Result of FASTA (ccds) for pF1KB8758
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8758, 201 aa
  1>>>pF1KB8758 201 - 201 aa - 201 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5677+/-0.00091; mu= 11.5331+/- 0.055
 mean_var=76.4960+/-15.824, 0's: 0 Z-trim(107.2): 205  B-trim: 283 in 1/50
 Lambda= 0.146641
 statistics sampled from 9198 (9432) to 9198 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.677), E-opt: 0.2 (0.29), width:  16
 Scan time:  1.800

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14156.1 RAB9A gene_id:9367|Hs108|chrX          ( 201) 1353 295.5 1.5e-80
CCDS14515.1 RAB9B gene_id:51209|Hs108|chrX         ( 201) 1072 236.0 1.2e-62
CCDS3052.1 RAB7A gene_id:7879|Hs108|chr3           ( 207)  688 154.8 3.4e-38
CCDS73011.1 RAB7B gene_id:338382|Hs108|chr1        ( 199)  508 116.7 9.6e-27
CCDS10212.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15        ( 216)  472 109.1   2e-24
CCDS12201.1 RAB11B gene_id:9230|Hs108|chr19        ( 218)  436 101.5   4e-22
CCDS1058.1 RAB13 gene_id:5872|Hs108|chr1           ( 203)  433 100.8 5.8e-22
CCDS8264.1 RAB30 gene_id:27314|Hs108|chr11         ( 203)  432 100.6 6.8e-22
CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15        ( 207)  431 100.4   8e-22
CCDS1459.1 RAB29 gene_id:8934|Hs108|chr1           ( 203)  429 100.0 1.1e-21
CCDS41846.1 RAB35 gene_id:11021|Hs108|chr12        ( 201)  425 99.1 1.9e-21
CCDS12339.1 RAB8A gene_id:4218|Hs108|chr19         ( 207)  424 98.9 2.2e-21
CCDS31613.1 RAB1B gene_id:81876|Hs108|chr11        ( 201)  420 98.1 3.9e-21
CCDS46306.1 RAB1A gene_id:5861|Hs108|chr2          ( 205)  420 98.1   4e-21
CCDS6827.1 RAB14 gene_id:51552|Hs108|chr9          ( 215)  420 98.1 4.1e-21
CCDS41413.1 RAB25 gene_id:57111|Hs108|chr1         ( 213)  416 97.3 7.4e-21
CCDS11703.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 216)  412 96.4 1.3e-20
CCDS7155.1 RAB18 gene_id:22931|Hs108|chr10         ( 206)  408 95.6 2.3e-20
CCDS14766.1 RAB39B gene_id:116442|Hs108|chrX       ( 213)  407 95.4 2.8e-20
CCDS10460.1 RAB26 gene_id:25837|Hs108|chr16        ( 256)  408 95.6 2.8e-20
CCDS1720.1 RAB10 gene_id:10890|Hs108|chr2          ( 200)  404 94.7 4.1e-20
CCDS9003.1 RAB21 gene_id:23011|Hs108|chr12         ( 225)  404 94.7 4.5e-20
CCDS82198.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 196)  403 94.5 4.6e-20
CCDS32722.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 223)  403 94.5 5.1e-20
CCDS54161.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 228)  403 94.5 5.2e-20
CCDS33497.1 RAB22A gene_id:57403|Hs108|chr20       ( 194)  401 94.1 6.1e-20
CCDS8338.1 RAB39A gene_id:54734|Hs108|chr11        ( 217)  399 93.7   9e-20
CCDS31050.1 RAB4A gene_id:5867|Hs108|chr1          ( 218)  396 93.0 1.4e-19
CCDS8900.1 RAB5B gene_id:5869|Hs108|chr12          ( 215)  390 91.8 3.4e-19
CCDS76806.1 RAB26 gene_id:25837|Hs108|chr16        ( 190)  389 91.5 3.5e-19
CCDS76691.1 RAB15 gene_id:376267|Hs108|chr14       ( 212)  386 90.9   6e-19
CCDS9570.1 RAB2B gene_id:84932|Hs108|chr14         ( 216)  386 90.9 6.1e-19
CCDS33850.1 RAB43 gene_id:339122|Hs108|chr3        ( 212)  385 90.7 6.9e-19
CCDS58373.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15        ( 155)  381 89.8 9.6e-19
CCDS6175.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8           ( 212)  382 90.1 1.1e-18
CCDS11419.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17         ( 216)  381 89.9 1.3e-18
CCDS3747.1 RAB33B gene_id:83452|Hs108|chr4         ( 229)  381 89.9 1.3e-18
CCDS58551.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17         ( 249)  381 89.9 1.4e-18
CCDS6662.1 RASEF gene_id:158158|Hs108|chr9         ( 740)  387 91.5 1.4e-18
CCDS33030.1 RAB4B gene_id:53916|Hs108|chr19        ( 213)  380 89.6 1.4e-18
CCDS3976.1 RAB3C gene_id:115827|Hs108|chr5         ( 227)  378 89.2   2e-18
CCDS45826.1 RAB31 gene_id:11031|Hs108|chr18        ( 195)  377 89.0 2.1e-18
CCDS2520.1 RAB17 gene_id:64284|Hs108|chr2          ( 212)  372 87.9 4.6e-18
CCDS2633.1 RAB5A gene_id:5868|Hs108|chr3           ( 215)  368 87.1 8.4e-18
CCDS12372.1 RAB3A gene_id:5864|Hs108|chr19         ( 220)  366 86.7 1.2e-17
CCDS8224.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11          ( 208)  365 86.5 1.3e-17
CCDS8223.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11          ( 208)  363 86.0 1.7e-17
CCDS4962.1 RAB23 gene_id:51715|Hs108|chr6          ( 237)  363 86.1 1.9e-17
CCDS9485.1 RAP2A gene_id:5911|Hs108|chr13          ( 183)  361 85.6 2.1e-17
CCDS12257.1 RAB3D gene_id:9545|Hs108|chr19         ( 219)  361 85.6 2.4e-17


>>CCDS14156.1 RAB9A gene_id:9367|Hs108|chrX               (201 aa)
 initn: 1353 init1: 1353 opt: 1353  Z-score: 1559.7  bits: 295.5 E(32554): 1.5e-80
Smith-Waterman score: 1353; 100.0% identity (100.0% similar) in 201 aa overlap (1-201:1-201)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAGKSSLFKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDTQLFHTIGVEFLNKDLEVDGHFVTMQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MAGKSSLFKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDTQLFHTIGVEFLNKDLEVDGHFVTMQI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 WDTAGQERFRSLRTPFYRGSDCCLLTFSVDDSQSFQNLSNWKKEFIYYADVKEPESFPFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 WDTAGQERFRSLRTPFYRGSDCCLLTFSVDDSQSFQNLSNWKKEFIYYADVKEPESFPFV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 ILGNKIDISERQVSTEEAQAWCRDNGDYPYFETSAKDATNVAAAFEEAVRRVLATEDRSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ILGNKIDISERQVSTEEAQAWCRDNGDYPYFETSAKDATNVAAAFEEAVRRVLATEDRSD
              130       140       150       160       170       180

              190       200 
pF1KB8 HLIQTDTVNLHRKPKPSSSCC
       :::::::::::::::::::::
CCDS14 HLIQTDTVNLHRKPKPSSSCC
              190       200 

>>CCDS14515.1 RAB9B gene_id:51209|Hs108|chrX              (201 aa)
 initn: 1072 init1: 1072 opt: 1072  Z-score: 1238.4  bits: 236.0 E(32554): 1.2e-62
Smith-Waterman score: 1072; 76.1% identity (91.5% similar) in 201 aa overlap (1-201:1-201)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAGKSSLFKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDTQLFHTIGVEFLNKDLEVDGHFVTMQI
       :.::: :.:::::::::::::::::::::::::.: ::::::::::.::::::.:::.::
CCDS14 MSGKSLLLKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDSQAFHTIGVEFLNRDLEVDGRFVTLQI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 WDTAGQERFRSLRTPFYRGSDCCLLTFSVDDSQSFQNLSNWKKEFIYYADVKEPESFPFV
       :::::::::.:::::::::.::::::::::: :::.::.::.::::::::::.:: ::::
CCDS14 WDTAGQERFKSLRTPFYRGADCCLLTFSVDDRQSFENLGNWQKEFIYYADVKDPEHFPFV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 ILGNKIDISERQVSTEEAQAWCRDNGDYPYFETSAKDATNVAAAFEEAVRRVLATEDRSD
       .::::.:  .:::.:::::.:: .::::::.:::::: :::..:::::::.:::.:.. .
CCDS14 VLGNKVDKEDRQVTTEEAQTWCMENGDYPYLETSAKDDTNVTVAFEEAVRQVLAVEEQLE
              130       140       150       160       170       180

              190       200 
pF1KB8 HLIQTDTVNLHRKPKPSSSCC
       : .   :..:.   : .::::
CCDS14 HCMLGHTIDLNSGSKAGSSCC
              190       200 

>>CCDS3052.1 RAB7A gene_id:7879|Hs108|chr3                (207 aa)
 initn: 675 init1: 675 opt: 688  Z-score: 799.2  bits: 154.8 E(32554): 3.4e-38
Smith-Waterman score: 688; 50.7% identity (79.6% similar) in 201 aa overlap (4-201:5-205)

                10        20        30        40        50         
pF1KB8  MAGKSSLFKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDTQLFHTIGVEFLNKDLEVDGHFVTMQ
           :. :.:::.:::.::::.::::.::..::..:   :::..::.:.. :: ..::::
CCDS30 MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQ
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB8 IWDTAGQERFRSLRTPFYRGSDCCLLTFSVDDSQSFQNLSNWKKEFIYYADVKEPESFPF
       ::::::::::.:: . ::::.:::.:.:.:   ..:..:..:. ::.  :. ..::.:::
CCDS30 IWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPF
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB8 VILGNKIDISERQVSTEEAQAWCRDNGDYPYFETSAKDATNVAAAFEEAVRRVLATEDRS
       :.::::::. .:::.:..::::: .... ::::::::.: ::  ::.  .: .:  : . 
CCDS30 VVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEV
              130       140       150       160       170       180

     180        190         200   
pF1KB8 DHLIQ-TDTVNLHR--KPKPSSSCC  
       .   .  . ..: .  . : :.  :  
CCDS30 ELYNEFPEPIKLDKNDRAKASAESCSC
              190       200       

>>CCDS73011.1 RAB7B gene_id:338382|Hs108|chr1             (199 aa)
 initn: 451 init1: 271 opt: 508  Z-score: 593.6  bits: 116.7 E(32554): 9.6e-27
Smith-Waterman score: 508; 42.6% identity (70.6% similar) in 197 aa overlap (8-201:9-199)

                10        20        30        40        50         
pF1KB8  MAGKSSLFKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDTQLFHTIGVEFLNKDLEVDGHFVTMQ
               .:.:..:  ::::.::...:: . :  .   :.:. .:.: . .    . .:
CCDS73 MNPRKKVDLKLIIVGAIGVGKTSLLHQYVHKTFYEEYQTTLGASILSKIIILGDTTLKLQ
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB8 IWDTAGQERFRSLRTPFYRGSDCCLLTFSVDDSQSFQNLSNWKKEFIYYADVKEPESFPF
       ::::.:::::::. . ::.::: :.:.:.: : .::. :. :. . .    :   .:.:.
CCDS73 IWDTGGQERFRSMVSTFYKGSDGCILAFDVTDLESFEALDIWRGD-VLAKIVPMEQSYPM
               70        80        90       100        110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB8 VILGNKIDISERQVSTEEAQAWCRDNGDYPYFETSAKDATNVAAAFEEAVRRVLATEDR-
       :.::::::...:.:  : ::.:::.. : ::::.:::.  ::. :::  . :.:.  .  
CCDS73 VLLGNKIDLADRKVPQEVAQGWCREK-DIPYFEVSAKNDINVVQAFEMLASRALSRYQSI
     120       130       140        150       160       170        

       180       190        200 
pF1KB8 -SDHLIQTDTVNLHRKPKPSSS-CC
         .::  :....:  .:  : : ::
CCDS73 LENHL--TESIKL--SPDQSRSRCC
      180           190         

>>CCDS10212.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15             (216 aa)
 initn: 469 init1: 343 opt: 472  Z-score: 551.9  bits: 109.1 E(32554): 2e-24
Smith-Waterman score: 472; 38.9% identity (69.2% similar) in 208 aa overlap (7-201:11-213)

                   10        20        30        40        50      
pF1KB8     MAGKSSLFKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDTQLFHTIGVEFLNKDLEVDGHFV
                 ::::.:.::.:::::.:..:.. :.:. .   :::::: .....:::. .
CCDS10 MGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTI
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB8 TMQIWDTAGQERFRSLRTPFYRGSDCCLLTFSVDDSQSFQNLSNWKKEFIYYADVKEPES
         ::::::::::.:.. . .:::.   ::....    ...:.  : ::.  .::     .
CCDS10 KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHAD----SN
               70        80        90       100       110          

        120       130        140       150       160          170  
pF1KB8 FPFVILGNKIDISE-RQVSTEEAQAWCRDNGDYPYFETSAKDATNVAAAFEEA---VRRV
       . ....::: :. . : : :.::.:. . ::   ..:::: :.::: :::.     . :.
CCDS10 IVIMLVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKNG-LSFIETSALDSTNVEAAFQTILTEIYRI
        120       130       140        150       160       170     

                 180       190           200    
pF1KB8 LATE---DR--SDHLIQTDTVNLHRKP----KPSSSCC   
       .. .   ::  .:   ....: .:  :    ::. .::   
CCDS10 VSQKQMSDRRENDMSPSNNVVPIHVPPTTENKPKVQCCQNI
         180       190       200       210      

>>CCDS12201.1 RAB11B gene_id:9230|Hs108|chr19             (218 aa)
 initn: 406 init1: 343 opt: 436  Z-score: 510.7  bits: 101.5 E(32554): 4e-22
Smith-Waterman score: 441; 37.1% identity (69.0% similar) in 210 aa overlap (7-201:11-215)

                   10        20        30        40        50      
pF1KB8     MAGKSSLFKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDTQLFHTIGVEFLNKDLEVDGHFV
                 ::::.:.::.:::::.:..:.. :.:. .   :::::: .....:::. .
CCDS12 MGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTI
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB8 TMQIWDTAGQERFRSLRTPFYRGSDCCLLTFSVDDSQSFQNLSNWKKEFIYYADVKEPES
         ::::::::::.:.. . .:::.   ::....    ...:.  : ::.  .::     .
CCDS12 KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHAD----SN
               70        80        90       100       110          

        120       130        140       150       160          170  
pF1KB8 FPFVILGNKIDISE-RQVSTEEAQAWCRDNGDYPYFETSAKDATNVAAAFEEA---VRRV
       . ....::: :. . : : :.::.:. . : .  ..:::: :.:::  ::..    . :.
CCDS12 IVIMLVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKN-NLSFIETSALDSTNVEEAFKNILTEIYRI
        120       130       140        150       160       170     

               180         190             200    
pF1KB8 LATE---DRSDHLIQ--TDTVNLHRKP-----KPSS-SCC   
       .. .   ::. :  .  ...:..   :     ::.. .::   
CCDS12 VSQKQIADRAAHDESPGNNVVDISVPPTTDGQKPNKLQCCQNL
         180       190       200       210        

>>CCDS1058.1 RAB13 gene_id:5872|Hs108|chr1                (203 aa)
 initn: 399 init1: 325 opt: 433  Z-score: 507.7  bits: 100.8 E(32554): 5.8e-22
Smith-Waterman score: 433; 35.5% identity (68.0% similar) in 200 aa overlap (7-201:8-200)

                10        20        30        40        50         
pF1KB8  MAGKSSLFKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDTQLFHTIGVEFLNKDLEVDGHFVTMQ
              :::..:.::.::::. :. :.. ..:..  . :::..:  . ....:. . .:
CCDS10 MAKAYDHLFKLLLIGDSGVGKTCLIIRFAEDNFNNTYISTIGIDFKIRTVDIEGKKIKLQ
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB8 IWDTAGQERFRSLRTPFYRGSDCCLLTFSVDDSQSFQNLSNWKKEFIYYADVKEPES--F
       .:::::::::... : .:::.   .:.... : .::.:..:: :      ..::  :   
CCDS10 VWDTAGQERFKTITTAYYRGAMGIILVYDITDEKSFENIQNWMK------SIKENASAGV
               70        80        90       100             110    

       120        130       140       150       160       170      
pF1KB8 PFVILGNKIDI-SERQVSTEEAQAWCRDNGDYPYFETSAKDATNVAAAFEEAVRRVLATE
         ..:::: :. ..:.:. :.:.   :..:   .::::::.. ::  ::   .: .:   
CCDS10 ERLLLGNKCDMEAKRKVQKEQADKLAREHG-IRFFETSAKSSMNVDEAFSSLARDILLKS
          120       130       140        150       160       170   

          180       190       200    
pF1KB8 D--RSDHLIQTDTVNLHRKPKPSSSCC   
          :: .  .  ...:.   : ... :   
CCDS10 GGRRSGNGNKPPSTDLKTCDKKNTNKCSLG
           180       190       200   

>>CCDS8264.1 RAB30 gene_id:27314|Hs108|chr11              (203 aa)
 initn: 403 init1: 317 opt: 432  Z-score: 506.6  bits: 100.6 E(32554): 6.8e-22
Smith-Waterman score: 432; 38.9% identity (67.7% similar) in 198 aa overlap (7-201:9-200)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB8   MAGKSSLFKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDTQLFHTIGVEFLNKDLEVDGHFVTM
               :::..:.:..::::. :. :.. . :      ::::.:. : .:..:. : .
CCDS82 MSMEDYDFLFKIVLIGNAGVGKTCLVRRFTQGLFPPGQGATIGVDFMIKTVEINGEKVKL
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB8 QIWDTAGQERFRSLRTPFYRGSDCCLLTFSVDDSQSFQNLSNWKKEFIYYADVKEPESFP
       :::::::::::::.   .::...  .::...   .::. : .: .:.  ::. :      
CCDS82 QIWDTAGQERFRSITQSYYRSANALILTYDITCEESFRCLPEWLREIEQYASNK----VI
               70        80        90       100       110          

      120       130        140       150       160       170       
pF1KB8 FVILGNKIDISER-QVSTEEAQAWCRDNGDYPYFETSAKDATNVAAAFEEAVRRVLATED
        :..:::::..:: .:: ..:. .  .  :. :.:::::.. ::   : . . : : .: 
CCDS82 TVLVGNKIDLAERREVSQQRAEEFS-EAQDMYYLETSAKESDNVEKLFLDLACR-LISEA
        120       130       140        150       160        170    

       180       190         200    
pF1KB8 RSDHLIQTDTVNLHRKPKPSS--SCC   
       :.. :... .  :  . :  :  .::   
CCDS82 RQNTLVNNVSSPLPGEGKSISYLTCCNFN
          180       190       200   

>>CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15             (207 aa)
 initn: 405 init1: 332 opt: 431  Z-score: 505.3  bits: 100.4 E(32554): 8e-22
Smith-Waterman score: 431; 40.0% identity (72.0% similar) in 175 aa overlap (7-178:8-175)

                10        20        30        40        50         
pF1KB8  MAGKSSLFKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDTQLFHTIGVEFLNKDLEVDGHFVTMQ
              :::..:.::.::::. :. :.  . :.: .. :::..:  . .:.::. . .:
CCDS10 MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCLLFRFSEDAFNTTFISTIGIDFKIRTIELDGKKIKLQ
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100         110       
pF1KB8 IWDTAGQERFRSLRTPFYRGSDCCLLTFSVDDSQSFQNLSNWKKEFIYYA--DVKEPESF
       :::::::::::.. : .:::.   .:.... . .::.:..:: ...  .:  ::..    
CCDS10 IWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIKNWIRNIEEHASSDVER----
               70        80        90       100       110          

       120       130        140       150       160       170      
pF1KB8 PFVILGNKIDISE-RQVSTEEAQAWCRDNGDYPYFETSAKDATNVAAAFEEAVRRVLATE
         .::::: :... :::: :...    : :   ..:::::...::  ::   .: ...  
CCDS10 --MILGNKCDMNDKRQVSKERGEKLAIDYG-IKFLETSAKSSANVEEAFFTLARDIMTKL
          120       130       140        150       160       170   

        180       190       200          
pF1KB8 DRSDHLIQTDTVNLHRKPKPSSSCC         
       .:                                
CCDS10 NRKMNDSNSAGAGGPVKITENRSKKTSFFRCSLL
           180       190       200       

>>CCDS1459.1 RAB29 gene_id:8934|Hs108|chr1                (203 aa)
 initn: 387 init1: 265 opt: 429  Z-score: 503.1  bits: 100.0 E(32554): 1.1e-21
Smith-Waterman score: 429; 34.8% identity (67.2% similar) in 204 aa overlap (1-201:1-203)

               10        20        30        40        50          
pF1KB8 MAGKSSLFKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDTQLFHTIGVEFLNKDLE-VDGHFVTMQ
       :.... ::::...::..:::.::..::  ..:. .   :.::.:  : :.  : ..: .:
CCDS14 MGSRDHLFKVLVVGDAAVGKTSLVQRYSQDSFSKHYKSTVGVDFALKVLQWSDYEIVRLQ
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB8 IWDTAGQERFRSLRTPFYRGSDCCLLTFSVDDSQSFQNLSNWKKEFIYYADVKEPESFPF
       .:: :::::: :.   .:: .. :.. :.: .. .:.: . ::...     . . :  : 
CCDS14 LWDIAGQERFTSMTRLYYRDASACVIMFDVTNATTFSNSQRWKQDLDSKLTLPNGEPVPC
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB8 VILGNKIDISERQVSTEEAQAWCRDNGDYPYFETSAKDATNVAAAFEEAVRRVL--ATED
       ..:.:: :.:   :: .. . . ..::   . :::.:.  :.  :..  .....  .:::
CCDS14 LLLANKCDLSPWAVSRDQIDRFSKENGFTGWTETSVKENKNINEAMRVLIEKMMRNSTED
              130       140       150       160       170       180

       180       190       200 
pF1KB8 RSDHLIQTDTVNLHRKPKPSSSCC
         .   : : .::. : . : :::
CCDS14 IMSLSTQGDYINLQTK-SSSWSCC
              190        200   




201 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 15:20:03 2016 done: Fri Nov  4 15:20:03 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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