seq1 = pF1KB8945.tfa, 912 bp seq2 = pF1KB8945/gi568815594f_54000345.tfa (gi568815594f:54000345_54201919), 201575 bp >pF1KB8945 912 >gi568815594f:54000345_54201919 (Chr4) 1-574 (100001-100574) 99% -> 575-912 (101238-101575) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGTCGCGCTCCTTCTATGTCGACTCGCTCATCATCAAGGACACCTCACG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGTCGCGCTCCTTCTATGTCGACTCGCTCATCATCAAGGACACCTCACG 50 . : . : . : . : . : 51 GCCTGCGCCCTCGCTGCCTGAACCGCACCCCGGGCCGGATTTCTTCATCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 GCCTGCGCCCTCGCTGCCTGAACCGCACCCCGGGCCGGATTTCTTCATCC 100 . : . : . : . : . : 101 CGCTTGGCATGCCGCCCCCATTGGTGATGTCCGTGTCCGGCCCCGGCTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 CGCTTGGCATGCCGCCCCCATTGGTGATGTCCGTGTCCGGCCCCGGCTGC 150 . : . : . : . : . : 151 CCGTCTCGCAAGAGCGGCGCGTTCTGCGTGTGCCCTCTCTGCGTCACTTC ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100151 CCGTCCCGCAAGAGCGGCGCGTTCTGCGTGTGCCCTCTCTGCGTCACTTC 200 . : . : . : . : . : 201 GCACCTGCACTCCTCTCGGGGGTCTGTGGGCGCCGGCAGCGGGGGCGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100201 GCACCTGCACTCCTCTCGGGGGTCTGTGGGCGCCGGCAGCGGGGGCGCAG 250 . : . : . : . : . : 251 GGGCCGGGGTTACCGGGGCCGGAGGCAGTGGGGTGGCAGGGGCCGCAGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100251 GGGCCGGGGTTACCGGGGCCGGAGGCAGTGGGGTGGCAGGGGCCGCAGGG 300 . : . : . : . : . : 301 GCACTGCCTCTGCTTAAGAGCCAGTTCTCTTCGGCTCCTGGGGACGCGCA |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| 100301 GCACTGCCTCTGCTTAAGGGCCAGTTCTCTTCGGCTCCTGGGGACGCGCA 350 . : . : . : . : . : 351 GTTTTGCCCGCGGGTGAACCATGCGCATCATCACCACCACCCGCCGCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100351 GTTTTGCCCGCGGGTGAACCATGCGCATCATCACCACCACCCGCCGCAGC 400 . : . : . : . : . : 401 ACCACCACCACCATCATCAGCCCCAGCAGCCTGGCTCGGCCGCGGCGGCG ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100401 ACCACCATCACCATCATCAGCCCCAGCAGCCTGGCTCGGCCGCGGCGGCG 450 . : . : . : . : . : 451 GCAGCAGCAGCAGCGGCGGCGGCGGCCGCGGCGGCCTTGGGGCACCCGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100451 GCAGCAGCAGCAGCGGCGGCGGCGGCCGCGGCGGCCTTGGGGCACCCGCA 500 . : . : . : . : . : 501 GCACCACGCACCTGTCTGCACCGCCACCACCTACAACGTGGCGGACCCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100501 GCACCACGCACCTGTCTGCACCGCCACCACCTACAACGTGGCGGACCCGC 550 . : . : . : . : . : 551 GGAGATTCCACTGCCTCACCATGG GAGGCTCTGACGCCAGC ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 100551 GGAGATTCCACTGCCTCACCATGGGTA...CAGGAGGCTCTGACGCCAGC 600 . : . : . : . : . : 592 CAGGTACCCAATGGCAAGAGGATGAGGACGGCGTTCACTAGCACGCAACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101255 CAGGTACCCAATGGCAAGAGGATGAGGACGGCGTTCACTAGCACGCAACT 650 . : . : . : . : . : 642 CCTGGAGCTGGAGAGAGAATTCTCTTCCAACATGTACCTGTCTCGACTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101305 CCTGGAGCTGGAGAGAGAATTCTCTTCCAACATGTACCTGTCTCGACTCC 700 . : . : . : . : . : 692 GGAGGATTGAAATCGCCACTTACCTGAACCTGTCGGAGAAGCAGGTGAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101355 GGAGGATTGAAATCGCCACTTACCTGAACCTGTCGGAGAAGCAGGTGAAA 750 . : . : . : . : . : 742 ATCTGGTTTCAGAACCGCCGAGTGAAGCACAAGAAGGAGGGGAAGGGCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101405 ATCTGGTTTCAGAACCGCCGAGTGAAGCACAAGAAGGAGGGGAAGGGCAC 800 . : . : . : . : . : 792 GCAGAGGAACAGTCACGCGGGCTGCAAGTGCGTCGGGAGCCAGGTGCACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101455 GCAGAGGAACAGTCACGCGGGCTGCAAGTGCGTCGGGAGCCAGGTGCACT 850 . : . : . : . : . : 842 ACGCGCGCTCCGAGGATGAGGACTCCCTGTCGCCGGCCTCAGCCAACGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101505 ACGCGCGCTCCGAGGATGAGGACTCCCTGTCGCCGGCCTCAGCCAACGAT 900 . : . : 892 GACAAGGAGATTTCCCCCTTA ||||||||||||||||||||| 101555 GACAAGGAGATTTCCCCCTTA