Result of SIM4 for pF1KB6245

seq1 = pF1KB6245.tfa, 2259 bp
seq2 = pF1KB6245/gi568815593r_157526343.tfa (gi568815593r:157526343_157752078), 225736 bp

>pF1KB6245 2259
>gi568815593r:157526343_157752078 (Chr5)

(complement)

1-967  (100001-100967)   100% ->
968-1207  (103183-103422)   100% ->
1208-1387  (105263-105442)   100% ->
1388-1880  (113357-113849)   100% ->
1881-2259  (125358-125736)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAGAGCCAGACCCGAGCCGCCGCCTCAGCCGCGCCCGTTGCGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAGAGCCAGACCCGAGCCGCCGCCTCAGCCGCGCCCGTTGCGTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCTCCGCCCCCGCTGCCGGTCGAGGGCACCTCCTTTTGGGCAGCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCTCCGCCCCCGCTGCCGGTCGAGGGCACCTCCTTTTGGGCAGCAGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGAGCCCCCTCCGTCGTCTCCCACACTGAGCGCGGCAGCCAGTGCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGAGCCCCCTCCGTCGTCTCCCACACTGAGCGCGGCAGCCAGTGCGACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGGCCTCGTCGTGCGGGGAGGCAGTGGCGTCCGGCTTACAGCCCGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGGCCTCGTCGTGCGGGGAGGCAGTGGCGTCCGGCTTACAGCCCGCGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCGGCGGCTGCTGCAGGTGAAGCCAGAGCAGGTGTTGCTGCTACCACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCGGCGGCTGCTGCAGGTGAAGCCAGAGCAGGTGTTGCTGCTACCACAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTCAGGCCCAGAACGAGGAAGCCGCTGCCTCGTCCGCGCAGGCGCGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTCAGGCCCAGAACGAGGAAGCCGCTGCCTCGTCCGCGCAGGCGCGGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTGCAGTTCAGGCCCGACCTGCGGCTCCTGCAGCCGCCGACAGCGTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTGCAGTTCAGGCCCGACCTGCGGCTCCTGCAGCCGCCGACAGCGTCAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGGCGCCACCTCCAGGCCCGAGTTGCACCCGGTGCAGCCCCTGGCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGGCGCCACCTCCAGGCCCGAGTTGCACCCGGTGCAGCCCCTGGCGCTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGTCAAGGCCAAGAAGCAGAAGCTGGGGCCCAGCCTGGATCAGTCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGTCAAGGCCAAGAAGCAGAAGCTGGGGCCCAGCCTGGATCAGTCAGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGGCCTCGAGGGGCCGTCGAAACCGGTCCTAGAGCCTCCAGGGTGGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGGCCTCGAGGGGCCGTCGAAACCGGTCCTAGAGCCTCCAGGGTGGTCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTTGGAAGGCCCCGGGCCGGCCCTCGGCTACTTCCGAGGGGACGAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTTGGAAGGCCCCGGGCCGGCCCTCGGCTACTTCCGAGGGGACGAGAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCAAGCTGGAGGCGGAGGAGGTCATGAGAGACTCGATGCAAGGCGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCAAGCTGGAGGCGGAGGAGGTCATGAGAGACTCGATGCAAGGCGGGGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGCAAAAGCCCGGCAGCCATCCGAGAAGGTGTGATCAAAACGGAGGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGCAAAAGCCCGGCAGCCATCCGAGAAGGTGTGATCAAAACGGAGGAACC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGAGAGACTCCTCGAGGACTGCAGGCTCGGCGCGGAGCCCGCGTCCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGAGAGACTCCTCGAGGACTGCAGGCTCGGCGCGGAGCCCGCGTCCAATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCCTGGTTCATGGCAGCGCGGAGGTCATCTTGGCCCCAACGTCCGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCCTGGTTCATGGCAGCGCGGAGGTCATCTTGGCCCCAACGTCCGGTGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTTGGGCCGCACCAGCAAGACCTTAGGATCCCTTTGACGCTCCACACGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTTGGGCCGCACCAGCAAGACCTTAGGATCCCTTTGACGCTCCACACGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCCCCCTGGGGCCCGGATCCAGTTTCAGGGAGCTCCGCCTTCAGAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCCCCCTGGGGCCCGGATCCAGTTTCAGGGAGCTCCGCCTTCAGAGCTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TAAGATTGACCAAGGTCCCCCTGACACCAGTGCCTACTAAAATGCAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TAAGATTGACCAAGGTCCCCCTGACACCAGTGCCTACTAAAATGCAGTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CTACTGGAGCCTTCTGTAAAAATTGAAACCAAAGATGTCCCGCTCACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTACTGGAGCCTTCTGTAAAAATTGAAACCAAAGATGTCCCGCTCACCGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GTTGCCCTCAGATGCAG         GCATACCAGATACTCCCTTCAGTA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100951 GTTGCCCTCAGATGCAGGTA...TAGGCATACCAGATACTCCCTTCAGTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 AGGACAGAAATGGTCATGTGAAGCGACCCATGAACGCATTTATGGTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103207 AGGACAGAAATGGTCATGTGAAGCGACCCATGAACGCATTTATGGTTTGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GCAAGGATCCACCGACCAGCACTAGCCAAAGCTAACCCAGCAGCCAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103257 GCAAGGATCCACCGACCAGCACTAGCCAAAGCTAACCCAGCAGCCAACAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 TGCAGAAATCAGTGTCCAGCTTGGGTTAGAGTGGAACAAACTTAGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103307 TGCAGAAATCAGTGTCCAGCTTGGGTTAGAGTGGAACAAACTTAGTGAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 AACAAAAGAAACCCTATTACGATGAAGCACAAAAGATTAAGGAAAAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103357 AACAAAAGAAACCCTATTACGATGAAGCACAAAAGATTAAGGAAAAGCAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 AGAGAGGAATTTCCTG         GTTGGGTTTATCAGCCTCGTCCAGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 103407 AGAGAGGAATTTCCTGGTA...TAGGTTGGGTTTATCAGCCTCGTCCAGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 GAAGCGAAAACGATTCCCTCTAAGTGTTTCCAATGTATTTTCTGGTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105288 GAAGCGAAAACGATTCCCTCTAAGTGTTTCCAATGTATTTTCTGGTACCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 CACAGAATATCATCTCTACAAATCCTACAACAGTTTATCCTTACCGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105338 CACAGAATATCATCTCTACAAATCCTACAACAGTTTATCCTTACCGCTCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 CCTACGTACTCTGTGGTAATTCCCAGCCTACAGAATCCCATCACTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105388 CCTACGTACTCTGTGGTAATTCCCAGCCTACAGAATCCCATCACTCATCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 AGTTG         GTGAAACCTCACCTGCTATCCAGCTGCCCACACCTG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105438 AGTTGGTG...AAGGTGAAACCTCACCTGCTATCCAGCTGCCCACACCTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 CAGTCCAGAGCCCAAGCCCTGTCACACTTTTCCAGCCCAGCGTCTCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113393 CAGTCCAGAGCCCAAGCCCTGTCACACTTTTCCAGCCCAGCGTCTCCAGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 GCTGCTCAGGTGGCTGTCCAGGATCCAAGTCTACCTGTCTATCCAGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113443 GCTGCTCAGGTGGCTGTCCAGGATCCAAGTCTACCTGTCTATCCAGCACT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 CCCACCCCAACGCTTTACTGGGCCTTCCCAAACAGACACTCATCAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113493 CCCACCCCAACGCTTTACTGGGCCTTCCCAAACAGACACTCATCAGCTGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 ATTCTGAAGCCACTCACACTGTGAAGCAACCCACTCCTGTCTCTCTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113543 ATTCTGAAGCCACTCACACTGTGAAGCAACCCACTCCTGTCTCTCTAGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 AGCGCCAACAGGATTTCAAGTAGTGCAAGTACTGCCCATGCCAGATTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113593 AGCGCCAACAGGATTTCAAGTAGTGCAAGTACTGCCCATGCCAGATTTGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 AACTTCGACCATCCAACCTCCTAGGGAGTATTCCAGCGTTTCCCCTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113643 AACTTCGACCATCCAACCTCCTAGGGAGTATTCCAGCGTTTCCCCTTGTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 CCAGAAGTGCTCCAATCCCCCAGGCTTCTCCCATTCCACACCCACATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113693 CCAGAAGTGCTCCAATCCCCCAGGCTTCTCCCATTCCACACCCACATGTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 TACCAGCCCCCTCCCCTTGGCCATCCAGCCACACTGTTCGGGACACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113743 TACCAGCCCCCTCCCCTTGGCCATCCAGCCACACTGTTCGGGACACCACC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 AAGATTCTCTTTTCATCACCCTTACTTCCTACCCGGACCTCACTACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113793 AAGATTCTCTTTTCATCACCCTTACTTCCTACCCGGACCTCACTACTTCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1874 CATCAAG         TACATGCCCTTACAGTCGGCCTCCCTTTGGCTAT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113843 CATCAAGGTA...CAGTACATGCCCTTACAGTCGGCCTCCCTTTGGCTAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1915 GGAAATTTTCCGAGTTCAATGCCAGAATGCCTTAGTTATTATGAAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125392 GGAAATTTTCCGAGTTCAATGCCAGAATGCCTTAGTTATTATGAAGACAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1965 GTACCCAAAACATGAGGGTATCTTTTCAACTTTAAATAGAGACTATTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125442 GTACCCAAAACATGAGGGTATCTTTTCAACTTTAAATAGAGACTATTCTT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2015 TTAGAGACTACTCAAGTGAATGCACACACAGTGAAAATTCTCGGAGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125492 TTAGAGACTACTCAAGTGAATGCACACACAGTGAAAATTCTCGGAGTTGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2065 GAGAACATGAATGGAACTTCTTACTATAACAGTCATAGCCACAGTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125542 GAGAACATGAATGGAACTTCTTACTATAACAGTCATAGCCACAGTGGGGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2115 AGAAAACTTAAACCCTGTGCCTCAGCTGGACATTGGAACCTTGGAGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125592 AGAAAACTTAAACCCTGTGCCTCAGCTGGACATTGGAACCTTGGAGAATG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2165 TCTTCACAGCCCCGACATCAACTCCTTCTAGCATCCAGCAAGTCAATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125642 TCTTCACAGCCCCGACATCAACTCCTTCTAGCATCCAGCAAGTCAATGTC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2215 ACCGACAGTGATGAGGAGGAAGAAGAAAAAGTGCTCAGGGATTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125692 ACCGACAGTGATGAGGAGGAAGAAGAAAAAGTGCTCAGGGATTTA

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