEFTASPKPQLSSRANAFSIAALMSSGGSKEKEATENTIKPLEQFVEKSSCAQPLGELTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MEFTASPKPQLSSRANAFSIAALMSSGGSKEKEATENTIKPLEQFVEKSSCAQPLGELTS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 LDAHGEFGGGSGSSPSSSSLCTEPLIPTTPIIPSEEMAKIACSLETKELWDKFHELGTEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LDAHGEFGGGSGSSPSSSSLCTEPLIPTTPIIPSEEMAKIACSLETKELWDKFHELGTEM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 IITKSGRRMFPTIRVSFSGVDPEAKYIVLMDIVPVDNKRYRYAYHRSSWLVAGKADPPLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IITKSGRRMFPTIRVSFSGVDPEAKYIVLMDIVPVDNKRYRYAYHRSSWLVAGKADPPLP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 ARLYVHPDSPFTGEQLLKQMVSFEKVKLTNNELDQHGHIILNSMHKYQPRVHIIKKKDHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ARLYVHPDSPFTGEQLLKQMVSFEKVKLTNNELDQHGHIILNSMHKYQPRVHIIKKKDHT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 ASLLNLKSEEFRTFIFPETVFTAVTAYQNQLITKLKIDSNPFAKGFRDSSRLTDIERESV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ASLLNLKSEEFRTFIFPETVFTAVTAYQNQLITKLKIDSNPFAKGFRDSSRLTDIERESV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 ESLIQKHSYARSPIRTYGGEEDVLGDESQTTPNRGSAFTTSDNLSLSSWVSSSSSFPGFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ESLIQKHSYARSPIRTYGGEEDVLGDESQTTPNRGSAFTTSDNLSLSSWVSSSSSFPGFQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 HPQSLTALGTSTASIATPIPHPIQGSLPPYSRLGMPLTPSAIASSMQGSGPTFPSFHMPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HPQSLTALGTSTASIATPIPHPIQGSLPPYSRLGMPLTPSAIASSMQGSGPTFPSFHMPR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       
pF1KB7 YHHYFQQGPYAAIQGLRHSSAVMTPFV
       :::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YHHYFQQGPYAAIQGLRHSSAVMTPFV
              430       440       

>>CCDS34495.1 TBX18 gene_id:9096|Hs108|chr6               (607 aa)
 initn: 927 init1: 680 opt: 947  Z-score: 858.8  bits: 168.5 E(32554): 1.6e-41
Smith-Waterman score: 961; 46.9% identity (70.5% similar) in 369 aa overlap (69-421:115-457)

       40        50        60        70        80        90        
pF1KB7 IKPLEQFVEKSSCAQPLGELTSLDAHGEFGGGSGSSPSSSSLCTEPLIPTTPIIPSEEMA
                                     ::: ..  . ::      : ::. :: .  
CCDS34 PARSGADLERGAAGGCEDGFQQGASPLASPGGSPKGSPARSLAR----PGTPL-PSPQAP
           90       100       110       120           130          

      100       110       120       130       140       150        
pF1KB7 KIACSLETKELWDKFHELGTEMIITKSGRRMFPTIRVSFSGVDPEAKYIVLMDIVPVDNK
       ..  .:.  ::: .:::.::::::::.::::::..::..::.::. .: . :::::::::
CCDS34 RV--DLQGAELWKRFHEIGTEMIITKAGRRMFPAMRVKISGLDPHQQYYIAMDIVPVDNK
     140         150       160       170       180       190       

      160       170       180       190       200       210        
pF1KB7 RYRYAYHRSSWLVAGKADPPLPARLYVHPDSPFTGEQLLKQMVSFEKVKLTNNELDQHGH
       ::::.:: :.:.:::.:: :.: :.:.::::: .::  ..:..::.:.::::::::..::
CCDS34 RYRYVYHSSKWMVAGNADSPVPPRVYIHPDSPASGETWMRQVISFDKLKLTNNELDDQGH
       200       210       220       230       240       250       

      220       230         240       250        260       270     
pF1KB7 IILNSMHKYQPRVHIIKKK--DHTASLLNLKSEE-FRTFIFPETVFTAVTAYQNQLITKL
       :::.::::::::::.:.:   :  . .  . : :  ..: :::::::.::::::: ::.:
CCDS34 IILHSMHKYQPRVHVIRKDCGDDLSPIKPVPSGEGVKAFSFPETVFTTVTAYQNQQITRL
       260       270       280       290       300       310       

         280       290       300       310       320       330     
pF1KB7 KIDSNPFAKGFRDSSRLTDIERESVESLIQKHSYARSPIRTYGGEEDVLGDESQTTPNRG
       ::: ::::::::::.:    .: ..:.:...... :  .::    ::. :      :..:
CCDS34 KIDRNPFAKGFRDSGR----NRMGLEALVESYAFWRPSLRTLT-FEDIPG-----IPKQG
       320       330           340       350        360            

         340       350       360       370        380          390 
pF1KB7 SAFTTSDNLSLSSWVSSSSSFPGFQHPQSLTALGTSTASIATPI-PHPIQ-GSLPP--YS
       .: ..:  :.     ..... :.  ::. :.  :.: .: :  . :.  :  :: :  ::
CCDS34 NA-SSSTLLQ-----GTGNGVPA-THPHLLS--GSSCSSPAFHLGPNTSQLCSLAPADYS
        370            380        390         400       410        

                  400           410       420       430       440  
pF1KB7 ---RLGMPLT--PSAIASSMQ----GSGPTFPSFHMPRYHHYFQQGPYAAIQGLRHSSAV
          : :. :.   ...: ...     .: ::   . : :                     
CCDS34 ACARSGLTLNRYSTSLAETYNRLTNQAGETFAPPRTPSYVGVSSSTSVNMSMGGTDGDTF
      420       430       440       450       460       470        

                                                                   
pF1KB7 MTPFV                                                       
                                                                   
CCDS34 SCPQTSLSMQISGMSPQLQYIMPSPSSNAFATNQTHQGSYNTFRLHSPCALYGYNFSTSP
      480       490       500       510       520       530        

>>CCDS30816.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1               (496 aa)
 initn: 846 init1: 646 opt: 930  Z-score: 844.9  bits: 165.7 E(32554): 9.6e-41
Smith-Waterman score: 930; 45.5% identity (68.9% similar) in 354 aa overlap (97-436:4-344)

         70        80        90       100       110       120      
pF1KB7 FGGGSGSSPSSSSLCTEPLIPTTPIIPSEEMAKIACSLETKELWDKFHELGTEMIITKSG
                                     : .:   :.  .:: .::..::::::::.:
CCDS30                            MSSMEEIQVELQCADLWKRFHDIGTEMIITKAG
                                          10        20        30   

        130       140       150       160       170       180      
pF1KB7 RRMFPTIRVSFSGVDPEAKYIVLMDIVPVDNKRYRYAYHRSSWLVAGKADPPLPARLYVH
       :::::..::...:.::. .: . :::::::::::::.:: :.:.:::.:: :.: :.:.:
CCDS30 RRMFPAMRVKITGLDPHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYHSSKWMVAGNADSPVPPRVYIH
            40        50        60        70        80        90   

        190       200       210       220       230       240      
pF1KB7 PDSPFTGEQLLKQMVSFEKVKLTNNELDQHGHIILNSMHKYQPRVHIIKKKDHTASLLNL
       :::  .:.  ..:.:::.:.::::::::..:::::.::::::::::.:.: : ...:   
CCDS30 PDSLASGDTWMRQVVSFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKYQPRVHVIRK-DFSSDLSPT
           100       110       120       130       140        150  

            250       260       270       280       290       300  
pF1KB7 K----SEEFRTFIFPETVFTAVTAYQNQLITKLKIDSNPFAKGFRDSSRLTDIERESVES
       :    ..  .:: :::::::.::::::: ::.:::: ::::::::::.:    .: ..:.
CCDS30 KPVPVGDGVKTFNFPETVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNPFAKGFRDSGR----NRTGLEA
            160       170       180       190       200            

            310       320            330       340       350       
pF1KB7 LIQKHSYARSPIRTYGGEEDVL-----GDESQTTPNRGSAFTTSDNLSLSSWVSSSSSFP
       ... ... : :.::   :. .      :  . :.:. .:. : : . : :  .: : : :
CCDS30 IMETYAFWRPPVRTLTFEDFTTMQKQQGGSTGTSPTTSSTGTPSPSAS-SHLLSPSCSPP
      210       220       230       240       250        260       

       360       370       380       390       400            410  
pF1KB7 GFQHPQSLTALGTSTASIATPIPHPIQGSLPPYSRLGMPLTPSAIASSMQG-----SGPT
        :.   .   .:   ...     .   .. :: .: .:    :  . : .:     :: :
CCDS30 TFHLAPNTFNVGCRESQLC----NLNLSDYPPCARSNMAALQSYPGLSDSGYNRLQSGTT
       270       280           290       300       310       320   

            420       430       440                                
pF1KB7 FPSFHMPRYHHYFQQGPYAAIQGLRHSSAVMTPFV                         
         :  .:    . :. : . :.:.                                    
CCDS30 --SATQPSETFMPQRTP-SLISGIPTPPSLPGNSKMEAYGGQLGSFPTSQFQYVMQAGNA
             330        340       350       360       370       380

>>CCDS81360.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1               (602 aa)
 initn: 935 init1: 646 opt: 931  Z-score: 844.5  bits: 165.9 E(32554): 1e-40
Smith-Waterman score: 1008; 42.2% identity (65.1% similar) in 455 aa overlap (11-436:11-450)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MEFTASPKPQLSSRANAFSIAALMSSGGSKEKEATENTIKPLEQFVEKSSCAQPLGELTS
                 :::::.:::. ::.  :..:...  .   : :.  .:  : : :::.  .
CCDS81 MSERRRSAVALSSRAHAFSVEALI--GSNKKRKLRDWEEKGLDLSMEALSPAGPLGDTED
               10        20          30        40        50        

                      70            80        90           100     
pF1KB7 LDAHG-------EFGGGSGSSP----SSSSLCTEPLIPTTPI--IPSE--EMAKIACSLE
         :::       : . :: :      .: :. :.  . .     .:.    : .:   :.
CCDS81 AAAHGLEPHPDSEQSTGSDSEVLTERTSCSFSTHTDLASGAAGPVPAAMSSMEEIQVELQ
       60        70        80        90       100       110        

         110       120       130       140       150       160     
pF1KB7 TKELWDKFHELGTEMIITKSGRRMFPTIRVSFSGVDPEAKYIVLMDIVPVDNKRYRYAYH
         .:: .::..::::::::.::::::..::...:.::. .: . :::::::::::::.::
CCDS81 CADLWKRFHDIGTEMIITKAGRRMFPAMRVKITGLDPHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYH
      120       130       140       150       160       170        

         170       180       190       200       210       220     
pF1KB7 RSSWLVAGKADPPLPARLYVHPDSPFTGEQLLKQMVSFEKVKLTNNELDQHGHIILNSMH
        :.:.:::.:: :.: :.:.::::  .:.  ..:.:::.:.::::::::..:::::.:::
CCDS81 SSKWMVAGNADSPVPPRVYIHPDSLASGDTWMRQVVSFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMH
      180       190       200       210       220       230        

         230       240           250       260       270       280 
pF1KB7 KYQPRVHIIKKKDHTASLLNLK----SEEFRTFIFPETVFTAVTAYQNQLITKLKIDSNP
       :::::::.:.: : ...:   :    ..  .:: :::::::.::::::: ::.:::: ::
CCDS81 KYQPRVHVIRK-DFSSDLSPTKPVPVGDGVKTFNFPETVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNP
      240        250       260       270       280       290       

             290       300       310       320            330      
pF1KB7 FAKGFRDSSRLTDIERESVESLIQKHSYARSPIRTYGGEEDVL-----GDESQTTPNRGS
       ::::::::.:    .: ..:.... ... : :.::   :. .      :  . :.:. .:
CCDS81 FAKGFRDSGR----NRTGLEAIMETYAFWRPPVRTLTFEDFTTMQKQQGGSTGTSPTTSS
       300           310       320       330       340       350   

        340       350       360       370       380       390      
pF1KB7 AFTTSDNLSLSSWVSSSSSFPGFQHPQSLTALGTSTASIATPIPHPIQGSLPPYSRLGMP
       . : : . : :  .: : : : :.   .   .:   ...     .   .. :: .: .: 
CCDS81 TGTPSPSAS-SHLLSPSCSPPTFHLAPNTFNVGCRESQLC----NLNLSDYPPCARSNMA
           360        370       380       390           400        

        400            410       420       430       440           
pF1KB7 LTPSAIASSMQG-----SGPTFPSFHMPRYHHYFQQGPYAAIQGLRHSSAVMTPFV    
          :  . : .:     :: :  :  .:    . :. : . :.:.               
CCDS81 ALQSYPGLSDSGYNRLQSGTT--SATQPSETFMPQRTP-SLISGIPTPPSLPGNSKMEAY
      410       420         430       440        450       460     

CCDS81 GGQLGSFPTSQFQYVMQAGNAASSSSSPHMFGGSHMQQSSYNAFSLHNPYNLYGYNFPTS
         470       480       490       500       510       520     

>>CCDS13767.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22               (495 aa)
 initn: 838 init1: 652 opt: 870  Z-score: 791.0  bits: 155.7 E(32554): 9.7e-38
Smith-Waterman score: 880; 39.0% identity (59.5% similar) in 464 aa overlap (1-437:10-442)

                         10        20        30        40        50
pF1KB7          ME-FTASPKPQLSSRANAFSIAALMSSGGSKEKEATENTIKPLEQFVEKSS
                :: ::::   .:.. :..:  ::   : :.      :    : .   .  .
CCDS13 MHFSTVTRDMEAFTASSLSSLGA-AGGFPGAA---SPGADPYGPREPPPPPPR--YDPCA
               10        20         30           40          50    

               60         70        80                90       100 
pF1KB7 CAQPLGELTSLDAHG-EFGGGSGSSPSSSSLCTEPLIP--------TTPIIPSEEMAKIA
        : : .       :.  :. ..:.. :...   ::  :         .:.  . ..: ..
CCDS13 AAAPGAPGPPPPPHAYPFAPAAGAATSAAA---EPEGPGASCAAAAKAPVKKNAKVAGVS
           60        70        80           90       100       110 

             110       120       130       140       150       160 
pF1KB7 CSLETKELWDKFHELGTEMIITKSGRRMFPTIRVSFSGVDPEAKYIVLMDIVPVDNKRYR
        .:: : :::.:..::::::.::.:::::::..:.. :.:: : :..:::.::::.::::
CCDS13 VQLEMKALWDEFNQLGTEMIVTKAGRRMFPTFQVKLFGMDPMADYMLLMDFVPVDDKRYR
             120       130       140       150       160       170 

             170       180       190       200       210       220 
pF1KB7 YAYHRSSWLVAGKADPPLPARLYVHPDSPFTGEQLLKQMVSFEKVKLTNNELDQHGHIIL
       ::.: :::::::::::  :.:.. :::::  : : .::.:::.:.::::: ::..:::::
CCDS13 YAFHSSSWLVAGKADPATPGRVHYHPDSPAKGAQWMKQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIIL
             180       190       200       210       220       230 

             230       240       250       260       270       280 
pF1KB7 NSMHKYQPRVHIIKKKDHTASLLNLKSEEFRTFIFPETVFTAVTAYQNQLITKLKIDSNP
       ::::.:::: :..   :   .  .   :.:.::.: :: :::::::::. ::.::: :::
CCDS13 NSMHRYQPRFHVVYV-DPRKDSEKYAEENFKTFVFEETRFTAVTAYQNHRITQLKIASNP
             240        250       260       270       280       290

             290         300       310           320       330     
pF1KB7 FAKGFRDSS--RLTDIERESVESLIQKHSYARSPIRT----YGGEEDVLGDESQTTPNRG
       ::::::: .       .: ..  :..  . .:.:. .     : :.:.   . .   . :
CCDS13 FAKGFRDCDPEDWPRNHRPGALPLMSAFARSRNPVASPTQPSGTEKDAAEARREFQRDAG
              300       310       320       330       340       350

         340       350       360       370       380        390    
pF1KB7 SAFTTSDNLSLSSWVSSSSSFPGFQHPQSLTALGTSTASIATPIPHPIQGSLP-PYSRLG
       .  . .:              :.  :: .: :    . : . :      : .: : .  :
CCDS13 GPAVLGD--------------PA--HPPQLLA---RVLSPSLPGAGGAGGLVPLPGAPGG
                              360          370       380       390 

          400       410       420                 430       440    
pF1KB7 MPLTPSAIASSMQGSGPTFPSFHMPR------YHHYF----QQGPYAAIQGLRHSSAVMT
        : .:      ... : . :  : :       : ::.    . .::  . :::       
CCDS13 RP-SPPNPELRLEAPGASEPLHHHPYKYPAAAYDHYLGAKSRPAPYP-LPGLRGHGYHPH
              400       410       420       430        440         

                                                     
pF1KB7 PFV                                           
                                                     
CCDS13 AHPHHHHHPVSPAAAAAAAAAAAAAAANMYSSAGAAPPGSYDYCPR
     450       460       470       480       490     

>>CCDS13765.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22               (372 aa)
 initn: 838 init1: 652 opt: 858  Z-score: 782.3  bits: 153.7 E(32554): 3e-37
Smith-Waterman score: 858; 44.5% identity (66.4% similar) in 348 aa overlap (1-332:10-347)

                         10        20        30        40        50
pF1KB7          ME-FTASPKPQLSSRANAFSIAALMSSGGSKEKEATENTIKPLEQFVEKSS
                :: ::::   .:.. :..:  ::   : :.      :    : .   .  .
CCDS13 MHFSTVTRDMEAFTASSLSSLGA-AGGFPGAA---SPGADPYGPREPPPPPPRY--DPCA
               10        20         30           40        50      

               60         70        80                90       100 
pF1KB7 CAQPLGELTSLDAHG-EFGGGSGSSPSSSSLCTEPLIP--------TTPIIPSEEMAKIA
        : : .       :.  :. ..:.. :...   ::  :         .:.  . ..: ..
CCDS13 AAAPGAPGPPPPPHAYPFAPAAGAATSAAA---EPEGPGASCAAAAKAPVKKNAKVAGVS
           60        70        80           90       100       110 

             110       120       130       140       150       160 
pF1KB7 CSLETKELWDKFHELGTEMIITKSGRRMFPTIRVSFSGVDPEAKYIVLMDIVPVDNKRYR
        .:: : :::.:..::::::.::.:::::::..:.. :.:: : :..:::.::::.::::
CCDS13 VQLEMKALWDEFNQLGTEMIVTKAGRRMFPTFQVKLFGMDPMADYMLLMDFVPVDDKRYR
             120       130       140       150       160       170 

             170       180       190       200       210       220 
pF1KB7 YAYHRSSWLVAGKADPPLPARLYVHPDSPFTGEQLLKQMVSFEKVKLTNNELDQHGHIIL
       ::.: :::::::::::  :.:.. :::::  : : .::.:::.:.::::: ::..:::::
CCDS13 YAFHSSSWLVAGKADPATPGRVHYHPDSPAKGAQWMKQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIIL
             180       190       200       210       220       230 

             230       240       250       260       270       280 
pF1KB7 NSMHKYQPRVHIIKKKDHTASLLNLKSEEFRTFIFPETVFTAVTAYQNQLITKLKIDSNP
       ::::.:::: :..   :   .  .   :.:.::.: :: :::::::::. ::.::: :::
CCDS13 NSMHRYQPRFHVVYV-DPRKDSEKYAEENFKTFVFEETRFTAVTAYQNHRITQLKIASNP
             240        250       260       270       280       290

             290         300       310           320       330     
pF1KB7 FAKGFRDSS--RLTDIERESVESLIQKHSYARSPIRT----YGGEEDVLGDESQTTPNRG
       ::::::: .       .: ..  :..  . .:.:. .     : :. .. . :   :   
CCDS13 FAKGFRDCDPEDWPRNHRPGALPLMSAFARSRNPVASPTQPSGTEKGLVTEGSGLQPGLL
              300       310       320       330       340       350

         340       350       360       370       380       390     
pF1KB7 SAFTTSDNLSLSSWVSSSSSFPGFQHPQSLTALGTSTASIATPIPHPIQGSLPPYSRLGM
                                                                   
CCDS13 DVLLKPPSKKSESLRPPHCKDT                                      
              360       370                                        

>>CCDS13766.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22               (398 aa)
 initn: 857 init1: 671 opt: 856  Z-score: 780.0  bits: 153.3 E(32554): 4e-37
Smith-Waterman score: 862; 44.1% identity (66.5% similar) in 358 aa overlap (1-334:10-357)

                         10        20        30        40        50
pF1KB7          ME-FTASPKPQLSSRANAFSIAALMSSGGSKEKEATENTIKPLEQFVEKSS
                :: ::::   .:.. :..:  ::   : :.      :    : .   .  .
CCDS13 MHFSTVTRDMEAFTASSLSSLGA-AGGFPGAA---SPGADPYGPREPPPPPPRY--DPCA
               10        20         30           40        50      

               60         70        80                90       100 
pF1KB7 CAQPLGELTSLDAHG-EFGGGSGSSPSSSSLCTEPLIP--------TTPIIPSEEMAKIA
        : : .       :.  :. ..:.. :...   ::  :         .:.  . ..: ..
CCDS13 AAAPGAPGPPPPPHAYPFAPAAGAATSAAA---EPEGPGASCAAAAKAPVKKNAKVAGVS
           60        70        80           90       100       110 

             110       120       130       140       150       160 
pF1KB7 CSLETKELWDKFHELGTEMIITKSGRRMFPTIRVSFSGVDPEAKYIVLMDIVPVDNKRYR
        .:: : :::.:..::::::.::.:::::::..:.. :.:: : :..:::.::::.::::
CCDS13 VQLEMKALWDEFNQLGTEMIVTKAGRRMFPTFQVKLFGMDPMADYMLLMDFVPVDDKRYR
             120       130       140       150       160       170 

             170       180       190       200       210       220 
pF1KB7 YAYHRSSWLVAGKADPPLPARLYVHPDSPFTGEQLLKQMVSFEKVKLTNNELDQHGHIIL
       ::.: :::::::::::  :.:.. :::::  : : .::.:::.:.::::: ::..:::::
CCDS13 YAFHSSSWLVAGKADPATPGRVHYHPDSPAKGAQWMKQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIIL
             180       190       200       210       220       230 

             230       240       250       260       270       280 
pF1KB7 NSMHKYQPRVHIIKKKDHTASLLNLKSEEFRTFIFPETVFTAVTAYQNQLITKLKIDSNP
       ::::.:::: :..   :   .  .   :.:.::.: :: :::::::::. ::.::: :::
CCDS13 NSMHRYQPRFHVVYV-DPRKDSEKYAEENFKTFVFEETRFTAVTAYQNHRITQLKIASNP
             240        250       260       270       280       290

             290         300       310                   320       
pF1KB7 FAKGFRDSS--RLTDIERESVESLIQKHSYARSPIRT--------YGG----EEDVLGDE
       ::::::: .       .: ..  :..  . .:.:. .         ::    ...: .. 
CCDS13 FAKGFRDCDPEDWPRNHRPGALPLMSAFARSRNPVASPTQPSGTEKGGHVLKDKEVKAET
              300       310       320       330       340       350

       330       340       350       360       370       380       
pF1KB7 SQTTPNRGSAFTTSDNLSLSSWVSSSSSFPGFQHPQSLTALGTSTASIATPIPHPIQGSL
       :..::.:                                                     
CCDS13 SRNTPEREVELLRDAGGCVNLGLPCPAECQPFNTQGLVAGRTAGDRLC            
              360       370       380       390                    

>>CCDS14445.1 TBX22 gene_id:50945|Hs108|chrX              (520 aa)
 initn: 799 init1: 349 opt: 851  Z-score: 773.6  bits: 152.6 E(32554): 9e-37
Smith-Waterman score: 851; 40.5% identity (65.1% similar) in 410 aa overlap (11-405:3-397)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MEFTASPKPQLSSRANAFSIAALMSSGGSKEKEATENTIKPLEQFVEKSSCAQPLGELTS
                 ::::: :::. ::.   :   :.  .. :.  .  ..... ..   :  :
CCDS14         MALSSRARAFSVEALV---GRPSKRKLQDPIQAEQPELREKKGGEEEEERRS
                       10           20        30        40         

                    70        80         90       100       110    
pF1KB7 LDAHG-----EFGGGSGSSPSSSSLC-TEPLIPTTPIIPSEEMAKIACSLETKELWDKFH
        .: :     :    .  : :.:: : ..    ..    : :   :   :. .::: .::
CCDS14 -SAAGKSEPLEKQPKTEPSTSASSGCGSDSGYGNSS--ESLEEKDIQMELQGSELWKRFH
       50        60        70        80          90       100      

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB7 ELGTEMIITKSGRRMFPTIRVSFSGVDPEAKYIVLMDIVPVDNKRYRYAYHRSSWLVAGK
       ..::::::::.::::::..::. .:.::  .: : .:.::::.:::::.:: :.:.:::.
CCDS14 DIGTEMIITKAGRRMFPSVRVKVKGLDPGKQYHVAIDVVPVDSKRYRYVYHSSQWMVAGN
        110       120       130       140       150       160      

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB7 ADP--PLPARLYVHPDSPFTGEQLLKQMVSFEKVKLTNNELDQHGHIILNSMHKYQPRVH
       .:    .: :.::::::: .::  ..:..::...::::::.:..:::::.:::::.::::
CCDS14 TDHLCIIP-RFYVHPDSPCSGETWMRQIISFDRMKLTNNEMDDKGHIILQSMHKYKPRVH
        170        180       190       200       210       220     

            240         250       260       270       280       290
pF1KB7 IIKKKDHT--ASLLNLKSEEFRTFIFPETVFTAVTAYQNQLITKLKIDSNPFAKGFRDSS
       .:.. . .  ... .: .:  .:: : :: ::.::::::: ::::::. :::::::::..
CCDS14 VIEQGSSVDLSQIQSLPTEGVKTFSFKETEFTTVTAYQNQQITKLKIERNPFAKGFRDTG
         230       240       250       260       270       280     

              300       310       320       330       340       350
pF1KB7 RLTDIERESVESLIQKHSYARSPIRTYGGEEDVLGDESQTTPNRGSAFTTSDNLSLSSWV
       :   .    .:.   . :.. . ..:.:.  :. .  : ..:  .:. . :    :.: .
CCDS14 RNRGVLDGLLETYPWRPSFTLD-FKTFGA--DTQSGSSGSSPVTSSGGAPSP---LNSLL
         290       300        310         320       330            

              360       370        380       390           400     
pF1KB7 SSSSSFPGFQHPQSLTALGTSTASIATP-IPHPIQGSLPPYSRLGM-PLT---PSAIASS
       :     : :. : :  .::        : .  :.  .. : .   . ::.   :  .:::
CCDS14 SPLCFSPMFHLPTS--SLGMPCPEAYLPNVNLPLCYKICPTNFWQQQPLVLPAPERLASS
     340       350         360       370       380       390       

         410       420       430       440                         
pF1KB7 MQGSGPTFPSFHMPRYHHYFQQGPYAAIQGLRHSSAVMTPFV                  
                                                                   
CCDS14 NSSQSLAPLMMEVPMLSSLGVTNSKSGSSEDSSDQYLQAPNSTNQMLYGLQSPGNIFLPN
       400       410       420       430       440       450       

>>CCDS31621.1 TBX10 gene_id:347853|Hs108|chr11            (385 aa)
 initn: 811 init1: 624 opt: 839  Z-score: 765.0  bits: 150.5 E(32554): 2.7e-36
Smith-Waterman score: 847; 41.4% identity (65.2% similar) in 374 aa overlap (50-402:15-376)

      20        30        40        50        60        70         
pF1KB7 IAALMSSGGSKEKEATENTIKPLEQFVEKSSCAQPLGELTSLDAHGEFGGGSGSSPSSSS
                                     : . ::   ::   . ..:.   :.: .::
CCDS31                 MAAFLSAGLGILAPSETYPL-PTTSSGWEPRLGSPFPSGPCTSS
                               10        20         30        40   

      80        90        100       110       120       130        
pF1KB7 LCTEPLIPTTPIIPSE-EMAKIACSLETKELWDKFHELGTEMIITKSGRRMFPTIRVSFS
         .. .   :   :.. ...... .:: : ::..:..::::::.::.:::::: ..:.. 
CCDS31 TGAQAVAEPTGQGPKNPRVSRVTVQLEMKPLWEEFNQLGTEMIVTKAGRRMFPPFQVKIL
            50        60        70        80        90       100   

      140       150       160       170       180       190        
pF1KB7 GVDPEAKYIVLMDIVPVDNKRYRYAYHRSSWLVAGKADPPLPARLYVHPDSPFTGEQLLK
       :.:  : : .:::..:.:.::::::.: :.:::::::::  :.:.. :::::  : : ..
CCDS31 GMDSLADYALLMDFIPLDDKRYRYAFHSSAWLVAGKADPATPGRVHFHPDSPAKGAQWMR
           110       120       130       140       150       160   

      200       210       220       230          240       250     
pF1KB7 QMVSFEKVKLTNNELDQHGHIILNSMHKYQPRVHII---KKKDHTASLLNLKSEEFRTFI
       :.:::.:.::::: ::..:::::::::.:::: :..    .::         .:.:..::
CCDS31 QIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRFHVVFVDPRKDSE----RYAQENFKSFI
           170       180       190       200           210         

         260       270       280       290        300       310    
pF1KB7 FPETVFTAVTAYQNQLITKLKIDSNPFAKGFRDSSRLT-DIERESVESLIQKHSYARSPI
       : :: :::::::::. ::.::: :::::::::.:.  .  .  . . :.  .   . :: 
CCDS31 FTETQFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRESDLDSWPVAPRPLLSVPARSHSSLSPC
     220       230       240       250       260       270         

          320       330       340       350          360           
pF1KB7 RTYGGEEDVLGDESQTTPNRGSAFTTSDNLSLSSWVSSSSSF---PGFQHP---QSLTAL
          :      . . .  ::..:: :..    :   .         :.  .:   ::: . 
CCDS31 VLKG------ATDREKDPNKASASTSKTPAWLHHQLLPPPEVLLAPATYRPVTYQSLYSG
     280             290       300       310       320       330   

      370         380               390       400       410        
pF1KB7 GTSTASI--ATPIPHPI--------QGSLPPYSRLGMPLTPSAIASSMQGSGPTFPSFHM
       . :  .:  . : :.:.        ::.::  . ::. :.:...                
CCDS31 APSHLGIPRTRPAPYPLPNIRADRDQGGLPLPAGLGL-LSPTVVCLGPGQDSQ       
           340       350       360       370        380            

      420       430       440       
pF1KB7 PRYHHYFQQGPYAAIQGLRHSSAVMTPFV

>>CCDS9175.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12                (723 aa)
 initn: 633 init1: 375 opt: 834  Z-score: 756.0  bits: 149.8 E(32554): 8.6e-36
Smith-Waterman score: 836; 40.5% identity (64.7% similar) in 380 aa overlap (9-378:19-383)

                         10        20        30        40          
pF1KB7           MEFTASPKPQLSSRANAFSIAALMSSGGSKEKEATENTIKP--LEQFVEK
                         : :  ::  :...:..   : .       :. :     .   
CCDS91 MSLSMRDPVIPGTSMAYHPFLPHRAPDFAMSAVL---GHQPPFFPALTLPPNGAAALSLP
               10        20        30           40        50       

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB7 SSCAQPLGELTSLDAHGEFGGGSGSSPSSSSLCTEPLIPTTPIIPSEEMAKIACSLETKE
       .. :.:.  . .: . .: :   .:   .. :  .::    :    :.  :.   ::.::
CCDS91 GALAKPI--MDQLVGAAETGIPFSSLGPQAHL--RPLKTMEPEEEVEDDPKV--HLEAKE
        60          70        80          90       100         110 

      110       120       130       140       150       160        
pF1KB7 LWDKFHELGTEMIITKSGRRMFPTIRVSFSGVDPEAKYIVLMDIVPVDNKRYRYAYHRSS
       :::.::. ::::.:::::::::: ..:  ::.: .::::.::::. .:. ::.  .: : 
CCDS91 LWDQFHKRGTEMVITKSGRRMFPPFKVRCSGLDKKAKYILLMDIIAADDCRYK--FHNSR
             120       130       140       150       160           

      170       180       190       200       210       220        
pF1KB7 WLVAGKADPPLPARLYVHPDSPFTGEQLLKQMVSFEKVKLTNNELDQHGHIILNSMHKYQ
       :.::::::: .: :.:.::::: :::: ....:.:.:.:::::  :.::  :::::::::
CCDS91 WMVAGKADPEMPKRMYIHPDSPATGEQWMSKVVTFHKLKLTNNISDKHGFTILNSMHKYQ
     170       180       190       200       210       220         

      230       240       250       260       270       280        
pF1KB7 PRVHIIKKKDHTASLLNLKSEEFRTFIFPETVFTAVTAYQNQLITKLKIDSNPFAKGFRD
       :: ::.. .:    .:.:    :::..:::: : :::::::. ::.::::.:::::::::
CCDS91 PRFHIVRAND----ILKLPYSTFRTYLFPETEFIAVTAYQNDKITQLKIDNNPFAKGFRD
     230           240       250       260       270       280     

      290            300       310       320       330       340   
pF1KB7 SS-----RLTDIERESVESLIQKHSYARSPIRTYGGEEDVLGDESQTTPNRGSAFTTSD-
       ..     .  ..  .:.. . ..:.   .     ..:. ...  .:..   .:.  ::. 
CCDS91 TGNGRREKRKQLTLQSMRVFDERHKKENGTSDESSSEQAAFNCFAQASSPAASTVGTSNL
         290       300       310       320       330       340     

             350       360        370       380       390       400
pF1KB7 -NLSLSSWVSSSSSFPGFQH-PQSLTALGTSTASIATPIPHPIQGSLPPYSRLGMPLTPS
        .:  :   :.. .    .: :..  :   ::..   :                      
CCDS91 KDLCPSEGESDAEAESKEEHGPEACDAAKISTTTSEEPCRDKGSPAVKAHLFAAERPRDS
         350       360       370       380       390       400     

              410       420       430       440                    
pF1KB7 AIASSMQGSGPTFPSFHMPRYHHYFQQGPYAAIQGLRHSSAVMTPFV             
                                                                   
CCDS91 GRLDKASPDSRHSPATISSSTRGLGAEERRSPVREGTAPAKVEEARALPGKEAFAPLTVQ
         410       420       430       440       450       460     




447 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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