Result of SIM4 for pF1KB5848

seq1 = pF1KB5848.tfa, 1458 bp
seq2 = pF1KB5848/gi568815597f_212186111.tfa (gi568815597f:212186111_212460767), 274657 bp

>pF1KB5848 1458
>gi568815597f:212186111_212460767 (Chr1)

1-181  (100001-100181)   100% ->
182-378  (143025-143221)   100% ->
379-480  (147387-147488)   100% ->
481-573  (156078-156170)   100% ->
574-704  (159693-159823)   100% ->
705-764  (161237-161296)   100% ->
765-873  (162279-162387)   100% ->
874-927  (163079-163132)   100% ->
928-978  (170516-170566)   100% ->
979-1098  (170840-170959)   100% ->
1099-1226  (171047-171174)   100% ->
1227-1328  (172576-172677)   100% ->
1329-1458  (174528-174657)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGTCGTCGTCGCCGCCGGCGGGGGCTGCCAGCGCCGCCATCTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGTCGTCGTCGCCGCCGGCGGGGGCTGCCAGCGCCGCCATCTCGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCGGAGAAAGTGGACGGCTTCACCCGGAAATCGGTCCGCAAGGCGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCGGAGAAAGTGGACGGCTTCACCCGGAAATCGGTCCGCAAGGCGCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCAGAAGCGCTCCCAGGGCTCGTCGCAGTTTCGCAGCCAGGGCAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCAGAAGCGCTCCCAGGGCTCGTCGCAGTTTCGCAGCCAGGGCAGCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCAGAGCTGCACCCGCTGCCCCAGCTCAAAG         ATGCCACTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100151 GCAGAGCTGCACCCGCTGCCCCAGCTCAAAGGTA...TAGATGCCACTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAATGAACAACAAGAGCTTTTCTGTCAGAAGTTGCAGCAGTGTTGTATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143035 AAATGAACAACAAGAGCTTTTCTGTCAGAAGTTGCAGCAGTGTTGTATAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGTTTGATTTCATGGACTCTGTTTCAGACTTGAAGAGCAAAGAAATTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143085 TGTTTGATTTCATGGACTCTGTTTCAGACTTGAAGAGCAAAGAAATTAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGAGCAACACTGAATGAACTGGTTGAGTATGTTTCAACTAATCGTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143135 AGAGCAACACTGAATGAACTGGTTGAGTATGTTTCAACTAATCGTGGTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AATTGTTGAATCAGCGTATTCTGATATAGTAAAAATG         ATCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 143185 AATTGTTGAATCAGCGTATTCTGATATAGTAAAAATGGTA...CAGATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GTGCTAACATCTTCCGTACACTTCCTCCAAGTGATAATCCAGATTTTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147391 GTGCTAACATCTTCCGTACACTTCCTCCAAGTGATAATCCAGATTTTGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCAGAAGAGGATGAACCCACGCTTGAGGCCTCTTGGCCTCACATACAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 147441 CCAGAAGAGGATGAACCCACGCTTGAGGCCTCTTGGCCTCACATACAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    481        TTGGTATATGAATTCTTCTTGAGATTTTTGGAGAGCCCTGATT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147491 A...TAGTTGGTATATGAATTCTTCTTGAGATTTTTGGAGAGCCCTGATT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCCAGCCTAGCATTGCAAAACGATACATTGATCAGAAATTCGTACAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156121 TCCAGCCTAGCATTGCAAAACGATACATTGATCAGAAATTCGTACAACAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574          CTCCTGGAGCTTTTTGATAGTGAAGATCCCAGAGAACGTGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156171 GTA...AAGCTCCTGGAGCTTTTTGATAGTGAAGATCCCAGAGAACGTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CTTCCTGAAGACTGTTCTGCACCGAATTTATGGGAAATTTCTTGGATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159734 CTTCCTGAAGACTGTTCTGCACCGAATTTATGGGAAATTTCTTGGATTAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GAGCATTCATCAGAAAACAAATTAACAACATTTTCCTCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 159784 GAGCATTCATCAGAAAACAAATTAACAACATTTTCCTCAGGTA...CAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TTTATATATGAAACAGAACATTTCAATGGTGTTGCTGAACTTCTTGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161238 TTTATATATGAAACAGAACATTTCAATGGTGTTGCTGAACTTCTTGAAAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ATTAGGAAG         TATTATCAATGGCTTTGCATTGCCACTGAAAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 161288 ATTAGGAAGGTA...CAGTATTATCAATGGCTTTGCATTGCCACTGAAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CAGAACATAAACAATTTCTAATGAAGGTTCTTATTCCTATGCATACTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162311 CAGAACATAAACAATTTCTAATGAAGGTTCTTATTCCTATGCATACTGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AAAGGATTAGCTTTGTTTCATGCTCAG         CTAGCATATTGTGT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 162361 AAAGGATTAGCTTTGTTTCATGCTCAGGTA...TAGCTAGCATATTGTGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TGTACAGTTCCTGGAGAAAGATACAACACTAACAGAGCCA         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 163093 TGTACAGTTCCTGGAGAAAGATACAACACTAACAGAGCCAGTA...CAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TGATCAGAGGACTGCTGAAATTTTGGCCAAAAACCTGCAGTCAGAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170517 TGATCAGAGGACTGCTGAAATTTTGGCCAAAAACCTGCAGTCAGAAAGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979          GTGATGTTTTTAGGAGAAATTGAAGAAATCTTAGATGTCAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170567 GTG...TAGGTGATGTTTTTAGGAGAAATTGAAGAAATCTTAGATGTCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TGAACCAACACAGTTCAAAAAAATTGAAGAGCCACTTTTCAAGCAGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170881 TGAACCAACACAGTTCAAAAAAATTGAAGAGCCACTTTTCAAGCAGATAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CCAAGTGTGTATCCAGTTCTCATTTTCAG         GTTGCAGAAAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 170931 CCAAGTGTGTATCCAGTTCTCATTTTCAGGTA...TAGGTTGCAGAAAGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GCATTGTACTTCTGGAATAACGAATATATTCTTAGTTTGATTGAGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171059 GCATTGTACTTCTGGAATAACGAATATATTCTTAGTTTGATTGAGGAGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 CATTGATAAAATTCTGCCAATTATGTTTGCCAGTTTGTACAAAATTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171109 CATTGATAAAATTCTGCCAATTATGTTTGCCAGTTTGTACAAAATTTCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AAGAACACTGGAATCC         GACCATTGTAGCACTGGTATACAAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 171159 AAGAACACTGGAATCCGTA...CAGGACCATTGTAGCACTGGTATACAAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 GTGCTGAAAACCCTAATGGAAATGAATGGCAAGCTTTTCGATGACCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172601 GTGCTGAAAACCCTAATGGAAATGAATGGCAAGCTTTTCGATGACCTTAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 TAGCTCATACAAAGCTGAAAGACAGAG         AGAGAAAAAGAAGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 172651 TAGCTCATACAAAGCTGAAAGACAGAGGTA...CAGAGAGAAAAAGAAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 AATTGGAACGTGAAGAATTATGGAAAAAATTAGAGGAGCTAAAGCTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174542 AATTGGAACGTGAAGAATTATGGAAAAAATTAGAGGAGCTAAAGCTAAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 AAAGCTCTAGAAAAACAGAATAGTGCTTACAACATGCACAGTATTCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174592 AAAGCTCTAGAAAAACAGAATAGTGCTTACAACATGCACAGTATTCTCAG

   1550     .    :    .
   1443 CAATACAAGTGCCGAA
        ||||||||||||||||
 174642 CAATACAAGTGCCGAA

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