FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9521, 588 aa 1>>>pF1KB9521 588 - 588 aa - 588 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6310+/-0.000308; mu= 15.0267+/- 0.019 mean_var=141.9410+/-29.320, 0's: 0 Z-trim(120.4): 53 B-trim: 0 in 0/57 Lambda= 0.107652 statistics sampled from 35457 (35518) to 35457 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.743), E-opt: 0.2 (0.416), width: 16 Scan time: 12.470 The best scores are: opt bits E(85289) XP_016856740 (OMIM: 614269) PREDICTED: probable G- ( 454) 969 162.0 3.9e-39 XP_011539736 (OMIM: 614269) PREDICTED: probable G- ( 609) 969 162.1 4.9e-39 XP_016856739 (OMIM: 614269) PREDICTED: probable G- ( 609) 969 162.1 4.9e-39 NP_997253 (OMIM: 614269) probable G-protein couple ( 609) 969 162.1 4.9e-39 >>XP_016856740 (OMIM: 614269) PREDICTED: probable G-prot (454 aa) initn: 852 init1: 692 opt: 969 Z-score: 823.5 bits: 162.0 E(85289): 3.9e-39 Smith-Waterman score: 1459; 55.7% identity (79.5% similar) in 409 aa overlap (8-406:2-389) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MARGGAGAEEASLRSNALSWLACGLLALLANAWIILSISAKQQKHKPLELLLCFLAGTHI ..: : ..:..::.:: :.:::::: :::..:::.: ::::.::: ::.::. XP_016 MSDERRLPGSAVGWLVCGGLSLLANAWGILSVGAKQKKWKPLEFLLCTLAATHM 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 LMAAVPLTTFAVVQLRRQASSDYDWNESICKVFVSTYYTLALATCFTVASLSYHRMWMVR : .:::..:..::::::: :..:::..:::::::.:::.:::::.:.:::::::::: XP_016 LNVAVPIATYSVVQLRRQ-RPDFEWNEGLCKVFVSTFYTLTLATCFSVTSLSYHRMWMVC 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 WPVNYRLSNAKKQALHAVMGIWMVSFILSTLPSIGWHNNGERYYARGCQFIVSKIGLGFG ::::::::::::::.:.::::::::::::.::..:::...::.:..::.:::..:::::: XP_016 WPVNYRLSNAKKQAVHTVMGIWMVSFILSALPAVGWHDTSERFYTHGCRFIVAEIGLGFG 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 VCFSLLLLGGIVMGLVCVAITFYQTLWARPRRARQARRVGGGGGTKAGGPGALGTRPAFE ::: ::. :...::..:.::...::: .. .::: : :: XP_016 VCFLLLVGGSVAMGVICTAIALFQTLAVQ--VGRQA------------------DRRAFT 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 VPAIVVEDARGKRRSSLDGSESAKTSLQVTNLVSAIVFLYDSLTGVPILVVSFFSLKSDS ::.::::::.::::::.:::: ::::::.:.::..:::.:: : : :.::::: ::..:. XP_016 VPTIVVEDAQGKRRSSIDGSEPAKTSLQTTGLVTTIVFIYDCLMGFPVLVVSFSSLRADA 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 pF1KB9 APPWMVLAVLWCSMAQTLLLPSFIWSCERYRADVRTVWEQCVAIMS-EEDGDDD----GG . :::.: :::::.::.:::: :.:.:.:::::...: :.:.:.:. .:..::. :: XP_016 SAPWMALCVLWCSVAQALLLPVFLWACDRYRADLKAVREKCMALMANDEESDDETSLEGG 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KB9 CD-DYAEGRVCKVRFDANGATGPGSRDPAQVKLLPGRHMLFP--PLE--RVHYLQVPLSR . : . : . .. .. : : .:.: ::. ...:::: XP_016 ISPDLVLERSLDYGYGGDFVALDRMAKYEISALEGGLPQLYPLRPLQEDKMQYLQVSAGL 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KB9 RLSHDETNIFSTPREPGSFLHKWSSSDDIRVLPAQSRALGGPPEYLGQGHRLEDEEDEEE XP_016 GERPHLRVTGCPELPEASPLGAHLTPSAVAGVAVTIRGRAVQRSHSLCGWAPTATPMVPV 400 410 420 430 440 450 >>XP_011539736 (OMIM: 614269) PREDICTED: probable G-prot (609 aa) initn: 945 init1: 692 opt: 969 Z-score: 821.9 bits: 162.1 E(85289): 4.9e-39 Smith-Waterman score: 1611; 47.0% identity (71.2% similar) in 593 aa overlap (8-579:2-564) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MARGGAGAEEASLRSNALSWLACGLLALLANAWIILSISAKQQKHKPLELLLCFLAGTHI ..: : ..:..::.:: :.:::::: :::..:::.: ::::.::: ::.::. XP_011 MSDERRLPGSAVGWLVCGGLSLLANAWGILSVGAKQKKWKPLEFLLCTLAATHM 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 LMAAVPLTTFAVVQLRRQASSDYDWNESICKVFVSTYYTLALATCFTVASLSYHRMWMVR : .:::..:..::::::: :..:::..:::::::.:::.:::::.:.:::::::::: XP_011 LNVAVPIATYSVVQLRRQ-RPDFEWNEGLCKVFVSTFYTLTLATCFSVTSLSYHRMWMVC 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 WPVNYRLSNAKKQALHAVMGIWMVSFILSTLPSIGWHNNGERYYARGCQFIVSKIGLGFG ::::::::::::::.:.::::::::::::.::..:::...::.:..::.:::..:::::: XP_011 WPVNYRLSNAKKQAVHTVMGIWMVSFILSALPAVGWHDTSERFYTHGCRFIVAEIGLGFG 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 VCFSLLLLGGIVMGLVCVAITFYQTLWARPRRARQARRVGGGGGTKAGGPGALGTRPAFE ::: ::. :...::..:.::...::: .. .::: : :: XP_011 VCFLLLVGGSVAMGVICTAIALFQTLAVQ--VGRQA------------------DRRAFT 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 VPAIVVEDARGKRRSSLDGSESAKTSLQVTNLVSAIVFLYDSLTGVPILVVSFFSLKSDS ::.::::::.::::::.:::: ::::::.:.::..:::.:: : : :.::::: ::..:. XP_011 VPTIVVEDAQGKRRSSIDGSEPAKTSLQTTGLVTTIVFIYDCLMGFPVLVVSFSSLRADA 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 pF1KB9 APPWMVLAVLWCSMAQTLLLPSFIWSCERYRADVRTVWEQCVAIMS-EEDGDDD----GG . :::.: :::::.::.:::: :.:.:.:::::...: :.:.:.:. .:..::. :: XP_011 SAPWMALCVLWCSVAQALLLPVFLWACDRYRADLKAVREKCMALMANDEESDDETSLEGG 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KB9 CD-DYAEGRVCKVRFDANGATGPGSRDPAQVKLLPGRHMLFP--PLE--RVHYLQVPLSR . : . : . .. .. : : .:.: ::. ...::::: .: XP_011 ISPDLVLERSLDYGYGGDFVALDRMAKYEISALEGGLPQLYPLRPLQEDKMQYLQVPPTR 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KB9 RLSHDETNIFSTPREPGSFLHKWSSSDDIRVLPAQSRALGGPPEYLGQGHRLEDEEDEEE :.:::....... : .:: .:.:..:. .: :. .:: . .. . .. . XP_011 RFSHDDADVWAAVPLP-AFLPRWGSGEDLAAL-AHLVLPAGPERRRASLLAFAEDAPPSR 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 pF1KB9 AE---GGGLASLR-QFLESGVLG---SGGGPPR---GPGFFREEITTFIDETPLPSPTAS :. . .: ::: . :.:: : : : :: ::: . . : : . XP_011 ARRRSAESLLSLRPSALDSGPRGARDSPPGSPRRRPGPGPRSASASLLPDAFALTAFECE 460 470 480 490 500 510 530 540 550 560 570 pF1KB9 PGHSPRRPRPLGLSPRRLSLGSPESRAVG-LPLGLSAGRRCSLTGGEESARAWGGSWGPG : : : :. .: ..:.. : : :...: : . ::.. .:: :: XP_011 PQALRRPPGPFPAAP-----AAPDGADPGEAPTPPSSAQRSP--GPRPSAHSHAGSLRPG 520 530 540 550 560 580 pF1KB9 NPIFPQLTL XP_011 LSASWGEPGGLRAAGGGGSTSSFLSSPSESSGYATLHSDSLGSAS 570 580 590 600 >>XP_016856739 (OMIM: 614269) PREDICTED: probable G-prot (609 aa) initn: 945 init1: 692 opt: 969 Z-score: 821.9 bits: 162.1 E(85289): 4.9e-39 Smith-Waterman score: 1611; 47.0% identity (71.2% similar) in 593 aa overlap (8-579:2-564) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MARGGAGAEEASLRSNALSWLACGLLALLANAWIILSISAKQQKHKPLELLLCFLAGTHI ..: : ..:..::.:: :.:::::: :::..:::.: ::::.::: ::.::. XP_016 MSDERRLPGSAVGWLVCGGLSLLANAWGILSVGAKQKKWKPLEFLLCTLAATHM 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 LMAAVPLTTFAVVQLRRQASSDYDWNESICKVFVSTYYTLALATCFTVASLSYHRMWMVR : .:::..:..::::::: :..:::..:::::::.:::.:::::.:.:::::::::: XP_016 LNVAVPIATYSVVQLRRQ-RPDFEWNEGLCKVFVSTFYTLTLATCFSVTSLSYHRMWMVC 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 WPVNYRLSNAKKQALHAVMGIWMVSFILSTLPSIGWHNNGERYYARGCQFIVSKIGLGFG ::::::::::::::.:.::::::::::::.::..:::...::.:..::.:::..:::::: XP_016 WPVNYRLSNAKKQAVHTVMGIWMVSFILSALPAVGWHDTSERFYTHGCRFIVAEIGLGFG 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 VCFSLLLLGGIVMGLVCVAITFYQTLWARPRRARQARRVGGGGGTKAGGPGALGTRPAFE ::: ::. :...::..:.::...::: .. .::: : :: XP_016 VCFLLLVGGSVAMGVICTAIALFQTLAVQ--VGRQA------------------DRRAFT 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 VPAIVVEDARGKRRSSLDGSESAKTSLQVTNLVSAIVFLYDSLTGVPILVVSFFSLKSDS ::.::::::.::::::.:::: ::::::.:.::..:::.:: : : :.::::: ::..:. XP_016 VPTIVVEDAQGKRRSSIDGSEPAKTSLQTTGLVTTIVFIYDCLMGFPVLVVSFSSLRADA 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 pF1KB9 APPWMVLAVLWCSMAQTLLLPSFIWSCERYRADVRTVWEQCVAIMS-EEDGDDD----GG . :::.: :::::.::.:::: :.:.:.:::::...: :.:.:.:. .:..::. :: XP_016 SAPWMALCVLWCSVAQALLLPVFLWACDRYRADLKAVREKCMALMANDEESDDETSLEGG 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KB9 CD-DYAEGRVCKVRFDANGATGPGSRDPAQVKLLPGRHMLFP--PLE--RVHYLQVPLSR . : . : . .. .. : : .:.: ::. ...::::: .: XP_016 ISPDLVLERSLDYGYGGDFVALDRMAKYEISALEGGLPQLYPLRPLQEDKMQYLQVPPTR 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KB9 RLSHDETNIFSTPREPGSFLHKWSSSDDIRVLPAQSRALGGPPEYLGQGHRLEDEEDEEE :.:::....... : .:: .:.:..:. .: :. .:: . .. . .. . XP_016 RFSHDDADVWAAVPLP-AFLPRWGSGEDLAAL-AHLVLPAGPERRRASLLAFAEDAPPSR 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 pF1KB9 AE---GGGLASLR-QFLESGVLG---SGGGPPR---GPGFFREEITTFIDETPLPSPTAS :. . .: ::: . :.:: : : : :: ::: . . : : . XP_016 ARRRSAESLLSLRPSALDSGPRGARDSPPGSPRRRPGPGPRSASASLLPDAFALTAFECE 460 470 480 490 500 510 530 540 550 560 570 pF1KB9 PGHSPRRPRPLGLSPRRLSLGSPESRAVG-LPLGLSAGRRCSLTGGEESARAWGGSWGPG : : : :. .: ..:.. : : :...: : . ::.. .:: :: XP_016 PQALRRPPGPFPAAP-----AAPDGADPGEAPTPPSSAQRSP--GPRPSAHSHAGSLRPG 520 530 540 550 560 580 pF1KB9 NPIFPQLTL XP_016 LSASWGEPGGLRAAGGGGSTSSFLSSPSESSGYATLHSDSLGSAS 570 580 590 600 >>NP_997253 (OMIM: 614269) probable G-protein coupled re (609 aa) initn: 945 init1: 692 opt: 969 Z-score: 821.9 bits: 162.1 E(85289): 4.9e-39 Smith-Waterman score: 1611; 47.0% identity (71.2% similar) in 593 aa overlap (8-579:2-564) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MARGGAGAEEASLRSNALSWLACGLLALLANAWIILSISAKQQKHKPLELLLCFLAGTHI ..: : ..:..::.:: :.:::::: :::..:::.: ::::.::: ::.::. NP_997 MSDERRLPGSAVGWLVCGGLSLLANAWGILSVGAKQKKWKPLEFLLCTLAATHM 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 LMAAVPLTTFAVVQLRRQASSDYDWNESICKVFVSTYYTLALATCFTVASLSYHRMWMVR : .:::..:..::::::: :..:::..:::::::.:::.:::::.:.:::::::::: NP_997 LNVAVPIATYSVVQLRRQ-RPDFEWNEGLCKVFVSTFYTLTLATCFSVTSLSYHRMWMVC 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 WPVNYRLSNAKKQALHAVMGIWMVSFILSTLPSIGWHNNGERYYARGCQFIVSKIGLGFG ::::::::::::::.:.::::::::::::.::..:::...::.:..::.:::..:::::: NP_997 WPVNYRLSNAKKQAVHTVMGIWMVSFILSALPAVGWHDTSERFYTHGCRFIVAEIGLGFG 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 VCFSLLLLGGIVMGLVCVAITFYQTLWARPRRARQARRVGGGGGTKAGGPGALGTRPAFE ::: ::. :...::..:.::...::: .. .::: : :: NP_997 VCFLLLVGGSVAMGVICTAIALFQTLAVQ--VGRQA------------------DRRAFT 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 VPAIVVEDARGKRRSSLDGSESAKTSLQVTNLVSAIVFLYDSLTGVPILVVSFFSLKSDS ::.::::::.::::::.:::: ::::::.:.::..:::.:: : : :.::::: ::..:. NP_997 VPTIVVEDAQGKRRSSIDGSEPAKTSLQTTGLVTTIVFIYDCLMGFPVLVVSFSSLRADA 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 pF1KB9 APPWMVLAVLWCSMAQTLLLPSFIWSCERYRADVRTVWEQCVAIMS-EEDGDDD----GG . :::.: :::::.::.:::: :.:.:.:::::...: :.:.:.:. .:..::. :: NP_997 SAPWMALCVLWCSVAQALLLPVFLWACDRYRADLKAVREKCMALMANDEESDDETSLEGG 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KB9 CD-DYAEGRVCKVRFDANGATGPGSRDPAQVKLLPGRHMLFP--PLE--RVHYLQVPLSR . : . : . .. .. : : .:.: ::. ...::::: .: NP_997 ISPDLVLERSLDYGYGGDFVALDRMAKYEISALEGGLPQLYPLRPLQEDKMQYLQVPPTR 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KB9 RLSHDETNIFSTPREPGSFLHKWSSSDDIRVLPAQSRALGGPPEYLGQGHRLEDEEDEEE :.:::....... : .:: .:.:..:. .: :. .:: . .. . .. . NP_997 RFSHDDADVWAAVPLP-AFLPRWGSGEDLAAL-AHLVLPAGPERRRASLLAFAEDAPPSR 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 pF1KB9 AE---GGGLASLR-QFLESGVLG---SGGGPPR---GPGFFREEITTFIDETPLPSPTAS :. . .: ::: . :.:: : : : :: ::: . . : : . NP_997 ARRRSAESLLSLRPSALDSGPRGARDSPPGSPRRRPGPGPRSASASLLPDAFALTAFECE 460 470 480 490 500 510 530 540 550 560 570 pF1KB9 PGHSPRRPRPLGLSPRRLSLGSPESRAVG-LPLGLSAGRRCSLTGGEESARAWGGSWGPG : : : :. .: ..:.. : : :...: : . ::.. .:: :: NP_997 PQALRRPPGPFPAAP-----AAPDGADPGEAPTPPSSAQRSP--GPRPSAHSHAGSLRPG 520 530 540 550 560 580 pF1KB9 NPIFPQLTL NP_997 LSASWGEPGGLRAAGGGGSTSSFLSSPSESSGYATLHSDSLGSAS 570 580 590 600 588 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 17:06:50 2016 done: Fri Nov 4 17:06:52 2016 Total Scan time: 12.470 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]