Result of SIM4 for pF1KB8952

seq1 = pF1KB8952.tfa, 981 bp
seq2 = pF1KB8952/gi568815592f_88980895.tfa (gi568815592f:88980895_89184193), 203299 bp

>pF1KB8952 981
>gi568815592f:88980895_89184193 (Chr6)

1-540  (100001-100540)   100% ->
541-981  (102859-103299)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTGTCGTCTCCGTCCCGCAGCGGGAGCCGCTCGTCCTGGGTGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTGTCGTCTCCGTCCCGCAGCGGGAGCCGCTCGTCCTGGGTGGCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTTGCGCCGCTTGGCTTTTCCTCCCGAGGTTACTTTGGGGCCCTCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTTGCGCCGCTTGGCTTTTCCTCCCGAGGTTACTTTGGGGCCCTCCCGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGTGACCACGGCTCCGCCTCCTTTACCCCGGATCCCGGACCCCCGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGTGACCACGGCTCCGCCTCCTTTACCCCGGATCCCGGACCCCCGGGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGCCCCCGACCCTCTTCCTCCCTCATTTCCTAGGGGGAGATGGCCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGCCCCCGACCCTCTTCCTCCCTCATTTCCTAGGGGGAGATGGCCCGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCTGACCCCCCAGCCTCGCGCTCCAGCAGCTCTGCCCAACCGCAGCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCTGACCCCCCAGCCTCGCGCTCCAGCAGCTCTGCCCAACCGCAGCCTCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCGTGGCGGGAGGCACTCCTCGGGCAGCGCCGAAGAAGCGGCGAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCGTGGCGGGAGGCACTCCTCGGGCAGCGCCGAAGAAGCGGCGAAAGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGGTGCGGGCCAGCCCCGCAGGGCAGCTGCCCAGCCGCTTCCACCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAGGTGCGGGCCAGCCCCGCAGGGCAGCTGCCCAGCCGCTTCCACCAGTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCAGCAGCACCGGCCGAGTCTGGAGGGCGGCCGGAGCCCCGCGACCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCAGCAGCACCGGCCGAGTCTGGAGGGCGGCCGGAGCCCCGCGACCGGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CGAGCGGAGCGCAGGAGGTCCCGGGCCCGGCCGCCGCCTTGGCCCCGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CGAGCGGAGCGCAGGAGGTCCCGGGCCCGGCCGCCGCCTTGGCCCCGAGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCTGCAGCCGCAGCCGGCACGGAGGGAGCCAGCCCCGACCTTGCCCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCTGCAGCCGCAGCCGGCACGGAGGGAGCCAGCCCCGACCTTGCCCCGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCGGCCCGCGGCTCCCGGCCAAACCCCCCTCAGGAAAGAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100501 GCGGCCCGCGGCTCCCGGCCAAACCCCCCTCAGGAAAGAGGTG...TAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TTTTAAAATCAAAGATGGGAAAATCGGAGAAAATTGCCCTTCCCCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102860 TTTTAAAATCAAAGATGGGAAAATCGGAGAAAATTGCCCTTCCCCATGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CAGCTTGTTCATGGTATACACTTGTATGAGCAACCAAAGATAAACAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102910 CAGCTTGTTCATGGTATACACTTGTATGAGCAACCAAAGATAAACAGACA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GAAAAGCAAATATAACTTGCCACTAACCAAGATCACCTCTGCAAAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102960 GAAAAGCAAATATAACTTGCCACTAACCAAGATCACCTCTGCAAAAAGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ATGAAAACAACTTTTGGCAGGATTCTGTTTCATCTGACAGAATTCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103010 ATGAAAACAACTTTTGGCAGGATTCTGTTTCATCTGACAGAATTCAGAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CAGGAAAAAAAGCCTTTTAAAAATACCGAGAACATTAAAAATTCGCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103060 CAGGAAAAAAAGCCTTTTAAAAATACCGAGAACATTAAAAATTCGCATTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GAAGAAATCAGCATTTCTAACTGAAGTGAGCCAAAAGGAAAATTATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103110 GAAGAAATCAGCATTTCTAACTGAAGTGAGCCAAAAGGAAAATTATGCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GGGCAAAGTTTAGTGATCCACCTTCTCCTAGTGTTCTTCCAAAGCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103160 GGGCAAAGTTTAGTGATCCACCTTCTCCTAGTGTTCTTCCAAAGCCTCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 AGTCACTGGATGGGAAGCACTGTTGAAAATTCCAACCAAAACAGGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103210 AGTCACTGGATGGGAAGCACTGTTGAAAATTCCAACCAAAACAGGGAGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GATGGCAGTACACTTAAAAACGCTCCTCAAAGTTCAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103260 GATGGCAGTACACTTAAAAACGCTCCTCAAAGTTCAAACT

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