FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9545, 543 aa 1>>>pF1KB9545 543 - 543 aa - 543 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5723+/-0.00049; mu= 4.6417+/- 0.030 mean_var=401.1281+/-99.112, 0's: 0 Z-trim(116.8): 733 B-trim: 2967 in 2/54 Lambda= 0.064037 statistics sampled from 27119 (28242) to 27119 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.682), E-opt: 0.2 (0.331), width: 16 Scan time: 8.840 The best scores are: opt bits E(85289) XP_011507633 (OMIM: 614787,616364) PREDICTED: pogo (1291) 990 107.2 3.2e-22 NP_665739 (OMIM: 614787,616364) pogo transposable (1315) 990 107.2 3.2e-22 NP_001181867 (OMIM: 614787,616364) pogo transposab (1348) 990 107.2 3.3e-22 XP_005245063 (OMIM: 614787,616364) PREDICTED: pogo (1357) 990 107.2 3.3e-22 XP_016856237 (OMIM: 614787,616364) PREDICTED: pogo (1357) 990 107.2 3.3e-22 NP_997054 (OMIM: 614787,616364) pogo transposable (1357) 990 107.2 3.3e-22 XP_016856238 (OMIM: 614787,616364) PREDICTED: pogo (1357) 990 107.2 3.3e-22 XP_005245062 (OMIM: 614787,616364) PREDICTED: pogo (1357) 990 107.2 3.3e-22 XP_016856234 (OMIM: 614787,616364) PREDICTED: pogo (1401) 990 107.3 3.3e-22 XP_016856235 (OMIM: 614787,616364) PREDICTED: pogo (1401) 990 107.3 3.3e-22 NP_001181866 (OMIM: 614787,616364) pogo transposab (1401) 990 107.3 3.3e-22 XP_005245057 (OMIM: 614787,616364) PREDICTED: pogo (1410) 990 107.3 3.4e-22 NP_055915 (OMIM: 614787,616364) pogo transposable (1410) 990 107.3 3.4e-22 XP_005245056 (OMIM: 614787,616364) PREDICTED: pogo (1410) 990 107.3 3.4e-22 XP_005245058 (OMIM: 614787,616364) PREDICTED: pogo (1410) 990 107.3 3.4e-22 XP_016856233 (OMIM: 614787,616364) PREDICTED: pogo (1417) 990 107.3 3.4e-22 XP_016856236 (OMIM: 614787,616364) PREDICTED: pogo (1361) 543 65.9 8.9e-10 XP_011540388 (OMIM: 604084) PREDICTED: zinc finger ( 728) 316 44.6 0.0013 XP_011540389 (OMIM: 604084) PREDICTED: zinc finger ( 728) 316 44.6 0.0013 XP_016857731 (OMIM: 604084) PREDICTED: zinc finger ( 728) 316 44.6 0.0013 XP_005246044 (OMIM: 604084) PREDICTED: zinc finger ( 734) 316 44.6 0.0013 XP_011540387 (OMIM: 604084) PREDICTED: zinc finger ( 734) 316 44.6 0.0013 XP_005246043 (OMIM: 604084) PREDICTED: zinc finger ( 747) 316 44.6 0.0013 NP_001274532 (OMIM: 604084) zinc finger and BTB do ( 810) 316 44.6 0.0014 XP_011540390 (OMIM: 604084) PREDICTED: zinc finger ( 721) 306 43.6 0.0024 NP_001229813 (OMIM: 604084) zinc finger and BTB do ( 721) 306 43.6 0.0024 NP_001311066 (OMIM: 604084) zinc finger and BTB do ( 727) 306 43.6 0.0025 NP_001274533 (OMIM: 604084) zinc finger and BTB do ( 727) 306 43.6 0.0025 NP_001311067 (OMIM: 604084) zinc finger and BTB do ( 740) 306 43.7 0.0025 NP_003434 (OMIM: 604084) zinc finger and BTB domai ( 803) 306 43.7 0.0026 >>XP_011507633 (OMIM: 614787,616364) PREDICTED: pogo tra (1291 aa) initn: 944 init1: 816 opt: 990 Z-score: 519.9 bits: 107.2 E(85289): 3.2e-22 Smith-Waterman score: 1018; 36.7% identity (61.9% similar) in 528 aa overlap (33-536:81-602) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 QSCEEEKEPEPQKNIQETKQVDDEDAELIFVGVEHVNEDAELIFVGVTSNSKPVVSNILN ::: .: . . : : .:. .: .. 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