Result of FASTA (ccds) for pF1KB8694
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8694, 455 aa
  1>>>pF1KB8694 455 - 455 aa - 455 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2421+/-0.00104; mu= 18.2368+/- 0.062
 mean_var=71.3095+/-14.124, 0's: 0 Z-trim(103.5): 69  B-trim: 70 in 2/49
 Lambda= 0.151880
 statistics sampled from 7394 (7464) to 7394 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.592), E-opt: 0.2 (0.229), width:  16
 Scan time:  2.910

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12         ( 455) 2918 649.0 2.9e-186
CCDS8656.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12         ( 406) 1595 359.0   5e-99
CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19        ( 483) 1220 276.9 3.1e-74
CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20        ( 796)  913 209.8 8.2e-54
CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11          ( 875)  768 178.1 3.2e-44
CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17        ( 411)  759 175.9   7e-44
CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2           ( 670)  758 175.8 1.2e-43
CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5          (1031)  756 175.5 2.3e-43
CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5          (1032)  756 175.5 2.3e-43
CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17        ( 938)  753 174.8 3.3e-43
CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11          ( 483)  741 172.0 1.2e-42
CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22        ( 729)  742 172.3 1.5e-42
CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22        ( 731)  742 172.3 1.5e-42
CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19       ( 427)  734 170.4 3.2e-42
CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6          ( 428)  731 169.7   5e-42
CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3          ( 407)  718 166.9 3.5e-41
CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17          ( 614)  720 167.4 3.6e-41
CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17          ( 614)  720 167.4 3.6e-41
CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12        ( 881)  715 166.5   1e-40
CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12        ( 882)  715 166.5   1e-40
CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6          ( 648)  704 164.0 4.2e-40
CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17        ( 406)  698 162.5 7.3e-40
CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1         ( 619)  698 162.6   1e-39
CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX        ( 631)  667 155.8 1.1e-37
CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY          ( 660)  614 144.2 3.7e-34
CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX          ( 646)  608 142.9 9.1e-34
CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX          ( 662)  608 142.9 9.3e-34
CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17        ( 599)  591 139.2 1.1e-32
CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 479)  585 137.8 2.4e-32
CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16       ( 478)  584 137.6 2.7e-32
CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1           ( 824)  576 136.0 1.4e-31
CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 370)  568 134.0 2.5e-31
CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11        ( 483)  557 131.7 1.7e-30
CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5          ( 622)  549 130.0 6.9e-30
CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11        ( 369)  536 127.0 3.3e-29
CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12         ( 600)  535 126.9 5.6e-29
CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16       ( 447)  519 123.3   5e-28
CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 448)  518 123.1 5.9e-28
CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 453)  518 123.1 5.9e-28
CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 575)  519 123.4 6.1e-28
CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 690)  519 123.4 7.1e-28
CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 704)  519 123.4 7.2e-28
CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5           ( 724)  519 123.4 7.4e-28
CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17        ( 347)  506 120.4   3e-27
CCDS8770.1 DDX23 gene_id:9416|Hs108|chr12          ( 820)  442 106.6 9.8e-23
CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9          ( 585)  419 101.5 2.5e-21
CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10         ( 737)  420 101.8 2.5e-21
CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10         ( 715)  383 93.6 6.8e-19
CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10         ( 783)  383 93.7 7.3e-19
CCDS9918.1 DDX24 gene_id:57062|Hs108|chr14         ( 859)  379 92.8 1.5e-18


>>CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12              (455 aa)
 initn: 2918 init1: 2918 opt: 2918  Z-score: 3457.4  bits: 649.0 E(32554): 2.9e-186
Smith-Waterman score: 2918; 99.8% identity (99.8% similar) in 455 aa overlap (1-455:1-455)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 GRDIIGLAETGPGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIG
       ::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 GRDIIGLAETGSGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 VQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 VQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRIL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 NMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEKLQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 NMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEKLQQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 YYIFIPSKFKDTYLVYILNELAGNSFMIFCSTCNNTQRTALLLRNLGFTAIPLHGQMSQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 YYIFIPSKFKDTYLVYILNELAGNSFMIFCSTCNNTQRTALLLRNLGFTAIPLHGQMSQS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 KRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKDYIHRVGRTARAGRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 KRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKDYIHRVGRTARAGRS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 GKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMMLTERVAEAQRFARMELREHGEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 GKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMMLTERVAEAQRFARMELREHGEK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450     
pF1KB8 KKRSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 KKRSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR
              430       440       450     

>>CCDS8656.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12              (406 aa)
 initn: 1587 init1: 1587 opt: 1595  Z-score: 1891.4  bits: 359.0 E(32554): 5e-99
Smith-Waterman score: 2487; 89.0% identity (89.0% similar) in 455 aa overlap (1-455:1-406)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 GRDIIGLAETGPGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIG
       ::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 GRDIIGLAETGSGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 VQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 VQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRIL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 NMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEKLQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 NMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEKLQQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 YYIFIPSKFKDTYLVYILNELAGNSFMIFCSTCNNTQRTALLLRNLGFTAIPLHGQMSQS
       ::::::::::                                                 :
CCDS86 YYIFIPSKFK-------------------------------------------------S
              250                                                  

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 KRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKDYIHRVGRTARAGRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 KRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKDYIHRVGRTARAGRS
             260       270       280       290       300       310 

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 GKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMMLTERVAEAQRFARMELREHGEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 GKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMMLTERVAEAQRFARMELREHGEK
             320       330       340       350       360       370 

              430       440       450     
pF1KB8 KKRSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 KKRSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR
             380       390       400      

>>CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19             (483 aa)
 initn: 1213 init1: 591 opt: 1220  Z-score: 1446.3  bits: 276.9 E(32554): 3.1e-74
Smith-Waterman score: 1226; 44.4% identity (75.4% similar) in 439 aa overlap (26-453:4-442)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQ
                                : .::... : : : :::  .:: .:.  ::  :.
CCDS12                       MAGFAELGLSSWLVEQCRQLGLKQPTPVQLGCIPAILE
                                     10        20        30        

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 GRDIIGLAETGPGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIG
       ::: .: :.:: :::.::.::::. : : :  .: ::::::::::.::.:::..::. .:
CCDS12 GRDCLGCAKTGSGKTAAFVLPILQKLSEDPYGIFCLVLTPTRELAYQIAEQFRVLGKPLG
       40        50        60        70        80        90        

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 VQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRIL
       ... .::::.: ..:.: :..:::..::::::: :::.... :... ...::::::::.:
CCDS12 LKDCIIVGGMDMVAQALELSRKPHVVIATPGRLADHLRSSNTFSIKKIRFLVMDEADRLL
      100       110       120       130       140       150        

                 190       200       210       220       230       
pF1KB8 NM---DFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEK
       ..   :: .... :: ..:  :.:.:::::.:  ...::  : ..:    ...  .:::.
CCDS12 EQGCTDFTVDLEAILAAVPARRQTLLFSATLTDTLRELQGLATNQPFFWEAQAPVSTVEQ
      160       170       180       190       200       210        

       240       250       260           270       280       290   
pF1KB8 LQQYYIFIPSKFKDTYLVYILNELAGN----SFMIFCSTCNNTQRTALLLRNLGFTAIPL
       :.: :...: : ::.:::......  .    :..:: .::.. :   ..::...: .. :
CCDS12 LDQRYLLVPEKVKDAYLVHLIQRFQDEHEDWSIIIFTNTCKTCQILCMMLRKFSFPTVAL
      220       230       240       250       260       270        

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB8 HGQMSQSKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKDYIHRVGR
       :..:.:..:...: :::..   ::.:::::::::::: :.::.: . :   : :::::::
CCDS12 HSMMKQKERFAALAKFKSSIYRILIATDVASRGLDIPTVQVVINHNTPGLPKIYIHRVGR
      280       290       300       310       320       330        

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pF1KB8 TARAGRSGKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMMLTERVAEAQRFARME
       ::::::.:.:::.:::::..: . ::. : :::  : ... ::...  .:  ..:  ...
CCDS12 TARAGRQGQAITLVTQYDIHLVHAIEEQIKKKLEEFSVEEAEVLQILTQVNVVRRECEIK
      340       350       360       370       380       390        

            420          430       440       450                   
pF1KB8 LRE-HGEKKK---RSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR              
       :.  : ..::   . ..   .. : .     . ..:  :.:.:.                
CCDS12 LEAAHFDEKKEINKRKQLILEGKDPDLEAKRKAELAKIKQKNRRFKEKVEETLKRQKAGR
      400       410       420       430       440       450        

CCDS12 AGHKGRPPRTPSGSHSGPVPSQGLV
      460       470       480   

>>CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20             (796 aa)
 initn: 908 init1: 401 opt: 913  Z-score: 1079.6  bits: 209.8 E(32554): 8.2e-54
Smith-Waterman score: 913; 37.2% identity (69.3% similar) in 417 aa overlap (21-431:215-631)

                         10        20        30        40        50
pF1KB8           MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKI
                                     .:. .:.:....  : .:   .:. .:: :
CCDS13 KADTLKVKDRKKKKKKGQEAGGFFEDASQYDENLSFQDMNLSRPLLKAITAMGFKQPTPI
          190       200       210       220       230       240    

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pF1KB8 QIEAIPLALQGRDIIGLAETGPGKTGAFALPILNALLETPQR---LFALVLTPTRELAFQ
       :   ::..: :.:: . : :: :::.:::::.:. :.  :..     .:::.:::::..:
CCDS13 QKACIPVGLLGKDICACAATGTGKTAAFALPVLERLIYKPRQAPVTRVLVLVPTRELGIQ
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pF1KB8 ISEQFEALGSSIGVQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKGFNLRA
       .    . :..  .. . . :::.:  ::  ::   : :.:::::::::::.:  .:.: .
CCDS13 VHSVTRQLAQFCNITTCLAVGGLDVKSQEAALRAAPDILIATPGRLIDHLHNCPSFHLSS
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pF1KB8 LKYLVMDEADRILNMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCA
       .. :..:::::.:.  :: .. .:...  . :.:.::::::: .:. :  ..:::::.  
CCDS13 IEVLILDEADRMLDEYFEEQMKEIIRMCSHHRQTMLFSATMTDEVKDLASVSLKNPVRIF
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pF1KB8 VSSKYQTVEKLQQYYIFI-PSKFKDTYLVY--ILNELAGNSFMIFCSTCNNTQRTALLLR
       :.:. ...  :.: .: : :..  :   .   .:..   .  :.: .: ....:  .:: 
CCDS13 VNSNTDVAPFLRQEFIRIRPNREGDREAIVAALLTRTFTDHVMLFTQTKKQAHRMHILLG
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pF1KB8 NLGFTAIPLHGQMSQSKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHS
        .:. .  :::..::..:: .: .:: .  .::.:::::.:::::  : .:.:: .:.  
CCDS13 LMGLQVGELHGNLSQTQRLEALRRFKDEQIDILVATDVAARGLDIEGVKTVINFTMPNTI
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pF1KB8 KDYIHRVGRTARAGRSGKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMMLTERVA
       : :.:::::::::::.:.....: . . .....: .     . .    .: .. . ... 
CCDS13 KHYVHRVGRTARAGRAGRSVSLVGEDERKMLKEIVKAAKAPVKARILPQDVILKFRDKIE
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pF1KB8 EAQRFARMELREHGEKKKRSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR         
       . .. .   :. ..:.:. .. .:  :                                 
CCDS13 KMEKDVYAVLQLEAEEKEMQQSEAQINTAKRLLEKGKEAVVQEPERSWFQTKEERKKEKI
          610       620       630       640       650       660    

>>CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11               (875 aa)
 initn: 709 init1: 264 opt: 768  Z-score: 907.3  bits: 178.1 E(32554): 3.2e-44
Smith-Waterman score: 768; 33.9% identity (65.9% similar) in 416 aa overlap (18-425:63-469)

                            10        20        30        40       
pF1KB8              MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKP
                                     .. .:   :.:. ..    .. ..  .   
CCDS83 KKKQLRKQLKKPEWQVERESISRLMQNYEKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLV
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pF1KB8 TKIQIEAIPLALQGRDIIGLAETGPGKTGAFALPILNALLE----TPQRLFALVLTPTRE
       :.:: ..: :::::.:..: :.:: ::: :: .:.:.:: .    . . : .:...::::
CCDS83 TEIQKQTIGLALQGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEALYRLQWTSTDGLGVLIISPTRE
            100       110       120       130       140       150  

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pF1KB8 LAFQISEQFEALGSSIGVQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKGF
       ::.:  : .. .:..   ....:.:: : ...     .. .:.. :::::..:...: .:
CCDS83 LAYQTFEVLRKVGKNHDFSAGLIIGGKD-LKHEAERINNINILVCTPGRLLQHMDETVSF
            160       170       180        190       200       210 

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pF1KB8 NLRALKYLVMDEADRILNMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNP
       .   :..::.:::::::.: :   .. ... .:. :.:.:::::.::.:. : : .::::
CCDS83 HATDLQMLVLDEADRILDMGFADTMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKNP
             220       230       240       250       260       270 

             230       240       250       260       270       280 
pF1KB8 VKCAV--SSKYQTVEKLQQYYIFIPSKFKDTYLVYILNELAGNSFMIFCSTCNNTQRTAL
           :  ..::.:   :.: ::    . : . :  .:     .. ..: :.:...:    
CCDS83 EYVWVHEKAKYSTPATLEQNYIVCELQQKISVLYSFLRSHLKKKSIVFFSSCKEVQYLYR
             280       290       300       310       320       330 

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pF1KB8 LLRNL--GFTAIPLHGQMSQSKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFD
       ..  :  : . . :::...: .:.   :.:  :  ..:.:::.:.::::.: :. :..::
CCDS83 VFCRLRPGVSILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVNWVLQFD
             340       350       360       370       380       390 

     340       350       360       370       380       390         
pF1KB8 IPTHSKDYIHRVGRTARAGRSGKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMML
        :  .. ::::.:::::  ..:.:. ..   .  . :.   :. ::.:       :. . 
CCDS83 CPEDANTYIHRAGRTARYKEDGEALLILLPSEKAMVQQ---LLQKKVP-----VKEIKIN
             400       410       420          430            440   

     400       410       420       430       440       450         
pF1KB8 TERVAEAQRFARMELREHGEKKKRSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR    
        :.. ..:.  .  : .  . :.:..                                  
CCDS83 PEKLIDVQKKLESILAQDQDLKERAQRCFVSYVRSVYLMKDKEVFDVSKLPIPEYALSLG
           450       460       470       480       490       500   

>>CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17             (411 aa)
 initn: 639 init1: 531 opt: 759  Z-score: 901.3  bits: 175.9 E(32554): 7e-44
Smith-Waterman score: 759; 31.9% identity (68.4% similar) in 373 aa overlap (19-390:33-404)

                           10        20        30        40        
pF1KB8             MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPT
                                     : . : ::  .:. . : ..    :. ::.
CCDS11 TTATMATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPS
             10        20        30        40        50        60  

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB8 KIQIEAIPLALQGRDIIGLAETGPGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTPTRELAFQI
        :: .::   ..:::.:. ...: :::..:.. .:. :    ..  ::.:.:::::: ::
CCDS11 AIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQI
             70        80        90       100       110       120  

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pF1KB8 SEQFEALGSSIGVQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKGFNLRAL
       .. . :::. ..::  . .:: .   .   :    :.. .::::..: ..  ...  ::.
CCDS11 QKGLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRR-RSLRTRAI
            130       140       150       160       170        180 

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pF1KB8 KYLVMDEADRILNMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAV
       :.::.::::..::  :. ..  . . .:   .. :.:::. ... ..    . .:..  :
CCDS11 KMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILV
             190       200       210       220       230       240 

      230       240        250       260       270       280       
pF1KB8 SSKYQTVEKLQQYYIFIPSK-FKDTYLVYILNELAGNSFMIFCSTCNNTQRTALLLRNLG
       .    :.: ..:... .  . .:   :  . . :. .. .:::.:  ...  .  .:. .
CCDS11 KRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREAN
             250       260       270       280       290       300 

       290       300       310       320       330       340       
pF1KB8 FTAIPLHGQMSQSKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKDY
       ::.  .::.: :..: . ...:.. :  .:..::: .::::.:.:....:.:.:.. . :
CCDS11 FTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELY
             310       320       330       340       350       360 

       350       360       370       380       390       400       
pF1KB8 IHRVGRTARAGRSGKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMMLTERVAEAQ
       :::.::..: ::.: ::.:: . :..... ::.  . ..  .:                 
CCDS11 IHRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI          
             370       380       390       400       410           

       410       420       430       440       450     
pF1KB8 RFARMELREHGEKKKRSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR

>>CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2                (670 aa)
 initn: 778 init1: 356 opt: 758  Z-score: 897.1  bits: 175.8 E(32554): 1.2e-43
Smith-Waterman score: 760; 34.7% identity (64.8% similar) in 458 aa overlap (4-442:154-603)

                                          10           20        30
pF1KB8                            MAAPEEHDSPTEA-SQPI--VEEEETKTFKDLG
                                     :.. .. .:. : :.  .   :  .: .: 
CCDS21 DTKKAKTENKGKSEEESAETTKETENNVEKPDNDEDESEVPSLPLGLTGAFEDTSFASLC
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pF1KB8 --VTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAI-PLALQGRDIIGLAETGPGKTGAFALPILNALL
         :..   .:  ..:.:. :.:: ..: :: :.:::... :.:: ::: :: .: .. ..
CCDS21 NLVNENTLKAIKEMGFTNMTEIQHKSIRPL-LEGRDLLAAAKTGSGKTLAFLIPAVELIV
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pF1KB8 ET---PQR-LFALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIGVQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKP
       .    :.    .:.:.::::::.:    .. : .      ..:.:: .  ...  :..  
CCDS21 KLRFMPRNGTGVLILSPTRELAMQTFGVLKELMTHHVHTYGLIMGGSNRSAEAQKLGNGI
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pF1KB8 HIIIATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRILNMDFETEVDKILKVIPRDRKTFL
       .::.::::::.::..:: ::  . :. ::.:::::::.. :: :. .:.:..:  :.:.:
CCDS21 NIIVATPGRLLDHMQNTPGFMYKNLQCLVIDEADRILDVGFEEELKQIIKLLPTRRQTML
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pF1KB8 FSATMTKKVQKLQRAALKN-PVKCAVSSKYQ--TVEKLQQYYIFIPSKFKDTYLVYILNE
       ::::.:.::. : : .::. :.  .:..     ::. :.: :.  ::. .   :  .:..
CCDS21 FSATQTRKVEDLARISLKKEPLYVGVDDDKANATVDGLEQGYVVCPSEKRFLLLFTFLKK
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pF1KB8 LAGNSFMIFCSTCNNTQRTALLLRNLGFTAIPLHGQMSQSKRLGSLNKFKAKARSILLAT
          ...:.: :.: ...    ::  . . .. .::...:.::  .. .:     . :: :
CCDS21 NRKKKLMVFFSSCMSVKYHYELLNYIDLPVLAIHGKQKQNKRTTTFFQFCNADSGTLLCT
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pF1KB8 DVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKDYIHRVGRTARAGRSGKAITFVTQYDVEL-FQRIE
       :::.::::::.:: .:..: :   :.:::::::::: : .:.. ...     :: : :  
CCDS21 DVAARGLDIPEVDWIVQYDPPDDPKEYIHRVGRTAR-GLNGRGHALLILRPEELGFLR--
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pF1KB8 HLIGKKLP----GFP-TQDDEVMMLTERVAEAQRFARMELREHGEKKKRSREDAGDNDDT
       .:  .:.:     :  .. ....   :.. : . :    :.. ...  .:   : :. . 
CCDS21 YLKQSKVPLSEFDFSWSKISDIQSQLEKLIEKNYF----LHKSAQEAYKSYIRAYDSHSL
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pF1KB8 EGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR                                       
       .  ..: :                                                    
CCDS21 KQIFNVNNLNLPQVALSFGFKVPPFVDLNVNSNEGKQKKRGGGGGFGYQKTKKVEKSKIF
         600       610       620       630       640       650     

>>CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5               (1031 aa)
 initn: 602 init1: 263 opt: 756  Z-score: 892.1  bits: 175.5 E(32554): 2.3e-43
Smith-Waterman score: 774; 32.5% identity (63.2% similar) in 459 aa overlap (24-453:372-826)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB8        MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIE
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CCDS34 LAKMSQEEVNVFRLEMEGITVKGKGCPKPIKSWVQCGISMKILNSLKKHGYEKPTPIQTQ
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pF1KB8 AIPLALQGRDIIGLAETGPGKTGAFALPILNAL-----LETPQRLFALVLTPTRELAFQI
       :::  ..:::.::.:.:: ::: :: ::..  .     ::  .  .:...:::::::.::
CCDS34 AIPAIMSGRDLIGIAKTGSGKTIAFLLPMFRHIMDQRSLEEGEGPIAVIMTPTRELALQI
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pF1KB8 SEQFEALGSSIGVQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKG--FNLR
       ... . .....:.. . . ::     :   : .  .::. ::::.:: :  ..:   :::
CCDS34 TKECKKFSKTLGLRVVCVYGGTGISEQIAELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVTNLR
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pF1KB8 ALKYLVMDEADRILNMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKC
        . :.:.:::::...: :: .: .:.  .  ::.: .::::. . .. : :  :..:.. 
CCDS34 RVTYVVLDEADRMFDMGFEPQVMRIVDNVRPDRQTVMFSATFPRAMEALARRILSKPIEV
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pF1KB8 AVSSKYQTVEKLQQYYIFIPSKFKDTYLVYILNELA-GNSFMIFCSTCNNTQRTALLLRN
        :...  .   ..:  : :  . :   :. .:..   ..: .::    .. ...  ::..
CCDS34 QVGGRSVVCSDVEQQVIVIEEEKKFLKLLELLGHYQESGSVIIFV---DKQEHADGLLKD
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pF1KB8 LGFTAIP---LHGQMSQSKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPT
       :  .. :   ::: ..:  : . .: ::  . ..:.::.::.::::. :. .:::.. :.
CCDS34 LMRASYPCMSLHGGIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNYSCPN
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pF1KB8 HSKDYIHRVGRTARAGRSGKAITFVTQ----YDVELFQRIEHLIGKKLP--------GFP
       : .::.::.:::.::: .: : ::.:.    :  .... .: : :  .:         : 
CCDS34 HYEDYVHRAGRTGRAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALE-LSGTAVPPDLEKLWSDFK
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pF1KB8 TQDDEVMMLTERVA----EAQRFARMELREHGEKKKRSREDAG--DNDDTEGAIGVRNKV
        :.     . .. .    .. .: . :    .:.:: ..   :  :.:: ..:. . ...
CCDS34 DQQKAEGKIIKKSSGFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVDIDEQI
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pF1KB8 AGGKMKKRKGR                                                 
        .   .:..                                                   
CCDS34 ESMFNSKKRVKDMAAPGTSSVPAPTAGNAEKLEIAKRLALRINAQKNLGIESQDVMQQAT
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>>CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5               (1032 aa)
 initn: 602 init1: 263 opt: 756  Z-score: 892.1  bits: 175.5 E(32554): 2.3e-43
Smith-Waterman score: 774; 32.5% identity (63.2% similar) in 459 aa overlap (24-453:372-826)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB8        MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIE
                                     :.. . :..  . ..  . :. ::: :: .
CCDS75 LAKMSQEEVNVFRLEMEGITVKGKGCPKPIKSWVQCGISMKILNSLKKHGYEKPTPIQTQ
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pF1KB8 AIPLALQGRDIIGLAETGPGKTGAFALPILNAL-----LETPQRLFALVLTPTRELAFQI
       :::  ..:::.::.:.:: ::: :: ::..  .     ::  .  .:...:::::::.::
CCDS75 AIPAIMSGRDLIGIAKTGSGKTIAFLLPMFRHIMDQRSLEEGEGPIAVIMTPTRELALQI
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pF1KB8 SEQFEALGSSIGVQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKG--FNLR
       ... . .....:.. . . ::     :   : .  .::. ::::.:: :  ..:   :::
CCDS75 TKECKKFSKTLGLRVVCVYGGTGISEQIAELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVTNLR
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pF1KB8 ALKYLVMDEADRILNMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKC
        . :.:.:::::...: :: .: .:.  .  ::.: .::::. . .. : :  :..:.. 
CCDS75 RVTYVVLDEADRMFDMGFEPQVMRIVDNVRPDRQTVMFSATFPRAMEALARRILSKPIEV
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pF1KB8 AVSSKYQTVEKLQQYYIFIPSKFKDTYLVYILNELA-GNSFMIFCSTCNNTQRTALLLRN
        :...  .   ..:  : :  . :   :. .:..   ..: .::    .. ...  ::..
CCDS75 QVGGRSVVCSDVEQQVIVIEEEKKFLKLLELLGHYQESGSVIIFV---DKQEHADGLLKD
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pF1KB8 LGFTAIP---LHGQMSQSKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPT
       :  .. :   ::: ..:  : . .: ::  . ..:.::.::.::::. :. .:::.. :.
CCDS75 LMRASYPCMSLHGGIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNYSCPN
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pF1KB8 HSKDYIHRVGRTARAGRSGKAITFVTQ----YDVELFQRIEHLIGKKLP--------GFP
       : .::.::.:::.::: .: : ::.:.    :  .... .: : :  .:         : 
CCDS75 HYEDYVHRAGRTGRAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALE-LSGTAVPPDLEKLWSDFK
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pF1KB8 TQDDEVMMLTERVA----EAQRFARMELREHGEKKKRSREDAG--DNDDTEGAIGVRNKV
        :.     . .. .    .. .: . :    .:.:: ..   :  :.:: ..:. . ...
CCDS75 DQQKAEGKIIKKSSGFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVDIDEQI
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pF1KB8 AGGKMKKRKGR                                                 
        .   .:..                                                   
CCDS75 ESMFNSKKRVKDMAAPGTSSVPAPTAGNAEKLEIAKRLALRINAQKNLGIESQVDVMQQA
       820       830       840       850       860       870       

>>CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17             (938 aa)
 initn: 716 init1: 252 opt: 753  Z-score: 889.1  bits: 174.8 E(32554): 3.3e-43
Smith-Waterman score: 753; 37.9% identity (68.3% similar) in 356 aa overlap (25-371:254-606)

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pF1KB8       MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEA
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CCDS32 ITNLTPQQLIDLRHKLNLRVSGAAPPRPGSSFAHFGFDEQLMHQIRKSEYTQPTPIQCQG
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pF1KB8 IPLALQGRDIIGLAETGPGKTGAFALPILNAL-----LETPQRLFALVLTPTRELAFQIS
       .:.::.:::.::.:.:: :::.::  :.:  .     ::  .  .:... :::::  :: 
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