Result of FASTA (ccds) for pF1KB8895
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8895, 223 aa
  1>>>pF1KB8895 223 - 223 aa - 223 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4294+/-0.000859; mu= 13.2941+/- 0.052
 mean_var=67.4139+/-13.205, 0's: 0 Z-trim(106.5): 59  B-trim: 6 in 2/51
 Lambda= 0.156207
 statistics sampled from 8930 (8991) to 8930 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.656), E-opt: 0.2 (0.276), width:  16
 Scan time:  2.030

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5752.1 DNAJB9 gene_id:4189|Hs108|chr7          ( 223) 1507 348.3 2.3e-96
CCDS684.1 DNAJB4 gene_id:11080|Hs108|chr1          ( 337)  343 86.1   3e-17
CCDS47755.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7        ( 241)  340 85.3 3.6e-17
CCDS5946.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7         ( 326)  340 85.4 4.7e-17
CCDS35007.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9        ( 348)  337 84.7 7.9e-17
CCDS47959.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9        ( 420)  337 84.8 9.3e-17
CCDS47960.2 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9        ( 462)  337 84.8   1e-16
CCDS3277.1 DNAJB11 gene_id:51726|Hs108|chr3        ( 358)  320 80.9 1.2e-15
CCDS3048.1 DNAJB8 gene_id:165721|Hs108|chr3        ( 232)  312 79.0 2.8e-15
CCDS12312.1 DNAJB1 gene_id:3337|Hs108|chr19        ( 340)  308 78.2 7.2e-15
CCDS7316.2 DNAJB12 gene_id:54788|Hs108|chr10       ( 409)  304 77.3 1.6e-14
CCDS45400.1 DNAJA3 gene_id:9093|Hs108|chr16        ( 453)  304 77.3 1.7e-14
CCDS10515.1 DNAJA3 gene_id:9093|Hs108|chr16        ( 480)  304 77.4 1.8e-14
CCDS46519.1 DNAJB2 gene_id:3300|Hs108|chr2         ( 277)  297 75.7 3.4e-14
CCDS2439.1 DNAJB2 gene_id:3300|Hs108|chr2          ( 324)  297 75.7 3.9e-14
CCDS10726.1 DNAJA2 gene_id:10294|Hs108|chr16       ( 412)  286 73.3 2.6e-13
CCDS34035.1 DNAJB14 gene_id:79982|Hs108|chr4       ( 379)  283 72.6 3.9e-13
CCDS14008.1 DNAJB7 gene_id:150353|Hs108|chr22      ( 309)  278 71.4 7.2e-13
CCDS30606.1 DNAJC16 gene_id:23341|Hs108|chr1       ( 782)  279 71.8 1.4e-12
CCDS45316.1 DNAJA4 gene_id:55466|Hs108|chr15       ( 397)  273 70.3 1.9e-12
CCDS10299.2 DNAJA4 gene_id:55466|Hs108|chr15       ( 426)  273 70.3 2.1e-12
CCDS6533.1 DNAJA1 gene_id:3301|Hs108|chr9          ( 397)  270 69.7 3.1e-12
CCDS74613.1 DNAJC10 gene_id:54431|Hs108|chr2       ( 747)  266 68.9 9.9e-12
CCDS33345.1 DNAJC10 gene_id:54431|Hs108|chr2       ( 793)  266 68.9   1e-11
CCDS4214.1 DNAJC18 gene_id:202052|Hs108|chr5       ( 358)  260 67.4 1.4e-11


>>CCDS5752.1 DNAJB9 gene_id:4189|Hs108|chr7               (223 aa)
 initn: 1507 init1: 1507 opt: 1507  Z-score: 1843.5  bits: 348.3 E(32554): 2.3e-96
Smith-Waterman score: 1507; 100.0% identity (100.0% similar) in 223 aa overlap (1-223:1-223)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MATPQSIFIFAICILMITELILASKSYYDILGVPKSASERQIKKAFHKLAMKYHPDKNKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MATPQSIFIFAICILMITELILASKSYYDILGVPKSASERQIKKAFHKLAMKYHPDKNKS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 PDAEAKFREIAEAYETLSDANRRKEYDTLGHSAFTSGKGQRGSGSSFEQSFNFNFDDLFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 PDAEAKFREIAEAYETLSDANRRKEYDTLGHSAFTSGKGQRGSGSSFEQSFNFNFDDLFK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 DFGFFGQNQNTGSKKRFENHFQTRQDGGSSRQRHHFQEFSFGGGLFDDMFEDMEKMFSFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 DFGFFGQNQNTGSKKRFENHFQTRQDGGSSRQRHHFQEFSFGGGLFDDMFEDMEKMFSFS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220   
pF1KB8 GFDSTNQHTVQTENRFHGSSKHCRTVTQRRGNMVTTYTDCSGQ
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 GFDSTNQHTVQTENRFHGSSKHCRTVTQRRGNMVTTYTDCSGQ
              190       200       210       220   

>>CCDS684.1 DNAJB4 gene_id:11080|Hs108|chr1               (337 aa)
 initn: 324 init1: 296 opt: 343  Z-score: 423.1  bits: 86.1 E(32554): 3e-17
Smith-Waterman score: 343; 43.4% identity (69.9% similar) in 143 aa overlap (25-161:3-137)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MATPQSIFIFAICILMITELILASKSYYDILGVPKSASERQIKKAFHKLAMKYHPDKNKS
                               :.:: :::. :.::...::::..: :.:.:::::::
CCDS68                       MGKDYYCILGIEKGASDEDIKKAYRKQALKFHPDKNKS
                                     10        20        30        

               70        80        90       100        110         
pF1KB8 PDAEAKFREIAEAYETLSDANRRKEYDTLGHSAFTSGKGQR-GSGSSFEQSFNFNFDDLF
       :.:: ::.:.:::::.::: ..:. :: .:. .. .: :   :.:..:. .:. .    :
CCDS68 PQAEEKFKEVAEAYEVLSDPKKREIYDQFGEEGLKGGAGGTDGQGGTFRYTFHGDPHATF
       40        50        60        70        80        90        

     120       130       140       150            160       170    
pF1KB8 KDFGFFGQNQNTGSKKRFENHFQTRQDGGSSRQRHH-----FQEFSFGGGLFDDMFEDME
          .:::     ::.  ::  :  :. :: . .. .     :. :.:             
CCDS68 A--AFFG-----GSNP-FEIFFGRRMGGGRDSEEMEIDGDPFSAFGFSMNGYPRDRNSVG
        100             110       120       130       140       150

          180       190       200       210       220              
pF1KB8 KMFSFSGFDSTNQHTVQTENRFHGSSKHCRTVTQRRGNMVTTYTDCSGQ           
                                                                   
CCDS68 PSRLKQDPPVIHELRVSLEEIYSGCTKRMKISRKRLNADGRSYRSEDKILTIEIKKGWKE
              160       170       180       190       200       210

>>CCDS47755.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7             (241 aa)
 initn: 180 init1: 150 opt: 340  Z-score: 421.7  bits: 85.3 E(32554): 3.6e-17
Smith-Waterman score: 344; 36.8% identity (65.7% similar) in 204 aa overlap (27-210:4-202)

               10        20        30        40        50          
pF1KB8 MATPQSIFIFAICILMITELILASKSYYDILGVPKSASERQIKKAFHKLAMKYHPDKN--
                                 ::..::: . :: ..::::..:::.:.:::::  
CCDS47                        MVDYYEVLGVQRHASPEDIKKAYRKLALKWHPDKNPE
                                      10        20        30       

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB8 KSPDAEAKFREIAEAYETLSDANRRKEYDTLGHSAFTSGKGQRGSGSSFEQSFNFNF---
       .. .:: ::...:::::.::::..:  ::  :. ....: :   .:: :.. :.:.:   
CCDS47 NKEEAERKFKQVAEAYEVLSDAKKRDIYDKYGKEGLNGGGG---GGSHFDSPFEFGFTFR
        40        50        60        70           80        90    

           120       130         140       150          160        
pF1KB8 --DDLFKDFGFFGQNQNTGS--KKRFENHFQTRQDGGSSRQR---HHFQEFS----FGGG
         ::.:..: : :..  . .  .  ::. : .:.   .::.:     :. ::    ::.:
CCDS47 NPDDVFREF-FGGRDPFSFDFFEDPFEDFFGNRRGPRGSRSRGTGSFFSAFSGFPSFGSG
          100        110       120       130       140       150   

            170         180       190       200       210       220
pF1KB8 L--FDDMFEDMEKMF--SFSGFDSTNQHTVQTENRFHGSSKHCRTVTQRRGNMVTTYTDC
       .  ::  : .. ..   ....:.::.       : :.. :   . :. :.          
CCDS47 FSSFDTGFTSFGSLGHGGLTSFSSTSFGGSGMGN-FKSISTSTKMVNGRKITTKRIVENG
           160       170       180        190       200       210  

                                    
pF1KB8 SGQ                          
                                    
CCDS47 QERVEVEEDGQLKSLTINGKEQLLRLDNK
            220       230       240 

>>CCDS5946.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7              (326 aa)
 initn: 180 init1: 150 opt: 340  Z-score: 419.7  bits: 85.4 E(32554): 4.7e-17
Smith-Waterman score: 344; 36.8% identity (65.7% similar) in 204 aa overlap (27-210:4-202)

               10        20        30        40        50          
pF1KB8 MATPQSIFIFAICILMITELILASKSYYDILGVPKSASERQIKKAFHKLAMKYHPDKN--
                                 ::..::: . :: ..::::..:::.:.:::::  
CCDS59                        MVDYYEVLGVQRHASPEDIKKAYRKLALKWHPDKNPE
                                      10        20        30       

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB8 KSPDAEAKFREIAEAYETLSDANRRKEYDTLGHSAFTSGKGQRGSGSSFEQSFNFNF---
       .. .:: ::...:::::.::::..:  ::  :. ....: :   .:: :.. :.:.:   
CCDS59 NKEEAERKFKQVAEAYEVLSDAKKRDIYDKYGKEGLNGGGG---GGSHFDSPFEFGFTFR
        40        50        60        70           80        90    

           120       130         140       150          160        
pF1KB8 --DDLFKDFGFFGQNQNTGS--KKRFENHFQTRQDGGSSRQR---HHFQEFS----FGGG
         ::.:..: : :..  . .  .  ::. : .:.   .::.:     :. ::    ::.:
CCDS59 NPDDVFREF-FGGRDPFSFDFFEDPFEDFFGNRRGPRGSRSRGTGSFFSAFSGFPSFGSG
          100        110       120       130       140       150   

            170         180       190       200       210       220
pF1KB8 L--FDDMFEDMEKMF--SFSGFDSTNQHTVQTENRFHGSSKHCRTVTQRRGNMVTTYTDC
       .  ::  : .. ..   ....:.::.       : :.. :   . :. :.          
CCDS59 FSSFDTGFTSFGSLGHGGLTSFSSTSFGGSGMGN-FKSISTSTKMVNGRKITTKRIVENG
           160       170       180        190       200       210  

                                                                   
pF1KB8 SGQ                                                         
                                                                   
CCDS59 QERVEVEEDGQLKSLTINGVADDDALAEERMRRGQNALPAQPAGLRPPKPPRPASLLRHA
            220       230       240       250       260       270  

>>CCDS35007.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9             (348 aa)
 initn: 370 init1: 308 opt: 337  Z-score: 415.6  bits: 84.7 E(32554): 7.9e-17
Smith-Waterman score: 353; 37.7% identity (63.3% similar) in 199 aa overlap (25-212:3-198)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MATPQSIFIFAICILMITELILASKSYYDILGVPKSASERQIKKAFHKLAMKYHPDKNKS
                               :.:: :::.:..:.: .::::..:.:.:::::::: 
CCDS35                       MGKDYYKILGIPSGANEDEIKKAYRKMALKYHPDKNKE
                                     10        20        30        

               70        80        90       100        110         
pF1KB8 PDAEAKFREIAEAYETLSDANRRKEYDTLGHSAFTSGKGQRGSGS-SFEQSFNFNFDDLF
       :.:: ::.::::::..::: ..:  ::  :. .. .: :  :..: ::. .:. .    :
CCDS35 PNAEEKFKEIAEAYDVLSDPKKRGLYDQYGEEGLKTGGGTSGGSSGSFHYTFHGDPHATF
       40        50        60        70        80        90        

     120            130       140       150       160         170  
pF1KB8 KDFGFFGQNQ-----NTGSKKRFENHFQTRQDGGSSRQRHHFQEFS-FG-GGLFDDMFED
        .: : :.:       .. . :  . :.  .:   ....  :  :. :: .::     . 
CCDS35 ASF-FGGSNPFDIFFASSRSTRPFSGFDP-DDMDVDEDEDPFGAFGRFGFNGLSRGPRRA
      100        110       120        130       140       150      

            180          190       200       210       220         
pF1KB8 MEKMFSFSGF-DSTNQHT--VQTENRFHGSSKHCRTVTQRRGNMVTTYTDCSGQ      
        : ..      :    :   :. :. .:::.:. . .:.:: :                 
CCDS35 PEPLYPRRKVQDPPVVHELRVSLEEIYHGSTKRMK-ITRRRLNPDGRTVRTEDKILHIVI
        160       170       180       190        200       210     

CCDS35 KRGWKEGTKITFPKEGDATPDNIPADIVFVLKDKPHAHFRRDGTNVLYSALISLKEALCG
         220       230       240       250       260       270     

>>CCDS47959.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9             (420 aa)
 initn: 347 init1: 308 opt: 337  Z-score: 414.3  bits: 84.8 E(32554): 9.3e-17
Smith-Waterman score: 353; 37.7% identity (63.3% similar) in 199 aa overlap (25-212:75-270)

                     10        20        30        40        50    
pF1KB8       MATPQSIFIFAICILMITELILASKSYYDILGVPKSASERQIKKAFHKLAMKYH
                                     :.:: :::.:..:.: .::::..:.:.:::
CCDS47 EPLKLRAWTLNGFVKFRNKETSAGPVAVMGKDYYKILGIPSGANEDEIKKAYRKMALKYH
           50        60        70        80        90       100    

           60        70        80        90       100        110   
pF1KB8 PDKNKSPDAEAKFREIAEAYETLSDANRRKEYDTLGHSAFTSGKGQRGSGS-SFEQSFNF
       ::::: :.:: ::.::::::..::: ..:  ::  :. .. .: :  :..: ::. .:. 
CCDS47 PDKNKEPNAEEKFKEIAEAYDVLSDPKKRGLYDQYGEEGLKTGGGTSGGSSGSFHYTFHG
          110       120       130       140       150       160    

           120            130       140       150       160        
pF1KB8 NFDDLFKDFGFFGQNQ-----NTGSKKRFENHFQTRQDGGSSRQRHHFQEFS-FG-GGLF
       .    : .: : :.:       .. . :  . :.  .:   ....  :  :. :: .:: 
CCDS47 DPHATFASF-FGGSNPFDIFFASSRSTRPFSGFDP-DDMDVDEDEDPFGAFGRFGFNGLS
          170        180       190        200       210       220  

        170       180          190       200       210       220   
pF1KB8 DDMFEDMEKMFSFSGF-DSTNQHT--VQTENRFHGSSKHCRTVTQRRGNMVTTYTDCSGQ
           .  : ..      :    :   :. :. .:::.:. . .:.:: :           
CCDS47 RGPRRAPEPLYPRRKVQDPPVVHELRVSLEEIYHGSTKRMK-ITRRRLNPDGRTVRTEDK
            230       240       250       260        270       280 

CCDS47 ILHIVIKRGWKEGTKITFPKEGDATPDNIPADIVFVLKDKPHAHFRRDGTNVLYSALISL
             290       300       310       320       330       340 

>>CCDS47960.2 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9             (462 aa)
 initn: 347 init1: 308 opt: 337  Z-score: 413.7  bits: 84.8 E(32554): 1e-16
Smith-Waterman score: 353; 37.7% identity (63.3% similar) in 199 aa overlap (25-212:117-312)

                     10        20        30        40        50    
pF1KB8       MATPQSIFIFAICILMITELILASKSYYDILGVPKSASERQIKKAFHKLAMKYH
                                     :.:: :::.:..:.: .::::..:.:.:::
CCDS47 EPLKLRAWTLNGFVKFRNKETSAGPVAVMGKDYYKILGIPSGANEDEIKKAYRKMALKYH
         90       100       110       120       130       140      

           60        70        80        90       100        110   
pF1KB8 PDKNKSPDAEAKFREIAEAYETLSDANRRKEYDTLGHSAFTSGKGQRGSGS-SFEQSFNF
       ::::: :.:: ::.::::::..::: ..:  ::  :. .. .: :  :..: ::. .:. 
CCDS47 PDKNKEPNAEEKFKEIAEAYDVLSDPKKRGLYDQYGEEGLKTGGGTSGGSSGSFHYTFHG
        150       160       170       180       190       200      

           120            130       140       150       160        
pF1KB8 NFDDLFKDFGFFGQNQ-----NTGSKKRFENHFQTRQDGGSSRQRHHFQEFS-FG-GGLF
       .    : .: : :.:       .. . :  . :.  .:   ....  :  :. :: .:: 
CCDS47 DPHATFASF-FGGSNPFDIFFASSRSTRPFSGFDP-DDMDVDEDEDPFGAFGRFGFNGLS
        210        220       230       240        250       260    

        170       180          190       200       210       220   
pF1KB8 DDMFEDMEKMFSFSGF-DSTNQHT--VQTENRFHGSSKHCRTVTQRRGNMVTTYTDCSGQ
           .  : ..      :    :   :. :. .:::.:. . .:.:: :           
CCDS47 RGPRRAPEPLYPRRKVQDPPVVHELRVSLEEIYHGSTKRMK-ITRRRLNPDGRTVRTEDK
          270       280       290       300        310       320   

CCDS47 ILHIVIKRGWKEGTKITFPKEGDATPDNIPADIVFVLKDKPHAHFRRDGTNVLYSALISL
           330       340       350       360       370       380   

>>CCDS3277.1 DNAJB11 gene_id:51726|Hs108|chr3             (358 aa)
 initn: 330 init1: 185 opt: 320  Z-score: 394.7  bits: 80.9 E(32554): 1.2e-15
Smith-Waterman score: 320; 41.6% identity (74.4% similar) in 125 aa overlap (4-126:3-118)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MATPQSIFIFAICILMITELILASKSYYDILGVPKSASERQIKKAFHKLAMKYHPDKNKS
          ::..  : . .:..   ..:....: :::::.::: ..::::..:::.. :::.: .
CCDS32  MAPQNLSTFCLLLLYLIGAVIAGRDFYKILGVPRSASIKDIKKAYRKLALQLHPDRNPD
                10        20        30        40        50         

                70        80        90       100       110         
pF1KB8 -PDAEAKFREIAEAYETLSDANRRKEYDTLGHSAFTSGKGQRGSGSSFEQSFNFNFDDLF
        :.:. ::.... :::.:::...::.::: :. .. .:. : . :. : .        .:
CCDS32 DPQAQEKFQDLGAAYEVLSDSEKRKQYDTYGEEGLKDGH-QSSHGDIFSH--------FF
      60        70        80        90        100               110

     120        130       140       150       160       170        
pF1KB8 KDFGF-FGQNQNTGSKKRFENHFQTRQDGGSSRQRHHFQEFSFGGGLFDDMFEDMEKMFS
        :::: ::                                                    
CCDS32 GDFGFMFGGTPRQQDRNIPRGSDIIVDLEVTLEEVYAGNFVEVVRNKPVARQAPGKRKCN
              120       130       140       150       160       170

>>CCDS3048.1 DNAJB8 gene_id:165721|Hs108|chr3             (232 aa)
 initn: 194 init1: 151 opt: 312  Z-score: 387.8  bits: 79.0 E(32554): 2.8e-15
Smith-Waterman score: 312; 36.1% identity (67.2% similar) in 180 aa overlap (26-200:3-173)

               10        20        30        40        50          
pF1KB8 MATPQSIFIFAICILMITELILASKSYYDILGVPKSASERQIKKAFHKLAMKYHPDKN--
                                .::..:::  ::: ..::::..:::...:::::  
CCDS30                        MANYYEVLGVQASASPEDIKKAYRKLALRWHPDKNPD
                                      10        20        30       

       60        70        80        90       100        110       
pF1KB8 KSPDAEAKFREIAEAYETLSDANRRKEYDTLGHSAFTSGKGQRGS-GSSFEQSFNF-NFD
       .. .:: ::. ..::::.:::...:. ::  : ... .: :      : :. ...: : .
CCDS30 NKEEAEKKFKLVSEAYEVLSDSKKRSLYDRAGCDSWRAGGGASTPYHSPFDTGYTFRNPE
        40        50        60        70        80        90       

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB8 DLFKDFGFFGQNQNTGSKKRFENHFQTRQDGGSSRQRHHFQEFSFGGGLFDDMFEDMEKM
       :.:..  ::: . .  : . ... :.. . :     : :  . .:..: : ..   :: .
CCDS30 DIFRE--FFG-GLDPFSFEFWDSPFNSDRGG-----RGHGLRGAFSAG-FGEFPAFMEAF
       100          110       120            130        140        

        180        190       200       210       220               
pF1KB8 FSFSGFD-STNQHTVQTENRFHGSSKHCRTVTQRRGNMVTTYTDCSGQ            
        ::. .  : ..::. . . : :::                                   
CCDS30 SSFNMLGCSGGSHTTFSSTSFGGSSSGSSGFKSVMSSTEMINGHKVTTKRIVENGQERVE
      150       160       170       180       190       200        

>>CCDS12312.1 DNAJB1 gene_id:3337|Hs108|chr19             (340 aa)
 initn: 267 init1: 267 opt: 308  Z-score: 380.4  bits: 78.2 E(32554): 7.2e-15
Smith-Waterman score: 308; 36.7% identity (64.7% similar) in 150 aa overlap (25-169:3-144)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MATPQSIFIFAICILMITELILASKSYYDILGVPKSASERQIKKAFHKLAMKYHPDKNKS
                               :.::. ::. ..::...::.:... :..::::::: 
CCDS12                       MGKDYYQTLGLARGASDEEIKRAYRRQALRYHPDKNKE
                                     10        20        30        

               70        80        90            100       110     
pF1KB8 PDAEAKFREIAEAYETLSDANRRKEYDTLGH-----SAFTSGKGQRGSGSSFEQSFNFNF
       : :: ::.::::::..:::  .:. .:  :.     :. ..:.:  ..:.::  .:. . 
CCDS12 PGAEEKFKEIAEAYDVLSDPRKREIFDRYGEEGLKGSGPSGGSGGGANGTSFSYTFHGDP
       40        50        60        70        80        90        

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB8 DDLFKDFGFFGQNQNTGSKKRFENHFQTRQDGGSSRQRHHFQEFSFGGGLFDDMFEDMEK
         .: .: : :.:        :.. :  :.   .      :. : .: : : ..      
CCDS12 HAMFAEF-FGGRNP-------FDTFFGQRNGEEGMDIDDPFSGFPMGMGGFTNVNFGRSR
      100        110              120       130       140       150

         180       190       200       210       220               
pF1KB8 MFSFSGFDSTNQHTVQTENRFHGSSKHCRTVTQRRGNMVTTYTDCSGQ            
                                                                   
CCDS12 SAQEPARKKQDPPVTHDLRVSLEEIYSGCTKKMKISHKRLNPDGKSIRNEDKILTIEVKK
              160       170       180       190       200       210




223 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 16:24:06 2016 done: Fri Nov  4 16:24:07 2016
 Total Scan time:  2.030 Total Display time:  0.010

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com