Result of FASTA (ccds) for pF1KB9830
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9830, 342 aa
  1>>>pF1KB9830 342 - 342 aa - 342 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3599+/-0.00114; mu= 15.3157+/- 0.067
 mean_var=114.9604+/-36.564, 0's: 0 Z-trim(102.1): 244  B-trim: 868 in 2/44
 Lambda= 0.119619
 statistics sampled from 6487 (6809) to 6487 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.553), E-opt: 0.2 (0.209), width:  16
 Scan time:  1.900

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3159.1 P2RY12 gene_id:64805|Hs108|chr3         ( 342) 2256 401.2 6.4e-112
CCDS3158.2 P2RY13 gene_id:53829|Hs108|chr3         ( 354) 1075 197.4 1.5e-50
CCDS3156.1 P2RY14 gene_id:9934|Hs108|chr3          ( 338) 1001 184.6 9.9e-47
CCDS3157.1 GPR87 gene_id:53836|Hs108|chr3          ( 358)  918 170.3 2.1e-42
CCDS3155.1 GPR171 gene_id:29909|Hs108|chr3         ( 319)  656 125.1   8e-29
CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX          ( 381)  575 111.2 1.5e-24
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13         ( 361)  522 102.0 7.9e-22
CCDS318.1 PTAFR gene_id:5724|Hs108|chr1            ( 342)  517 101.1 1.4e-21
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13         ( 344)  489 96.3   4e-20
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13       ( 346)  486 95.8 5.7e-20
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX          ( 370)  458 91.0 1.7e-18
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11           ( 380)  444 88.6 9.3e-18
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2           ( 367)  441 88.0 1.3e-17
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3            ( 359)  437 87.3 2.1e-17
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 388)  437 87.4 2.2e-17
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 394)  437 87.4 2.2e-17
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX       ( 337)  429 85.9 5.2e-17
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX          ( 365)  423 84.9 1.1e-16
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 389)  419 84.3 1.9e-16
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 392)  419 84.3 1.9e-16
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 397)  419 84.3 1.9e-16
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 400)  419 84.3 1.9e-16
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 403)  419 84.3 1.9e-16
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 406)  419 84.3 1.9e-16
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 418)  419 84.3   2e-16
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 420)  419 84.3   2e-16
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 446)  419 84.3   2e-16
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 493)  419 84.4 2.2e-16
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5           ( 397)  415 83.6 3.1e-16
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8           ( 380)  405 81.8 9.8e-16
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11          ( 377)  404 81.7 1.1e-15
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2           ( 360)  400 80.9 1.7e-15
CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14          ( 365)  398 80.6 2.2e-15
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12         ( 372)  395 80.1 3.2e-15
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20        ( 333)  394 79.9 3.4e-15
CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX        ( 333)  392 79.5 4.3e-15
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2          ( 362)  390 79.2 5.7e-15
CCDS14442.1 P2RY10 gene_id:27334|Hs108|chrX        ( 339)  384 78.1 1.1e-14
CCDS9235.1 HCAR2 gene_id:338442|Hs108|chr12        ( 363)  384 78.2 1.2e-14
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17         ( 369)  380 77.5 1.9e-14
CCDS53842.1 HCAR3 gene_id:8843|Hs108|chr12         ( 387)  380 77.5   2e-14
CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19          ( 362)  377 77.0 2.7e-14
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3            ( 352)  375 76.6 3.4e-14
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3           ( 360)  372 76.1 4.9e-14
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14          ( 391)  371 76.0 5.8e-14
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14          ( 353)  370 75.8 6.2e-14
CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 319)  366 75.0 9.3e-14
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1            ( 372)  366 75.1   1e-13
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3           ( 384)  366 75.1 1.1e-13
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14          ( 391)  365 74.9 1.2e-13


>>CCDS3159.1 P2RY12 gene_id:64805|Hs108|chr3              (342 aa)
 initn: 2256 init1: 2256 opt: 2256  Z-score: 2122.8  bits: 401.2 E(32554): 6.4e-112
Smith-Waterman score: 2256; 100.0% identity (100.0% similar) in 342 aa overlap (1-342:1-342)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLAMRIFFQIRSKSNFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLAMRIFFQIRSKSNFI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 IFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYFTMYISISFLGLITI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYFTMYISISFLGLITI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 DRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTNRQPRDKNVKKCSFLKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTNRQPRDKNVKKCSFLKS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 EFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGVGKVPRKKVNVKVFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGVGKVPRKKVNVKVFI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 IIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWLTSLNACLDPFIYFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWLTSLNACLDPFIYFF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340  
pF1KB9 LCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM
              310       320       330       340  

>>CCDS3158.2 P2RY13 gene_id:53829|Hs108|chr3              (354 aa)
 initn: 1094 init1: 1047 opt: 1075  Z-score: 1021.2  bits: 197.4 E(32554): 1.5e-50
Smith-Waterman score: 1075; 48.7% identity (78.8% similar) in 316 aa overlap (17-332:36-349)

                             10        20        30        40      
pF1KB9               MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLA
                                     : :: .:.:..:: ::::.:..:.. : ::
CCDS31 RRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGILLNTLA
          10        20        30        40        50        60     

         50        60        70        80        90       100      
pF1KB9 MRIFFQIRSKSNFIIFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYF
       . .: .: :.:.:::.::::...::.: : .:::::::..:.   ::.:::. .::::: 
CCDS31 LWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSSVIFYE
          70        80        90       100       110       120     

        110       120       130       140       150       160      
pF1KB9 TMYISISFLGLITIDRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTNRQ
       :::..: .::::..::. :  ::...   :. . :: .:. :: :.:..:::: ::.:..
CCDS31 TMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNTILSNKE
         130       140       150       160       170       180     

        170       180       190       200       210       220      
pF1KB9 PRDKNVKKCSFLKSEFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGV
          ..::::. ::. .:: ::..:: ::: :::  :....: :..:.:..: :: .... 
CCDS31 ATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYRKSKSK
         190       200       210       220       230       240     

        230       240       250       260       270       280      
pF1KB9 GKVPRKKVNVKVFIIIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWL
        .   ::.. :::...::::.::.::::::.::: ::: .  ::  .: :: .::.::.:
CCDS31 DRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKETTLFL
         250       260       270       280       290       300     

        290       300       310       320       330       340  
pF1KB9 TSLNACLDPFIYFFLCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM
       .. : :.::.::.::::.: ..:  :    ..:.  ::.:.... :          
CCDS31 AATNICMDPLIYIFLCKKFTEKLPCMQGRKTTAS--SQENHSSQTDNITLG     
         310       320       330         340       350         

>>CCDS3156.1 P2RY14 gene_id:9934|Hs108|chr3               (338 aa)
 initn: 1023 init1: 990 opt: 1001  Z-score: 952.4  bits: 184.6 E(32554): 9.9e-47
Smith-Waterman score: 1001; 46.8% identity (77.5% similar) in 316 aa overlap (4-319:2-316)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLAMRIFFQIRSKSNFI
          ... .. : . : :...  ::: ..:.:: ..:..:.. ::..  ::: . :...::
CCDS31   MINSTSTQPPDES-CSQNLLITQQIIPVLYCMVFIAGILLNGVSGWIFFYVPSSKSFI
                 10         20        30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 IFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYFTMYISISFLGLITI
       :.::: ::.:..: ::::::::.:. ::   : .:::.:..:.:: .::.:: :.:::..
CCDS31 IYLKNIVIADFVMSLTFPFKILGDSGLGPWQLNVFVCRVSAVLFYVNMYVSIVFFGLISF
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 DRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTNRQPRDKNVKKCSFLKS
       ::: : ..:. ::  ...  .:.:::..: .:.::..::.::::.. :. .  ::  :::
CCDS31 DRYYKIVKPLWTSFIQSVSYSKLLSVIVWMLMLLLAVPNIILTNQSVREVTQIKCIELKS
       120       130       140       150       160       170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 EFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGVGKVPRKKVNVKVFI
       :.:  ::.  :::  .:::: ::..:: :: :::....:....   .   .:: . ..: 
CCDS31 ELGRKWHKASNYIFVAIFWIVFLLLIVFYTAITKKIFKSHLKSSRNSTSVKKKSSRNIFS
       180       190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 IIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWLTSLNACLDPFIYFF
       :. :::.::::.:.:::::: :::.  ..: ... : :.:: :: :.. :.::::.::::
CCDS31 IVFVFFVCFVPYHIARIPYTKSQTEAHYSCQSKEILRYMKEFTLLLSAANVCLDPIIYFF
       240       250       260       270       280       290       

              310       320       330       340  
pF1KB9 LCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM
       ::. ::. : . :. : .:                       
CCDS31 LCQPFREILCKKLHIPLKAQNDLDISRIKRGNTTLESTDTL 
       300       310       320       330         

>>CCDS3157.1 GPR87 gene_id:53836|Hs108|chr3               (358 aa)
 initn: 886 init1: 633 opt: 918  Z-score: 874.7  bits: 170.3 E(32554): 2.1e-42
Smith-Waterman score: 918; 42.2% identity (73.3% similar) in 329 aa overlap (6-330:25-348)

                                  10         20        30        40
pF1KB9                    MQAVDNLTSAPG-NTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGL
                               : ...:: ::.:     ..  ...:.:: ..: ...
CCDS31 MGFNLTLAKLPNNELHGQESHNSGNRSDGPGKNTTL---HNEFDTIVLPVLYLIIFVASI
               10        20        30           40        50       

               50        60        70        80        90       100
pF1KB9 ITNGLAMRIFFQIRSKSNFIIFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVT
       . ::::. :::.::.:..::..::: :..::.: :::::.:. :: .:   .. ..:. :
CCDS31 LLNGLAVWIFFHIRNKTSFIFYLKNIVVADLIMTLTFPFRIVHDAGFGPWYFKFILCRYT
        60        70        80        90       100       110       

              110       120       130       140       150       160
pF1KB9 SVIFYFTMYISISFLGLITIDRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNM
       ::.:: .:: :: :::::.:::: :...::  :   ..  .:.::: .:..: .:::::.
CCDS31 SVLFYANMYTSIVFLGLISIDRYLKVVKPFGDSRMYSITFTKVLSVCVWVIMAVLSLPNI
       120       130       140       150       160       170       

              170       180       190       200       210       220
pF1KB9 ILTNRQPRDKNVKKCSFLKSEFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSY
       :::: :: . :.. :: ::: .:. ::  :.:. . .:   ..:.: ::  :.. ...: 
CCDS31 ILTNGQPTEDNIHDCSKLKSPLGVKWHTAVTYVNSCLFVAVLVILIGCYIAISRYIHKS-
       180       190       200       210       220       230       

              230        240       250       260       270         
pF1KB9 VRTRGVGKVPRK-KVNVKVFIIIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYV
          . ...  :: : : .. ...:::: ::.:.:. :::.:.:.   ..: .:.. :.: 
CCDS31 -SRQFISQSSRKRKHNQSIRVVVAVFFTCFLPYHLCRIPFTFSHLDRLLDESAQKILYYC
         240       250       260       270       280       290     

     280       290       300       310         320       330       
pF1KB9 KESTLWLTSLNACLDPFIYFFLCKSFRNSLI--SMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPN
       :: ::.:.. :.::::.::::.:.::   :.  : ..  . .    :. :..:       
CCDS31 KEITLFLSACNVCLDPIIYFFMCRSFSRRLFKKSNIRTRSESIRSLQSVRRSEVRIYYDY
         300       310       320       330       340       350     

       340  
pF1KB9 EETPM
            
CCDS31 TDV  
            

>>CCDS3155.1 GPR171 gene_id:29909|Hs108|chr3              (319 aa)
 initn: 571 init1: 315 opt: 656  Z-score: 630.9  bits: 125.1 E(32554): 8e-29
Smith-Waterman score: 656; 34.4% identity (68.1% similar) in 320 aa overlap (13-327:3-314)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLAMRIFFQIRSKSNFI
                   :.:.    ::  .  :  .. ..:.::.: . .:   :.:  ..   .
CCDS31           MTNSSFFCPVYKDLEP-FTYFFYLVFLVGIIGSCFATWAFIQKNTNHRCV
                         10         20        30        40         

                70        80        90         100       110       
pF1KB9 -IFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGP--LRTFVCQVTSVIFYFTMYISISFLGL
        :.: : . .:.:. :..: ::. :  ::..:  :. : ::::. ..:..::.:: ::..
CCDS31 SIYLINLLTADFLLTLALPVKIVVD--LGVAPWKLKIFHCQVTACLIYINMYLSIIFLAF
      50        60        70          80        90       100       

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB9 ITIDRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTNRQPRDKNVKKCSF
       ..:::  . :.  :    ..   ::..:.:.: ...:. .:::..  .. ..:.   :  
CCDS31 VSIDRCLQLTHSCKIYRIQEPGFAKMISTVVWLMVLLIMVPNMMIPIKDIKEKSNVGCME
       110       120       130       140       150       160       

       180       190       200        210       220       230      
pF1KB9 LKSEFGLVWHEIVNYICQVIFWINF-LIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGVGKVPR-KKVN
       .:.:::  :: ..:.:: .:: .::  :...   :. ..:::.    .   . :  ::. 
CCDS31 FKKEFGRNWHLLTNFICVAIF-LNFSAIILISNCLVIRQLYRN----KDNENYPNVKKAL
       170       180        190       200           210       220  

         240       250       260       270       280       290     
pF1KB9 VKVFIIIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWLTSLNACLDP
       ...... . ..:::::.:..:::::::::. . ::... .:: .::.:: :.  : :.::
CCDS31 INILLVTTGYIICFVPYHIVRIPYTLSQTEVITDCSTRISLFKAKEATLLLAVSNLCFDP
            230       240       250       260       270       280  

         300       310       320       330       340  
pF1KB9 FIYFFLCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM
       ..:. : :.::...   .  :. . . ..  :               
CCDS31 ILYYHLSKAFRSKVTETFASPKETKAQKEKLRCENNA          
            290       300       310                   

>>CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX               (381 aa)
 initn: 325 init1: 269 opt: 575  Z-score: 554.5  bits: 111.2 E(32554): 1.5e-24
Smith-Waterman score: 575; 32.6% identity (64.6% similar) in 316 aa overlap (2-313:32-342)

                                            10        20        30 
pF1KB9                              MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLL
                                     :  .:....: :.. :  : :. ....   
CCDS14 RSHTITMTTTSVSSWPYSSHRMRFITNHSDQPPQNFSATP-NVTTCPMDEKLLSTVLTTS
              10        20        30        40         50        60

              40        50        60         70        80        90
pF1KB9 YTVLFFVGLITNGLAMRIFFQIRSKSNFI-IFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTG
       :.:.:.:::. : .:. .:. :. : : : :.: :..:.:::.:. .::.:.   . .  
CCDS14 YSVIFIVGLVGNIIALYVFLGIHRKRNSIQIYLLNVAIADLLLIFCLPFRIMYHINQNKW
               70        80        90       100       110       120

              100       110       120       130       140       150
pF1KB9 PLRTFVCQVTSVIFYFTMYISISFLGLITIDRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWA
        : ...:.:....::..::::: .::.:..::: : .: ..  .  .   .  .  ..: 
CCDS14 TLGVILCKVVGTLFYMNMYISIILLGFISLDRYIKINRSIQQRKAITTKQSIYVCCIVWM
              130       140       150       160       170       180

              160       170       180       190       200       210
pF1KB9 FMFLLSLPNMILTNRQPRDKNVKKCSFLKSEFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYT
       . .   :  .::: ..   .:   :   ... .   . : :.:  :.::. ::..:. : 
CCDS14 LALGGFLTMIILTLKKG-GHNSTMCFHYRDKHNAKGEAIFNFILVVMFWLIFLLIILSYI
              190        200       210       220       230         

               220         230       240       250       260       
pF1KB9 LITKELYR-SYVRTR--GVGKVPRKKVNVKVFIIIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDV
        : :.: : :  :..  . ::      :   ::.. .: :::::.:  :. :  ::  .:
CCDS14 KIGKNLLRISKRRSKFPNSGKYATTARN--SFIVLIIFTICFVPYHAFRFIYISSQL-NV
     240       250       260         270       280       290       

       270       280       290       300       310       320       
pF1KB9 FDCTAENTLFYVKESTLWLTSLNACLDPFIYFFLCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNR
        .:  .. .  ..:  : :.:.:.:::: .::.. ...:. . ..:              
CCDS14 SSCYWKEIVHKTNEIMLVLSSFNSCLDPVMYFLMSSNIRKIMCQLLFRRFQGEPSRSEST
        300       310       320       330       340       350      

       330       340            
pF1KB9 KKEQDGGDPNEETPM          
                                
CCDS14 SEFKPGYSLHDTSVAVKIQSSSKST
        360       370       380 

>>CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13              (361 aa)
 initn: 523 init1: 217 opt: 522  Z-score: 505.3  bits: 102.0 E(32554): 7.9e-22
Smith-Waterman score: 522; 27.0% identity (63.1% similar) in 355 aa overlap (1-342:3-351)

                    10         20        30        40        50    
pF1KB9   MQAVDNLT---SAP-GNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLAMRIFFQIR
         .: ..:.:   ..: ::       .. .....:: :...:..::. : ::. .. : :
CCDS94 MDIQMANNFTPPSATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLHYSLVFIIGLVGNLLALVVIVQNR
               10        20        30        40        50        60

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB9 SKSN-FIIFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYFTMYISIS
       .: :   ..  : ::::.:.  ..: .:   :      .   .:..:...::.. : ...
CCDS94 KKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIAYYAMGFDWRIGDALCRITALVFYINTYAGVN
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB9 FLGLITIDRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTNRQPRDKNVK
       :.  ..:::.  ...:.. .. : .  :: . . .: ..:  .:: .:    . . . . 
CCDS94 FMTCLSIDRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCIFVWILVFAQTLPLLINPMSKQEAERIT
              130       140       150       160       170       180

               180       190       200       210       220         
pF1KB9 KC----SFLKSEFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGVGK-
        :    .: ... .: :  :.   : . . . ..:...::. :  .:.:.  ..  . : 
CCDS94 -CMEYPNFEETK-SLPW--ILLGACFIGYVLPLIIILICYSQICCKLFRTAKQNPLTEKS
               190          200       210       220       230      

       230       240       250       260         270       280     
pF1KB9 -VPRKKVNVKVFIIIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTR--DVFDCTAENTLFYVKESTLW
        : .: .:. ...::.:: .::.:.: : : . ... :  . ..:. ....    . :. 
CCDS94 GVNKKALNT-IILIIVVFVLCFTPYHVAIIQHMIKKLRFSNFLECSQRHSFQISLHFTVC
        240        250       260       270       280       290     

         290       300       310       320       330       340     
pF1KB9 LTSLNACLDPFIYFFLCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM   
       : ..: :.::::::: ::... ... :::   :. :.:.  ..  ....    :: :   
CCDS94 LMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMRMLKRQVSV-SISSAVKSAPEENSREMTETQMMIH
         300       310       320        330       340       350    

CCDS94 SKSSNGK
          360 

>>CCDS318.1 PTAFR gene_id:5724|Hs108|chr1                 (342 aa)
 initn: 391 init1: 160 opt: 517  Z-score: 500.9  bits: 101.1 E(32554): 1.4e-21
Smith-Waterman score: 517; 33.2% identity (64.2% similar) in 307 aa overlap (11-309:3-304)

               10        20        30        40        50          
pF1KB9 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLAMRIFFQIR--SKSN
                 : ..:    ... :  :::..:...: .:.:.:: .. .: ..   .: :
CCDS31         MEPHDSSHMDSEFRYT--LFPIVYSIIFVLGVIANGYVLWVFARLYPCKKFN
                       10          20        30        40        50

       60         70        80        90       100       110       
pF1KB9 FI-IFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYFTMYISISFLGL
        : ::. : ...:.:...:.:. :.   . :.  :  :.:.:.. .:... : :..:::.
CCDS31 EIKIFMVNLTMADMLFLITLPLWIVYYQNQGNWILPKFLCNVAGCLFFINTYCSVAFLGV
               60        70        80        90       100       110

       120       130       140       150       160         170     
pF1KB9 ITIDRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMIL--TNRQPRDK---NV
       :: .:.: .:::.::.. ..   .  ::.:::. .   .   .::  ::  : .    ::
CCDS31 ITYNRFQAVTRPIKTAQANTRKRGISLSLVIWVAIVGAASYFLILDSTNTVPDSAGSGNV
              120       130       140       150       160       170

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB9 KKCSFLKSEFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGVGKVPRK
        .: : . : : :   :.. .    :.. :::.. :  .: . :  . :. .  ..: :.
CCDS31 TRC-FEHYEKGSVPVLIIHIFIVFSFFLVFLIILFCNLVIIRTLLMQPVQQQRNAEVKRR
               180       190       200       210       220         

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB9 KVNVKVFIIIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWLTSLNAC
        . . :  ..:::.::::: : ...:.::..     :   ....  ... :: : : :  
CCDS31 ALWM-VCTVLAVFIICFVPHHVVQLPWTLAEL-GFQDSKFHQAINDAHQVTLCLLSTNCV
     230        240       250       260        270       280       

            300       310       320       330       340       
pF1KB9 LDPFIYFFLCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM     
       ::: :: :: :.::. :                                      
CCDS31 LDPVIYCFLTKKFRKHLTEKFYSMRSSRKCSRATTDTVTEVVVPFNQIPGNSLKN
       290       300       310       320       330       340  

>>CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13              (344 aa)
 initn: 328 init1: 162 opt: 489  Z-score: 474.8  bits: 96.3 E(32554): 4e-20
Smith-Waterman score: 489; 26.6% identity (64.5% similar) in 301 aa overlap (13-309:5-302)

               10        20        30        40        50          
pF1KB9 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLAMRIFFQI-RSKSNF
                   :.: :  . ..  .:.  .....: .:::.: .:. ::. . . ... 
CCDS94         MVSVNSSHCFYNDSFKYTLYGCMFSMVFVLGLISNCVAIYIFICVLKVRNET
                       10        20        30        40        50  

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB9 IIFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYFTMYISISFLGLIT
         .. : ..::::...:.::.:.      . :.  ..:... ..:: .:: :: ::  :.
CCDS94 TTYMINLAMSDLLFVFTLPFRIFY-FTTRNWPFGDLLCKISVMLFYTNMYGSILFLTCIS
             60        70         80        90       100       110 

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB9 IDRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTNRQPRDKNVKK-C--S
       .::.   . :::... ..  .:::. . .:  ..  : : ... . . . .:... :  .
CCDS94 VDRFLAIVYPFKSKTLRTKRNAKIVCTGVWLTVIGGSAPAVFVQSTHSQGNNASEACFEN
             120       130       140       150       160       170 

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB9 FLKSEFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGVGKVPRKKVNV
       : .. .     .:: .:  : :.: ... ..: ... : : .  . .:  .:. . ::  
CCDS94 FPEATWKTYLSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSSMVLKTLTKPVTLSR--SKINKTKVLK
             180       190       200       210         220         

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB9 KVFIIIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWLTSLNACLDPF
        .:. . .: .::::...  : :.: .:.   .:..  ..  .   :: ..  : :.::.
CCDS94 MIFVHLIIFCFCFVPYNINLILYSLVRTQTFVNCSVVAAVRTMYPITLCIAVSNCCFDPI
     230       240       250       260       270       280         

        300       310       320       330       340           
pF1KB9 IYFFLCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM         
       .:.:   ...::.                                          
CCDS94 VYYFTSDTIQNSIKMKNWSVRRSDFRFSEVHGAENFIQHNLQTLKSKIFDNESAA
     290       300       310       320       330       340    

>>CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13            (346 aa)
 initn: 329 init1: 174 opt: 486  Z-score: 472.0  bits: 95.8 E(32554): 5.7e-20
Smith-Waterman score: 486; 29.5% identity (62.5% similar) in 312 aa overlap (6-314:20-321)

                             10         20        30        40     
pF1KB9               MQAVDNLTSAPGNTSLCT-RDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGL
                          : : . .:.  :: ...:  . .::..: ..:: :.. :::
CCDS94 MERKFMSLQPSISVSEMEPNGTFSNNNSRNCTIENFK--REFFPIVYLIIFFWGVLGNGL
               10        20        30          40        50        

          50        60         70        80        90       100    
pF1KB9 AMRIFFQIRSKSNFI-IFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIF
       .. .:.:  .::. . .:. : .:::::.: :.::.     . ..  .  ..:.. :  .
CCDS94 SIYVFLQPYKKSTSVNVFMLNLAISDLLFISTLPFRADYYLRGSNWIFGDLACRIMSYSL
       60        70        80        90       100       110        

          110       120       130       140       150       160    
pF1KB9 YFTMYISISFLGLITIDRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTN
       : .:: :: :: .... :.   ..::.  .  .. .: ::  .:: ...  :.  :.: .
CCDS94 YVNMYSSIYFLTVLSVVRFLAMVHPFRLLHVTSIRSAWILCGIIWILIMASSI--MLLDS
      120       130       140       150       160       170        

          170       180       190        200       210       220   
pF1KB9 RQPRDKNVKKCSFLKSEFGLVWHEIVNYICQVI-FWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRT
        . .. .: .:  : . . ..  . .:::  :.   . :. . .:: :: . : .  :  
CCDS94 GSEQNGSVTSCLEL-NLYKIAKLQTMNYIALVVGCLLPFFTLSICYLLIIRVLLKVEVPE
        180       190        200       210       220       230     

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB9 RGVGKVPRKKVNVKVFIIIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKEST
        :. .: ..:. . ..: . .::.::.:.:  :  .    :  :  :  .. :  .   :
CCDS94 SGL-RVSHRKALTTIIITLIIFFLCFLPYHTLRTVHL--TTWKVGLC--KDRLHKALVIT
          240       250       260       270           280       290

           290       300       310       320       330       340  
pF1KB9 LWLTSLNACLDPFIYFFLCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM
       : :.. :::..:..:.:  ..:.. : : :.                            
CCDS94 LALAAANACFNPLLYYFAGENFKDRLKSALRKGHPQKAKTKCVFPVSVWLRKETRV   
              300       310       320       330       340         




342 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 19:32:40 2016 done: Fri Nov  4 19:32:41 2016
 Total Scan time:  1.900 Total Display time:  0.040

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com