Result of FASTA (ccds) for pF1KF0006
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KF0006, 749 aa
  1>>>pF1KF0006 749 - 749 aa - 749 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7053+/-0.00127; mu= 12.5239+/- 0.075
 mean_var=123.8456+/-26.917, 0's: 0 Z-trim(104.3): 159  B-trim: 132 in 1/50
 Lambda= 0.115248
 statistics sampled from 7644 (7843) to 7644 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.241), width:  16
 Scan time:  3.890

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14002.1 SGSM3 gene_id:27352|Hs108|chr22        ( 749) 5014 846.2       0
CCDS45314.1 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15      ( 963)  696 128.3 5.5e-29
CCDS32301.2 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15      ( 914)  682 126.0 2.7e-28
CCDS59137.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9        ( 468)  659 121.9 2.2e-27
CCDS75865.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9        ( 928)  659 122.2 3.8e-27
CCDS47136.1 TBC1D9 gene_id:23158|Hs108|chr4        (1266)  589 110.6 1.5e-23
CCDS35080.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9        ( 917)  582 109.4 2.7e-23
CCDS14522.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX       (1120)  572 107.8 9.9e-23
CCDS4450.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5        (1233)  561 106.0 3.8e-22
CCDS43408.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5       (1250)  561 106.0 3.8e-22
CCDS46375.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2        (1140)  531 100.9 1.1e-20
CCDS82486.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2        (1155)  531 101.0 1.1e-20
CCDS9534.2 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13         ( 336)  475 91.2 2.8e-18
CCDS66591.1 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13        ( 344)  460 88.8 1.6e-17
CCDS13874.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22     ( 508)  433 84.4 4.9e-16
CCDS56227.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22     ( 515)  433 84.4 4.9e-16
CCDS8162.1 TBC1D10C gene_id:374403|Hs108|chr11     ( 446)  431 84.0 5.6e-16
CCDS10676.2 TBC1D10B gene_id:26000|Hs108|chr16     ( 808)  423 82.9 2.2e-15
CCDS33972.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4        (1168)  403 79.7   3e-14
CCDS66563.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13        (1235)  398 78.9 5.5e-14
CCDS66564.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13        (1290)  398 78.9 5.7e-14
CCDS41901.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13        (1298)  398 78.9 5.7e-14
CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19       ( 794)  383 76.2 2.2e-13
CCDS54209.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19       ( 805)  383 76.2 2.2e-13
CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1           ( 810)  383 76.2 2.2e-13
CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1           ( 821)  383 76.2 2.3e-13
CCDS14523.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX       ( 632)  381 75.8 2.3e-13
CCDS53492.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10        ( 828)  378 75.4   4e-13
CCDS44357.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10        ( 845)  378 75.4 4.1e-13
CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1        ( 815)  374 74.7 6.3e-13
CCDS6848.2 RABGAP1 gene_id:23637|Hs108|chr9        (1069)  366 73.5   2e-12


>>CCDS14002.1 SGSM3 gene_id:27352|Hs108|chr22             (749 aa)
 initn: 5014 init1: 5014 opt: 5014  Z-score: 4515.5  bits: 846.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5014; 100.0% identity (100.0% similar) in 749 aa overlap (1-749:1-749)

               10        20        30        40        50        60
pF1KF0 MSGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESAEQPEFYYDEFGFRVYKEEGDEPGSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MSGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESAEQPEFYYDEFGFRVYKEEGDEPGSS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KF0 LLANSPLMEDAPQRLRWQAHLEFTHNHDVGDLTWDKIAVSLPRSEKLRSLVLAGIPHGMR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LLANSPLMEDAPQRLRWQAHLEFTHNHDVGDLTWDKIAVSLPRSEKLRSLVLAGIPHGMR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KF0 PQLWMRLSGALQKKRNSELSYREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLLRTMPSNACFASMGSIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PQLWMRLSGALQKKRNSELSYREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLLRTMPSNACFASMGSIG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KF0 VPRLRRVLRALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMMSAIIEDLLPASYFSTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VPRLRRVLRALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMMSAIIEDLLPASYFSTT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KF0 LLGVQTDQRVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTAFASVVDIKLLLRIWDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LLGVQTDQRVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTAFASVVDIKLLLRIWDL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KF0 FFYEGSRVLFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPSQMEDAELLLGVAMRLAGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FFYEGSRVLFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPSQMEDAELLLGVAMRLAGS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KF0 LTDVAVETQRRKHLAYLIADQGQLLGAGTLTNLSQVVRRRTQRRKSTITALLFGEDDLEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LTDVAVETQRRKHLAYLIADQGQLLGAGTLTNLSQVVRRRTQRRKSTITALLFGEDDLEA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KF0 LKAKNIKQTELVADLREAILRVARHFQCTDPKNCSVELTPDYSMESHQRDHENYVACSRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LKAKNIKQTELVADLREAILRVARHFQCTDPKNCSVELTPDYSMESHQRDHENYVACSRS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KF0 HRRRAKALLDFERHDDDELGFRKNDIITIVSQKDEHCWVGELNGLRGWFPAKFVEVLDER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HRRRAKALLDFERHDDDELGFRKNDIITIVSQKDEHCWVGELNGLRGWFPAKFVEVLDER
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KF0 SKEYSIAGDDSVTEGVTDLVRGTLCPALKALFEHGLKKPSLLGGACHPWLFIEEAAGREV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SKEYSIAGDDSVTEGVTDLVRGTLCPALKALFEHGLKKPSLLGGACHPWLFIEEAAGREV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KF0 ERDFASVYSRLVLCKTFRLDEDGKVLTPEELLYRAVQSVNVTHDAVHAQMDVKLRSLICV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ERDFASVYSRLVLCKTFRLDEDGKVLTPEELLYRAVQSVNVTHDAVHAQMDVKLRSLICV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KF0 GLNEQVLHLWLEVLCSSLPTVEKWYQPWSFLRSPGWVQIKCELRVLCCFAFSLSQDWELP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GLNEQVLHLWLEVLCSSLPTVEKWYQPWSFLRSPGWVQIKCELRVLCCFAFSLSQDWELP
              670       680       690       700       710       720

              730       740         
pF1KF0 AKREAQQPLKEGVRDMLVKHHLFSWDVDG
       :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AKREAQQPLKEGVRDMLVKHHLFSWDVDG
              730       740         

>>CCDS45314.1 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15           (963 aa)
 initn: 688 init1: 606 opt: 696  Z-score: 633.9  bits: 128.3 E(32554): 5.5e-29
Smith-Waterman score: 708; 34.4% identity (65.6% similar) in 387 aa overlap (6-374:551-925)

                                        10        20        30     
pF1KF0                          MSGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESA
                                     ::.:.  .. :  .  :  : . . . :: 
CCDS45 ERDLMAKYSSLEAKLCQIESKYLILLQEMKTPVCSEDQGPTREVIAQ--LLEDALQVESQ
              530       540       550       560         570        

            40               50        60        70        80      
pF1KF0 EQPE--FY-------YDEFGFRVYKEEGDEPGSSLLANSPLMEDAPQRLRWQAHLEFTHN
       ::::  :        :: .:::.  :. .:   .:.:.   ..     :.    : .:.:
CCDS45 EQPEQAFVKPHLVSEYDIYGFRTVPEDDEEE--KLVAKVRALD-----LK---TLYLTEN
      580       590       600         610            620           

         90         100           110       120       130          
pF1KF0 HDVGD-LTWDK-IAVSLPR----SEKLRSLVLAGIPHGMRPQLWMRLSGALQKK--RNSE
       ..:.  . :.. .: .. :    : .:..:. :::::  : ..:        .:   :.:
CCDS45 QEVSTGVKWENYFASTVNREMMCSPELKNLIRAGIPHEHRSKVWKWCVDRHTRKFKDNTE
      630       640       650       660       670       680        

      140        150       160       170       180       190       
pF1KF0 LS-YREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLLRTMPSNACFASMGSIGVPRLRRVLRALAWLYPE
        . .. ..... . .. :.:::: :::::.:.:  ..   : :. .:: :: :..:  :.
CCDS45 PGHFQTLLQKALEKQNPASKQIELDLLRTLPNNKHYSCPTSEGIQKLRNVLLAFSWRNPD
      690       700       710       720       730       740        

       200       210       220       230       240       250       
pF1KF0 IGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMMSAIIEDLLPASYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQ
       :::::: . ..:  ::.::.::::: . .:.: ..: .:.. :::: :.::::.: :. .
CCDS45 IGYCQGLNRLVAVALLYLEQEDAFWCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQRVFRDLMSE
      750       760       770       780       790       800        

       260       270       280       290       300       310       
pF1KF0 YLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTAFASVVDIKLLLRIWDLFFYEGSRVLFQLTLGML
        ::::   .... .. .:::..:::..:.. :   .:..::: :.::: .:.:...:...
CCDS45 KLPRLHGHFEQYKVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDILFKIWDSFLYEGPKVIFRFALALF
      810       820       830       840       850       860        

       320       330       340       350       360       370       
pF1KF0 HLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPSQMEDAELLLGVAMRLAGSLTDVAVETQRRKHLAYL
       . ::::... ..: :::. :  .   . ::. :.....   . .    ....:  ::   
CCDS45 KYKEEEILKLQDSMSIFKYLRYFTRTILDARKLISISFGDLNPFPLRQIRNRRAYHLEKV
      870       880       890       900       910       920        

       380       390       400       410       420       430       
pF1KF0 IADQGQLLGAGTLTNLSQVVRRRTQRRKSTITALLFGEDDLEALKAKNIKQTELVADLRE
                                                                   
CCDS45 RLELTELEAIREDFLRERDTSPDKGELVSDEEEDT                         
      930       940       950       960                            

>>CCDS32301.2 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15           (914 aa)
 initn: 674 init1: 592 opt: 682  Z-score: 621.6  bits: 126.0 E(32554): 2.7e-28
Smith-Waterman score: 694; 35.8% identity (66.1% similar) in 360 aa overlap (6-347:551-898)

                                        10        20        30     
pF1KF0                          MSGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESA
                                     ::.:.  .. :  .  :  : . . . :: 
CCDS32 ERDLMAKYSSLEAKLCQIESKYLILLQEMKTPVCSEDQGPTREVIAQ--LLEDALQVESQ
              530       540       550       560         570        

            40               50        60        70        80      
pF1KF0 EQPE--FY-------YDEFGFRVYKEEGDEPGSSLLANSPLMEDAPQRLRWQAHLEFTHN
       ::::  :        :: .:::.  :. .:   .:.:.   ..     :.    : .:.:
CCDS32 EQPEQAFVKPHLVSEYDIYGFRTVPEDDEEE--KLVAKVRALD-----LK---TLYLTEN
      580       590       600         610            620           

         90         100           110       120       130          
pF1KF0 HDVGD-LTWDK-IAVSLPR----SEKLRSLVLAGIPHGMRPQLWMRLSGALQKK--RNSE
       ..:.  . :.. .: .. :    : .:..:. :::::  : ..:        .:   :.:
CCDS32 QEVSTGVKWENYFASTVNREMMCSPELKNLIRAGIPHEHRSKVWKWCVDRHTRKFKDNTE
      630       640       650       660       670       680        

      140        150       160       170       180       190       
pF1KF0 LS-YREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLLRTMPSNACFASMGSIGVPRLRRVLRALAWLYPE
        . .. ..... . .. :.:::: :::::.:.:  ..   : :. .:: :: :..:  :.
CCDS32 PGHFQTLLQKALEKQNPASKQIELDLLRTLPNNKHYSCPTSEGIQKLRNVLLAFSWRNPD
      690       700       710       720       730       740        

       200       210       220       230       240       250       
pF1KF0 IGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMMSAIIEDLLPASYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQ
       :::::: . ..:  ::.::.::::: . .:.: ..: .:.. :::: :.::::.: :. .
CCDS32 IGYCQGLNRLVAVALLYLEQEDAFWCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQRVFRDLMSE
      750       760       770       780       790       800        

       260       270       280       290       300       310       
pF1KF0 YLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTAFASVVDIKLLLRIWDLFFYEGSRVLFQLTLGML
        ::::   .... .. .:::..:::..:.. :   .:..::: :.::: .:.:...:...
CCDS32 KLPRLHGHFEQYKVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDILFKIWDSFLYEGPKVIFRFALALF
      810       820       830       840       850       860        

       320       330       340       350       360       370       
pF1KF0 HLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPSQMEDAELLLGVAMRLAGSLTDVAVETQRRKHLAYL
       . ::::... ..: :::. :  .   . ::                              
CCDS32 KYKEEEILKLQDSMSIFKYLRYFTRTILDARSGTDAPTTWRKSGWS              
      870       880       890       900       910                  

>>CCDS59137.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9             (468 aa)
 initn: 479 init1: 403 opt: 659  Z-score: 605.0  bits: 121.9 E(32554): 2.2e-27
Smith-Waterman score: 663; 33.3% identity (61.0% similar) in 415 aa overlap (22-419:77-465)

                        10        20        30        40           
pF1KF0          MSGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESAEQPEFY----YDEFGF
                                     :: : ..   : :... :.     :::.::
CCDS59 ESKYLAGLRRLQEALGDEASECSELLRQLVQEAL-QWEAGEASSDSIELSPISKYDEYGF
         50        60        70        80         90       100     

        50        60                    70        80        90     
pF1KF0 RVYKEEGDEPGSSLLANSPLME------------DAPQRLRWQAHLEFTHNHDVGDLTWD
        .  .   :   .:::.   .:            : : : :: :         .:::   
CCDS59 LTVPDYEVED-LKLLAKIQALESRSHHLLGLEAVDRPLRERWAA---------LGDL---
         110        120       130       140                150     

         100       110       120       130       140       150     
pF1KF0 KIAVSLPRSEKLRSLVLAGIPHGMRPQLWMRLSGALQKKRNSELSYREIVKNSSNDETIA
            .: .: :..:. ::.:.  ::..:  :     .. ..   :.:... ..  :  :
CCDS59 -----VPSAE-LKQLLRAGVPREHRPRVWRWLVHLRVQHLHTPGCYQELLSRGQAREHPA
                  160       170       180       190       200      

         160       170       180       190       200       210     
pF1KF0 AKQIEKDLLRTMPSNACFASMGSIGVPRLRRVLRALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFL
       :.::: :: ::.:.:  :.   :    .::::: :..:  : :::::: . .::  :: :
CCDS59 ARQIELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDKLRRVLLAFSWQNPTIGYCQGLNRLAAIALLVL
        210       220       230       240       250       260      

          220       230       240       250       260       270    
pF1KF0 EEED-AFWMMSAIIEDLLPASYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELS
       :::. ::: . ::.: ..::.:. .:: . :.:::::. :. . ::::   : .: ..::
CCDS59 EEEESAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQVDQRVLQDLLSEKLPRLMAHLGQHHVDLS
        270       280       290       300       310       320      

          280       290       300       310       320       330    
pF1KF0 LITLHWFLTAFASVVDIKLLLRIWDLFFYEGSRVLFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIF
       :.:..:::..::. .  ..:::.:: :.:::..:.:. .:.... .:.:... .:.  :.
CCDS59 LVTFNWFLVVFADSLISNILLRVWDAFLYEGTKVVFRYALAIFKYNEKEILRLQNGLEIY
        330       340       350       360       370       380      

          340       350       360       370       380       390    
pF1KF0 NTLSDIPSQMEDAELLLGVAMRLAGSLTDVAVETQRRKHLAYLIADQGQLLGAGTLTNLS
       . :  . . . ... :...:.   . .    ..  :  :   : :.  .:         .
CCDS59 QYLRFFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQLRQLRMVHRERLEAELRELEQLK-----A
        390       400       410       420       430       440      

          400       410       420       430       440       450    
pF1KF0 QVVRRRTQRRKSTITALLFGEDDLEALKAKNIKQTELVADLREAILRVARHFQCTDPKNC
       . ..::..::.. ..    .::..:                                   
CCDS59 EYLERRASRRRA-VSEGCASEDEVEGEA                                
             450        460                                        

>>CCDS75865.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9             (928 aa)
 initn: 479 init1: 403 opt: 659  Z-score: 600.8  bits: 122.2 E(32554): 3.8e-27
Smith-Waterman score: 663; 33.3% identity (61.0% similar) in 415 aa overlap (22-419:537-925)

                        10        20        30        40           
pF1KF0          MSGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESAEQPEFY----YDEFGF
                                     :: : ..   : :... :.     :::.::
CCDS75 ESKYLAGLRRLQEALGDEASECSELLRQLVQEAL-QWEAGEASSDSIELSPISKYDEYGF
        510       520       530       540        550       560     

        50        60                    70        80        90     
pF1KF0 RVYKEEGDEPGSSLLANSPLME------------DAPQRLRWQAHLEFTHNHDVGDLTWD
        .  .   :   .:::.   .:            : : : :: :         .:::   
CCDS75 LTVPDYEVED-LKLLAKIQALESRSHHLLGLEAVDRPLRERWAA---------LGDL---
         570        580       590       600                610     

         100       110       120       130       140       150     
pF1KF0 KIAVSLPRSEKLRSLVLAGIPHGMRPQLWMRLSGALQKKRNSELSYREIVKNSSNDETIA
            .: .: :..:. ::.:.  ::..:  :     .. ..   :.:... ..  :  :
CCDS75 -----VPSAE-LKQLLRAGVPREHRPRVWRWLVHLRVQHLHTPGCYQELLSRGQAREHPA
                  620       630       640       650       660      

         160       170       180       190       200       210     
pF1KF0 AKQIEKDLLRTMPSNACFASMGSIGVPRLRRVLRALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFL
       :.::: :: ::.:.:  :.   :    .::::: :..:  : :::::: . .::  :: :
CCDS75 ARQIELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDKLRRVLLAFSWQNPTIGYCQGLNRLAAIALLVL
        670       680       690       700       710       720      

          220       230       240       250       260       270    
pF1KF0 EEED-AFWMMSAIIEDLLPASYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELS
       :::. ::: . ::.: ..::.:. .:: . :.:::::. :. . ::::   : .: ..::
CCDS75 EEEESAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQVDQRVLQDLLSEKLPRLMAHLGQHHVDLS
        730       740       750       760       770       780      

          280       290       300       310       320       330    
pF1KF0 LITLHWFLTAFASVVDIKLLLRIWDLFFYEGSRVLFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIF
       :.:..:::..::. .  ..:::.:: :.:::..:.:. .:.... .:.:... .:.  :.
CCDS75 LVTFNWFLVVFADSLISNILLRVWDAFLYEGTKVVFRYALAIFKYNEKEILRLQNGLEIY
        790       800       810       820       830       840      

          340       350       360       370       380       390    
pF1KF0 NTLSDIPSQMEDAELLLGVAMRLAGSLTDVAVETQRRKHLAYLIADQGQLLGAGTLTNLS
       . :  . . . ... :...:.   . .    ..  :  :   : :.  .:         .
CCDS75 QYLRFFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQLRQLRMVHRERLEAELRELEQLK-----A
        850       860       870       880       890       900      

          400       410       420       430       440       450    
pF1KF0 QVVRRRTQRRKSTITALLFGEDDLEALKAKNIKQTELVADLREAILRVARHFQCTDPKNC
       . ..::..::.. ..    .::..:                                   
CCDS75 EYLERRASRRRA-VSEGCASEDEVEGEA                                
             910        920                                        

>>CCDS47136.1 TBC1D9 gene_id:23158|Hs108|chr4             (1266 aa)
 initn: 315 init1: 205 opt: 589  Z-score: 536.1  bits: 110.6 E(32554): 1.5e-23
Smith-Waterman score: 589; 29.9% identity (61.1% similar) in 422 aa overlap (23-423:422-832)

                       10        20        30        40        50  
pF1KF0         MSGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESAEQPEFYYDEFGFRVYKE
                                     :. .. ..   :. :     :  : : .. 
CCDS47 VQRISDFLQQTTSKIYSDKEFAGSYNSSDDEVYSRPSSLVSSSPQRSTSSDADGERQFNL
             400       410       420       430       440       450 

              60        70        80        90              100    
pF1KF0 EGDE-PGSSLLANSPLMEDAPQRLRWQAHLEFTHNHDVGDLTWDKI-------AVSLPRS
       .:.  : ..    .   . .:...  .   :: ...     .: ::       .. . :.
CCDS47 NGNSVPTATQTLMTMYRRRSPEEFNPKLAKEFLKEQ-----AW-KIHFAEYGQGICMYRT
             460       470       480             490       500     

          110       120       130       140       150       160    
pF1KF0 EKLRSLVLAGIPHGMRPQLWMRLSGALQKKRNSELSYREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLL
       :: : ::: :::..:: .::. ::::...: .    :...:..: .  ..:...::.:: 
CCDS47 EKTRELVLKGIPESMRGELWLLLSGAINEKATHPGYYEDLVEKSMGKYNLATEEIERDLH
         510       520       530       540       550       560     

          170       180       190       200       210       220    
pF1KF0 RTMPSNACFASMGSIGVPRLRRVLRALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMM
       :..: .  : .   .:.  ::::: : :.  :.:::::. ..:.. :::. .::.:::..
CCDS47 RSLPEHPAFQN--EMGIAALRRVLTAYAFRNPNIGYCQAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLL
         570         580       590       600       610       620   

          230       240       250       260       270       280    
pF1KF0 SAIIEDLLPASYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTA
        :. : .:: .:..: ..:. .:: :...:  .:.:.:   .:.  . .: :.: :::: 
CCDS47 VALCERMLP-DYYNTRVVGALVDQGVFEELARDYVPQLYDCMQDLGV-ISTISLSWFLTL
           630        640       650       660        670       680 

          290       300       310       320       330       340    
pF1KF0 FASVVDIKLLLRIWDLFFYEGSRVLFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPSQM
       : ::. ..  . . : ::::: .:.:::.:..:  . ..:.. ....  ...:.   ...
CCDS47 FLSVMPFESAVVVVDCFFYEGIKVIFQLALAVLDANVDKLLNCKDDGEAMTVLGRYLDSV
             690       700       710       720       730       740 

          350       360       370       380          390           
pF1KF0 EDAELLLGVAMRLAGSLTDVAVETQRRKHLAYLIADQGQLLG---AGTLTNLS-------
        . .  :    .: . :.:  ::   .  .  ::  . . .:   :  . ..        
CCDS47 TNKDSTLPPIPHLHSLLSD-DVEPYPEVDIFRLIRTSYEKFGTIRADLIEQMRFKQRLKV
             750       760        770       780       790       800

           400         410       420       430       440       450 
pF1KF0 -QVVRRRTQRR--KSTITALLFGEDDLEALKAKNIKQTELVADLREAILRVARHFQCTDP
        :...  :.:   .. .:   :  :.:: : :                            
CCDS47 IQTLEDTTKRNVVRTIVTETSFTIDELEELYALFKAEHLTSCYWGGSSNALDRHDPSLPY
              810       820       830       840       850       860

             460       470       480       490       500       510 
pF1KF0 KNCSVELTPDYSMESHQRDHENYVACSRSHRRRAKALLDFERHDDDELGFRKNDIITIVS
                                                                   
CCDS47 LEQYRIDFEQFKGMFALLFPWACGTHSDVLASRLFQLLDENGDSLINFREFVSGLSAACH
              870       880       890       900       910       920

>>CCDS35080.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9             (917 aa)
 initn: 654 init1: 333 opt: 582  Z-score: 531.7  bits: 109.4 E(32554): 2.7e-23
Smith-Waterman score: 609; 32.5% identity (58.6% similar) in 415 aa overlap (22-419:537-914)

                        10        20        30        40           
pF1KF0          MSGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESAEQPEFY----YDEFGF
                                     :: : ..   : :... :.     :::.::
CCDS35 ESKYLAGLRRLQEALGDEASECSELLRQLVQEAL-QWEAGEASSDSIELSPISKYDEYGF
        510       520       530       540        550       560     

        50        60                    70        80        90     
pF1KF0 RVYKEEGDEPGSSLLANSPLME------------DAPQRLRWQAHLEFTHNHDVGDLTWD
        .  .   :   .:::.   .:            : : : :: :         .:::   
CCDS35 LTVPDYEVED-LKLLAKIQALESRSHHLLGLEAVDRPLRERWAA---------LGDL---
         570        580       590       600                610     

         100       110       120       130       140       150     
pF1KF0 KIAVSLPRSEKLRSLVLAGIPHGMRPQLWMRLSGALQKKRNSELSYREIVKNSSNDETIA
            .: .: :..:. ::.:.  ::..:  :     .. ..   :.:... ..  :  :
CCDS35 -----VPSAE-LKQLLRAGVPREHRPRVWRWLVHLRVQHLHTPGCYQELLSRGQAREHPA
                  620       630       640       650       660      

         160       170       180       190       200       210     
pF1KF0 AKQIEKDLLRTMPSNACFASMGSIGVPRLRRVLRALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFL
       :.::: :: ::.:.:  :.   :    .::::: :..:  : :::::: . .::  :: :
CCDS35 ARQIELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDKLRRVLLAFSWQNPTIGYCQGLNRLAAIALLVL
        670       680       690       700       710       720      

          220       230       240       250       260       270    
pF1KF0 EEED-AFWMMSAIIEDLLPASYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELS
       :::. ::: . ::.: ..::.:. .:: . :.:::::. :. . ::::   : .: ..::
CCDS35 EEEESAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQVDQRVLQDLLSEKLPRLMAHLGQHHVDLS
        730       740       750       760       770       780      

          280       290       300       310       320       330    
pF1KF0 LITLHWFLTAFASVVDIKLLLRIWDLFFYEGSRVLFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIF
       :.:..:::..::. .  ..:::.:: :.:::..            .:.:... .:.  :.
CCDS35 LVTFNWFLVVFADSLISNILLRVWDAFLYEGTKY-----------NEKEILRLQNGLEIY
        790       800       810       820                  830     

          340       350       360       370       380       390    
pF1KF0 NTLSDIPSQMEDAELLLGVAMRLAGSLTDVAVETQRRKHLAYLIADQGQLLGAGTLTNLS
       . :  . . . ... :...:.   . .    ..  :  :   : :.  .:         .
CCDS35 QYLRFFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQLRQLRMVHRERLEAELRELEQLK-----A
         840       850       860       870       880            890

          400       410       420       430       440       450    
pF1KF0 QVVRRRTQRRKSTITALLFGEDDLEALKAKNIKQTELVADLREAILRVARHFQCTDPKNC
       . ..::..::.. ..    .::..:                                   
CCDS35 EYLERRASRRRA-VSEGCASEDEVEGEA                                
              900        910                                       

>>CCDS14522.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX            (1120 aa)
 initn: 355 init1: 193 opt: 572  Z-score: 521.5  bits: 107.8 E(32554): 9.9e-23
Smith-Waterman score: 572; 29.1% identity (64.1% similar) in 382 aa overlap (99-476:472-845)

       70        80        90       100       110       120        
pF1KF0 EDAPQRLRWQAHLEFTHNHDVGDLTWDKIAVSLPRSEKLRSLVLAGIPHGMRPQLWMRLS
                                     ::. :..: :.::. :::. .: .::: .:
CCDS14 QNLETLNSKMLKEKMKEQSWKILFAECGRGVSMFRTKKTRDLVVRGIPETLRGELWMLFS
             450       460       470       480       490       500 

      130       140       150       160       170       180        
pF1KF0 GALQKKRNSELSYREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLLRTMPSNACFASMGSIGVPRLRRVL
       ::..   ..   : :.:..: .  ..:...::.:: :..: .  : :  . :.  :::::
CCDS14 GAVNDMATNPDYYTEVVEQSLGTCNLATEEIERDLRRSLPEHPAFQS--DTGISALRRVL
             510       520       530       540         550         

      190       200       210       220       230       240        
pF1KF0 RALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMMSAIIEDLLPASYFSTTLLGVQTDQ
        : :.  :.:::::. ..... :::. .::.:::.. :. : .:: .::.  ..:. .::
CCDS14 TAYAYRNPKIGYCQAMNILTSVLLLYAKEEEAFWLLVAVCERMLP-DYFNRRIIGALVDQ
     560       570       580       590       600        610        

      250       260       270       280       290       300        
pF1KF0 RVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTAFASVVDIKLLLRIWDLFFYEGSRV
        :...:: ..::.: . . .  . .: ..: :::: : ::. :.  . . : :::.: ..
CCDS14 AVFEELIRDHLPQLTEHMTDMTF-FSSVSLSWFLTLFISVLPIESAVNVVDCFFYDGIKA
      620       630       640        650       660       670       

      310       320       330       340       350       360        
pF1KF0 LFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPSQMEDAELLLGVAMRLAGSLTDVAVET
       ..:: :..:  . ..:.  ...:   ..:. . ... . .  :   .. .....:  . .
CCDS14 ILQLGLAILDYNLDKLLTCKDDAEAVTALNRFFDNVTNKDSPLPSNVQQGSNVSDEKT-S
       680       690       700       710       720       730       

      370       380       390       400       410        420       
pF1KF0 QRRKHLAYLIADQGQLLGAGTLTNLSQVVRRRTQRRKSTITALL-FGEDDLEALKAKNIK
       . :  .. :: ....  :     .. ..   : . :  .: .:    ....  . ....:
CCDS14 HTRVDITDLIRESNEKYGNIRYEDIHSM---RCRNRLYVIQTLEETTKQNVLRVVSQDVK
        740       750       760          770       780       790   

       430       440       450       460          470       480    
pF1KF0 QTELVADLREAILRVARHFQCTDPKNCSVELTPDYSM---ESHQRDHENYVACSRSHRRR
        .    :   .:..    ..:    .: :    : :.   :..: : ... :        
CCDS14 LSLQELDELYVIFKKELFLSCYWCLGCPVLKHHDPSLPYLEQYQIDCQQFRALYHLLSPW
           800       810       820       830       840       850   

          490       500       510       520       530       540    
pF1KF0 AKALLDFERHDDDELGFRKNDIITIVSQKDEHCWVGELNGLRGWFPAKFVEVLDERSKEY
                                                                   
CCDS14 AHSANKDSLALWTFRLLDENSDCLINFKEFSSAIDIMYNGSFTEKLKLLFKLHIPPAYTE
           860       870       880       890       900       910   

>>CCDS4450.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5             (1233 aa)
 initn: 457 init1: 191 opt: 561  Z-score: 511.1  bits: 106.0 E(32554): 3.8e-22
Smith-Waterman score: 589; 28.3% identity (57.5% similar) in 562 aa overlap (32-581:424-932)

              10        20        30        40        50        60 
pF1KF0 SGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESAEQPEFYYDEFGFRVYKEEGDEPGSS-
                                     .:..:::    . .. :      . : .: 
CCDS44 LQKTPSKQPGSIGSRKASVVDPSTESSPAPQEGSEQPASPASPLSSRQSFCAQEAPTASQ
           400       410       420       430       440       450   

                    70        80        90       100       110     
pF1KF0 -LLA----NSPLMEDAPQRLRWQAHLEFTHNHDVGDLTWDKIAVSLPRSEKLRSLVLAGI
        ::     :::. . . .  . . . :  : :    . . . .: . :. : :.::: ::
CCDS44 GLLKLFQKNSPMEDLGAKGAKEKMKEESWHIH---FFEYGR-GVCMYRTAKTRALVLKGI
           460       470       480          490        500         

         120       130       140       150       160       170     
pF1KF0 PHGMRPQLWMRLSGALQKKRNSELSYREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLLRTMPSNACFAS
       :...: .::. .::: ..  .    : :.:..:..  ..:...::.:: :.:: .  :  
CCDS44 PESLRGELWLLFSGAWNEMVTHPGYYAELVEKSTGKYSLATEEIERDLHRSMPEHPAF--
     510       520       530       540       550       560         

         180       190       200       210       220       230     
pF1KF0 MGSIGVPRLRRVLRALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMMSAIIEDLLPAS
       .. .:.  ::::: : :.  : :::::. ..:.. :::.  ::.:::.. :. : .:: .
CCDS44 QNELGIAALRRVLTAYAFRNPTIGYCQAMNIVTSVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLP-D
       570       580       590       600       610       620       

         240       250       260       270       280       290     
pF1KF0 YFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTAFASVVDIKLLL
       :..: ..:. .:: ....:  ..::.:.. .:.  . .: :.: :::: : ::. ..  .
CCDS44 YYNTRVVGALVDQGIFEELTRDFLPQLSEKMQDLGV-ISSISLSWFLTLFLSVMPFESAV
        630       640       650       660        670       680     

         300       310       320       330       340       350     
pF1KF0 RIWDLFFYEGSRVLFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPSQMEDAELLLGVAM
        : : ::::: .:..:..:..:  . :.:.   .                      : ::
CCDS44 VIVDCFFYEGIKVILQVALAVLDANMEQLLGCSDE---------------------GEAM
         690       700       710       720                         

         360       370           380       390       400       410 
pF1KF0 RLAGSLTDVAVETQRRK----HLAYLIADQGQLLGAGTLTNLSQVVRRRTQRRKSTITAL
        . :   : .:. :  .    ::  :.... .  .   . .: .:    . .. :.. : 
CCDS44 TMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSSSDDPPAEVDIFELLKV----SYEKFSSLRA-
          730       740       750       760           770          

             420       430       440       450       460        470
pF1KF0 LFGEDDLEALKAKNIKQTELVADLREAILRVARHFQCTDPKNCSVELTPD-YSMESHQRD
           .:.: .. :  .. ... .:...  : . .   .:  . :.:   : : . . .. 
CCDS44 ----EDIEQMRFK--QRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIPVDI-GFSIEELEDLYMVFKAKHL
         780         790       800       810        820       830  

              480        490       500       510       520         
pF1KF0 HENYVACSRSHR-RRAKALLDFERHDDDELGFRKNDIITIVSQKDEHCWVGELNGLRGWF
         .: .:::.   ::  .:  .:..  :   ::.     ..:     :  :  . :   .
CCDS44 ASQYWGCSRTMAGRRDPSLPYLEQYRIDASQFRE----LFASLTPWAC--GSHTPL---L
            840       850       860           870         880      

     530       540       550       560       570       580         
pF1KF0 PAKFVEVLDERSKEYSIAGDDSVTEGVTDLVRGTLCPALKALFEHGLKKPSLLGGACHPW
        ... ..::: .:.  :   . :: :.. . .: :   ::.:..  :  :.:        
CCDS44 AGRMFRLLDE-NKDSLINFKEFVT-GMSGMYHGDLTEKLKVLYKLHLP-PALSPEEAESA
           890        900        910       920        930       940

     590       600       610       620       630       640         
pF1KF0 LFIEEAAGREVERDFASVYSRLVLCKTFRLDEDGKVLTPEELLYRAVQSVNVTHDAVHAQ
                                                                   
CCDS44 LEAAHYFTEDSSSEEALPQEEQEGSGSEERGEEKGTSSPDYRHYLRMWAKEKEAQKETIK
              950       960       970       980       990      1000

>>CCDS43408.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5            (1250 aa)
 initn: 457 init1: 191 opt: 561  Z-score: 511.0  bits: 106.0 E(32554): 3.8e-22
Smith-Waterman score: 589; 28.3% identity (57.5% similar) in 562 aa overlap (32-581:424-932)

              10        20        30        40        50        60 
pF1KF0 SGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESAEQPEFYYDEFGFRVYKEEGDEPGSS-
                                     .:..:::    . .. :      . : .: 
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        ::     :::. . . .  . . . :  : :    . . . .: . :. : :.::: ::
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        . :   : .:. :  .    ::  :.... .  .   . .: .:    . .. :.. : 
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           .:.: .. :  .. ... .:...  : . .   .:  . :.:   : : . . .. 
CCDS43 ----EDIEQMRFK--QRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIPVDI-GFSIEELEDLYMVFKAKHL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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