Result of FASTA (ccds) for pF1KB8978
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8978, 374 aa
  1>>>pF1KB8978 374 - 374 aa - 374 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4611+/-0.000945; mu= 15.8682+/- 0.056
 mean_var=105.2257+/-28.633, 0's: 0 Z-trim(106.1): 270  B-trim: 1130 in 2/45
 Lambda= 0.125030
 statistics sampled from 8402 (8800) to 8402 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.631), E-opt: 0.2 (0.27), width:  16
 Scan time:  2.420

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3         ( 374) 2513 464.4 7.2e-131
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3         ( 360) 2098 389.5 2.4e-108
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3            ( 352) 1569 294.1 1.3e-79
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3            ( 355) 1253 237.1 1.8e-62
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3            ( 355) 1152 218.9 5.5e-57
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3           ( 376) 1152 218.9 5.8e-57
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3            ( 360) 1099 209.3 4.2e-54
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3            ( 355)  958 183.9 1.9e-46
CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3         ( 355)  917 176.5 3.2e-44
CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3         ( 387)  917 176.5 3.4e-44
CCDS43079.1 CCRL2 gene_id:9034|Hs108|chr3          ( 344)  831 161.0 1.5e-39
CCDS46814.1 CCRL2 gene_id:9034|Hs108|chr3          ( 356)  831 161.0 1.5e-39
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3           ( 384)  782 152.2 7.2e-37
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17          ( 372)  779 151.6   1e-36
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17          ( 378)  779 151.6   1e-36
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 357)  755 147.3   2e-35
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 369)  755 147.3 2.1e-35
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6            ( 374)  735 143.7 2.5e-34
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2          ( 352)  710 139.2 5.5e-33
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2          ( 356)  710 139.2 5.6e-33
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2           ( 360)  709 139.0 6.3e-33
CCDS2736.1 XCR1 gene_id:2829|Hs108|chr3            ( 333)  699 137.1 2.1e-32
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2           ( 350)  695 136.4 3.6e-32
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX          ( 368)  694 136.3 4.2e-32
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX          ( 415)  694 136.3 4.6e-32
CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3          ( 342)  682 134.1 1.8e-31
CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3          ( 350)  646 127.6 1.6e-29
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11           ( 372)  623 123.5   3e-28
CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17         ( 362)  548 109.9 3.5e-24
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2          ( 362)  536 107.8 1.6e-23
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16         ( 364)  495 100.4 2.7e-21
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20         ( 388)  486 98.8 8.6e-21
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3            ( 359)  468 95.5 7.7e-20
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 388)  468 95.6 8.1e-20
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 394)  468 95.6 8.2e-20
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX          ( 370)  457 93.5 3.1e-19
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2           ( 367)  456 93.4 3.5e-19
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20         ( 370)  453 92.8 5.1e-19
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8           ( 380)  452 92.7 5.9e-19
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14          ( 391)  447 91.8 1.1e-18
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13       ( 346)  444 91.2 1.5e-18
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1            ( 372)  439 90.3   3e-18
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3           ( 373)  439 90.3   3e-18
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2            ( 355)  436 89.7 4.2e-18
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22         ( 418)  435 89.6 5.3e-18
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX           ( 363)  432 89.0   7e-18
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1           ( 361)  430 88.7   9e-18
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 389)  430 88.7 9.4e-18
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 392)  430 88.7 9.5e-18
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 397)  430 88.7 9.6e-18


>>CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3              (374 aa)
 initn: 2513 init1: 2513 opt: 2513  Z-score: 2463.0  bits: 464.4 E(32554): 7.2e-131
Smith-Waterman score: 2513; 100.0% identity (100.0% similar) in 374 aa overlap (1-374:1-374)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 MLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMCKLFTGLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMCKLFTGLY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 HIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFTK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 CQKEDSVYVCGPYFPRGWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNEKKRHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CQKEDSVYVCGPYFPRGWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNEKKRHR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 AVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLGMTHCCI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLGMTHCCI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 NPIIYAFVGEKFRSLFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLLDGRGKGKSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NPIIYAFVGEKFRSLFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLLDGRGKGKSI
              310       320       330       340       350       360

              370    
pF1KB8 GRAPEASLQDKEGA
       ::::::::::::::
CCDS43 GRAPEASLQDKEGA
              370    

>>CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3              (360 aa)
 initn: 2098 init1: 2098 opt: 2098  Z-score: 2058.6  bits: 389.5 E(32554): 2.4e-108
Smith-Waterman score: 2098; 98.4% identity (99.1% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 MLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMCKLFTGLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMCKLFTGLY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 HIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFTK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 CQKEDSVYVCGPYFPRGWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNEKKRHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CQKEDSVYVCGPYFPRGWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNEKKRHR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 AVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLGMTHCCI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLGMTHCCI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 NPIIYAFVGEKFRSLFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLLDGRGKGKSI
       :::::::::::::  . .                                          
CCDS46 NPIIYAFVGEKFRRYLSVFFRKHITKRFCKQCPVFYRETVDGVTSTNTPSTGEQEVSAGL
              310       320       330       340       350       360

>>CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3                 (352 aa)
 initn: 1571 init1: 890 opt: 1569  Z-score: 1543.1  bits: 294.1 E(32554): 1.3e-79
Smith-Waterman score: 1569; 75.2% identity (90.4% similar) in 311 aa overlap (21-325:7-317)

               10        20          30        40        50        
pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDY--GAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFV
                           . ..: .:  . ::.:..::::.:.:::::::::::::::
CCDS27               MDYQVSSPIYDINYYTSEPCQKINVKQIAARLLPPLYSLVFIFGFV
                             10        20        30        40      

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB8 GNMLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMCKLFTG
       :::::.:::::::.:: .:::::::::::::.::.:.:.::: :: .: :::.::.:.::
CCDS27 GNMLVILILINCKRLKSMTDIYLLNLAISDLFFLLTVPFWAHYAAAQWDFGNTMCQLLTG
         50        60        70        80        90       100      

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB8 LYHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIF
       :: ::.:.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.::::::.:::::
CCDS27 LYFIGFFSGIFFIILLTIDRYLAVVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWVVAVFASLPGIIF
        110       120       130       140       150       160      

      180       190           200       210       220       230    
pF1KB8 TKCQKEDSVYVCGPYFPRG----WNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRN
       :. :::   :.:. .:: .    :.::.:.   :::::::::.:::::::::::::::::
CCDS27 TRSQKEGLHYTCSSHFPYSQYQFWKNFQTLKIVILGLVLPLLVMVICYSGILKTLLRCRN
        170       180       190       200       210       220      

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB8 EKKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLG
       :::::::::.::::::::::::.:::::.:::::::::::.:: :...:::: :::::::
CCDS27 EKKRHRAVRLIFTIMIVYFLFWAPYNIVLLLNTFQEFFGLNNCSSSNRLDQAMQVTETLG
        230       240       250       260       270       280      

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB8 MTHCCINPIIYAFVGEKFRSLFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLLDGR
       :::::::::::::::::::. . . .  .::                             
CCDS27 MTHCCINPIIYAFVGEKFRNYLLVFFQKHIAKRFCKCCSIFQQEAPERASSVYTRSTGEQ
        290       300       310       320       330       340      

          360       370    
pF1KB8 GKGKSIGRAPEASLQDKEGA
                           
CCDS27 EISVGL              
        350                

>>CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3                 (355 aa)
 initn: 1100 init1: 412 opt: 1253  Z-score: 1235.0  bits: 237.1 E(32554): 1.8e-62
Smith-Waterman score: 1253; 57.7% identity (85.0% similar) in 319 aa overlap (12-325:5-321)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGN
                  ::.:.  ..:: :::  ..::.: . . .:::::::::::::..:.:::
CCDS27        METPNTTED-YDTTTEFDYGDATPCQKVNERAFGAQLLPPLYSLVFVIGLVGN
                       10        20        30        40        50  

               70        80        90        100       110         
pF1KB8 MLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWA-HSAANEWVFGNAMCKLFTGL
       .::::.:.. :.:: .:.::::::::::::::.:::.:  ..  ..::::.::::...:.
CCDS27 ILVVLVLVQYKRLKNMTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDDWVFGDAMCKILSGF
             60        70        80        90       100       110  

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB8 YHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFT
       :. : .. ::::::::::::::::::::::.::::::::.::.: : .:..::.::. :.
CCDS27 YYTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIIIWALAILASMPGLYFS
            120       130       140       150       160       170  

     180       190           200       210       220       230     
pF1KB8 KCQKEDSVYVCGPYFP----RGWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNE
       : : : . ..:. .::    : :. :...  :..:::::::.:.:::.::.: :::  ::
CCDS27 KTQWEFTHHTCSLHFPHESLREWKLFQALKLNLFGLVLPLLVMIICYTGIIKILLRRPNE
            180       190       200       210       220       230  

         240       250       260       270       280       290     
pF1KB8 KKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLGM
       ::  .:::.::.:::..::::::::..::...::.:.   .::.. .:: :.::::....
CCDS27 KKS-KAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLTILISVFQDFLFTHECEQSRHLDLAVQVTEVIAY
             240       250       260       270       280       290 

         300       310       320       330       340       350     
pF1KB8 THCCINPIIYAFVGEKFRSLFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLLDGRG
       ::::.::.:::::::.::. ..  .  :.:                              
CCDS27 THCCVNPVIYAFVGERFRKYLRQLFHRRVAVHLVKWLPFLSVDRLERVSSTSPSTGEHEL
             300       310       320       330       340       350 

>>CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3                 (355 aa)
 initn: 994 init1: 379 opt: 1152  Z-score: 1136.5  bits: 218.9 E(32554): 5.5e-57
Smith-Waterman score: 1152; 54.2% identity (83.7% similar) in 306 aa overlap (21-317:14-317)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGN
                           :...: : :  :.: :.. . ::..::::::::  :..::
CCDS27        MTTSLDTVETFGTTSYYD-DVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGN
                      10         20        30        40        50  

               70        80        90       100        110         
pF1KB8 MLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSA-ANEWVFGNAMCKLFTGL
       ..::.:::. ..:. .:.::::::::::::::.:::.: : . ...::::..::::..:.
CCDS27 VVVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGF
             60        70        80        90       100       110  

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB8 YHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFT
       :: : .. ::::::::::::::::::::::.::::::::.::..:: .::.:..: .:: 
CCDS27 YHTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFY
            120       130       140       150       160       170  

     180       190           200       210       220       230     
pF1KB8 KCQKEDSVYVCGPYFPR----GWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNE
       . ..     .:.  .:.    .: .:::.  .:. ::::::.:.:::.::.:::::: . 
CCDS27 ETEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTLLRCPS-
            180       190       200       210       220       230  

         240       250       260       270       280       290     
pF1KB8 KKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLGM
       ::...:.:.::.:: :.:.::::::..:::...: ..  ..:: ...:: .  :::....
CCDS27 KKKYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVTEVIAY
             240       250       260       270       280       290 

         300       310           320       330       340       350 
pF1KB8 THCCINPIIYAFVGEKFRS----LFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLL
       .:::.::.:::::::.::.    .::                                  
CCDS27 SHCCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERTSSVSPSTAEPEL
             300       310       320       330       340       350 

>>CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3                (376 aa)
 initn: 994 init1: 379 opt: 1152  Z-score: 1136.2  bits: 218.9 E(32554): 5.8e-57
Smith-Waterman score: 1152; 54.2% identity (83.7% similar) in 306 aa overlap (21-317:35-338)

                         10        20        30        40        50
pF1KB8           MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYS
                                     :...: : :  :.: :.. . ::..:::::
CCDS54 IRMLLRAHKPGSSRRSEMTTSLDTVETFGTTSYYD-DVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYS
           10        20        30         40        50        60   

               60        70        80        90       100          
pF1KB8 LVFIFGFVGNMLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSA-ANEWVFG
       :::  :..::..::.:::. ..:. .:.::::::::::::::.:::.: : . ...::::
CCDS54 LVFTVGLLGNVVVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFG
            70        80        90       100       110       120   

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB8 NAMCKLFTGLYHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAV
       ..::::..:.:: : .. ::::::::::::::::::::::.::::::::.::..:: .::
CCDS54 HGMCKLLSGFYHTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAV
           130       140       150       160       170       180   

     170       180       190           200       210       220     
pF1KB8 FASVPGIIFTKCQKEDSVYVCGPYFPR----GWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGI
       .:..: .:: . ..     .:.  .:.    .: .:::.  .:. ::::::.:.:::.::
CCDS54 LAALPEFIFYETEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGI
           190       200       210       220       230       240   

         230       240       250       260       270       280     
pF1KB8 LKTLLRCRNEKKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQ
       .:::::: . ::...:.:.::.:: :.:.::::::..:::...: ..  ..:: ...:: 
CCDS54 IKTLLRCPS-KKKYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDL
           250        260       270       280       290       300  

         290       300       310           320       330       340 
pF1KB8 ATQVTETLGMTHCCINPIIYAFVGEKFRS----LFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGK
       .  :::.....:::.::.:::::::.::.    .::                        
CCDS54 VMLVTEVIAYSHCCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERTSS
            310       320       330       340       350       360  

             350       360       370    
pF1KB8 NVKVTTQGLLDGRGKGKSIGRAPEASLQDKEGA
                                        
CCDS54 VSPSTAEPELSIVF                   
            370                         

>>CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3                 (360 aa)
 initn: 959 init1: 676 opt: 1099  Z-score: 1084.8  bits: 209.3 E(32554): 4.2e-54
Smith-Waterman score: 1099; 50.8% identity (80.1% similar) in 307 aa overlap (31-333:28-333)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGN
                                     :: :  .: .:  .:::::::::.::..::
CCDS26    MNPTDIADTTLDESIYSNYYLYESIPKPCTKEGIKAFGELFLPPLYSLVFVFGLLGN
                  10        20        30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 MLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMCKLFTGLY
        .:::.:.. :.:. .::.::::::::::::...::.:.. ::..:::: ..::... .:
CCDS26 SVVVLVLFKYKRLRSMTDVYLLNLAISDLLFVFSLPFWGYYAADQWVFGLGLCKMISWMY
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 HIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFTK
        .:...::::..:..::::::::::::.:.:::.:.::.::. :: ::::::.::..:. 
CCDS26 LVGFYSGIFFVMLMSIDRYLAIVHAVFSLRARTLTYGVITSLATWSVAVFASLPGFLFST
       120       130       140       150       160       170       

              190          200       210       220       230       
pF1KB8 CQKEDSVYVCGPYFPRG---WNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNEKK
       :  : .   :   .  .   :. . ..  ::::::.:: ::..::: :..:: .:.::::
CCDS26 CYTERNHTYCKTKYSLNSTTWKVLSSLEINILGLVIPLGIMLFCYSMIIRTLQHCKNEKK
       180       190       200       210       220       230       

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB8 RHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLGMTH
        ..::..::....... ::::::::..:.:. :.  :..:     :: : :.::::...:
CCDS26 -NKAVKMIFAVVVLFLGFWTPYNIVLFLETLVELEVLQDCTFERYLDYAIQATETLAFVH
        240       250       260       270       280       290      

       300       310        320       330       340       350      
pF1KB8 CCINPIIYAFVGEKFRS-LFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLLDGRGK
       ::.::::: :.:::::. ....   ::   .    ::                       
CCDS26 CCLNPIIYFFLGEKFRKYILQLFKTCRGLFVLCQYCGLLQIYSADTPSSSYTQSTMDHDL
        300       310       320       330       340       350      

        360       370    
pF1KB8 GKSIGRAPEASLQDKEGA
                         
CCDS26 HDAL              
        360              

>>CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3                 (355 aa)
 initn: 899 init1: 571 opt: 958  Z-score: 947.4  bits: 183.9 E(32554): 1.9e-46
Smith-Waterman score: 958; 43.5% identity (78.4% similar) in 301 aa overlap (20-313:9-308)

               10        20            30        40        50      
pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDY----GAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFG
                          :::  :: :    ..::    ..  :  ::  .: :.:.:.
CCDS26            MDYTLDLSVTTVTDYYYPDIFSSPCDAELIQTNGKLLLAVFYCLLFVFS
                          10        20        30        40         

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB8 FVGNMLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMCKLF
       ..:: ::.:.:. ::::. .::.::::::.:::::....:. ..   ..::::..:::. 
CCDS26 LLGNSLVILVLVVCKKLRSITDVYLLNLALSDLLFVFSFPFQTYYLLDQWVFGTVMCKVV
      50        60        70        80        90       100         

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CCDS26 SGFYYIGFYSSMFFITLMSVDRYLAVVHAVYALKVRTIRMGTTLCLAVWLTAIMATIPLL
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       .: .  .::.:  :  .. .    :. : ..  :::::..:. :...::  ::. : ::.
CCDS26 VFYQVASEDGVLQCYSFYNQQTLKWKIFTNFKMNILGLLIPFTIFMFCYIKILHQLKRCQ
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       :..:  .:.:... ..:. .:::.:.:.:..:.... .  :..:  ..::  ::.::: .
CCDS26 NHNKT-KAIRLVLIVVIASLLFWVPFNVVLFLTSLHSMHILDGCSISQQLTYATHVTEII
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       ..::::.::.:::::::::.                                        
CCDS26 SFTHCCVNPVIYAFVGEKFKKHLSEIFQKSCSQIFNYLGRQMPRESCEKSSSCQQHSSRS
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                        : ::  :.::  :  :.  :.  .:. .:  .::..: .:.::
CCDS43             MDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLSIFYSVIFAIGLVG
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CCDS43 NLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHYLINEKGLHNAMCKFTTAF
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       : :::.    :   .:.  ...  ..::.    ::..::::::  ::  :..::. :.:.
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CCDS43 KKA-KAIKLILLVVIVFFLFWTPYNVMIFLETLKLYDFFPSCDMRKDLRLALSVTETVAF
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CCDS43 SHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSESQRSRHGSVLSSNFT
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>>CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3              (387 aa)
 initn: 862 init1: 597 opt: 917  Z-score: 906.9  bits: 176.5 E(32554): 3.4e-44
Smith-Waterman score: 917; 46.6% identity (75.2% similar) in 311 aa overlap (18-322:38-343)

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pF1KB8              MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAP-CHKFDVKQIGAQLLP
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CCDS54 FKLADLDFRKSSLASGWRMASGAFTMDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLS
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pF1KB8 PLYSLVFIFGFVGNMLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEW
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CCDS54 IFYSVIFAIGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHYLINEK
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pF1KB8 VFGNAMCKLFTGLYHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWL
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CCDS54 GLHNAMCKFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVTISLGVWA
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pF1KB8 VAVFASVPGIIFTKCQKEDSVYVCGPYFPRGWNNFHTIMRNI----LGLVLPLLIMVICY
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CCDS54 AAILVAAPQFMFTK-QKENE---CLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYCY
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CCDS54 FRIIQTLFSCKNHKKA-KAIKLILLVVIVFFLFWTPYNVMIFLETLKLYDFFPSCDMRKD
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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