FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8788, 300 aa 1>>>pF1KB8788 300 - 300 aa - 300 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3459+/-0.000951; mu= 7.1504+/- 0.057 mean_var=139.2590+/-27.390, 0's: 0 Z-trim(109.2): 15 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.108683 statistics sampled from 10706 (10717) to 10706 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.679), E-opt: 0.2 (0.329), width: 16 Scan time: 2.510 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5903.1 GIMAP7 gene_id:168537|Hs108|chr7 ( 300) 1936 314.8 5.2e-86 CCDS5904.1 GIMAP4 gene_id:55303|Hs108|chr7 ( 329) 660 114.7 9.4e-26 CCDS5907.1 GIMAP5 gene_id:55340|Hs108|chr7 ( 307) 630 110.0 2.3e-24 CCDS75677.1 GIMAP5 gene_id:100527949|Hs108|chr7 ( 511) 630 110.1 3.5e-24 CCDS5906.1 GIMAP1 gene_id:170575|Hs108|chr7 ( 306) 615 107.6 1.2e-23 CCDS5905.1 GIMAP2 gene_id:26157|Hs108|chr7 ( 337) 594 104.4 1.3e-22 CCDS34778.1 GIMAP6 gene_id:474344|Hs108|chr7 ( 292) 584 102.8 3.3e-22 CCDS75676.1 GIMAP6 gene_id:474344|Hs108|chr7 ( 362) 584 102.8 3.9e-22 CCDS34777.1 GIMAP8 gene_id:155038|Hs108|chr7 ( 665) 470 85.1 1.5e-16 >>CCDS5903.1 GIMAP7 gene_id:168537|Hs108|chr7 (300 aa) initn: 1936 init1: 1936 opt: 1936 Z-score: 1657.7 bits: 314.8 E(32554): 5.2e-86 Smith-Waterman score: 1936; 100.0% identity (100.0% similar) in 300 aa overlap (1-300:1-300) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MAESEDRSLRIVLVGKTGSGKSATANTILGEEIFDSRIAAQAVTKNCQKASREWQGRDLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS59 MAESEDRSLRIVLVGKTGSGKSATANTILGEEIFDSRIAAQAVTKNCQKASREWQGRDLL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 VVDTPGLFDTKESLDTTCKEISRCIISSCPGPHAIVLVLLLGRYTEEEQKTVALIKAVFG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS59 VVDTPGLFDTKESLDTTCKEISRCIISSCPGPHAIVLVLLLGRYTEEEQKTVALIKAVFG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 KSAMKHMVILFTRKEELEGQSFHDFIADADVGLKSIVKECGNRCCAFSNSKKTSKAEKES :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS59 KSAMKHMVILFTRKEELEGQSFHDFIADADVGLKSIVKECGNRCCAFSNSKKTSKAEKES 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB8 QVQELVELIEKMVQCNEGAYFSDDIYKDTEERLKQREEVLRKIYTDQLNEEIKLVEEDKH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS59 QVQELVELIEKMVQCNEGAYFSDDIYKDTEERLKQREEVLRKIYTDQLNEEIKLVEEDKH 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB8 KSEEEKEKEIKLLKLKYDEKIKNIREEAERNIFKDVFNRIWKMLSEIWHRFLSKCKFYSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS59 KSEEEKEKEIKLLKLKYDEKIKNIREEAERNIFKDVFNRIWKMLSEIWHRFLSKCKFYSS 250 260 270 280 290 300 >>CCDS5904.1 GIMAP4 gene_id:55303|Hs108|chr7 (329 aa) initn: 580 init1: 540 opt: 660 Z-score: 575.8 bits: 114.7 E(32554): 9.4e-26 Smith-Waterman score: 660; 38.8% identity (72.1% similar) in 276 aa overlap (3-270:25-298) 10 20 30 pF1KB8 MAESEDRSLRIVLVGKTGSGKSATANTILGEEIFDSRI : .. .::::::::::.:::::.:.:::...: : CCDS59 MAAQYGSMSFNPSTPGASYGPGRQEPRNSQLRIVLVGKTGAGKSATGNSILGRKVFHSGT 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KB8 AAQAVTKNCQKASREWQGRDLLVVDTPGLFDTKESLDTTCKEISRCIISSCPGPHAIVLV ::...::.:.: : :. .:.::::::.:::. : ::: :::. . :::::..:: CCDS59 AAKSITKKCEKRSSSWKETELVVVDTPGIFDTEVPNAETSKEIIRCILLTSPGPHALLLV 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KB8 LLLGRYTEEEQKTVALIKAVFGKSAMKHMVILFTRKEELEGQSFHDFIADADVGLKSIVK . ::::::::.:.. : .::. : . :...::::..: ..::.. .: ..... 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CCDS59 IFGDRYCALNN--KATGAEQEAQRAQLLGLIQRVVRENKEGCYTNRMYQRAEEEIQKQTQ 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KB8 VLRKIYTDQLNEEIKLVEED--------KHKSEEEKEKEIKLLKLKYDEKIKNIREEAER ...... .:..: ..:. . : :.::.:. :: .: .:.. : CCDS59 AMQELHRVELEREKARIREEYEEKIRKLEDKVEQEKRKKQMEKKLAEQEAHYAVRQQRAR 240 250 260 270 280 290 280 290 300 pF1KB8 NIFKDVFNRIWKMLSEIWHRFLSKCKFYSS CCDS59 TEVESKDGILELIMTALQIASFILLRLFAED 300 310 320 >>CCDS5907.1 GIMAP5 gene_id:55340|Hs108|chr7 (307 aa) initn: 656 init1: 501 opt: 630 Z-score: 550.8 bits: 110.0 E(32554): 2.3e-24 Smith-Waterman score: 630; 41.2% identity (73.7% similar) in 243 aa overlap (8-249:27-264) 10 20 30 40 pF1KB8 MAESEDRSLRIVLVGKTGSGKSATANTILGEEIFDSRIAAQ .:::.:::::: :::::.:.:::. .:.:.. :: CCDS59 MGGFQRGKYGTMAEGRSEDNLSATPPALRIILVGKTGCGKSATGNSILGQPVFESKLRAQ 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB8 AVTKNCQKASREWQGRDLLVVDTPGLFDTKESLDTTCKEISRCIISSCPGPHAIVLVLLL .::..:: . :.:: .::::::..:... . . :.:. : . : ::::...::. : CCDS59 SVTRTCQVKTGTWNGRKVLVVDTPSIFESQADTQELYKNIGDCYLLSAPGPHVLLLVIQL 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB8 GRYTEEEQKTVALIKAVFGKSAMKHMVILFTRKEELEGQSFHDFIADAD-VGLKSIVKEC ::.: .. .. .: ::: .::.:.:::::.::.: ::.. :..:..: .::..:.:: CCDS59 GRFTAQDTVAIRKVKEVFGTGAMRHVVILFTHKEDLGGQALDDYVANTDNCSLKDLVREC 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KB8 GNRCCAFSNSKKTSKAEKESQVQELVELIEKMVQCNEGAYFSDDIYKDTEERLKQREEVL : :::.: : :...: ::. .::.. . ::.. :.:.. :.. . . CCDS59 ERRYCAFNN--WGSVEEQRQQQAELLAVIERLGREREGSFHSNDLFLDAQLLQRTGAGAC 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB8 RKIYTDQLNEEIKLVEEDKHKSEEEKEKEIKLLKLKYDEKIKNIREEAERNIFKDVFNRI .. : : . ... . .::: .: .:.: CCDS59 QEDYR-QYQAKVEW-QVEKHK-QELRENESNWAYKALLRVKHLMLLHYEIFVFLLLCSIL 240 250 260 270 280 290 >>CCDS75677.1 GIMAP5 gene_id:100527949|Hs108|chr7 (511 aa) initn: 898 init1: 501 opt: 630 Z-score: 547.6 bits: 110.1 E(32554): 3.5e-24 Smith-Waterman score: 630; 41.2% identity (73.7% similar) in 243 aa overlap (8-249:231-468) 10 20 30 pF1KB8 MAESEDRSLRIVLVGKTGSGKSATANTILGEEIFDSR .:::.:::::: :::::.:.:::. .:.:. CCDS75 FLERMGGFQRGKYGTMAEGRSEDNLSATPPALRIILVGKTGCGKSATGNSILGQPVFESK 210 220 230 240 250 260 40 50 60 70 80 90 pF1KB8 IAAQAVTKNCQKASREWQGRDLLVVDTPGLFDTKESLDTTCKEISRCIISSCPGPHAIVL . ::.::..:: . :.:: .::::::..:... . . :.:. : . : ::::...: CCDS75 LRAQSVTRTCQVKTGTWNGRKVLVVDTPSIFESQADTQELYKNIGDCYLLSAPGPHVLLL 270 280 290 300 310 320 100 110 120 130 140 150 pF1KB8 VLLLGRYTEEEQKTVALIKAVFGKSAMKHMVILFTRKEELEGQSFHDFIADAD-VGLKSI :. :::.: .. .. .: ::: .::.:.:::::.::.: ::.. :..:..: .::.. CCDS75 VIQLGRFTAQDTVAIRKVKEVFGTGAMRHVVILFTHKEDLGGQALDDYVANTDNCSLKDL 330 340 350 360 370 380 160 170 180 190 200 210 pF1KB8 VKECGNRCCAFSNSKKTSKAEKESQVQELVELIEKMVQCNEGAYFSDDIYKDTEERLKQR :.:: : :::.: : :...: ::. .::.. . ::.. :.:.. :.. . CCDS75 VRECERRYCAFNN--WGSVEEQRQQQAELLAVIERLGREREGSFHSNDLFLDAQLLQRTG 390 400 410 420 430 220 230 240 250 260 270 pF1KB8 EEVLRKIYTDQLNEEIKLVEEDKHKSEEEKEKEIKLLKLKYDEKIKNIREEAERNIFKDV . .. : : . ... . .::: .: .:.: CCDS75 AGACQEDYR-QYQAKVEW-QVEKHK-QELRENESNWAYKALLRVKHLMLLHYEIFVFLLL 440 450 460 470 480 490 280 290 300 pF1KB8 FNRIWKMLSEIWHRFLSKCKFYSS CCDS75 CSILFFIIFLFIFHYI 500 510 >>CCDS5906.1 GIMAP1 gene_id:170575|Hs108|chr7 (306 aa) initn: 512 init1: 259 opt: 615 Z-score: 538.1 bits: 107.6 E(32554): 1.2e-23 Smith-Waterman score: 615; 42.0% identity (77.0% similar) in 226 aa overlap (2-223:20-243) 10 20 30 40 pF1KB8 MAESEDRSLR-IVLVGKTGSGKSATANTILGEEIFDSRIAAQ :.:...: : ..:::.::.:::::.:.:::.. : ::..: CCDS59 MGGRKMATDEENVYGLEENAQSRQESTRRLILVGRTGAGKSATGNSILGQRRFFSRLGAT 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB8 AVTKNCQKASREWQGRDLLVVDTPGLFDTKES-LDTTCKEISRCIISSCPGPHAIVLVLL .::. : .::.:. . ::::: .:... : : :.: ..: . : :::::..:: CCDS59 SVTRACTTGSRRWDKCHVEVVDTPDIFSSQVSKTDPGCEERGHCYLLSAPGPHALLLVTQ 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 pF1KB8 LGRYTEEEQKTVALIKAVFGKSAMKHMVILFTRKEELEGQSFHDFIADADV-GLKSIVKE :::.: ..:..: .. .::....: :::.:::::.: : :.::...... .:. .: : CCDS59 LGRFTAQDQQAVRQVRDMFGEDVLKWMVIVFTRKEDLAGGSLHDYVSNTENRALRELVAE 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KB8 CGNRCCAFSNSKKTSKAEKESQVQELVELIEKMVQCNEGAYFSDDIYKDTEE-RLKQREE ::.: :::.: ... :.:.::..:. ..: .: ..::..:...:. .. : :: CCDS59 CGGRVCAFDN--RATGREQEAQVEQLLGMVEGLVLEHKGAHYSNEVYELAQVLRWAGPEE 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KB8 VLRKIYTDQLNEEIKLVEEDKHKSEEEKEKEIKLLKLKYDEKIKNIREEAERNIFKDVFN ::.. CCDS59 RLRRVAERVAARVQRRPWGAWLSARLWKWLKSPRSWRLGLALLLGGALLFWVLLHRRWSE 240 250 260 270 280 290 >>CCDS5905.1 GIMAP2 gene_id:26157|Hs108|chr7 (337 aa) initn: 639 init1: 485 opt: 594 Z-score: 519.7 bits: 104.4 E(32554): 1.3e-22 Smith-Waterman score: 598; 38.3% identity (75.2% similar) in 230 aa overlap (9-227:23-250) 10 20 30 40 pF1KB8 MAESEDRSLRIVLVGKTGSGKSATANTILGEEIFDSRIAAQAVTKN :::.::::::.::::..:.:: .. :.:....:..::. CCDS59 MDQNEHSHWGPHAKGQCASRSELRIILVGKTGTGKSAAGNSILRKQAFESKLGSQTLTKT 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB8 CQKASREWQGRDLLVVDTPGLFDTKESLDTTCKEISRCIISSCPGPHAIVLVLLLGRYTE :.:.. : .:.....::: .:. :. .. ::..:: . : ::::...:: ::::: CCDS59 CSKSQGSWGNREIVIIDTPDMFSWKDHCEALYKEVQRCYLLSAPGPHVLLLVTQLGRYTS 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB8 EEQKTVALIKAVFGKSAMKHMVILFTRKEELEGQSFHDFIADADV-GLKSIVKECGNRCC ..:... .: .::..:: : ..:::.::.:.: :. :.. :.: .:...: ::.: : CCDS59 QDQQAAQRVKEIFGEDAMGHTIVLFTHKEDLNGGSLMDYMHDSDNKALSKLVAACGGRIC 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 pF1KB8 AFSNSKKTSKAEKESQVQELVELIEKMVQCNEGAYFSDDIYK----------DTEERLKQ ::.: . :. ...::.::.. :: ... ..: .... .:. ..::.:. CCDS59 AFNNRAEGSN--QDDQVKELMDCIEDLLMEKNGDHYTNGLYSLIQRSKCGPVGSDERVKE 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KB8 REEVLRKIYTDQLNEEIKLVEEDKHKSEEEKEKEIKLLKLKYDEKIKNIREEAERNIFKD .. : : . : CCDS59 FKQSLIKYMETQRSYTALAEANCLKGALIKTQLCVLFCIQLFLRLIILWLCILHSMCNLF 240 250 260 270 280 290 >>CCDS34778.1 GIMAP6 gene_id:474344|Hs108|chr7 (292 aa) initn: 533 init1: 253 opt: 584 Z-score: 512.1 bits: 102.8 E(32554): 3.3e-22 Smith-Waterman score: 584; 37.1% identity (71.1% similar) in 256 aa overlap (7-258:39-291) 10 20 30 pF1KB8 MAESEDRSLRIVLVGKTGSGKSATANTILGEEIFDS : ::..:.::::::::::.:.:::...:.: CCDS34 IPQENPPEELSQDPVLELSGGLREKEQKTPRRLRLILMGKTGSGKSATGNSILGRDVFES 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KB8 RIAAQAVTKNCQKASREWQGRDLLVVDTPGLFDTKESLDTTCKEISRCIISSCPGPHAIV ..... :::. :. :::: :..: :.:::.... . : ... : . :. : :::::.. CCDS34 KLSTRPVTKTSQRRSREWAGKELEVIDTPNILSPQVSPEVA-DAICQAIVLSAPGPHAVL 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KB8 LVLLLGRYTEEEQKTVALIKAVFGKSAMKHMVILFTRKEELEGQSFHDFIADADV-GLKS :: :::.:.:.:..: .. ::: ... : ...:::::.: : :..:.. ... .: CCDS34 LVTQLGRFTDEDQQVVRRLQEVFGVGVLGHTILVFTRKEDLAGGSLEDYVRETNNQALAW 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KB8 IVKECGNRCCAFSNSKKTSKAEKESQVQELVELIEKMVQCNEGAYFSDDIYKDTEERLKQ . . : :.:.: ... :.:.:..::.: .: .. ::: :.:. :. :.. .. CCDS34 LDVTLARRHCGFNN--RAQGEEQEAQLRELMEKVEAIMWENEGDYYSNKAYQYTQQNFRL 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KB8 REEVLRKIYTDQLNEEIKLVE---EDKHKSEEEKEKEIKLLKLKYDEKIKNIREEAERNI .: :.. : .:.. : : . ..:.:. . : : : CCDS34 KELQERQVSQGQGSEDVPGEESWLEGLSQIQKESEEAHRCLLGKADL 250 260 270 280 290 280 290 300 pF1KB8 FKDVFNRIWKMLSEIWHRFLSKCKFYSS >>CCDS75676.1 GIMAP6 gene_id:474344|Hs108|chr7 (362 aa) initn: 533 init1: 253 opt: 584 Z-score: 510.8 bits: 102.8 E(32554): 3.9e-22 Smith-Waterman score: 584; 37.1% identity (71.1% similar) in 256 aa overlap (7-258:109-361) 10 20 30 pF1KB8 MAESEDRSLRIVLVGKTGSGKSATANTILGEEIFDS : ::..:.::::::::::.:.:::...:.: CCDS75 DKMGYMGPYPSSLCFLWIFLGLREKEQKTPRRLRLILMGKTGSGKSATGNSILGRDVFES 80 90 100 110 120 130 40 50 60 70 80 90 pF1KB8 RIAAQAVTKNCQKASREWQGRDLLVVDTPGLFDTKESLDTTCKEISRCIISSCPGPHAIV ..... :::. :. :::: :..: :.:::.... . : ... : . :. : :::::.. CCDS75 KLSTRPVTKTSQRRSREWAGKELEVIDTPNILSPQVSPEVA-DAICQAIVLSAPGPHAVL 140 150 160 170 180 190 100 110 120 130 140 150 pF1KB8 LVLLLGRYTEEEQKTVALIKAVFGKSAMKHMVILFTRKEELEGQSFHDFIADADV-GLKS :: :::.:.:.:..: .. ::: ... : ...:::::.: : :..:.. ... .: CCDS75 LVTQLGRFTDEDQQVVRRLQEVFGVGVLGHTILVFTRKEDLAGGSLEDYVRETNNQALAW 200 210 220 230 240 250 160 170 180 190 200 210 pF1KB8 IVKECGNRCCAFSNSKKTSKAEKESQVQELVELIEKMVQCNEGAYFSDDIYKDTEERLKQ . . : :.:.: ... :.:.:..::.: .: .. ::: :.:. :. :.. .. CCDS75 LDVTLARRHCGFNN--RAQGEEQEAQLRELMEKVEAIMWENEGDYYSNKAYQYTQQNFRL 260 270 280 290 300 310 220 230 240 250 260 270 pF1KB8 REEVLRKIYTDQLNEEIKLVE---EDKHKSEEEKEKEIKLLKLKYDEKIKNIREEAERNI .: :.. : .:.. : : . ..:.:. . : : : CCDS75 KELQERQVSQGQGSEDVPGEESWLEGLSQIQKESEEAHRCLLGKADL 320 330 340 350 360 280 290 300 pF1KB8 FKDVFNRIWKMLSEIWHRFLSKCKFYSS >>CCDS34777.1 GIMAP8 gene_id:155038|Hs108|chr7 (665 aa) initn: 605 init1: 373 opt: 470 Z-score: 410.4 bits: 85.1 E(32554): 1.5e-16 Smith-Waterman score: 504; 38.7% identity (73.5% similar) in 230 aa overlap (5-223:435-660) 10 20 30 pF1KB8 MAESEDRSLRIVLVGKTGSGKSATANTILGEEIF : ..: :::::..:.:::::.:.::: .: CCDS34 GEEEQRQADELLEKIESMVHQNGNKHCVFREKETLNIVLVGRSGTGKSATGNSILGSLVF 410 420 430 440 450 460 40 50 60 70 80 90 pF1KB8 DSRIAAQAVTKNCQKASREWQGRDLLVVDTPG---LFDTKESLDTTCKEISRCIISSCP- ::. :: :::. :.. : :.:....:::::. ..:.... . .:..::. : : CCDS34 TSRLRAQPVTKTSQSGRRTWDGQEVVVVDTPSFNQMLDVEKDPSRLEEEVKRCL-SCCEK 470 480 490 500 510 520 100 110 120 130 140 150 pF1KB8 GPHAIVLVLLLGRYTEEEQKTVALIKAVFGKSAMKHMVILFTRKEELEGQSFHDFIADAD : .:::. :::.:::.. .:: ..:.:: . :. ..::::::.: . ...::. ..: CCDS34 GDTFFVLVFQLGRFTEEDKTAVAKLEAIFGADFTKYAIMLFTRKEDLGAGNLEDFMKNSD 530 540 550 560 570 580 160 170 180 190 200 pF1KB8 V-GLKSIVKECGNRCCAFSNSKKTSKAEKESQVQELVELIEKMVQCN--EGAYFSDD--- .:. : :.:: : ::: :.:.:..:. :.::. :. .. . . . : ... 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