Result of FASTA (ccds) for pF1KB0479
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB0479, 518 aa
  1>>>pF1KB0479 518 - 518 aa - 518 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0591+/-0.000673; mu= 15.4728+/- 0.041
 mean_var=82.7199+/-16.152, 0's: 0 Z-trim(112.2): 32  B-trim: 68 in 1/51
 Lambda= 0.141016
 statistics sampled from 12935 (12961) to 12935 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.752), E-opt: 0.2 (0.398), width:  16
 Scan time:  3.370

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4847.1 UNC5CL gene_id:222643|Hs108|chr6        ( 518) 3622 746.2  2e-215
CCDS3643.1 UNC5C gene_id:8633|Hs108|chr4           ( 931)  420 94.9 4.2e-19
CCDS83279.1 UNC5D gene_id:137970|Hs108|chr8        ( 948)  396 90.0 1.3e-17
CCDS6093.2 UNC5D gene_id:137970|Hs108|chr8         ( 953)  396 90.0 1.3e-17
CCDS34299.1 UNC5A gene_id:90249|Hs108|chr5         ( 842)  368 84.3 5.9e-16
CCDS58083.1 UNC5B gene_id:219699|Hs108|chr10       ( 934)  311 72.7   2e-12
CCDS7309.1 UNC5B gene_id:219699|Hs108|chr10        ( 945)  311 72.7   2e-12


>>CCDS4847.1 UNC5CL gene_id:222643|Hs108|chr6             (518 aa)
 initn: 3622 init1: 3622 opt: 3622  Z-score: 3980.9  bits: 746.2 E(32554): 2e-215
Smith-Waterman score: 3622; 99.8% identity (99.8% similar) in 518 aa overlap (1-518:1-518)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MCPQESSFQPSQFLLLVGVPVASVLLLAQCLRWHCPRRLLGACWTLNGQEEPVSQPTPQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MCPQESSFQPSQFLLLVGVPVASVLLLAQCLRWHCPRRLLGACWTLNGQEEPVSQPTPQL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 ENEVSRQHLPATLPEMVAFYQELHTPTQGQTMVRQLMHKLLVFSAREVDHRGGCLMLQDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 ENEVSRQHLPATLPEMVAFYQELHTPTQGQTMVRQLMHKLLVFSAREVDHRGGCLMLQDT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 GISLLIPPGAVAVGRQERVSLILVWDLSDAPSLSQAQGLVSPVVACGPHGASFLKPCTLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GISLLIPPGAVAVGRQERVSLILVWDLSDAPSLSQAQGLVSPVVACGPHGASFLKPCTLT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 FKHCAEQPSHARTYSSNTTLLDAKVWRPLGRPGAHASRDECRIHLSHFSLYTCVLEAPVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 FKHCAEQPSHARTYSSNTTLLDAKVWRPLGRPGAHASRDECRIHLSHFSLYTCVLEAPVG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 REARKWLQLAVFCSPLVPGQSHLQLRIYFLNNTPCALQWALTNEQPHGGRLRGPCQLFDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 REARKWLQLAVFCSPLVPGQSHLQLRIYFLNNTPCALQWALTNEQPHGGRLRGPCQLFDF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 NGARGDQCLKLTYISEGWENVDDSSCQLVPHLHIWHGKCPFRSFCFRRKAADENEDCSAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 NGARGDQCLKLTYISEGWENVDDSSCQLVPHLHIWHGKCPFRSFCFRRKAADENEDCSAL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 TNEIIVTMHTFQDGLETKYMEILRFQASEEESWAAPPPVSQPPPCNRLPPELFEQLRMLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TNEIIVTMHTFQDGLETKYMEILRFQASEEESWAAPPPVSQPPPCNRLPPELFEQLRMLL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB0 EPNSITGNDWRGLASHLGLCGMKIRFLSCQRSPAAAILELFEEQNGSLQELHYLMTVMER
       ::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EPNSITGNDWRRLASHLGLCGMKIRFLSCQRSPAAAILELFEEQNGSLQELHYLMTVMER
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510        
pF1KB0 LDCASAIQNYLSGTHGGSPGPERGGARDNQGLELDEKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LDCASAIQNYLSGTHGGSPGPERGGARDNQGLELDEKL
              490       500       510        

>>CCDS3643.1 UNC5C gene_id:8633|Hs108|chr4                (931 aa)
 initn: 324 init1: 211 opt: 420  Z-score: 456.4  bits: 94.9 E(32554): 4.2e-19
Smith-Waterman score: 422; 25.7% identity (53.4% similar) in 459 aa overlap (52-481:469-916)

              30        40        50        60        70        80 
pF1KB0 ASVLLLAQCLRWHCPRRLLGACWTLNGQEEPVSQPTPQLENEVSRQHLPATLPEMVAFYQ
                                     :. .: :.:. .:      .:  . .. . 
CCDS36 PPDLTSAAAMYRGPVYALHDVSDKIPMTNSPILDPLPNLKIKVYNTSGAVTPQDDLSEFT
      440       450       460       470       480       490        

              90       100        110                 120       130
pF1KB0 ELHTPTQGQTMVRQLMHKLLVFS-AREVDHR----------GGCLMLQDTGISLLIPPGA
          .: . :.....   .:   : ::..:            :: :.. ..:.::::: ::
CCDS36 SKLSPQMTQSLLENEALSLKNQSLARQTDPSCTAFGSFNSLGGHLIVPNSGVSLLIPAGA
      500       510       520       530       540       550        

              140       150       160       170       180       190
pF1KB0 VAVGRQERVSLILVWDLSDAPSLSQAQGLVSPVVACGPHGASFLKPCTLTFKHCAEQPSH
       .  ::  .. . .    .  : ....: :..:::.::: :: . .: .::..:::.  ..
CCDS36 IPQGRVYEMYVTVHRKETMRPPMDDSQTLLTPVVSCGPPGALLTRPVVLTMHHCADPNTE
      560       570       580       590       600       610        

              200       210       220           230       240      
pF1KB0 ARTYSSNTTLLDAKVWRPLGRPGAHASRDECRIHLS----HFSLYTCVLEAPVG----RE
             ..   ... :. .   : .     : :.:.    :.   .    : ::    . 
CCDS36 DWKILLKNQAAQGQ-WEDVVVVGEENFTTPCYIQLDAEACHILTENLSTYALVGHSTTKA
      620       630        640       650       660       670       

            250       260       270       280       290       300  
pF1KB0 ARKWLQLAVFCSPLVPGQSHLQLRIYFLNNTPCALQWALTNEQPHGGRLRGPCQLFDFNG
       : : :.::.: .::  .. . ..:.: :..:  ::.  :  :.  ::.:    . . :.:
CCDS36 AAKRLKLAIF-GPLCCSSLEYSIRVYCLDDTQDALKEILHLERQMGGQLLEEPKALHFKG
       680        690       700       710       720       730      

            310        320       330       340       350       360 
pF1KB0 ARGDQCLKLTYISEG-WENVDDSSCQLVPHLHIWHGKCPFRSFCFRRKAADENEDCSALT
       .  .  :..  :... :..   .. : .:  :.: :.       :        :  :  :
CCDS36 STHNLRLSIHDIAHSLWKSKLLAKYQEIPFYHVWSGSQRNLHCTFTL------ERFSLNT
        740       750       760       770       780             790

             370       380       390       400                410  
pF1KB0 NEIIVTMHTFQDGLETKYMEILRFQASEEESWAAPPPVSQP---------PPCNRLPPEL
        :..  . . :   : . .. :   .::: . .   :. .:         :    .:  .
CCDS36 VELVCKLCVRQVEGEGQIFQ-LNCTVSEEPT-GIDLPLLDPANTITTVTGPSAFSIPLPI
              800       810        820        830       840        

            420       430       440       450       460       470  
pF1KB0 FEQLRMLLEPNSITGNDWRGLASHLGLCGMKIRFLSCQRSPAAAILELFEEQNGSLQELH
        ..:   :.  .  :.::: :: .:.:    . ... . ::...::.:.: ::    .: 
CCDS36 RQKLCSSLDAPQTRGHDWRMLAHKLNL-DRYLNYFATKSSPTGVILDLWEAQNFPDGNLS
      850       860       870        880       890       900       

            480       490       500       510        
pF1KB0 YLMTVMERLDCASAIQNYLSGTHGGSPGPERGGARDNQGLELDEKL
       .: .:.:..                                     
CCDS36 MLAAVLEEMGRHETVVSLAAEGQY                      
       910       920       930                       

>>CCDS83279.1 UNC5D gene_id:137970|Hs108|chr8             (948 aa)
 initn: 278 init1: 103 opt: 396  Z-score: 429.9  bits: 90.0 E(32554): 1.3e-17
Smith-Waterman score: 396; 26.3% identity (57.8% similar) in 391 aa overlap (110-481:545-920)

      80        90       100       110       120       130         
pF1KB0 YQELHTPTQGQTMVRQLMHKLLVFSAREVDHRGGCLMLQDTGISLLIPPGAVAVGRQERV
                                     : :: :.. .::.::::: ::.     :. 
CCDS83 TMHPRNKMPYIQNLSSLPTRTELRTTGVFGHLGGRLVMPNTGVSLLIPHGAIP----EEN
          520       530       540       550       560           570

     140       150           160       170       180       190     
pF1KB0 SLILVWDLSDA-PSLSQAQG---LVSPVVACGPHGASFLKPCTLTFKHCAEQPSHARTYS
       :  .  ..... ::: :..:   :.:: :.:::       : .::. :::.  :.  .  
CCDS83 SWEIYMSINQGEPSL-QSDGSEVLLSPEVTCGPPDMIVTTPFALTIPHCADVSSEHWNIH
              580        590       600       610       620         

         200       210            220         230       240        
pF1KB0 SNTTLLDAKVWRPLGRPGAHASR-----DE--CRIHLSHFSLYTCVLEAPVGREARKWLQ
        .    ..: :. .     ...      :   :.. :. :. :. . : :.   : : :.
CCDS83 LKKRTQQGK-WEEVMSVEDESTSCYCLLDPFACHVLLDSFGTYALTGE-PITDCAVKQLK
     630        640       650       660       670        680       

      250        260       270       280       290       300       
pF1KB0 LAVF-CSPLVPGQSHLQLRIYFLNNTPCALQWALTNEQPHGGRLRGPCQLFDFNGARGDQ
       .::: :  .  ..   .::.: ..:::::.: ....:. .::.:    .:. :.:   . 
CCDS83 VAVFGC--MSCNSLDYNLRVYCVDNTPCAFQEVVSDERHQGGQLLEEPKLLHFKGNTFSL
       690         700       710       720       730       740     

       310        320       330        340        350        360   
pF1KB0 CLKLTYISEG-WENVDDSSCQLVPHLHIW-HGKCPFR-SFCFRRKAADENE-DCSALTNE
        ...  :    :.    ..:: ::  ..:  .. :.. .: ..: .   .. .:.    .
CCDS83 QISVLDIPPFLWRIKPFTACQEVPFSRVWCSNRQPLHCAFSLERYTPTTTQLSCKICIRQ
         750       760       770       780       790       800     

           370          380       390       400       410       420
pF1KB0 IIVTMHTFQ---DGLETKYMEILRFQASEEESWAAPPPVSQPPPCNRLPPELFEQLRMLL
       .    . .:   . ::..  : . : :.:. ..    :..  :   ..:  . ...   .
CCDS83 LKGHEQILQVQTSILESER-ETITFFAQEDSTF----PAQTGPKAFKIPYSIRQRICATF
         810       820        830           840       850       860

              430       440       450       460       470       480
pF1KB0 EPNSITGNDWRGLASHLGLCGMKIRFLSCQRSPAAAILELFEEQNGSLQELHYLMTVMER
       .  .  :.::. ::.. .. . .. ... : ::.:.::.:.: ..    .:  :  ..:.
CCDS83 DTPNAKGKDWQMLAQKNSI-NRNLSYFATQSSPSAVILNLWEARHQHDGDLDSLACALEE
              870        880       890       900       910         

              490       500       510        
pF1KB0 LDCASAIQNYLSGTHGGSPGPERGGARDNQGLELDEKL
       .                                     
CCDS83 IGRTHTKLSNISESQLDEADFNYSRQNGL         
     920       930       940                 

>>CCDS6093.2 UNC5D gene_id:137970|Hs108|chr8              (953 aa)
 initn: 278 init1: 103 opt: 396  Z-score: 429.9  bits: 90.0 E(32554): 1.3e-17
Smith-Waterman score: 396; 26.3% identity (57.8% similar) in 391 aa overlap (110-481:550-925)

      80        90       100       110       120       130         
pF1KB0 YQELHTPTQGQTMVRQLMHKLLVFSAREVDHRGGCLMLQDTGISLLIPPGAVAVGRQERV
                                     : :: :.. .::.::::: ::.     :. 
CCDS60 TMHPRNKMPYIQNLSSLPTRTELRTTGVFGHLGGRLVMPNTGVSLLIPHGAIP----EEN
     520       530       540       550       560       570         

     140       150           160       170       180       190     
pF1KB0 SLILVWDLSDA-PSLSQAQG---LVSPVVACGPHGASFLKPCTLTFKHCAEQPSHARTYS
       :  .  ..... ::: :..:   :.:: :.:::       : .::. :::.  :.  .  
CCDS60 SWEIYMSINQGEPSL-QSDGSEVLLSPEVTCGPPDMIVTTPFALTIPHCADVSSEHWNIH
         580       590        600       610       620       630    

         200       210            220         230       240        
pF1KB0 SNTTLLDAKVWRPLGRPGAHASR-----DE--CRIHLSHFSLYTCVLEAPVGREARKWLQ
        .    ..: :. .     ...      :   :.. :. :. :. . : :.   : : :.
CCDS60 LKKRTQQGK-WEEVMSVEDESTSCYCLLDPFACHVLLDSFGTYALTGE-PITDCAVKQLK
          640        650       660       670       680        690  

      250        260       270       280       290       300       
pF1KB0 LAVF-CSPLVPGQSHLQLRIYFLNNTPCALQWALTNEQPHGGRLRGPCQLFDFNGARGDQ
       .::: :  .  ..   .::.: ..:::::.: ....:. .::.:    .:. :.:   . 
CCDS60 VAVFGC--MSCNSLDYNLRVYCVDNTPCAFQEVVSDERHQGGQLLEEPKLLHFKGNTFSL
              700       710       720       730       740       750

       310        320       330        340        350        360   
pF1KB0 CLKLTYISEG-WENVDDSSCQLVPHLHIW-HGKCPFR-SFCFRRKAADENE-DCSALTNE
        ...  :    :.    ..:: ::  ..:  .. :.. .: ..: .   .. .:.    .
CCDS60 QISVLDIPPFLWRIKPFTACQEVPFSRVWCSNRQPLHCAFSLERYTPTTTQLSCKICIRQ
              760       770       780       790       800       810

           370          380       390       400       410       420
pF1KB0 IIVTMHTFQ---DGLETKYMEILRFQASEEESWAAPPPVSQPPPCNRLPPELFEQLRMLL
       .    . .:   . ::..  : . : :.:. ..    :..  :   ..:  . ...   .
CCDS60 LKGHEQILQVQTSILESER-ETITFFAQEDSTF----PAQTGPKAFKIPYSIRQRICATF
              820        830       840           850       860     

              430       440       450       460       470       480
pF1KB0 EPNSITGNDWRGLASHLGLCGMKIRFLSCQRSPAAAILELFEEQNGSLQELHYLMTVMER
       .  .  :.::. ::.. .. . .. ... : ::.:.::.:.: ..    .:  :  ..:.
CCDS60 DTPNAKGKDWQMLAQKNSI-NRNLSYFATQSSPSAVILNLWEARHQHDGDLDSLACALEE
         870       880        890       900       910       920    

              490       500       510        
pF1KB0 LDCASAIQNYLSGTHGGSPGPERGGARDNQGLELDEKL
       .                                     
CCDS60 IGRTHTKLSNISESQLDEADFNYSRQNGL         
          930       940       950            

>>CCDS34299.1 UNC5A gene_id:90249|Hs108|chr5              (842 aa)
 initn: 233 init1: 201 opt: 368  Z-score: 399.9  bits: 84.3 E(32554): 5.9e-16
Smith-Waterman score: 395; 26.5% identity (54.4% similar) in 423 aa overlap (68-471:411-820)

        40        50        60        70        80        90       
pF1KB0 RLLGACWTLNGQEEPVSQPTPQLENEVSRQHLPATLPEMVAFYQELHTPTQGQTMVRQLM
                                     :  .   :   : ..: :    :.. :.: 
CCDS34 LCPRQDGPSPKFQLTNGHLLSPLGGGRHTLHHSSPTSEAEEFVSRLST----QNYFRSLP
              390       400       410       420           430      

       100       110       120       130       140       150       
pF1KB0 HKLLVFSAREVDHRGGCLMLQDTGISLLIPPGAVAVGRQERVSLILVWDLSDAPSLSQAQ
       .    ..    .  :: ::. .::::::::: :.  :.  .. : :    .    :.  :
CCDS34 RGTSNMTYGTFNFLGGRLMIPNTGISLLIPPDAIPRGKIYEIYLTLHKPEDVRLPLAGCQ
        440       450       460       470       480       490      

       160       170       180       190       200       210       
pF1KB0 GLVSPVVACGPHGASFLKPCTLTFKHCAEQPSHARTYSSNTTLLDAKVWRPLGRPGAHAS
        :.::.:.::: :. . .:  :.. ::.:    . .   .    ... :. . . : .: 
CCDS34 TLLSPIVSCGPPGVLLTRPVILAMDHCGEPSPDSWSLRLKKQSCEGS-WEDVLHLGEEAP
        500       510       520       530       540        550     

         220       230         240           250       260         
pF1KB0 RD--ECRIHLSHFSLYTCVLE--APVGRE----ARKWLQLAVFCSPLVPGQSHLQLRIYF
            :... :   ..:  :   : ::.     : : :.: .: .:..  . . ..:.: 
CCDS34 SHLYYCQLEASACYVFTEQLGRFALVGEALSVAAAKRLKLLLF-APVACTSLEYNIRVYC
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pF1KB0 LNNTPCALQWALTNEQPHGGRLRGPCQLFDFNGARGDQCLKLTYI-SEGWENVDDSSCQL
       :..:  ::. ..  :.  ::.:    ... :. .  .  :..  . :  :..    : : 
CCDS34 LHDTHDALKEVVQLEKQLGGQLIQEPRVLHFKDSYHNLRLSIHDVPSSLWKSKLLVSYQE
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pF1KB0 VPHLHIWHGKCPFR--SFCFRRKAADENE-DCSALTNEIIVTMHTFQDGL----ETKYME
       .:  :::.:   .   .: ..: . . ..  :.  . ..    ..:. ..    .:.. :
CCDS34 IPFYHIWNGTQRYLHCTFTLERVSPSTSDLACKLWVWQVEGDGQSFSINFNITKDTRFAE
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             390       400       410       420       430       440 
pF1KB0 ILRFQASEEESWAAPPPVSQPPPCNRLPPELFEQLRMLLEPNSITGNDWRGLASHLGLCG
       .: .     :: :. : .  :    ..:  . ...   :.:    : ::: ::..: :  
CCDS34 LLAL-----ESEAGVPALVGPSAF-KIPFLIRQKIISSLDPPCRRGADWRTLAQKLHL-D
               740       750        760       770       780        

             450       460          470       480       490        
pF1KB0 MKIRFLSCQRSPAAAILELFEEQ---NGSLQELHYLMTVMERLDCASAIQNYLSGTHGGS
        .. :.. . ::.: ::.:.: .   ::.:..:                           
CCDS34 SHLSFFASKPSPTAMILNLWEARHFPNGNLSQLAAAVAGLGQPDAGLFTVSEAEC     
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      500       510        
pF1KB0 PGPERGGARDNQGLELDEKL

>>CCDS58083.1 UNC5B gene_id:219699|Hs108|chr10            (934 aa)
 initn: 294 init1: 187 opt: 311  Z-score: 336.5  bits: 72.7 E(32554): 2e-12
Smith-Waterman score: 394; 27.8% identity (55.9% similar) in 388 aa overlap (112-481:542-919)

              90       100       110       120       130       140 
pF1KB0 ELHTPTQGQTMVRQLMHKLLVFSAREVDHRGGCLMLQDTGISLLIPPGAVAVGRQERVSL
                                     :: : .  ::.:::.: ::.  :.  .. :
CCDS58 HLRSASLGSQQLLGLPRDPGSSVSGTFGCLGGRLSIPGTGVSLLVPNGAIPQGKFYEMYL
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pF1KB0 ILVWDLSDAPSLSQAQGLVSPVVACGPHGASFLKPCTLTFKHCAEQPSHARTYSSNTTLL
       ..    :  :    .: ..:: :.::: :  . .:  ::. ::::  ..   .. .:   
CCDS58 LINKAESTLPLSEGTQTVLSPSVTCGPTGLLLCRPVILTMPHCAEVSARDWIFQLKTQAH
             580       590       600       610       620       630 

                     210        220       230       240       250  
pF1KB0 DAKVWRP--------LGRPG-AHASRDECRIHLSHFSLYTCVLEAPVGREARKWLQLAVF
       ... :.         :. :   .     :.: :.... :. . :.  .: : : ::::::
CCDS58 QGH-WEEVVTLDEETLNTPCYCQLEPRACHILLDQLGTYVFTGES-YSRSAVKRLQLAVF
              640       650       660       670        680         

            260       270       280       290       300       310  
pF1KB0 CSPLVPGQSHLQLRIYFLNNTPCALQWALTNEQPHGGRLRGPCQLFDFNGARGDQCLKLT
        .: .  . . .::.: :..:: ::. .:  :.  :: :    . . :. .  .  :.: 
CCDS58 -APALCTSLEYSLRVYCLEDTPVALKEVLELERTLGGYLVEEPKPLMFKDSYHNLRLSLH
      690       700       710       720       730       740        

             320       330         340       350        360        
pF1KB0 YISEG-WENVDDSSCQLVPHLHIWHG--KCPFRSFCFRRKAADENE-DCSALTNEIIVTM
        . .. :..   .. : .:  ::: :  :    .: ..:..   .:  :.  . ..    
CCDS58 DLPHAHWRSKLLAKYQEIPFYHIWSGSQKALHCTFTLERHSLASTELTCKICVRQVEGEG
      750       760       770       780       790       800        

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pF1KB0 HTFQDGLETKYMEILRFQASEEESWAAPPP---VSQPPPCN-RLPPELFEQLRMLLE-PN
       . ::  :.:   :     :.  ..  . :    ..:  :   ..:  . ...   :. ::
CCDS58 QIFQ--LHTTLAET---PAGSLDTLCSAPGSTVTTQLGPYAFKIPLSIRQKICNSLDAPN
      810         820          830       840       850       860   

           430       440       450       460       470       480   
pF1KB0 SITGNDWRGLASHLGLCGMKIRFLSCQRSPAAAILELFEEQNGSLQELHYLMTVMERLDC
       :  ::::: ::..:..    . ... . ::...::.:.:  . .  .:. : ...:..  
CCDS58 S-RGNDWRMLAQKLSM-DRYLNYFATKASPTGVILDLWEALQQDDGDLNSLASALEEMGK
            870        880       890       900       910       920 

           490       500       510        
pF1KB0 ASAIQNYLSGTHGGSPGPERGGARDNQGLELDEKL
                                          
CCDS58 SEMLVAVATDGDC                      
             930                          

>>CCDS7309.1 UNC5B gene_id:219699|Hs108|chr10             (945 aa)
 initn: 294 init1: 187 opt: 311  Z-score: 336.5  bits: 72.7 E(32554): 2e-12
Smith-Waterman score: 394; 27.8% identity (55.9% similar) in 388 aa overlap (112-481:553-930)

              90       100       110       120       130       140 
pF1KB0 ELHTPTQGQTMVRQLMHKLLVFSAREVDHRGGCLMLQDTGISLLIPPGAVAVGRQERVSL
                                     :: : .  ::.:::.: ::.  :.  .. :
CCDS73 HLRSASLGSQQLLGLPRDPGSSVSGTFGCLGGRLSIPGTGVSLLVPNGAIPQGKFYEMYL
            530       540       550       560       570       580  

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pF1KB0 ILVWDLSDAPSLSQAQGLVSPVVACGPHGASFLKPCTLTFKHCAEQPSHARTYSSNTTLL
       ..    :  :    .: ..:: :.::: :  . .:  ::. ::::  ..   .. .:   
CCDS73 LINKAESTLPLSEGTQTVLSPSVTCGPTGLLLCRPVILTMPHCAEVSARDWIFQLKTQAH
            590       600       610       620       630       640  

                     210        220       230       240       250  
pF1KB0 DAKVWRP--------LGRPG-AHASRDECRIHLSHFSLYTCVLEAPVGREARKWLQLAVF
       ... :.         :. :   .     :.: :.... :. . :.  .: : : ::::::
CCDS73 QGH-WEEVVTLDEETLNTPCYCQLEPRACHILLDQLGTYVFTGES-YSRSAVKRLQLAVF
             650       660       670       680        690       700

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pF1KB0 CSPLVPGQSHLQLRIYFLNNTPCALQWALTNEQPHGGRLRGPCQLFDFNGARGDQCLKLT
        .: .  . . .::.: :..:: ::. .:  :.  :: :    . . :. .  .  :.: 
CCDS73 -APALCTSLEYSLRVYCLEDTPVALKEVLELERTLGGYLVEEPKPLMFKDSYHNLRLSLH
               710       720       730       740       750         

             320       330         340       350        360        
pF1KB0 YISEG-WENVDDSSCQLVPHLHIWHG--KCPFRSFCFRRKAADENE-DCSALTNEIIVTM
        . .. :..   .. : .:  ::: :  :    .: ..:..   .:  :.  . ..    
CCDS73 DLPHAHWRSKLLAKYQEIPFYHIWSGSQKALHCTFTLERHSLASTELTCKICVRQVEGEG
     760       770       780       790       800       810         

      370       380       390          400        410       420    
pF1KB0 HTFQDGLETKYMEILRFQASEEESWAAPPP---VSQPPPCN-RLPPELFEQLRMLLE-PN
       . ::  :.:   :     :.  ..  . :    ..:  :   ..:  . ...   :. ::
CCDS73 QIFQ--LHTTLAET---PAGSLDTLCSAPGSTVTTQLGPYAFKIPLSIRQKICNSLDAPN
     820         830          840       850       860       870    

           430       440       450       460       470       480   
pF1KB0 SITGNDWRGLASHLGLCGMKIRFLSCQRSPAAAILELFEEQNGSLQELHYLMTVMERLDC
       :  ::::: ::..:..    . ... . ::...::.:.:  . .  .:. : ...:..  
CCDS73 S-RGNDWRMLAQKLSM-DRYLNYFATKASPTGVILDLWEALQQDDGDLNSLASALEEMGK
           880        890       900       910       920       930  

           490       500       510        
pF1KB0 ASAIQNYLSGTHGGSPGPERGGARDNQGLELDEKL
                                          
CCDS73 SEMLVAVATDGDC                      
            940                           




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