seq1 = pF1KB6167.tfa, 1947 bp
seq2 = pF1KB6167/gi568815586r_21370197.tfa (gi568815586r:21370197_21591718), 221522 bp

>pF1KB6167 1947
>gi568815586r:21370197_21591718 (Chr12)

(complement)

1-16  (92149-92164)   100% ->
17-214  (100003-100200)   100% ->
215-394  (101341-101520)   100% ->
395-501  (105134-105240)   100% ->
502-700  (108145-108343)   100% ->
701-867  (113750-113916)   100% ->
868-949  (114727-114808)   100% ->
950-1098  (115895-116043)   100% ->
1099-1216  (116134-116251)   100% ->
1217-1355  (116740-116878)   100% ->
1356-1447  (118077-118168)   100% ->
1448-1667  (120072-120291)   100% ->
1668-1797  (120621-120750)   100% ->
1798-1947  (121373-121522)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTCCGTTTCAG         CTCTAACTGAGGAACTGGATTCTAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
  92149 ATGGCGTCCGTTTCAGGTT...TAGCTCTAACTGAGGAACTGGATTCTAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AACCAGTGAGCTACATGCAGTAGAAATTCAAATTCAAGAACTTACGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100028 AACCAGTGAGCTACATGCAGTAGAAATTCAAATTCAAGAACTTACGGAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGCAACAAGAGCTTATTCAGAAAAAAAAAGTCCTGACAAAGAAAATAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100078 GGCAACAAGAGCTTATTCAGAAAAAAAAAGTCCTGACAAAGAAAATAAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGTGTTTAGAGGATTCTGATGCCGGGGCAAGCAATGAATATGATTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100128 CAGTGTTTAGAGGATTCTGATGCCGGGGCAAGCAATGAATATGATTCTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACCTGCCGCTTGGAATAAAGAAG         ATTTTCCATGGTCTGGTA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100178 ACCTGCCGCTTGGAATAAAGAAGGTT...TAGATTTTCCATGGTCTGGTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAGTTAAAGATATTCTGCAAAATGTCTTTAAACTGGAAAAGTTCAGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101359 AAGTTAAAGATATTCTGCAAAATGTCTTTAAACTGGAAAAGTTCAGACCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTTCAGCTTGAAACTATTAACGTAACAATGGCTGGAAAGGAGGTATTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101409 CTTCAGCTTGAAACTATTAACGTAACAATGGCTGGAAAGGAGGTATTTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGTTATGCCTACAGGAGGTGGAAAGAGCTTATGTTACCAGTTACCAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101459 TGTTATGCCTACAGGAGGTGGAAAGAGCTTATGTTACCAGTTACCAGCAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TATGTTCAGATG         GTTTTACACTCGTCATTTGCCCATTGATC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 101509 TATGTTCAGATGGTA...TAGGTTTTACACTCGTCATTTGCCCATTGATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCTCTTATGGAAGACCAATTAATGGTTTTAAAACAATTAGGAATTTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105163 TCTCTTATGGAAGACCAATTAATGGTTTTAAAACAATTAGGAATTTCAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AACCATGTTAAATGCTTCTAGTTCTAAG         GAGCATGTTAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 105213 AACCATGTTAAATGCTTCTAGTTCTAAGGTA...TAGGAGCATGTTAAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GGGTTCATGCTGAAATGGTAAATAAAAACTCCGAGTTAAAGCTGATTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108158 GGGTTCATGCTGAAATGGTAAATAAAAACTCCGAGTTAAAGCTGATTTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTGACTCCAGAGAAAATTGCAAAAAGCAAAATGTTTATGTCAAGACTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108208 GTGACTCCAGAGAAAATTGCAAAAAGCAAAATGTTTATGTCAAGACTAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GAAAGCCTATGAAGCAAGGAGATTTACTCGAATTGCTGTGGATGAAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108258 GAAAGCCTATGAAGCAAGGAGATTTACTCGAATTGCTGTGGATGAAGTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACTGCTGTAGTCAGTGGGGACATGATTTCAGACCTG         ATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 108308 ACTGCTGTAGTCAGTGGGGACATGATTTCAGACCTGGTA...CAGATTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAGGCACTTGGTATCTTAAAGCGGCAGTTCCCTAACGCATCACTAATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113755 AAGGCACTTGGTATCTTAAAGCGGCAGTTCCCTAACGCATCACTAATTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GCTGACTGCAACTGCAACAAATCACGTTTTGACGGATGCTCAGAAAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113805 GCTGACTGCAACTGCAACAAATCACGTTTTGACGGATGCTCAGAAAATTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGTGCATTGAAAAGTGTTTTACTTTTACAGCTTCTTTTAATAGGCCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113855 TGTGCATTGAAAAGTGTTTTACTTTTACAGCTTCTTTTAATAGGCCAAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTATATTATGAG         GTTCGGCAGAAGCCCTCAAACACTGAAGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 113905 CTATATTATGAGGTA...TAGGTTCGGCAGAAGCCCTCAAACACTGAAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TTTTATTGAGGATATTGTAAAGCTCATTAATGGGAGATACAAAGGGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114756 TTTTATTGAGGATATTGTAAAGCTCATTAATGGGAGATACAAAGGGCAAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CAG         GAATCATATATTGTTTTTCTCAGAAAGACTCTGAACAA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114806 CAGGTA...CAGGAATCATATATTGTTTTTCTCAGAAAGACTCTGAACAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GTTACGGTTAGTTTGCAGAATCTGGGAATTCATGCAGGTGCTTACCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115933 GTTACGGTTAGTTTGCAGAATCTGGGAATTCATGCAGGTGCTTACCATGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CAATTTGGAGCCAGAAGATAAGACCACAGTTCATAGAAAATGGTCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115983 CAATTTGGAGCCAGAAGATAAGACCACAGTTCATAGAAAATGGTCAGCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ATGAAATTCAG         GTAGTAGTGGCAACTGTTGCATTTGGTATG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 116033 ATGAAATTCAGGTT...CAGGTAGTAGTGGCAACTGTTGCATTTGGTATG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GGAATTGATAAGCCAGATGTGAGGTTTGTTATCCATCATTCAATGAGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116164 GGAATTGATAAGCCAGATGTGAGGTTTGTTATCCATCATTCAATGAGTAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 ATCCATGGAAAATTATTACCAAGAGAGTGGACGTGCAG         GTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 116214 ATCCATGGAAAATTATTACCAAGAGAGTGGACGTGCAGGTA...CAGGTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GAGATGACATGAAAGCAGACTGTATTTTGTACTACGGCTTTGGAGATATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116743 GAGATGACATGAAAGCAGACTGTATTTTGTACTACGGCTTTGGAGATATA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TTCAGAATAAGTTCAATGGTGGTGATGGAAAATGTGGGACAGCAGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116793 TTCAGAATAAGTTCAATGGTGGTGATGGAAAATGTGGGACAGCAGAAGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TTATGAGATGGTATCATACTGTCAAAACATAAGCAA         ATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 116843 TTATGAGATGGTATCATACTGTCAAAACATAAGCAAGTA...CAGATGTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 GTCGTGTGTTGATGGCTCAACATTTTGATGAAGTATGGAACTCAGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118082 GTCGTGTGTTGATGGCTCAACATTTTGATGAAGTATGGAACTCAGAAGCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 TGTAACAAAATGTGCGATAACTGCTGTAAAGACAGTG         CATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 118132 TGTAACAAAATGTGCGATAACTGCTGTAAAGACAGTGGTG...CAGCATT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 TGAAAGAAAGAACATAACAGAGTACTGCAGAGATCTAATCAAGATCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120076 TGAAAGAAAGAACATAACAGAGTACTGCAGAGATCTAATCAAGATCCTGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 AGCAGGCAGAGGAACTGAATGAAAAACTCACTCCATTGAAACTGATTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120126 AGCAGGCAGAGGAACTGAATGAAAAACTCACTCCATTGAAACTGATTGAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 TCTTGGATGGGAAAGGGTGCAGCAAAACTGAGAGTAGCAGGTGTTGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120176 TCTTGGATGGGAAAGGGTGCAGCAAAACTGAGAGTAGCAGGTGTTGTGGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 TCCCACACTTCCTCGTGAAGATCTGGAGAAGATTATTGCACACTTTCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120226 TCCCACACTTCCTCGTGAAGATCTGGAGAAGATTATTGCACACTTTCTAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 TACAGCAGTATCTTAA         AGAAGACTACAGTTTTACAGCTTAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 120276 TACAGCAGTATCTTAAGTA...CAGAGAAGACTACAGTTTTACAGCTTAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GCTACCATTTCGTATTTGAAAATAGGACCTAAAGCTAATCTTCTGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120646 GCTACCATTTCGTATTTGAAAATAGGACCTAAAGCTAATCTTCTGAACAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 TGAGGCACATGCTATTACTATGCAAGTGACAAAGTCCACGCAGAACTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120696 TGAGGCACATGCTATTACTATGCAAGTGACAAAGTCCACGCAGAACTCTT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 TCAGG         GCTGAATCGTCTCAAACTTGTCATTCTGAACAAGGT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120746 TCAGGGTA...TAGGCTGAATCGTCTCAAACTTGTCATTCTGAACAAGGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 GATAAAAAGATGGAGGAAAAAAATTCAGGCAACTTCCAGAAGAAGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121409 GATAAAAAGATGGAGGAAAAAAATTCAGGCAACTTCCAGAAGAAGGCTGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 AAACATGCTTCAGCAATCTGGTTCTAAGAATACAGGAGCTAAGAAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121459 AAACATGCTTCAGCAATCTGGTTCTAAGAATACAGGAGCTAAGAAAAGAA

   2050     .    :
   1934 AAATCGATGATGCC
        ||||||||||||||
 121509 AAATCGATGATGCC