Result of SIM4 for pF1KB7943

seq1 = pF1KB7943.tfa, 1131 bp
seq2 = pF1KB7943/gi568815597f_46407011.tfa (gi568815597f:46407011_46612491), 205481 bp

>pF1KB7943 1131
>gi568815597f:46407011_46612491 (Chr1)

1-154  (100001-100154)   100% ->
155-333  (103466-103644)   100% ->
334-682  (103925-104273)   100% ->
683-1131  (105033-105481)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGCACTACGGGGTGAACGGCTACTCACTGCACGCCATGAACTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGCACTACGGGGTGAACGGCTACTCACTGCACGCCATGAACTCACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCGCCATGTACAACCTGCACCAGCAGGCAGCCCAGCAGGCCCAGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGCGCCATGTACAACCTGCACCAGCAGGCAGCCCAGCAGGCCCAGCATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCCCGACTACCGGCCTTCAGTGCATGCGCTTACATTGGCTGAGCGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCCCGACTACCGGCCTTCAGTGCATGCGCTTACATTGGCTGAGCGCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCTG         ACATCATCTTGGAGGCCCGTTATGGTTCCCAGCACCG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCTGGTA...AAGACATCATCTTGGAGGCCCGTTATGGTTCCCAGCACCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAACAACGTCGCAGCCGCACAGCGTTCACGGCTCAGCAGCTCGAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103503 CAAACAACGTCGCAGCCGCACAGCGTTCACGGCTCAGCAGCTCGAGGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGAAAAGACCTTCCAGAAGACTCACTACCCAGATGTGGTGATGCGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103553 TGGAAAAGACCTTCCAGAAGACTCACTACCCAGATGTGGTGATGCGTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGGCTGGCCATGTGCACCAACCTGCCTGAGGCCCGGGTGCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 103603 AGGCTGGCCATGTGCACCAACCTGCCTGAGGCCCGGGTGCAGGTA...CA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    334  GTGTGGTTCAAGAACCGCCGGGCCAAGTTCCGGAAGAAGCAGCGTAGCC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103924 GGTGTGGTTCAAGAACCGCCGGGCCAAGTTCCGGAAGAAGCAGCGTAGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGCAGAAGGAACAGCTCCAGAAGCAGAAGGAGGCTGAGGGCTCCCATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103974 TGCAGAAGGAACAGCTCCAGAAGCAGAAGGAGGCTGAGGGCTCCCATGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAAGGCAAGGCCGAGGCCCCCACTCCAGATACCCAGCTGGACACTGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104024 GAAGGCAAGGCCGAGGCCCCCACTCCAGATACCCAGCTGGACACTGAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GCCCCCACGTCTGCCTGGCAGCGACCCCCCTGCTGAGCTTCACCTGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104074 GCCCCCACGTCTGCCTGGCAGCGACCCCCCTGCTGAGCTTCACCTGAGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGTCTGAGCAGTCAGCCAGTGAGTCAGCCCCCGAGGATCAGCCGGACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104124 TGTCTGAGCAGTCAGCCAGTGAGTCAGCCCCCGAGGATCAGCCGGACCGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GAGGAGGACCCCAGGGCAGGGGCTGAGGACCCCAAAGCTGAGAAGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104174 GAGGAGGACCCCAGGGCAGGGGCTGAGGACCCCAAAGCTGAGAAGAGCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TGGGGCTGACAGCAAGGGGCTGGGCTGCAAGAGGGGCAGCCCCAAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104224 TGGGGCTGACAGCAAGGGGCTGGGCTGCAAGAGGGGCAGCCCCAAGGCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683          ATTCCCCAGGCAGCCTGACCATCACTCCTGTGGCCCCAGGG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104274 GTG...CAGATTCCCCAGGCAGCCTGACCATCACTCCTGTGGCCCCAGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GGTGGCCTCCTGGGCCCCTCCCACTCCTATTCCTCGTCCCCGCTGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105074 GGTGGCCTCCTGGGCCCCTCCCACTCCTATTCCTCGTCCCCGCTGAGCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CTTCCGTCTGCAGGAGCAATTCCGCCAGCACATGGCGGCCACCAACAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105124 CTTCCGTCTGCAGGAGCAATTCCGCCAGCACATGGCGGCCACCAACAACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TGGTGCACTACTCGTCCTTCGAAGTAGGGGGTCCGGCCCCTGCTGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105174 TGGTGCACTACTCGTCCTTCGAAGTAGGGGGTCCGGCCCCTGCTGCTGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GCGGCGGCTGCTGCTGTGCCCTACCTGGGCGTCAACATGGCCCCGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105224 GCGGCGGCTGCTGCTGTGCCCTACCTGGGCGTCAACATGGCCCCGCTGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CTCACTGCACTGCCAGTCCTACTACCAGTCCCTGTCAGCAGCCGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105274 CTCACTGCACTGCCAGTCCTACTACCAGTCCCTGTCAGCAGCCGCTGCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CCCACCAGGGTGTGTGGGGGTCTCCTCTGCTGCCTGCACCCCCAGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105324 CCCACCAGGGTGTGTGGGGGTCTCCTCTGCTGCCTGCACCCCCAGCAGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 CTGGCTCCTGCATCAGCTACCCTGAACAGTAAAACCACAAGCATCGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105374 CTGGCTCCTGCATCAGCTACCCTGAACAGTAAAACCACAAGCATCGAGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CCTGCGGCTCCGGGCCAAGCAGCACGCGGCCTCCCTGGGACTCGATACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105424 CCTGCGGCTCCGGGCCAAGCAGCACGCGGCCTCCCTGGGACTCGATACGC

   1150     .
   1124 TGCCCAAC
        ||||||||
 105474 TGCCCAAC

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