Result of FASTA (ccds) for pF1KB8810
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8810, 361 aa
  1>>>pF1KB8810 361 - 361 aa - 361 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4817+/-0.00109; mu= 14.8712+/- 0.065
 mean_var=98.8206+/-29.535, 0's: 0 Z-trim(102.8): 300  B-trim: 913 in 2/48
 Lambda= 0.129018
 statistics sampled from 6555 (7128) to 6555 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.566), E-opt: 0.2 (0.219), width:  16
 Scan time:  2.450

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13         ( 361) 2407 459.3 2.4e-129
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX       ( 337)  595 122.0 7.7e-28
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13         ( 344)  595 122.0 7.8e-28
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX          ( 370)  578 118.8 7.3e-27
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3           ( 373)  536 111.0 1.7e-24
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13       ( 346)  530 109.9 3.4e-24
CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5             ( 425)  531 110.1 3.5e-24
CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX        ( 333)  525 108.9 6.4e-24
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3            ( 359)  524 108.8 7.6e-24
CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX          ( 381)  524 108.8 7.9e-24
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 388)  524 108.8 8.1e-24
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 394)  524 108.8 8.1e-24
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX        ( 359)  523 108.6 8.7e-24
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY        ( 359)  523 108.6 8.7e-24
CCDS3159.1 P2RY12 gene_id:64805|Hs108|chr3         ( 342)  522 108.4 9.5e-24
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11          ( 377)  515 107.1 2.5e-23
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3            ( 352)  513 106.7 3.1e-23
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX          ( 365)  509 106.0 5.3e-23
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3            ( 355)  507 105.6 6.8e-23
CCDS8220.1 P2RY6 gene_id:5031|Hs108|chr11          ( 328)  505 105.2 8.3e-23
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 406)  498 104.0 2.4e-22
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13         ( 337)  496 103.5 2.7e-22
CCDS3158.2 P2RY13 gene_id:53829|Hs108|chr3         ( 354)  496 103.6 2.8e-22
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 397)  496 103.6   3e-22
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 400)  496 103.6   3e-22
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 389)  495 103.4 3.4e-22
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 392)  495 103.4 3.4e-22
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 403)  495 103.4 3.5e-22
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 493)  496 103.7 3.5e-22
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 418)  495 103.4 3.6e-22
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 420)  495 103.4 3.6e-22
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 446)  495 103.5 3.7e-22
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12         ( 372)  491 102.6 5.5e-22
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5           ( 397)  491 102.7 5.8e-22
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2          ( 362)  489 102.3   7e-22
CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19          ( 362)  484 101.3 1.3e-21
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11           ( 372)  484 101.3 1.4e-21
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 357)  482 101.0 1.7e-21
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 369)  482 101.0 1.8e-21
CCDS3157.1 GPR87 gene_id:53836|Hs108|chr3          ( 358)  481 100.8   2e-21
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8           ( 380)  479 100.4 2.6e-21
CCDS9879.1 GPR65 gene_id:8477|Hs108|chr14          ( 337)  473 99.3 5.2e-21
CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5          ( 352)  470 98.7   8e-21
CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5           ( 374)  470 98.7 8.3e-21
CCDS3156.1 P2RY14 gene_id:9934|Hs108|chr3          ( 338)  469 98.5 8.8e-21
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17         ( 369)  459 96.7 3.4e-20
CCDS3162.1 SUCNR1 gene_id:56670|Hs108|chr3         ( 334)  457 96.3 4.1e-20
CCDS318.1 PTAFR gene_id:5724|Hs108|chr1            ( 342)  455 95.9 5.4e-20
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6            ( 374)  454 95.8 6.6e-20
CCDS3155.1 GPR171 gene_id:29909|Hs108|chr3         ( 319)  450 94.9 9.8e-20


>>CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13              (361 aa)
 initn: 2407 init1: 2407 opt: 2407  Z-score: 2435.7  bits: 459.3 E(32554): 2.4e-129
Smith-Waterman score: 2407; 100.0% identity (100.0% similar) in 361 aa overlap (1-361:1-361)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MDIQMANNFTPPSATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLHYSLVFIIGLVGNLLALVVIVQNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MDIQMANNFTPPSATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLHYSLVFIIGLVGNLLALVVIVQNR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 KKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIAYYAMGFDWRIGDALCRITALVFYINTYAGVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 KKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIAYYAMGFDWRIGDALCRITALVFYINTYAGVN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 FMTCLSIDRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCIFVWILVFAQTLPLLINPMSKQEAERIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 FMTCLSIDRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCIFVWILVFAQTLPLLINPMSKQEAERIT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 CMEYPNFEETKSLPWILLGACFIGYVLPLIIILICYSQICCKLFRTAKQNPLTEKSGVNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 CMEYPNFEETKSLPWILLGACFIGYVLPLIIILICYSQICCKLFRTAKQNPLTEKSGVNK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 KALNTIILIIVVFVLCFTPYHVAIIQHMIKKLRFSNFLECSQRHSFQISLHFTVCLMNFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 KALNTIILIIVVFVLCFTPYHVAIIQHMIKKLRFSNFLECSQRHSFQISLHFTVCLMNFN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 CCMDPFIYFFACKGYKRKVMRMLKRQVSVSISSAVKSAPEENSREMTETQMMIHSKSSNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 CCMDPFIYFFACKGYKRKVMRMLKRQVSVSISSAVKSAPEENSREMTETQMMIHSKSSNG
              310       320       330       340       350       360

        
pF1KB8 K
       :
CCDS94 K
        

>>CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX            (337 aa)
 initn: 518 init1: 360 opt: 595  Z-score: 613.3  bits: 122.0 E(32554): 7.7e-28
Smith-Waterman score: 595; 29.3% identity (67.5% similar) in 311 aa overlap (38-346:30-334)

        10        20        30        40        50        60       
pF1KB8 NFTPPSATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLHYSLVFIIGLVGNLLALVVIVQNRKKINSTT
                                     ::.. ..:. :: ..: :.... .: ..  
CCDS14  MDETGNLTVSSATCHDTIDDFRNQVYSTLYSMISVVGFFGNGFVLYVLIKTYHKKSAFQ
                10        20        30        40        50         

        70        80        90       100       110       120       
pF1KB8 LYSTNLVISDILFTTALPTRIAYYAMGFDWRIGDALCRITALVFYINTYAGVNFMTCLSI
       .:  ::...:.: . .:: :..::.    : .:: :::... ..:.: : .. ::: .:.
CCDS14 VYMINLAVADLLCVCTLPLRVVYYVHKGIWLFGDFLCRLSTYALYVNLYCSIFFMTAMSF
      60        70        80        90       100       110         

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB8 DRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCIFVWILVFAQTLPLLINPMSKQEAERITCMEYPNF
        : ::.: :..  ..   ..:. ::. .::.:.  . :.:.   .:.: .   :.: :. 
CCDS14 FRCIAIVFPVQNINLVTQKKARFVCVGIWIFVILTSSPFLMAKPQKDEKNNTKCFEPPQD
     120       130       140       150       160       170         

       190        200       210       220       230       240      
pF1KB8 EETKSLPWIL-LGACFIGYVLPLIIILICYSQICCKLFRTAKQNPLTEKSGVNKKALNTI
       ..::.   .:   . :.:...:..::..::..:   :.. . .. :.     .:::.. :
CCDS14 NQTKNHVLVLHYVSLFVGFIIPFVIIIVCYTMIILTLLKKSMKKNLSS----HKKAIGMI
     180       190       200       210       220           230     

        250       260       270       280       290       300      
pF1KB8 ILIIVVFVLCFTPYHVAIIQHMIKKLRFSNFLECSQRHSFQISLHFTVCLMNFNCCMDPF
       ... ..:.. : :::.    :.  ..  ..   :..   .: :. .:. :   :::.::.
CCDS14 MVVTAAFLVSFMPYHIQRTIHL--HFLHNETKPCDSVLRMQKSVVITLSLAASNCCFDPL
         240       250         260       270       280       290   

        310       320        330       340       350       360 
pF1KB8 IYFFACKGYKRKVMRMLKRQVS-VSISSAVKSAPEENSREMTETQMMIHSKSSNGK
       .:::.  ......  . :...: :.     :..  :...:.               
CCDS14 LYFFSGGNFRKRLSTFRKHSLSSVTYVPRKKASLPEKGEEICKV            
           300       310       320       330                   

>>CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13              (344 aa)
 initn: 539 init1: 300 opt: 595  Z-score: 613.2  bits: 122.0 E(32554): 7.8e-28
Smith-Waterman score: 595; 31.3% identity (66.3% similar) in 297 aa overlap (19-310:5-293)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MDIQMANNFTPPSATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLHYSLVFIIGLVGNLLALVVIVQNR
                         :.   . . :    ..   .:.::..::..: .:. ...   
CCDS94               MVSVNSSHCFYNDSFKYTLYGCMFSMVFVLGLISNCVAIYIFICVL
                             10        20        30        40      

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 KKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIAYYAMGFDWRIGDALCRITALVFYINTYAGVN
       :  : :: :  ::..::.::. .:: :: :..   .: .:: ::.:....:: : :... 
CCDS94 KVRNETTTYMINLAMSDLLFVFTLPFRIFYFTTR-NWPFGDLLCKISVMLFYTNMYGSIL
         50        60        70        80         90       100     

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 FMTCLSIDRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCIFVWILVFAQTLPLLINPMSKQEAERIT
       :.::.:.:::.:.:.:.. . ..  ..:: ::  ::. :.. . : ..   ......  .
CCDS94 FLTCISVDRFLAIVYPFKSKTLRTKRNAKIVCTGVWLTVIGGSAPAVFVQSTHSQGNNAS
         110       120       130       140       150       160     

              190          200       210       220       230       
pF1KB8 CMEYPNFEET--KS-LPWILLGACFIGYVLPLIIILICYSQICCKLFRTAKQNPLT-EKS
          . :: :.  :. :  :..   ..:. .:::. . : :..   : .     :.:  .:
CCDS94 EACFENFPEATWKTYLSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSSMVLKTLTK-----PVTLSRS
         170       180       190       200       210            220

        240        250       260       270       280       290     
pF1KB8 GVNK-KALNTIILIIVVFVLCFTPYHVAIIQHMIKKLRFSNFLECSQRHSFQISLHFTVC
        .:: :.:. :.. ...: .::.::.. .: . .  .: ..:..::   . .    .:.:
CCDS94 KINKTKVLKMIFVHLIIFCFCFVPYNINLILYSL--VRTQTFVNCSVVAAVRTMYPITLC
              230       240       250         260       270        

         300       310       320       330       340       350     
pF1KB8 LMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMRMLKRQVSVSISSAVKSAPEENSREMTETQMMIHS
       .   :::.::..:.:                                             
CCDS94 IAVSNCCFDPIVYYFTSDTIQNSIKMKNWSVRRSDFRFSEVHGAENFIQHNLQTLKSKIF
      280       290       300       310       320       330        

>>CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX               (370 aa)
 initn: 541 init1: 224 opt: 578  Z-score: 595.7  bits: 118.8 E(32554): 7.3e-27
Smith-Waterman score: 578; 30.6% identity (64.8% similar) in 330 aa overlap (38-355:46-368)

        10        20        30        40        50        60       
pF1KB8 NFTPPSATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLHYSLVFIIGLVGNLLALVVIVQNRKKINSTT
                                     ::.:::.::. : ..: :.    :  . :.
CCDS14 SSLRPRLGNATANNTCIVDDSFKYNLNGAVYSVVFILGLITNSVSLFVFCFRMKMRSETA
          20        30        40        50        60        70     

        70        80        90       100       110       120       
pF1KB8 LYSTNLVISDILFTTALPTRIAYYAMGFDWRIGDALCRITALVFYINTYAGVNFMTCLSI
       .. :::..::.::. .:: .: .: ..  : .::.::.:.. .:  : :... :.::.:.
CCDS14 IFITNLAVSDLLFVCTLPFKI-FYNFNRHWPFGDTLCKISGTAFLTNIYGSMLFLTCISV
          80        90        100       110       120       130    

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB8 DRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCIFVWILVFAQTLPLLINPMSKQEAERITCMEYPNF
       :::.:.:.:.:   :.  ...  ::  :::::..  .   .   .. .    ::.:  . 
CCDS14 DRFLAIVYPFRSRTIRTRRNSAIVCAGVWILVLSGGISASLFSTTNVNNATTTCFEGFSK
          140       150       160       170       180       190    

       190        200       210       220       230       240      
pF1KB8 EETKS-LPWILLGACFIGYVLPLIIILICYSQICCKLFRTAKQNPLTEKSGVNKKALNTI
       .  :. :  : .    .:...:::. . : : .    .:: ..     . :.::: .  .
CCDS14 RVWKTYLSKITIFIEVVGFIIPLILNVSCSSVV----LRTLRKPATLSQIGTNKKKVLKM
          200       210       220           230       240       250

         250       260       270       280       290       300     
pF1KB8 ILI-IVVFVLCFTPYHVAIIQHMIKKLRFSNFLECSQRHSFQISLHFTVCLMNFNCCMDP
       : . ..:::.::.::. ... . .  .: . . .:  ..  .:   .:.:: ..:::.::
CCDS14 ITVHMAVFVVCFVPYNSVLFLYAL--VRSQAITNCFLERFAKIMYPITLCLATLNCCFDP
              260       270         280       290       300        

         310            320          330       340         350     
pF1KB8 FIYFFACKGYKRKV-----MRM---LKRQVSVSISSAVKSAPEENSREMTET--QMMIHS
       :::.:. ......      .::   .: .. .. . .. .  :: : . :..  ..:..:
CCDS14 FIYYFTLESFQKSFYINAHIRMESLFKTETPLTTKPSLPAIQEEVSDQTTNNGGELMLES
      310       320       330       340       350       360        

         360 
pF1KB8 KSSNGK
             
CCDS14 TF    
      370    

>>CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3                (373 aa)
 initn: 458 init1: 303 opt: 536  Z-score: 553.4  bits: 111.0 E(32554): 1.7e-24
Smith-Waterman score: 536; 29.0% identity (63.7% similar) in 314 aa overlap (34-341:54-356)

            10        20        30        40        50        60   
pF1KB8 QMANNFTPPSATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLHYSLVFIIGLVGNLLALVVIVQNRKKI
                                     .:  : ::::::..:: .:. ..: . :  
CCDS31 SWGNSTVASTAAVSSSFKCALTKTGFQFYYLPAVYILVFIIGFLGNSVAIWMFVFHMKPW
            30        40        50        60        70        80   

            70        80        90       100       110       120   
pF1KB8 NSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIAYYAMGFDWRIGDALCRITALVFYINTYAGVNFMT
       .. ..:  ::...:.:.. .::. : ::    :: .:::.:..  ..:..: :... :.:
CCDS31 SGISVYMFNLALADFLYVLTLPALIFYYFNKTDWIFGDAMCKLQRFIFHVNLYGSILFLT
            90       100       110       120       130       140   

           130       140       150         160        170       180
pF1KB8 CLSIDRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCI--FVWILVFAQTLPLLI-NPMSKQEAERIT
       :.:  :. .::.::.  .. :... ...::  .::..: .   :.:. .  . .. . ::
CCDS31 CISAHRYSGVVYPLK--SLGRLKKKNAICISVLVWLIVVVAISPILFYSGTGVRKNKTIT
           150         160       170       180       190       200 

              190       200         210       220        230       
pF1KB8 CMEYPNFEETKSLPWILLGAC--FIGYVLPLIIILICYSQICCKL-FRTAKQNPLTEKSG
       :..  . :  .:  ... . :     . .::..:: ::. :   : ..   ..:: .:: 
CCDS31 CYDTTSDEYLRS--YFIYSMCTTVAMFCVPLVLILGCYGLIVRALIYKDLDNSPLRRKS-
             210         220       230       240       250         

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB8 VNKKALNTIILIIVVFVLCFTPYHVAIIQHMIKKLRFSNFLECSQRHSFQISLHFTVCLM
            .  .:....::.. . :.::   ...  .: :..   :.       . . :  : 
CCDS31 -----IYLVIIVLTVFAVSYIPFHVMKTMNLRARLDFQTPAMCAFNDRVYATYQVTRGLA
           260       270       280       290       300       310   

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB8 NFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMRMLKRQVSVSISSAVKSAPEENSREMTETQMMIHSKS
       ..: :.::..::.:   ..:.. :   :..:    . ..:  :.                
CCDS31 SLNSCVDPILYFLAGDTFRRRLSRAT-RKASRRSEANLQSKSEDMTLNILPEFKQNGDTS
           320       330        340       350       360       370  

       360 
pF1KB8 SNGK
           
CCDS31 L   
           

>>CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13            (346 aa)
 initn: 504 init1: 374 opt: 530  Z-score: 547.8  bits: 109.9 E(32554): 3.4e-24
Smith-Waterman score: 589; 32.1% identity (65.1% similar) in 315 aa overlap (12-325:19-322)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB8        MDIQMANNFTPPSATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLHYSLVFIIGLVGNLLAL
                         :..: ..:.    . ..  :  .:. : ..:. :..:: :..
CCDS94 MERKFMSLQPSISVSEMEPNGTFSNNNSRNCTIENFKREFFPIVYLIIFFWGVLGNGLSI
               10        20        30        40        50        60

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB8 VVIVQNRKKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIAYYAMGFDWRIGDALCRITALVFYI
        :..:  :: .:....  ::.:::.:: ..:: :  ::  : .: .::  ::: .  .:.
CCDS94 YVFLQPYKKSTSVNVFMLNLAISDLLFISTLPFRADYYLRGSNWIFGDLACRIMSYSLYV
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB8 NTYAGVNFMTCLSIDRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCIFVWILVFAQTLPLLINPMSK
       : :... :.: ::. ::.:.:::.:  ..  :. :  .: ..:::..:... .:..  :.
CCDS94 NMYSSIYFLTVLSVVRFLAMVHPFRLLHVTSIRSAWILCGIIWILIMASSI-MLLDSGSE
              130       140       150       160       170          

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB8 QEAERITCMEYPNFEETKSLPWILLGACFIGYVLPLIIILICYSQICCKLFRTAKQNPLT
       :..   .:.:  :. .  .:  .   :  .: .::.. . :::  :   :...  . : .
CCDS94 QNGSVTSCLEL-NLYKIAKLQTMNYIALVVGCLLPFFTLSICYLLIIRVLLKV--EVPES
     180       190        200       210       220       230        

           240       250       260       270        280       290  
pF1KB8 EKSGVNKKALNTIILIIVVFVLCFTPYHVAIIQHMIK-KLRFSNFLECSQRHSFQISLHF
            ..:::.:::. ...: ::: :::.    :.   :. .     :..:  .. .: .
CCDS94 GLRVSHRKALTTIIITLIIFFLCFLPYHTLRTVHLTTWKVGL-----CKDR--LHKALVI
        240       250       260       270            280           

            300       310       320       330       340       350  
pF1KB8 TVCLMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMRMLKRQVSVSISSAVKSAPEENSREMTETQMM
       :. :   : :..:..:.:: ...: ..   :..                           
CCDS94 TLALAAANACFNPLLYYFAGENFKDRLKSALRKGHPQKAKTKCVFPVSVWLRKETRV   
     290       300       310       320       330       340         

            360 
pF1KB8 IHSKSSNGK

>>CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5                  (425 aa)
 initn: 488 init1: 356 opt: 531  Z-score: 547.7  bits: 110.1 E(32554): 3.5e-24
Smith-Waterman score: 531; 30.2% identity (61.9% similar) in 341 aa overlap (20-355:91-418)

                          10        20        30        40         
pF1KB8            MDIQMANNFTPPSATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLHYSLVFIIGLVGN
                                     : . :   :   . .:  :. ::...:  :
CCDS40 KNESGLTEYRLVSINKSSPLQKQLPAFISEDASGYLTSSWLTLFVPSVYTGVFVVSLPLN
               70        80        90       100       110       120

      50        60        70        80        90       100         
pF1KB8 LLALVVIVQNRKKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIAYYAMGFDWRIGDALCRITAL
       ..:.::.. . :  . ...:  .:. .:.::...:: .:.::  : ::..:. :::... 
CCDS40 IMAIVVFILKMKVKKPAVVYMLHLATADVLFVSVLPFKISYYFSGSDWQFGSELCRFVTA
              130       140       150       160       170       180

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB8 VFYINTYAGVNFMTCLSIDRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCIFVWILVFAQTLPLLIN
       .:: : ::.. .:: .:::::.:::.:..  . . . .:. .:. .: :..: ..:::..
CCDS40 AFYCNMYASILLMTVISIDRFLAVVYPMQSLSWRTLGRASFTCLAIWALAIAGVVPLLLK
              190       200       210       220       230       240

     170         180          190       200       210       220    
pF1KB8 PMSKQEA--ERITCMEYPN---FEETKSLPWILLGACFIGYVLPLIIILICYSQICCKLF
        .. :    .  :: .  :   .:   .  .  ..: :  . .::::  .:: .:   : 
CCDS40 EQTIQVPGLNITTCHDVLNETLLEGYYAYYFSAFSAVF--FFVPLIISTVCYVSIIRCLS
              250       260       270         280       290        

          230       240       250       260       270       280    
pF1KB8 RTAKQNPLTEKSGVNKKALNTIILIIVVFVLCFTPYHVAIIQHMIKKLRFSNFLECSQRH
        .:  :  ..::    .::     .. .:..:: : .: .: :      .: . . :  .
CCDS40 SSAVANR-SKKS----RALFLSAAVFCIFIICFGPTNVLLIAH------YSFLSHTSTTE
      300            310       320       330             340       

          290       300       310       320       330       340    
pF1KB8 SFQISLHFTVCLMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMRMLKRQVSVSISSAVKSAPEENSR
       .  ..  . ::. ...::.::.::..: .  .: :. .:  . : . ::  .:.    :.
CCDS40 AAYFAYLLCVCVSSISCCIDPLIYYYASSECQRYVYSILCCKESSDPSSYNSSGQLMASK
       350       360       370       380       390       400       

          350       360  
pF1KB8 EMTETQMMIHSKSSNGK 
         : .. . .:       
CCDS40 MDTCSSNLNNSIYKKLLT
       410       420     

>>CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX             (333 aa)
 initn: 361 init1: 139 opt: 525  Z-score: 543.0  bits: 108.9 E(32554): 6.4e-24
Smith-Waterman score: 525; 28.5% identity (62.9% similar) in 340 aa overlap (5-337:1-322)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MDIQMANNFTPPSATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLHYSLVFIIGLVGNLLALVVIVQNR
           :  :.:   . :.:.. :.        ... . :..... ::.::.::: :.    
CCDS14     MPANYT--CTRPDGDNTDFR------YFIYAVTYTVILVPGLIGNILALWVFYGYM
                     10              20        30        40        

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 KKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIAYYAMGFDWRIGDALCRITALVFYINTYAGVN
       :. . ....  ::.:.:.: . .:: :: :: .. :: .: .:: .   . :.: ::.. 
CCDS14 KETKRAVIFMINLAIADLLQVLSLPLRIFYY-LNHDWPFGPGLCMFCFYLKYVNMYASIY
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CCDS14 FLVCISVRRFWFLMYPFRFHDCKQ-KYDLYISIAGWLIICLACVLFPLLRTSDDTSGNRT
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        : .. :  : . ..:.  . .:  .::.: ::.:.: :  .   .:     . :...  
CCDS14 KCFVDLPTRNVNLAQSVVMMTIGE-LIGFVTPLLIVLYCTWKTVLSL---QDKYPMAQDL
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pF1KB8 GVNKKALNTIILIIVVFVLCFTPYHVAI-IQHMIKKLRFSNFLE-CSQRHSFQISLHFTV
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CCDS14 GEKQKALKMILTCAGVFLICFAPYHFSFPLDFLVK----SNEIKSCLARRVILIFHSVAL
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       :: ..: :.:: ::.:. . ..:.. :. :. ....  .: :..                
CCDS14 CLASLNSCLDPVIYYFSTNEFRRRLSRQDLHDSIQLHAKSFVSNHTASTMTPELC     
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>>CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3                 (359 aa)
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CCDS31    MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYM
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CCDS31 KLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVF
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pF1KB8 FMTCLSIDRFIAVVHPLRYNKIKR-IEHAKGVCIFVWILVFAQTLPLLIN-PMSKQEAER
       ..:::::::..:.:::.. ....: .  :: .::..:.:.   .:: .:.  .   :   
CCDS31 LLTCLSIDRYLAIVHPMK-SRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTN
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       ::   .    ....::  : :   ..:...:..:::  :. :   :    :   . ... 
CCDS31 ITVCAFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKAL---KKAYEIQKNKP
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CCDS31 RNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQL--GIIRDCRIADIVDTAMPITICIA
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CCDS31 YFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKK
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>>CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX               (381 aa)
 initn: 416 init1: 341 opt: 524  Z-score: 541.2  bits: 108.8 E(32554): 7.9e-24
Smith-Waterman score: 524; 25.6% identity (61.4% similar) in 352 aa overlap (11-359:33-378)

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CCDS14 SHTITMTTTSVSSWPYSSHRMRFITNHSDQPPQNFSATPNVTTCPM--DEKLLSTVLTTS
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CCDS14 YSVIFIVGLVGNIIALYVFLGIHRKRNSIQIYLLNVAIADLLLIFCLPFRIMYHINQNKW
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CCDS14 LALGGFLTMIILTLKKGGHNSTMCFHYRDKHNAKGEA-IFNFILVVMFWLIFLLIILSYI
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361 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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