seq1 = pF1KB9803.tfa, 600 bp
seq2 = pF1KB9803/gi568815575f_103509065.tfa (gi568815575f:103509065_103709664), 200600 bp

>pF1KB9803 600
>gi568815575f:103509065_103709664 (ChrX)

1-600  (100001-100600)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAAAACCCTACAATAAAAATGAAGGAAACCTGGAAAACGAGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAAAACCCTACAATAAAAATGAAGGAAACCTGGAAAACGAGGGAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCAGAAGATGAAGTAGAGCCTGATGATGAAGGAAAGTCAGACGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCAGAAGATGAAGTAGAGCCTGATGATGAAGGAAAGTCAGACGAGGAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAAAGCCAGACGTGGAGGGGAAGACAGAATGCGAGGGAAAGAGAGAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAAAGCCAGACGTGGAGGGGAAGACAGAATGCGAGGGAAAGAGAGAGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGGAGAGCCAGGTGATGAGGGACAACTGGAAGATGAGGGAAGCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGGGAGAGCCAGGTGATGAGGGACAACTGGAAGATGAGGGAAGCCAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AAAGCAGGGCAGGTCCGAAGGTGAGGGCAAGCCACAAGGCGAGGGCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AAAGCAGGGCAGGTCCGAAGGTGAGGGCAAGCCACAAGGCGAGGGCAAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAGCCTCCCAGGCAAAGCCAGAGAGCCAGCCGCGGGCCGCCGAAAAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CAGCCTCCCAGGCAAAGCCAGAGAGCCAGCCGCGGGCCGCCGAAAAGCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCGGCTGAAGATTATGTGCCCCGGAAAGCAAAAAGAAAAACGGACAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCGGCTGAAGATTATGTGCCCCGGAAAGCAAAAAGAAAAACGGACAGGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GACGGACGATTCCCCCAAGGACTCTCAGGAGGACTTACAGGAAAGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GACGGACGATTCCCCCAAGGACTCTCAGGAGGACTTACAGGAAAGGCATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGAGCAGTGAGGAGATGATGAGAGAATGTGGAGATGTGTCAAGGGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGAGCAGTGAGGAGATGATGAGAGAATGTGGAGATGTGTCAAGGGCTCAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAGGAGCTAAGGAAAAAACAGAAAATGGGTGGTTTTCATTGGATGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAGGAGCTAAGGAAAAAACAGAAAATGGGTGGTTTTCATTGGATGCAAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGATGTACAGGATCCATTCGCCCCAAGGGGACAACGGGGTGTCAGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGATGTACAGGATCCATTCGCCCCAAGGGGACAACGGGGTGTCAGGGGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGAGGGGTGGAGGTAGGGGCCAGAGGGGCTTACACGATATCCCATACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGAGGGGTGGAGGTAGGGGCCAGAGGGGCTTACACGATATCCCATACCTT