Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6680
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6680, 456 aa
1>>>pF1KB6680 456 - 456 aa - 456 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6472+/-0.00148; mu= -1.4367+/- 0.089
mean_var=305.7599+/-61.165, 0's: 0 Z-trim(108.9): 134 B-trim: 73 in 2/50
Lambda= 0.073347
statistics sampled from 10425 (10547) to 10425 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.324), width: 16
Scan time: 3.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 ( 456) 2918 322.8 4.5e-88
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 458) 2025 228.3 1.3e-59
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 420) 2007 226.4 4.5e-59
CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 ( 472) 1871 212.0 1e-54
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 ( 473) 1844 209.2 7.6e-54
CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17 ( 432) 1709 194.8 1.4e-49
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 ( 584) 1624 186.0 9e-47
CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17 ( 400) 1554 178.4 1.2e-44
CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 ( 494) 1509 173.7 3.7e-43
CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17 ( 623) 1484 171.2 2.7e-42
CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17 ( 525) 1413 163.6 4.4e-40
CCDS11376.1 KRT28 gene_id:162605|Hs108|chr17 ( 464) 1375 159.5 6.5e-39
CCDS11375.1 KRT27 gene_id:342574|Hs108|chr17 ( 459) 1374 159.4 7e-39
CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17 ( 467) 1321 153.8 3.4e-37
CCDS11373.1 KRT25 gene_id:147183|Hs108|chr17 ( 450) 1320 153.7 3.6e-37
CCDS11394.2 KRT35 gene_id:3886|Hs108|chr17 ( 455) 1270 148.4 1.4e-35
CCDS11374.1 KRT26 gene_id:353288|Hs108|chr17 ( 468) 1247 146.0 7.8e-35
CCDS11393.1 KRT32 gene_id:3882|Hs108|chr17 ( 448) 1217 142.8 6.9e-34
CCDS11379.1 KRT20 gene_id:54474|Hs108|chr17 ( 424) 1203 141.3 1.8e-33
CCDS11388.1 KRT33A gene_id:3883|Hs108|chr17 ( 404) 1178 138.6 1.1e-32
CCDS11391.1 KRT31 gene_id:3881|Hs108|chr17 ( 416) 1178 138.6 1.1e-32
CCDS11389.1 KRT33B gene_id:3884|Hs108|chr17 ( 404) 1167 137.5 2.5e-32
CCDS11390.1 KRT34 gene_id:3885|Hs108|chr17 ( 436) 1156 136.3 5.9e-32
CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12 ( 430) 1095 129.9 5.1e-30
CCDS11380.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 422) 1069 127.1 3.4e-29
CCDS42320.1 KRT40 gene_id:125115|Hs108|chr17 ( 431) 1057 125.9 8.3e-29
CCDS11382.1 KRT39 gene_id:390792|Hs108|chr17 ( 491) 1056 125.8 9.8e-29
CCDS11392.1 KRT38 gene_id:8687|Hs108|chr17 ( 456) 1044 124.5 2.3e-28
CCDS32653.1 KRT37 gene_id:8688|Hs108|chr17 ( 449) 1036 123.6 4e-28
CCDS62182.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 285) 769 95.2 9.3e-20
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 ( 470) 667 84.6 2.3e-16
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 431) 663 84.2 3e-16
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 432) 661 83.9 3.4e-16
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 438) 661 84.0 3.5e-16
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 483) 651 82.9 7.7e-16
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 511) 651 83.0 8.1e-16
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 ( 466) 637 81.4 2.1e-15
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8 ( 916) 639 81.9 2.9e-15
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12 ( 469) 627 80.4 4.4e-15
CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12 ( 590) 621 79.8 8e-15
CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8 ( 543) 609 78.5 1.8e-14
CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10 ( 499) 606 78.2 2.1e-14
CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12 ( 600) 606 78.3 2.4e-14
CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 ( 551) 604 78.0 2.7e-14
CCDS8824.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12 ( 507) 591 76.6 6.5e-14
CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12 ( 564) 581 75.6 1.5e-13
CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12 ( 564) 579 75.4 1.7e-13
CCDS8828.1 KRT6B gene_id:3854|Hs108|chr12 ( 564) 577 75.2 2e-13
CCDS13858.1 NEFH gene_id:4744|Hs108|chr22 (1020) 581 75.8 2.2e-13
CCDS8823.1 KRT83 gene_id:3889|Hs108|chr12 ( 493) 573 74.7 2.4e-13
>>CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 (456 aa)
initn: 2918 init1: 2918 opt: 2918 Z-score: 1694.6 bits: 322.8 E(32554): 4.5e-88
Smith-Waterman score: 2918; 99.6% identity (100.0% similar) in 456 aa overlap (1-456:1-456)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTTTFLQTSSSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSGGGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MTTTFLQTSSSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSGGGY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLASYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLASYL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 DKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPASPECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRVILE
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRVILE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 IDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEELAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEELAYL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 KKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDVEAWFFSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDVEAWFFSK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 TEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAETECRYATQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAETECRYATQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 LQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMAGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMAGI
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KB6 GIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI
430 440 450
>>CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 (458 aa)
initn: 2255 init1: 1882 opt: 2025 Z-score: 1183.9 bits: 228.3 E(32554): 1.3e-59
Smith-Waterman score: 2104; 75.9% identity (89.1% similar) in 440 aa overlap (27-451:13-446)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTTTFLQTSSSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSGGGY
:::::::: . ::: :..:. :.::::.::.:::
CCDS11 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGGG-RGVSTCSTRFVSGGSAGGY
10 20 30 40
70 80 90 100
pF1KB6 GGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGG---------------DGGLLSGNE
:::. ::::::::: ::::.:::.:::.:::.::: :::::.:::
CCDS11 GGGVS-CGFGGGAGSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNE
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110 120 130 140 150 160
pF1KB6 KITMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPASPECDYSQYFKTIEELRD
:::::::::::::::.::::::::::::::::.::. ::.::::: ::: :.::::::::
CCDS11 KITMQNLNDRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRD
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 KIMATTIDNSRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTD
::...::.:.::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::..::
CCDS11 KILTATIENNRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTD
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 LEMQIEGLNEELAYLKKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAM
::::::.:::::::.::::::::::::.:..:::::::::.::.::::::::::::::::
CCDS11 LEMQIESLNEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAM
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 AEKNRRDVEAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAG
::.::::.: :: .:. ::::::..:: ::::::::::.::::.: ::::::::::::::
CCDS11 AERNRRDAEEWFHTKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAG
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 LENSLAETECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIAT
:::..:::::::: :::::::::...:::::::: ::: :::::::::::::::::::::
CCDS11 LENTVAETECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIAT
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KB6 YRSLLEGQDAKMAGIGIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI
:::::::::::: :. ::.:. : . ... :.. ..:.
CCDS11 YRSLLEGQDAKMIGF----PSSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP
410 420 430 440 450
>>CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 (420 aa)
initn: 1868 init1: 1868 opt: 2007 Z-score: 1174.1 bits: 226.4 E(32554): 4.5e-59
Smith-Waterman score: 2086; 80.5% identity (91.9% similar) in 405 aa overlap (27-416:13-415)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTTTFLQTSSSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSGGGY
:::::::: . ::: :..:. :.::::.::.:::
CCDS11 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGGG-RGVSTCSTRFVSGGSAGGY
10 20 30 40
70 80 90 100
pF1KB6 GGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGG---------------DGGLLSGNE
:::. ::::::::: ::::.:::.:::.:::.::: :::::.:::
CCDS11 GGGVS-CGFGGGAGSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNE
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 KITMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPASPECDYSQYFKTIEELRD
:::::::::::::::.::::::::::::::::.::. ::.::::: ::: :.::::::::
CCDS11 KITMQNLNDRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRD
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 KIMATTIDNSRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTD
::...::.:.::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::..::
CCDS11 KILTATIENNRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTD
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 LEMQIEGLNEELAYLKKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAM
::::::.:::::::.::::::::::::.:..:::::::::.::.::::::::::::::::
CCDS11 LEMQIESLNEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAM
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 AEKNRRDVEAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAG
::.::::.: :: .:. ::::::..:: ::::::::::.::::.: ::::::::::::::
CCDS11 AERNRRDAEEWFHTKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAG
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 LENSLAETECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIAT
:::..:::::::: :::::::::...:::::::: ::: :::::::::::::::::::::
CCDS11 LENTVAETECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIAT
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KB6 YRSLLEGQDAKMAGIGIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI
:::::::::::
CCDS11 YRSLLEGQDAKKRQPP
410 420
>>CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 (472 aa)
initn: 1822 init1: 1336 opt: 1871 Z-score: 1095.6 bits: 212.0 E(32554): 1e-54
Smith-Waterman score: 1871; 66.6% identity (86.9% similar) in 449 aa overlap (14-454:25-466)
10 20 30 40
pF1KB6 MTTTFLQTSSSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSA
::::.: .:.::::. . : ::: .:.::.
CCDS11 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGS-CRAPSTYGGG----LSVSSS
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 RFVSSGS---GGGYGGGMRVCG--FGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGN
:: :.:. :::::::. . ::.: :. .:::.:.:.::::::::.:::: :: :.
CCDS11 RFSSGGACGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDG-LLVGS
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 EKITMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPASPECDYSQYFKTIEELR
::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::.: :: . ::: ::::::.::
CCDS11 EKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIK-DYSPYFKTIEDLR
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 DKIMATTIDNSRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLART
.::...:.::. :.:.:::::::::::: :::.:: ::..:::::::::::::::::::.
CCDS11 NKILTATVDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 DLEMQIEGLNEELAYLKKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEA
:::::::.:.::::::::::::::. . .:..:.:::::::::::::.:.: :::.:::
CCDS11 DLEMQIESLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEK
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 MAEKNRRDVEAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKA
::::::.:.: :::.::::::.:::.:.:..:..:.::..::::::.:::::::::::::
CCDS11 MAEKNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 GLENSLAETECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIA
.::::: ::. :: :: ::: .::..: ::..:::::: ::::::.:::.:::::::::
CCDS11 SLENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIA
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KB6 TYRSLLEGQDAKMAGIGIREASSGG---GGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI
::: ::::.::.... . .:... .:: ... .: . ::.:::.:..
CCDS11 TYRRLLEGEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN
420 430 440 450 460 470
>>CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 (473 aa)
initn: 1786 init1: 1368 opt: 1844 Z-score: 1080.2 bits: 209.2 E(32554): 7.6e-54
Smith-Waterman score: 1844; 69.6% identity (86.7% similar) in 428 aa overlap (14-433:25-440)
10 20 30 40
pF1KB6 MTTTFLQTSSSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSA
::::.: .:.::::. . : ::: .:.::
CCDS11 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGS-CRAPSTYGGG----LSVSS-
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 RFVSSGS---GGGYGGGMRVC-----GFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLL
:: :.:. :::::::. ::::: :. .:.:::::.:.::::::.:::: ::
CCDS11 RFSSGGACGLGGGYGGGFSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGGDG-LL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 SGNEKITMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPASPECDYSQYFKTIE
:.::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::.: :. . ::: ::::::
CCDS11 VGSEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIK-DYSPYFKTIE
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 ELRDKIMATTIDNSRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTL
.::.::.:.::.:.. ::.:::::::::::: :::.:::::: ::::.::::::::::::
CCDS11 DLRNKIIAATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 ARTDLEMQIEGLNEELAYLKKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQ
::::::::::::.::::::.::::::: . .: .:.:::::::::::::.:.: :::.:
CCDS11 ARTDLEMQIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 YEAMAEKNRRDVEAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLS
:: ::::::::.:.::.:::::::::::::.:..:.:..:.:.:::..: ::::::::::
CCDS11 YEQMAEKNRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 MKAGLENSLAETECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQ
:::.::::: ::. :: ::.:::::::..: ::..:::::: :.:::..:::.::::::
CCDS11 MKASLENSLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQ
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KB6 EIATYRSLLEGQDAKMAGIGIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI
:::::: ::::.::.... . .:: . ::
CCDS11 EIATYRRLLEGEDAHLSS----QQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFS
420 430 440 450 460
CCDS11 QGQSS
470
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10 20 30 40 50 60
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:::.. : .::. : .:.: :.::.. . :::: : :.: :. ::.::
CCDS11 MTTSIRQFTSSS----SIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLG-----AGSCRL---GSAGGL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
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:. . .:: ... .. : :::.:..::: :: ::.:.:: :::::::::::::
CCDS11 GSTL--------GGSSYSSCYSFGSGGGYGSSFGGVDG-LLAGGEKATMQNLNDRLASYL
50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 DKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPASPECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRVILE
::::::::::..:::::.::::.:.:. : :::::..:::::..::...:.::. ..:.
CCDS11 DKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPG-PARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQ
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
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:::::::::::: :.:.: ::: .:::::::::::::::::::.:::::::.:.::::::
CCDS11 IDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYL
160 170 180 190 200 210
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::::::::. . .:..:..::::::::::::.:.: :::.::: ::::::.:.: :::::
CCDS11 KKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSK
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 TEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAETECRYATQ
:::::.:::.:.:..:..:.::..:::::: :::::::::::::.::..::::: :: .:
CCDS11 TEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQ
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 LQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMAGI
:.:::::::..: ::..:::::: ::::::.:::.:::::::::::: ::::.::...
CCDS11 LSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQY
340 350 360 370 380 390
430 440 450
pF1KB6 GIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI
. .. . . . ::: ::.:.::...
CCDS11 KKEPVT------TRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
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10 20 30
pF1KB6 MTTTFLQTSSSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGG
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CCDS11 GGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRGS--SGGGCFGGSS-GGY
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 GGSRSISASSAR--FVSSGSGGGYGGGMRVCGFGGGA---GSVFGGGFGGG-VGGGFGGG
:: .....: : . ::. ::.::: . .::::. :: ::::::: :::::::
CCDS11 GGLGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGGIFGGGSFGGGSFGGGSFGGGGFGGGGFGGGFGGG
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 FGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQ--TPASPE
::: ::::::::::.:::::::::::::::::::::.: .:: ::..::.:. . .
CCDS11 FGG-DGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKEWYEKHGNSHQGEP
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 CDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADIN
:::.:.:::..:...:. : ::. ..:.::::::::::::::::::.::::.::::::
CCDS11 RDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFRLKYENEVALRQSVEADIN
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 GLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEELAYLKKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVD
:::::::::::...:::::::.:.:::::::::::::::.. . .:.:::::.::::::
CCDS11 GLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTGDVNVEMNAAPGVD
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 LTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDVEAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQ
::..: .:: ::: .::.::.:.:::: :..::. :. .: :.:.. :.:::.:::..:
CCDS11 LTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISSYKSEITELRRNVQ
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 ELEIELQSQLSMKAGLENSLAETECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYK
:::::::::..: .:: :::::: :: .::.:::. :..:: ::...: : : :: ::.
CCDS11 ALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQIRAETECQNTEYQ
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 MLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMAGIGIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVS
.::::: :::.:: ::::::::. . .: : : ..: :::
CCDS11 QLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGS--SGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGGGSSGGGHGGGH
440 450 460 470 480 490
pF1KB6 SHKREI
CCDS11 GGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSGGGGGGYGGGSSGGGS
500 510 520 530 540 550
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10 20 30 40 50
pF1KB6 MTT-TFLQTS-SSTFGGGSTRGGSLLAGGG-GFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSG
::. .. :.: .:.::: :::. : : .: . :. ::.:.:..:.::::::::.:.
CCDS11 MTSYSYRQSSATSSFGG--LGGGSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 GGYGGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLA
:.:::: .:: . ..:: ::.::::.::::::::::
CCDS11 GAYGGG-------------------------YGGVLTASDG-LLAGNEKLTMQNLNDRLA
60 70 80 90
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pF1KB6 SYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPASPECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRV
:::::::::: ::..:::::.:::::: :. : :::.:. ::..:::::...::.:::.
CCDS11 SYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPG-PSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRI
100 110 120 130 140 150
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pF1KB6 ILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEEL
.:.:::::::::::: :.:.: :::..:::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS11 VLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEEL
160 170 180 190 200 210
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pF1KB6 AYLKKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDVEAWF
::::::::::.. . .:..:::.::.:.:::.::...:..:: :::.:::.::.:.::::
CCDS11 AYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWF
220 230 240 250 260 270
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pF1KB6 FSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAETECRY
:.:::::.:::..::..: :..:.::::::.: :::::::::::::.::..::::: :.
CCDS11 TSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARF
280 290 300 310 320 330
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pF1KB6 ATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKM
..:: .::.::.:.::::...: . : :::::. :.:::.::::::::::::::::.
CCDS11 GAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHY
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450
pF1KB6 AGIGIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI
CCDS11 NNLSASKVL
400
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: :: : . :.:.::... : ::: .
CCDS11 MDLSNNTMSLSVRTPGLSRRLSSQSVIGRPRGMSASSVGSGYGGSAFGFGASCGGG---F
10 20 30 40 50
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::.: ::: ::: :..: . :.:.: : ..::: ::.: ::::. :::
CCDS11 SAASMFGSSSGFGGGSGSSM-AGGLGAGYGRALGGGSFGGLGMGFGGSPGGGSLGILSGN
60 70 80 90 100 110
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:::::::.:: :::::::::::::::::::::::..:: ::..::. . : . . ::
CCDS11 DGGLLSGSEKETMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELENKIREWYETRGTGTADASQSDY
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:.:. ::.::.::....: :....:.::::::::.:::.::::::::::::::::::::
CCDS11 SKYYPLIEDLRNKIISASIGNAQLLLQIDNARLAAEDFRMKYENELALRQGVEADINGLR
180 190 200 210 220 230
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::::::::.:::::::::.:::::::.:::::.:.. : :.:.:::::::::::::
CCDS11 RVLDELTLTRTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEDELQSFRVGGPGEVSVEMDAAPGVDLTR
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pF1KB6 VLAEMREQYEAMAEKNRRDVEAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELE
.: .:: :::..::.::.:.::::. :. :: ::...:::..:.::.:.:::::..:.::
CCDS11 LLNDMRAQYETIAEQNRKDAEAWFIEKSGELRKEISTNTEQLQSSKSEVTDLRRAFQNLE
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 IELQSQLSMKAGLENSLAETECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLL
:::::::.:: .::.::::.: : .::.:.: ::..::::: ..: . : :: ... ::
CCDS11 IELQSQLAMKKSLEDSLAEAEGDYCAQLSQVQQLISNLEAQLLQVRADAERQNVDHQRLL
360 370 380 390 400 410
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pF1KB6 DIKTRLEQEIATYRSLLEGQ---DAKMAGIGIREASSGGGGSSSN--------FHINVEE
..:.::: :: ::: ::.:. :. .. . ...: . ...:. .. :.:
CCDS11 NVKARLELEIETYRRLLDGEAQGDGLEESLFVTDSKSQAQSTDSSKDPTKTRKIKTVVQE
420 430 440 450 460 470
450
pF1KB6 SVDGQVVSSHKREI
:.:.::::. .::
CCDS11 MVNGEVVSSQVQEIEELM
480 490
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10 20 30
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.::: .::::.: :::. . :::
CCDS32 GGGGLGSGGSIRSSYSRFSSSGGGGGGGRFSSSSGYGGGSSRVCGRGGGGSFGYSYGGGS
20 30 40 50 60 70
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CCDS32 GGGFSASSLGGGFGGGSRGFGGASGGGYSS--SGGFGGG-----FGGGSGGGFGGGYGSG
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:: ::::: ::::::.:..::: :::.::.:::::::::.:::::: ::: ::.:::.
CCDS32 FGGFGGFGGGAGGGDGGILTANEKSTMQELNSRLASYLDKVQALEEANNDLENKIQDWYD
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CCDS32 KKGPAAIQKNYSPYYNTIDDLKDQIVDLTVGNNKTLLDIDNTRMTLDDFRIKFEMEQNLR
200 210 220 230 240 250
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:::.:::::::.:::.::. ..::::: : :.::: :::::.:::.....: .:.::::
CCDS32 QGVDADINGLRQVLDNLTMEKSDLEMQYETLQEELMALKKNHKEEMSQLTGQNSGDVNVE
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...::: :::..: .::..:: . :::.:.: . .. ....::.:. . .:.: :.
CCDS32 INVAPGKDLTKTLNDMRQEYEQLIAKNRKDIENQYETQITQIEHEVSSSGQEVQSSAKEV
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 TDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAETECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEM
:.::. .:::::::::::: ::.::.:: .:. :: :::.:: :..::::....: :.
CCDS32 TQLRHGVQELEIELQSQLSKKAALEKSLEDTKNRYCGQLQMIQEQISNLEAQITDVRQEI
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430
pF1KB6 EAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEG--QDAKMAGIG-IREASSGGGGSSSNFHIN
: :::::..::.:: :::.:: ::..:::: .: . .: : : .. ::.:.:
CCDS32 ECQNQEYSLLLSIKMRLEKEIETYHNLLEGGQEDFESSGAGKIGLGGRGGSGGSYGRGSR
440 450 460 470 480 490
440 450
pF1KB6 VEESVDGQVVSSHKREI
CCDS32 GGSGGSYGGGGSGGGYGGGSGSRGGSGGSYGGGSGSGGGSGGGYGGGSGGGHSGGSGGGH
500 510 520 530 540 550
456 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 11:44:42 2016 done: Sat Nov 5 11:44:42 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]