Result of FASTA (ccds) for pF1KB6292
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6292, 789 aa
  1>>>pF1KB6292 789 - 789 aa - 789 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1076+/-0.00111; mu= -1.3981+/- 0.066
 mean_var=271.8359+/-56.189, 0's: 0 Z-trim(112.6): 926  B-trim: 693 in 1/50
 Lambda= 0.077789
 statistics sampled from 12331 (13329) to 12331 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.738), E-opt: 0.2 (0.409), width:  16
 Scan time:  4.270

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5054.2 PRDM1 gene_id:639|Hs108|chr6            ( 825) 5409 621.0 2.4e-177
CCDS34505.1 PRDM1 gene_id:639|Hs108|chr6           ( 691) 4721 543.7 3.7e-154
CCDS279.2 ZNF683 gene_id:257101|Hs108|chr1         ( 504)  814 105.2 2.8e-22
CCDS76126.1 ZNF683 gene_id:257101|Hs108|chr1       ( 524)  616 83.0 1.4e-15
CCDS12975.1 ZSCAN22 gene_id:342945|Hs108|chr19     ( 491)  544 74.9 3.7e-13
CCDS41502.1 ZNF239 gene_id:8187|Hs108|chr10        ( 458)  534 73.7 7.6e-13
CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19        ( 738)  537 74.2 8.7e-13
CCDS33094.1 ZNF468 gene_id:90333|Hs108|chr19       ( 522)  532 73.5 9.8e-13
CCDS12861.1 ZNF677 gene_id:342926|Hs108|chr19      ( 584)  532 73.6 1.1e-12
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19        ( 516)  529 73.2 1.2e-12
CCDS12946.1 ZFP28 gene_id:140612|Hs108|chr19       ( 868)  533 73.8 1.4e-12
CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19       ( 700)  526 73.0   2e-12
CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19        ( 907)  527 73.1 2.2e-12
CCDS54276.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19        ( 913)  527 73.1 2.2e-12
CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19        ( 748)  524 72.7 2.4e-12
CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19        ( 799)  524 72.8 2.5e-12
CCDS33047.1 ZNF233 gene_id:353355|Hs108|chr19      ( 670)  522 72.5 2.6e-12
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19      ( 536)  519 72.1 2.7e-12
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19      ( 592)  519 72.1   3e-12
CCDS32915.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19       ( 742)  520 72.3 3.3e-12
CCDS74289.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19       ( 745)  520 72.3 3.3e-12
CCDS74348.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19       ( 540)  516 71.8 3.5e-12
CCDS54257.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19       ( 563)  516 71.8 3.6e-12
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19       ( 781)  518 72.1   4e-12
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19       ( 970)  520 72.4 4.1e-12
CCDS33096.1 ZNF816 gene_id:125893|Hs108|chr19      ( 651)  514 71.6 4.7e-12
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5           ( 461)  510 71.0 4.9e-12
CCDS54310.1 ZNF578 gene_id:147660|Hs108|chr19      ( 590)  511 71.2 5.5e-12
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9        (1059)  516 72.0 5.9e-12
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19      ( 717)  512 71.4   6e-12
CCDS452.2 ZFP69B gene_id:65243|Hs108|chr1          ( 534)  509 71.0   6e-12
CCDS32440.1 ZNF267 gene_id:10308|Hs108|chr16       ( 743)  512 71.4 6.1e-12
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 503)  507 70.7 6.6e-12
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9           ( 630)  509 71.0 6.8e-12
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9          ( 631)  509 71.0 6.8e-12
CCDS12212.1 ZNF177 gene_id:7730|Hs108|chr19        ( 321)  502 70.0 6.9e-12
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19      ( 527)  507 70.7 6.9e-12
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9          ( 645)  509 71.0 6.9e-12
CCDS31418.1 ZNF214 gene_id:7761|Hs108|chr11        ( 606)  508 70.9 7.1e-12
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17        ( 502)  506 70.6 7.2e-12
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 555)  507 70.7 7.2e-12
CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 564)  507 70.8 7.3e-12
CCDS33092.1 ZNF701 gene_id:55762|Hs108|chr19       ( 465)  505 70.5 7.3e-12
CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 577)  507 70.8 7.4e-12
CCDS42495.1 ZNF699 gene_id:374879|Hs108|chr19      ( 642)  508 70.9 7.5e-12
CCDS82393.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19       ( 325)  501 69.9 7.5e-12
CCDS12856.1 ZNF600 gene_id:162966|Hs108|chr19      ( 722)  509 71.1 7.6e-12
CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 616)  507 70.8 7.8e-12
CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19      ( 569)  506 70.6 7.9e-12
CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 629)  507 70.8 7.9e-12


>>CCDS5054.2 PRDM1 gene_id:639|Hs108|chr6                 (825 aa)
 initn: 5409 init1: 5409 opt: 5409  Z-score: 3297.3  bits: 621.0 E(32554): 2.4e-177
Smith-Waterman score: 5409; 99.9% identity (100.0% similar) in 789 aa overlap (1-789:37-825)

                                             10        20        30
pF1KB6                               MKMDMEDADMTLWTEAEFEEKCTYIVNDHP
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 EKRVGTTLAAPKCNSSTVRFQGLAEGTKGTMKMDMEDADMTLWTEAEFEEKCTYIVNDHP
         10        20        30        40        50        60      

               40        50        60        70        80        90
pF1KB6 WDSGADGGTSVQAEASLPRNLLFKYATNSEEVIGVMSKEYIPKGTRFGPLIGEIYTNDTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 WDSGADGGTSVQAEASLPRNLLFKYATNSEEVIGVMSKEYIPKGTRFGPLIGEIYTNDTV
         70        80        90       100       110       120      

              100       110       120       130       140       150
pF1KB6 PKNANRKYFWRIYSRGELHHFIDGFNEEKSNWMRYVNPAHSPREQNLAACQNGMNIYFYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 PKNANRKYFWRIYSRGELHHFIDGFNEEKSNWMRYVNPAHSPREQNLAACQNGMNIYFYT
        130       140       150       160       170       180      

              160       170       180       190       200       210
pF1KB6 IKPIPANQELLVWYCREFAERLHYPYPGELTMMNLTQTQSSLKQPSTEKNELCPKNVPKR
       ::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 IKPIPANQELLVWYCRDFAERLHYPYPGELTMMNLTQTQSSLKQPSTEKNELCPKNVPKR
        190       200       210       220       230       240      

              220       230       240       250       260       270
pF1KB6 EYSVKEILKLDSNPSKGKDLYRSNISPLTSEKDLDDFRRRGSPEMPFYPRVVYPIRAPLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 EYSVKEILKLDSNPSKGKDLYRSNISPLTSEKDLDDFRRRGSPEMPFYPRVVYPIRAPLP
        250       260       270       280       290       300      

              280       290       300       310       320       330
pF1KB6 EDFLKASLAYGIERPTYITRSPIPSSTTPSPSARSSPDQSLKSSSPHSSPGNTVSPVGPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 EDFLKASLAYGIERPTYITRSPIPSSTTPSPSARSSPDQSLKSSSPHSSPGNTVSPVGPG
        310       320       330       340       350       360      

              340       350       360       370       380       390
pF1KB6 SQEHRDSYAYLNASYGTEGLGSYPGYAPLPHLPPAFIPSYNAHYPKFLLPPYGMNCNGLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 SQEHRDSYAYLNASYGTEGLGSYPGYAPLPHLPPAFIPSYNAHYPKFLLPPYGMNCNGLS
        370       380       390       400       410       420      

              400       410       420       430       440       450
pF1KB6 AVSSMNGINNFGLFPRLCPVYSNLLGGGSLPHPMLNPTSLPSSLPSDGARRLLQPEHPRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 AVSSMNGINNFGLFPRLCPVYSNLLGGGSLPHPMLNPTSLPSSLPSDGARRLLQPEHPRE
        430       440       450       460       470       480      

              460       470       480       490       500       510
pF1KB6 VLVPAPHSAFSFTGAAASMKDKACSPTSGSPTAGTAATAEHVVQPKATSAAMAAPSSDEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 VLVPAPHSAFSFTGAAASMKDKACSPTSGSPTAGTAATAEHVVQPKATSAAMAAPSSDEA
        490       500       510       520       530       540      

              520       530       540       550       560       570
pF1KB6 MNLIKNKRNMTGYKTLPYPLKKQNGKIKYECNVCAKTFGQLSNLKVHLRVHSGERPFKCQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 MNLIKNKRNMTGYKTLPYPLKKQNGKIKYECNVCAKTFGQLSNLKVHLRVHSGERPFKCQ
        550       560       570       580       590       600      

              580       590       600       610       620       630
pF1KB6 TCNKGFTQLAHLQKHYLVHTGEKPHECQVCHKRFSSTSNLKTHLRLHSGEKPYQCKVCPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 TCNKGFTQLAHLQKHYLVHTGEKPHECQVCHKRFSSTSNLKTHLRLHSGEKPYQCKVCPA
        610       620       630       640       650       660      

              640       650       660       670       680       690
pF1KB6 KFTQFVHLKLHKRLHTRERPHKCSQCHKNYIHLCSLKVHLKGNCAAAPAPGLPLEDLTRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 KFTQFVHLKLHKRLHTRERPHKCSQCHKNYIHLCSLKVHLKGNCAAAPAPGLPLEDLTRI
        670       680       690       700       710       720      

              700       710       720       730       740       750
pF1KB6 NEEIEKFDISDNADRLEDVEDDISVISVVEKEILAVVRKEKEETGLKVSLQRNMGNGLLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 NEEIEKFDISDNADRLEDVEDDISVISVVEKEILAVVRKEKEETGLKVSLQRNMGNGLLS
        730       740       750       760       770       780      

              760       770       780         
pF1KB6 SGCSLYESSDLPLMKLPPSNPLPLVPVKVKQETVEPMDP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 SGCSLYESSDLPLMKLPPSNPLPLVPVKVKQETVEPMDP
        790       800       810       820     

>>CCDS34505.1 PRDM1 gene_id:639|Hs108|chr6                (691 aa)
 initn: 4721 init1: 4721 opt: 4721  Z-score: 2881.1  bits: 543.7 E(32554): 3.7e-154
Smith-Waterman score: 4721; 99.7% identity (100.0% similar) in 689 aa overlap (101-789:3-691)

               80        90       100       110       120       130
pF1KB6 IPKGTRFGPLIGEIYTNDTVPKNANRKYFWRIYSRGELHHFIDGFNEEKSNWMRYVNPAH
                                     .:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34                             MEKIYSRGELHHFIDGFNEEKSNWMRYVNPAH
                                           10        20        30  

              140       150       160       170       180       190
pF1KB6 SPREQNLAACQNGMNIYFYTIKPIPANQELLVWYCREFAERLHYPYPGELTMMNLTQTQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS34 SPREQNLAACQNGMNIYFYTIKPIPANQELLVWYCRDFAERLHYPYPGELTMMNLTQTQS
             40        50        60        70        80        90  

              200       210       220       230       240       250
pF1KB6 SLKQPSTEKNELCPKNVPKREYSVKEILKLDSNPSKGKDLYRSNISPLTSEKDLDDFRRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SLKQPSTEKNELCPKNVPKREYSVKEILKLDSNPSKGKDLYRSNISPLTSEKDLDDFRRR
            100       110       120       130       140       150  

              260       270       280       290       300       310
pF1KB6 GSPEMPFYPRVVYPIRAPLPEDFLKASLAYGIERPTYITRSPIPSSTTPSPSARSSPDQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GSPEMPFYPRVVYPIRAPLPEDFLKASLAYGIERPTYITRSPIPSSTTPSPSARSSPDQS
            160       170       180       190       200       210  

              320       330       340       350       360       370
pF1KB6 LKSSSPHSSPGNTVSPVGPGSQEHRDSYAYLNASYGTEGLGSYPGYAPLPHLPPAFIPSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LKSSSPHSSPGNTVSPVGPGSQEHRDSYAYLNASYGTEGLGSYPGYAPLPHLPPAFIPSY
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pF1KB6 NAHYPKFLLPPYGMNCNGLSAVSSMNGINNFGLFPRLCPVYSNLLGGGSLPHPMLNPTSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NAHYPKFLLPPYGMNCNGLSAVSSMNGINNFGLFPRLCPVYSNLLGGGSLPHPMLNPTSL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PSSLPSDGARRLLQPEHPREVLVPAPHSAFSFTGAAASMKDKACSPTSGSPTAGTAATAE
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pF1KB6 HVVQPKATSAAMAAPSSDEAMNLIKNKRNMTGYKTLPYPLKKQNGKIKYECNVCAKTFGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HVVQPKATSAAMAAPSSDEAMNLIKNKRNMTGYKTLPYPLKKQNGKIKYECNVCAKTFGQ
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pF1KB6 LSNLKVHLRVHSGERPFKCQTCNKGFTQLAHLQKHYLVHTGEKPHECQVCHKRFSSTSNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LSNLKVHLRVHSGERPFKCQTCNKGFTQLAHLQKHYLVHTGEKPHECQVCHKRFSSTSNL
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pF1KB6 KTHLRLHSGEKPYQCKVCPAKFTQFVHLKLHKRLHTRERPHKCSQCHKNYIHLCSLKVHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KTHLRLHSGEKPYQCKVCPAKFTQFVHLKLHKRLHTRERPHKCSQCHKNYIHLCSLKVHL
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pF1KB6 KGNCAAAPAPGLPLEDLTRINEEIEKFDISDNADRLEDVEDDISVISVVEKEILAVVRKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KGNCAAAPAPGLPLEDLTRINEEIEKFDISDNADRLEDVEDDISVISVVEKEILAVVRKE
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KEETGLKVSLQRNMGNGLLSSGCSLYESSDLPLMKLPPSNPLPLVPVKVKQETVEPMDP
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>>CCDS279.2 ZNF683 gene_id:257101|Hs108|chr1              (504 aa)
 initn: 763 init1: 735 opt: 814  Z-score: 513.4  bits: 105.2 E(32554): 2.8e-22
Smith-Waterman score: 827; 39.8% identity (61.2% similar) in 405 aa overlap (299-701:111-473)

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB6 LPEDFLKASLAYGIERPTYITRSPIPSSTTPSPSARSSPDQSLKSSSPHSSPGNTVSPVG
                                     :. .: :. :...  . :...     .:  
CCDS27 DLNLCTPQPAPLGTDLQGLQEDALSMKHEPPGLQASSTDDKKFTVKYPQNKDKLGKQPER
               90       100       110       120       130       140

      330       340       350       360       370       380        
pF1KB6 PGSQEHRDSYAYLNASYGTEGLGSYPGYAPLPHLPPAFIPSYNAHYPKFLLPPYGMNCNG
        :      ...  :.: .   : .  . .::   :   . : . . : :::  .     :
CCDS27 AGEGAPCPAFSSHNSS-SPPPLQNRKSPSPLAFCPCPPVNSISKELP-FLLHAF---YPG
              150        160       170       180        190        

      390       400        410       420        430       440      
pF1KB6 LSAVSSMNGINNFGLFPR-LCPVYSNLLGGGSLPHPMLNPT-SLPSSLPSDGARRLLQPE
          .     . ..: .:   ::   .::    ::.    :: ..:: :    . .: .: 
CCDS27 YPLLLPPPHLFTYGALPSDQCP---HLL---MLPQDPSYPTMAMPSLLMM--VNELGHPS
         200       210          220          230         240       

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pF1KB6 HPREVLVPAPHSAFSFTGAAASMKDKACSPTSGSPTAGTAATAEHVVQPKATSAAMAAPS
          :.:.: : .::. .: :   . .       .: ::.: :     .:    ..::.:.
CCDS27 ARWETLLPYP-GAFQASGQALPSQAR-------NPGAGAAPTD----SPGLERGGMASPA
       250        260       270              280           290     

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pF1KB6 SDEAMNLIKNKRNMTGYKTLPYPLKKQNGKIKYECNVCAKTFGQLSNLKVHLRVHSGERP
       .   ..      ..::  .:::::::.:::: ::::.:.:.:::::::::::::::::::
CCDS27 KRVPLS------SQTGTAALPYPLKKKNGKILYECNICGKSFGQLSNLKVHLRVHSGERP
         300             310       320       330       340         

        570       580       590       600       610       620      
pF1KB6 FKCQTCNKGFTQLAHLQKHYLVHTGEKPHECQVCHKRFSSTSNLKTHLRLHSGEKPYQCK
       :.:  :.:.::::::::::.::::::.::.:.::::::::.:::::::::::: .:.::.
CCDS27 FQCALCQKSFTQLAHLQKHHLVHTGERPHKCSVCHKRFSSSSNLKTHLRLHSGARPFQCS
     350       360       370       380       390       400         

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pF1KB6 VCPAKFTQFVHLKLHKRLHTRERPHKCSQCHKNYIHLCSLKVHLKGNCAAAPAPGLPLED
       :: ..::: .:::::.:::.   :. :.  : . . : ::       : :    :  :. 
CCDS27 VCRSRFTQHIHLKLHHRLHA---PQPCGLVHTQ-LPLASLA------CLAQWHQG-ALDL
     410       420          430        440             450         

        690       700       710       720       730       740      
pF1KB6 LTRINEEIEKFDISDNADRLEDVEDDISVISVVEKEILAVVRKEKEETGLKVSLQRNMGN
       ..  .:.   .::..                                             
CCDS27 MAVASEKHMGYDIDEVKVSSTSQGKARAVSLSSAGTPLVMGQDQNN              
      460       470       480       490       500                  

>>CCDS76126.1 ZNF683 gene_id:257101|Hs108|chr1            (524 aa)
 initn: 875 init1: 463 opt: 616  Z-score: 393.0  bits: 83.0 E(32554): 1.4e-15
Smith-Waterman score: 779; 37.9% identity (58.4% similar) in 425 aa overlap (299-701:111-493)

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB6 LPEDFLKASLAYGIERPTYITRSPIPSSTTPSPSARSSPDQSLKSSSPHSSPGNTVSPVG
                                     :. .: :. :...  . :...     .:  
CCDS76 DLNLCTPQPAPLGTDLQGLQEDALSMKHEPPGLQASSTDDKKFTVKYPQNKDKLGKQPER
               90       100       110       120       130       140

      330       340       350       360       370       380        
pF1KB6 PGSQEHRDSYAYLNASYGTEGLGSYPGYAPLPHLPPAFIPSYNAHYPKFLLPPYGMNCNG
        :      ...  :.: .   : .  . .::   :   . : . . : :::  .     :
CCDS76 AGEGAPCPAFSSHNSS-SPPPLQNRKSPSPLAFCPCPPVNSISKELP-FLLHAF---YPG
              150        160       170       180        190        

      390       400        410       420        430       440      
pF1KB6 LSAVSSMNGINNFGLFPR-LCPVYSNLLGGGSLPHPMLNPT-SLPSSLPSDGARRLLQPE
          .     . ..: .:   ::   .::    ::.    :: ..:: :    . .: .: 
CCDS76 YPLLLPPPHLFTYGALPSDQCP---HLL---MLPQDPSYPTMAMPSLLMM--VNELGHPS
         200       210          220          230         240       

        450       460       470       480       490       500      
pF1KB6 HPREVLVPAPHSAFSFTGAAASMKDKACSPTSGSPTAGTAATAEHVVQPKATSAAMAAPS
          :.:.: : .::. .: :   . .       .: ::.: :     .:    ..::.:.
CCDS76 ARWETLLPYP-GAFQASGQALPSQAR-------NPGAGAAPTD----SPGLERGGMASPA
       250        260       270              280           290     

        510       520       530       540       550       560      
pF1KB6 SDEAMNLIKNKRNMTGYKTLPYPLKKQNGKIKYECNVCAKTFGQLSNLKVHLRVHSGERP
       .   ..      ..::  .:::::::.:::: ::::.:.:.:::::::::::::::::::
CCDS76 KRVPLS------SQTGTAALPYPLKKKNGKILYECNICGKSFGQLSNLKVHLRVHSGERP
         300             310       320       330       340         

        570       580       590                           600      
pF1KB6 FKCQTCNKGFTQLAHLQKHYLVHTGEKPHEC--------------------QVCHKRFSS
       :.:  :.:.::::::::::.::::::.::.:                    .::::::::
CCDS76 FQCALCQKSFTQLAHLQKHHLVHTGERPHKCSIPWVPGRNHWKSFQAWREREVCHKRFSS
     350       360       370       380       390       400         

        610       620       630       640       650       660      
pF1KB6 TSNLKTHLRLHSGEKPYQCKVCPAKFTQFVHLKLHKRLHTRERPHKCSQCHKNYIHLCSL
       .:::::::::::: .:.::.:: ..::: .:::::.:::.   :. :.  : . . : ::
CCDS76 SSNLKTHLRLHSGARPFQCSVCRSRFTQHIHLKLHHRLHA---PQPCGLVHTQ-LPLASL
     410       420       430       440          450        460     

        670       680       690       700       710       720      
pF1KB6 KVHLKGNCAAAPAPGLPLEDLTRINEEIEKFDISDNADRLEDVEDDISVISVVEKEILAV
              : :    :  :. ..  .:.   .::..                         
CCDS76 A------CLAQWHQG-ALDLMAVASEKHMGYDIDEVKVSSTSQGKARAVSLSSAGTPLVM
               470        480       490       500       510        

        730       740       750       760       770       780      
pF1KB6 VRKEKEETGLKVSLQRNMGNGLLSSGCSLYESSDLPLMKLPPSNPLPLVPVKVKQETVEP
                                                                   
CCDS76 GQDQNN                                                      
      520                                                          

>>CCDS12975.1 ZSCAN22 gene_id:342945|Hs108|chr19          (491 aa)
 initn: 948 init1: 506 opt: 544  Z-score: 349.8  bits: 74.9 E(32554): 3.7e-13
Smith-Waterman score: 547; 37.7% identity (60.7% similar) in 247 aa overlap (445-671:243-484)

          420       430       440       450         460       470  
pF1KB6 LGGGSLPHPMLNPTSLPSSLPSDGARRLLQPEHPREVLVPA--PHSAFSFTGAAASMKDK
                                     : . .  :: :   .  ....:  .: : .
CCDS12 DVPTDQRGRESGASRNSSSAWPNLTSQEKPPSEDKFDLVDAYGTEPPYTYSGKRSS-KCR
            220       230       240       250       260        270 

            480       490        500       510       520       530 
pF1KB6 ACSPTSGSPTAGTAATAEHVVQ-PKATSAAMAAPSSDEAMNLIKNKRNMTGYKTLPYPLK
        :     : .:  :    :  . : : :    : :  .. .: ...   :: :  :.  :
CCDS12 ECRKMFQSASALEAHQKTHSRKTPYACSECGKAFS--RSTHLAQHQVVHTGAK--PHECK
             280       290       300         310       320         

                              540       550       560       570    
pF1KB6 K-----------------QNGKIKYECNVCAKTFGQLSNLKVHLRVHSGERPFKCQTCNK
       .                 ..:.  :.:. :.:::.. ..:  : :::.::::..:..:.:
CCDS12 ECGKAFSRVTHLTQHQRIHTGEKPYKCGECGKTFSRSTHLTQHQRVHTGERPYECDACGK
       330       340       350       360       370       380       

          580       590       600       610       620       630    
pF1KB6 GFTQLAHLQKHYLVHTGEKPHECQVCHKRFSSTSNLKTHLRLHSGEKPYQCKVCPAKFTQ
       .:.: .:: .:  .::::::..:..: . ::. : :  :::.:::::::::::::  :.:
CCDS12 AFSQSTHLTQHQRIHTGEKPYKCDACGRAFSDCSALIRHLRIHSGEKPYQCKVCPKAFAQ
       390       400       410       420       430       440       

          640       650       660       670       680       690    
pF1KB6 FVHLKLHKRLHTRERPHKCSQCHKNYIHLCSLKVHLKGNCAAAPAPGLPLEDLTRINEEI
          :  :.:.:: :.:.:::.: : . .  .: :::.                       
CCDS12 SSSLIEHQRIHTGEKPYKCSDCGKAFSRSSALMVHLRIHITVLQ                
       450       460       470       480       490                 

          700       710       720       730       740       750    
pF1KB6 EKFDISDNADRLEDVEDDISVISVVEKEILAVVRKEKEETGLKVSLQRNMGNGLLSSGCS

>>CCDS41502.1 ZNF239 gene_id:8187|Hs108|chr10             (458 aa)
 initn: 512 init1: 512 opt: 534  Z-score: 344.1  bits: 73.7 E(32554): 7.6e-13
Smith-Waterman score: 534; 40.8% identity (73.4% similar) in 169 aa overlap (503-671:283-451)

            480       490       500       510       520       530  
pF1KB6 ACSPTSGSPTAGTAATAEHVVQPKATSAAMAAPSSDEAMNLIKNKRNMTGYKTLPYPLKK
                                     :. .... ..  :  ....  . :    . 
CCDS41 HQAVHTDEKPYKCDKCGKGFTRSSSLLIHHAVHTGEKPYKCDKCGKGFSQSSKLHIHQRV
            260       270       280       290       300       310  

            540       550       560       570       580       590  
pF1KB6 QNGKIKYECNVCAKTFGQLSNLKVHLRVHSGERPFKCQTCNKGFTQLAHLQKHYLVHTGE
       ..:.  :::. :. .:.: :::..: :::.::::.::  :.:::.: ..:. :  .::::
CCDS41 HTGEKPYECEECGMSFSQRSNLHIHQRVHTGERPYKCGECGKGFSQSSNLHIHRCIHTGE
            320       330       340       350       360       370  

            600       610       620       630       640       650  
pF1KB6 KPHECQVCHKRFSSTSNLKTHLRLHSGEKPYQCKVCPAKFTQFVHLKLHKRLHTRERPHK
       ::..:  : : ::..:.:. :::.:.:::::.:  :   :.:  .: .:.:.:: :.:..
CCDS41 KPYQCYECGKGFSQSSDLRIHLRVHTGEKPYHCGKCGKGFSQSSKLLIHQRVHTGEKPYE
            380       390       400       410       420       430  

            660       670       680       690       700       710  
pF1KB6 CSQCHKNYIHLCSLKVHLKGNCAAAPAPGLPLEDLTRINEEIEKFDISDNADRLEDVEDD
       ::.: :.. .  .:..: .                                         
CCDS41 CSKCGKGFSQSSNLHIHQRVHKKDPR                                  
            440       450                                          

>>CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19             (738 aa)
 initn: 3504 init1: 518 opt: 537  Z-score: 343.0  bits: 74.2 E(32554): 8.7e-13
Smith-Waterman score: 537; 44.0% identity (73.0% similar) in 159 aa overlap (521-678:300-458)

              500       510       520        530       540         
pF1KB6 HVVQPKATSAAMAAPSSDEAMNLIKNKRNMTGYKT-LPYPLKKQNGKIKYECNVCAKTFG
                                     :.:.. .:   . ..:: .: :. :.: :.
CCDS33 EAFNDSSSLELHKQVHLGKKSPACSTHEKDTSYSSGIPVQQSVRTGKKRYWCHECGKGFS
     270       280       290       300       310       320         

     550       560       570       580       590       600         
pF1KB6 QLSNLKVHLRVHSGERPFKCQTCNKGFTQLAHLQKHYLVHTGEKPHECQVCHKRFSSTSN
       : :::..: :::.::.:. :. :.:.:.: .::  :  .::::::..:. : : :: ...
CCDS33 QSSNLQTHQRVHTGEKPYTCHECGKSFNQSSHLYAHLPIHTGEKPYRCDSCGKGFSRSTD
     330       340       350       360       370       380         

     610       620       630       640       650       660         
pF1KB6 LKTHLRLHSGEKPYQCKVCPAKFTQFVHLKLHKRLHTRERPHKCSQCHKNYIHLCSLKVH
       :. : :.:.:::::.:.::   :::  ::. :.:.:: :.:.::..: : .    .:..:
CCDS33 LNIHCRVHTGEKPYKCEVCGKGFTQRSHLQAHERIHTGEKPYKCGDCGKRFSCSSNLHTH
     390       400       410       420       430       440         

     670       680       690       700       710       720         
pF1KB6 LKGNCAAAPAPGLPLEDLTRINEEIEKFDISDNADRLEDVEDDISVISVVEKEILAVVRK
        . .    :                                                   
CCDS33 QRVHTEEKPYKCDECGKCFSLSFNLHSHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSSASSFQSHQRVH
     450       460       470       480       490       500         

>>CCDS33094.1 ZNF468 gene_id:90333|Hs108|chr19            (522 aa)
 initn: 2993 init1: 515 opt: 532  Z-score: 342.1  bits: 73.5 E(32554): 9.8e-13
Smith-Waterman score: 532; 45.2% identity (74.0% similar) in 146 aa overlap (533-678:349-494)

            510       520       530       540       550       560  
pF1KB6 AAPSSDEAMNLIKNKRNMTGYKTLPYPLKKQNGKIKYECNVCAKTFGQLSNLKVHLRVHS
                                     ..:.  : :: :.:.:..::.:  : :.:.
CCDS33 RIHTGEKPYKCKVCDEAFAYNSYLAKHTILHTGEKPYTCNECGKVFNRLSTLARHHRLHT
      320       330       340       350       360       370        

            570       580       590       600       610       620  
pF1KB6 GERPFKCQTCNKGFTQLAHLQKHYLVHTGEKPHECQVCHKRFSSTSNLKTHLRLHSGEKP
       ::.:.::. :.: :.. .::..:  .:.::::..:. : : ::  :::. : :.:.::::
CCDS33 GEKPYKCEECDKVFSRKSHLERHRRIHSGEKPYKCEECCKVFSRKSNLERHRRIHTGEKP
      380       390       400       410       420       430        

            630       640       650       660       670       680  
pF1KB6 YQCKVCPAKFTQFVHLKLHKRLHTRERPHKCSQCHKNYIHLCSLKVHLKGNCAAAPAPGL
       :.::::   : .  ::  :.:.:: :.:.::..: :.. .  :: .: . . .  :    
CCDS33 YKCKVCDKAFQRDSHLAQHQRVHTGEKPYKCNECGKTFGQTSSLIIHRRLHTGEKPYKCN
      440       450       460       470       480       490        

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pF1KB6 PLEDLTRINEEIEKFDISDNADRLEDVEDDISVISVVEKEILAVVRKEKEETGLKVSLQR
                                                                   
CCDS33 ECGKTFSQMSSLVYHHRLHSGEKP                                    
      500       510       520                                      

>>CCDS12861.1 ZNF677 gene_id:342926|Hs108|chr19           (584 aa)
 initn: 943 init1: 504 opt: 532  Z-score: 341.4  bits: 73.6 E(32554): 1.1e-12
Smith-Waterman score: 532; 40.1% identity (66.0% similar) in 197 aa overlap (488-678:207-402)

       460       470       480       490       500       510       
pF1KB6 SAFSFTGAAASMKDKACSPTSGSPTAGTAATAEHVVQPKATSAAMAAPSSDEAMNLIKNK
                                     :.:.. . . .  .. . : .     .:: 
CCDS12 RYAGNKYVKCFENKIGLSLQAQLAELQRFQTGEKMYECNPVEKSINSSSVSPLPPCVKNI
        180       190       200       210       220       230      

       520       530             540       550       560       570 
pF1KB6 RNMTGYKTLPYPL-KKQNGKIK-----YECNVCAKTFGQLSNLKVHLRVHSGERPFKCQT
        :    : : ::: . : :. .     :.:: :.:.:.. :::  : :.:::.::.::. 
CCDS12 CN-KYRKILKYPLLHTQYGRTHIREKSYKCNDCGKAFSKSSNLTNHQRIHSGQRPYKCNE
         240       250       260       270       280       290     

             580       590       600       610       620       630 
pF1KB6 CNKGFTQLAHLQKHYLVHTGEKPHECQVCHKRFSSTSNLKTHLRLHSGEKPYQCKVCPAK
       :.:.:.: ..: .:  :::::::..:..: :  :..::: .: :.:.:::::.:. :   
CCDS12 CGKAFNQCSNLTRHQRVHTGEKPYQCNICGKVCSQNSNLASHQRMHTGEKPYKCNECGKA
         300       310       320       330       340       350     

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pF1KB6 FTQFVHLKLHKRLHTRERPHKCSQCHKNYIHLCSLKVHLKGNCAAAPAPGLPLEDLTRIN
       : :  ::  :.:.:: :.:.::..: : . .  ::  : . . .  :             
CCDS12 FIQRSHLWGHERIHTGEKPYKCNECDKAFAERSSLTQHKRIHTGEKPYICNECGKAFKQC
         360       370       380       390       400       410     

             700       710       720       730       740       750 
pF1KB6 EEIEKFDISDNADRLEDVEDDISVISVVEKEILAVVRKEKEETGLKVSLQRNMGNGLLSS
                                                                   
CCDS12 SHLTRHQNIHPGEKPHKCNVCGRAFIQSSSLVEHQRIHTGEKPYKCNKCDKAFIKRSHLW
         420       430       440       450       460       470     

>>CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19             (516 aa)
 initn: 2205 init1: 520 opt: 529  Z-score: 340.4  bits: 73.2 E(32554): 1.2e-12
Smith-Waterman score: 531; 36.6% identity (61.2% similar) in 224 aa overlap (474-678:95-316)

           450       460       470       480       490         500 
pF1KB6 QPEHPREVLVPAPHSAFSFTGAAASMKDKACSPTSGSPTAGTAATAEHVVQPKATS--AA
                                     ::  . .   :   : ..... : :.    
CCDS12 THISHTYECNFVDSLFTQKEKANIGTEHYKCSERGKAFHQGLHFTIHQIIHTKETQFKCD
           70        80        90       100       110       120    

             510       520       530                        540    
pF1KB6 MAAPSSDEAMNLIKNKRNMTGYKTLPYPLKK-----------------QNGKIKYECNVC
       . .   ..  :: ...:  :: :  ::  ..                 ..:.  :.:: :
CCDS12 ICGKIFNKKSNLASHQRIHTGEK--PYKCNECGKVFHNMSHLAQHRRIHTGEKPYKCNEC
          130       140         150       160       170       180  

          550       560       570       580       590       600    
pF1KB6 AKTFGQLSNLKVHLRVHSGERPFKCQTCNKGFTQLAHLQKHYLVHTGEKPHECQVCHKRF
       .:.:.:.:.:  : :.:.::.:.::. :.: : :..:: .:  .::::::.::. : : :
CCDS12 GKVFNQISHLAQHQRIHTGEKPYKCNECGKVFHQISHLAQHRTIHTGEKPYECNKCGKVF
            190       200       210       220       230       240  

          610       620       630       640       650       660    
pF1KB6 SSTSNLKTHLRLHSGEKPYQCKVCPAKFTQFVHLKLHKRLHTRERPHKCSQCHKNYIHLC
       : .: :  :: .:.:::::.:.::   : .. ::  :.:.:: :.:.::..: : . :  
CCDS12 SRNSYLVQHLIIHTGEKPYRCNVCGKVFHHISHLAQHQRIHTGEKPYKCNECGKVFSHKS
            250       260       270       280       290       300  

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pF1KB6 SLKVHLKGNCAAAPAPGLPLEDLTRINEEIEKFDISDNADRLEDVEDDISVISVVEKEIL
       ::  : . . .  :                                              
CCDS12 SLVNHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSHKSSLVNHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSRNSYLAQ
            310       320       330       340       350       360  




789 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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