Result of FASTA (ccds) for pF1KB9866
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9866, 435 aa
  1>>>pF1KB9866 435 - 435 aa - 435 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4463+/-0.000804; mu= 5.9849+/- 0.049
 mean_var=220.1864+/-44.682, 0's: 0 Z-trim(116.2): 28  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.086433
 statistics sampled from 16794 (16821) to 16794 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.805), E-opt: 0.2 (0.517), width:  16
 Scan time:  3.880

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS9289.1 GJA3 gene_id:2700|Hs108|chr13           ( 435) 2966 382.0 6.2e-106
CCDS30834.1 GJA8 gene_id:2703|Hs108|chr1           ( 433) 1176 158.8 9.6e-39
CCDS929.1 GJA5 gene_id:2702|Hs108|chr1             ( 358) 1023 139.7 4.6e-33
CCDS30669.1 GJA4 gene_id:2701|Hs108|chr1           ( 333)  989 135.4 8.3e-32
CCDS5025.1 GJA10 gene_id:84694|Hs108|chr6          ( 543)  955 131.3 2.2e-30
CCDS432.1 GJA9 gene_id:81025|Hs108|chr1            ( 515)  949 130.6 3.6e-30
CCDS5123.1 GJA1 gene_id:2697|Hs108|chr6            ( 382)  942 129.6 5.3e-30
CCDS7191.1 GJD4 gene_id:219770|Hs108|chr10         ( 370)  534 78.7 1.1e-14
CCDS9290.1 GJB2 gene_id:2706|Hs108|chr13           ( 226)  477 71.4   1e-12
CCDS1569.1 GJC2 gene_id:57165|Hs108|chr1           ( 439)  471 70.9 2.8e-12
CCDS9291.1 GJB6 gene_id:10804|Hs108|chr13          ( 261)  466 70.1   3e-12
CCDS11487.1 GJC1 gene_id:10052|Hs108|chr17         ( 396)  462 69.7 5.7e-12
CCDS14408.1 GJB1 gene_id:2705|Hs108|chrX           ( 283)  447 67.7 1.6e-11
CCDS383.1 GJB4 gene_id:127534|Hs108|chr1           ( 266)  446 67.6 1.7e-11
CCDS384.1 GJB3 gene_id:2707|Hs108|chr1             ( 270)  443 67.2 2.2e-11


>>CCDS9289.1 GJA3 gene_id:2700|Hs108|chr13                (435 aa)
 initn: 2966 init1: 2966 opt: 2966  Z-score: 2015.4  bits: 382.0 E(32554): 6.2e-106
Smith-Waterman score: 2966; 99.8% identity (100.0% similar) in 435 aa overlap (1-435:1-435)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGDWSFLGRLLENAQEHSTVIGKVWLTVLFIFRILVLGAAAEDVWGDEQSDFTCNTQQPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 MGDWSFLGRLLENAQEHSTVIGKVWLTVLFIFRILVLGAAAEDVWGDEQSDFTCNTQQPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 CENVCYDRAFPISHIRFWALQIIFVSTPTLIYLGHVLHIVRMEEKKKEREEEEQLKRESP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 CENVCYDRAFPISHIRFWALQIIFVSTPTLIYLGHVLHIVRMEEKKKEREEEEQLKRESP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 SPKEPPQDNPSSRDDRGRVRMAGALLRTYVFNIIFKTLFEVGFIAGQYFLYGFELKPLYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 SPKEPPQDNPSSRDDRGRVRMAGALLRTYVFNIIFKTLFEVGFIAGQYFLYGFELKPLYR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 CDRWPCPNTVDCFISRPTEKTIFIIFMLAVACASLLLNMLEIYHLGWKKLKQGVTSRLGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 CDRWPCPNTVDCFISRPTEKTIFIIFMLAVACASLLLNMLEIYHLGWKKLKQGVTSRLGP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 DASEAPLGTADPPPLPPSSRPPAVAIGFPPYYAHTAAPLGQARAVGYPGAPPPAADFKML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS92 DASEAPLGTADPPPLPPSSRPPAVAIGFPPYYAHTAAPLGQARAVGYPGAPPPAADFKLL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 ALTEARGKGQSAKLYNGHHHLLMTEQNWANQAAERQPPALKAYPAASTPAAPSPVGSSSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 ALTEARGKGQSAKLYNGHHHLLMTEQNWANQAAERQPPALKAYPAASTPAAPSPVGSSSP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 PLAHEAEAGAAPLLLDGSGSSLEGSALAGTPEEEEQAVTTAAQMHQPPLPLGDPGRASKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 PLAHEAEAGAAPLLLDGSGSSLEGSALAGTPEEEEQAVTTAAQMHQPPLPLGDPGRASKA
              370       380       390       400       410       420

              430     
pF1KB9 SRASSGRARPEDLAI
       :::::::::::::::
CCDS92 SRASSGRARPEDLAI
              430     

>>CCDS30834.1 GJA8 gene_id:2703|Hs108|chr1                (433 aa)
 initn: 1171 init1: 657 opt: 1176  Z-score: 809.1  bits: 158.8 E(32554): 9.6e-39
Smith-Waterman score: 1176; 45.5% identity (66.4% similar) in 446 aa overlap (1-435:1-433)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGDWSFLGRLLENAQEHSTVIGKVWLTVLFIFRILVLGAAAEDVWGDEQSDFTCNTQQPG
       :::::::: .::...:::::::.::::::::::::.::.::: :::::::::.:::::::
CCDS30 MGDWSFLGNILEEVNEHSTVIGRVWLTVLFIFRILILGTAAEFVWGDEQSDFVCNTQQPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 CENVCYDRAFPISHIRFWALQIIFVSTPTLIYLGHVLHIVRMEEKKKEREEEEQLKRESP
       :::::::.::::::::.:.:::::::::.:.:.::..: ::::::.: :: :: : ... 
CCDS30 CENVCYDEAFPISHIRLWVLQIIFVSTPSLMYVGHAVHYVRMEEKRKSREAEE-LGQQAG
               70        80        90       100       110          

               130         140       150       160       170       
pF1KB9 SPKEPPQDN-PSSRDDRG--RVRMAGALLRTYVFNIIFKTLFEVGFIAGQYFLYGFELKP
       .   : : .  .:  ..:  . :. :.:::::. .::::::::::::.:.::::::.. :
CCDS30 TNGGPDQGSVKKSSGSKGTKKFRLEGTLLRTYICHIIFKTLFEVGFIVGHYFLYGFRILP
     120       130       140       150       160       170         

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB9 LYRCDRWPCPNTVDCFISRPTEKTIFIIFMLAVACASLLLNMLEIYHLGWKKLKQGVTSR
       ::::.::::::.::::.::::::::::.:::.:: .::.::..:. ::: : .....   
CCDS30 LYRCSRWPCPNVVDCFVSRPTEKTIFILFMLSVASVSLFLNVMELGHLGLKGIRSALKRP
     180       190       200       210       220       230         

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB9 LGPDASEAPLGTADPPPLPPSSRPPAVAIGFPPYYAHTAAPLGQARAVGYPGAPPPAADF
       .    .: :  .     .   ..  .  .      .    :: ..  :    .: ::  :
CCDS30 VEQPLGEIPEKSLHSIAVSSIQKAKGYQLLEEEKIVSHYFPLTEVGMV--ETSPLPAKPF
     240       250       260       270       280         290       

       300       310       320       330        340       350      
pF1KB9 KMLALTEARGKGQSAKLYNGHHHLLMTEQNWANQAAERQ-PPALKAYPAASTPAAPSPVG
       ...   :  . :  . :  :... : .  . . : .: . ::: ..    . : .     
CCDS30 NQFE--EKISTGPLGDLSRGYQETLPSYAQVGAQEVEGEGPPAEEG----AEPEVGEKKE
       300         310       320       330       340           350 

        360       370       380       390       400                
pF1KB9 SSSPPLAHEAEAGAAPLLLDGSGSSLEGSALAGTPEEEEQAVTTAAQMHQ-------PPL
        .    ..: :  :.:   .:      :    :  :: ..  ..   .         : :
CCDS30 EAERLTTEEQEKVAVP---EGEKVETPGVDKEGEKEEPQSEKVSKQGLPAEKTPSLCPEL
             360          370       380       390       400        

     410       420       430     
pF1KB9 PLGDPGRASKASRASSGRARPEDLAI
          :    :. :.::: ::: .::..
CCDS30 TTDDARPLSRLSKASS-RARSDDLTV
      410       420        430   

>>CCDS929.1 GJA5 gene_id:2702|Hs108|chr1                  (358 aa)
 initn: 1032 init1: 627 opt: 1023  Z-score: 707.1  bits: 139.7 E(32554): 4.6e-33
Smith-Waterman score: 1023; 61.0% identity (83.5% similar) in 236 aa overlap (1-232:1-236)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGDWSFLGRLLENAQEHSTVIGKVWLTVLFIFRILVLGAAAEDVWGDEQSDFTCNTQQPG
       :::::::: .::....::::.::::::::::::.::::.:::. :::::.:: :.: :::
CCDS92 MGDWSFLGNFLEEVHKHSTVVGKVWLTVLFIFRMLVLGTAAESSWGDEQADFRCDTIQPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110          
pF1KB9 CENVCYDRAFPISHIRFWALQIIFVSTPTLIYLGHVLHIVRMEEKKKEREEEEQLK-RES
       :.:::::.::::::::.:.:::::::::.:.:.::..: :::.::.: :: :.  . : :
CCDS92 CQNVCYDQAFPISHIRYWVLQIIFVSTPSLVYMGHAMHTVRMQEKRKLREAERAKEVRGS
               70        80        90       100       110       120

     120       130          140       150       160       170      
pF1KB9 PSPKEPPQDNPSS---RDDRGRVRMAGALLRTYVFNIIFKTLFEVGFIAGQYFLYGFELK
        : . :  ..      ..  ::. . :.:: ::: .:...: .:::::.::::.::. : 
CCDS92 GSYEYPVAEKAELSCWEEGNGRIALQGTLLNTYVCSILIRTTMEVGFIVGQYFIYGIFLT
              130       140       150       160       170       180

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB9 PLYRCDRWPCPNTVDCFISRPTEKTIFIIFMLAVACASLLLNMLEIYHLGWKKLKQGVTS
        :. : : :::. :.:..::::::..::.::::::  ::::.. :.:::::::..:    
CCDS92 TLHVCRRSPCPHPVNCYVSRPTEKNVFIVFMLAVAALSLLLSLAELYHLGWKKIRQRFVK
              190       200       210       220       230       240

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB9 RLGPDASEAPLGTADPPPLPPSSRPPAVAIGFPPYYAHTAAPLGQARAVGYPGAPPPAAD
                                                                   
CCDS92 PRQHMAKCQLSGPSVGIVQSCTPPPDFNQCLENGPGGKFFNPFSNNMASQQNTDNLVTEQ
              250       260       270       280       290       300

>>CCDS30669.1 GJA4 gene_id:2701|Hs108|chr1                (333 aa)
 initn: 1070 init1: 603 opt: 989  Z-score: 684.6  bits: 135.4 E(32554): 8.3e-32
Smith-Waterman score: 1018; 46.6% identity (66.6% similar) in 371 aa overlap (1-359:1-328)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGDWSFLGRLLENAQEHSTVIGKVWLTVLFIFRILVLGAAAEDVWGDEQSDFTCNTQQPG
       ::::.:: .::...::::::.::.:::::::::::.:: :.:.::::::::: ::: :::
CCDS30 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110          
pF1KB9 CENVCYDRAFPISHIRFWALQIIFVSTPTLIYLGHVLHIVRMEEKKKEREEE-EQLKRES
       : :::::.::::::::.:.::..:::::::.:::::... : ::. ...: : . :  ..
CCDS30 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQKEGELRALPAKD
               70        80        90       100       110       120

     120            130       140       150       160       170    
pF1KB9 PSPKEP-----PQDNPSSRDDRGRVRMAGALLRTYVFNIIFKTLFEVGFIAGQYFLYGFE
       :. ..       :    :  . ::.:. :::. ::: ... :...:.::. ::. :::. 
CCDS30 PQVERALAAVERQMAKISVAEDGRLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLYGWT
              130       140       150       160       170       180

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB9 LKPLYRCDRWPCPNTVDCFISRPTEKTIFIIFMLAVACASLLLNMLEIYHLGWKKLKQGV
       ..:.. :.: :::  ::::.::::::::::::::.:.  ::.::.::. ::  . :..:.
CCDS30 MEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCRCLSRGM
              190       200       210       220       230       240

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB9 TSRLGPDASEAPLGTADPPPLPPSSRPPAVAIGFPPYYAHTAAPLGQARAVGYPGAPPPA
        .: : ::         ::    :: : .  . :  :      :.::.     :..::  
CCDS30 RARQGQDA---------PPTQGTSSDPYTDQVFF--YL-----PVGQG-----PSSPP--
                       250       260              270              

          300       310       320       330            340         
pF1KB9 ADFKMLALTEARGKGQSAKLYNGHHHLLMTEQNWANQAAERQ-----PPALKAYPAASTP
                           :::   :  .:::::: ..:..     :: .   :  .  
CCDS30 -----------------CPTYNG---LSSSEQNWANLTTEERLASSRPPLFLDPPPQNGQ
                        280          290       300       310       

     350        360       370       380       390       400        
pF1KB9 AAPS-PVGSSSPPLAHEAEAGAAPLLLDGSGSSLEGSALAGTPEEEEQAVTTAAQMHQPP
         :: : .:.:                                                 
CCDS30 KPPSRPSSSASKKQYV                                            
       320       330                                               

>>CCDS5025.1 GJA10 gene_id:84694|Hs108|chr6               (543 aa)
 initn: 945 init1: 551 opt: 955  Z-score: 658.9  bits: 131.3 E(32554): 2.2e-30
Smith-Waterman score: 955; 52.5% identity (79.3% similar) in 261 aa overlap (1-253:1-258)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGDWSFLGRLLENAQEHSTVIGKVWLTVLFIFRILVLGAAAEDVWGDEQSDFTCNTQQPG
       ::::..:: .::... :::..::.:::.:::::.::: .:::::: :::: :.:::.:::
CCDS50 MGDWNLLGGILEEVHSHSTIVGKIWLTILFIFRMLVLRVAAEDVWDDEQSAFACNTRQPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110          
pF1KB9 CENVCYDRAFPISHIRFWALQIIFVSTPTLIYLGHVLHIVRMEEKKKEREEEE-QLKRES
       :.:.::: ::::: ::::.:::::::.:.:.:.::.:. .:  :: ..:.. . . . :.
CCDS50 CNNICYDDAFPISLIRFWVLQIIFVSSPSLVYMGHALYRLRAFEKDRQRKKSHLRAQMEN
               70        80        90       100       110       120

     120          130        140          150       160       170  
pF1KB9 PSPKEPPQ---DNPSSR-DDRGRVR---MAGALLRTYVFNIIFKTLFEVGFIAGQYFLYG
       :.     :   :    : ... :..   . : ::::::..:. ....::::. :::.:::
CCDS50 PDLDLEEQQRIDRELRRLEEQKRIHKVPLKGCLLRTYVLHILTRSVLEVGFMIGQYILYG
              130       140       150       160       170       180

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB9 FELKPLYRCDRWPCPNTVDCFISRPTEKTIFIIFMLAVACASLLLNMLEIYHLGWKKLKQ
       :...:::.: . ::::.::::.:::::::::..:: ..:  :::::.:::.::: .:. .
CCDS50 FQMHPLYKCTQPPCPNAVDCFVSRPTEKTIFMLFMHSIAAISLLLNILEIFHLGIRKIMR
              190       200       210       220       230       240

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB9 GVTSRLGPDASEAPLGTADPPPLPPSSRPPAVAIGFPPYYAHTAAPLGQARAVGYPGAPP
        . .. . .. :   :   ::                                       
CCDS50 TLYKKSSSEGIEDETG---PPFHLKKYSVAQQCMICSSLPERISPLQANNQQQVIRVNVP
              250          260       270       280       290       

>>CCDS432.1 GJA9 gene_id:81025|Hs108|chr1                 (515 aa)
 initn: 955 init1: 555 opt: 949  Z-score: 655.1  bits: 130.6 E(32554): 3.6e-30
Smith-Waterman score: 949; 54.5% identity (83.1% similar) in 242 aa overlap (1-234:1-242)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGDWSFLGRLLENAQEHSTVIGKVWLTVLFIFRILVLGAAAEDVWGDEQSDFTCNTQQPG
       ::::..::  ::... :::.:::.:::.:::::.::::.::::::.:::: : :::.:::
CCDS43 MGDWNLLGDTLEEVHIHSTMIGKIWLTILFIFRMLVLGVAAEDVWNDEQSGFICNTEQPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110          
pF1KB9 CENVCYDRAFPISHIRFWALQIIFVSTPTLIYLGHVLHIVRMEEKKKERE------EEEQ
       :.:::::.::::: ::.:.::.::::.:.:.:.::.:. .:. :....:       : :.
CCDS43 CRNVCYDQAFPISLIRYWVLQVIFVSSPSLVYMGHALYRLRVLEEERQRMKAQLRVELEE
               70        80        90       100       110       120

          120       130         140       150       160       170  
pF1KB9 LKRESPSPKEPPQDNPSSRDDR--GRVRMAGALLRTYVFNIIFKTLFEVGFIAGQYFLYG
       .. : :  ..  ...  . . :  ... . :.:: :::..:. ... ::::. :::.:::
CCDS43 VEFEMPRDRRRLEQELCQLEKRKLNKAPLRGTLLCTYVIHIFTRSVVEVGFMIGQYLLYG
              130       140       150       160       170       180

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB9 FELKPLYRCDRWPCPNTVDCFISRPTEKTIFIIFMLAVACASLLLNMLEIYHLGWKKLKQ
       :.:.::..:   :::: .:::.:::::::::..:: ..:  ::.::.:::.:::.::.:.
CCDS43 FHLEPLFKCHGHPCPNIIDCFVSRPTEKTIFLLFMQSIATISLFLNILEIFHLGFKKIKR
              190       200       210       220       230       240

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB9 GVTSRLGPDASEAPLGTADPPPLPPSSRPPAVAIGFPPYYAHTAAPLGQARAVGYPGAPP
       :.                                                          
CCDS43 GLWGKYKLKKEHNEFHANKAKQNVAKYQSTSANSLKRLPSAPDYNLLVEKQTHTAVYPSL
              250       260       270       280       290       300

>>CCDS5123.1 GJA1 gene_id:2697|Hs108|chr6                 (382 aa)
 initn: 1117 init1: 583 opt: 942  Z-score: 652.1  bits: 129.6 E(32554): 5.3e-30
Smith-Waterman score: 991; 41.3% identity (65.0% similar) in 443 aa overlap (1-435:1-382)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGDWSFLGRLLENAQEHSTVIGKVWLTVLFIFRILVLGAAAEDVWGDEQSDFTCNTQQPG
       ::::: ::.::...: .::. :::::.::::::::.::.:.:..:::::: : :::::::
CCDS51 MGDWSALGKLLDKVQAYSTAGGKVWLSVLFIFRILLLGTAVESAWGDEQSAFRCNTQQPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 CENVCYDRAFPISHIRFWALQIIFVSTPTLIYLGHVLHIVRMEEKKKEREEEEQLKRESP
       :::::::..:::::.:::.:::::::.:::.::.::....: ::: ...::: .. . . 
CCDS51 CENVCYDKSFPISHVRFWVLQIIFVSVPTLLYLAHVFYVMRKEEKLNKKEEELKVAQTDG
               70        80        90       100       110       120

              130             140       150       160       170    
pF1KB9 SPKEPPQDNPSSR------DDRGRVRMAGALLRTYVFNIIFKTLFEVGFIAGQYFLYGFE
          .    .   .      ...:.:.: :.:::::...:.::..:::.:.  :...::: 
CCDS51 VNVDMHLKQIEIKKFKYGIEEHGKVKMRGGLLRTYIISILFKSIFEVAFLLIQWYIYGFS
              130       140       150       160       170       180

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB9 LKPLYRCDRWPCPNTVDCFISRPTEKTIFIIFMLAVACASLLLNMLEIYHLGWKKLKQGV
       :. .: : : :::. ::::.::::::::::::::.:. .:: ::..:.... .:    ::
CCDS51 LSAVYTCKRDPCPHQVDCFLSRPTEKTIFIIFMLVVSLVSLALNIIELFYVFFK----GV
              190       200       210       220       230          

          240       250       260       270         280       290  
pF1KB9 TSRLGPDASEAPLGTADPPPLPPSSRPPAVAIGFPPY--YAHTAAPLGQARAVGYPGAPP
        .:.         : .::     ..  ::   :   :  .   ..:     :   : .::
CCDS51 KDRVK--------GKSDPYHATSGALSPAKDCGSQKYAYFNGCSSPT----APLSPMSPP
        240               250       260       270           280    

            300       310       320       330       340       350  
pF1KB9 PAADFKMLALTEARGKGQSAKLYNGHHHLLMTEQNWANQAAERQPPALKAYPAASTPAAP
           .:.  .:  :... : . :: .     .:::::: .::..    .   :.::    
CCDS51 ---GYKL--VTGDRNNS-SCRNYNKQ----ASEQNWANYSAEQN----RMGQAGST----
               290        300           310           320          

            360       370       380       390       400       410  
pF1KB9 SPVGSSSPPLAHEAEAGAAPLLLDGSGSSLEGSALAGTPEEEEQAVTTAAQMHQPPLPLG
         ...:     :     : :. .               :......   ::  .  :: . 
CCDS51 --ISNS-----H-----AQPFDF---------------PDDNQNSKKLAAGHELQPLAIV
          330                                340       350         

            420       430     
pF1KB9 DPGRASKASRASSGRARPEDLAI
       :   .:.::  .:.: ::.:: :
CCDS51 DQRPSSRASSRASSRPRPDDLEI
     360       370       380  

>>CCDS7191.1 GJD4 gene_id:219770|Hs108|chr10              (370 aa)
 initn: 606 init1: 294 opt: 534  Z-score: 377.3  bits: 78.7 E(32554): 1.1e-14
Smith-Waterman score: 553; 30.5% identity (56.4% similar) in 374 aa overlap (6-372:6-342)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGDWSFLGRLLENAQEHSTVIGKVWLTVLFIFRILVLGAAAEDVWGDEQSDFTCNTQQPG
            .:: :. . . . :..::.:... ...:.::.  :.. :. :::  :.::: :::
CCDS71 MEGVDLLGFLIITLNCNVTMVGKLWFVLTMLLRMLVIVLAGRPVYQDEQERFVCNTLQPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 CENVCYDRAFPISHIRFWALQIIFVSTPTLIYLGHVLHIVRMEEKKKEREEEEQLKRESP
       : :::::   :.::.::: .: . :  :. ..  .:::        .         :. :
CCDS71 CANVCYDVFSPVSHLRFWLIQGVCVLLPSAVFSVYVLH--------RGATLAALGPRRCP
               70        80        90               100       110  

                 130       140       150       160       170       
pF1KB9 SPKEPPQDN---PSSRDDRGRVRMAGALLRTYVFNIIFKTLFEVGFIAGQYFLYGFELKP
       .:.:: . .   :    .:: ...   .   :.......::.:..: : .:::.::    
CCDS71 DPREPASGQRRCPRPFGERGGLQVPD-FSAGYIIHLLLRTLLEAAFGALHYFLFGFLAPK
            120       130        140       150       160       170 

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB9 LYRCDRWPCPNTVDCFISRPTEKTIFIIFMLAVACASLLLNMLEIYHLGWKKLKQGVTSR
        . : : :: ..:::..::::::.....:. ::.  :.::.. ..      .:.. .  :
CCDS71 KFPCTRPPCTGVVDCYVSRPTEKSLLMLFLWAVSALSFLLGLADLVC----SLRRRMRRR
             180       190       200       210           220       

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB9 LGPDASEAPLGTADPPPLPPSSRPPAVAIGFPPYYAHTAAPLGQARAVGYPGAPPPAADF
        ::             :  :: :  . : :     .. .   :  .  : : ::: :   
CCDS71 PGP-------------PTSPSIRKQSGASGHAE--GRRTDEEGGREEEGAP-APPGAR--
       230                    240         250       260            

       300       310       320        330          340       350   
pF1KB9 KMLALTEARGKGQSAKLYNGHHHLL-MTEQNWANQAAE---RQPPALKAYPAASTPAAPS
          :  :. :. . ..  .:: ..    :.. ...:.:   :::   .. :   .   : 
CCDS71 ---AGGEGAGSPRRTSRVSGHTKIPDEDESEVTSSASEKLGRQP---RGRPHREAAQDPR
        270       280       290       300       310          320   

           360       370       380       390       400       410   
pF1KB9 PVGSSSPPLAHEAEAGAAPLLLDGSGSSLEGSALAGTPEEEEQAVTTAAQMHQPPLPLGD
         ::   : :  .. .: :                                         
CCDS71 GSGSEEQPSAAPSRLAAPPSCSSLQPPDPPASSSGAPHLRARKSEWV             
           330       340       350       360       370             

>>CCDS9290.1 GJB2 gene_id:2706|Hs108|chr13                (226 aa)
 initn: 762 init1: 464 opt: 477  Z-score: 341.7  bits: 71.4 E(32554): 1e-12
Smith-Waterman score: 764; 51.3% identity (75.9% similar) in 224 aa overlap (3-225:2-213)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGDWSFLGRLLENAQEHSTVIGKVWLTVLFIFRILVLGAAAEDVWGDEQSDFTCNTQQPG
         ::. :  .: ....::: :::.::::::::::..: .::..::::::.::.::: :::
CCDS92  MDWGTLQTILGGVNKHSTSIGKIWLTVLFIFRIMILVVAAKEVWGDEQADFVCNTLQPG
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 CENVCYDRAFPISHIRFWALQIIFVSTPTLIYLGHVLHIVRMEEKKKEREEEEQLKRESP
       :.:::::. :::::::.::::.::::::.:.   :: .  : .:::..  . : .: :  
CCDS92 CKNVCYDHYFPISHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAY--RRHEKKRKFIKGE-IKSEFK
      60        70        80        90         100       110       

              130       140       150       160       170          
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