Result of SIM4 for pF1KB9696

seq1 = pF1KB9696.tfa, 795 bp
seq2 = pF1KB9696/gi568815593f_150066877.tfa (gi568815593f:150066877_150283677), 216801 bp

>pF1KB9696 795
>gi568815593f:150066877_150283677 (Chr5)

1-445  (100001-100445)   99% ->
446-591  (115892-116037)   100% ->
592-795  (116598-116801)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTATGTGGGCTATGTGCTGGACAAGGATTCGCCCGTGTACCCCGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTATGTGGGCTATGTGCTGGACAAGGATTCGCCCGTGTACCCCGGCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCCAGGCCAGCCAGCCTCGGCCTGGGCCCGCAAGCCTACGGCCCCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGCCAGGCCAGCCAGCCTCGGCCTGGGCCCGCAAGCCTACGGCCCCCCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCCGCCCCCGGCGCCCCCGCAGTACCCCGACTTCTCCAGCTACTCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCCGCCCCCGGCGCCCCCGCAGTACCCCGACTTCTCCAGCTACTCTCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGGAGCCGGCCCCCGCGCCCCCGACGGCCTGGGGGGCGCCCTTCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGGAGCCGGCCCCCGCGCCCCCGACGGCCTGGGGGGCGCCCTTCCCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCCCAAGGACGACTGGGCCGCCGCCTACGGCCCGGGCCCCGCGGCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCCCAAGGACGACTGGGCCGCCGCCTACGGCCCGGGCCCCGCGGCCCCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCGCCAGCCCAGCTTCGCTGGCATTCGGGCCCCCTCCAGACTTTAGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCGCCAGCCCAGCTTCGCTGGCATTCGGGCCCCCTCCAGACTTTAGCCCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGCCGGCGCCCCCTGGGCCCGGCCCGGGCCTCCTGGCGCAGCCCCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGCCGGCGCCCCCTGGGCCCGGCCCGGGCCTCCTGGCGCAGCCCCTCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGGCCCGGGCACACCGTCCTCGCCCGGAGCGCAGAGGCGGACGCCCTACG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 100351 GGGCCCGGGCACACCGTCCTCGCCCGGAGCGCAGAGGCCGACGCCCTACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGTGGATGCGGCGCAGCGTGGCGGCCGGAGGCGGCGGTGGCAGCG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100401 AGTGGATGCGGCGCAGCGTGGCGGCCGGAGGCGGCGGTGGCAGCGGTA..

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    446     GTAAGACTCGGACCAAGGACAAGTACCGCGTGGTCTACACCGACCA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 .CAGGTAAGACTCGGACCAAGGACAAGTACCGCGTGGTCTACACCGACCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CCAACGCCTGGAGCTGGAGAAGGAGTTTCATTACAGCCGTTACATCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115938 CCAACGCCTGGAGCTGGAGAAGGAGTTTCATTACAGCCGTTACATCACAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TCCGGCGGAAATCAGAGCTGGCTGCCAATCTGGGGCTCACTGAACGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115988 TCCGGCGGAAATCAGAGCTGGCTGCCAATCTGGGGCTCACTGAACGGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592          GTGAAGATCTGGTTCCAAAACCGGCGGGCAAAGGAGCGCAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116038 GTG...CAGGTGAAGATCTGGTTCCAAAACCGGCGGGCAAAGGAGCGCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 AGTGAACAAGAAGAAACAGCAGCAGCAACAGCCCCCACAGCCGCCGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116639 AGTGAACAAGAAGAAACAGCAGCAGCAACAGCCCCCACAGCCGCCGATGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CCCACGACATCACGGCCACCCCAGCCGGGCCATCCCTGGGGGGCCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116689 CCCACGACATCACGGCCACCCCAGCCGGGCCATCCCTGGGGGGCCTGTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CCCAGCAACACCAGCCTCCTGGCCACCTCCTCTCCAATGCCTGTGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116739 CCCAGCAACACCAGCCTCCTGGCCACCTCCTCTCCAATGCCTGTGAAAGA

    800     .    :
    783 GGAGTTTCTGCCA
        |||||||||||||
 116789 GGAGTTTCTGCCA

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