Result of FASTA (ccds) for pF1KB8825
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8825, 415 aa
  1>>>pF1KB8825 415 - 415 aa - 415 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3563+/-0.000772; mu= 17.2961+/- 0.047
 mean_var=97.9844+/-26.149, 0's: 0 Z-trim(110.1): 246  B-trim: 1341 in 2/47
 Lambda= 0.129567
 statistics sampled from 10961 (11331) to 10961 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.7), E-opt: 0.2 (0.348), width:  16
 Scan time:  3.310

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX          ( 415) 2769 528.1  6e-150
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX          ( 368) 2435 465.6 3.5e-131
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11           ( 372)  845 168.4   1e-41
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2           ( 360)  827 165.0   1e-40
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2           ( 350)  791 158.3 1.1e-38
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17          ( 372)  786 157.4 2.1e-38
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17          ( 378)  786 157.4 2.2e-38
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2          ( 356)  758 152.1 7.8e-37
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2          ( 352)  754 151.4 1.3e-36
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6            ( 374)  750 150.6 2.3e-36
CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17         ( 362)  735 147.8 1.6e-35
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3            ( 360)  734 147.6 1.8e-35
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3           ( 384)  731 147.1 2.7e-35
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3         ( 374)  694 140.2 3.2e-33
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3         ( 360)  685 138.5   1e-32
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3            ( 352)  683 138.1 1.3e-32
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 357)  677 137.0 2.8e-32
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 369)  677 137.0 2.9e-32
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3            ( 355)  670 135.7   7e-32
CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3          ( 350)  655 132.8 4.8e-31
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3            ( 355)  643 130.6 2.3e-30
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3           ( 376)  643 130.6 2.4e-30
CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3          ( 342)  639 129.8 3.8e-30
CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3         ( 355)  617 125.7 6.7e-29
CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3         ( 387)  617 125.8 7.1e-29
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 388)  616 125.6 8.1e-29
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 394)  616 125.6 8.2e-29
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3            ( 359)  614 125.2   1e-28
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3            ( 355)  601 122.8 5.3e-28
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX           ( 363)  594 121.5 1.3e-27
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2          ( 362)  560 115.1 1.1e-25
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1           ( 361)  540 111.4 1.5e-24
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14          ( 391)  505 104.9 1.4e-22
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX          ( 365)  500 103.9 2.6e-22
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX       ( 337)  473 98.8 8.2e-21
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17         ( 387)  472 98.7   1e-20
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13       ( 346)  466 97.5 2.1e-20
CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19          ( 350)  462 96.8 3.5e-20
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16         ( 364)  445 93.6 3.3e-19
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3           ( 373)  444 93.4 3.8e-19
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2           ( 367)  442 93.0 4.8e-19
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2            ( 355)  439 92.5   7e-19
CCDS9626.1 LTB4R gene_id:1241|Hs108|chr14          ( 352)  437 92.1   9e-19
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14          ( 353)  437 92.1   9e-19
CCDS12699.1 C5AR2 gene_id:27202|Hs108|chr19        ( 337)  436 91.9 9.9e-19
CCDS1124.1 RXFP4 gene_id:339403|Hs108|chr1         ( 374)  433 91.4 1.6e-18
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX          ( 370)  432 91.2 1.8e-18
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20         ( 388)  423 89.5 5.9e-18
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20        ( 333)  420 88.9 7.8e-18
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18         ( 349)  419 88.7 9.2e-18


>>CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX               (415 aa)
 initn: 2769 init1: 2769 opt: 2769  Z-score: 2805.5  bits: 528.1 E(32554): 6e-150
Smith-Waterman score: 2769; 100.0% identity (100.0% similar) in 415 aa overlap (1-415:1-415)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MELRKYGPGRLAGTVIGGAAQSKSQTKSDSITKEFLPGLYTAPSSPFPPSQVSDHQVLND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MELRKYGPGRLAGTVIGGAAQSKSQTKSDSITKEFLPGLYTAPSSPFPPSQVSDHQVLND
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 AEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDFSLNFDRAFLPALYSLLFLLGLLGNGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 AEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDFSLNFDRAFLPALYSLLFLLGLLGNGA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 VAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAVQWVFGSGLCKVAGALFNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAVQWVFGSGLCKVAGALFNI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 NFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTLTCLAVWGLCLLFALPDFIFLSAH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 NFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTLTCLAVWGLCLLFALPDFIFLSAH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 HDERLNATHCQYNFPQVGRTALRVLQLVAGFLLPLLVMAYCYAHILAVLLVSRGQRRLRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 HDERLNATHCQYNFPQVGRTALRVLQLVAGFLLPLLVMAYCYAHILAVLLVSRGQRRLRA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 MRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNCGRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNCGRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410     
pF1KB8 NPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSSSRRDSSWSETSEASYSGL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 NPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSSSRRDSSWSETSEASYSGL
              370       380       390       400       410     

>>CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX               (368 aa)
 initn: 2435 init1: 2435 opt: 2435  Z-score: 2468.7  bits: 465.6 E(32554): 3.5e-131
Smith-Waterman score: 2435; 99.7% identity (100.0% similar) in 365 aa overlap (51-415:4-368)

               30        40        50        60        70        80
pF1KB8 QSKSQTKSDSITKEFLPGLYTAPSSPFPPSQVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENE
                                     .:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14                            MVLEVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENE
                                          10        20        30   

               90       100       110       120       130       140
pF1KB8 SDSCCTSPPCPQDFSLNFDRAFLPALYSLLFLLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SDSCCTSPPCPQDFSLNFDRAFLPALYSLLFLLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLL
            40        50        60        70        80        90   

              150       160       170       180       190       200
pF1KB8 HLAVADTLLVLTLPLWAVDAAVQWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HLAVADTLLVLTLPLWAVDAAVQWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNI
           100       110       120       130       140       150   

              210       220       230       240       250       260
pF1KB8 VHATQLYRRGPPARVTLTCLAVWGLCLLFALPDFIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQVGRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VHATQLYRRGPPARVTLTCLAVWGLCLLFALPDFIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQVGRT
           160       170       180       190       200       210   

              270       280       290       300       310       320
pF1KB8 ALRVLQLVAGFLLPLLVMAYCYAHILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ALRVLQLVAGFLLPLLVMAYCYAHILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHL
           220       230       240       250       260       270   

              330       340       350       360       370       380
pF1KB8 VVLVDILMDLGALARNCGRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VVLVDILMDLGALARNCGRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLL
           280       290       300       310       320       330   

              390       400       410     
pF1KB8 LRLGCPNQRGLQRQPSSSRRDSSWSETSEASYSGL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LRLGCPNQRGLQRQPSSSRRDSSWSETSEASYSGL
           340       350       360        

>>CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11                (372 aa)
 initn: 788 init1: 444 opt: 845  Z-score: 862.4  bits: 168.4 E(32554): 1e-41
Smith-Waterman score: 845; 40.9% identity (68.3% similar) in 357 aa overlap (67-411:14-367)

         40        50        60        70        80         90     
pF1KB8 PGLYTAPSSPFPPSQVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENESD-SCCTSPPCPQD--
                                     ::..    :  .: .: :   .  ::    
CCDS84                  MNYPLTLEMDLENLEDLFWELDRLDNYNDTSLVENHLCPATEG
                                10        20        30        40   

            100       110       120       130       140       150  
pF1KB8 -FSLNFDRAFLPALYSLLFLLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLT
        .  .:  .:.:. :::.::::..::  : ..:  .: . :::.:::.:::::: :::. 
CCDS84 PLMASFKAVFVPVAYSLIFLLGVIGNVLVLVILERHRQTRSSTETFLFHLAVADLLLVFI
            50        60        70        80        90       100   

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB8 LPLWAVDAAVQWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPP
       ::. .....: ::.:. :::.. :: ..::: ..::::::. :::: ::::.. ::.   
CCDS84 LPFAVAEGSVGWVLGTFLCKTVIALHKVNFYCSSLLLACIAVDRYLAIVHAVHAYRHRRL
           110       120       130       140       150       160   

            220       230          240       250       260         
pF1KB8 ARVTLTCLAVWGLCLLFALPDFIFLSA---HHDERLNATHCQYNFPQVGRT----ALRVL
         . .:: ..: . .:.:::...: ..   ::.. :   .: ..  . ..:    . : :
CCDS84 LSIHITCGTIWLVGFLLALPEILFAKVSQGHHNNSL--PRCTFSQENQAETHAWFTSRFL
           170       180       190         200       210       220 

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pF1KB8 QLVAGFLLPLLVMAYCYAHILAVL-LVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLV
         :::::::.:::..::. ..  :  ..:  .: .:.:....:.  : :::.:::.:...
CCDS84 YHVAGFLLPMLVMGWCYVGVVHRLRQAQRRPQRQKAVRVAILVTSIFFLCWSPYHIVIFL
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pF1KB8 DILMDLGALARNCGRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLG
       : :  : :.  .:  .. . :: ..   ::  ::::::.::.:.:::::  .  :: .::
CCDS84 DTLARLKAVDNTCKLNGSLPVAITMCEFLGLAHCCLNPMLYTFAGVKFRSDLSRLLTKLG
             290       300       310       320       330       340 

          390       400       410      
pF1KB8 CPNQRGLQRQPSSSRRDSSWSETSEASYSGL 
       : .  .: .   : :: :: ::. .:.     
CCDS84 CTGPASLCQLFPSWRR-SSLSESENATSLTTF
             350        360       370  

>>CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2                (360 aa)
 initn: 829 init1: 388 opt: 827  Z-score: 844.4  bits: 165.0 E(32554): 1e-40
Smith-Waterman score: 827; 40.6% identity (68.5% similar) in 340 aa overlap (72-408:21-357)

              50        60        70        80        90       100 
pF1KB8 APSSPFPPSQVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDFSLNFDRA
                                     :.:.:. .       . ::  . ::.... 
CCDS24           MEDFNMESDSFEDFWKGEDLSNYSYSSTLPPFLLDAAPCEPE-SLEINKY
                         10        20        30        40          

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pF1KB8 FLPALYSLLFLLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAA
       :.  .:.:.:::.::::. :  :.:  :.. : ::..::.::.:: :..::::.::.. .
CCDS24 FVVIIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKV
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pF1KB8 VQWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTLTCLA
         :.::. ::::.. : ..:::.: ::::::: :::: :::::.   .     : . ::.
CCDS24 NGWIFGTFLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQ-KRYLVKFICLS
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pF1KB8 VWGLCLLFALPDFIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQVG---RTALRVLQLVAGFLLPLLVM
       .::: ::.::: ..:  . ..  .. . :  .. .     :  ::.:    ::..:::.:
CCDS24 IWGLSLLLALPVLLFRRTVYSSNVSPA-CYEDMGNNTANWRMLLRILPQSFGFIVPLLIM
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pF1KB8 AYCYAHILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNCG
        .::.  : .:. ..  .. ::::.. .::. : ::: ::.::.:.: ::   .. ..: 
CCDS24 LFCYGFTLRTLFKAHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCE
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pF1KB8 RESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSSS
       :....: : ..:  :: .: :::::.:::.: :::. .  .:   :  .. .: ..   :
CCDS24 RRNHIDRALDATEILGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSLPKDSRPS
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pF1KB8 RRDSSWSETSEASYSGL
          :: ..::       
CCDS24 FVGSSSGHTSTTL    
       350       360    

>>CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2                (350 aa)
 initn: 774 init1: 369 opt: 791  Z-score: 808.2  bits: 158.3 E(32554): 1.1e-38
Smith-Waterman score: 791; 40.2% identity (68.0% similar) in 331 aa overlap (88-408:21-348)

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pF1KB8 LNDAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDFS------LNFDRAFLPALYSLLF
                                     ::  .:.:       ....  .   :.:.:
CCDS24           MSNITDPQMWDFDDLNFTGMPPADEDYSPCMLETETLNKYVVIIAYALVF
                         10        20        30        40        50

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pF1KB8 LLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAVQWVFGSGLC
       ::.::::. :  :.:  :.. : ::..::.::.:: :..::::.::.. .  :.::. ::
CCDS24 LLSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFGTFLC
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pF1KB8 KVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTLTCLAVWGLCLLFAL
       ::.. : ..:::.: ::::::: :::: :::::.   .     : ..::. ::: . ..:
CCDS24 KVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQ-KRHLVKFVCLGCWGLSMNLSL
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pF1KB8 PDFIFLSAHHDERLNATHCQY----NFPQVGRTALRVLQLVAGFLLPLLVMAYCYAHILA
       : :.: .:.: .  :..   :    :     : .::.:  . ::..::.:: .::.  : 
CCDS24 PFFLFRQAYHPN--NSSPVCYEVLGNDTAKWRMVLRILPHTFGFIVPLFVMLFCYGFTLR
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pF1KB8 VLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNCGRESRVDVAK
       .:. ..  .. ::::.. .::. : ::: ::.::.:.: ::   .. ..: :.. .  : 
CCDS24 TLFKAHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQESCERRNNIGRAL
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pF1KB8 SVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSSSRRDSSWSET
       ..:  ::..: ::::..:::.: .::. .  .:   :  ... : :.  .:  .:: . .
CCDS24 DATEILGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRHGFLKILAMHGLVSKEFLARHRVTSYTSSSVNVS
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       410     
pF1KB8 SEASYSGL
       :       
CCDS24 SNL     
       350     

>>CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17               (372 aa)
 initn: 690 init1: 369 opt: 786  Z-score: 802.8  bits: 157.4 E(32554): 2.1e-38
Smith-Waterman score: 786; 38.4% identity (70.2% similar) in 346 aa overlap (75-411:25-367)

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pF1KB8 SPFPPSQVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDY-GENES-DSCCTSPPCPQDFSLNFDRAF
                                     :: :.: . :       : .    ::   :
CCDS77       MKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWF
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pF1KB8 LPALYSLLFLLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAV
       :: .::.. ..:::::: :. . .  .   . :::.::.::::: :..::::.:: .:: 
CCDS77 LPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAK
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pF1KB8 QWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTL----T
       .::::  .::.  :.....:..: ::: :::.:::. ::.:.. .:.   ::: :    .
CCDS77 SWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHR--ARVLLISKLS
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pF1KB8 CLAVWGLCLLFALPDFIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQV-GRTALRVLQLVAGFLLPLLV
       :...: :  ....:.... . ...   .: .:.    .: .  ...: :.: :::.:::.
CCDS77 CVGIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLLA
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pF1KB8 MAYCYAHILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNC
       :..::  :. .:: .:. .: .:......:::.: .   ::. :::.. . ...  . .:
CCDS77 MSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTC
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pF1KB8 GRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSS
          .....: .:: .:. ..::.::.::::.:::::. .. :.  ::: .:. : :: ::
CCDS77 ELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQL-RQWSS
            300       310       320       330       340        350 

         400       410      
pF1KB8 SR--RDSSWSETSEASYSGL 
        :  : :: :  .:..     
CCDS77 CRHIRRSSMSVEAETTTTFSP
             360       370  

>>CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17               (378 aa)
 initn: 690 init1: 369 opt: 786  Z-score: 802.7  bits: 157.4 E(32554): 2.2e-38
Smith-Waterman score: 786; 38.4% identity (70.2% similar) in 346 aa overlap (75-411:31-373)

           50        60        70         80         90       100  
pF1KB8 SPFPPSQVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDY-GENES-DSCCTSPPCPQDFSLNFDRAF
                                     :: :.: . :       : .    ::   :
CCDS11 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWF
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB8 LPALYSLLFLLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAV
       :: .::.. ..:::::: :. . .  .   . :::.::.::::: :..::::.:: .:: 
CCDS11 LPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAK
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pF1KB8 QWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTL----T
       .::::  .::.  :.....:..: ::: :::.:::. ::.:.. .:.   ::: :    .
CCDS11 SWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHR--ARVLLISKLS
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pF1KB8 CLAVWGLCLLFALPDFIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQV-GRTALRVLQLVAGFLLPLLV
       :...: :  ....:.... . ...   .: .:.    .: .  ...: :.: :::.:::.
CCDS11 CVGIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLLA
      180       190       200       210       220       230        

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pF1KB8 MAYCYAHILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNC
       :..::  :. .:: .:. .: .:......:::.: .   ::. :::.. . ...  . .:
CCDS11 MSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTC
      240       250       260       270       280       290        

       340       350       360       370       380       390       
pF1KB8 GRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSS
          .....: .:: .:. ..::.::.::::.:::::. .. :.  ::: .:. : :: ::
CCDS11 ELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQL-RQWSS
      300       310       320       330       340       350        

         400       410      
pF1KB8 SR--RDSSWSETSEASYSGL 
        :  : :: :  .:..     
CCDS11 CRHIRRSSMSVEAETTTTFSP
       360       370        

>>CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2               (356 aa)
 initn: 730 init1: 456 opt: 758  Z-score: 774.7  bits: 152.1 E(32554): 7.8e-37
Smith-Waterman score: 758; 36.2% identity (68.4% similar) in 354 aa overlap (66-411:7-351)

          40        50        60        70           80        90  
pF1KB8 LPGLYTAPSSPFPPSQVSDHQVLNDAEVAALLENFSS---SYDYGENESDSCCTSPPCPQ
                                     ::. ..:   . ..: .. ::   . :: .
CCDS33                         MSIPLPLLQIYTSDNYTEEMGSGDYDS--MKEPCFR
                                       10        20          30    

            100       110       120       130       140       150  
pF1KB8 DFSLNFDRAFLPALYSLLFLLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLT
       . . ::.. :::..::..:: :..::: :  :.  ..   : :: . :::.::: :.:.:
CCDS33 EENANFNKIFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVIT
           40        50        60        70        80        90    

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB8 LPLWAVDAAVQWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPP
       ::.:::::...: ::. :::.. .....:.:...:.:: ::.:::: :::::.  :    
CCDS33 LPFWAVDAVANWYFGNFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYLAIVHATNSQRPRKL
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            220       230       240        250        260       270
pF1KB8 ARVTLTCLAVWGLCLLFALPDFIFLSAHH-DERLNATHCQYNFPQ-VGRTALRVLQLVAG
           .. ..::   ::...::::: .. . :.:     :.  .:. .  ....  ....:
CCDS33 LAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSEADDRYI---CDRFYPNDLWVVVFQFQHIMVG
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pF1KB8 FLLPLLVMAYCYAHILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDL
       ..:: .:.  ::  :.. :  :.:... .:.. .:....::  :: ::.. . .: .. :
CCDS33 LILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTVILILAFFACWLPYYIGISIDSFILL
             220       230       240       250       260       270 

              340       350       360       370       380       390
pF1KB8 GALARNCGRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRG
         . ..:  :. :    :.: .:...::::::.::::.:.::.      :  ..    ::
CCDS33 EIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVS----RG
             280       290       300       310       320           

               400         410      
pF1KB8 LQRQP-SSSRRD--SSWSETSEASYSGL 
        . .  :...:   :: :  ::.:     
CCDS33 SSLKILSKGKRGGHSSVSTESESSSFHSS
       330       340       350      

>>CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2               (352 aa)
 initn: 730 init1: 456 opt: 754  Z-score: 770.7  bits: 151.4 E(32554): 1.3e-36
Smith-Waterman score: 754; 36.5% identity (68.7% similar) in 342 aa overlap (75-411:15-347)

           50        60        70        80        90       100    
pF1KB8 SPFPPSQVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDFSLNFDRAFLP
                                     ..: .. ::   . :: .. . ::.. :::
CCDS46                 MEGISIYTSDNYTEEMGSGDYDS--MKEPCFREENANFNKIFLP
                               10        20          30        40  

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pF1KB8 ALYSLLFLLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAVQW
       ..::..:: :..::: :  :.  ..   : :: . :::.::: :.:.:::.:::::...:
CCDS46 TIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVITLPFWAVDAVANW
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pF1KB8 VFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTLTCLAVWG
        ::. :::.. .....:.:...:.:: ::.:::: :::::.  :        .. ..:: 
CCDS46 YFGNFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYLAIVHATNSQRPRKLLAEKVVYVGVWI
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pF1KB8 LCLLFALPDFIFLSAHH-DERLNATHCQYNFPQ-VGRTALRVLQLVAGFLLPLLVMAYCY
         ::...::::: .. . :.:     :.  .:. .  ....  ....:..:: .:.  ::
CCDS46 PALLLTIPDFIFANVSEADDRYI---CDRFYPNDLWVVVFQFQHIMVGLILPGIVILSCY
            170       180          190       200       210         

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pF1KB8 AHILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNCGRESR
         :.. :  :.:... .:.. .:....::  :: ::.. . .: .. :  . ..:  :. 
CCDS46 CIIISKLSHSKGHQKRKALKTTVILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENT
     220       230       240       250       260       270         

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pF1KB8 VDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQP-SSSRRD
       :    :.: .:...::::::.::::.:.::.      :  ..    :: . .  :...: 
CCDS46 VHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVS----RGSSLKILSKGKRG
     280       290       300       310       320           330     

               410      
pF1KB8 --SSWSETSEASYSGL 
         :: :  ::.:     
CCDS46 GHSSVSTESESSSFHSS
         340       350  

>>CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6                 (374 aa)
 initn: 575 init1: 199 opt: 750  Z-score: 766.4  bits: 150.6 E(32554): 2.3e-36
Smith-Waterman score: 750; 37.7% identity (66.9% similar) in 332 aa overlap (69-385:7-336)

       40        50        60        70        80                90
pF1KB8 LYTAPSSPFPPSQVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPP--------C
                                     :::. .: .:.   :  ::          :
CCDS52                         MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVNTSYYSVDSEMLLC
                                       10        20        30      

              100       110       120       130       140       150
pF1KB8 PQDFSLNFDRAFLPALYSLLFLLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLV
         .   .:.: :.:  :::. ..:::::  :. ..   . : : ::..::..:.:: :.:
CCDS52 SLQEVRQFSRLFVPIAYSLICVFGLLGNILVVITFAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFV
         40        50        60        70        80        90      

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pF1KB8 LTLPLWAVDAAV-QWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYR-
       ::::.:::. :.  :::... ::.  ... :::  : :::.:::.:::. ::.::. .: 
CCDS52 LTLPFWAVSHATGAWVFSNATCKLLKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQATKSFRL
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pF1KB8 --RGPPARVTLTCLAVWGLCLLFALPDFIFLSAHHDERLNATHCQYNF---PQVGRTALR
         :  : :  . ::.:::: ....   :.: . .. .  .. . .:.    :   .  . 
CCDS52 RSRTLP-RSKIICLVVWGLSVIISSSTFVFNQKYNTQGSDVCEPKYQTVSEPIRWKLLML
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pF1KB8 VLQLVAGFLLPLLVMAYCYAHILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVL
        :.:. ::..::. : .::. :. .:. .....: .:.:....::..:  :  :...:.:
CCDS52 GLELLFGFFIPLMFMIFCYTFIVKTLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLL
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pF1KB8 VDILMDLGALARNCGRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRL
       :    .:: . :.:  :. .  .:.::  :...::::::.::::.: :::. .  .:  :
CCDS52 VTA-ANLGKMNRSCQSEKLIGYTKTVTEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDL
          280       290       300       310       320       330    

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pF1KB8 GCPNQRGLQRQPSSSRRDSSWSETSEASYSGL        
        :                                      
CCDS52 WCVRRKYKSSGFSCAGRYSENISRQTSETADNDNASSFTM
          340       350       360       370    




415 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 15:53:54 2016 done: Fri Nov  4 15:53:54 2016
 Total Scan time:  3.310 Total Display time:  0.050

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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