Result of FASTA (ccds) for pF1KB5990
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5990, 609 aa
  1>>>pF1KB5990 609 - 609 aa - 609 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6469+/-0.000922; mu= 17.4068+/- 0.055
 mean_var=72.6941+/-14.850, 0's: 0 Z-trim(105.7): 176  B-trim: 330 in 1/52
 Lambda= 0.150427
 statistics sampled from 8386 (8575) to 8386 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.263), width:  16
 Scan time:  3.340

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1         ( 609) 4126 905.0       0
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1       ( 642) 1828 406.3 6.1e-113
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 568) 1729 384.8 1.6e-106
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 709) 1729 384.9 1.9e-106
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 755) 1729 384.9  2e-106
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13         ( 748) 1681 374.5 2.8e-103
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1         ( 568) 1670 372.0 1.1e-102
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4          ( 694) 1623 361.9 1.6e-99
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 593) 1610 359.0 9.9e-99
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 597) 1610 359.0 9.9e-99
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5          ( 587) 1606 358.1 1.8e-98
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3        ( 574) 1600 356.8 4.3e-98
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5         ( 555) 1598 356.4 5.7e-98
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13        ( 687) 1592 355.1 1.7e-97
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX         ( 718) 1592 355.2 1.7e-97
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX         ( 720) 1570 350.4 4.8e-96
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4          ( 620) 1567 349.7 6.6e-96
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14       ( 585) 1538 343.4 4.9e-94
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14        ( 571) 1531 341.9 1.4e-93
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5         ( 505) 1421 318.0 1.9e-86
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 505) 1415 316.7 4.7e-86
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19         ( 624) 1345 301.5 2.1e-81
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 496) 1323 296.7 4.8e-80
CCDS77937.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4         ( 544) 1279 287.2 3.9e-77
CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 427) 1112 250.9 2.6e-66
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3         ( 600) 1097 247.7 3.3e-65
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7         ( 586) 1046 236.6 6.9e-62
CCDS75163.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4         ( 437) 1004 227.4   3e-59
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3          ( 621)  988 224.0 4.4e-58
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15       ( 589)  985 223.4 6.7e-58
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7          ( 538)  977 221.6 2.1e-57
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5            ( 589)  957 217.3 4.5e-56
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2       ( 875)  948 215.4 2.4e-55
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22       ( 634)  866 197.6 4.2e-50
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19       ( 615)  860 196.3   1e-49
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1         ( 597)  848 193.7   6e-49
CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5           ( 516)  836 191.0 3.2e-48
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1            ( 582)  810 185.4 1.8e-46
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1            ( 584)  810 185.4 1.8e-46
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8       ( 581)  808 185.0 2.4e-46
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2       ( 578)  758 174.1 4.4e-43
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16           ( 597)  735 169.1 1.4e-41
CCDS44685.2 KLHL35 gene_id:283212|Hs108|chr11      ( 583)  728 167.6 4.1e-41
CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16       ( 616)  691 159.6 1.1e-38
CCDS1368.1 IVNS1ABP gene_id:10625|Hs108|chr1       ( 642)  662 153.3   9e-37
CCDS2906.2 KBTBD8 gene_id:84541|Hs108|chr3         ( 601)  655 151.8 2.5e-36
CCDS34614.1 KBTBD2 gene_id:25948|Hs108|chr7        ( 623)  651 150.9 4.6e-36
CCDS42340.1 KLHL10 gene_id:317719|Hs108|chr17      ( 608)  639 148.3 2.7e-35
CCDS76909.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16       ( 553)  603 140.5 5.7e-33
CCDS11411.1 KLHL11 gene_id:55175|Hs108|chr17       ( 708)  585 136.6 1.1e-31


>>CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1              (609 aa)
 initn: 4126 init1: 4126 opt: 4126  Z-score: 4836.8  bits: 905.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4126; 100.0% identity (100.0% similar) in 609 aa overlap (1-609:1-609)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MEGKPMRRCTNIRPGETGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MEGKPMRRCTNIRPGETGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LRKHRELCDVVLVVGAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LRKHRELCDVVLVVGAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAME
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 LLIDFAYTSQITVEEGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LLIDFAYTSQITVEEGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 SCRELLRIADKFTQHNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SCRELLRIADKFTQHNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 YSIQERRPQLPQVLQHVRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YSIQERRPQLPQVLQHVRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQER
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 PLMQGPRTRPRKPIRCGEVLFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PLMQGPRTRPRKPIRCGEVLFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 SVLDDLLYAVGGHDGSSYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SVLDDLLYAVGGHDGSSYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 QDGVSCLNIVERYDPKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QDGVSCLNIVERYDPKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 NPQENRWHTIAPMGTRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWSPVVAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NPQENRWHTIAPMGTRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWSPVVAM
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 TSRRSGVGLAVVNGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TSRRSGVGLAVVNGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIK
              550       560       570       580       590       600

                
pF1KB5 MTHCESHIW
       :::::::::
CCDS13 MTHCESHIW
                

>>CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1            (642 aa)
 initn: 2575 init1: 1203 opt: 1828  Z-score: 2141.2  bits: 406.3 E(32554): 6.1e-113
Smith-Waterman score: 1828; 49.9% identity (77.3% similar) in 555 aa overlap (47-601:71-624)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KB5 TGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVVGA
                                     : .: .... ... .:..  :::.:: :.:
CCDS30 RTRPRQARPAAPMEGAVQLLSREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHVAA
               50        60        70        80        90       100

         80        90       100       110       120       130      
pF1KB5 KKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTSQITVEEG
       :.: ::.:.:..:::::.::::.:..:::::.:...::: .:.. :..::::..:.: ::
CCDS30 KEIRAHKVVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVGEG
              110       120       130       140       150       160

        140       150       160       170       180       190      
pF1KB5 NVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQHN
       ::::::::: ::::  ...:::.::  :::::::::::.:::.::: .::. : ... ..
CCDS30 NVQTLLPAASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQH
              170       180       190       200       210       220

        200       210       220       230       240       250      
pF1KB5 FQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQH
       : .: ..::::::: .:.....::: ::: :::.:. ::..:::.... :: ..:.... 
CCDS30 FVDVAKTEEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKC
              230       240       250       260       270       280

        260       270       280       290       300       310      
pF1KB5 VRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQERPLMQGPRTRPRKPIRC
       :::::::  ::.: : .. :..   .:.::. :: .. :::..: ..   :::::.    
CCDS30 VRLPLLSRDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLPEQRGVLGTSRTRPRRCEGA
              290       300       310       320       330       340

        320       330       340       350       360       370      
pF1KB5 GEVLFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLDDLLYAVGGHDGS
       : :::::::       .. : :: .:..:..::::: ::  :::... . ::::::.::.
CCDS30 GPVLFAVGGGSLFAIHGDCEAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYAVGGYDGT
              350       360       370       380       390       400

        380       390       400       410       420       430      
pF1KB5 SYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVSCLNIVERYDPK
       : : .:: ::: :: :. .:.  .: :. .:::.: :.::..:: ::.:::: .::::: 
CCDS30 SDLATVESYDPVTNTWQPEVS-MGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYDPL
              410       420        430       440       450         

        440       450       460       470       480       490      
pF1KB5 ENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERYNPQENRWHTIAPMGTR
        . :: ::.:::::  : ::.: : :::::: :..: : :::.:.:: : :  .: : .:
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CCDS30 TSL
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CCDS33 CLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFME
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pF1KB5 NSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVSCLNIVERYDPKENK
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pF1KB5 LGCAVYQDMIYAVGGRDD-----TTELSS-AERYNPRTNQWSPVVAMTSRRSGVGLAVVN
       .: .... ..::.::.:      :..::. .:::.:.:..:. :..:.  :..::. ...
CCDS33 VGVTTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSISRDAVGVCLLG
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pF1KB5 GQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIKMTHCESHIW
        .:.::::.:: .::.:.:..::..: :   . .   : :. : ..:.        
CCDS33 DKLYAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL        
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>>CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13              (748 aa)
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Smith-Waterman score: 1681; 45.9% identity (76.2% similar) in 562 aa overlap (45-600:189-746)

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                                     : . .: .::.. ..   :...::::.:.:
CCDS94 TGEGCGHRLSSTGHSMTPQSDLDSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQQQLCDVILIV
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       : .:: :::..::. : :: ::::... :..: :. .. ::  :.  :..::::. . ..
CCDS94 GNRKIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELK
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pF1KB5 EGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQ
       : ....:: ::::::: .. :.::.:: . : ::::::::::::...: ::...: ..:.
CCDS94 EDTIENLLAAACLLQLPQVVEVCCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTM
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pF1KB5 HNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVL
       .:..::....::.::::..:  ...::..:: .:: .:.:.: ::::..: :  .: ..:
CCDS94 ENIMEVIRNQEFLLLPAEELHKLLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLL
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pF1KB5 QHVRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQERPLMQGPRTRPRKPI
         .::::: :..:.  . .  :.:.: ::. :. :: .: :::..: :::.:::.:::  
CCDS94 AFIRLPLLPPQILAD-LENHALFKNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKST
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pF1KB5 RCGEVLFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLDDLLYAVGGHD
         : .:.::::  .. . ...:.:: .:: : ... :. ::   ::.:.:: :...::.:
CCDS94 -VG-TLYAVGGMDNNKGATTIEKYDLRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFVIGGRD
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pF1KB5 GSSYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVSCLNIVERYD
       : . ::.:: :.:::. :.  . : :: : ..::.:: : .:::::.:: : :: :::.:
CCDS94 GLKTLNTVECYNPKTKTWTV-LPPMSTHRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTVERWD
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pF1KB5 PKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERYNPQENRWHTIAPMG
       :. ..:: :::::  :  :.::.:.: ::.::: ::.: :...: :.:. :.:.  ::: 
CCDS94 PQSQQWTFVASMSIARSTVGVAALNGKLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMCAPMC
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pF1KB5 TRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTE------LSSAERYNPRTNQWSPVVAMTSRRSGVG
        ::  .: :. . ..:::::.:  .       :. .:::.:.:. :. :. ..  :..::
CCDS94 KRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPASNHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPRDAVG
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pF1KB5 LAVVNGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIKMTHCESHI
       . ... .:.::::.:: :::.:.: .::..: :  ....:  : :. : :::        
CCDS94 VCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNTMESYDPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP      
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pF1KB5 W

>>CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1              (568 aa)
 initn: 2530 init1: 924 opt: 1670  Z-score: 1956.7  bits: 372.0 E(32554): 1.1e-102
Smith-Waterman score: 1670; 44.5% identity (75.0% similar) in 569 aa overlap (36-600:3-566)

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pF1KB5 MRRCTNIRPGETGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHR
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CCDS14                             MGGIMAPKDI--MTNTHAKSILNSMNSLRKSN
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pF1KB5 ELCDVVLVVGAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDF
        ::::.: :  : . :::..:.::: :: ::::.::.:. .  : :. .   .::.:.::
CCDS14 TLCDVTLRVEQKDFPAHRIVLAACSDYFCAMFTSELSEKGKPYVDIQGLTASTMEILLDF
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pF1KB5 AYTSQITVEEGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCREL
       .::  . :   ::: ::::::::::  ...::::::. ::::::::::: ::.::.: .:
CCDS14 VYTETVHVTVENVQELLPAACLLQLKGVKQACCEFLESQLDPSNCLGIRDFAETHNCVDL
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pF1KB5 LRIADKFTQHNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQE
       .. :. :.:..: ::.. :::.::  ...  .:. ::..: ::: ::.::. :::.. .:
CCDS14 MQAAEVFSQKHFPEVVQHEEFILLSQGEVEKLIKCDEIQVDSEEPVFEAVINWVKHAKKE
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pF1KB5 RRPQLPQVLQHVRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQERPLMQG
       :. .::..::.::.:::.:.... .. ..:.:. . .:::::::::.. : :. :  :::
CCDS14 REESLPNLLQYVRMPLLTPRYITDVIDAEPFIRCSLQCRDLVDEAKKFHLRPELRSQMQG
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pF1KB5 PRTRPRKPIRCGEVLFAVGGWCSGDA-ISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLD
       :::: :  .  .:::..:::. : .. :. ::.:::.:.:: .. :....:  :.   : 
CCDS14 PRTRAR--LGANEVLLVVGGFGSQQSPIDVVEKYDPKTQEWSFLPSITRKRRYVASVSLH
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pF1KB5 DLLYAVGGHDGSSYLNSVERYDPKTNQ---WSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQ
       : .:..::.:: : :.:::  :  ...   : : ::: .. :  .:...:: ..:. :: 
CCDS14 DRIYVIGGYDGRSRLSSVECLDYTADEDGVWYS-VAPMNVRRGLAGATTLGDMIYVSGGF
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pF1KB5 DGVSCLNIVERYDPKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERYN
       ::    . .:::::. ..:. ...:.: : :....: .: .: .:: :: . ::.::.:.
CCDS14 DGSRRHTSMERYDPNIDQWSMLGDMQTAREGAGLVVASGVIYCLGGYDGLNILNSVEKYD
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pF1KB5 PQENRWHTIAPMGTRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWSPVVAMT
       :. ..: ...::.:.:.  : :. .: ::.::: : :..:::.: :: ::..:. :..::
CCDS14 PHTGHWTNVTPMATKRSGAGVALLNDHIYVVGGFDGTAHLSSVEAYNIRTDSWTTVTSMT
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pF1KB5 SRRSGVGLAVVNGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIKM
       . :  :: .:. :.:.:..:.::.. :..:: .::  ..:..  .:. .:  .:: :.. 
CCDS14 TPRCYVGATVLRGRLYAIAGYDGNSLLSSIECYDPIIDSWEVVTSMGTQRCDAGVCVLRE
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pF1KB5 THCESHIW
               
CCDS14 K       
               

>>CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4               (694 aa)
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Smith-Waterman score: 1623; 45.9% identity (78.1% similar) in 525 aa overlap (83-601:174-694)

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pF1KB5 QTLEVINLLRKHRELCDVVLVVGAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIR
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CCDS34 EDCGGAHWLDRPEVDDGTSEEENESDSSSCRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKME
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pF1KB5 DIDERAMELLIDFAYTSQITVEEGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLG
        ..  ..  ::..:::... ..: :.. :: .::::::... ::::.:: .:: ::::::
CCDS34 GVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNIECLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLG
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pF1KB5 IRAFADTHSCRELLRIADKFTQHNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVF
       ::.:::...: .: ..: ..:...:.::....::.::::...  ...::..:. .:: ..
CCDS34 IRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFMEVIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETIL
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pF1KB5 NAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQHVRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKN
       ::...::......:: .: ..: ..:::::.:.::.  . .. :...: ::. :. :: .
CCDS34 NALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIRLPLLAPQFLAD-MENNVLFRDDIECQKLIMEAMK
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pF1KB5 YLLLPQERPLMQGPRTRPRKPIRCGEVLFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMS
       : :::..::..:.:::.:::    : .::::::  :  . .:.:.:: .:: :  ::.:.
CCDS34 YHLLPERRPMLQSPRTKPRKST-VG-TLFAVGGMDSTKGATSIEKYDLRTNMWTPVANMN
            390       400         410       420       430       440

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pF1KB5 KRRCGVGVSVLDDLLYAVGGHDGSSYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLG
        ::   ::.:::: ::.:::.:: . ::.:: :.:::. ::  . : :: : ..::::: 
CCDS34 GRRLQFGVAVLDDKLYVVGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWSV-MPPMSTHRHGLGVAVLE
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pF1KB5 GFLYAVGGQDGVSCLNIVERYDPKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTS
       : .:::::.:: : :: :::.::.  .:. ::.::: :  :.::::.: :::::: ::.:
CCDS34 GPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQARQWNFVATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSS
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pF1KB5 PLNTVERYNPQENRWHTIAPMGTRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDD-----TTELSS-AER
        :..:: ..:. :.:   : :. ::  .: .... ..::.::.:      :..::. .::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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