Result of SIM4 for pF1KB8994

seq1 = pF1KB8994.tfa, 987 bp
seq2 = pF1KB8994/gi568815596f_218162725.tfa (gi568815596f:218162725_218363714), 200990 bp

>pF1KB8994 987
>gi568815596f:218162725_218363714 (Chr2)

1-987  (100001-100990)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGCCCAACAGCACTGGCGAGGTGCCCAGCCCCATTCCCAAGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACGCCCAACAGCACTGGCGAGGTGCCCAGCCCCATTCCCAAGGGGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTGGGGCTCTCCCTGGCCCTGGCAAGCCTCATCATCACCGCGAACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTGGGGCTCTCCCTGGCCCTGGCAAGCCTCATCATCACCGCGAACCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCTAGCCCTGGGCATCGCCTGGGACCGCCGCCTGCGCAGCCCACCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCTAGCCCTGGGCATCGCCTGGGACCGCCGCCTGCGCAGCCCACCTGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCTGCTTCTTCCTGAGCCTACTGCTGGCTGGGCTGCTCACGGGTCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCTGCTTCTTCCTGAGCCTACTGCTGGCTGGGCTGCTCACGGGTCTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ATTG  C CATTGCCAGGGCTGTGGAACCAGAGTCGCCGGGGTTACTGGT
        ||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ATTGCCCACATTGCCAGGGCTGTGGAACCAGAGTCGCCGGGGTTACTGGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    248 CCTGCCTCCTCGTCTACTTGGCTCCCAACTTCTCCTTCCTCTCCCTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCTGCCTCCTCGTCTACTTGGCTCCCAACTTCTCCTTCCTCTCCCTGCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    298 GCCAACCTCTTGCTGGTGCACGGGGAGCGCTACATGGCAGTCCTGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCCAACCTCTTGCTGGTGCACGGGGAGCGCTACATGGCAGTCCTGAGGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    348 ACTCCAGCCCCCTGGGAGCATTCGGCTGGCCCTGCTCCTCACCTGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ACTCCAGCCCCCTGGGAGCATTCGGCTGGCCCTGCTCCTCACCTGGGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    398 GTCCCCTGCTCTTTGCCAGTCTGCCCGCTCTGGGGTGGAACCACTGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTCCCCTGCTCTTTGCCAGTCTGCCCGCTCTGGGGTGGAACCACTGGACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    448 CCTGGTGCCAACTGCAGCTCCCAGGCTATCTTCCCAGCCCCCTACCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCTGGTGCCAACTGCAGCTCCCAGGCTATCTTCCCAGCCCCCTACCTGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    498 CCTCGAAGTCTATGGGCTCCTGCTGCCCGCCGTGGGTGCTGCTGCCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCTCGAAGTCTATGGGCTCCTGCTGCCCGCCGTGGGTGCTGCTGCCTTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    548 TCTCTGTCCGCGTGCTGGCCACTGCCCACCGCCAGCTGCAGGACATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCTCTGTCCGCGTGCTGGCCACTGCCCACCGCCAGCTGCAGGACATCTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    598 CGGCTGGAGCGGGCAGTGTGCCGCGATGAGCCCTCCGCCCTGGCCCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CGGCTGGAGCGGGCAGTGTGCCGCGATGAGCCCTCCGCCCTGGCCCGGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    648 CCTTACCTGGAGGCAGGCAAGGGCACAGGCTGGAGCCATGCTGCTCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCTTACCTGGAGGCAGGCAAGGGCACAGGCTGGAGCCATGCTGCTCTTCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    698 GGCTGTGCTGGGGGCCCTACGTGGCCACACTGCTCCTCTCAGTCCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGCTGTGCTGGGGGCCCTACGTGGCCACACTGCTCCTCTCAGTCCTGGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    748 TATGAGCAGCGCCCGCCACTGGGGCCTGGGACACTGTTGTCCCTCCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TATGAGCAGCGCCCGCCACTGGGGCCTGGGACACTGTTGTCCCTCCTCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    798 CCTAGGAAGTGCCAGTGCAGCGGCAGTGCCCGTAGCCATGGGGCTGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCTAGGAAGTGCCAGTGCAGCGGCAGTGCCCGTAGCCATGGGGCTGGGCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    848 ATCAGCGCTACACAGCCCCCTGGAGGGCAGCCGCCCAAAGGTGCCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATCAGCGCTACACAGCCCCCTGGAGGGCAGCCGCCCAAAGGTGCCTGCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    898 GGGCTGTGGGGAAGAGCCTCCCGGGACAGTCCCGGCCCCAGCATTGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GGGCTGTGGGGAAGAGCCTCCCGGGACAGTCCCGGCCCCAGCATTGCCTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :
    948 CCACCCAAGCAGCCAAAGCAGTGTCGACCTGGACTTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCACCCAAGCAGCCAAAGCAGTGTCGACCTGGACTTGAAC

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