Result of FASTA (ccds) for pF1KB8710
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8710, 400 aa
  1>>>pF1KB8710 400 - 400 aa - 400 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2514+/-0.000804; mu= 9.7199+/- 0.049
 mean_var=144.4300+/-29.460, 0's: 0 Z-trim(113.0): 73  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.106720
 statistics sampled from 13600 (13675) to 13600 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.753), E-opt: 0.2 (0.42), width:  16
 Scan time:  3.270

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2051.1 RNF149 gene_id:284996|Hs108|chr2        ( 400) 2731 431.7 5.9e-121
CCDS34065.1 RNF150 gene_id:57484|Hs108|chr4        ( 438)  960 159.0 7.7e-39
CCDS64340.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5        ( 384)  886 147.6 1.9e-35
CCDS4451.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5         ( 419)  886 147.6   2e-35
CCDS14521.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX        ( 428)  874 145.8 7.3e-35
CCDS14520.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX        ( 402)  817 137.0 3.1e-32
CCDS47692.1 RNF148 gene_id:378925|Hs108|chr7       ( 305)  653 111.6 9.8e-25
CCDS5784.1 RNF133 gene_id:168433|Hs108|chr7        ( 376)  628 107.9 1.7e-23


>>CCDS2051.1 RNF149 gene_id:284996|Hs108|chr2             (400 aa)
 initn: 2731 init1: 2731 opt: 2731  Z-score: 2285.0  bits: 431.7 E(32554): 5.9e-121
Smith-Waterman score: 2731; 99.8% identity (100.0% similar) in 400 aa overlap (1-400:1-400)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAWRRREASVGARGVLALALLALALCVPGARGRALEWFSAVVNIEYVDPQTNLTVWSVSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 MAWRRREASVGARGVLALALLALALCVPGARGRALEWFSAVVNIEYVDPQTNLTVWSVSE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 SGRFGDSSPKEGAHGLVGVPWAPGGDLEGCAPDTRFFVPEPGGRGAAPWVALVARGGCTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 SGRFGDSSPKEGAHGLVGVPWAPGGDLEGCAPDTRFFVPEPGGRGAAPWVALVARGGCTF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 KDKVLVAARRNASAVVLYNEERYGNITLPMSHAGTGNIVVIMISYPKGREILELVQKGIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 KDKVLVAARRNASAVVLYNEERYGNITLPMSHAGTGNIVVIMISYPKGREILELVQKGIP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 VTMTIGVGTRHVQEFISGQSVVFVAIAFITMMIISLAWLIFYYIQRFLYTGSQIGSQSHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 VTMTIGVGTRHVQEFISGQSVVFVAIAFITMMIISLAWLIFYYIQRFLYTGSQIGSQSHR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 KETKKVIGQLLLHTVKHGEKGIDVDAENCAVCIENFKVKDIIRILPCKHIFHRICIDPWL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 KETKKVIGQLLLHTVKHGEKGIDVDAENCAVCIENFKVKDIIRILPCKHIFHRICIDPWL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 LDHRTCPMCKLDVIKALGYWGEPGDVQEMPAPESPPGRDPAANLSLALPDDDGSDESSPP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS20 LDHRTCPMCKLDVIKALGYWGEPGDVQEMPAPESPPGRDPAANLSLALPDDDGSDDSSPP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400
pF1KB8 SASPAESEPQCDPSFKGDAGENTALLEAGRSDSRHGGPIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 SASPAESEPQCDPSFKGDAGENTALLEAGRSDSRHGGPIS
              370       380       390       400

>>CCDS34065.1 RNF150 gene_id:57484|Hs108|chr4             (438 aa)
 initn: 567 init1: 456 opt: 960  Z-score: 810.8  bits: 159.0 E(32554): 7.7e-39
Smith-Waterman score: 960; 43.5% identity (71.8% similar) in 347 aa overlap (25-358:27-366)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB8   MAWRRREASVGARGVLALALLALALCVPGARGRALEWFSAVVNIEYVDPQTNLTVWSV
                                 ::.  . ..  ::..: ::: :..:  .  . ..
CCDS34 MAMSLIQACCSLALSTWLLSFCFVHLLCLDFTVAEKEEWYTAFVNITYAEPAPDPGAGAA
               10        20        30        40        50        60

                  60        70        80        90       100       
pF1KB8 -----------SESGRFGDSSPKEGAHGLVGVPWAPGGDLEGCAPDTRFFVPEPGGRGAA
                  .: ::.:. :::. :.: : :  . . :  .: :.:.: .:    ::  
CCDS34 GGGGAELHTEKTECGRYGEHSPKQDARGEV-VMASSAHDRLACDPNTKFAAPT---RGKN
               70        80        90        100       110         

       110       120       130       140       150       160       
pF1KB8 PWVALVARGGCTFKDKVLVAARRNASAVVLYNEERYGNITLPMSHAGTGNIVVIMISYPK
        :.::. .:.::..::.  :  .::::::..:     : :. : :::. .::.:::  ::
CCDS34 -WIALIPKGNCTYRDKIRNAFLQNASAVVIFNVGSNTNETITMPHAGVEDIVAIMIPEPK
         120       130       140       150       160       170     

       170       180       190       200       210       220       
pF1KB8 GREILELVQKGIPVTMTIGVGTRHVQEFISGQSVVFVAIAFITMMIISLAWLIFYYIQRF
       :.::. :....: ::: : .:::..:...:  :::::.:.::..::::::::.:::::::
CCDS34 GKEIVSLLERNITVTMYITIGTRNLQKYVSRTSVVFVSISFIVLMIISLAWLVFYYIQRF
         180       190       200       210       220       230     

       230       240        250       260       270       280      
pF1KB8 LYTGSQIGSQSHRKET-KKVIGQLLLHTVKHGEKGIDVDAENCAVCIENFKVKDIIRILP
        :....  .: .  .. ::.:..: ..:.:.:.:  . : .:::::::..: .:..::::
CCDS34 RYANARDRNQRRLGDAAKKAISKLQIRTIKKGDKETESDFDNCAVCIEGYKPNDVVRILP
         240       250       260       270       280       290     

        290       300       310       320       330        340     
pF1KB8 CKHIFHRICIDPWLLDHRTCPMCKLDVIKALGYWGEPGDVQEMPAP-ESPPGRDPAANLS
       :.:.::. :.::::::::::::::....::::   .   ....:.  :.  :  :. ...
CCDS34 CRHLFHKSCVDPWLLDHRTCPMCKMNILKALGIPPNADCMDDLPTDFEGSLGGPPTNQIT
         300       310       320       330       340       350     

         350       360       370       380       390       400     
pF1KB8 LALPDDDGSDESSPPSASPAESEPQCDPSFKGDAGENTALLEAGRSDSRHGGPIS     
        :  .:   .:::                                               
CCDS34 GA--SDTTVNESSVTLDPAVRTVGALQVVQDTDPIPQEGDVIFTTNSEQEPAVSSDSDIS
           360       370       380       390       400       410   

>>CCDS64340.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5             (384 aa)
 initn: 580 init1: 436 opt: 886  Z-score: 750.0  bits: 147.6 E(32554): 1.9e-35
Smith-Waterman score: 886; 41.7% identity (66.0% similar) in 379 aa overlap (11-381:5-377)

               10        20           30        40        50       
pF1KB8 MAWRRREASVGARGVLALALLALALCV--PG-ARGRALEWFSAVVNIEYVDPQTNLTVWS
                 :  :   :: :::  :   :. : . . :...:..:.   .:  .  .  
CCDS64       MSCAGRAGPARLAALALLTCSLWPARADNASQEYYTALINVTVQEPGRGAPLTF
                     10        20        30        40        50    

        60        70        80          90       100       110     
pF1KB8 VSESGRFGDSSPKEGAHGLVGVPWAPGG--DLEGCAPDTRFFVPEPGGRGAAPWVALVAR
         . ::.: .:::  ..: : .:    :  :  :: :.:::::: :. .    :.::. :
CCDS64 RIDRGRYGLDSPKAEVRGQVLAPLPLHGVADHLGCDPQTRFFVP-PNIK---QWIALLQR
           60        70        80        90        100          110

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB8 GGCTFKDKVLVAARRNASAVVLYNEERYGNITLPMSHAGTGNIVVIMISYPKGREILELV
       :.::::.:.  :: .:: :::.::. .  .  . :.: :::.:...::.  .:..::  .
CCDS64 GNCTFKEKISRAAFHNAVAVVIYNN-KSKEEPVTMTHPGTGDIIAVMITELRGKDILSYL
              120       130        140       150       160         

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB8 QKGIPVTMTIGVGTRHVQEFISGQSVVFVAIAFITMMIISLAWLIFYYIQRFLYTGSQIG
       .:.: : :::.::::   . .:  :.:::.:.::..:::: ::::::.::.. ::...  
CCDS64 EKNISVQMTIAVGTRMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLMIISSAWLIFYFIQKIRYTNARDR
     170       180       190       200       210       220         

         240        250       260       270       280       290    
pF1KB8 SQSHRKET-KKVIGQLLLHTVKHGEKGIDVDAENCAVCIENFKVKDIIRILPCKHIFHRI
       .: .  .. ::.:..:  .:::.:.:  : : ..::::::..: .:..:::::::.::. 
CCDS64 NQRRLGDAAKKAISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAVCIESYKQNDVVRILPCKHVFHKS
     230       240       250       260       270       280         

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB8 CIDPWLLDHRTCPMCKLDVIKALGYWGEPGDVQEMPAPESPPGRDPAANLSLALPD--DD
       :.:::: .: :::::::...::::   .   ....        :  :.:   :: :   :
CCDS64 CVDPWLSEHCTCPMCKLNILKALGIVPNLPCTDNVAFDMERLTRTQAVNRRSALGDLAGD
     290       300       310       320       330       340         

            360       370       380       390       400
pF1KB8 GSDESSPPSASPAESEPQCDPSFKGDAGENTALLEAGRSDSRHGGPIS
       .:    :  .:     :: :  .   .::                   
CCDS64 NSLGLEPLRTSGISPLPQ-DGELTPRTGEINIAVTR            
     350       360        370       380                

>>CCDS4451.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5              (419 aa)
 initn: 580 init1: 436 opt: 886  Z-score: 749.5  bits: 147.6 E(32554): 2e-35
Smith-Waterman score: 886; 41.7% identity (66.0% similar) in 379 aa overlap (11-381:5-377)

               10        20           30        40        50       
pF1KB8 MAWRRREASVGARGVLALALLALALCV--PG-ARGRALEWFSAVVNIEYVDPQTNLTVWS
                 :  :   :: :::  :   :. : . . :...:..:.   .:  .  .  
CCDS44       MSCAGRAGPARLAALALLTCSLWPARADNASQEYYTALINVTVQEPGRGAPLTF
                     10        20        30        40        50    

        60        70        80          90       100       110     
pF1KB8 VSESGRFGDSSPKEGAHGLVGVPWAPGG--DLEGCAPDTRFFVPEPGGRGAAPWVALVAR
         . ::.: .:::  ..: : .:    :  :  :: :.:::::: :. .    :.::. :
CCDS44 RIDRGRYGLDSPKAEVRGQVLAPLPLHGVADHLGCDPQTRFFVP-PNIK---QWIALLQR
           60        70        80        90        100          110

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB8 GGCTFKDKVLVAARRNASAVVLYNEERYGNITLPMSHAGTGNIVVIMISYPKGREILELV
       :.::::.:.  :: .:: :::.::. .  .  . :.: :::.:...::.  .:..::  .
CCDS44 GNCTFKEKISRAAFHNAVAVVIYNN-KSKEEPVTMTHPGTGDIIAVMITELRGKDILSYL
              120       130        140       150       160         

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB8 QKGIPVTMTIGVGTRHVQEFISGQSVVFVAIAFITMMIISLAWLIFYYIQRFLYTGSQIG
       .:.: : :::.::::   . .:  :.:::.:.::..:::: ::::::.::.. ::...  
CCDS44 EKNISVQMTIAVGTRMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLMIISSAWLIFYFIQKIRYTNARDR
     170       180       190       200       210       220         

         240        250       260       270       280       290    
pF1KB8 SQSHRKET-KKVIGQLLLHTVKHGEKGIDVDAENCAVCIENFKVKDIIRILPCKHIFHRI
       .: .  .. ::.:..:  .:::.:.:  : : ..::::::..: .:..:::::::.::. 
CCDS44 NQRRLGDAAKKAISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAVCIESYKQNDVVRILPCKHVFHKS
     230       240       250       260       270       280         

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB8 CIDPWLLDHRTCPMCKLDVIKALGYWGEPGDVQEMPAPESPPGRDPAANLSLALPD--DD
       :.:::: .: :::::::...::::   .   ....        :  :.:   :: :   :
CCDS44 CVDPWLSEHCTCPMCKLNILKALGIVPNLPCTDNVAFDMERLTRTQAVNRRSALGDLAGD
     290       300       310       320       330       340         

            360       370       380       390       400            
pF1KB8 GSDESSPPSASPAESEPQCDPSFKGDAGENTALLEAGRSDSRHGGPIS            
       .:    :  .:     :: :  .   .::                               
CCDS44 NSLGLEPLRTSGISPLPQ-DGELTPRTGEINIAVTKEWFIIASFGLLSALTLCYMIIRAT
     350       360        370       380       390       400        

>>CCDS14521.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX             (428 aa)
 initn: 610 init1: 561 opt: 874  Z-score: 739.4  bits: 145.8 E(32554): 7.3e-35
Smith-Waterman score: 874; 41.3% identity (68.8% similar) in 356 aa overlap (20-369:26-375)

                     10        20        30        40        50    
pF1KB8       MAWRRREASVGARGVLALALLALALCVPGARGRALEWFSAVVNIEYVDPQT--N
                                ::::.  .::.::    : .: .:. .  :.:  :
CCDS14 MGPPPGAGVSCRGGCGFSRLLAWCFLLALSPQAPGSRGAEAVW-TAYLNVSWRVPHTGVN
               10        20        30        40         50         

             60        70        80        90       100        110 
pF1KB8 LTVWSVSESGRFGDSSPKEGAHGLVGVPWAPGGDLEGCAPDTRFFVPEPGGRGA-APWVA
        ::: .:: : .:..:: : . :..  : .::. :..: : : : ::   :  . . :.:
CCDS14 RTVWELSEEGVYGQDSPLEPVAGVLVPPDGPGA-LNACNPHTNFTVPTVWGSTVQVSWLA
      60        70        80        90        100       110        

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pF1KB8 LVARGG-CTFKDKVLVAARRNASAVVLYNEERYGNITLPMSHAGTGNIVVIMISYPKGRE
       :. ::: ::: ::. .: .:.::..:..:     : ..:::: :. .::.:::.  :: .
CCDS14 LIQRGGGCTFADKIHLAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIMIGNLKGTK
      120       130       140       150       160       170        

              180       190       200       210       220       230
pF1KB8 ILELVQKGIPVTMTIGVGTRHVQEFISGQSVVFVAIAFITMMIISLAWLIFYYIQRFLYT
       ::. .:.:: :::.: :: .:   ...  :. ::...:. .   .....:::  .:.  .
CCDS14 ILQSIQRGIQVTMVIEVGKKH-GPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLRNA
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pF1KB8 GSQIGSQSHRK-ETKKVIGQLLLHTVKHGEKGIDVDAENCAVCIENFKVKDIIRILPCKH
        .:  .: . : ..::.::.: :.:.:.:.: :  :...:::::: .: .:..::: :.:
CCDS14 RAQSRKQRQLKADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCNH
       240       250       260       270       280       290       

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pF1KB8 IFHRICIDPWLLDHRTCPMCKLDVIKALGYWGEPGDVQEMPAPESPPGRDPAANLSLALP
       :::. :.:::::.:::::::: :..::::      ::..  .  . :  .  .: . .  
CCDS14 IFHKTCVDPWLLEHRTCPMCKCDILKALGI---EVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHE
       300       310       320          330       340       350    

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pF1KB8 DDDGSDESSPPSAS-PAESEPQCDPSFKGDAGENTALLEAGRSDSRHGGPIS        
       .:. :. .:   ::  . .::                                       
CCDS14 EDNRSETASSGYASVQGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEED
          360       370       380       390       400       410    

>>CCDS14520.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX             (402 aa)
 initn: 618 init1: 618 opt: 817  Z-score: 692.3  bits: 137.0 E(32554): 3.1e-32
Smith-Waterman score: 817; 39.6% identity (69.1% similar) in 333 aa overlap (39-369:29-349)

       10        20        30        40        50        60        
pF1KB8 SVGARGVLALALLALALCVPGARGRALEWFSAVVNIEYVDPQTNLTVWSVSESGRFGDSS
                                     :: :.. : .  .: :.  . : : .: .:
CCDS14   MNQENRSSFFWLLVIFTFLLKITASFSMSAYVTVTYYNETSNYTAIETCECGVYGLAS
                 10        20        30        40        50        

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pF1KB8 PKEGAHGLVGVPWAPGGDLEGCAPDTRFFVPEPGGRGAAPWVALVARGGCTFKDKVLVAA
       :  .: :.::.:   ... ..:  .:.:      .    ::.::. ::.:::..:. .:.
CCDS14 PVANAMGVVGIP--KNNNYQACDHNTEF------SNTKKPWIALIERGNCTFSEKIQTAG
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pF1KB8 RRNASAVVLYNEERYGNITLPMSHAGTGNIVVIMISYPKGREILELVQKGIPVTMTIGVG
       ::::.:::.::  . :: :. :.. :. .::.:::.  :: .::. .:.:: :::.: ::
CCDS14 RRNADAVVIYNAPETGNQTIQMANFGAVDIVAIMIGNLKGTKILQSIQRGIQVTMVIEVG
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pF1KB8 TRHVQEFISGQSVVFVAIAFITMMIISLAWLIFYYIQRFLYTGSQIGSQSHRK-ETKKVI
        .:   ...  :. ::...:. .   .....:::  .:.  . .:  .: . : ..::.:
CCDS14 KKH-GPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLRNARAQSRKQRQLKADAKKAI
               180       190       200       210       220         

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pF1KB8 GQLLLHTVKHGEKGIDVDAENCAVCIENFKVKDIIRILPCKHIFHRICIDPWLLDHRTCP
       :.: :.:.:.:.: :  :...:::::: .: .:..::: :.::::. :.:::::.:::::
CCDS14 GRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCNHIFHKTCVDPWLLEHRTCP
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pF1KB8 MCKLDVIKALGYWGEPGDVQEMPAPESPPGRDPAANLSLALPDDDGSDESSPPSAS-PAE
       ::: :..::::      ::..  .  . :  .  .: . .  .:. :. .:   ::  . 
CCDS14 MCKCDILKALGI---EVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEEDNRSETASSGYASVQGT
     290       300          310       320       330       340      

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pF1KB8 SEPQCDPSFKGDAGENTALLEAGRSDSRHGGPIS                      
       .::                                                     
CCDS14 DEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEEDETPNQETAVREIKS
        350       360       370       380       390       400  

>>CCDS47692.1 RNF148 gene_id:378925|Hs108|chr7            (305 aa)
 initn: 664 init1: 338 opt: 653  Z-score: 557.5  bits: 111.6 E(32554): 9.8e-25
Smith-Waterman score: 737; 41.4% identity (69.1% similar) in 307 aa overlap (14-315:17-304)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB8    MAWRRREASVGARGVLALALLALALCVPGARGRALEWFSAVVNIEYVDPQTNLTVWS
                       :.: :... : :  : . :.:. : .: .:: .   :..  . :
CCDS47 MSFLRITPSTHSSVSSGLLRLSIF-LLLSFPDSNGKAI-W-TAHLNITF---QVGNEITS
               10        20         30          40           50    

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pF1KB8 -VSESGRFGDSSPKEGAHGLVGVPWAPGGDLEGCAPDTRFFVPEPGGRGAAPWVALVARG
        ..::: ::. :: : . :.:..:   : . ..: : : :  :    . :  :.::. ::
CCDS47 ELGESGVFGNHSPLERVSGVVALP--EGWNQNACHPLTNFSRP----KQADSWLALIERG
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pF1KB8 GCTFKDKVLVAARRNASAVVLYNEERYGNITLPMSHAGTGNIVVIMISYPKGREILELVQ
       ::::  :. :::...:..:..:: .  :. ..:::: :: :::..:::  :: :::. .:
CCDS47 GCTFTHKINVAAEKGANGVIIYNYQGTGSKVFPMSHQGTENIVAVMISNLKGMEILHSIQ
      110       120       130       140       150       160        

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pF1KB8 KGIPVTMTIGVGTRHVQEFISGQSV---VFVAIAFITMMIISLAWLIFYYI-QRFLYTGS
       ::. ::. : ::  :.: ..:   .   .:.: : :... .. .: .   . . :    :
CCDS47 KGVYVTVIIEVGRMHMQ-WVSHYIMYLFTFLA-ATIAYFYLDCVWRLTPRVPNSFTRRRS
      170       180        190        200       210       220      

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pF1KB8 QIGSQSHRKETKKVIGQLLLHTVKHGEKGIDVDAENCAVCIENFKVKDIIRILPCKHIFH
       ::     . ..::.: :: :...:.:.. .:.. .::.::....: .:..::: :::.::
CCDS47 QI-----KTDVKKAIDQLQLRVLKEGDEELDLNEDNCVVCFDTYKPQDVVRILTCKHFFH
             230       240       250       260       270       280 

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pF1KB8 RICIDPWLLDHRTCPMCKLDVIKALGYWGEPGDVQEMPAPESPPGRDPAANLSLALPDDD
       . ::::::: :::::::: :..:                                     
CCDS47 KACIDPWLLAHRTCPMCKCDILKT                                    
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>>CCDS5784.1 RNF133 gene_id:168433|Hs108|chr7             (376 aa)
 initn: 635 init1: 320 opt: 628  Z-score: 535.5  bits: 107.9 E(32554): 1.7e-23
Smith-Waterman score: 676; 34.0% identity (61.2% similar) in 379 aa overlap (3-370:9-366)

                     10        20        30        40        50    
pF1KB8       MAWRRREASVGARGVLALALLALALCVPGARGRALEWFSAVVNIEYVDPQTNLT
               ::   ::       .: :..   :      ::   . : .:: .     : .
CCDS57 MHLLKVGTWRNNTASSWLMKFSVLWLVSQNCC------RASVVWMAYMNISF--HVGNHV
               10        20        30              40          50  

           60        70        80         90       100       110   
pF1KB8 VWSVSESGRFGDSSPKEGAHGLVGVPWAPGGDLEG-CAPDTRFFVPEPGGRGAAPWVALV
       .  ..:.: :: ::  . . :.. ::  : : ... : :.: :      .. .  :.::.
CCDS57 LSELGETGVFGRSSTLKRVAGVI-VP--PEGKIQNACNPNTIF----SRSKYSETWLALI
             60        70           80        90           100     

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pF1KB8 ARGGCTFKDKVLVAARRNASAVVLYNEERYGNITLPMSHAGTGNIVVIMISYPKGREILE
        :::::: .:. ::....::.:..::    :: ..:: : .  ..::.::.  :: ::..
CCDS57 ERGGCTFTQKIKVATEKGASGVIIYNVPGTGNQVFPMFHQAFEDVVVVMIGNLKGTEIFH
         110       120       130       140       150       160     

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pF1KB8 LVQKGIPVTMTIGVGTRHVQEFISGQSVVFVAIAFITMMIISLAWLIFYYIQRFLYTGSQ
       :..::. .: .. :: .:.  ...   : :: ..  :     ::..:::.:.:.  .  :
CCDS57 LIKKGVLITAVVEVGRKHII-WMNHYLVSFVIVTTAT-----LAYFIFYHIHRLCLARIQ
         170       180        190       200            210         

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pF1KB8 IGS-QSHRKETKKVIGQLLLHTVKHGEKGIDVDAENCAVCIENFKVKDIIRILPCKHIFH
           :    . ....::: :..::.:.. :. ....:..:.: .: .::.::: :::.::
CCDS57 NRRWQRLTTDLQNTFGQLQLRVVKEGDEEINPNGDSCVICFERYKPNDIVRILTCKHFFH
     220       230       240       250       260       270         

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pF1KB8 RICIDPWLLDHRTCPMCKLDVIKALGYW-----G-EPGDV---QEMPAPESPPGRDPAAN
       . :::::.: : :::.:: :..:.::       : :: .:   .:.:   ::  ..   .
CCDS57 KNCIDPWILPHGTCPICKCDILKVLGIQVVVENGTEPLQVLMSNELPETLSPSEEETNNE
     280       290       300       310       320       330         

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pF1KB8 LSLALPDDDGSDESSPPSASPAESEPQCDPSFKGDAGENTALLEAGRSDSRHGGPIS
       .: :  .:        :...  . .:.                              
CCDS57 VSPAGTSDKVIHVEENPTSQNNDIQPHSVVEDVHPSP                    
     340       350       360       370                          




400 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Fri Nov  4 14:48:54 2016 done: Fri Nov  4 14:48:55 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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