Result of FASTA (ccds) for pF1KB8703
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8703, 574 aa
  1>>>pF1KB8703 574 - 574 aa - 574 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7825+/-0.000814; mu= 5.7871+/- 0.049
 mean_var=238.0925+/-47.768, 0's: 0 Z-trim(116.6): 7  B-trim: 189 in 1/53
 Lambda= 0.083119
 statistics sampled from 17251 (17256) to 17251 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.819), E-opt: 0.2 (0.53), width:  16
 Scan time:  3.950

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS73958.1 SENP3 gene_id:26168|Hs108|chr17        ( 574) 4035 496.6 3.6e-140
CCDS3322.1 SENP5 gene_id:205564|Hs108|chr3         ( 755) 1040 137.5 5.7e-32
CCDS44868.2 SENP1 gene_id:29843|Hs108|chr12        ( 644)  559 79.8 1.2e-14
CCDS77876.1 SENP5 gene_id:205564|Hs108|chr3        ( 709)  524 75.6 2.3e-13
CCDS33902.1 SENP2 gene_id:59343|Hs108|chr3         ( 589)  494 71.9 2.4e-12


>>CCDS73958.1 SENP3 gene_id:26168|Hs108|chr17             (574 aa)
 initn: 4035 init1: 4035 opt: 4035  Z-score: 2630.0  bits: 496.6 E(32554): 3.6e-140
Smith-Waterman score: 4035; 99.8% identity (99.8% similar) in 574 aa overlap (1-574:1-574)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MKETIQGTGSWGPEPPGPGIPPAYSSPRRERLRWPPPPKPRLKSGGGFGPDPGSGTTVPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MKETIQGTGSWGPEPPGPGIPPAYSSPRRERLRWPPPPKPRLKSGGGFGPDPGSGTTVPA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 RRLPVPRPSFDASASEEEEEEEEEVDEDEEEEVAAWRLPPRWSQLGTSQRPRPSRPTHRK
       :::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RRLPVPRPSFDASASEEEEEEEEEEDEDEEEEVAAWRLPPRWSQLGTSQRPRPSRPTHRK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 TCSQRRRRAMRAFRMLLYSKSTSLTFHWKLWGRHRGRRRGLAHPKNHLSPQQGGATPQVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TCSQRRRRAMRAFRMLLYSKSTSLTFHWKLWGRHRGRRRGLAHPKNHLSPQQGGATPQVP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 SPCCRFDSPRGPPPPRLGLLGALMAEDGVRGSPPVPSGPPMEEDGLRWTPKSPLDPDSGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SPCCRFDSPRGPPPPRLGLLGALMAEDGVRGSPPVPSGPPMEEDGLRWTPKSPLDPDSGL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 LSCTLPNGFGGQSGPEGERSLAPPDASILISNVCSIGDHVAQELFQGSDLGMAEEAERPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LSCTLPNGFGGQSGPEGERSLAPPDASILISNVCSIGDHVAQELFQGSDLGMAEEAERPG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 EKAGQHSPLREEHVTCVQSILDEFLQTYGSLIPLSTDEVVEKLEDIFQQEFSTPSRKGLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EKAGQHSPLREEHVTCVQSILDEFLQTYGSLIPLSTDEVVEKLEDIFQQEFSTPSRKGLV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 LQLIQSYQRMPGNAMVRGFRVAYKRHVLTMDDLGTLYGQNWLNDQVMNMYGDLVMDTVPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LQLIQSYQRMPGNAMVRGFRVAYKRHVLTMDDLGTLYGQNWLNDQVMNMYGDLVMDTVPE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 KVHFFNSFFYDKLRTKGYDGVKRWTKNVDIFNKELLLIPIHLEVHWSLISVDVRRRTITY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KVHFFNSFFYDKLRTKGYDGVKRWTKNVDIFNKELLLIPIHLEVHWSLISVDVRRRTITY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 FDSQRTLNRRCPKHIAKYLQAEAVKKDRLDFHQGWKGYFKMNVARQNNDSDCGAFVLQYC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FDSQRTLNRRCPKHIAKYLQAEAVKKDRLDFHQGWKGYFKMNVARQNNDSDCGAFVLQYC
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570    
pF1KB8 KHLALSQPFSFTQQDMPKLRRQIYKELCHCKLTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KHLALSQPFSFTQQDMPKLRRQIYKELCHCKLTV
              550       560       570    

>>CCDS3322.1 SENP5 gene_id:205564|Hs108|chr3              (755 aa)
 initn: 1041 init1: 887 opt: 1040  Z-score: 687.5  bits: 137.5 E(32554): 5.7e-32
Smith-Waterman score: 1040; 53.5% identity (79.2% similar) in 284 aa overlap (291-572:475-753)

              270       280       290       300        310         
pF1KB8 LAPPDASILISNVCSIGDHVAQELFQGSDLGMAEEAERPGEKAGQH-SPLREEHVT-CVQ
                                     :.  : .  : : .:. ::. .:... :..
CCDS33 DGSLKQSILSSELLDHPYCKSPLEAPLVCSGLKLENQVGGGKNSQKASPVDDEQLSVCLS
          450       460       470       480       490       500    

      320       330       340       350       360       370        
pF1KB8 SILDEFLQTYGSLIPLSTDEVVEKLEDIFQQEFSTPSRKGLVLQLIQSYQRMPGNAMVRG
       ..::: .. ::::.:::  ::. .:.:.:...::  .:: .. . : .:.    .    .
CCDS33 GFLDEVMKKYGSLVPLSEKEVLGRLKDVFNEDFS--NRKPFINREITNYRARHQKC---N
          510       520       530         540       550            

      380       390       400       410       420       430        
pF1KB8 FRVAYKRHVLTMDDLGTLYGQNWLNDQVMNMYGDLVMDTVPEKVHFFNSFFYDKLRTKGY
       ::. :..:.: ::::.:: :::::::::.::::.:.::.::.:::::::::. .: ::::
CCDS33 FRIFYNKHMLDMDDLATLDGQNWLNDQVINMYGELIMDAVPDKVHFFNSFFHRQLVTKGY
     560       570       580       590       600       610         

      440       450       460       470       480       490        
pF1KB8 DGVKRWTKNVDIFNKELLLIPIHLEVHWSLISVDVRRRTITYFDSQRTLNRRCPKHIAKY
       .:::::::.::.:.: :::::::::::::::.: .  : :...:::    . : ..: ::
CCDS33 NGVKRWTKKVDLFKKSLLLIPIHLEVHWSLITVTLSNRIISFYDSQGIHFKFCVENIRKY
     620       630       640       650       660       670         

      500       510       520       530       540       550        
pF1KB8 LQAEAVKKDRLDFHQGWKGYFKMNVARQNNDSDCGAFVLQYCKHLALSQPFSFTQQDMPK
       : .:: .:.: .: :::.      . .:.::::::.::::::: ::: :::.:.:.:::.
CCDS33 LLTEAREKNRPEFLQGWQTAVTKCIPQQKNDSDCGVFVLQYCKCLALEQPFQFSQEDMPR
     680       690       700       710       720       730         

      560       570    
pF1KB8 LRRQIYKELCHCKLTV
       .:..::::::.:.:  
CCDS33 VRKRIYKELCECRLMD
     740       750     

>>CCDS44868.2 SENP1 gene_id:29843|Hs108|chr12             (644 aa)
 initn: 492 init1: 331 opt: 559  Z-score: 376.7  bits: 79.8 E(32554): 1.2e-14
Smith-Waterman score: 562; 37.0% identity (63.7% similar) in 273 aa overlap (308-572:393-643)

       280       290       300       310        320       330      
pF1KB8 DHVAQELFQGSDLGMAEEAERPGEKAGQHSPLREE-HVTCVQSILDEFLQTYGSLIPLST
                                     ::..:  :: ::       :  :  .  : 
CCDS44 QKALALQLQNQRLQEREHSVHDSVELHLRVPLEKEIPVTVVQET-----QKKGHKLTDSE
            370       380       390       400            410       

        340       350       360       370       380       390      
pF1KB8 DEVVEKLEDIFQQEFSTPSRKGLVLQLIQSYQRMPGNAMVRGFRVAYKRHVLTMDDLGTL
       ::  :  :.. ..:...  :.:              ... ..::..  :.     :. ::
CCDS44 DEFPEITEEM-EKEIKNVFRNG-----------NQDEVLSEAFRLTITRK-----DIQTL
       420        430                  440       450            460

        400       410       420           430       440       450  
pF1KB8 YGQNWLNDQVMNMYGDLVMDTVPEK----VHFFNSFFYDKLRTKGYDGVKRWTKNVDIFN
          :::::...:.: ...:.   ::    :: ::.::. ::.: ::..::::::.::.:.
CCDS44 NHLNWLNDEIINFYMNMLMERSKEKGLPSVHAFNTFFFTKLKTAGYQAVKRWTKKVDVFS
              470       480       490       500       510       520

            460       470       480       490       500       510  
pF1KB8 KELLLIPIHLEVHWSLISVDVRRRTITYFDSQRTLNRRCPKHIAKYLQAEAVKKDRLDFH
        ..::.:::: ::: :  :: :...:::.::.  .: .  . . .::. :.. : : .: 
CCDS44 VDILLVPIHLGVHWCLAVVDFRKKNITYYDSMGGINNEACRILLQYLKQESIDKKRKEFD
              530       540       550       560       570       580

             520         530       540       550       560         
pF1KB8 -QGWKGYFK--MNVARQNNDSDCGAFVLQYCKHLALSQPFSFTQQDMPKLRRQIYKELCH
        .::. . :  ... .: : :::: :. .:   .. ..:..:::: :: .:...  :. :
CCDS44 TNGWQLFSKKSQEIPQQMNGSDCGMFACKYADCITKDRPINFTQQHMPYFRKRMVWEILH
              590       600       610       620       630       640

     570    
pF1KB8 CKLTV
        ::  
CCDS44 RKLL 
            

>>CCDS77876.1 SENP5 gene_id:205564|Hs108|chr3             (709 aa)
 initn: 848 init1: 371 opt: 524  Z-score: 353.4  bits: 75.6 E(32554): 2.3e-13
Smith-Waterman score: 769; 44.7% identity (66.9% similar) in 284 aa overlap (291-572:475-707)

              270       280       290       300        310         
pF1KB8 LAPPDASILISNVCSIGDHVAQELFQGSDLGMAEEAERPGEKAGQH-SPLREEHVT-CVQ
                                     :.  : .  : : .:. ::. .:... :..
CCDS77 DGSLKQSILSSELLDHPYCKSPLEAPLVCSGLKLENQVGGGKNSQKASPVDDEQLSVCLS
          450       460       470       480       490       500    

      320       330       340       350       360       370        
pF1KB8 SILDEFLQTYGSLIPLSTDEVVEKLEDIFQQEFSTPSRKGLVLQLIQSYQRMPGNAMVRG
       ..::: .. ::::.:::  ::. .:.:.:...::  .:: .. . : .:.    .    .
CCDS77 GFLDEVMKKYGSLVPLSEKEVLGRLKDVFNEDFS--NRKPFINREITNYRARHQKC---N
          510       520       530         540       550            

      380       390       400       410       420       430        
pF1KB8 FRVAYKRHVLTMDDLGTLYGQNWLNDQVMNMYGDLVMDTVPEKVHFFNSFFYDKLRTKGY
       ::. :..:.: ::::.:: :::::::::.::::.:.::.::.:::::::::. .: ::::
CCDS77 FRIFYNKHMLDMDDLATLDGQNWLNDQVINMYGELIMDAVPDKVHFFNSFFHRQLVTKGY
     560       570       580       590       600       610         

      440       450       460       470       480       490        
pF1KB8 DGVKRWTKNVDIFNKELLLIPIHLEVHWSLISVDVRRRTITYFDSQRTLNRRCPKHIAKY
       .:::::::                                              :.: ::
CCDS77 NGVKRWTK----------------------------------------------KNIRKY
     620                                                     630   

      500       510       520       530       540       550        
pF1KB8 LQAEAVKKDRLDFHQGWKGYFKMNVARQNNDSDCGAFVLQYCKHLALSQPFSFTQQDMPK
       : .:: .:.: .: :::.      . .:.::::::.::::::: ::: :::.:.:.:::.
CCDS77 LLTEAREKNRPEFLQGWQTAVTKCIPQQKNDSDCGVFVLQYCKCLALEQPFQFSQEDMPR
           640       650       660       670       680       690   

      560       570    
pF1KB8 LRRQIYKELCHCKLTV
       .:..::::::.:.:  
CCDS77 VRKRIYKELCECRLMD
           700         

>>CCDS33902.1 SENP2 gene_id:59343|Hs108|chr3              (589 aa)
 initn: 469 init1: 293 opt: 494  Z-score: 335.0  bits: 71.9 E(32554): 2.4e-12
Smith-Waterman score: 494; 34.1% identity (69.0% similar) in 229 aa overlap (356-572:361-588)

         330       340       350       360       370            380
pF1KB8 QTYGSLIPLSTDEVVEKLEDIFQQEFSTPSRKGLVLQLIQSYQRMPGNAMVRG-----FR
                                     :   .:.: .....  .::. .:     . 
CCDS33 LGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDRRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQDEILS
              340       350       360       370       380       390

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pF1KB8 VAYKRHVLTMDDLGTLYGQNWLNDQVMNMYGDLVMDTVPEK----VHFFNSFFYDKLRTK
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