seq1 = pF1KB9872.tfa, 1485 bp
seq2 = pF1KB9872/gi568815586f_4811379.tfa (gi568815586f:4811379_5012863), 201485 bp

>pF1KB9872 1485
>gi568815586f:4811379_5012863 (Chr12)

1-1485  (100001-101485)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGGTGATGTCTGGGGAGAACGTGGACGAGGCTTCGGCCGCCCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACGGTGATGTCTGGGGAGAACGTGGACGAGGCTTCGGCCGCCCCGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCACCCCCAGGATGGCAGCTACCCCCGGCAGGCCGACCACGACGACCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCACCCCCAGGATGGCAGCTACCCCCGGCAGGCCGACCACGACGACCACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTGCTGCGAGCGCGTGGTGATCAACATCTCCGGGCTGCGCTTCGAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTGCTGCGAGCGCGTGGTGATCAACATCTCCGGGCTGCGCTTCGAGACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGCTCAAGACCCTGGCGCAGTTCCCCAACACGCTGCTGGGCAACCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGCTCAAGACCCTGGCGCAGTTCCCCAACACGCTGCTGGGCAACCCTAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAACGCATGCGCTACTTCGACCCCCTGAGGAACGAGTACTTCTTCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAAACGCATGCGCTACTTCGACCCCCTGAGGAACGAGTACTTCTTCGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCAACCGGCCCAGCTTCGACGCCATCCTCTACTACTACCAGTCCGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCAACCGGCCCAGCTTCGACGCCATCCTCTACTACTACCAGTCCGGCGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGCCTGCGGAGGCCGGTCAACGTGCCCCTGGACATGTTCTCCGAGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CGCCTGCGGAGGCCGGTCAACGTGCCCCTGGACATGTTCTCCGAGGAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAAGTTTTACGAGTTGGGCGAGGAGGCCATGGAGAAGTTCCGGGAGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAAGTTTTACGAGTTGGGCGAGGAGGCCATGGAGAAGTTCCGGGAGGACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGGCTTCATCAAGGAGGAGGAGCGCCCTCTGCCCGAGAAGGAGTACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGGCTTCATCAAGGAGGAGGAGCGCCCTCTGCCCGAGAAGGAGTACCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGCCAGGTGTGGCTGCTCTTCGAGTACCCCGAGAGCTCGGGGCCCGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGCCAGGTGTGGCTGCTCTTCGAGTACCCCGAGAGCTCGGGGCCCGCCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGTCATCGCCATCGTCTCCGTCATGGTCATCCTCATCTCCATCGTCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGTCATCGCCATCGTCTCCGTCATGGTCATCCTCATCTCCATCGTCATCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTTGCCTGGAGACGCTCCCCGAGCTGAAGGATGACAAGGACTTCACGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTTGCCTGGAGACGCTCCCCGAGCTGAAGGATGACAAGGACTTCACGGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACCGTCCACCGCATCGACAACACCACGGTCATCTACAATTCCAACATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACCGTCCACCGCATCGACAACACCACGGTCATCTACAATTCCAACATCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CACAGACCCCTTCTTCATCGTGGAAACGCTGTGTATCATCTGGTTCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CACAGACCCCTTCTTCATCGTGGAAACGCTGTGTATCATCTGGTTCTCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCGAGCTGGTGGTGCGCTTCTTCGCCTGCCCCAGCAAGACGGACTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCGAGCTGGTGGTGCGCTTCTTCGCCTGCCCCAGCAAGACGGACTTCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAAAACATCATGAACTTCATAGACATTGTGGCCATCATTCCTTATTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AAAAACATCATGAACTTCATAGACATTGTGGCCATCATTCCTTATTTCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CACGCTGGGCACCGAGATAGCTGAGCAGGAAGGAAACCAGAAGGGCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CACGCTGGGCACCGAGATAGCTGAGCAGGAAGGAAACCAGAAGGGCGAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGGCCACCTCCCTGGCCATCCTCAGGGTCATCCGCTTGGTAAGGGTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGGCCACCTCCCTGGCCATCCTCAGGGTCATCCGCTTGGTAAGGGTTTTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGAATCTTCAAGCTCTCCCGCCACTCTAAGGGCCTCCAGATCCTGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGAATCTTCAAGCTCTCCCGCCACTCTAAGGGCCTCCAGATCCTGGGCCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GACCCTCAAAGCTAGTATGAGAGAGCTAGGGCTGCTCATCTTTTTCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GACCCTCAAAGCTAGTATGAGAGAGCTAGGGCTGCTCATCTTTTTCCTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TCATCGGGGTCATCCTGTTTTCTAGTGCAGTGTACTTTGCCGAGGCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TCATCGGGGTCATCCTGTTTTCTAGTGCAGTGTACTTTGCCGAGGCGGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAAGCTGAGTCGCACTTCTCCAGTATCCCCGATGCTTTCTGGTGGGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAAGCTGAGTCGCACTTCTCCAGTATCCCCGATGCTTTCTGGTGGGCGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGTGTCCATGACCACTGTAGGATACGGTGACATGTACCCTGTGACAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGTGTCCATGACCACTGTAGGATACGGTGACATGTACCCTGTGACAATTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GAGGCAAGATCGTGGGCTCCTTGTGTGCCATCGCTGGTGTGCTAACAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GAGGCAAGATCGTGGGCTCCTTGTGTGCCATCGCTGGTGTGCTAACAATT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GCCCTGCCCGTACCTGTCATTGTGTCCAATTTCAACTATTTCTACCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GCCCTGCCCGTACCTGTCATTGTGTCCAATTTCAACTATTTCTACCACCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 AGAAACTGAGGGGGAAGAGCAGGCTCAGTTGCTCCACGTCAGTTCCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 AGAAACTGAGGGGGAAGAGCAGGCTCAGTTGCTCCACGTCAGTTCCCCTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ACTTAGCCTCTGACAGTGACCTCAGTCGCCGCAGTTCCTCTACTATGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ACTTAGCCTCTGACAGTGACCTCAGTCGCCGCAGTTCCTCTACTATGAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 AAGTCTGAGTACATGGAGATCGAAGAGGATATGAATAATAGCATAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 AAGTCTGAGTACATGGAGATCGAAGAGGATATGAATAATAGCATAGCCCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TTATAGACAGGTCAATATCAGAACTGCCAATTGCACCACTGCTAACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 TTATAGACAGGTCAATATCAGAACTGCCAATTGCACCACTGCTAACCAAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .
   1451 ACTGCGTTAATAAGAGCAAGCTACTGACCGATGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 ACTGCGTTAATAAGAGCAAGCTACTGACCGATGTT