Result of FASTA (ccds) for pF1KB8768
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8768, 229 aa
  1>>>pF1KB8768 229 - 229 aa - 229 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3991+/-0.00109; mu= 13.4111+/- 0.066
 mean_var=80.2708+/-16.253, 0's: 0 Z-trim(105.0): 175  B-trim: 396 in 2/48
 Lambda= 0.143151
 statistics sampled from 7981 (8186) to 7981 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.635), E-opt: 0.2 (0.251), width:  16
 Scan time:  1.520

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS641.1 DIRAS3 gene_id:9077|Hs108|chr1           ( 229) 1516 322.8 1.2e-88
CCDS6687.1 DIRAS2 gene_id:54769|Hs108|chr9         ( 199)  614 136.4 1.3e-32
CCDS12092.1 DIRAS1 gene_id:148252|Hs108|chr19      ( 198)  578 129.0 2.2e-30
CCDS9485.1 RAP2A gene_id:5911|Hs108|chr13          ( 183)  374 86.8 9.8e-18
CCDS3170.1 RAP2B gene_id:5912|Hs108|chr3           ( 183)  370 86.0 1.7e-17
CCDS840.1 RAP1A gene_id:5906|Hs108|chr1            ( 184)  367 85.4 2.7e-17
CCDS14632.1 RAP2C gene_id:57826|Hs108|chrX         ( 183)  366 85.2 3.1e-17
CCDS8984.1 RAP1B gene_id:5908|Hs108|chr12          ( 184)  363 84.6 4.8e-17
CCDS7814.1 RRAS2 gene_id:22800|Hs108|chr11         ( 204)  344 80.7 7.8e-16
CCDS11921.1 RIT2 gene_id:6014|Hs108|chr18          ( 217)  328 77.4 8.1e-15
CCDS1123.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1            ( 219)  326 77.0 1.1e-14
CCDS58037.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1           ( 236)  326 77.0 1.2e-14
CCDS8778.1 RHEBL1 gene_id:121268|Hs108|chr12       ( 183)  318 75.3   3e-14
CCDS3100.1 MRAS gene_id:22808|Hs108|chr3           ( 208)  310 73.7   1e-13
CCDS12774.1 RRAS gene_id:6237|Hs108|chr19          ( 218)  310 73.7 1.1e-13
CCDS2131.1 RALB gene_id:5899|Hs108|chr2            ( 206)  303 72.2 2.8e-13
CCDS5460.1 RALA gene_id:5898|Hs108|chr7            ( 206)  301 71.8 3.7e-13
CCDS8702.1 KRAS gene_id:3845|Hs108|chr12           ( 188)  299 71.4 4.6e-13
CCDS8703.1 KRAS gene_id:3845|Hs108|chr12           ( 189)  297 70.9 6.2e-13
CCDS6261.1 GEM gene_id:2669|Hs108|chr8             ( 296)  294 70.5 1.3e-12
CCDS8673.1 RERG gene_id:85004|Hs108|chr12          ( 199)  278 67.0 9.8e-12
CCDS53603.1 RRAS2 gene_id:22800|Hs108|chr11        ( 169)  275 66.4 1.3e-11
CCDS7698.1 HRAS gene_id:3265|Hs108|chr11           ( 189)  274 66.2 1.7e-11
CCDS10824.1 RRAD gene_id:6236|Hs108|chr16          ( 308)  274 66.4 2.4e-11
CCDS10200.1 RASL12 gene_id:51285|Hs108|chr15       ( 266)  273 66.1 2.5e-11
CCDS5927.1 RHEB gene_id:6009|Hs108|chr7            ( 184)  271 65.6 2.5e-11
CCDS877.1 NRAS gene_id:4893|Hs108|chr1             ( 189)  267 64.8 4.5e-11


>>CCDS641.1 DIRAS3 gene_id:9077|Hs108|chr1                (229 aa)
 initn: 1516 init1: 1516 opt: 1516  Z-score: 1705.1  bits: 322.8 E(32554): 1.2e-88
Smith-Waterman score: 1516; 100.0% identity (100.0% similar) in 229 aa overlap (1-229:1-229)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MGNASFGSKEQKLLKRLRLLPALLILRAFKPHRKIRDYRVVVVGTAGVGKSTLLHKWASG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MGNASFGSKEQKLLKRLRLLPALLILRAFKPHRKIRDYRVVVVGTAGVGKSTLLHKWASG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 NFRHEYLPTIENTYCQLLGCSHGVLSLHITDSKSGDGNRALQRHVIARGHAFVLVYSVTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 NFRHEYLPTIENTYCQLLGCSHGVLSLHITDSKSGDGNRALQRHVIARGHAFVLVYSVTK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 KETLEELKAFYELICKIKGNNLHKFPIVLVGNKSDDTHREVALNDGATCAMEWNCAFMEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 KETLEELKAFYELICKIKGNNLHKFPIVLVGNKSDDTHREVALNDGATCAMEWNCAFMEI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220         
pF1KB8 SAKTDVNVQELFHMLLNYKKKPTTGLQEPEKKSQMPNTTEKLLDKCIIM
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SAKTDVNVQELFHMLLNYKKKPTTGLQEPEKKSQMPNTTEKLLDKCIIM
              190       200       210       220         

>>CCDS6687.1 DIRAS2 gene_id:54769|Hs108|chr9              (199 aa)
 initn: 560 init1: 560 opt: 614  Z-score: 699.2  bits: 136.4 E(32554): 1.3e-32
Smith-Waterman score: 614; 49.0% identity (80.4% similar) in 194 aa overlap (37-229:7-199)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KB8 GSKEQKLLKRLRLLPALLILRAFKPHRKIRDYRVVVVGTAGVGKSTLLHKWASGNFRHEY
                                     ::::.: :..:::::.:. ....:.::. :
CCDS66                         MPEQSNDYRVAVFGAGGVGKSSLVLRFVKGTFRESY
                                       10        20        30      

         70        80        90       100       110       120      
pF1KB8 LPTIENTYCQLLGCSHGVLSLHITDSKSGDGNRALQRHVIARGHAFVLVYSVTKKETLEE
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CCDS66 IPTVEDTYRQVISCDKSICTLQITDTTGSHQFPAMQRLSISKGHAFILVYSITSRQSLEE
         40        50        60        70        80        90      

        130       140       150        160       170       180     
pF1KB8 LKAFYELICKIKGNNLHKFPIVLVGNKSDDT-HREVALNDGATCAMEWNCAFMEISAKTD
       :: .:: ::.:::. ....::.::::: :..  :::  ... . :  :.::::: ::: .
CCDS66 LKPIYEQICEIKGD-VESIPIMLVGNKCDESPSREVQSSEAEALARTWKCAFMETSAKLN
        100       110        120       130       140       150     

         190       200       210       220         
pF1KB8 VNVQELFHMLLNYKKKPTTGLQEPEKKSQMPNTTEKLLDKCIIM
        ::.:::. ::: .:. :..::   :::.. .  :::  ::.::
CCDS66 HNVKELFQELLNLEKRRTVSLQIDGKKSKQQKRKEKLKGKCVIM
         160       170       180       190         

>>CCDS12092.1 DIRAS1 gene_id:148252|Hs108|chr19           (198 aa)
 initn: 561 init1: 356 opt: 578  Z-score: 659.1  bits: 129.0 E(32554): 2.2e-30
Smith-Waterman score: 578; 46.6% identity (78.2% similar) in 193 aa overlap (37-229:7-198)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KB8 GSKEQKLLKRLRLLPALLILRAFKPHRKIRDYRVVVVGTAGVGKSTLLHKWASGNFRHEY
                                     :::::: :..:::::.:. ....:.::  :
CCDS12                         MPEQSNDYRVVVFGAGGVGKSSLVLRFVKGTFRDTY
                                       10        20        30      

         70        80        90       100       110       120      
pF1KB8 LPTIENTYCQLLGCSHGVLSLHITDSKSGDGNRALQRHVIARGHAFVLVYSVTKKETLEE
       .::::.:: :...:...: .:.:::. ..    :.::  :..::::.::.:::.:..:::
CCDS12 IPTIEDTYRQVISCDKSVCTLQITDTTGSHQFPAMQRLSISKGHAFILVFSVTSKQSLEE
         40        50        60        70        80        90      

        130       140       150       160       170       180      
pF1KB8 LKAFYELICKIKGNNLHKFPIVLVGNKSDDTHREVALNDGATCAMEWNCAFMEISAKTDV
       :  .:.:: .:::. .. .:..::::: :.:.:::   .. . :.::.::::: ::: . 
CCDS12 LGPIYKLIVQIKGS-VEDIPVMLVGNKCDETQREVDTREAQAVAQEWKCAFMETSAKMNY
        100       110        120       130       140       150     

        190       200       210       220         
pF1KB8 NVQELFHMLLNYKKKPTTGLQEPEKKSQMPNTTEKLLDKCIIM
       ::.:::. ::. . . . .:.   :.:   . :...  :: .:
CCDS12 NVKELFQELLTLETRRNMSLNIDGKRSGKQKRTDRVKGKCTLM
         160       170       180       190        

>>CCDS9485.1 RAP2A gene_id:5911|Hs108|chr13               (183 aa)
 initn: 319 init1: 188 opt: 374  Z-score: 431.8  bits: 86.8 E(32554): 9.8e-18
Smith-Waterman score: 374; 36.0% identity (70.9% similar) in 172 aa overlap (35-202:1-170)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KB8 SFGSKEQKLLKRLRLLPALLILRAFKPHRKIRDYRVVVVGTAGVGKSTLLHKWASGNFRH
                                     .:.:.:::.:..:::::.:  ....:.: .
CCDS94                               MREYKVVVLGSGGVGKSALTVQFVTGTFIE
                                             10        20        30

           70        80        90       100       110       120    
pF1KB8 EYLPTIENTYCQLLGCSHGVLSLHITDSKSGDGNRALQRHVIARGHAFVLVYSVTKKETL
       .: ::::. : . .  . .   :.: :. . .   ...   :  :..:.::::.......
CCDS94 KYDPTIEDFYRKEIEVDSSPSVLEILDTAGTEQFASMRDLYIKNGQGFILVYSLVNQQSF
               40        50        60        70        80        90

          130       140       150        160       170       180   
pF1KB8 EELKAFYELICKIKGNNLHKFPIVLVGNKSD-DTHREVALNDGATCAMEWNCAFMEISAK
       ...: . . : ..:    .: :..::::: : ...:::. ..: . : ::.: ::: :::
CCDS94 QDIKPMRDQIIRVK--RYEKVPVILVGNKVDLESEREVSSSEGRALAEEWGCPFMETSAK
              100         110       120       130       140        

           190          200       210       220         
pF1KB8 TDVNVQELFHML---LNYKKKPTTGLQEPEKKSQMPNTTEKLLDKCIIM
       . . :.:::  .   .::  .:                           
CCDS94 SKTMVDELFAEIVRQMNYAAQPDKDDPCCSACNIQ              
      150       160       170       180                 

>>CCDS3170.1 RAP2B gene_id:5912|Hs108|chr3                (183 aa)
 initn: 320 init1: 189 opt: 370  Z-score: 427.4  bits: 86.0 E(32554): 1.7e-17
Smith-Waterman score: 370; 35.5% identity (70.9% similar) in 172 aa overlap (35-202:1-170)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KB8 SFGSKEQKLLKRLRLLPALLILRAFKPHRKIRDYRVVVVGTAGVGKSTLLHKWASGNFRH
                                     .:.:.:::.:..:::::.:  ....:.: .
CCDS31                               MREYKVVVLGSGGVGKSALTVQFVTGSFIE
                                             10        20        30

           70        80        90       100       110       120    
pF1KB8 EYLPTIENTYCQLLGCSHGVLSLHITDSKSGDGNRALQRHVIARGHAFVLVYSVTKKETL
       .: ::::. : . .  . .   :.: :. . .   ...   :  :..:.::::.......
CCDS31 KYDPTIEDFYRKEIEVDSSPSVLEILDTAGTEQFASMRDLYIKNGQGFILVYSLVNQQSF
               40        50        60        70        80        90

          130       140       150        160       170       180   
pF1KB8 EELKAFYELICKIKGNNLHKFPIVLVGNKSD-DTHREVALNDGATCAMEWNCAFMEISAK
       ...: . . : ..:    .. :..::::: : . .:::. ..: . : ::.: ::: :::
CCDS31 QDIKPMRDQIIRVK--RYERVPMILVGNKVDLEGEREVSYGEGKALAEEWSCPFMETSAK
              100         110       120       130       140        

           190          200       210       220         
pF1KB8 TDVNVQELFHML---LNYKKKPTTGLQEPEKKSQMPNTTEKLLDKCIIM
       . ..:.:::  .   .::  .:                           
CCDS31 NKASVDELFAEIVRQMNYAAQPNGDEGCCSACVIL              
      150       160       170       180                 

>>CCDS840.1 RAP1A gene_id:5906|Hs108|chr1                 (184 aa)
 initn: 266 init1: 266 opt: 367  Z-score: 424.0  bits: 85.4 E(32554): 2.7e-17
Smith-Waterman score: 367; 35.7% identity (70.3% similar) in 182 aa overlap (35-213:1-180)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KB8 SFGSKEQKLLKRLRLLPALLILRAFKPHRKIRDYRVVVVGTAGVGKSTLLHKWASGNFRH
                                     .:.:..::.:..:::::.:  ....: : .
CCDS84                               MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVE
                                             10        20        30

           70        80        90       100       110       120    
pF1KB8 EYLPTIENTYCQLLGCSHGVLSLHITDSKSGDGNRALQRHVIARGHAFVLVYSVTKKETL
       .: ::::..: . .  .     :.: :. . .   :..   .  :..:.::::.: . :.
CCDS84 KYDPTIEDSYRKQVEVDCQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTF
               40        50        60        70        80        90

          130       140       150        160       170        180  
pF1KB8 EELKAFYELICKIKGNNLHKFPIVLVGNKSD-DTHREVALNDGATCAMEW-NCAFMEISA
       ..:. . : : ..:  . .  :..::::: : . .: :. ..: . : .: ::::.: ::
CCDS84 NDLQDLREQILRVK--DTEDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWCNCAFLESSA
              100         110       120       130       140        

            190        200       210       220         
pF1KB8 KTDVNVQELFHMLL-NYKKKPTTGLQEPEKKSQMPNTTEKLLDKCIIM
       :. .::.:.:. :. . ..:  .  ..:.:::                
CCDS84 KSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVEKKKPKKKSCLLL            
      150       160       170       180                

>>CCDS14632.1 RAP2C gene_id:57826|Hs108|chrX              (183 aa)
 initn: 332 init1: 189 opt: 366  Z-score: 422.9  bits: 85.2 E(32554): 3.1e-17
Smith-Waterman score: 366; 35.4% identity (70.2% similar) in 181 aa overlap (35-214:1-175)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KB8 SFGSKEQKLLKRLRLLPALLILRAFKPHRKIRDYRVVVVGTAGVGKSTLLHKWASGNFRH
                                     .:.:.:::.:..:::::.:  ....:.: .
CCDS14                               MREYKVVVLGSGGVGKSALTVQFVTGTFIE
                                             10        20        30

           70        80        90       100       110       120    
pF1KB8 EYLPTIENTYCQLLGCSHGVLSLHITDSKSGDGNRALQRHVIARGHAFVLVYSVTKKETL
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CCDS14 KYDPTIEDFYRKEIEVDSSPSVLEILDTAGTEQFASMRDLYIKNGQGFILVYSLVNQQSF
               40        50        60        70        80        90

          130       140       150        160       170       180   
pF1KB8 EELKAFYELICKIKGNNLHKFPIVLVGNKSD-DTHREVALNDGATCAMEWNCAFMEISAK
       ...: . . : ..:    .: :..::::: : . .:::  ..: . :.::.: ::: :::
CCDS14 QDIKPMRDQIVRVK--RYEKVPLILVGNKVDLEPEREVMSSEGRALAQEWGCPFMETSAK
              100         110       120       130       140        

           190       200       210       220         
pF1KB8 TDVNVQELFHMLLNYKKKPTTGLQEPEKKSQMPNTTEKLLDKCIIM
       .   :.:::  ..  ..   ..:  :::..:               
CCDS14 SKSMVDELFAEIV--RQMNYSSL--PEKQDQCCTTCVVQ       
      150       160           170       180          

>>CCDS8984.1 RAP1B gene_id:5908|Hs108|chr12               (184 aa)
 initn: 271 init1: 271 opt: 363  Z-score: 419.5  bits: 84.6 E(32554): 4.8e-17
Smith-Waterman score: 363; 34.6% identity (68.6% similar) in 185 aa overlap (35-215:1-183)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KB8 SFGSKEQKLLKRLRLLPALLILRAFKPHRKIRDYRVVVVGTAGVGKSTLLHKWASGNFRH
                                     .:.:..::.:..:::::.:  ....: : .
CCDS89                               MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVE
                                             10        20        30

           70        80        90       100       110       120    
pF1KB8 EYLPTIENTYCQLLGCSHGVLSLHITDSKSGDGNRALQRHVIARGHAFVLVYSVTKKETL
       .: ::::..: . .  .     :.: :. . .   :..   .  :..:.::::.: . :.
CCDS89 KYDPTIEDSYRKQVEVDAQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTF
               40        50        60        70        80        90

          130       140       150        160       170        180  
pF1KB8 EELKAFYELICKIKGNNLHKFPIVLVGNKSD-DTHREVALNDGATCAMEWN-CAFMEISA
       ..:. . : : ..: ..    :..::::: : . .: :. ..: . : .:: :::.: ::
CCDS89 NDLQDLREQILRVKDTD--DVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWNNCAFLESSA
              100         110       120       130       140        

            190         200       210       220         
pF1KB8 KTDVNVQELFHMLLNY--KKKPTTGLQEPEKKSQMPNTTEKLLDKCIIM
       :. .::.:.:. :.    .: :. :  . ... :.              
CCDS89 KSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVPGKARKKSSCQLL             
      150       160       170       180                 

>>CCDS7814.1 RRAS2 gene_id:22800|Hs108|chr11              (204 aa)
 initn: 311 init1: 195 opt: 344  Z-score: 397.7  bits: 80.7 E(32554): 7.8e-16
Smith-Waterman score: 344; 34.7% identity (63.8% similar) in 196 aa overlap (38-228:15-203)

        10        20        30        40        50        60       
pF1KB8 SKEQKLLKRLRLLPALLILRAFKPHRKIRDYRVVVVGTAGVGKSTLLHKWASGNFRHEYL
                                     ::.:::: .:::::.:  .. .. :  .: 
CCDS78                 MAAAGWRDGSGQEKYRLVVVGGGGVGKSALTIQFIQSYFVTDYD
                               10        20        30        40    

        70        80        90       100       110       120       
pF1KB8 PTIENTYCQLLGCSHGVLSLHITDSKSGDGNRALQRHVIARGHAFVLVYSVTKKETLEEL
       ::::..: .    .  .  : : :. . .   :.... .  :..:.::.::: . ..::.
CCDS78 PTIEDSYTKQCVIDDRAARLDILDTAGQEEFGAMREQYMRTGEGFLLVFSVTDRGSFEEI
           50        60        70        80        90       100    

       130       140       150        160       170       180      
pF1KB8 KAFYELICKIKGNNLHKFPIVLVGNKSD-DTHREVALNDGATCAMEWNCAFMEISAKTDV
         : . : ..:  .  .::..:.:::.: : .:.:. ..:   : . . ..:: :::  .
CCDS78 YKFQRQILRVKDRD--EFPMILIGNKADLDHQRQVTQEEGQQLARQLKVTYMEASAKIRM
          110         120       130       140       150       160  

        190       200       210       220             
pF1KB8 NVQELFHMLLNYKKKPTTGLQEPEKKSQMPNTTEKLLDK----CIIM
       ::.. :: :.   .:    .:: :   . :. :.:  ::    :.: 
CCDS78 NVDQAFHELVRVIRK----FQEQECPPS-PEPTRKEKDKKGCHCVIF
            170           180        190       200    

>>CCDS11921.1 RIT2 gene_id:6014|Hs108|chr18               (217 aa)
 initn: 327 init1: 190 opt: 328  Z-score: 379.5  bits: 77.4 E(32554): 8.1e-15
Smith-Waterman score: 333; 32.5% identity (63.9% similar) in 191 aa overlap (36-225:19-197)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB8 FGSKEQKLLKRLRLLPALLILRAFKPHRKIRDYRVVVVGTAGVGKSTLLHKWASGNFRHE
                                     :.:.::..:..:::::..  .. : .:   
CCDS11             MEVENEASCSPGSASGGSREYKVVMLGAGGVGKSAMTMQFISHQFPDY
                           10        20        30        40        

          70        80        90       100       110       120     
pF1KB8 YLPTIENTYCQLLGCSHGVLSLHITDSKSGDGNRALQRHVIARGHAFVLVYSVTKKETLE
       . ::::..:   .  ..    : : :. .     :.... .  :..:.. :::: .....
CCDS11 HDPTIEDAYKTQVRIDNEPAYLDILDTAGQAEFTAMREQYMRGGEGFIICYSVTDRQSFQ
       50        60        70        80        90       100        

         130       140       150        160       170       180    
pF1KB8 ELKAFYELICKIKGNNLHKFPIVLVGNKSD-DTHREVALNDGATCAMEWNCAFMEISAKT
       :   : ::: ...  . ...:.:::::: : .  :.:. ..: . :.:.::.:.: ::  
CCDS11 EAAKFKELIFQVR--HTYEIPLVLVGNKIDLEQFRQVSTEEGLSLAQEYNCGFFETSAAL
      110       120         130       140       150       160      

          190       200       210       220                        
pF1KB8 DVNVQELFHMLLNYKKKPTTGLQEPEKKSQMPNTTEKLLDKCIIM               
          ... :: :.          .: .:: .::.  :: : .                   
CCDS11 RFCIDDAFHGLV----------REIRKKESMPSLMEKKLKRKDSLWKKLKGSLKKKRENM
        170                 180       190       200       210      

CCDS11 T
        




229 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 15:25:25 2016 done: Fri Nov  4 15:25:25 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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