seq1 = pF1KB7970.tfa, 1230 bp
seq2 = pF1KB7970/gi568815592r_169604006.tfa (gi568815592r:169604006_169818848), 214843 bp

>pF1KB7970 1230
>gi568815592r:169604006_169818848 (Chr6)

(complement)

1-61  (100001-100061)   100% ->
62-145  (100943-101026)   100% ->
146-279  (102761-102894)   100% ->
280-429  (102992-103141)   100% ->
430-539  (104007-104116)   100% ->
540-693  (106310-106463)   100% ->
694-849  (108458-108613)   100% ->
850-958  (113125-113233)   100% ->
959-1147  (113528-113716)   100% ->
1148-1230  (114761-114843)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTTCAAGAACAAGTCAGTGAATATTTGGGTGTGACCTCCTTTAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTTCAAGAACAAGTCAGTGAATATTTGGGTGTGACCTCCTTTAAAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAATATCCAG         ATTTAGAGCGACGAGATTTGTCTCACAAGG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAATATCCAGGTA...GAGATTTAGAGCGACGAGATTTGTCTCACAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGAAACTCTACCTGAGAGAGCTAAATGTCATTACTGAAACTCAGTGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100973 AGAAACTCTACCTGAGAGAGCTAAATGTCATTACTGAAACTCAGTGCACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTAG         GCTTAACAGCATTGCGCAGTGATGAAGTGATTGATTT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101023 CTAGGTA...TAGGCTTAACAGCATTGCGCAGTGATGAAGTGATTGATTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AATGATAAAAGAATATCCAGCCAAACATGCTGAGTATTCTGTTATTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102798 AATGATAAAAGAATATCCAGCCAAACATGCTGAGTATTCTGTTATTCTAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAGAAAAAGAACGTCAACGAATTACAGACCATTATAAAGAGTATTCC   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 102848 AAGAAAAAGAACGTCAACGAATTACAGACCATTATAAAGAGTATTCCGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    280       CAAATGCAACAACAGAATACTCAGAAAGTTGAAGCCAGTAAAGT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102898 ...CAGCAAATGCAACAACAGAATACTCAGAAAGTTGAAGCCAGTAAAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCCTGAGTATATTAAGAAAGCTGCCAAAAAAGCAGCAGAATTTAATAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103036 GCCTGAGTATATTAAGAAAGCTGCCAAAAAAGCAGCAGAATTTAATAGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACTTAAACCGGGAACGCATGGAAGAAAGAAGAGCTTATTTTGACTTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103086 ACTTAAACCGGGAACGCATGGAAGAAAGAAGAGCTTATTTTGACTTGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACACAT         GTTATCCAGGTACCTCAAGGGAAGTACAAAGTTTT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103136 ACACATGTA...TAGGTTATCCAGGTACCTCAAGGGAAGTACAAAGTTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GCCAACAGAGCGAACAAAGGTCAGTTCTTACCCAGTGGCTCTCATCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104042 GCCAACAGAGCGAACAAAGGTCAGTTCTTACCCAGTGGCTCTCATCCCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GACAGTTCCAGGAATATTATAAGAG         GTACTCACCAGATGAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 104092 GACAGTTCCAGGAATATTATAAGAGGTA...CAGGTACTCACCAGATGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CTGCGGTATCTGCCATTAAACACAGCCCTGTATGAGCCCCCTCTGGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106326 CTGCGGTATCTGCCATTAAACACAGCCCTGTATGAGCCCCCTCTGGATCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGAGCTCCCTGCTCTAGACAGTGATGGTGATTCAGATGATGGCGAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106376 TGAGCTCCCTGCTCTAGACAGTGATGGTGATTCAGATGATGGCGAAGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GTCGAGGTGATGAGAAACGGAAAAATAAAGGCACTTCG         GAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 106426 GTCGAGGTGATGAGAAACGGAAAAATAAAGGCACTTCGGTG...CAGGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AGCTCCTCTGGCAATGTATCTGAAGGGGAAAGCCCTCCTGACAGCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108461 AGCTCCTCTGGCAATGTATCTGAAGGGGAAAGCCCTCCTGACAGCCAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GGACTCTTTCCAGGGAAGACAGAAATCAAAAGACAAAGCTGCCACTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108511 GGACTCTTTCCAGGGAAGACAGAAATCAAAAGACAAAGCTGCCACTCCAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GAAAAGATGGTCCCAAACGTTCTGTACTGTCCAAGTCAGTTCCTGGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108561 GAAAAGATGGTCCCAAACGTTCTGTACTGTCCAAGTCAGTTCCTGGGTAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AAG         CCAAAGGTCATTCCAAATGCTATATGTGGAATTTGTCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108611 AAGGTA...CAGCCAAAGGTCATTCCAAATGCTATATGTGGAATTTGTCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GAAGGGTAAGGAGTCCAACAAGAAAGGAAAGGCTGAATCACTTATACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113163 GAAGGGTAAGGAGTCCAACAAGAAAGGAAAGGCTGAATCACTTATACACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GCTCCCAATGTGAGAATAGTG         GCCATCCTTCTTGCCTGGAT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 113213 GCTCCCAATGTGAGAATAGTGGTA...TAGGCCATCCTTCTTGCCTGGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 ATGACAATGGAGCTTGTTTCTATGATTAAGACCTACCCATGGCAGTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113548 ATGACAATGGAGCTTGTTTCTATGATTAAGACCTACCCATGGCAGTGTAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GGAATGTAAAACATGCATTATATGTGGACAACCCCACCATGAAGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113598 GGAATGTAAAACATGCATTATATGTGGACAACCCCACCATGAAGAAGAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TGATGTTCTGTGATATGTGTGACAGAGGTTATCATACTTTTTGTGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113648 TGATGTTCTGTGATATGTGTGACAGAGGTTATCATACTTTTTGTGTGGGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CTTGGTGCTATTCCATCAG         GTCGCTGGATTTGTGACTGTTG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 113698 CTTGGTGCTATTCCATCAGGTA...TAGGTCGCTGGATTTGTGACTGTTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TCAGCGGGCCCCCCCAACACCCAGGAAAGTGGGCAGAAGGGGGAAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114783 TCAGCGGGCCCCCCCAACACCCAGGAAAGTGGGCAGAAGGGGGAAAAACA

   1300     .    :
   1220 GCAAAGAGGGA
        |||||||||||
 114833 GCAAAGAGGGA