Result of SIM4 for pF1KB9599

seq1 = pF1KB9599.tfa, 1317 bp
seq2 = pF1KB9599/gi568815596f_113399257.tfa (gi568815596f:113399257_113600583), 201327 bp

>pF1KB9599 1317
>gi568815596f:113399257_113600583 (Chr2)

1-1317  (100001-101327)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACTTGCCAAGAGCTGAGCGCCTTCGCTCCACACCGCAGCGCAGCCT
        |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACCTGCCAAGAGCTGAGCGCCCTCGCTCCACACCGCAGCGCAGCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGGACTCCGATGGGGAAGACGGTAAAATCGATGTCCTGGGAGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGGGACTCCGATGGGGAAGACGGTAAAATCGATGTCCTGGGAGAGGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGATGAAGACGAGG    AG  GAGG      CGGCGAGCCAGCAGTTC
        |||||||||||||||----||--||||------ |||||||||| |||||
 100101 AAGATGAAGACGAGGTGGAAGACGAGGAGGAGGAGGCGAGCCAGAAGTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    139 CTAGAGCAGTCGCTCCAGCCGGGGCTGCAGGTGGCCCGGTGGGGCGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTAGAGCAGTCGCTCCAGCCGGGGCTGCAGGTGGCCCGGTGGGGCGGGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    189 TGCGCTTCCCCGAGAGCACATCGAGGGCGGCGGCGGCCCGAGCGACCCCT
        ||||||||||||||||||||||||--|-||||||||||||||||||||||
 100201 TGCGCTTCCCCGAGAGCACATCGA  G GGCGGCGGCCCGAGCGACCCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    239 CAGAGTTTGGCACCGAGTTCAGGGCACCGCCAAGGTCTGCGGCGGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100248 CAGAGTTTGGCACCGAGTTCAGGGCACCGCCAAGGTCTGCGGCGGCCTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    289 GAAGATGCCCGGCAGCCGGCAAAGCCCCCCTCCTCGTACATCGCGCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 100298 GAAGATGCCCGGCAGCCGGCAAAGCCCCCCTACTCGTACATCGCGCTCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    339 CACCATGGCCATCCTGCAAAGCCCGCACAAGCGCCTCACGCTCAGCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100348 CACCATGGCCATCCTGCAAAGCCCGCACAAGCGCCTCACGCTCAGCGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    389 TCTGCGCCTTCATTAGTGGCCGCTTCCCCTACTACTGCCGCAAGTTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 100398 TCTGCGCCTTCATTAGTGGCCGCTTCCCCTACTACCGCCGCAAGTTCCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    439 GCCTGGCAGAACAGCATCCGCCACAACCTCTCGCTGAACGACTGCTTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100448 GCCTGGCAGAACAGCATCCGCCACAACCTCTCGCTGAACGACTGCTTCGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    489 CAAGATCCCCCGCGAGCCGGGCCGCCCAGGCAAGGGCAACTACTGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
 100498 CAAGATCCCCCGCGAGCCGGGCCACCCAGGCAAGGGCACCTACTGGAGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    539 TGGACCCCGCCTCCCAGGACATGTTCGACAATGGCAGCTTTCTCCGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100548 TGGACCCCGCCTCCCAGGACATGTTCGACAATGGCAGCTTTCTCCGGCGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    589 AGGAAGCGTTTCCAGCGCCACCAACCGACCCCGGGAGCCCACCTGCCCCA
        |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 100598 AGGAAGCGTTTCAAGCGCCACCAACTGACCCCGGGAGCCCACCTGCCCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    639 CCCCTTCCCTCTACCTGCTGCACACGCCGCCCTGCACAACCCCCGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100648 CCCCTTCCCTCTACCTGCTGCACACGCCGCCCTGCACAACCCCCGCCCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    689 GCCGTCTGCTTGGGGCCCCTGCCCCGCCGCAGCCAGTCCCGGGGGCCTAC
        ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 100698 GCCCTCTGCTTGGGGCCCCTGCCCTGCCGCAGCCAGTCCCGGGGGCCTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    739 CCCAACACCGCCCCCGGGAGACGCCCTTACGCTCTGCTGCACCCGCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100748 CCCAACACCGCCCCCGGGAGACGCCCTTACGCTCTGCTGCACCCGCATCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    789 TCCTCGCTACCTACTGCTCTCGGCCCCCGCCTATGCCGGGGCACCGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100798 TCCTCGCTACCTACTGCTCTCGGCCCCCGCCTATGCCGGGGCACCGAAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    839 AAGCAGAAGGCGCGGACCTGGCGACCCC GGCACCCTTCCCGTGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||
 100848 AAGCAGAAGGCGCGGACCTGGCGACCCCCGGCACCCTTCCCGTGCTGCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CCCTCACTTGGTCCTCAGCCTTGGGAGGAGGGCAAGGGTCTGGCGTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100898 CCCTCACTTGGTCCTCAGCCTTGGGAGGAGGGCAAGGGTCTGGCGTCGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ACCGGGAGGCGGATGCATCTCTTTCAGCATTGAGAGTATCATGCAAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100948 ACCGGGAGGCGGATGCATCTCTTTCAGCATTGAGAGTATCATGCAAGGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TCAGGGGAGCGGGTACAGGGGCTGCGCAGAGTTTGTCCCCGACCGCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100998 TCAGGGGAGCGGGTACAGGGGCTGCGCAGAGTTTGTCCCCGACCGCGTGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 AGCTACTGCCCCCTGCTCCAGCGACCGTCAAGCCTGTCGGACAATTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101048 AGCTACTGCCCCCTGCTCCAGCGACCGTCAAGCCTGTCGGACAATTTTGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AGCAACAGCAGCGGCATCAGGAGGAGGACTGCGCCAACGGCTGCGCTCCC
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101098 AGCAACAGCAGCAGCATCAGGAGGAGGACTGCGCCAACGGCTGCGCTCCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 ACCAAGGGCGCGGTGCTGGGCGGGCACCTGTCGGCCGCGTCGGCGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101148 ACCAAGGGCGCGGTGCTGGGCGGGCACCTGTCGGCCGCGTCGGCGCTGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GCGGTATCAGGCGGTGGCAGAGGGCTCTGGGCTGACATCGCTGGCCGCCC
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||
 101198 GCGGTATCAGGCGGTGGCAGAGGGCTCTAGGCTGACATCGCTGGCTGCCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CTTTGGGCGGAGAGGGGACCTCACCAGTTTTTTTAGTATCGCCCACGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101248 CTTTGGGCGGAGAGGGGACCTCACCAGTTTTTTTAGTATCGCCCACGCCC

   1300     .    :    .    :    .    :
   1288 GGTTCCCTGGCCGAGTCCGCAGGGCCCTCC
         ||||||||||| |||||||||||||||||
 101298 AGTTCCCTGGCCAAGTCCGCAGGGCCCTCC

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