Result of SIM4 for pF1KB8959

seq1 = pF1KB8959.tfa, 1014 bp
seq2 = pF1KB8959/gi568815593f_146239113.tfa (gi568815593f:146239113_146440441), 201329 bp

>pF1KB8959 1014
>gi568815593f:146239113_146440441 (Chr5)

1-120  (100001-100120)   100% ->
121-1014  (100436-101329)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGGCCATGAACTCCAAGCAGCCTTTCGGCATGCACCCGGTGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGGCCATGAACTCCAAGCAGCCTTTCGGCATGCACCCGGTGCTGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAACCCAAATTCTCCAGTCTGCACTCTGGCTCCGAGGCCATGCGCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAACCCAAATTCTCCAGTCTGCACTCTGGCTCCGAGGCCATGCGCCGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTGTCTCCCAGCCCCGCAG         CTGCAGGGTAATATATTTGGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100101 TCTGTCTCCCAGCCCCGCAGGTA...CAGCTGCAGGGTAATATATTTGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGCTTTGATGAGAGCCTGCTGGCACGCGCCGAAGCTCTGGCGGCGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100457 AGCTTTGATGAGAGCCTGCTGGCACGCGCCGAAGCTCTGGCGGCGGTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TATCGTCTCCCACGGCAAGAACCATCCGTTCAAGCCCGACGCCACCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100507 TATCGTCTCCCACGGCAAGAACCATCCGTTCAAGCCCGACGCCACCTACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATACCATGAGCAGCGTGCCCTGCACGTCCACTTCGTCCACCGTGCCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100557 ATACCATGAGCAGCGTGCCCTGCACGTCCACTTCGTCCACCGTGCCCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCCCACCCAGCTGCGCTCACCTCACACCCTCACCACGCCGTGCACCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100607 TCCCACCCAGCTGCGCTCACCTCACACCCTCACCACGCCGTGCACCAGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCTCGAAGGCGACCTGCTGGAGCACATCTCGCCCACGCTGAGTGTGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100657 CCTCGAAGGCGACCTGCTGGAGCACATCTCGCCCACGCTGAGTGTGAGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GCCTGGGCGCTCCGGAACACTCGGTGATGCCCGCACAGATCCATCCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100707 GCCTGGGCGCTCCGGAACACTCGGTGATGCCCGCACAGATCCATCCACAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CACCTGGGCGCCATGGGCCACCTGCACCAGGCCATGGGCATGAGTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100757 CACCTGGGCGCCATGGGCCACCTGCACCAGGCCATGGGCATGAGTCACCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCACACCGTGGCCCCTCATAGCGCCATGCCTGCATGCCTCAGCGACGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100807 GCACACCGTGGCCCCTCATAGCGCCATGCCTGCATGCCTCAGCGACGTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AGTCAGACCCGCGCGAGCTGGAAGCCTTCGCCGAGCGCTTCAAGCAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100857 AGTCAGACCCGCGCGAGCTGGAAGCCTTCGCCGAGCGCTTCAAGCAGCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CGCATCAAGCTGGGGGTGACCCAGGCGGACGTGGGCGCGGCTCTGGCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100907 CGCATCAAGCTGGGGGTGACCCAGGCGGACGTGGGCGCGGCTCTGGCTAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TCTCAAGATCCCCGGCGTGGGCTCGCTGAGCCAAAGCACCATCTGCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100957 TCTCAAGATCCCCGGCGTGGGCTCGCTGAGCCAAAGCACCATCTGCAGGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TCGAGTCTCTCACTCTCTCGCACAACAACATGATCGCTCTCAAGCCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101007 TCGAGTCTCTCACTCTCTCGCACAACAACATGATCGCTCTCAAGCCGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CTCCAGGCCTGGTTGGAGGAGGCCGAGGCCGCCTACCGAGAGAAGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101057 CTCCAGGCCTGGTTGGAGGAGGCCGAGGCCGCCTACCGAGAGAAGAACAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CAAGCCAGAGCTCTTCAACGGCAGCGAACGGAAGCGCAAACGCACGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101107 CAAGCCAGAGCTCTTCAACGGCAGCGAACGGAAGCGCAAACGCACGTCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TCGCGGCGCCGGAGAAGCGTTCACTCGAGGCCTATTTCGCTATCCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101157 TCGCGGCGCCGGAGAAGCGTTCACTCGAGGCCTATTTCGCTATCCAGCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CGTCCTTCATCTGAGAAGATCGCGGCCATCGCTGAGAAACTGGACCTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101207 CGTCCTTCATCTGAGAAGATCGCGGCCATCGCTGAGAAACTGGACCTTAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 AAAGAACGTGGTGAGAGTCTGGTTCTGCAACCAGAGACAGAAACAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101257 AAAGAACGTGGTGAGAGTCTGGTTCTGCAACCAGAGACAGAAACAGAAAC

   1000     .    :    .    :
    992 GAATGAAGTATTCGGCTGTCCAC
        |||||||||||||||||||||||
 101307 GAATGAAGTATTCGGCTGTCCAC

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