seq1 = pF1KB9832.tfa, 1029 bp
seq2 = pF1KB9832/gi568815575f_26038986.tfa (gi568815575f:26038986_26240014), 201029 bp

>pF1KB9832 1029
>gi568815575f:26038986_26240014 (ChrX)

1-1029  (100001-101029)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTCGAGGTCAGAAGAGTAAGCTCCGTGCCCGTGAGAAACGCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTCGAGGTCAGAAGAGTAAGCTCCGTGCCCGTGAGAAACGCCACCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTCGTTGTGAGAATCAGGATCTGGGAGCTACGCAGGCCACTGTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTCGTTGTGAGAATCAGGATCTGGGAGCTACGCAGGCCACTGTGGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGGAGAGTCACCCTCCCCTGCCTATCTTCTCTTTGGTGACAGACCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGGAGAGTCACCCTCCCCTGCCTATCTTCTCTTTGGTGACAGACCCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AATTTGCCTGCTGCTGAGACACCTAGCATCCCTGAAGCGCTTCAGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AATTTGCCTGCTGCTGAGACACCTAGCATCCCTGAAGCGCTTCAGGGAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCATCCACCACCAATGCTATTGCACCTGTTTCATGCAGTTCAAATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCATCCACCACCAATGCTATTGCACCTGTTTCATGCAGTTCAAATGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTGCCAGCAGCCAAGATGAGAAAAGTCTAGGTTCCTCAAGGGAAGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTGCCAGCAGCCAAGATGAGAAAAGTCTAGGTTCCTCAAGGGAAGCTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCTGGAAAGAAGATCCTTTAAACAAGAAAGTAGTGTCGCTGGTGCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCTGGAAAGAAGATCCTTTAAACAAGAAAGTAGTGTCGCTGGTGCATTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTTGCTTCAGAAGTATGAAACGAAAGAGCCAATTACAAAGGGAGATATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTTGCTTCAGAAGTATGAAACGAAAGAGCCAATTACAAAGGGAGATATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TAAAGTTTGTTATCAGGAAGGATAAGTGTCACTTCAATGAGATCCTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TAAAGTTTGTTATCAGGAAGGATAAGTGTCACTTCAATGAGATCCTCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGAGCCTCTGAGCACATGGAGCTGGCACTTGGTGTTGATTTGAAGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGAGCCTCTGAGCACATGGAGCTGGCACTTGGTGTTGATTTGAAGGAAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGATCCCATCAGGCACTACTATGCCTTTTTCAGCAAATTAGACCTCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGATCCCATCAGGCACTACTATGCCTTTTTCAGCAAATTAGACCTCACCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATGATGAAACAACCAGTGATGAAGAAAAAATTCCCAAGACTGGCCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATGATGAAACAACCAGTGATGAAGAAAAAATTCCCAAGACTGGCCTCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATGATTGCACTGGGTGTGATCTTTCTGAATGGCAACCGTGCCCCAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATGATTGCACTGGGTGTGATCTTTCTGAATGGCAACCGTGCCCCAGAAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGCAGTCTGGGAAATTATGAATATGATGGGTGTATATGCCGATAGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGCAGTCTGGGAAATTATGAATATGATGGGTGTATATGCCGATAGGAAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACTTCCTCTATGGGGATCCCAGGAAGGTCATGACCAAAGATTTGGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACTTCCTCTATGGGGATCCCAGGAAGGTCATGACCAAAGATTTGGTGCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTAAAGTACCTGGAGTACCAGCAAGTGCCCAACAGTGATCCTCCACGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTAAAGTACCTGGAGTACCAGCAAGTGCCCAACAGTGATCCTCCACGCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGAATTCCTGTGGGGTCCAAGAGCTCACGCTGAAACTAGCAAGATGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGAATTCCTGTGGGGTCCAAGAGCTCACGCTGAAACTAGCAAGATGAAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCCTGGAGTTTGTAGCCAAGATACATGATACCGTCCCTAGTGCCTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCCTGGAGTTTGTAGCCAAGATACATGATACCGTCCCTAGTGCCTTCCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TCCTGCTATGAAGAGGCTTTGAGGGATGAGGAACAGAGAACCCAAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TCCTGCTATGAAGAGGCTTTGAGGGATGAGGAACAGAGAACCCAAGCCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AGCTGCAGCCAGGGCTCATACTGCTGCCATGGCAAATGCACGTTCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AGCTGCAGCCAGGGCTCATACTGCTGCCATGGCAAATGCACGTTCCAGAA

   1000     .    :    .    :    .
   1001 CCACGTCTAGCAGCTTCTCCCATGCTAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCACGTCTAGCAGCTTCTCCCATGCTAAG